Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042612

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042612
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042612
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACGAGGAAGCACGCGGGCCCCGGCGTCATACGCGCCCTTGTCGCGGT CGCAGCTTCCGTTGCGTCCGCCGCACCGCCCCGGAGTACCCCGAGGCGCG CCGCTCCCTTCCTCGCCGTCGTCCTCCGCTGCGGCCGCGCCGAGGCCGCG GTGCGCCTCAACCATCTTCTCCGCTTGCTCCCCCTCCCGGAGTCCCCCGC GCTCCTCTCGGCGCTCCCCTCGGTCCGCGACGCCGTCTCCTACAACACCG TACTCGCCGCCCTCTGCCGGCAGGGCTGCCTCGACGCCGCGCTCTTCCTC CTCCGCGTCATGTCGCACGAGCCACGCCTCGCCTCCCGCCCCAACGCCGT CTCCTACACCACCCTCATGCGCGCTCTCTGCGCCGACCGCCGCGCGGGTA AGGCCGTCGGGCTGCTCCGTTCCATGCAGGCCTGCGGCGTCAGCGCCGAC GTGGTCACCTACGGCACGCTCATCCGTGGGCTCTGCGACGCCGCGGACGT CGACAAGGCCGTGGAGCTGCTGAACGAGATGTGTGAGAGTGGTATCGAGC CTAACGTGGTTGTGTATAGTTGTTTGCTCCAAGGCTACTGCAAGGCTGGG AGGTGGGAAAGTGTAGGCAAGGTGTTCGAGGAAATGTCAGACAGGGGTAT TGAACCAGATGTTGTGATGTGTACTGGTTTGATCGATAGCCTGTGTAGAA ACGGGAAGGTGAATAAGGCAGCACGTGTGATGGACAAGATGATGGAGCGG GGTGTGGAGCCAAACGTGGTGACTTACAATGTGCTGATCAATTCCATGTG CAAGGAAGGGTCCGTGAGGGAGGCGCTCGATTTGCGGAAGAATATGTTGG AGAAGGGGGTGCAACCAGATACCGTGACATATAACACACTTATCACAGGG CTATCTGGTGTGCTTGAGATGGATAAGGCGATGGGGTTGCTAGAGGAGAT GATTCAGGGCGAAACTGTGGTTAGGCCTGACGTAGTGACATTCAACTCTG TTATACATGGACTTTGTAAGACTGGTAGGATGCGGGAAGCAGACCGAGTT CGTTCCATGATGGCCGAGAATGGATGCCCATGTAACTTGGTGACATTTAA TATGCTGATTGGTGGACTCCTTAGAGTCCACAAGGTAAAGAAGGCTATGG AGCTGATGAATGAGATGGCTAGTTCTGGATTGAAGCCTGATTCATTCACC TATAGCATATTGATTAATGGGTTCTGCAAATTATGGCAAGTTGACCGTGT GGAAAGTCTCTTGTCTGAAATGAGATCTCGCGGGATAGAGCCTGAGCTGG TTCACTATATTCCTTTTCTTAAAGCTATGTGTGACCAAGGCATGATGGCG CGGGCTAGGATTTTGTTTGATGAAATTGATATGAAATTCAAACTAGATCT TGTTGCATATAGCACTATGATCCATGGCGCTTGCAAATTAGGGGACAAGA AAACTGCAGAAGAGTTTCTTAAATATATGCTTGATGAGGGGATCTCTCCT GATGCTGTGACATATACCATCCTAATCAACATGTTTGCAAAATCTGGAGA CCTAGGGGCAGCGGAAGGGGTGCTTAACCAGATGACTGCAAGTGGCTTTG TGCCTGACGTTGCTGTATTTGATTCACTGATTCAAGGTTATGGAGCTAAA GGTGACACAGAGAAGGTCCTCGAGTTAATTCGTGAAATGAAAGCCAAGGA TGTAGCACTTGATTCAAAAATTGTTTCAACTATTGTCACTACTCTGGAAG CAAGCAACGAAGGCCAATCGTTATTGCAGAGTTTGCCTGGTTTTGATACT GAAATAGCCAAAGGCGACATCATCCCACGTCCTGATGCAATGAATATGCT GCATAAACTTTGCAGTAAACTTGAACCTCCTGAAGCTTGCTGATCTCTGA CCCCAATTCAGGTGCTTGTGTGTATGTTGCCTTCATATTTGAAATCTATT