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GrainGenes Sequence Report: AA005122

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Sequence
AA005122
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005122
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCAGCACCTCTCGACGTAGGCCTCATCATCAACACCATGCGCCGAATG
CGACCCCGCACGCCGCATTGCCCCCCGTCTTCCTCGTTCGGTTTGGGGCT
TCGGGCATGGGTGCGTCTTCCATGGCTTACCAATTTCTCTAGTTTTACTT
TGATTCTGAGCACATATATCGAGTTGACGTTGCACCTCGCTGCACAATTT
TCTGGTTTACATGCTCCGCCGACGACTAATTGCGTCATTCTAGTTCTAGC
TCTAGCTCGCAAGTTGGCGACTGGGGAAAATGTTTTCATTTGATGTCGGA
GGCAGATGATTGAGGCTAGTTTGACTAAATCAGACACTTCTCCGTGATTA
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TTTCCTATCCTATTTTTAGCAAGAGGGTATTTCCATCCACGTTTTCTTTC
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TTGCGAGAGTTGTTTTCAACAGAGATGGCCTTTCTTATCCCGATAGTGTT
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TATGCTCAGTGATATTTGATTGTCGGTATTTGTCCATTGAGCTAGTTCAG
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GTTTTGATGATCCTTAAATGTTCAGCCACGACCTAACCATGAAACCAAAG
TGCATTTGGTCCAAGTACATGGCATGCAGTTATCACTACTGCAGATGAAC
CTTGATAACAATTTTCCGAGTGAGCTCAGTGAATGTTTTGTATATTTACT
TCTTCTAGCTTCCATGAGCAGCCCATGAGCATGGTGTTACCTGGCGTTGT
CGGATTCAAGCTACATGGAACACTAAGGAATGGGGTCACAGCAACTGATC
TAGTTCTGACAGTCACCCAAATGCTGCGAAAACATGGTGTTGTTGGCAAG
TTCGTGGAGTTCTATGGTATTTTATTCTACATAATTGGCAGATTTCGTCT
GTCCTATCACAAACTGTTGTTTTGTAACCTTCTAGGTAACTATTTAACCC
CTACCAAGAACTTAACTTTGTTATTTGTAAATGTAGGCAGAGGTATGGAA
AAACTTGCGTTGGCTGATAGAGCAACAATTGCAAATATGGCACCAGAGTA
TGGAGCAACTGTTGGTTTCTTTCCAGTTGACCATATCACCTTAGAATATC
TTAAAATGACAGGAAGAGAAGATAAAACTGTGAGTTTATACTTTAGTTCT
TTTAAAATGACTATGATATATATTCCTTACCATGTAGCTGCTGTTTGGGA
GAAAATTGTACAACTAGGCTATTCATGTTGTCCCGATGGTCAACATAATT
TAATGTGAACTGTTCTTATTTGGTAATGCTAAATGCTTCCTCTATTTAGG
TGTCAACAATAGAGGCATATCTGCGCGCAAACAAAATGTTTGTGGATTAC
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TTCATCGTACTTAGAATTGGATCTGAGAGATGTTGAACCATGTATTTCAG
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TGAAAGAAATGAAGGCAGACTGGCATGCGTGTCTGGAAAATAAAGTTGGT
TTCAAGGTGTGGAGATCGGCACATAATGCAAATGTGTTTAGCCTTGCTAA
TTCAATGCATACTTGGTGACTAGATTATACATTGAAATCGGTTCCAAGTG
ATTGAGTAGTTCACATAATATATTAGTTTAACATATGTTTTCTGTAAGTG
TGCCCCCTGTCCTGTCTTTGCAAACACAAATTTTATTATATCTAAAATTG
GATCCACAAAGTACATCATTGGTTGTGCCCTGATACATTTGAAAATTACA
GATTTTGCCCCTCTTCTGAATAGTTGCATGTGCTGACTAACATCTATACT
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TTCTATTTTTGGAGAAGAAGAAGCAACGATGATTTATTCAATTTATTTCA
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ATCACAAGTTGCACAAACACCTCAAACCCCACAGTTATGATTTCTTCTGG
