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GrainGenes Sequence Report: AA002636

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Sequence
AA002636
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002636
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGATCTACTCCGTGATTTACATGCTTCAAGCTCATGATGCTACGCCGGC
TGCCGCTTCCAATAGGAAGCATACCATAATTCGAGACATCACTAACACCC
ACAACTCAGGTAATATGGGATGAATATATGATCTCACATGATTGATGTGG
ATATATTCTAAGTGAATTGTATTATGTATGCAGGTCCTAAGGAACTGAAG
AGGCAATCAGAGAGGGAACGGTATTCACAAAATAGGGACGAAATATTAAA
GAAACAACGTCAAGCTTACAGTCAGAAAAAAATGACAGCTGCTTCCACTG
AAATTAACGGACAGGGAAATGAAACACAAACACCGGTGTCCATAACCATT
GGTAATAATGTTCAACTAATGCATATATGCCCCTACTTATTTTTATCTAA
TAATAATATCGTGTTCATCTGCGCAGACCCTAACTCTAAAGAAATAAGGA
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ATTAACAAATCTATAAGGAGGTGAAGTTTGGATCTTACTGTGATTACTGT
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ATAATTTTCAAGTGCATGAATTTGTTCTACTATCTTATTTATTATTTATA
CATAAATAGATTGCTTGGGAGACGAGAACCTTCGAGAGGCTGCATATGTT
GAGCCTGATGAGGAAGCTACGCTTTTTGCCAAACAGGGTAAGAATAATAT
ATTGATAATATAAATAAGATATGATATAATACTATCACTTATGCAAAAAA
TGTTGATTATGTTCCAGATGTTCATTTTCAATCCTACCGAGTTCAGCGAC
AACAAGCTAATGCAGTTCCCAATGATGATACCTATGATAATGTTTACAAA
AACATACCTAATAGGCATCATGTCCTAAGAAAAGTTCCGGACTACCGACA
CTGTGGGGCATTGCGTTTTCCATTCGAGGGACCTGCATTTTGTTATAGGA
AAGGAAAAGTCAGTTTAGTTACTCCTGTTGTTCCAGAAGAGCTGAAATAG
TTGTTTATAAGTCAAGAGGATGATGATGCTAAATACTTCAGAGGTAATAT
ACGATATTTTAACTCCCATTTCTCATTCACAAGTCTAGGAGTCACCCTTG
ATCGCCGAGTAAGCACAACTGCAAGAACTGGCGTATATACATTTCGGGCT
TGTGGTGGTTTGTACCATTCTCTTGGCAATCTGGTGTCAGCTGGTAATGG
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ATAGGGCGCAGAGGTCTCCGGATCTTAATATAGATGTCATACGGAAGATC
CTGGGCATACTACAACATAACCCTTATGCGCAAGTTTTCAAGATCCTTGG
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GCTATGACCCATTATCATATCCACTATTCTTTCCTCGTGGGGAAACTGGT
TGGAACCGTTGGATGCCATATGCCGACCCCCCTACCGACACGACCCAAGG
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CAAGTTGCTGGATTTTTGCCACGTGGAGACCATGCCACCAAATTTCCAGC
AGGTATTGATCAACCGTTGGTTATTTTAATGTTTTGCGATATATCATCCT
TATATTAATGTTTTTAACAACCTTTCAGATAATAACATAATGCAAGAACC
AAACAGTAATTATGCAGTACATGAAGACCAAGCCACTGATTTACCCGAAG
