Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016536

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016536
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016536
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCCCTCTCTCTCCCCTCTCCTCCTTGCGCTCCTCCCGAATCGAAGCTT CCAGAGTCTGCCGGCGGCGGAGGCCGGCGCGAGGGAGCGCACCGAGCCGC GCCAGCATGGCGGAGCCGCAGCGGGTCTCGTTTCGCGACGGCCGCCTCGC GTCACGGAAGGCGGAGGAGGCTGGTACGCAGATCTCTCCTTGATCGAGGG TTCCTCATCGGTTCATTCCCTTCTGATGTTGTTCCTTTAAGATTTCCTTG GACCTTCTTTGTGGAGTCTTTTCTTCGGTTGGGTTTTAGATGGATTTGTG CTGCAGAGAGCTTTTGGTCTTTGGGGCGGGGGGACGTTTATGCTAGTATA GTAGTAGTAACTTTGGCGGACTGGTCGCTGGAAAATAGCGTGGGATGGGC CATGATTCACGGGAGTCCCCGGCGGGGTTATTGCGCGATTTGATGCGCAG CGAACTTCTCTTATTACTGCTTCTATTGGAGAAAAATTAACGTACGGTTA TACTAGTTCTTAGCCAGAAGATGTCCACTGGAGTAATATTTAGAGGATAT TGGCATGTGGTGTCCCGGATATCACACGGTTTGATTGATGTGGCTTGAAC CCTGATTCGTCCAGTGCTCCATAGAGTGTTGTATTTTGGTTATTCCTAAG CCACTCTACATTTGTACAAGGAACCGAAAGTACAGGTTTAGTTCAGATGG TACAGACTACTTTAATTTCTGAATTAAAAAAATTTAATCAGCTTGTGCAC TTGGATAGTTCTAAACTTCTTTTCTAGCGCAAAATTGACACTCTTGCCGC TAGATTATTGCATTTCCTTGTATATAAAGTCAATACCATGTCCAGTCTGC AACAATTGCTAATACATGAAGTCAAGGTCTGTGTAAATTTCGTTGGCTCA TTGTACTTTTTTTGCTTTGCTTTCTGCAAGCATGGAGACGGCACCAGGCC GCAGCCTGGCTCGAGAGCATGGTTGGGCCTTTGGGCATATCCCCTTGCCC GTCCGACCAAGAATTTGTTGCTGCTCTAAGGAATGGCATTGTCCTATGCA AGGCCATCAACAAAATACAGCCTGGTGTTGTGCCAAAGGTTGTCGCATAT GCCCCCTGCGATAGCCATCCATCGACCGCTTTTCAGTACTTTGAGAACAT CCGCAACTTCTTGGTTGCTGTTCAAGAGCTAAAGTTGCCATGTTTTGAGG CCTCTGATTTGGAAAAGGTGTGCTATCTATCCTCAACATGTTAATCTTCG CGATGGAGAGATGCTTATCAGTCACTATATATATATTGCTAAATGGGTTG CTTCTGCAGGAAAATGTTGATGTTGGATCAGTGGGCAAGATTGTTGATTG TGTCAATTCTTTGAAGTCTTACCACGAGCGTAAGCATTGCGGTGGAGCCA ATGGTTCATTCAAGTTCAAGAAATCACCTCTTGCACCACGTTATGCAGTT CACTCTCAATCTGAAAATCTTGCTTTGGGATCTTCTATCCCACAAAAGTG TCTAGACATGACAGTGACTGATTCTGAGGAACACAATTTTCAAAATGGGG GCCCTAACATGGAAGGTTTGTGGTACACTTACCTTCGTGTGTTTATACAC TTAATGTGTAATTTTTCCAGGCCAATAATCAATCCCTCCACTGGATGGAT GCTTGTTTTAGTTAATTTCACAGTCAGTTGTGTTGTTTTTGTTTTTCTGA ACGCATTAATACTTTTTAGCAACTTGGTTAAACATAGCCACCACAGCAAT TAAACCATCAAAGTATTTTGATTTTTGCTGGTAAACCATCTATGTGTTGT GCGTTTGCAGAGGCAATTGAAAAACTACAGAGGATTATTCTTGATTGCAT GATAAGCTGCAAGGAAAATTTGGACCAAGACGTTCTTAGAAAGGTCCTTA GACAACATGTGTTTTCTTTTGTAAGTGTACAATACTAATTGTACCATGTA