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GrainGenes Sequence Report: AA004248

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Sequence
AA004248
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004248
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGGTCTCCAAGTCGGTGCCCTTAGGAGCTGGAGCAGATGTCATGTG
CTCCATTAGCGATAAAAAGAGAGTGTGTGCCACGCGTGTATGTATACTAC
TGCTATAATACACATCCTACCCCCATTTTGAGAAAATACCAATCTGAAAT
CCAACAAGGAACTTTGAATTATTTGTGATCTTGTCCTAATTGTGGGAAAC
TTACGTCTTACTACTGAATGTTATTACTACATACTACAAATTGTGCTGGA
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TTCTATCAACTATTGAAGTCTAACTTTTGTTATCTTACTATAGGTTAGTA
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ATAATTTCAATTTATTGAAAAAATATGATTGTCGTCGCATCATCCATGCA
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ATAATTTTGTGATGACTTCATGGAATTGTTCCACAGTTTGTACTGAAATT
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ACTGCATTTACTGAGATTAACACAACAATATATGACCGTGATGCTGATGG
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TGCTGTCTGAACTTACCATGTCTATACGCAGGTAAGATTTCCTTGCTGGA
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TTGGAAGAACAGCGTAATGATCCTAATGATTCTCAATGAAATTCATGTGC
TAAGTGTGGATGTACTACTTTTTTCTTGCAATGAAAGGAACGAACCTTCC
GGTTTTGTTTTTGCTTTGTAACGATAGCTAAACAAGATTCTGAGTTTGAT
GCCAGATTGTGTCTGGTTTTTACAGGCACCGGCCTTTTCAAACCCAGTAC
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AAGAAAATAAAACACTATCTTTATCATTGTTCAGACTTCAGAAATCAGTC
CTTGGTATAGACTAAAAACACTGCAATAGAATAAGCTCGTACAAGATTGC
TTAACTCTTTCAGAAGATTTCTTTAATGAATATGTCATGAATTACAATTG
TTTTCATAAACGCTTAGTGAATTACAAATATTTTGATCCATGCATCTAGA
TCTAGCTTTGTTGAACCGTGGCAACGCACGAGCGTTCAACTATACCTAAA
AAAAAATCAGGTTCCGTCTCCGCCGATACGTGTGTGTCCTTCGTCCGAGT
ATCCCACCCATCGCCTCTCCCCGCGAACTACGGCTCCCTGACGCCATCGT
CCCCTCGATCGAACCAGTAGAAACAACAGATCGTGTCTTCACCACCCACG
CCCACACAGCTTCCCCCATCGATCGGCGCCGACCACGACTCTAGCTCTCC
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CCCCACGGCCGCATCTTCGCTCCTCCCAGCACCCGCCGCCACTGCCTCGA
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CGGCAGGCATCCAGACCACATCACCGCGGACATACAGATCAACGTCGGGC
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TCTTGCTCTATATCACGGTGTCTTTGTTGACTTACCAGATTTGGTGTCAA
TAATTGTAGAAAATGCATAGGAAGGCTGGAAGGGGAAGGGAGCACCAAAG
TGGATATGTAATTTACTTTTCTAAAATTTTGCAATTGTGTCCATCAGTGA
GATGCTGACTAGCGATAGTGGTGGACCGTATTTTTCTAATTCACTAATTA
