Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022306

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022306
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022306
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCATCCAAGGTCGCGCTCGTCGTTGCCCTGAGTCTCCTCTCTGCCGT CGTGGTGCATGGCTGCGGATCATATTGCCAGCCACCGGTTGCGGTGCCAC CTCCACCCGTCGCCATTCCTCCGCCGCCATACCTCCAACCACCAGTTGTG GAGCCGACGCCACCTGTCGCCGTTCCGCCGCCGTCGTACCTCCAGCCACC GGCTATGGTGCCGACGCCACCCATCGCCGTTCCGCCACCGCCACACCATG GAGGAGGAGGGCACAACCATGGTGGGAAGTGCTCGATCGATGTGCTCAGA CTAAGGGTGTGCGCCAACGTTCTCGGCGGACTGCTCGGCCTCCTCAAGGT TGGAATTCCGGCCTACGATGAGTGCTGCCTGCTGCTGCGGGGGTTAGTCG ACCTCGACGCCGCCGTCTGCCTTTGCACAGCTGTCGAGGCCAACGTCCTC GGCATCGTCCACCTCAGTGTCCCTTTGGACATCACCCTTCTCCTCAACCA CTGTGGCAAGACGTGTCCGTCCGATTTCACTTGCTAGGCTCATTAACAGA CATATTATTGCATGCATGGGCGCCCAATAAGATTTGATTTATTCATACTT TGTTGTTAATTTCATGAGGTGTGGAATTGTTCCACTTCCACATTTGAATT GCTGTAACCAAGTTACTCCTAGTATTCTTCATGCAAAAGAAACATGGATT GTACACTTCGTATTGTCATCAATGAGTAACTTACTCTAGTTGTCGAATTT TAGTTTTTCTTGAAAAGGGCAATGGGTGTACAACTCTACTGCCTGCTGGC CCACCCACATCAATCGTTGTCGAATCGTATACTCAAGCGTGTTGCCATGC GAGGAATATATTTTGAAAATAGAAAGTGTGTAGCCCCTTCCTTGCTGCAT AAAGTCAGTAGTTTACCATGTACTCAAACACACGGCAAAGGATATTTTCC ACACGGTAAATTATTTGCCGTATGTTTGCTAATAGCAAATAATGGACATC AAATCGTCGATTCGCCAAGAGCATTCTATCATGCTCATGGCAAAGGGCTG TCCGGGAAAATAAAAACATGGCGAACAAGACTTTGCCGTGAGGTCCACTA TGATTATTGGCAAAGGCCCAATGGAGGGACCCACTAGCCTCAAACTTTGT GGTGAGCTACCTAAGGCTAGCCCAATAGGGGTATTATAGGTGGTATCATG TATCACATGCATGTAGTAAAATGCTTAAACCTTTTCTAATGGGGTGTATC TTAGCACGTTTTTATAGGAGCTATTAAATCTTAAGAAATAACTATCACAA TAGGGTGTATCTTAGAGATGTTGTATTAATAATTTTGTGCTCATGCATGT GTGTGATTGGACCAACCAAGTTTTTTGCCTATGATAGCGATACAACACCC TTCTCTTTTATCATTAAAAAGGGTGCCGCATAAGCATTTTACATAAGATA AAGCGCTAAGACATTTTCATTGTGAAAGGCCTTAGAGCAAGGGCAATAAC GTAGCTGGATGCTGGCTACAGGCTCATGCCAACTCAACTAGAGCCATCAT AAAAAATCTTTTCATACAATAGACAGGCTTTTAGACTTACTCTTGTTGAA TATTCAAATATTTATTGTTTGCATGTTTGAAGATGGGCCAGCGACACAAA AATCATGCATGTGTTTAGTGCTATCATTAGGCTGCAAGCATGCGATAGTC AGCTCGATTTCTGTGTATAGCCCGGCGCTTGATATATCGCCGGCTCCCTT CTCTCTCTTACTTTCTCTCACCTCCACCTAAGAATTTGCTGACTTGGAAT