GTACTGCTCATCATTGCTATTTTATATTTGTTGTAAATGAATCCATTCTA
CAACTATTTATGCTGTCAAATTATTTATAGATGACAACGAGGATAAGCCA
GATGACGATTTTGGTGACGATGAGGTGAATGCAACACAATCCAGAAAATT
TGTTAGCGCGAGAGAGTACTACTGTTTCAAGATGCAGGTGAGGAAGAAGC
TTTTTAACATCATCTTGTTCGGAGGGCGCCTTTTCCAACAGTGGGTTGTT
GACATGTACATCAAGATTGAGACTATGAGGCTTGACTGGTACTCAAAGCC
GGAAAATCAGAAGGTTATACGCCCTGACCTCTACCAGGTAACATGCTTGC
TTCTATTCTGTAATACATTATTATAGATGTGTGTTGCGTGCTTTTCTATA
ATCTTGTGTACTTTTATTTATTAATAGGGTCTTGTTGACACTATCATCGC
TGGCGAGTCACGTGGTGATCGGATTGGCAAAAGAATTGTGCTTCCACGTA
CATTTCCTAGTGGTGACCGTGACATGCAACTGAGGTTCTTGGATGCGATG
GCAATAGTTCAACGTTGGGGAAAACCCGACTATTTCATCACGATGACTTG
CAATCCATATTGGGAAGAGATAACTGAGAAATTGTTGCCTGGACAACTGC
CACAAGACCGTCCTGACCTGGTGGCAAGAGTATTCAAAGCAAAACAGCGA
TATATGATGGAGTTACTCACTAAGGGTAAGCATTTTGGAGAAGTGGCAGC
TTATGTTCATGTCACAGAGTTCCAAAAACGAGGTCTCCCGCATGAACATA
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GATCAGGTGATATCTGCAGAGATACCTGACAAAGATAAATACCCTATCCT
GCATGAACTTTGTTGTAAATGAAGCCATTCTACAACTATTTATGCTGTCA
AATTATTTATAGATGACAACGAGGATAACCCAGATGACGATTTTGGTGAC
GATGAGGTGAATGCAACACAATCCAGAAAATTTGTTAGCGCGAGAGAGTA
CTACTGTTTCAAGATGCAGGTGAGGAAGAAGCTTTTTAACATCATCTTGT
TCGGAGGGCGCCTTTTCCAACAGTGGGTTGTTGACATGTACATCAAGATT
GAGACTATGAGGCTTGACTGGTACTCAAAGCCGGAAAATCAGAAGGTTAT
ACGCGCTGACCTCTACCAGGTAACATGCTTGCTTCTATTCTGTAATACAT
TATTATAGATGTGTGTTGCGTGCTTTTCTATAATCTTGTGTACTTTTATT
TATTAATAGGGTCTTGTTGACACTGTCATTGCTGGCGAGTCACGTGGTGA
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GTGACATGCAACTGAGGTTCTTGGATGAGATGGCAATAGTTCAACGTTGG
GGAAAACCCGACTATTTCATCACGATGACTTGCAATCCATATTGGGAAGA
GATAACTGAGAAATTGTTGCCTGGACAACTGCCACAAGACCGTCATGACC
TGGTGGCAAGAGTATTCAAAGCAAAACAGCGAGATATGATGGAGTTACTC
ACTAAGGGTAAGCATTTTGGAGAAGTGGCAGCTTATGTTCATGTCACAGA
GTTCCAAAAACGAGGTCTCCCGCATGAACATATACTTCTAATCATGAAAG
CAAAAAGCAAGTTAGCGACCCCAGATGACTATGATCAGGTGATATCTGCA
GAGATACCTGACAAAGATAAATACCCTATCTTGCATGAACTGGTCGTCAA
ACACATGCTGCACGGACCATGTGGTGAGCCGAGGAGAAGTTGCCCATGCA
TGATTGACGGACAATGCCGATTTCGTTACCCACGAGAATTTTGTAATGCC
ACACAGCAAGGGAAAGACTCATATCCCATCTATAGGAGGAGGGATGATGG
ACGTGCAGTAAAGATCAGAGGAGCAGATTTGGACAATAGATGGGTCGTCC
CTTACAACCCATTTTTGCTTATGAGATACAACTGCCATATTAATGTCAAA
GCATGCTCAAGCATCAAGGCCGTCAAGTTCTTATTCAAGTACATCTACAA