TCAGTTTCCGACATGGCTTAACTTATTTTGCAGGATCCAGTTAAACTGGT TGGCACTATTTTATCAAATCAGCTAGAAAAAGAACAGGTGACTTTTCTGT TGATTTCTTCCTCTCAAATGCCATGCAGATTGTCGATGTTTACCTCTCAA ACTTAGCCACGTGCTCTTTAATTTTGTTGACCACAAGAATAAGGACATAC TCATAGTGCTTCTTGTCAGATGTGTGTTTCCGTATTAAGTCGATGAACAC ATTTCCTGAAAATGGTCTGTTTCAAGTGGTTGTGAAACCTCATGCATCTG TGGTCCCTCTGCTATTACTTGTGGTGCTGTTTCCTTACTGCTCTGAGCCT CTGGAGCATTATATTTAGAAAGTACCATGTAATACAAGCAGAAATTGAGA TTGATCATTCATATTTCTCAGCTCTGACTACTGAACTGTGGTTATACCAA GTTCGCTTTGCTTAATGTATGGCCTTGAATGCTGGCATAGTTTGTCTATA CATTTGATCACATTTTTTATTATGACCTTATTTCAAATTCATATTTACCT TTTTTTGCACTTCTTGATGTTTTAATTGATGCTAATTAAAGCTGAAATCA ATACCTTATATGCAGTTCAAACCACTTCTTCAACTTTTTTCTCCAGAAGG TTCTGCAATAAAAAATGAACCAAATCAGCATACTGAGGTACTGTTTAAAC ATTGCAATGCACTGTTCCATTTATCAGCAGAAGTTAGAGGAATTGACTCG ATCTTTACCCTCACTGTAGAATTGACACGAGGTTAATAGATTGAAAAAGT ATGATTTGCAAACCTAACACTAGTATCTGCCCGCATCACACACTACACAC TAAGCATTATATAGACGTCACGCCACGTTTGGCAGCCACTGAACTAAACA GGTAGCGGCTTCCATAGCCCAGGATCTCAAGTCCGATAGCTTTGATGAAC TTTTAGATTGTGCACATGGAGATAACCTGTTTTGTTATTTACCAGTGCTA CATGCTCGAGACCTGACATTCTATCAGATTTTCCTCATGCTTATAGTAAA AAAAGCTACAGATTTGTTCCCATTTTATAGACATCACACACAGATTTGTG TGGTTACATTTTTTAGGATCACTAGTGTACTTCACAATTGGGATACATAA TATATGCTGGTGCTGAAGAATGTAATAACAGAATAAAGTCTTACTCTGTT TACAGATATTGTTATATGATTGAGGTATATGTTTCCACCGGTACTTCAGG GATAAAATATGACACTAGTGTGATTCTGCAAGTCCCTGCGTCAGATTGCT CAAAAAAAATTCAAGGCTTGATAATTGCTTGAAAAATATTAGAGCATTTC ACGAATTCATGAGTCACAAACTAGGTATTGAAAAAAGCGTGACTTCTTGG TAGGATAATTCTGACTTCTATAACAAAATTAGCTTGATCACCAATATTTA CGGTTTACCAAAGAAAAGTTTGAAGAGCTACTTGAACAACATTAAGTCCT TGCTTAGTACATAAATCATATTCATGAAAGCACGTTGCAAAAAGAATCAT CAGTAGGGCAGTTAGTGTTAACAGAGTCAGCTTCAGAAATTGTTTATTTC TAAATTTGTTTATGTTGTTTCTAAAAGATTTTTGAGAAAGCAGCATTATA CCTACTAAGTAGTACTCCCTCTGTTCAGAAATATAAGACGTTTTAGCTTT GTGAGTCGAATGTATCTAGGCGTCTTTTAGTGTATAGGTTCTTAGAGGTT CGGAGTGAACCTATACACTAAAAGGCGTCTAGATACATTCATTTCACAAA GCTAAAATGTCTTATATTTCTGAACGGAGGGAGTAATACTTAATAGTGAT ATGACAGCAGAGTTCAAAAGAACATTTAATAAGTTAAGATTTAATTTCTG TGTGAAAATATAACGCTAAAACATTTGCATTATTTAAAGTTTGGAATCTA TGCCATGGTGCACAGAACAATTTGTTGGAGTTTGCATGTTCAGTCATTCA ATATATTACTCCACACTCAAGCACTCAAGTCGTATATCATTGTGATGCAT TATACCATCTTTCTTGCAGTGTTCAAACTCAGAGATTGAGAATAGAATGC GCATCTTAGAAGCACAGGAATCTGAACTTTCGGTGAGATCTCATGCTGCT AACTGTATCATATTTGAGTTTAATAGTCTACATCATCCATTTGTGGTTAA