Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009712

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009712
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009712
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCGCGGGATGTCAAGCACGCATGATAGGTGGATCCATCATGGAGAGCC TTTACGTACAGAACCTCGAGTTGAACCTGAACCTAATGAAGAGGCACACC ATGCTGGTGAAGGCGGTGATTTTGTAGAAGATGATATTCCACAAAAGGAT GATGATTTTGAGGAGGAGGATGGGTATGAGGATGACAAGATTCCTGATTT GTTTAAGGATCTGTACAAGTTAGAACCGCAAGGTGATGGACAGAGGACGA TCTATGCCGAGCTGATAGAGAATGCAAAGCGCGCAGCTAGTGATGGTGGG ACATTGTCCAGATTTTTCTTCACTGTGAAGCTACTCCACGTCAAGTCCTT CTACCAGATAAGCAATGTTGCCTTCAACGCAATACTCCATATCTTGACCA CCCAATATCCTAAAAGCTCAATTCCCAAAACTTATGATGAAGCATTGAGT ATAATCGGCAGATTGGGGCTTGGTTATGAATCAATCCACGTCTGCCCAAA CAATTGTATCTTGTTTCGGAACACGTATGCCAAGCATGACAAATGCCCAA AGTGTGATGCTTCTAGGTGGAAAGATGCAGATGGGAGGGGACAGATACCG GAGAAGGTGTTGAGGTACTTTCCTTTGATTCCAAGGTTACAGAGGATGTT CATTTTGAAGCAACAGTCGGAGGATGTACAATGGCACAAGCTAAAGCGGC AACCCATGGATGATGAACTTAGCCATACAGCTGACGGAAAGGCATGGAAA GATTTTGACGATAAACATAAAGAGTTTGTCGCCGATGCGAGGAACATCAG ACTCGGCCTTGCCACAGATGGCTTTAATCCATTTGGAATGAGCTCGAAAT ATAGCATGTGTCCGGTATTGGACGTGTCGTACAATCTTCCACCATGGGCA TGTATGGAGCAGTCAAACTTCATGATGGATTTGTTGATCCCGGGTCCAAA ATCTCCAGGAAAGGATTTTGATGTCTTTATGGAGCCCCTGGTAGAAGATC TGCTCAAGCTCTGGGAGGGTGTCCGTACCTATGATGCCCCGAGTCCTGAT AAGTTCGATCTCCGTGCTGTGGTAATATGGTGTATCCATGATTTCCCGGC GTTGCACACTTTGTCGGGGAGGCTCACGTCTGGTTATCAAACATGCGTGC GTTGTGACCGTTTTTGAATTTTTTATGCCCGTTTCAAACTATGGTCAAAA CGGCGGTCATGAAGGTTCTTATCTAGGGGATGAGCCTCGCTAAACTTGGC GTTGGATCTCCAAATAAATAGCATATTGTGAGTCTAAAAATGATTTTTTC GAAAAATCATGGGCATCGAATCATGTATCTATAGTTCAAATCGGACCCAC TTCCTACCGATTCGGCATGAATTTGTCTTTTTCATCAGGGGTGGATGGAA AGATTTGAGAGGCCCCGGTTGGGACATTTGTACATTTAAGGTGGCCTATT ATTTTTAAAAAATGGGATGATAGCATTTTGAAACTTTTATTTGGTGGTTG CTTCACAAAACGGCCCGTTTTTGCGCTCGGAAAATGTAAAATGGTTTTTA CGTGTGACGAAATGGAAAACTTCCTCCTACAACATTGTTCGCCATCCCAT GATGCACATGTGTGCACAATACAGGCGCATTATCATAAACTATGCCCCAA TTCTATCCATAGCATTGGTCATTTGACCCGAAAGTCATAAAACCTCGAAC ATGAGGTCATTTCGTGAAGGCTTTTTTGATACATACTCAATTTACCAAGT TTGGTATTTTTTTCTTGCAAATATGTCACATAATAAGACACCGCGCGAAG GATTTGCATTGATCGGACCGTTTTTGAATTTTTTATGCCCGTTTCAATGG AAACCTTCGTCGTGACGTCATTTTATATGCACGGTCCGAACAATGTACGT CATTTTATGTGACACGGTGTAAAAAAACTTTGCGTTGCGTTATTTTATGT