TATTTGATATTTTTGTCCATTCCAAGAGCATAGCTGTGTCATATGCTTAT ATTACTTTCAGCTGATCTATATCCTAAAATGTGCATCATCACGTTCATGA TTACTGCATGTCATGTACCTGTTGCCCTCATGATTATTGCAGTGACTGCT TAATTCACTCTTTGCTTCTCAATGTTCCAGTGCAGACTATACCATCAAAG CAGAGCTGACAGAAGTGACGTGTGAGCACAAAAGCACCTCCTCAAATTTT TAAATCTGGCGCACAAATATTTGTCAAAACTGCTGGTTAAGTGGTGTCTC CAAATTTCATGTGATATGGCAATCAGTATCCTCAAAAGGCTGTGGATATT TCAACTTGTAGTTCACAAGGCTGGCCATGGCTCATAAGGCTAACCTGCAA GCCTTGTAGGGCTATTCACAGGTTTCATAACCCACTAAGACCCAAAATGC AAAGCTGCTCCATTTGTTAGGTTTGGTATGGGATTTGAATGAAACCCATC TACATTACTATCCTACCAGGTGGTATATCTGCAACCCACCAGATCCTTTT AGCCTGAGTTGCTGTGGAGTCATGGAGGGCCCCATCTCACATCAAGGCTC AGAACTCACTGACTGTGTTTGCTTGACATGCCGCTTCCTCCAGGCAAGAG TTTTTCTACCAGCAACTTATACTCCCTCCGGCCCATATTAATTGACTCAA ATTTGTCTAGATTTGAATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGGTTCAT CCAAATTTTGACAAATCAAAGTCAATTAATATGGATCGGAGGGAGTAACA AATCAAGAACCAGCCCTGCTTACATGCGACTGTCTGTGTGGCCAATTTTC CCAAGGCCTCAGACCAGAGTTGGACTTGCTGGTGGAGGTGGGCATCTAGA AGTGTAATTGGTGCCCCCCCATGGGCTCCTCACAGCGAACCACGTTGCTC AGCCGTTGGATCGAGCCCTGGAACGAATCACAACCATTGGTTCATTTTTG ACCTCATCTTATAAAAGACCAGACCCACAGTGAAACCCTAGCCGCCTCCC AGCCCCACGCTCGCGTCTCTCCCCTTTCCCATCTTTCTCTCGTGCTGAGG CGGCTGCCCCACGCGAGCTCCCTTCTCCTCCCCTGGCCGCTGCCCCATCC CCATGCACTCCCTCCCTGGCTGCCGCCCCACCCCCACGCGCTCCCTCTCC CCCACCTATCGCTCCCTCTCCTAGCCGCCTCCCCAGCCCCAAGCTTTCGC TCATGGTCTTCTAGGCCGAATCGGGGGGAGGATGCGGAGGAGGAATCCCT CCACGAGGCTGCTACTGCTGGAGACGGTGGTGAAGTGGGCAAGGAGTGGC AGTGGTGCAGCACCTCCGCGCCTCTCTTGACCGTCGTGGGTGCAGTCGTC TGCGATCTTCTAGACATGGAGTCCGAAGCCAGCGAGAAGATGAGTATCCG AGCAGAATGGTTGGCGGCCAGCAGACGCTACATGGCCTCAACTCAAGGGA TTTTGGTTTGCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTGATGCTC ATTGTCCTTGATTTTTTTCTGCGTGCCAAAGTTCATTGACAACTCAAGGC TAGGATAAATTGTGGAGGTTGCTTGGAAGTAAATTAGGTGAACAACACAA GGCTAGGCTAAATTGCGTAGGTTGCTTGGAAGTAAATTAGGTGAATAAGT TCAAAATAATTCAAGAATGGCTATATCTTAAGGAAATTATTTATTTTTCT CATATCTGTGCTCCAATCTTTCTATTGTTAATTAAGCACGATTTTTTCGC ATATCTGTGCCATTGACACCATGGTGTTTGAGATAAATATTGACAAAGTA TGGTACAACATGTACTTCTTGCCCAATTTCTTCTACCGAGGACACCTGCT AGGCAATACCGCTGCATGATCGCTGTCAAGAAGTTCACCGAGATGGCTTG GCCCTCTCCCTATAAGTTCAAGGTATGCCCGGATCCCCGGAAGACAGAGT TTTTCTTTTTGCTGCATTATAATTATAAATTCGCTCGGCGGCGGTGAAGT GTTCACTCTGGTTTCTTTGTTTGTTTGGTTCGCAGGAGGAGGCAAAGGGG