Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA015593

[Submit comment/correction]

Sequence
AA015593
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015593
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTCTGTGCCGAAGAAAGACTCCATCGTCTTCTCTCTTCGCTTCCCACA
TACCAGTACACAGGACCCGTCAAACGTGAGAGCTAGAGCTGATTAGATCC
ATGGAGGAGATGAACTTGGCCAAAGGCATAATAAGCGTTGAGGAGCTGAG
GATTATGACAAGATCCATGGAGGAGATGAACTTGGCCGACAGCATAATAA
GCGCTGAGGAGGCGAGGATTACCTTAGAACGCTTGCGCCCTATTCACGCT
GCTGTAAGTTTGTCCTCCTATGAACTATTCCCTCCATCACAAAAATAGAT
GTTGGAATTTTTTCTAAATTGGATGTATCCATACACTATTTAGTACTAGA
TACATCTAAATTTAGAAACATTTGTGAAATCTATTTTGAGACGGAGGGAG
TATGAAAGTTTTAGGAGATCATGTGATATGTGAATCTTAGCTGTATGGGC
TTCTTTTGTTGAACACAAGACTTAGCGGAAAGAAACAAACTAGTTTTGTG
GAAAGCAAATCATGGGGCACACACGTGAATATGGGATCATGTGCCCGCAT
CTTACACATCCTTGGTTATCCATAAGGTGATACTTGGGTATGAAAATTAA
ACTTTGGACTGATGTCTTATTATTATTGACAGGAACTGGACGATGATGGA
TTTGCTGCTGCACGCAGAAGAAGACGCCGCCTGAGGCTGGTGAGCCAAAC
TTGCGGAAATCATTCGGTAACATATATATGCACATAAACAAAGATATTGG
AACATAAAAAACATCGATCGGGGGGAGAGAGTTGGATTTCTGGATCACCA
GAGAAGGAGCTATCCCCTCACACTTGGGTCACATACCTCAGAGTGAACCA
GGTTTGAACCATACTGATTAATCAGGATGGGCTGGATGCTTGGATTGGCC
GGTGCAGATGCAGGCTCGGTAGCTGAGTGGTCCTTGGCTGATGGCAGCGG
CACATTGCTGCTGCCAACATAGGACTTGCCAGCTGGCCTTTTGAGTTTTT
TCCCGGCTTTTGAGAGGAACAACTGGAGAAACACCAACAGGTGTCTTCAA
TTGGGCAACTTTCTCCTGCCTTGCATTGCCATTGCCAGGATCACCCTTGC
TAGAGACCTCCGCTTCCTTGCGCTTCTCCTGTTCTTTGTTGCGTGCTGGG
GCTTTTCCAATGTCTTTCGGACACGTTCTGTTCATCACTCTCTTCTTCAT
CTTCATCATATTTCTATTTATCTTCCAGGCCAGGTGGTGGTGGTGGGGCC
TGCGAGTTGGGCCCTTTACAAATTTAGAATGTGACCCGACAGGTGCCTGC
GAGTGAAATAATAGCATGGGCACCGCTCCCTCGGGATTGGCCAGAGATTC
CTCATCCACGGTGCGGATCTAGCGCCTGTTTGGTATATGCATCTATTTTC
TAGTCCAGTCCGACAGTGCCGTGAATATCACTGACAACATCATATAGGCC
TCGGGCCATGAATGGCAGTCTATTTGCTAGCTTGCATGTCTTATTTCTGC
ATCAACGAAAAATATAAATGCGCCTGTTTGGTTGTATGCATGCATCTATG
AACAGAAGCGAGCCATGCGTTTGGTTGCCTACAGCGTTGCTGCTATGGTC
ACCTCTTTGTGAAAGAGGTGAGGATATCACATAAACACAAACACAAATAT
AGATCAAACGACAGTTCATCGGCCACACACACAAATAAGAACAACTTTCA
TGTTGATAGAAGTCACCGCTGCTCCACGATCCTCCTGAAAGCTTCAGGGC