CGTTCATTGTAACCACAAGAGAATAAGAGGAACATGTCATGTTGACCACG
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GGAGGGGTAGACCGCGGAGATGAAGATGAGCTTGACAGCAGTGGTGGCAA
GAGCGCTGAAGTCGACGATGGTGACCGGTAGCAGGGGCAAGGACATACGT
GAGACATCCGATGAGCGCCTCGACATTATTATATCAGGTTTTCTTATTGC
TTGCTTCTAGAGATTACAAGTATTGACATTGATGTTTTTTCCAGCCAGGG
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CTACATATCTCACTTCACCATCCTGTAATGACATGTGAAACTAAGATATA
TTATATTTGCTCTGACTTCTTTTGGTAAACTGGCATTTAAAAGTATCTTT
GCTTAGAGATTATAATAGCATAATAAGCTTAAGTTGTGGTTCAAGAGGCT
TAACCTTTCATTCATAGATCAAAGTGTTAGGATACAATATATGCCCATCT
ATGTTCTTCATCTAATCTTAATTTGAGCAATGCCTCTGTTACCGAATGTT
TTTCCTTGTATACACTAGCAAGCATGTGATGATAAGATGTTGAAGAATCG
TTTGGCTGAGTGAAGAGAAAACAGAACCATGTAATCTCTTTTTCCAATGA
CAATCTGTTATGGAGTCTGCGTGCATGGAGGCAGTATTTACAAATTAAGG
TACTGTTGCTTGAGTTTTATGTTCATATTGTGTGTTTCTGTTCATTTGAC
TTCCTGGTCTCTGGTACTATAGCGCCGAAACTGTAAGAAAAGAGTGCCTG
TTTTCGGATGAAAATCTCGTTTTGGCTATTTTAGTGTGAAGATGTATTAA
ACGCCTAAGAAGATGGAGGCTTCTGGTATTAGTGCTTTGCTTTACTAGAC
TTGAAAATCTTAGAGAACATCAACATTTGAGATGGGCTAGCTGAATCCTT
TCCTTTGCTGTACCACCAACAATGCTCTGGTCTTAGATGCCGCATATGGA
AGATGTTAATTGTAGACTCTGAAGACCTTAATATTATGCCGCACACAAAG
GTAAGAAGCATGTGACTGAGAAAGAAAGTCTATCCGAACCACTGACATAT
GTGGAGGAAAATCTTATTTTGTTGCATTAGGTGATACATTCATCTTTGCA
GATCGTGTCATGTTTCCCGTGGCTTAACCTAGAGACTAACCTAGAGACAG
GGCTTCAACTCAAATATTTTATTCATGAAATCTTCTTAAGTTCTGTACTG
TTCAGTGTTACTGATTTGAATTCAGTGCTGATTCGTTTCCATTTTCTTGG
AATGCCAGTTTGCCACTCTCTGTTACTAATAGGCTTTGCACATTTTTTTG
ACTTATTTGCCAGAAGCTATCTTATATTCTCCTCCTGCATGCTTACGGCC
ACTTACCATGTTTCCATTTTCGGTGACTGCTGAACTGTGGAACAGGAGGT
GGACAAGGTTTGTGTCAGTATCACAGGCATTAATTCTTACAGTAAGCTTC
AGTGATACCGCAACACAAACCTGTGTTTGTTTTGTCTATTGGAGATTGCA
TGAAATATCATGGGAACTCATTAGTTGATTTTTTTTGGTAATAAATGTAA
TATTGTATCCGATGTACCGTTGTAGTGCGTTTCTTAGTTTTTCTTGTAAT
GCAGATTGAGGATGAGCCCGTTCAACATATTGGAGCTGGGCATACAATTA
TGCATCAAAGAAGTTTATAAGAGGTAAGATCTAGAGAACTTTATCTGATA
TTCTGAAATTTATAGGAGTAAGATCTGGCAAACTTTATCTGATATTCTGA
AACTTATAGGTGCTAAGATCTAGAAAGTTCAAATTATCTGATATTCTGTA
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AGGAGGTAATATCTAGGAAGTTCAACTATTTTGGAATCCCATACATGAGC
ATTGCATTTTATATGTGCAGCTTAGTACACTTGTGTTTGCCTACTGATGC
TAATCATCCAACATCACCCTCTTATGATTATGACTTATCTTTACAGAGGC
TAGAAATTCAATGTCGAATCCACATGCTTTATTTCCAATGGTATGTATTA
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GGTTAAGGTCTATTTTTTTTGAAAAGTCAAGCTACGGAAAGTTTAACCAA