TGTCGGGAGCTGCGGCGCCGGCGGCTGGACCCTGATTGGCTATGGTTCCT CGTCATTGAGTTCATGCCCAACGAAACCCTCCCCAAAACCTCTTCCACTG TAAGTTTGCCGTGCAATGACAAATTTAGTTGGTAGCGGCGATAACGGGCT AACTATTCAGCTTTAGTGCCCTACTATTGTGTTGCTTTTAGTTGATGTAC TCCCCTGGTTCCCTTTCTAGACTTAAATTTTAATTTTCATTCAGCTATGG CTTTATAATATAAGTATAAAACAAATTATTATAGAGCTAAAAGTATATTG GTTTGCTGCATATAGTACAATTATTTGAACAGAGTGCAAGAAGGGTGGAT GGTCTGAAGTAGGGTATTTTAGAAATAATCAAAAGTAATTCTCCAATGTG AGTCTTATATGCTACGGAAATTCCTATATTACTACATTTAAGGGTTACTA CCTTCTGATTCTCTAGGGTTTAAAATATTGGCAATGATACTTTACCTTTT TCTCAAATTCATTCATTTCCAATTGATGTGGACATGTGGTTGTTGTGGAT GCAGGATTAAAGAAAAAATATCATGCATCCCAAAAAAACAGATGGAAGGT TCTCCATGTTTGAGAGGTAAATAATGGATCTTCATTAATTTGTTGGTATC ATTATTCTGATTTGTTGCTGTCAAGATCAGTTAGTTCAGTAAGGGAATCT CTTTGAAATGCTTTATGATATGATTGTTAAGTTGGATTCTTGCCTATTCT AATAATTTTATCATATACATTGTTCAGTGCAGAATTGTATGCTTTTCTGA CACTGAGGTAAAGGCCACTCGAATCATATAACTGATATCTCTTAATGTAA AATATGTGCTTGAGAAAAAGATCATATAGCTGATAAGTGCCAGTGAAATT ATCTTAAATTGCTCTGTATTGTGTTATGCACTTGTGGATGCACATGTTAA TGCTTATACATATTTCATTTTGTTTTTATCAGTGTATTCATGACATTACA TAACCCTTGATTCTATTAGGTTTGCCCATCTGAAGTTGATCGCTACGTTT TTGCTCCTAATGGTAACATTTATTAAATGATTCTTTTGTGGTTACTTTTG TTATTGGTGCTAATATACTTACTAAAACAGATAGAAATTACAATGGTCAA AGTGGTTCAGTTTCAGAAGGTCGGTTGATTTTGTTCAAAAGAGCTTTATT TACGCATGCATATGTCTATGTCAATTTGTTTGCTATGTTCTAACCTTGTA TATTTGTAGAGGATACTCAATATCCTGCTCACGAGAAAGCAATAACAGCC CAAGTAAGAGAATGGATATGCTCAATAGACATCAGTGATAATAGCTCAAG TAAGAGGATACTAAGATCCTACAATAATCAGTTTGCCATGTCTGCAGTTT AGTCAGTATAATACATATAGACTCTTTTAGGTAATTATTCTTGACATTCA TATAATATAGAGGGTTTTTTTCTATGAATTACCGTGCTCTGGTATGTGCT TATTCCAGTAACAGTGACTAGCTAGCCGACCATGCCAGCAAGGCCAAAGC GACAAAGTTAGTAAGAAGATTTCAGGGTGGTGAACAAATTTGCTGCTTGT GCTGATCTCCACCATTTGGTTATGTTTCTTGCTGGGAGGCAAGCAGATGT ACATCAAGAAGCTCTTTAGGTGCTTGAATCTCCAGTTTAGTTGTTTAAAA TGTATTGGTCAAATTTAGCCTCTACAAGGCAGGATTAACAGTTGTTTCAG CATTCTCTGTACTCAAACATTAGAAGAAAGAAGTTTCTTGTTGGGAGGCA ACCAGATGTACATCAAGAAGCTCTTTAGTTGCTTGAATCTCCAGTTTACT TGTTTAAAATGTCTTCGTCAAATTTAGCCTCTACAAGGCAGGATTAGCAG TTGTTTCAGCATTCTCTGTACTCAAACATTAGAAGAAAGAAGCTTAGGCA GAATATTTTGCAGGTTCTAGACTCCACCCCCTCCAACGGTGGGCAGTGCT GAAGATGAGGTTTGGCATCATGGAGACATGGACTGAAACTACATTGGCTG CTACACTTCACCCCCTCAAATATAAGCCTCCAAAAGTAAGAAGCCCATAT GCTCTTTCATTTGTGCTAGCATGCATTTTATATAGCAGAAGACAGCTCAA