ACCTCTTGACAACCTCAGCTTGACTGTAGTTGTAGATGACCACCTTATAA
ACCTTTGGGTAGATCTTCTTGAAGGTCAGCATGTAACTGATATTCAGGTC
ATGAGCTACTGCAAAAGCTGCCCAACCTTGATCGAAGCAAATTTTACCAT
TGACATCAGAGATGCTGATGTCCCATTGGCATCCAGTCATCAGCTTCAGT
GTGACCGTGTCAAGGACACTGTCCAAGTATGCCATGAATGCATCTGGATA
GAAAGCAATCCCAGTCTAGATGCTACCAACACCTTGCAGAACTAGGTAGG
GCTCACTACCTCTTCCTAGTTGCCAACATTGGGAGGCATCCCTGCTTTTT
TGCCCTCTTGTTCGAGCCATCGGCAGACTGCTTTTCCCGGCCACCTATGT
TGATAGCCTGCAATAGATGAGCGGTGCTAGCTGCTGCAGTCACTACCGGA
ATAGGTTGTTACGCCGTCGGAAAAGGGTCATTATGTCGTCGGCGTAGGCA
TAATTTGTGTCGGCATAGGAAAGTTGCTGGCATATATAGCAGCCACGCCG
ACGGCTAAGCCATCAGCATAGGTTAGATGGGCCCTACCTCGATGGCTAAC
GACTGTTTGTCTACGCCGACGGCTTAGACCTTGGCCTAGTTTTTTTTAAG
TTTACTTTTTTGAATTGTTTGACTCGTTAATCTCACATGCGTATTTTTTT
AACTCTAAGTACGCTTAATCTCTGGGGTCGGTCACCCATCCTCACACTAC
TCCAACCCCAACACGTTTAAATTTTTAGTTCCTTCCGGATGAGCTTTCGA
TAAATAAATTAGACCTTGTTGATAATACTGCCATATCAATCATATGAATC
CTTGGTCCATGGTGTCACACGCCTATATTTTTAAAATTTTAAACAACTAT
TTAAGTAAACAAAAATGAATAAGTAATCATAATCTTAAATTCAAAATAAC
AATAAAATGAATTTTGTTTTGCCTTTTTCTATTTAATATAGAATAATTTA
TATCTTTAAATCTGTAAATCGAAATTCGACAAATAATATGTCTAAATCAA
TCAAAAAGATGAGAAGAATACAAACATGACATCCGTATAAATTTTATAAT
CATGCATCATATATTTTAATAGTATACTGTAAAGTTTTCTAAATAAAATT
TATTTAATAGTGTTCAAATCTTCAAAAAAATCATATAAAAAATCCTTTGA
GGATTCTAAAAAATCCTTAGATCAGGGCTGACCCTCTCTAAACTTGTTGT
GGATCTCTAATGAAATAGTATATTTTAAACATAAAAATGATTTTTCTAAA
AATCATGAGCAACAGATTATGTACATGTAGGTCAAATCTGACTCACTTCC
TACTAATTTGGTAGGAATTTGTCTTTTTCATGAGGCGTGGACAAAACTTT
TTAAGATATCCCGGTTGGGACACCGTTCATGCAAGGTGGCCTAATATTTT
CCAAAAATAGGGTGGTACCATTTTGAAACTTTCATTTGGTGGTTGCTTAA
CAAAACACCCCGTTTTTGAAACTCGGAAAATGGGCTTTTGATGCGACGAA
AAGGAAAACATCCTCCTGAAATATTGTTCTTCATCCTAAAATACACATGT
ATATAAAATATGGACACATTATTACAAACTATGCTATGATTCTAACCATA
ACATTGGTCATTTTGTCCTAAAACCATGAAATCTCGAACGTGATAACTCA
TTTTTGGGAAGGTTTCTTTGAGATATTTGGAATATTTCAAGTTTGATATT
TTTCCTTGCAACTATATCTCATAATATAACACCACATGAAGGTTTTACAT
TGTTCAAATCGTTTTTGAATTTCTTATGTCCGTTTTAAACTATGGTCAAA
ACGGTGGGCATGAAGATTCTGAGTCGGGGCTAAGCCTCGCTAAACTTGAA
GTGGATCTCTGATGAAATAGCATAATTTGTGAACCTAAAAATATTTTTTT
TCAAAAATCATGAATATCAAAATCATGTACTTGTAATTCAAATCTGATCC
