Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023988

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023988
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023988
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCTGCGCTGCGACCCTCGTTCTCGTCGGCGACGATGGCCATGAACAA TAGCTGCAGCACCATCAAGTTCCCCAAAACTGCACTTCTGCCTGGTTTTG GTGGTATCGCTCGCACTCAAGACGTGCAGGACAGGAACGCTAGCCTCACC TGTTCAAGGCCCAAGGCAGCCTTAGTGACTGACCAGTCTGTAGCAGAGCC AGCAAAGACCAGGCAGAAGAAACACACTGTCGATCCTGCTGCTCCAGAGT TTCTGCCGCTCCCAGCGTTTGAAGAATGCTTTCCACGGAGCACCAAAGAG TGCAGGCATGCTTCCTGTTTTTTGCTTCATCTAGCTACTCTACTCAGATT GCCACCATGGTTAGGTTTCAGTATATTGATTATGCCTTGTATTTTCTGTG GTTATGTTCTGCAGTGAAGTTGTTCACGAGGAATCAGGCCACTCCCTCAA GGTTCCATTCCGGAGGATCCATTTGACCGGAGATAGTGGGCACTTCGATA CATATGACACCAGTGGTCCACAGAACATAAGCCCGAGGCTTGGTAACTCA CTAGCCTCATCTTTCTTGCCATGTTTTTGGCTTAAGATGTTTAAACTGCT TTTACTCTTTAAGTCGTAACATCTAGACCAGCTCTTGAGTAGAAACATAG ACAGTGTGTTCGCTCTGATAAAACTATGCATTTGTGCTTACTATTGGTGC CTTGCTCTGATCTGTGCGAGAATTAGTTCAATAGTACACGGTTCCAACAG TTGGATGGTTCCAGTGCCTGGTTTTGAGTTGAGTGTTGATTTCGCACTTG AAAAATAGTTGAAGAGGCAAAATAGGCTTGTCACGTTTTTATGGTCATAT ATCAAATATCACTCTAGATACTTATGTGATAAATTTAGTTGTATCCATAC TGTACCATTCTTAAGTCTTAACTAGCTGAACCCTGGTGCTTTGATTACGA TAAAATAATCATATTACCCTACTTAGCACATCAAGTCATCTTATCAGGCT TGGTTGGAGGTGTTTTGTTTCCCTGACTTTTTTTGTGGATATTTTGTTTG GAGATGGAGGGCTGAATGAACTTCTACCTCCACTTTTATAGTAGTAAAGA TAAAGATAGATTCAATTAGAAAATAACAGAAATGTTAGCAGCGCACAAGG TTATGGTCGTCGTGGTATTGGATCGTCCTTAGGGAAAAAAAGTAGTCAAC CCTATGTACCCTCGTTTAAAGTGTTCTAGAATAAAACAGGAATGTTAGAT GGTTAAGTATCCTTGGAGATTTTATATATATAAGTTTCATCAAAAAATTC AAGGTATATATTTTTGTTCATCTGAAATTATTCAGATTAGTTTTCTTGCC CCAATCTTAAAATTCAAGGTATATACTTTTATTTATAGTAAGTTCATTAC ATTTTACAGGACTCCCGAAGATAAGGAAGGAATGGATTGACAGGAGGGAG AAGATGGGCAGTCCTCGATACACGCAAATGTACTATGCTAAGCAGGGAAT CATAACAGAGGAGATGTTGTACTGTGCCAAACGTGAGAACCTCACTCCTG AATTTGTCCGGTCTGAGGTCGCCCGCGGACGAGCCATTATTCCTTCAAAC AAGAGGCACCTGGAATTGGAACCCATGATTGTTGGAAGAAACTTCCTGGT AAAGGTGAATGCAAACATTGGAAACTCAGCTGTTGTGAGCTCCATTGAGG AGGAAGTCCACAAGCTCCAGTGGGCCACAATGTGGGGAGCTGATACTGTC ATGGACCTTTCAACAGGGCGCCATATCCATGAGACCCGGGAGTGGATTAT TCGTAACTCTTCTGTTCCTATTGGCACTGTTCCTATTTACCAAGCACTTG AGAAAGTTAATGGTATTGCGGAAGATCTGAGCTGGGAAGTCTTTAGGGAA ACTTTAATTGAACAAGCTGAGCAGGGTGTTGATTATTTCACAATCCATGC TGGTGTGTTGCTTCGTTATATTCCTCTTACAGCAAAGAGAATGACTGGCA