Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026680

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026680
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026680
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATGGCGACTTGGCGATGTTCCAACTTGATATGAACTTACGTATAGT TTCTAATTCGTGTTCGGTATATGCATATGCTGGATTTGGTGAATTTGAAT TAGAGAAAAAAGTGTTCAAAGCGATCATATGTCAAACTTTCCATTTGTGG CATGCAGTGTGGCCTAGCAAATGAGCCATAAAATTATAATGGTACTCAGC AAAGACACGTTCCAGCGGTGTGTTTTGGCAAACTCCAAAAAATAACGGTG TCCTCTAGCAAATTTTCCCTAATATTTATTTACACTTTATTAAACTTAAA TAAATATGGTTATATTTTTCTTAGGTGGATATTATTTTAATAAACATTTG GATGTATTAAATATATTTTTAGGATTTTCCTACATTTTTCTACAGCTTAG AATGTGTAGAGGGTATTTTAATAATTTCCACTTTTCTTTTTATTTATATT GAGCCAAGTTCTTGGGCCCTTCTAGCCCAATACCCAGCCCAGTCCACATG GTTGGACTAGGCCACAAAGCCCAACCGATCGAGTCGGTCAACCCGACCCA TACGATCCCATCCTTTCTCCCACGCTGGCTCGTTCATCACCTTCTCCCTT TCTGGCGACGTGGTGTCGCCGCCTTCACCGTGCAACCATGGCCGGCCCCG GCCTCCTTGGCCGCCGCCATAGGTCGCCCTCGATGCTCCCCTCTCTGCTA CTCCTTTCCATCCAATTCGATATGTGATACGAACCCTCTTTCGCTCGTCC CCGCTACACTCCCGTGGCTAGGGTTTCGGCCTTCATCTCCGGTGTGCTCC GGTGACTCCTGGATGGTGACGGTGGTAGAGTGGTGGTGTCCTGGTGATGC GGAGAGGGTCTGGTGGTGGTGTGCTCGTGGTCGCTGGCCACAGTTGCTTG CGGTGACGAGCTGGTGGTGCTGATTGCCGTAGGTTGCAACTTGGCGCAGC TCGGCGCGGGGTTAGCACTTGGTGCTCTCTATGCCGCTGTGTCGCTGCTT AGTCCAGTATGCCTTCTCTTCGGCGAGCAGTAGCTTGCCAAAGGTAGGCA TTCTTTCCTTGCCTCTCCTCTCTTCTCATTATTCTACGCTGGTTCACATA CATGGTGATGGATGGATGCCCCTTGCTGGTTATTAATGATTGAGTTGTTA AATAATAGTCTACTATGCCTCTGATTTGAATATTATCAGTAGTAGGAATT CCATATTGAATAAACAGAGATGATCTCTGGTGGTACTGCCTTAAGAAAAT GATCAAACATCCATGCTATGGTTATGACAGTGACATATTGTTGCTCTGTT ATTGACAAAACTGAATGCTTGTCATTCAGTTCTAACCATCCTAATGTGTT CCATGTGCTTTTGAAGTACTTCTGTGTTGGCACAATAAGAATAGATACAA GATCTTTCTAAGGAGATGATTATTTAAGTTGAAACCTTGTGACTGCTAGA TTTGCTTGCTACAACCAATTATGAATCATGTATGATAACTGAACCCGTGG TTCAGAGTTTGTTCTTGGTTGAGTTTAGAGTGCAGTGATGATTCTGAATT TACATTGATAATGTGATACCTACTTTTCAATGATTCCTAGGTAATGGACT AGGAAAATGATTAAAGTTGTTACCCTGCATTCTAGTAGAGATAATATGGT