ACCTTATAGCCTGCTGACTAAGACCTATTATACTTGCTCTTATGTGTCAT AGCAATTAATAATAAAAAAGATTGTGTTGATATCATAAGACATGGTATCA TAGCACATAAAACTAGAAAAACTAATTCCAAACAAATCTTGTCCATAATT TTACATTGGGTTTCTACAAAACAATAAATACACTAAGACTATGATAGTAT GCATTGTGAAGATGATATCATATACTAGTATCATATGCATGATACTACTA TATGATACTCTCCATTGCGACTAGTCTAAGGCTAGTCATAGTGAGAATAA ATTAGCTAGTAACATACATGTACATCTAATGCCAAGTAAGCAAATTGGTG ACATGACATGATAATTATAATGAAGAAAGAGATGAAGATAGTAACTTAGC TAGTTACCATAACATTACATATACCAAGACCATATGAGTCGTCCCGGTTT AAAAGACACAATCCGAAAATATTTAGACACAAAAGCATTTAATCTCTGTA ATTACTCCGGTGTGAAAAGAACAAAATGCTTGCATGCACATGTGTGAATA AATGTGAATGCTTTGCATGCTCTTTTTTTTCTCACGCATGTTCTTCTCCA CACTATAAAATAGACCAATTACTGAATAACTAGGACCTAGAGAATTGCAA ATTGAGTCCTTTAAACCGAGACGGAGGGAGTAGGTGCTTTGCCTATGTGG CATGTCATTTAACAAGAAAGATGGTGTTGGTATATATCTTAGATAAGATA CATCCCTTGCACCCCTTGCACGGTATCATAGGAAAAAATTGGCTAGACCA ATTACACATGCATGAGACTAAAATCATTAAATACAACACCACTAAGAAAC ACCATCTAAAAAACAATGAATTGTCATTGTTGTTTCTTAAGTTTTAATTA CTTCTATGAAAACATGCTAAGAAACACCTCTAAAAGCTCTTGACAAACAT TTTACGCACGACACAAATAATTATAATTTTCATTATAGGAGAATTCCTTA CAAAGAATTATTACTAGGCAATAATGTGCTTAGATTACAATATTAATGCG AAAAGTAAATAGACCAATAGTGGGAAGCGCCAGTTAGCGGCCAACGGCTT TAGGAACTCGGATCCAGGCGGGATCTGACTTTGCGGGAATCGGCAAAAAC ATCACCATCGGTCGCGTTTTGTACGTCGATGGTCTTCCTATCGTCCCCAA CAAGGCCGCCCTTTCCTGAGCTAGGGTTCGCAGCTTAGGGAGAAGCAGAG GAAGCCATCGCCGTTGGCACCACGCGGGCAGCTAGAGGGGGTTACTGAAG GGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGACATCGGGAGAGGAGGGGAGCCCCC GGTAGCCTCGCTGGTGAGGCGACCAAGGGGTGAGAGCGGGGTGCGTGCGT GCGTGTGTCAAGAATCGTTTATTTCATTCGTTTGGCGGTTGACCTCAGTC TCTTACTCCCTCCCGTAAACATTTCTTTTGTGAGAGAAAATAAAATAAAC GGTAGCCCATGTGGTTCAGCGGTATCGATCTCACCTCCCATGTACGTTTC ATGCATGCACAAATGATATATCTTCTCCGTCTTAAAATAGATTTTAGAAA GCTGTCTAAATTTAAATATATCTAAACATTATTTAATTAGTATTAAATAT ATTTAAATTTAAACAAATTTGCAACATCTATTTTGGTATGAAAAAAGTAT TCCCTCTATTTCATAATGTAAGATGTTTTACCTTTGTGAAAGGAGTATAT CTCACTTCGAACCTATACACTAAAAAGGTTCATATTCACTCCTTTCACAA ACTAAAATATCTTATATTATAAAACGGAGTAAGTACTTCCTCCGTTTCAA AATATAAGATGTTTTAAATTTATGAAAAATATGTATCTCTAGACTTATTT TAGTGTATAGGTTCGTTTTAAATAAGTTTAGATATATTTTCTTCACAAAA