GTTGGTTGCAAAGAAAGCTTACGAGTTGGGCCTTGAGGTCAGTACTCGGT
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TACTCTGCTGGCTAGCCTGTGTACTTGATTGTCTATTTCCGTTGGCAAGG
TCAAACCATGGATTAAAACAAGTCTTGTGCCTGGATCAGGAGTTGTTACC
AAATATCTTCTTAGGAGGTATTTTCTACAAGTTAGCCAATGCATCATATG
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TATCATATTGAAACTAACACTACTGTAAATTTCTTTGTTTATTAGACATC
ATTGCGGCTTCTGTTCTTTCTGGAAACCGTAATTTCGAAGGCAGGATACA
TCCATTAACTCAAGCCAATTATCTCGCTTCTCCTCTAGTCGTTGTGTATG
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ATTGCAACTAATGCAAAAAATATAAATGGAAACATACCAGTTCATGCTAT
ATTTTTTTTGTAATTAATATCCATGAGACCATGACAAATTTAATGGTTAT
CCTGTAGTTAAACCATGTCCAACATTCAGAAAATGTGATACAGAAAGGGT
GCATCTTGGTTCCCACAACACTTGGATGCTTATGTTTAGTGTTTTGTTTA
GGTTGACATCAATTTTGAAGAGGAGCCGATTGGAACTGGAAAGGGAAACA
TACCAGTTTTCCTTAGGGATATCTGGCCATCAACCGAGGAAGTTTCAGAC
GTAAGTAAGCTTGCTGAAAAACAATCGATGTACATCAGTACAGAGGTTGA
ATAGGCTTAGCATTCACATATGCACCTTTGCATAAACTAATTTCAATTTA
GAAATTAACATGTACTCCTGTTGGACTATTTTTGATTCCCACTGTTGATG
TTACCGATGCAAATCACAGATTGTGCATTCCAATGTCCTGGCTGAAATGT
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CTGGTAGTTCCAAGTGCAGATGTTTACTCTGGGATCCCAATTCAACCTAC
ATCCGTGAGCCTCCTTTCTTTAAAGGAATGAATATGGATCCACCTGGGCC
TCGTAGAATAAAGGATGCCTACTGCTTGTTGAGCTTCGGTGACTGTGTTA
CGACCGATCATATTTCACCAGCTGGGAGCATTCACAAGGATAGCCCAGCT
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TGGCAGCCGCCGCGGAAATTATGAAGTAATGATGAGGGGAACCTTTGGCA
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CATCCTACACTTCCTCACTTCTGCAGGCTCATGGAATAATGTGAGATGCA
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CGAAGCAATTTAGTCGGGATGGGAGTTATCCCTTTGTGCTTCAAGTATGG
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ATCTTCCAAGCAGTGTGCATGAAATGCGACCTGGCCAGGACATTGTTGTT
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GGTAAATGGAACCTTTACTTATTATACCCCCTCTTGTTTCCTGAAAGTCA
TACGGAGTATTAGACACCGGCGCAATCTCCAAAAGGAACTTTAACCACTA
ATTTATATCCTAATATATGTATTAAGCCCAAGTCCATTTCAAAAAAAAAA
ATTGTATTAAACCCAAGAACAAAATTAAATATTGTGAGACTACTTTTTGA
ACATATACATGCGTGTATATGGTTTTCAAGTATGTTATCCCTTAGAAGCC
TTTGATTCTCTGTACACTAATCTACTTTTTCAGGAGACTTACTAGTTGGC
TATTTCTGCTTGTAAGAAATACCAAGTTCAGAAGTAAATTATTTGATATA
TGTTCTGCAGTTGTTAATGTACTGAAAATGCCTCTAAAGGCTCTAACGCT
AGCACTAATCTACTTTCTGCAATCTCAAAACCACCCTTCTCACATCTGTT
TCTGCCCTAATATTGTTGCCACCTTAGGTCAACACCATTTCATCATATTA
ACAGACATGAGACAAACATAACAGGAGAATCTAAAAATAGTATAAAATCA
TATAATATGCATAAAATATTTACAACAAGGAATTTCTTCTCATCCATTTT
TTTTATTATGTGAGAGTATATTAGCAAAAAAAATCTATCTTCCTGAGCTT
CATGTAACATACTCAAAATTTCCTTATAATAATATCTTAGGGTGCAGATT
GAAGGACATAGACGAATCCTCTATATGACGAATTCTATTTCTAGTGAAAT