ACTTTCTATCGATTTGGCAGGAATTTATCTTTTTCACGAGAGGTAGACGG
AAAGGTTTAAGATACCCCGGTTGGGATATTATCGATGCAAGGTGGCCTAG
TATTTTTAAAAATAGAGTGGTATCATTTTAAAACTTTTATTTGATGGTTG
CTTCACAAAACACCCCATTATTGACACTCAGAAAATAGAAAATATGTTAT
ACGAAAGTATATATAATGTTTTACTTGATTTTTATTCAACATAAATGTAT
AATATTTATTTTATATAGATAGATCTTATTTTTCTACAAATTTTAATATA
TTGTTTATATTTTTTAATTAGAATGATTTAGTTATGATTTTTCTAGGATT
AATGTGATAAAAAGGAAAAACAACTAAGCTGAGTCGACGGGCGTCGGCGT
AGGTTGACAGCGTCGCGTCGCCATTACGACCTGGTTACGCCGACGGTTTC
CGTCGGCCTATCTCGTCATACGTCGACGATAAACCTGGAACGACGGCCGG
TTTGACAAATAGCCATCGACGCAGTTTCTGACCGTCGACATGTTCCTGTA
GTGAGTGCAACACTGCTACCAGAGTCTGAATCTGTCAGATACGAAGAAGT
GAATACTACATGTATGAAAGATAGGACGAATTCTCGCTTCCTCCGTGCTC
CACCACGTTTGTGGCACAGTTCATAAGAACAATGTTAAACACTGTCGTGC
ATATATATATATATAAGATGCTACATGTGCATATTAATCTAACCATTGGA
TATTCTATAGAGAGTATGAAGTTGAGCAGCAGGAGTATAAAATATCTAAC
GGAAAACATCACCCACGTTATATCAAGAGCATTTTTTGCATGCATTGCTA
GTACATGCAAGTACACATGCAAGCTAGCACATGCAATGCAAACTAGCAAT
AGCTCACGCGAGCTAGCAATACTAGTAGACCACTGAACTGGCTAAAATTT
TAGCATGCATTCTAGCAATACTAGCTTTTGTACCGAAAAAATCTAGCGGG
AACGGACATGGGAAGCACCGCTTTAAAACGAAAGCCACGTGCGGAAATAT
TGGCCGAAATTCGTGCAACCTAAAACGCATGATAACTTGCTTGTTATGTT
GGTCTACTTCCACGGTTGGTTTTATTGCAGAAATTTTTGTATGTTTTCAT
GCTAGGATTCATGCTAACATGCACACATCCCATCAACTAGTACAGCTAGT
CAGGTCTAGTGCATGCAAGTACAACTAGCAACCGCGTGTAGTTTGTAAAT
TTTTTTGTAACAATATAGGCTGGTTGGTATGTTACAATACAGTCTGGTCT
TGCTATTTTACAAACGATAAATAAAACCGTTAACTGCATGTAAGATTTTG
GCTCTCTCTCATCTTGGCAGCTAGTTCACGTACTCCATGTATCCTACGTA
TATAAAAGACGGATGAATCATCCTTGCTTCCTCGGTGCTCCACGTTTGTG
GCATAGTTCATAAGAACAGTGTTAAATAGTGCCGTGCACTGGTTTGACCG
TTAGACTTCAATCAAACATCTAGAAAAACTATGAAAAATAGTCCTCTGTG
TTGCTCATCGTGGTATATTTTGCGGTTGATTTTTTCACAGTTTCATGCTT
TGGTATTTTTTAGGCAAATTTTTTGGTACATATCTACATCTTAAACTATA
ATTCCTCGGCGATCATTACTCAACAGTGATTAACATGAACTATAATTTCC
CAGACCAACATGAATTAGTCGTGCAACGATTATTTTCCTTCTACGATAAA
TTCTTTATTAGACCGCAATTCTTCGACAACTTTCTAGCCGTAATTTTTCT
AAGTAGTTTATGTGTTGTCACTCTTTGACGTTGCGTCATTCTGCAAGTAA
ATTTTATTTGTTACTATATGCATCAGAAAATACACATACTACTCCCTCCG
TTCCTTATAATAAGGCTTATAAATTTAGTCAAAAGTCAAACATTGCAAAG
TTTGACCTAACTTTTAGAAAAAACAGAGGGTCAAATCAATCTTATTAGAT
