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GrainGenes Sequence Report: AA040862

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Sequence
AA040862
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040862
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GACACTTGCCTGGTTATCACTGGCCCCAAAGGAGGCTGCCGGGTTATCAC
TGGATTTGGATACTGGGATCCTCTCTTCTAGAGATCTACACTCTCTTGTC
ATCTCCAGTCCAGTTTCCGTGCACCACTCCCCTCTCCTCCCCACCTCGCC
GGCGATCCCGCGATGGCGGCGGCCGCTCCCCCTCCCGCAGCGGCGCTGGA
GCAGCTGAGCAAGACCAAGATGTTCGGCGGCCACAACCTTCGCTTCCGTC
ACCAGAGCGCCACACTCGGCTGCCCCATGACCTTCTCCCTCTTCCTCCCC
GCTTCCCCGGCGTCCAAGCTCCCCGTGAGTGCCCTAACCCGCTCGCCCCT
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AGTATGTTTCTTGATAATTGGGGTGCTTTTCCATGTTCATTTGCTAGAAC
TGCGCTTAAGTTTGACTGTTCAGAATTGCCCCTGTTTAATGGTTGTGTCA
TTCCATTTTGTGCCTCCGTGTATTATTGTATCCAAAATTGTTTGCTGCAG
TTGGTGATACTTGCCAGTTGACACAGTTCTCCATGTAGGGATCACTTTTC
TGCTGAGTGTCTGATAGGTACTGAGTAGAAGTGTTGACTGGCCCCAAATT
CCCAATTTCCCATATCAGTAGCAGGGTCAAGTTCCATTCCGTTTGGTATA
TATTTATGCTATTTCATGATGGTATACTTTTGCAGTTTCTACAAATATTG
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TGTGTATGGAGCTGAAGGAACAAGAGTAACCATAAGAATCTTGCATCTTC
CTGACACATAATAACTTAAATTTTGCATGTTTGGTTTGGATTCTTAGGGG
ATGGAAGATGTTATAGCCCAAGAGAACACATTCTTGTTAGGCCTGATGCT
TCAACGTGTAATTGGTACACGGATTATGTTTTGTGAGTGCGTACTGATAC
TCATTTCTAAGCATTGTGCTGGGCAGGGACTGTTGAAGGCGTAACTCTAA
TCACTAATGTTGTAATTAAATCGTGTCATGGTGGCAATGCACATGTCTTC
TGCCCGCTATTTGCTTGATGGTTATGTTTGTGATGTGTCTGTTACACCTA
TGCACCAGTAAATAGTCTTTATCCATTTGTTGCCGGGTTGTACATGGTAA
ATTGGTGAACTCATGAGTATCACCCCACTCATACATTAAGACCTTAGCCA
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GTGTCATTCCATTTTGTGCCTCCGTGGATTATTGTATCCAAAATTGTTTG
CTGCAGTTGGTGATACTTGCCAGTTGACACAGTTCTCCATGTAGGGATCA
CTTTTCTGCTGAGTGTCTGATAGGTACTGAGTAGAAGTGTTGACTGGCCG
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GGTACATATTTATACTATTTCATGACAGTATACTTTTGCAGTTACTACCA
TTATTGACATGTCAAAAAGTGTCCATTGTCATGTTGCTACCCGGTAGGTT
TAGCAAGCCTCCCGCATGAGTAATCTAATTCTCCACATTAGTGCTGCTTG
TGTATGGAGCTGAAGGAACAAGAGTAACCATAAGAATCTTGGCATCTTCC
TGACACATAATTACTTAAATTTTACATGTTTGGTTTGGATTCTTAGGGGA
TGGAAGATGTTATAGCCTAACAGAACACATTCTGCCTCTTGTCTAGAGCA
TGTATAAACTGTATTTTATATTTCATTTTTTCCGACCTAATTGAGCAATA
AGATAGATCTGTCCAGCCTAAAGGTTGGTAGATGTTAAAACCAAGCAAGG
CCAACAAAACACAATCTGCCTCTTGTCTGGGGCATGCATAAACTGTATCT
TACATTCTACTCCATTTTTTCTACCTAGTTGAGCAATAAGATAGACCTGT
TCAGCCTAAACATGGCGTAGAGTTGAGGTCTGAATAACTTTACAGGCATT
CTAGCTTGATGAACGACTGCTGTGTTGCTGATATTCTTGGAACGAATAAA
GTGTTTTGTTCCCCTTAACTACCAAATAACTTGTAAATTCAGTGTGATCT
CATCTCTGTTGCTTCTCATCACCTTTCTTTTGTTGAGAACACATTATGTG
ATTCCTGGACCTTATTTTAACTGTTAAACCTTTCCTTTTCTCATCACTGT
TCTCCTTTGTTTCATGCAGGTGGACTAAATGTAGAAGGAGAGGCAGATAG
TTGGGATTTTGGTGTTGGTAAGGACTATAGCTAAGACAATCTTGTTTGAC
ATTTGCAGTTTGTACGATATATGGCTCAGCAACTTCCATGAGAGTCTACA