GTGCACAGTTTAGTGGATGAGCTGTATGATTTCACATTATTTTGAGTATA
TTTAATTTCTCCAAATAGTATGCATGCGGAATCTCAGTTTTTTTCATCAA
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CCACATGCGGGTGAGAAAGGAAAGCATGAGGTCCAGAACTTTCTTCTTTT
GCTGTTTCCTTGTATATATGAATCATGTCTTGTAATAAGAATTTTATGGT
GTTCTTATATCTTTGATTTGAACTAAGGCGAGCACAGTGATACAATACGT
TGGTTGATAATACTCACACTAAGTTTTTCGAATTAAAATAACTTTGCTTC
TATCTAGTTTATGGTAATGTTCACTTATAGGTTCTTATTTGTTTGACTTT
ACAACTGTACCGTAGTAATCAAGTTTAGAATATAGTCATATTTTGCTTTT
TAGTACTAAGTAGCTAGTGTGTGATGGTAGAAAAACTTATCTGCGCTTAC
TTGATAATTATTTCTGATATTTTCGGCAAGTATTAGCCTTCAAGAGACGA
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TATTTATTCTTGCTTTTCTTTCCTAAAACACAGGAAGGATCTGTGTCTCT
ATTCCTTTCCTGGAGCCTGGACATTGAGGTCAACGCCAAACAGCCTGTGC
TGATCCCCATCCGTGACCGGCGGGGCCACTGGTGGGAGAGAGCCACCAGC
CTCGCTCCCAGTGTGCTGCCTCTTGTACCCTCCAGTCTCCTGCCTGGACT
GCCACCCTGTGTTGAATAGCCTGGTGTAGCGCTCCATGAGCAGCGCCCTG
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ATGCTGCCTGATCATTCTGGGCCTGGACCCTCCTGTCCTTGTTGTGGGCA
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GCGATGGAGCTGCCCTGTTCGCTGCCCGGGTTACCTACTGCCATCTCTGC
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TGGTGACTGAATTGCCATCTTCGCTGGGGTGCACTGTGTTACCACGATCA
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TTCAGGCACATCTGGTTCTCTCTTGACATTGACAGACTGATCATGCGGTT
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GACTGATCCTGCGCTATCTGGCTGTGGCGGTGCTTGAGTGTGAGCATAAT
GTAGGCCGCCAGTATCTCGAACGTGTTTAGATTGGGGTCTCGCTGGCTGT
ACCTGGCCACAGGACGACCAGTGTCGACAGGTGGCGGCAGGAGCCTGGGC
TTCGCAGGCGGCGGCGTGGCGCCTTTGTAGCCTCGGTGCGGGTGGCTCCG
GAGGTGGCCAAACATGGACTTGTTGCTCCTGAAGTGCTTCCCGCACTCTG
GGCACTGGACGTCGCCGCCGCCGCTCCCGAGCTCCTCCGAGTCGTTGCTA
CCTTCAGTAGCAACAGAAACAGCAACCTGACCACCCAGCAGGGAATCCTC
TTCATCTTCTTCCTTGTCTGCATACTCTTCTCCGTCCACAGATCTGTCAG
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GATCTTGACACAAAAATTCGTCTCCAATCTGAGCAAGCAGCTGCTGGTCG
CCGGCGAGCACAGGCCGGAGCAGCAACACCAAGACGCAGACGACGCAGAG
CAGGCTGCTCTGCTTACTCATGTAGATGGGGAGAGACGGAGTATGGTCAG
GTGAGTGGGGGAGGAAAACAGACAGACGGTGGTGGAGATCCGCCGGCGGC
GTGGCTGTGGTGGGGGAGGGGAAGTGGCAGAGCCGGGGCTACGAAGAACG
CGCGCACGTATATATGTGGAAGTCCTGAAAGATAGCTGCTCAATAGGAGT
AATAATGGTGGGAGTCCTTATCTCTCGCCGTGATCATGCGTGCGAACGGG
ACCTTCTTTTGGGAATGAAAACGGCGCCGATTCGATTTTTGATCTGTTGC
TATTCTTTCTGTTTTGTTGTTTTCTCATGGTGTGGTGGGCCCAGCCTGGC
CATTAACAATGACAATTAATAATATCGTCCCTGAAGTTTAGTGTACTGGA
GTAATTAGTTGCCATCCAAACGGTTGTCAAGATTATTACTTTTTGTTTAG
ATCTGCAAGATCAGTAGTACTGATTAAATCTTTTTTTTTAGAAAGGAGCA
TATATTAATATCAGATGATACCAATTACACTCAGTCTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.