ACATTATGAAATATATTTTCGTACCATAGCTATCTATTATCATAGTTAGT
GGTAGTTTTTTTATAAACTTAATCAACATTGTGTGTGTTGGCTAACGTCT
AACAACTTTTAAAAAATCATGTCGAGCCATGTATACAAGTGAATTAACAC
CACATGGGCGGCACCATTTTCACTAGTTGTCCATAATAATACCCATACAA
TGGATAGTCCAGACGATACTACAGGCCCGTTGGGCTAGCAATTGCACAAT
TGCACCGTGAAGAGCCCGCCAATGCACACCTAATTAGAGCGAAATTATAA
AGATTCTTGCGCTTCTTAATGGAATTATTCCCGCGTAAAGTATGTTTGTG
TTTTTGTAGTTTCGATGTGATTGTTTTCATTCATGAGATGATTTGAGAAA
CAAGATGAACTGATCTACTGACTGTTTAAGTTGCAGGCACGAAGTCAAGC
CGCCACGCTCGCCTCATACGACACCGTCGACCACCACCCAGAAAATTTCA
TTTCACGTTTTTGTGCCACTATAAGAAGTCGCATCACCATAAGAATCCTC
CATTTCCAAAAAGCCGAAACAATCCTGCAGACTATAGAAACGTTGGAAGC
TGCAGAACAAGTGGAAATACAAGGACATGAGCTTGAGCACCGTGCTTACA
TGTTAGCGTTGGGAGTAGCTCGTCCAGGCTCTATCGTTGTACGCGGAGGA
CCTGGTCGTCGAGCTCATTGGATTCATGACACGCTACGGCCGCTCCGTTC
CGCCGCTTCAACCGGCGGCTCTGAAGCTCGGGGCGTTGATGAAGCGGGTG
GCCACTATTACTCTATTGACGTGGATGACGATGCCGACCCGCAGCAAAGT
GGTCAAAGTTCGGCGGCAGCTGCTCCTAGAACAAACGTAAGTACTACTCC
GTATATATACATGCCATGATCTCGTTTCCAGACATGCATATCAGCAAACC
CCAACACCTCACGAGTCTTGTAGATGCTAAAATGAAGCAAGTTCCTGACA
TATTTTTTATTTTATTTGTTACAAAACAATAAATAGCTGTGTTAATTCAA
CTTCCTTATTTAGCAACGAGGTTTAAATTTATTGTCTTCAATGGCGGCTA
CTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCTACTGCT
ACTGCTACTACTACTACTACTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC
TACTGCTGCTACTACTACTACTGCTACTCCTACTGCTACTGCTACTACTA
CTACTGCTACTACTGCTACTGCTGCTGCTACTACTGCTACTGCTACTACT
GCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTAATACGTA
CTTTGAGAAAATAGTTTCGTAAATTTGATCAATAAAATATAAACTATACT
TAATAAAAATTATACCATTAGCTTTATATTCAGAATACGTTTTTAATGAT
ATAATTTTTGTGACATGTGATTCATATATTGTTGAACAAATTTACGGTCA
AATTATTTCCTTAGAGTATGTATTTGTCTAATAAACCGAAATGGAGGTAG
TAGTATTGGTAGGATTTGTCTGTAACTACTCCATACGTCTCAGTTTATTA
GACTTGCATGTCTATCTAGATCAGCAATTTGACCAACTTAATATGAGGTA
TATATTAAAAAATATTATTAATGGTATAATTTGTATTATATAACTTATTT
TATATGTTTCAAATTAACGATCTAGATATAAGTGCAAGACTAATAAACTG
AGATGGTGGGAGTAAATAGATTGGGTGACCTAGTGGCTGGTGTTGAATAT
AACAACATTTTTCTATTAGTTCGAATTTTTGGGCGAACTGTGTGGTGCAT
CAATTTAATATAATATCAGAATCAAGTGGTTTCAAGTTGAAGGCAACGCC
AACACAATAATAAATAAAATAGGTGGATGTGGATTATTATGTAGCAGTGT