CCTTTTAAGTTGAAAGAAACTTGATGTACCCTTTGTTGACAACTATACTA AGCTAACCTAGGTGTTGTGGAGCCTCCATCTTGGAGTGTGCACAACATCT GGTACAATGTAATATGACTTTCTATGAGCATATATGGATTTGGGTAATTC TAGTGACCTCTTCTGATCGCCTAGAAATCCTTTAGTTGCAGGTCAGTGGA ATTTGATTGCTTATACCTTTGTGCATAATCATGTGTGTGGCTATCAATCC TTGTGGGATATGACTTGACAAAATCAGATGGTGTAATGGTACATAGGCCC TGCCATTGATGCAAATATTGAGGAACTGATTTGGATAAAGAAGGACAATT ACTTTTACTTGGCTAATTTCCCTGTGATGAGTTTTGGGGATATGTATTGG CTGTCAATCAGACAGCATAAACAAATATGATTCCTAGTATGTACTAGGAA ATGATTATGCTTTTCCTAAGGAGATTTTGTAGAGTCCTTCTAGTAGTGTA TATACCACTGTGGTACCTCTAACTAGAGTGGCACAGTAGGTATGTACTTA ACCTGGTTTGCTACACTCAATCTATGAATATATGAGATTGAGATAATTTA TTAGATATAATTTATATGGGATTTTTGGGGAGTTCCTGGCTAGTGATGCA AAAGACTGAGGCCTTGATTTATGTAGGATAAGAACAGATGCTGATATTTG ATGGCTTATAATATTCTGTAATGATCTTGCAAAGCAATTCTTTGCAAGCT GAGAGTAATATCCTCACAATCCCAAGGCTTGGCATTACATATTGACTTAT TGTCTGGAGTCTACACATGGTTAATTTTATGTTCTTGTCTAAGAGCTTAA GATCTGATGGTTGCTTAGTTTTATTGCATTTGTTCCCATGTGCTTCTGCT AGACTGGATTTACACCTGTGGTGCATCACCTGAGTGTGCATAGTGTAAAT ATTTGTTTTAGCATGAATTGGTGATGTTGGTGCTTATGCTTGTAAAGAAA CAGATCTTGTGATTTCAATCTTATATTAGTGTGATGTCACACTACTGCAT ATAATGAAACCTCTTCCCATACACTCCTGCTGGCTTGGTGATGAATATCT ACCTGGTATGGAAGCTTGATGATGTTGTTCCTAAGATTTATGCTTGATCA GCTGTCTCTTCTTATTCCTGTGCTTAAGCTGATCCTCCTTGATCTTCTGT TGGCTTGATTCTAATGATGGACTTGATCTTGATCTTGTTCTTGACAACTT CTCCTCCTGACTTCAGATTCCTACTTATCCTACTCCTACTAGCTTCTGCT ACATATCTTGATGTAAGTATCCTGTGATATTGGTGATCTTTTGGCAGTTT ACTTCAGTGGATTTGGTTTGTGTGGATGAATGAAGAAGTAGGGAAGAAAT GATAGTGCTGTTGACTTGTGAGAGTGTAGGGAAAGGATATGGTAGCAGCT TTGCCACGGCTGGTGCCTTTTGCTTATGTACTTCATGTGCTAGCTGTGGT GTTGACAACACAACAACTGCACGTGGTGTGTGTGCTGCCTGTTTTCTTAC TCACTCTAGTGGATCAGATCAAGTAAAATATCTTGCTCCTACTTACTTAC TTCCATTCTCTATGGTGAAACTTGCCCCTTTTGTCCACTGCCAATGAGGT TGTTCTGAGGCAAAATTTGCAATAAGAACAGATACTATTTCATTTGGTGA AACTTGCCCCATTTTAATATGCTCAATGATGTGACAAAATAGTGCATCAC ACTGTTACTACTGAGAGCACTAATACTAACCCCTAATCTTTTTTTGTTTT TGTTTTATCTTCAATTAAATTTGTTTTGCAGGAATCAAACGATTATCTAG GAATATCAAGACTAGATATAGGAGTTGTAGTTTAGATTTGAATTACTGTA