TTAAAATATTTTATATTTTAAAATGAAAGGAGTATATATAAATGATATCG GCTTACCTTCCGGTGGCTATGCCGGACACCACTTTTCTTTTTCCTTTCTC TGCGCCACGTACTGCTTATTTAGGGCCTAAGCGGTTACGCCACATGCTAA AATTCTGTCCTTTCACACTAAAATATGATTCGTTGCATGATAAGCTTCTT TCACTGTTCATTGGTGCGTAACGTGCATGAAACATGCGGGATTGCTAGCT CAAGCTGTTGCATTATCGCCAAAATTCCATGACAACTCCCTCATGCCAAA ATCTTGCCATATCTCTCTAAAACAACTGGCGCATCATGCAGGAACGACCG AGCAATCCTGGAACCGATCGACTCACACCAGCTGGCTGGCCACACCTATG ATAATTGATAGGTAAGCTCGATCCTATGCTAAACAACTCCATCTCACCGG ACTATAAATACACCACTCTTCAAGCTCGATCTCCCGCATCCTAAACCAAC ACCACTCGAGCCAAAGCTGCAGCGACTCGTGTACGCACGATCGATCACGA TGGCATCCAAGGTCGCGCTCGTTGTTGCCCTGAGCCTCCTCTCTGCCGTC GCGGTGCACGGCTGCGGATCATATTGCCAGCCACCGGTTGCGGTGCCACC GCCACCCGTCACCGTTCCGCCGCCGCCGTACCTCCAGCCACCAGTTGTGG AGCCGACACCGCCGGTCGCCGTTCCGCCGCCGCCGTACCTCCAGCCACCG GTTATGGTGCCGACGTCACCCATCGCCGTTCCGCCACCGCCGCACCATGG AGGAGGAGGGCACAGCCATGGCGGGAAGTGCTCGATTGATGTTCTTAGAC TGAGGGTGTGCGCCAACGTTCTCGGCGGACTGCTCGGCCTCCTCAAGGTT GGAATTCCGGCCTACGATGAGTGTTGCCCGCTGCTGCGGGGGTTAGTCGA CCTTGACGCCGCCGTTTGCCTCTGCACCGCTGTCGAGGCCAACGTCCTCG GCATCGTGCACCTCAGCATCCCTCTGGACATCACCCTTCTCCTCAATCAC TGTGGCAAGACGTGTCCATCCGATTTCACTTGCTCGGTCCAGCATTAACA GACATACTATTGCATGCACTCAGGCGCCTAATAAGATTTAATTTATTCCA TACTTTGTTGTTAATTTCATGAGGCGTGGAATTGTTCCACTTCTACATTT GAATTGCTGTAACCAAGTTACTCCTAGTATACTTTACACAAAAAAATATG TATTGCACACTTCGTATTCATCAATGAGTAAATTACTCTAGTTGTTGAAT TTTAGTTTTTCTTAATAAGGGCGACGAGTCTACAACTTGATGCCTGCTTC CCCACCCACATCACCTATTGCGGCATCGTACTTAAGCATGTAGGGTTGAA AACCGAACAGAAATAGATGGAAACATATGTTATTGTTACACTGGACATCA CCCTTCTCCTCAACCACTCCGGCAAGACGTGCCCGTCATATTTCACCTGC TCAGTCGATCGTTAACAGACATACCGTTGCACAGCCTCCGAATAAGATTT GATTTTTTGAGTAGTTTGTTGTTAATTTCACGAGGCATGGAATTGTTCCA CTTTTACATTGAAATTGTTGTAACCGTGTTACTCCTAGTATTCTTTATGC AAAAAAAGTATCATACACTTCGTGTTCATTAATGAGTAAATTACTCTACT TGTCAAATTTTAGTTTTTCTTGAAAAGGGCAATGGCATACAACTCGACGC CTGCTGCCCCACCCACATCACCCATTGTCTCTTCTTATTGTGCAGTTCAA ATTATTCAGTATATTAAAATCTTGGATTATAAAAGATTAAGACATGTACC AACCATGTAAAAAAATATAGCATGAAGAAGCTATCCATTATGTACTTTAC TAGTGTGATGGTGCTAGCCAATAGCCTAATAGTAGACATCCTAAGAAACC ATCTGTAGCCGATTCATCTAGTAGCCATATGTCCCCATTGGTCTGCTAGA