GACATAGTATCTAGTGGGTAGAAACTTTTTTCACCAAAATTATGTGCAAC AAGAAATGCCATAACCCTTTAACCCCATATATCCCAAAAACCATTAACCC TAAACCCAAAAAATTCTACCGCCCAAACCGATTTTTTTTGCCTCTTCTGC CGCCAAAACCCAATTTTTTTGCCTCTCCCAATTTTTTTCCTCTCCCGTCC AAAACCCAAACTTTTTGTCTCTCCCGCCCACGAATTTCGGGAATGAAAGA GAGACAGGGGTAATTTGGAAAAACTGACCCTACCCCACCCATCCATCCCC ACCCGACCCCGGTCCTCCCCAGTCCCCACTCGACCCCGGCCCTCTCCCTA GTCCCCACCCATCCATCCTCATCCCACACCTCCACTCCCCACGACGCGAG CGGTGACTGCCCCGCGCCGCGTGCTCGCTCCCCCGACGGCCCCGCGCCGC GTGCTCGCTCCCCGGACGGCCTCGCGCCGCACGCTAGCTACCACGACGGG CACGGGCTGGTAGCTGCGAGCGACGACGACGCTAGTGAAGGCGACAACCA CAGAAGGGGAGCGGTCTTCCTCTTAGTTCGACAGTCAGGCGAGTTCTCTG CTCCTTCTACTACCAACCGGTTAGGGTTAGGGTTTGCTTCTCATGGCGTG TCTAGGGTTAGGGTTTGGCTCTCCTGGCGTGTCTAGGTTTAGGGTTTGGC TCTCCTGGCGTGTCTAGGATTCTATGCTAGGGCTTGCGTTTAGCTCTTGT GATTCACAACCAATTTCGGCTATGGTATGTGCTTGCGTTTAGCCCACTGT CTGTAGTTAGATGCAGAGCTTGTTGCTACACACTATCAGTAGTTGCTACT CTCATCAAATCAAGCTTGGTTGTGAATATAAATCTGAATGTGTAGACTCA CATCTTGTGCTTTCCTTTTAATCTTATGTGTTGATTTATGATGCCACTAA ATATAAATCTGAATGTGTAGACTCACACCACAGTAGTTATATTGCTGATT GAATATGTGCATGTTATATGTATGCATTGCAGTTATATTGCTGATTGAAT ATTGCTTGCTTCCATAATGCCATTTATGATGCCCTTTATCTAACCACTTG TTCCCTGCAGGAAAGTGGCAAGTGATTTCTCAAGGTAAACAGAGCTCGAC ATCACCAACCTAGCAGCTTTAATCCAGCCACTTAGAGATAAGCAATGGCA AGGAAGAAAGAGCCTGCTAGTAAGAAATGATCGCCTTGTTCTTATGCTGC TAGTTTTCTAATGACTGTTTGCACATATGCTAAGTATAGAAATTTGTCTA GCTTGTGCTTATAATATGGGAATTGAAAATATACTAAGAGCATGCTGGTA TGAAATGAGCTCCTTGTATGCTGCTAGTTTTCTAATGATTGTTTGCACAT ATGCTAGGTATAGAAATTTTCTTAGCTTGTGATTATAATCTGGTAATTGA AAATGTGCTAAGAGCCTGCTGGTATGAAATGAGCTCCTTGTGCTTATGCA TCTAGTTTTCTAATTGGGTTAATCTACTAGTATTAAATGTAACTAAAACC TGATTGGATTATTTAGTTGTTTGAGTTGTCTTGCTCTCCTATGCATTTCA ACCATTCATCTAATGGCCATATTTTCTCTATTCATGTAAAGAAGCGCCCC TCACTGAGTATGAGAAGTTTAGGGCTAAGCTTATGATGAGGAAAAACCGT ATTCTTCAGTCCCTTGGTATTCCCGCGGTAGTATCAATGATTAGAAGGTC ACGTGCGGGCAAAGAAGGTAGTGCACTTACCACTGAGGAATCTGCCATAA CAAACGGTGGAAGCTCAGATTATAATCCACAGGATGATGAAGTTATGGAT GGAGAGGAAGTTGATGACATTGTAGTGCAAAAGAATGTGAAGGTGGAAAT TCTTTATCTTGTTTGGAGGGGTGGGAGTACTTAAATTCTTTGTGCTTCTT TGTTTATCTTTCATTTCTTGTTACTTGCCATTGATGCTTAATGCCATTTT ACTTGTTTATATGAGGCCCAGAAGTCTAGGAGGAAGAAGAGTGCAGTCAA GAAAGTAAGCAAGAGCAAGAATAGTCAGGAAACATCAACAACAATGGCTC CATGAAGGGTTTTTGCGGTACCTCCTGGAGGAACGAAGAGAATGCTGGAA