TAGTTTCACGTGGTGGATCGATCCATGCAAAATGGTGCTTAACTTATCAC AAGGAGAACTTTGCTTATGAGCATTGGGATGACATTCTTGACATATGCAA TCAGTATGATGTGGCACTATCAATTGGTGATGGCTTGAGGCCTGGTTCTA TTTATGATGCAAATGACAGTGCTCAGTTTGCAGAACTGCTGACTCAAGGG GAGCTAACACGCCGAGCATGGGAGAAAGATGTGCAGGTGAGAATAGTACA AATAAAGTTGGACTAAATAGAGTTGTTTCCTTTACATATCAACACAATCG AGTATACACTGTCGCGGTTTTATGTTACTGCTTTTATTTTCCAGTGATCA ATAACAGGATGTTCTAACTAATCTTTAATTATGCAATCGAACTCTGATAC AAATTCCATGGACAAGATTATTAACTAGGTTATCCATTCAAAAATTTAGC ATGAGATTGAAGTGAATATTTCAAGTAACTTGTGATAAGTAGAAACAACA TTTTGTTTTGCACCACAACCGAATATGGTTGCCAGGTCGGCAGATTGCAT ATTGAGCATAAAAGGCACCACTTTTAACAGGACATACATTAGCTGTTTAT AATCTGATCATTTCTATGCCCATGACTAATGTGCACACTGCCACTTTTAT GGAACAGTGTATAGGCAATGATATTCACTTATAGCGCAATGTAGCTTAAG TAGCTTACCTAGAAATTAGTTGTCAAAAGACAATAAGTGAGAAGATATTA AAGATGATTTCCCACACTCTTTGATTTCCAAGTGCCCCACAATGATGAAT TATTTTTATTTGCCCTAGTGGCTCGATAGTTAAACTTGGAACTGTATTTT TTTCTGAATGGTGAATTGTTTCTATCTGCTTTGTAACTTGGTCTTTCTGA TATTCCTTCACTTGTAGGTGATGAATGAAGGTCCAGGGCATATTCCGATG AATAAAATTCCTGAAAACATGGAGAAACAGCTGGAGTGGTGCAATGAAGC ACCTTTCTATACATTGGGTCCATTGACAACCGATATTGCACCTGGTTATG ATCACATTACCTCAGCCATTGGTGCTGCCAACATTGGGGCTCTTGGCACT GCACTTCTTTGTTATGTAACACCAAAGGAGCATCTTGGATTGCCTAACCG TGATGATGTTAAGACAGGTGTGATATCCTATAAAATTGCTGCTCATGCTG CTGATTTGGCAAAGCGTCACCCCTATGCACAAGCATGGGATGATGCATTA AGCAAGGCAAGGTTTGAGTTTAGATGGTTGGACCAATTTGCTTTATCTCT GGATCCAGTCACTGCTATGTCTTTCCATGATGAAACATTACCATCTGATG GTGCCAAAGTAGCACATTTCTGCTCGATGTGTGGTCCCAAGTTTTGTTCG ATGAAAATCACCGAAGATATTAGGAAGTATGCTGATGAACATGGTTACGG GACAGTAGAGGAAGCTGTGAGACAAGGAATGAGTGATATGAGTGCTGAAT TCTTGGCTGCAAGGAAAACAATTAGTGGAGAACAACATGGTGAAGCTGGC GGAGAAATCTATGTTCCAGAAAGCTACCTAGCTAAAAAATAAGGTCAGTT TGTTTTGTATATGATGTAAAGTTGTCATGCGAGAGAACACACATGAAGAT TTTTTTCTTTGAGATACTATACATTATAATAAGATTTTAACCATATTGGT AAATCCTTTTAACAGAAAATAAAGCATGCTTCATACTTTGAGCCACATAT TATTTTCTTTCCTTCAGATAATTTTCGTGACCATAGATAACTCATTTTGA CCTCATTAACTTGATCATAATTACATTGCATGATCTGCTCAATCATTGTT CTGCGTTGCCATGTCATACAATGTTGGTTATTTTTTTCCCACAAAAAGTG AAAACTTTTCTAGCACTGAGCAAACTTTATCTTTCTTAAAAAGACCTGTA TGGTTGTAAAGAAGCAAACATTTATTAGAACATTAATGTGGTTGAATGAT CCGTTCATTAATTTCGGAGCAACTACATGCAGGTGTACTTTGATATCATA ATGTAATTCTGTTGTAGTGGCTTATTTTCCCTTGTTTCTGTTGGTATGAA TTTCTACTTGTAATTTTAGGGCAGTTAATATACCATTTTGAATTGTATGT CATACCGTTCTGAATACGCATGCGTTTTATCTCTCTAATATTTTCTCATA