AGAGATAGGCCCACGGTGGATCCAACGTGTAGCAAAGTGAATAACCACAA AAAAATGTATTATTTTTCGTGTTAAACACAACTTTATTTCTACATGTCTA AATGGACAACACAGAGCTGAAAATACGTATCCAACCATTATTCCTCTTAT CAATTCTATTTAACCATCTAACAAATATATTAATAATATTGGCCAGGGAG GTATATTATATGTGAAATAGAACATGCGACGTGCAAAAGGACAAGTAAGA AATAAGTGTTTATGGTCTCCATTGAGTCACAAGAGAAACATATTTGATAG AGAAAACTATTATAAAAAATGTATAATTTTTTAAAAATGTCAAGAAAATT TGAAACAAATATTTCCTGTACACCCAGATATTCTATGTTCATACACATGT TTTCATAAAGAAATAACATTTCATGTGATTTTCGCAAAAAGACAAAAAAT GTCCCTGAATAGACATGTCTGAGCATCAAACAGGCAGCCCATGCCCCATT GACGTCTCCTTCCTTGAATACTTGTAGGCAAAAACCCAGCAACATCACCG GTGCGGCACCGCTACTATCCCTACCACTCCTCTTTCTCCTCGAGTCCTCC TGCCACGTGGCGACCCAATGGTGACCATCCATATAATAGTTGCTGAAGCG TTTTCAAACTATTGCCGAAATACTGCTAAAATATTGTTGTAGTGTTGTTG TTATGTTGGTTGTTGTTTTGTTTATGTATATAACATATAACCAATGAATA TTCGTGGATACCCGGATATCCGATGGGTTTGGATTTGAGGCGACATCTAT GCCTATGGATATCTTCGTGGGCAGGCTAGAGTGAGGTTTATGGATTTGAG TCTGGATTTGGTTTTGTATATCCGTCCAAATCCGCTCCATTGCCATCCTT AATATCGGCTTAACTTCATGTGGCTATGCCCGACACCACATTTTTTCTTT TTTTCTCTGCGCCACGTACTGCTAATTTAGGTCTAAGCAGTTACGCCACA CGCTAAAATTCTGTCCTTTCACACTAAAATATTATTCGTTGCATGATAAG CTTCTTGCACTGTTCATTGGTGCGTGACGTGCATGAAACATGCACCGGCG GGATTGCTAGCTCAAGATGTTGCATTATCACCAAAATTCCATGACAACTC CCTCGTGCCAAAATCTTGCCATATCTGTCTAAAACAACTGGCGCATGAAC CAATCAATCCTGGAACCGATCGACTCACACCAGCTGGCTGGCCACACCTA TGATAATTGATAGGTAAGCTCGATCCTATGCTAAACAACTCCATCTCACC GGGCTATAAATACACAACTCTTCAAGCTCGATCTCCCGCATCCCAAACCA ACACCACTCGAGCAAAAGCTGCAGCGACTCGTGTACGCACGATCGATCAC GATGGCATCCAAGGTCACGCTCGTTGTTGTCCTGAGCCTCCTCTCTGCCG TCGCGGTGCATGGCTGCGGATCATATTGCCAGCTACCGGTTGCGGTGCCA CGGCCACCCGTCGCCGTTCCGCCGTCGCCGTACCTCCAACCACCAGTTGT GGAGCCGACGCCACCCGTCGCCGTTCCGCCGCCGCCGTACCTCAAGCCAC CGTTTATGGTGCCGACGTCACCCATCGTTGTTCCGCCAACACCGCACCAT GGAGGAGGAGGGCACAACCATGGCGGGAAGTGCTCGATCGATGTGCTTAG ACTGAGGGTGTGCGCCAACGTTCTCGGCGGACTACTCGGCCTCCTCAAGG TTGGAATTCCGGCCTACGATGAGTGCTGCCCGTTGCTGCGGGGGTTAGTT GACCTCGACGCCGCCGTTTGCCTCTGCACCGCTGTCGAGGCCAACGTCCT CGACATTGTTCACCTCAGCATCCCTCTGGACATCACCCTTCTCCTAAATC ACTGTGGCAAGACGTGCCCATCCGATTTCACTTGCTCGGTCCAGCATTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.