CAAATTGTTTGAGCATAGTGAATAACAGTAAAAATAGTAGTATATAAATT AATCGACCTCCTCTCTATGTGCCCTCCTTTGTGAATGTCATGTGTTTAAT GAATTTCATAATGAAATGGGTGTAGTTCGTGGTCTTTATTTCAGGTTATA AGAGCAGGGATGGGAGTCGCTAGCGGCAGTCATGGGACAATGATCTTAAA ACCGACTAGAGTAGTTCTTCTTCATGGTATATAGTACCTTATTATTTAGC CTAAAATCTTGAGCAAAGTTAAGAAATATATACTATGATTTTCCTAATGA GACAAAGCCATTCATGTTCTGGTTTCTGAATGTATAGGTTGTCAAAAATG TTGGTATCCTCTTTGAGCGCATTTTAATGAAATATTGGTTCCTCTTATGG GTGGAAATGTAAGAATTTCCTCCTCCTTTGTTTTTATCTCATCGGGTAAT TTGTTATGACGTATTTTAACTGCAGGATGTTCAGTTCATTATCAAAACAT GACAAGCCAAGAGTGGTTTGGACACAACTATCTGTAACTAGCATAAAGAT GCTTCTCAAGGTATTTACTTTTCTTTGTCCTCATTGGCATTTCTTCGTTT AGTTGACAGTTCCAAGCTTACCTCATGAGTATGGAACAAGTATTCTGCTT GTTTATGGATGTGAAACTATTTTTTTTTTCTTCTGCTATTTGATAAAAAT ATTCTCTTAATCTTGCAGGAGGTATTCTACTTGTTTTATTACTATTTTGT AGTCGGTGCTCATTCTGATCCAATGAAACAGCAGGAGGTATTCCATGTGC AGGCCTATCGTGTCAGTTTGCTTACAAGAGCTTGGGCTGAATTTGAGGCG AGAGGTCCAGTACGAATGTGGGCATGTGTGACTTTCGTTAACTTACACTG ACACTCGACACTTGAATTGTATCTCTTCAGGGCATGGATCATCCGGTGTG AGGACATACAAACCAAGAATTTAGATATTGAGATTTGAGAATCTCCTAGC TAACTACAAATAAGGATTGCAGAATAAAGGGCTTGACCTGATGTCTAGCT AGAGCAGCCCGCATATGGGCAGCTTTGTTACTCTCTTTTCCAATTTTCAC TACTTCAAATGATGACAACTTTCTTGGATTTTTAATCTCATCTTAATGCT TTCACATAAATGAGAGGCCCTATTTCTTCTGCTTGATTGCTTCAACGATA CAAGAATTGTTGGACTCCAAGATTATTGAGGCAGTTTCAACAGCATGGAC ACTCTGAAGACCAAGAAGGCACACCCTGGCTTTACATCCTGGCACTTAAT CCCGACAGTACTGTGAGCCAATAGAACCTTTTCAGATTGGTTACGGGTGG AACAGGCGATAGAGCACATACCCAGGTTCACCTCAACATAAGCGTCATCC ATCAGCTGGAGTAAGTCCGATTCTTTGTCTGGATAGGTTTCGGAGACTAG CAGCTGAGTCCAACTTAGAATCACTAGGGCTCCAGTTACACATGATGGTC TCCCTAACTTTGCTGCTTGTCTTTCACCTAAAAATATTGATGATGTGATA ACCAATTCTTATGCTCAGAATGGCACAAGATCTCGGACATATGATTTTGA AGTGGTAATTTTTTTTCTTTTATTTAGAATCACATGTGATTTTTCACTTT TGACTATGCAACCTGATATATTTTATATTTCTGTATGCACAGACTACTTA TATGCTTAAACTATAATTTTAGATGTCTGATTACTTAGTCCATGAGGTAA GAAATTTGTCTCGTGTGTTCCTGCAGATAACGATTAAGAAATCAAGTGAT CCAATTATGCTCCAATCATCTTTTTCATGCACGGCATCTTTTCTCAGGTA CCAATATAATATAGTGACAAAACATCATCAGTTTCTGGTCATTTTTCTTA ATTCCTTGCTTTGCGTGTATGTACTTCATTTCTTACCCGTTTTTGCTCAC GACAATTCTCTATAGTTGTTGAGAGAAGGGGCAGTGCTCATAAAATGATA TATTACAGGGTTTCATGATGGAGTAAGCATTTAGTTATGGACTGGACTAT GCCGCGGCGTTGCAAATTAGCGATGCCGTGCGGCGGCTGGTAGACACGCG AAGGCACAGCGTGAGGTCGTTGTCCATTGTGACTTGTCCGTGTTAAACGC