ACTTTTTGAAAAAACTATAAAGAACTATGATATTATATAAATATCATGTG
AAAATATGTCTTATGACGTATTAAAGGGTATATATTTCATATTGTAAATA
TTAATACTTTTTTCTAAAACTTGGTCAAACTTTACATAGTTTGACTTTTT
CAAAAAAATATAGGCCTTAAGCCTTCGGACGGAGGTAGTATTAGCAGGAA
TTCATATCAAGAGAAGTGTGTATGATAAAGTTTTATTGTTTTGAAGGATT
AGCAGTGACCTCGTTTACCATAAAACCTCGTCGCTTCAATATCCCTTGAT
AAATCTCCAATCGATCTAGCTCTTCACAACAACCATTGTTTTCGCCATTG
TTCTTTTGATATGACATGGCAGCCTGGGGGTATATGGAGAATATTTCCAG
CGTACTTCATGCCTCATTGCATGGAAATTTATAACTAGGGTTGTCCATGC
ATGCTTGGGAAAAATGTTTCACTGTTGTGCTAAGTAGATGTTGGTATGTC
TTTCCTCAACTTATTTTTAGGGTCAACTCATCTGAATTATGTGCGACAGT
GTATGTAAGATCAAGTTAGAAGTGCTTCCTGCACAAAATATTGTTCCGGA
TAAGCTATGAGAAATTTGTAAACCGAGGCTTATTTCTTCCCTCTAATGCG
GGTTCATGCTATAGGTACTTATATATTAGACATTAATTTTACATGCTTGA
GTACACGAATGGCTGATAATTATTATCATTTCATTCTCTTGCTGATATTA
CTCTGCTCGCACCTATAAAATGTATTGATTATTCATGTTGCTTGAATTTC
TGGTCAAGGTTTGAATGTTGTTTATTGGTCAGGTTGTGTAACATCCATGC
TGTCTTGTGTTGTTTCATGCATATAGGTTTGCTTTAAGTCTACTATAAAT
ACCTTCTATTATTCGTTTTCTCCTTTTTCTCCACTCTTTTCTTGGTCTGT
TTTATTCTGATTTTAGGATTTATTATTCTTACAAGATTATGAAGGACTGA
ACCATCACACGGTTTAAAGAGCTCGTGATCTTACAAGATTTCAAAGAATA
TGACCACCACACATCCTTGTTTTTTCTAAGTATATACTTCTCACTTCCTT
CTGGTTCTAGGTACACGAATATTTCTTTATGCATCCAACTACATGAACAC
AAAAGTTTGTTGCTATTTTTAATCTTGTGTTCCAGTTTCTTCATAGTTTT
TCTTTTTAAACATTTTGTTCATGATGCGGACTTCACCCAGCCATGTGGTG
AATCCCAAACTTAACACCACCTTGTACAAGGAGAGTGACCTCGTGGTGAA
CTTCTTAGTTGCAATTGCAGTTGCAGCAGTGGCATTATCTATCCTATACT
GGACTTGGAGTAGGTGGTGGAAGAACATTGAGACGTCTGGCACAACTGCT
TTGTTATGGGACCACGGGTTAAGAGGATCATTGGGCACACCATTCTATGT
AACATATTGTTAATGTAAGGGTAAGCAATTAAGCATGATATTTCAGAGTT
AATGGTCCTTTATATTTTGGAGAAAATTTCTTGCACGAAAACTTTCTACG
TGTTATTTTTTAAAAAGTAGCAGATGATTTTTTTATTTATTTTTTAAGAG
AGGGGACAAGATATATTGCAATATCTAAGTTTTTCAATAGATGCAAATTG
TGCTATCAATAAGACCAGTCGTTCAATGTTGTACTCACATTAAAAAAAAT
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GAATTGAGCATGGGGGTTACAGCTAAAGAATTCCTTCGAGCATAGAAAAC
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GCAGGTCTAGGACACTGGCCTACCAAAGTGGCAAAGGGCGACTGAGTAAT
GGGGGAGAGACGCCGACTTTGTAGGTGTGAGTCCAGCTTCTCTATCATCA
CCGTGTAATATGAGGCCTTGCTGGCGAATAGTAGCTTGTGAGGGGGTGTG
CCGCCATGAGGTTTGAGCTCGTATTGGACAAAGTTGCACTAGCACCGATC
AAGTGGCCATGGCATGTGCATAATGAAATGGTTGAAGTTTGAGGAATGGT
TCATTTTTTTATTTTCTCATCTATACCTGGCATAGAAAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.