ATTTTCTTATTCTTTTGTAATAACCATGTAATTCTTATATATTTGATTAA AGTATTTCTTTTCTAACAAGAAATTATGTAATGATATTTTAATGCAATAA TTTATATTATTATAATTGTATCCATCTCTTATTATTCCTTTATTGTAAAA GAATAATGGAATATATATTATTTTAATAAAGATTTTTTCTACTTGTTTTA ATTATTGTAATTCATTTTCCATTTTCTTTATTCACTTATTTGTTTCATTG TAATATTCCTTTATTCTTTTATTGTAAAAGAACATTGTAATGTTGGATTT TAATAATCTTTATACTTTTATTTATAATACTTGTATTTGTATTATTGTGA GTAATTATTTAGAAGTCAAATTTCTCCCCTCATAACTCAACAAAGCAATA GAGGTCATGTAAAAATTCATCCCACTCCCCTTTTGATGACACTAAACCTA ATTCGTCAGAGTAAGAATTTTGATCACTTAGTCTTTTTATTTGGCGAAAA ATTTATCCGGATTTTTAGATGCATACATGCAGATGCACAAAATCCTAAAT ATATCCTTCGTTTAGTCCTAAATGCTGGGATGTTACACATGGTTCCATTC CACTGGAATAGGTTGGTTATGTTCTTGTGTTTGGTTGGGACAAAAAATGT GTAATGGGGAATGGTTCCATTCTATGTTCAGTTGGGCCAAAAAATGGAAT GGAATGGTTACGTTCTATGTTTGGGTGCATTTAGCAAAAAATATGGCAAG GGAATAGAGAGAGTGAGATCATTTAGGTGACTTTAGCATAGAGGAACAGG TAGATTCCACCAATTTGGTGGAATGAGTGTATTCTGGATCTAGAGGGAAT ATTCTCTTTTGAGGAACCACCTCATTCCATTCTATTTCCCAACTGAACAC TAGAACGGTTCTCAAGTGTGGAACCATTCCATTCCATTCCACTTCGTGAC ACCAACTGAACACACCCTTATGCAAAGGTCTTTTTATAGTAAACAATGCG TATGACCTGACGAGGGATGAGGTTTGGAGGACTTCGACACCGTCTTGTAG CTCAACTCCTGATGGAAATAGGCTAGTATGACACCTCATATGGAAGGCTG GTGTACCTCCTAAGGTACAGAATTTTGCCCGACGCCTTGACACTGATTCT CTCCATACCTGGTCAAATAAACACAAACGTACAATTGATCTGTCAAGTTG CTTTTTTATTTGTGGAACGGAACCAGAGAATAATTTTCTTGCTTTCTTCC AATGTACCTTTGCAAAAAAAATCTAGGAGTTTATGCAGGAGAAGTGGACT CTCCCTGGTTTGGAATCCATAACATATAATGACCCAGATTGGCCACTAAA CCTATTGCCAAATAGGATACCATGTATAGAACTTTGATGACTCTTTGGCG CATATGGTTTATTTGCAATGAAGTTGTGCATGACAAAAAAAACTCCACCA AAGGAAGTTCCCTGACAATTCATTATGAGCTACGTGGATTCTTTGCTCCA GATTAAGTATCACTCAGCATATGATAATGTTCAAGGTAAATTTGGTTTGG TTGTGGTTGATGAAACCAGGACTAAGCCCAAGATCACATGTGATATTGAT TTAAAATGGGAAGCTCCTCCGACTGGCTGGTGCAAAATAAATACAGATGG GTCGTTCGGTGCTGATGGTTCTGTTGGAGGGGGTGTAGTTCTTCGCAACA ATTTGGGTGAGATTATTCTGTAGAGGTACCCTTGAAGCGGAGATATATGC AACAAAGGAAGGTATGAGACTAGCCTTGAGCTGGTGAATCAACCTATGAT ACTTGAGATGGACTGCTTGGAGCTTATTAAGATCATGCATGATCATTCTT TGGATCGCTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.