ATGGATATCATTTTGCGGCTGTGTGCAGGGGTCATCACGTCCTTTATCTA TTTATTTATTTTTTGCTTCGTGACTCTATGATAAAAATAAATAAATGTGT TCCCGAGATACAGTACTGAGCTTATGTGAATGGCATATTCATCTCAGTGT AGGTTCAACAGTATTTTGCTCAGTACTCAGTTTATATTTAGTAATAAAAT GACTTATTTTGCAGGAGCTCAAGACAATGTTTCAAGAGGTTAAAGTTGAT TTCATGTCATTGCAGAGCCAATTTCATGATGATATCACTGAATTAGGTAT CTGTGCTAAACCATGACTAGAATACACAATTTCAGTGTTCCAAGCAAACT TTATTTTCAAGCTTTAGCTGTGTAGTATAAGTATAGCGCTGCACTTTAAA CTTTACAGGTCATAATATTGAAGGGCTTTCGAAAGCTGCTCTTGGTTATA ACCAAGCTGTGAAAGAAAACAGAAACTTGTATAACATGCTTCAAGAAGTG CGAGGTATCAGTATAGTTCGGTTTTTTCATCGATGTTAACTCTTTCAATG ATTTCTAAGAGCTATTTTTTAGGAAATATCCGAGTCTACTGTCGGATAAG ACCACTCAACTCAGAGTCTATTTCTTCGATTGAACATATTGGAAATGATG GTTCGATAATGGTTTGTGATCCATTTAAGGCACAAAATACACGTAAGATC TTCCAGTTCAACAAAACTTTTGGGCCAACTACCACCCAAGGTAATATTGG TCTATACTGTACTTGGAAGCACATGTCCTTATCCTTCCAACTGATGCATC TTCATGCTCAAATTTCTGCAGATGAGGTTTACATGGAGACACAATCATTG ATTAGATCTGTCATGGATGGTTATAATGTGTGCATATTTGCCTACGGGCA GACAGGTTCTGGCAAAACTCACACAATGGTATATAGGGCAAAATCATATT TTCTACAGTAACTCCTTATTTGCCTGGGACCATACTTAAGTCACATACAA CTGTTCTTTGTCTGTGCTTGTTGGTGTGGTGATTAGTGCGGCCCGTCTGG TGGGCTATCGTCCAACAATCTTGGAATTAATTACATGGCATTGAACGATC TCTTCACTATATCAACTTCTAGGGAAGATATGAAGTATGATATGCGAGTG CAGATGGTTGAAATATACAATGAGCAAGTTCGTGATCTCCTAAGCGAAGA TACTTCAAGCACGAAATATCCTTTCATGTCTTATGTGCTATTCTTGTTAT ATTTGTTCTAGGGACCAGGGTTACCTGATTTCATAACCATTGTTGGTTCC TGACATTTATTCACATTAGATATAAGGACTTCAACCAATGGTCTGTTCAA CATCCCAGATGCAAAGATGTGCCCAGTTCAGTCCCCTTCCGATGTTATGA ATTTGATGCTGATGGGAGAAAAGCACCGTGCTTCTGGACCAACAGCAATG AACAATAGAAGCAGTAGATCTCATAGGTATGCATCCACATTATCTACCAG GTGAACATTTTTGTTTGATGTCCTTTCAGTGTTTGCTTCTACTGATTTTC TATGTTTTCTTGTAGTATCTTGACTGTCCATGTAAATGGGAAGGACATGT CAGGCAATGTGAGCTGTAGTTGTCTGCATTTGGTAGATCTTGCAGGAAGT GAGAGGGTTGACAGGTCGGAAGCCACAGGAGACAGACTGAAGGAGGCTCA GCATATTAACAAGTCACTTTCTTGCCTAGGAGATGTCATCACTGCCTTAG CTCAGAAGAATTCTCACATTCCTTACAGAAATAGCAAACTTACCCAATTG CTACAGAGTTCATTAGGTATATGACTGAATCTGTGAACATGTTCACCACA TGCACTTGTCTAGCTATGGGATACTAATACTACTGATCGGCCACTTGATC GGTCACTCTTGATGTTATATATATTATCCATAAGTATCTTGCACATGATT AGTAGAATCATAGTGTAAGTTCATGCAATAAAACTGATAATGAAGCTAGT GTTTTTATTGGGAGTATAATATAACAAAGGAATTTCCATCCGACCTTGTT ATGAATTGAGGCTGCAAATGCAATTGTAATATCTTCTAATATTGTTTTTC CCTTGCTGATGACAGGGGGTAATGCAAAGACATTAATGTTAGCCCACATA