GGGCCATGATCGGACATCCTTTGCATTCGAGCAGGATATTATCAATGATG
GTGGAATCATCAATGAAATACGACAATATAGGGATGCACGCTATGTAACT
CCTCCAGATGCTATGTACAGGCTTTACGGTTTTAAAATGTTTGGTGTTAG
CCCATCTGTGCTGCAACTCCATCTTCATTTGCCTAACATGCATACAGTCG
CGTTTAAAGCCAATGAAAATCTAGAAGATGTTGTCGCTCGGCCATCTTCT
TCCAAGTCCATGCTTACCGAGTACTTTGATATGAACCGGAAGTTTCCGGA
GGCACGAAAATGGTTGTACAGAGAGTTTCCTGAACATTATAGATGGATTG
CTGGAAAAAAGTGGCAGAATAGAAGAAGTAAGAGATCACAAATTGGAAGA
CTTGTGTATGCACACCCTGCTGAAGGAGAAAGGTACTATTTGCGAGTGCT
CCTAAGTCATGTCCGAGGTGCCACTTCGTTTGATGATTTGAAAATGGTAA
ATGGCATGCCATGCAGTTCCTTCAGAGAGGCATGTGAGCATTTAGGACTC
ATTGAGCACGACAGGAGCCTTGATGATTGCATGACGGAGGCGGCCACATT
TCAGATGCCTTGTGCCCTAAGACGGCTGTTTGCCACGATACTGGTATTCT
GTGAGGTAACAGAAATCAGACAAATGTGGGACAAACATCTAGCATCAATG
TGTGAGGATTACCATCTTAATCAGCCAAATGAGGCAACACTTGAGTAGAT
GGTCCTTAGAGATATGAGGGATACGTTGCAATCCATGGGAAATGATATTA
CAAGCTATGGACTTCCGGATCTGGTTGAGACCGATGGATCTTATGATGCT
GAGTATAGAGAAGTAGTGGAGGAAAGGCAAGTCACCGCAGACAAAGAACA
TCTAGATTTAATCAGCACTTTGAACAATGAGCAGCTGGATGGTTTCAATG
ATATAATGGATCATGTGACGAACCAAAAAAGCAAGGTATTCTCTGTTGAT
GGTCCAGGAGGCACTGGGAAGACATACTTGTACAAGGCATTGCTTGCAAA
GGTGCGGCACATGGGCCTAATAGCGATAGCAACTGCTACATCAGGTATAG
CAGCGTCGATAATGCCTGGAGGCCGGACTGCGCACTCCAGGTTCAAAATT
CCAATCAAGCTCACCGACAACAGCATGTGTAGTTTCACAAAGCAAAGTGG
TACTGCGGAGTTGCTTAAACATGCGTCGTTGATAATTTGGGACGAAGTAG
CCATGACAAAAAGGAAGGCAGTTGAGACGCTTGATAGATCACTCCAGGAT
ATAATGGAATGTCCTTTGCCATTTGGGGGAAAGGTTGTCGTCTTTGGTGG
GGATTTTAGGCAGGTCCTTCCCGTTGTGACACGTGGGACAAGAGCACAAA
TCATAGATGCTACACTTTTAAAATCCTATTTGTGGGATAAGACACACAAG
ATACACCTCAAACGCAATATGCGGGCACAAGCTGATCCTTGGTTCTCCGA
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ATGTGCGTCTCCCTAACGACATTGTGATCGTCTACACCGAGGATGAAAAT
GCTATTAACATGTTCATCGATAATGTCTTCCCATTGATGCATGCCAATGC
TAGGTCAAGAGAATACATGAGCACACGGGCAATTCTTTCAACCAAGAATG
ATCATGTCGATAACCTGAATGACAAAATGATCGCCAGGTTTCCAGGCCAA
GAAAGATTATACCATTGTTTCGAATCAATCGAGGATAACTTGCAGAATAA
TTACACTATTGACTTTCTGAACTCGATCACACCAAATGGCTTGCCCCCGC
ATGTCTTGAGATTGAAGGTGAATTTCCCAGTTATTCTGCTCCGGAACCTC
GACCCTCATAATGGCCTATGCAATGGAACACGGCTTATGATCAGAGCCTT
CCAGGATAATGCAATCGACGCGGAGATAGTTGGTGGTCAGCATGCTGGAA
AGAGAGTGTTCATACCTAGGATCCCTATGTCTCCCTCCGATGACATCTCA
CTTCCCTTCAAACTCAAGAGAAAACAGTTCCCCATCCGTCTGAGTTTTGC