GTCATACTCCCTCCATACCGGTTTAAAGGGCTAGCATGTAGTCCAATAAG
AGTGAGTATGCTAGCTATAAGACTTAAAATACTATATATATTTGTGTTGA
GTTGGCAGATAAAATAGGAGAGAGAAAGAAAGTGGGCTCTTATGCAAGAA
CAACCGGCTCTTGCACATGCTTCTAGACATTTTGTGAGATTAGAAAGTGG
ACCATATGTTAATAAAGTAGCACATTATTGTAACTAGTTATTATACATGT
TAGCTATAGTAGCTATAGATAACCTAACAGTGTCTTATAACCAGCCCGTC
GGCTATACTATTAAACTTGCTCTGATAGTACTACTATTGTCTTTCTCGTT
ATTAATTAGTGTGTCACATAAATTTTTTGCATGCATGAATTACATGATAA
ATTGTATGATACTCCCACCATGGCCACCTGGTGGGTTGTGTTTGTAGCCT
TTCTCACCATGGTATGGTTGTGTTCTCACATACATGTTGACCCCCAACCC
CCCACCCCCACCCCAGACCATTGAGACATGTTGAGTCGTGCCATTGTTTA
ATACTCCCTCCGTTTCAAGGCTTAAGGCGTCATCGTTTTGCGTGTTTTTT
TTGACCAAGAATTACTCTAAATACGTAAAGAGTTTTGGTATAAAACTAGT
ATCACTGGAAAGAATTTTTCAATACGAATCCAACGGTACTAATTATGTAT
AATATAATTAAGATTTTGTTGCTTAATTCATTCGGTCAAACTTTGCTTTG
GAAAACGTGTGCGCCTTAAGCCTTGAAACAGAGGTAGTAGCATTTAATTA
TTGAGATATGCTAGCTGATCTCAGAATTTCTGTAGTCGCTTGTATATGTG
TGATAGAGCTGGTAACATCTTCCCTGATGTGGGAGTGTATCCCGTTTTAA
AATATAAGATATTTTAGATTTGTAAAAAAAAAATCTATTTTTTTGTGTGT
GTAGATTTATCTTAAAGTTAAGTGAACCTAGATACTAAAAGAAGTCTAGA
TTTATTTGCTTCATAAAGCTAAAACACCTTATATTTTGAAACTAAGGAAG
TACCACCACAATTATGCATGAGACATAACAAAAGCAAAAAATGTACACTC
CAGGGATTAGTTTCGTCAGATCATTAGCGCAGCTTCGTTCTCGTTTCCAT
GAGGTAATTAAAGAACAAAGGTGGTTGGGAGGCGAATGGTAATCTTAGCG
GGCATGGGTTTGATGTGCACCGGAACTCATGGAGGCACAGGGGTTATAAT
GAGCATATAGGATAAATGGACTTTTTTTTGCCTCAAATGTCATAACAAAT
TCCTTGATTATGCTGACAGGAAAGAGGGTGGTGTGTGTCAATCTGTCTCC
TAAGCGTTTTGGCGTGACCATATTTTTACGGAGAAACTTCTGATCTTAAT
TCTTAAGATGGAATATCATGATCTCCGAATTACCCTACCTAACTTAATTA
TTCTCCCTTAATTCTTAATTCTTCCAGGATGGCGCGAATGACAATCCGGA
TCAACGAATTGTGCAATCACTTGTCGGCAGTCTCGTGCCCTTATGCTTTG
ACGTCTTGCGTGATGTGTCGAAGGGGGAGTGTCCTGAGCTCATCAAGGTG
TTCCTTTACACTGGGCTTGGGATTGTTCTTATTCTTGCATGCATCGGGAT
CACATCAACGAAGATGGCCAAGCCTGCCATGAGGATCGTGGCCAGCGCAT
CGATAGCCGCGCTGACAATAGGCGCGGTACACCAGGTCTCGGAGAAAGTC
TACATGAGGTGGATTTTTGGGACCTTGGGGGCGATGGGAACGTTAGCGAT
GGCAGCGTTAACCTGCAAGAACTATGAACTCATTTAGCCCGCCTCCTGGT
ACTAGTTTATATGTATACTACTGCTACCTAAAATATCCTATCTAAGAATA
GATTATACTTGAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.