ATTCAGAAATACAAACTTTGTGCAGATCTCCCTGAGAACCGTCTCTTCCA GGTGATGCAGGTCTGATGGCTAGGATGTTTGCCAGCAGCACTTCTACCAT CCTTTGTTAGGAGGTGGTAAGCAGGATATATGCCTCAATAAAGCTGGTGT CACTTAGCTTCAGTTTTTTAATGTCGTTATGGATTGTAATAAAGAGAACT CTATTGTCCTCTGTTTTTTATATTTCTATTTTTGTATCATTATGGGATTG TTAGTGATGAAAGTTGCACCAGGGGTGCCCGTATTCTCAACAATCTGAAG GGCCCTTGGCCTGGATTGTTGTGATACGGGCTGAGAAAGTCCCTTTGAAC CTGATCAGGATAATGCCTGCGAAGGGAGTGTGCATTTCTATTTTCATGTT TCTCAGGACACACTCAACCCTCGACTTTCCGGAAAATCGAGGGACCATAT TTTCCTGAATGTGTGGAGCCGCACCAACTGGATATGCATGTTTCTTACCT CGGAGGTTACATGGTAATGTACATGTTTTCTTGAACCAGTTTGCATATTG GCATTTTTCCAGGAGAGAATCTTGGGTATTTATCATGGCTTGCATGTGAT TTAGTCACACACTTGATCGATAGAGCCAAACTTCAGTGCGGCCATTAAAT CTTGCAAAGTCACTATGTCATGTATAATGTACTTCTACACCTATCCATCT ACATCTTTCTTTACTAGAAGTATAGAAGTGTGGCCTGCACTCTGACTGTC TTACAGATTGGATCTTTTAGGCGCATGCCAACTGTCAATTGGGAATAAAA GTACTTGATTATGTGAAATGTATCTATTAATAACTGATTATGTAGGATGG CTAAGATACATTTTAATCAACTATCGTTTTGTTCTTCCCATTGGAATTAT CAAATGTAGCAAGTGCATCATGTGGTTCAATACATCATTGTTTCTCCATG GACACTTAATAACATGTTTTTTTAAGGGGAGTTGATAACATGTTAATCTT TCATGCATAACTGTGTATATACATTGTAGAACTTGGCAGAATTATTTAGT GCTGGAATGGTTTATGACAACAAATCTCCTCCCATAAGTTTAGGAATTTC ATACATGTTTAGTTCTCGACGACAGTAAAGGATACTAAAGAAATACACTC CTATCAGCCATACTAGTGTGGCAAAAAACTTAGTATATACCCCATACTTT TATCCTTGCGAAGTCGCTTTTGTATGGGTGGAGAACATGACTTTATTTTT ACTCGCTTTCTGTATCGGTGGAGAACATGACTTTATGTTTACTTCGGTTG TTTAGGCATCTGTTTCCTAGTTGACTTGCCAATCTACCTTTTGGTTCATG ACCCAATTACCTTTGCTGAAACGAAACATGCTCGTGGCTGGGGTCTTTCT AAGATGGCAATGTCCTTCGCTTATGTTCTGATTGCGCTAGTACTACCTTG TTGAACTTGGATTGTAACAAAACTGCTCTATGAACGGCACGTTTTATGTA ATGTTCTGGGCTCTGGGCTCATCGCTACGATTCTCGCACTTCTGTTATTT CGTCCTCAAAGCGCCGTACTTCTTTTCACTGTGTAAAGGGATTCATTGCA AGTTCAGATGTTAACTTGTATACATATTTTGACGTTGGACAAGGCCATGT TCCTGTATCGATTTATCTACTTTATTATGCTTTGTGTATTGATTTTTTTT TTTGCTTCGTTGAAACTTCATCCTTGAGAATAATAGGAATATATTTGAGA ATCTGCACGTTTGTCCTGAAATCATACTGTTTTTTCTGGAAAAAATTCTC CGGTTACATAAACATACATGCATTGTGTGTCAAGCACGATCCTGTCCCTG ACCAATTAGCTCATCTGTCCACGCAACGGCAATCCCAGTGCAATGGCATC AGCTGTGTATAAAATCTGTTAACGAGGCAAAATATTGACGTGGAATCATA GTAGGTATGAAAAGAAACACGGTATCTTGTCTTAATCCAGATTCCACTGG TGTGACTTTCAATGATTATATTTTTTCAGTCACAAGAAAATTTTAAGAAG ATGGCAACTCCAAGTTGAGCTAGCATGTGCTCTCGGCTTGAAATGAAAAA TCTACATAGTGCTTTGGTGGAATCGGTGCAGTTATATGAAATTATAAGAG TTTGATTCCCAGAATAATAGAAGGGCAGTGAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.