GATGACCATTAACAAGGCACAGGGTCAGACCATACCAAACGTCGGTATTT
ACCTTCCCGAGCCTGTATTTTCACATGGCCAGCTATATGTTGCACTGTCA
AGGGGTGTGTCAAGAAAGACGACACGGATTTTGGCCAAGCCTAACAAGGA
GGTAGATAAATCCGGTAAAAGCACCAAAAACATTGTTTATAGAGATGTTT
TAGAGGGATGAGGAAGGTGCGTGCTTTGGTGTTTTCTTGGCATCTTTGTT
TCTGTATCTATATAACTATACTTTTAGACCTAACATAATTGTTTTTTATT
TGCAGGATTTGCTCAAGATCATGATATATAATAAGCATGAAAGAAGAAAG
ATGTCGATGCGATGGCAATAGGTCTGTATGATGGCAATAGGCCTATACCA
AAGGCTCTATGGCTGTAGCACTGGAACTCATATTTGGAGGAGATGCTTTC
TGGATGATCAACATTATATATGTAAATTTGTAAGATAGATCTCTGGTGTA
TGCGTGCGTAAGATAAGATGTTAAAAGTTCTCTGTCTCTGGGTTTACTTC
TACTTTTTGTTACTCTCATCCTATCTGTTATAGTTTCAGGTCAATGTCAT
TGTCCATTGCAGATATTACCTGTCCATGTGCTCATGTACTTCATTTTCAA
TATGAAGATTGCTTTAGTTTATTAAAACTTTTTTTCCTAATGTTAAGTTA
GTTAGAGTGTGAGACTGTTAGTCAACAAGTCGTCTCTTCTTTTAACTATA
TTTCATATGTATCAATAATACATAGCACTTACAAGAGATAGGCTCTTACT
TGCGTGATACCATAAATTACCAGGTAGCATACACTGTGGATTGGCTAAAG
ACTGGTCAACAACTAGCCAAGCTTTCACCACTCTACAACATAATTGTCAC
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ATTGATACACTTAAATAGTTAAGCCCAACTATACAGCCAAGCCAAACCAA
CTCAACAGTATATTTTAAAGAAAAAAGCTACCGCTAAGAAAAGGGTACAG
CAACTTCTGTATACGTGGGCTATATAACCAAAATAAAAATAAAGTGTGAG
ACCAGAGATAAAACAACAGGATTAGCTTTAACATATGTGTACGTGGGCTA
TATAACCAAAATAAAAATAAAGTGTGTGGCTAGAGATAAATCATGCACGT
GGGCTATATAACCAAAATAAAAATAATGTGTGGGGTCAGAGATAAATCAA
TGGGATTGGGTTTTTTTAGGTTCATCAATGGGATTATATAGTAGCTCAAT
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ACGATTGTAGGGATTTTTATTTCCCATCCTCTCATTTTGGAATTACTATA
AGAATCACGGACGTACATCCCTACGACTGTGATCTAGCCCTAGGGTTTTT
GTGCCCTGATAAAATCCCTCCCATCTCTCCTCCCCAGCGATCTCGCTGCC
GCATTCCCTACCCTCCTCCACCTTGCCGGCCTCCTCCAAAACAGATCTCT
CCACTCACCACACGAATCTGCATATTGTGCATCGTTCTCAATGTCGGCGC
CACCATCCCCAATGTCCTCTCCCAATCAATCTCCAACCATATTTGGTGCA
ACTGTCGATGCTATCAAAATGGTAATGATATATCTCTGTAACTTCATCCT
ATGCAAAGTTTTGTATCTAAAAGTGATATGTGTTTGTGTTTTCAGGAAAA
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ATATTGTGGGTTTCAGTTATGGAGTGAACAAGAATCAAGTGAAATAGCTG
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ACAAACGCCTGATATAGAAGTACCGGGAACTATAGAGGAGGAGCTGGCAT
TGCCCGTGCAGATAAAGAAACATATGCGACGGCATAACAAGCCTAAGAAG
GCACAAGACTATGTGGTTTCTCCAGAAGGCACAAGACTTAACATTCTATG
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.