ACAGAAGAAGAACCTTCTCCTAGAATGACTAGGTAGAAATCAAAGGAGAC CGCTGTACCTAACCGTGAAGAAAGCCCACTGCGCCAGGATGATGTGTTTG TGCCCATTGATGAAGGAAGCTCTCTTCGTCTTGAACTCAGCCCTGTTTCA CATACTGTGGACAGGAATTAGCCTCTAGACTATACTGATTTTTCTGGAGA CCGTGAGGAGGCAATGAATGATGAAGGCAAGTTCATCTTGTACTTCTCTT CTTTTACTTATTCATTGTTTGGAATGTAAAGACAGCATATATGGGTGACG GTATCCAATGATGTTTTAATGTTTCCTTTTCAGGTACTCTTGCCATGGTA AAGAAAGCTGTTGTGGCCAAGAATTTTAGGAAGGGCTCGGGGTTAGAAAA GCTGACGAAGGGGCTGGGAGCAAAGGTGAGGATTGAAATAGCTTAAGGGA TGAAGCGTCCGGTGAAGCCTGTGCAGGCTGCGAAGCTAGCATCAGAGGCA GGACTCATTGTGAGAACTCATATGCCAATTCTTCCTCACTTCAAGGAATT CAAAAAGGACACAAGCCTGGTGAAAGACTACATGGAAAAAGTTGCAGTAA GCTTTCTATGCTGATTCTATGTTGATGACTGTTCTTTCTTCCCTGTTACA CATATCATATGGTTACTAATCTTGCCATTGCCCTCTTTGCTGCCTTGGTA GGAAAACTTTGATATGGACACCGATTCAACTGACGTTCAGGCCGCGTGCA ATGATATCCTAAAGAATGTGTCCAAGAACAGACGTCATTATGTCAAGAAG CAATATTTTGATAAAGTCGAAGCAAGCCAGGTCAGCATCAAATCGCCTGT TGCATACATAACGGATTCTGAATGGCAAAAGCTGGTTGATCTGTGGTCAA GTCCAAGACACAAGGTATGTTAGTACCTTTCTTTACCATGTGCATGCCAC CTGTCTTATTTGCTTTGTTGTATGCAAAAGATGATGGGATGTACCAATCT GCAGGACACCTGTAGGAAGAACAAGGATAATAGAACAAAAGTCAAGTTTG GGCAAAAAACTGGTTCGCGCTGCTATCTAGCTCATGTGCATGCAATTGTA AGATCCACATTGCTGTTTTCCTCTATTTTTTCCCTTCACACATTAGTAAC TTTCTCGCAGAAGCTTATGGTTTGATTCTTGATGAAACATTTTCAGAAGG AGGAAAGAAAGGTTGATAAGCTGTCTGTTGTTGAGATGTTCAAGGTAACC CACAATAGCACCAAGGATGGCTTTTTATAGGAGGCTAAGATTGCCATAGT AAGTCACACTCTAAGTCTGTTTATGGTTTTGTTAATTACTGCATAGTAGG TGGTAATTGTCCGATGAAAATGTTTTGTAATATTTTGAATACATAGGAGG TGGTAAGAGTCTGTGTTGGTGTCTGTGTATGTGTGCACCAAACGCTAGAA GTGTGGTTGCTGTAGTTATTACATAATTCTTGTGATTTGCTCCTAAAAAC CTGTTGCCATATCTCAAATCTTTAATGAAACAGCCATTTATTCAATTTTA GCTGTGTTTGCAAATTTAGTTGTATTCCAAGATGAAATCTGAACTCAATT CTTTGATGAAGTGTTGCCTTTATGTAATGTAATCTGGAGCATAGTTTTTA TCCTTTATGTCAATGTATAGCTGCTATTCTTGTACTTGCTGATAAACTGT ATGATATTGTGTCAGATTGAAATGGAAAAGAAGATGGATGCTGCTGCACC ATAAGGCGAATCGCCCAAATCTGATGTAGAGGTTGTTGCCGAGGTTTTGA CCAAGAAAAGCACATTCCTAAAGAATGTAGGTCTGTAGTCAAGCTCTACT AACAATACTAGCAAGTCGAATGCTGTTGTTAGTGCTCATGTGCTTGATCT TGAAGAGAAGATGCAGAGGTCGGAGCACCAAAACGAAGCCATGAGCACAG AGATGGCTGCCATGAAGAAGAAGGCCGAAGAAGCTGAAGCTACACAAGCC TTGCTTCTCAAAAGGGCCAAAGAGAATGATGCGAGGTATGCTCAGATGTT GGCGCTGCTTTCAAGTAAACCTACAGGGAACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.