GTTGCTGGACCTTGTTGGGCCGAGATTCGTTGTTAAAAAAATCAGCTGCC CATTTCCGTGCTCCTGCTCCTTTTTATTTTTCTTTCGACTTAATAATCAC AGCATTTTCTGCCTTGTGCCCGTATACTATGTGTTGTCTTAGTTGCCATA TGCCTGATTAATTTATTCACAAAAAAAACTGCCTGATTAATTATGAGTAA TTGCCAGATTAATTACGGGTATTTGCCAGATAAATTAAAAATCCTAGTTA CATTATTAATGGTCGGTTAAATTAGCTCTTACTTGCCCGATTATTAAGAG TAATTACCAGATTAATTAGGAGTAGCTGCCAAGTTTAAATGTGGCTAATT TTTAGATTAATTATTTCTGCCTAATTGCCATGTTAATTATCTTGCTAAAT TGCCAGATTATTTTATTACTTAGCAAAATTGCCAGGTTTCCCATGTACTC CTTCCGTTTATTTAGGCTCCTAATAAAATCTAAATAATTACCTTACCCAA TTAGCAATTAATGTGGCGATTAATCAGGCAGCACGCCTCTCCTCCCCCGA GACCTATACATGCAAGTACTATACTCTTAGAAATTTTGCATGCCGCGTGC GACCAACCTCGTCCTTCACAGCGACGGCTACGGGGTCGCCGTGCCTCACC TGCAGCGATTATGCCATGGTGGAGGCTCCGTCGCCGCCCCGCCCCCATGG TGACGAGAACGCCGTGCCGCCCCGCCCCCATGGTGACGAGAACGCCGTGC CGCCCCGCCCCCATGGTGACGAGAACGCCGTGCTGCAGCATCAAATCCTA GCGCCGCATGTCGGACAGCTTCGCGCCGACGCGCCTTTAGCTACCCTAGC AGCGTGCTTGCGGGGCCTCGTCCCCTTCCCGGCGACATCCACGCCTTGGA GGCAGCTCCCGACGACCTCATGGCGTGGCGCGGCGTCCTCGACCTCCCAG TGCGGGGCAACTCTCCCGCGACGCCCCCACCTACGAGGGAACCTTTGCTC GGGAAATCTATGATTAGAGAAAACGATGGATGTGTGGCTGGAGCGTAGGT TGCGAGCAGATAAGATTAGGTGGCAGTGGTAAGGGTGAGAGGTGAGAGAA ATAATCAAATGGTGAGCAAATAAGATTGAGTGGCACTGGAATTAAAAGGA TTAAATCAGACGGTCTAGCTCGCGCAGCACGGGTGAACGAGACGTGCGAC ACCTCTCGTTATCTTTTTCCTTCAGTTATTTGTTGAAGTGAGATTTTAGT GTAAGCTCAATGGTCGTTTCTCATAGAAGCACAATATCATTCCATGGAAT ATGGATACAGATTCAACTATAATTGAAAGATAAGGCTAAGGTATCACTTC ATTAGTCTTTTTCTTCCTTTCCAACGATATATTGAACTGCCTAGCAGAAA CTATCTTGAATATGAGATGCACCAGCAATTGGGACGTATGTTCTGAACTT TTGTGTGAGATTCTAACATTCTTCTGATATCTGTAATGCTTCTGAAAATC TAGGAGAGAAAAAAATTCAGGTCATCTTGCTATGTTTTTTGGCAGTAGAT GATTAGTCTTAACATGCGAAAGTGACTTTTCAGCACGTAAAGTCTTGCTA TTATTTCCAATCTGTTTCAAAACATATGCATATTCAGTTGTAGTTTTTTT ACTTTGTCTTGCAAAAGGCGATGTAAGTCAAATTATTTCTATTGAGTTTC TTGATGCCGACCGGACAACAGAAATGAAGAGGCTATCAGAAAGTCCACCG CTGATAAAAACCACGCTGGCCCTTGATATCCATATTCAAGATGTATCTAA CTACGCACGTCGCATCAAAAAACATAGTCTTGGAAAACTTAGCTCCAAAT CCTGCTGTTCTGCATGGAAACCAACAAGCTGGACTCCTTGACATTTAGGC CATTTCTATTCGTCTCTGTACTGCTAAAACTCTTGTCTTGCTCAAGGCTC CTTCTGATGATGGCCAGTCCTCTGGATCCTATGACTCGAGTGAAGTTTAC AGAACAAGCAATGTGTACGACTTCAATTCAGATGGTTCTACCAATGACAG ACTGATTACAGCTTCTCCTACTTCATTATGGGCATTGAACTTTCTATTTC GTATTTCTTCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.