AGTCCAGAGGGAGAATCTTATGTAGAAACTCTTAGCACACTGAAATTTGC TCAAAGGGTTTCTACTGTTGAACTTGGAACTGCTCATGCTAACAAGGAAA GCAATGATATAAGAGAGCTTAAAGAACAGGTAAGTTTTCCCCATTACCAC CATCAGAATTTATTTAAGCATTATTTCCATAATTTGCTTCAGTCAACCAT ATGTTGTGGCCATCTTTTTACGGAAGTTTTTCTATGGTTAAATTTTATAT TTTCATCACTTCAGCATTGAATGGAACACTGGACTGAAGAATGCAAGACA GTCCCTACAGAATTTTGCATCTCTCTCTGTGTTGTTAATGTCCAATTCAA TTTTTAATGTTATAGATACTTACATTTTACACGTATTTCATTTGTCTTAC AAACAGAAGATAAGTGCATAATTTTCAACGTACTTTCAGGTAGACACTCT CAAAAAGGCATTGGCGACCAAAGACTTGGAAAAATCTTCACTTAAACTGA GGGAAAGTACAGTAACGAGTGAGAGAACAAAGAAACTCCCGGAGCGTACT CTACCAAGGCCACGCCGGTTAAGCCTGGAGAACGCCAGTTGTGGCAAAGG TGGCATACCAGGAAGGGCACCAAAATCACCTATTTCAGTCATGAAGTTCA ACAGAGATCACATGACAACTCATGACAAGGAATGCAGTATTGATGGCTTC AGTCACACAAAGCACCACAGATCAGTAATACAGGTAAATATCGCTCTGGA TTACTTTGTATTGTTTTATGTTGTAGCGATTCATATTTTGTCCTTATTCC TCATTGTGATAAAAGATGCCCCCAACATTATCTGAACAGCCGGTCCGACA GGAGACTGAGAAATTAGTCCCAACAGATAATGTGGTCACCTTTTATCAAC TCCCTCCTGATGCTCACAATCAATACAAGCAGTCAGGTTTGGATACTCCC CAGAGAACACCATGCAGTTCAAGGTACATGAGTGGTGAAGTGAGTCAGAC GGATGACTCTTCTGATGCCAAATTGGATAAAATAACTACAAGCAATGTGG TGAAGAAAGGATCGCATTTAAGAAGGTCCATCCAGAGCAGCATAGGGAAA TTGATTCATGGGTCTGAAAAAAGGTATGCCATGTGATGCATTTTAAATAT TAGCATGCATTTGCAAATGATTATAGATACTATCTGCATACGCACTGAGC GTCTAAGCCTTCTCTGCTGTTGATACAACATTGCAGGAATACTCCACATT CAGCACAAGCAACTCCTGCCAAAATCACTAGTAGTACAAACTATGATGGC CCATCTCCAATTGCTACTAACTCAATGTTAAGGAGAAGACAGTCTTCAAC GGGTCTACCCCCGCCATCACGCAGATCGTCTCTAGGAGGGAAGTCAGATT CGAGTGAGTATCTGGATAAACAAAAGTCTGTTTTGCTCTTATGTTCACAT AATCAATACATAACCGTCTGCCTCGTGCAGAGGATTAATCACTTGTTCCT AATGTCATGTCATTTCATGGAAGGTGTACAAAATAGTCAAATCATTGCAT GTGCTTCCAGCCAATACAAGCCACTGCCATTCTCCTGGGTTCGATGGCCT GAACAACACCAATGTGAATTCTCCATTCTTTCTTAACCAAACCTTTGTTC ACCAGGCCAAAACCACTATGCCCTTTTCTTAGCTGCTTGCATTATATTTC CCCTTGGCTTGATTAAGTCTTCAATTTTGGTACATATACTAAGACCACAT AACTGATTCTTGCCACTGCTTTGCGAGCCTATAGATTATCCCAGGGAGCT TTTATGATGCTCAGAATTGATTTTTTTTAAAAGAAAATCTTTAGATCATG TTGTGCATGTAGTTATAACTGATAGTTCTGTGATGGTCTTCATTTTTACT GAAATATCTTCCAATTTCATTAGCAGGTTCAAATGACAAAAGAGCCAAAA CACCACCTCCGGTGAATTCAGCAGCAAAGGTGAAGAGGTGGCTTTGAATC TGAAGCAAAATCGTTAGGGATTTCCATCTCAAGCAGAGCATTAAAATCCA CCATAGCTTACCAGTCAGAGTTAGCTTCTCTCAAGCCTCAGAATTGCTCA GGAAAGAACACCAGGAGAGGGTTCACAATGTTCAGAGAGCCCCCCCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.