ACTTACTGCATGATGTATGGCTGTACTGTTTTCCGTTTTTGTCTTAATTT
ATGCTGGTTTGCTGATATTGTGTTTGTTATGGAGCAAATATTTATAATTT
TTTAGAAACATATGCACATAATTACTGCAAACATGTTCTTTAATACTACC
TCTGTGCTGAATTAGATGTCACAGATTTGTCTTGATTCGCATGTATCTAC
GTCTAGATACATGCGAATCTAGACAAATCTGTGACATCCTTTTTGGGACA
GAGGGAGTAGATGAAACCTCTCATGGAGTTGCTGAATAAATAAATATTTA
ATCAACACATTGAACTAAGGATATTCTTTTCATTTTGACATTGCTGTATC
TCGATGTGGTCAAAGCTCAGCAAGATTGTCCTAGCGATAACATTCTTTAT
CTCAACCATCAGGGTCCCACCAGATCATATGTTAAGACACAACAGATATA
TATCCGATGGTTTAGATTTTTCTTTATCAATGTGGGATCTGATAACATGG
CGCCCTTTGGCCTCTGTTAACCTGTTAAGACACAAACATCATGTACTATT
CAGCAAGTGAATTTGACAACTAGGACAAAAAATAATAATATGTGGCCATT
AATTCTTTCATCTGGCACCTATGTTTGACGTAAAGATGCAATAATTGAAT
ACACCTTACTGTTGGGTCATAATAAGATAACTATTCATGAATTCGTGAAG
TTATTCTACAGTATTTCTAAATCAATTAGGTAATAATGGATGCTCTGATT
TTCTTTTCTCCATTAGAGAGTCCAGATTGTTTACATTTGTCGAATTCTTC
TAAGCGAGCACCACCTGAAGCATTGTGTCATGTTAAGTATATGTGTCTGC
ATGTGGCTAGACCTGCCTAACATTCCTATCTTGATTGTTCATGATTAGGT
GCTGGATTTTATTTGAATGCCACAAATGAGAAGTGGAAAAACTGGCGCAT
GTATGACTATGTTGTGAAGGAGCTGCCAAACGTTTTAAGTGACAACTTTG
AACAGCTTAACACGTCATGTGCATCAATTTTTGGTCACTCTATGGGAGGG
CATGGTGCACTGACTATCTACCTGAAGAACACTGACAAATACAAGGTACT
ATTTCTTAAGACCTCAGTATCTGGAAATCTCTGTCTAGGAACCTTTTTAT
ATCTGGAAACTTGTAGGTGTCTACCTCATATACAATCTGCACTCTGTTAT
TATTATTTTCACCGAATCTCACATGGCACTGTGAATTTATCTCATATATG
CAGTCGGTGTCTGCATTTGCTCCAGTTGCTAACCCAATAAGCTGCCCTTG
GGGTCAGAAAGCATTCTCTAACTATTTGGGCTCAGCTAAATCAGAATGGG
AGGTAACTCTTCTCTGAGACCATCTCCCTCACTCTCTCCATCCATTCTGA
AACCAGGTAATGTTAAATACTTAATATTGTGTGCTTGTTGCAGGAATATG
ATGCAACCTGCTTGATTAGAAAGTCCAACGGAGTTTCAACTTCTATCCTG
ATTGACCAGGTATAAACGTATAATGCAACTATGAAATGGACAGTGTCCAA
TTCCTGCTTTCAGGCTATTTCTAGCCCATTGTGTTGTTTTTATCATATGT
TGTTGGAATGAACCATTTAGCATGTTGAGTTGCATTTTTCGATTAGAGTG
TAGTGACAACTGAGCAACTAGTCATCTCCATGTGCATGTAAGGTAGCTGG
AAAATGCTGCTGAAAGGTACAAGTGAGTATCAAACTAGGACCTGCTGTCT
GGCATTTGTGACAACATGTAGTCATCCTCCTGGATAACAGGCAACTGATT
GGTTAGTTATAAATTGAGCCCTATGACAATTTTAAATGAGTTGGTGTCTG
AAAGACATGAAGCCATTCTGATTGCTATTCCTGCTGCACATGGCGGGTTC
AGTTGGTAGTCTTGTACACTGGATATGCTTTGATATGATTGCCTCAAAGT
GATCACTTTCTAGCTTGGTTAGCATCAGTAGGAGTCCATTGCATGTTCAG
TAAGAGAGTCTATCAAGGCCATGCCACGGTACTTCTGGATCAGACATTCT
TACAGAAGTTCCATCAGTGTAGCATGTATTTTCTCTCGTGTTATCATTAG
ACATGTTCAGCTCAACTGCCCAGAGTCGAAGGCTGTCTACGCAACAGAAG
TGCATTAAGGAATTTATTATACATTGGTCGATAGTCTTGATGAACAATGT
GAATAGTACAGGTCCCTAGAGAGTAGTTTAGCTGTACACGAATTGTATCC
GATGGACATGTATTTCAAAACTTAATCCCTATGATTTATAACCTTTGGAT
TTCAGCATGCTGCTGCTATTTGCAAAGTTGTCTATACCTGCCTAATGCTG
TCACATCTGCCTTTATTAGTCCGTCCCTCCAAAATTATACTCCCTCCGTC
CTAAAAAGGATGTCGCGGATCTCTATGCACTAAAACACTTCTAGATGCAT
AGGAATCTAGACAAATCCGCGGCATCCTTTTTAGAATGGAGGGAGCAGTA
TGAATTAACCAATTTCTGCAAAAGCACTTATCTGTTCTTTTCTTTGCTAA
TTTGAATAGGGAGATGACGACAAGTTCCTGGCCGAGCAGCTGCTGCCTGG
CAACTTTGAGGAGGCGTGCAAGGCCGCGGGAGTTCCCCTGACCCTCCGCA
TGCAGCCCGGATACGACCATTCCTTCTTCTTCATCGCCACGTTCGTCGAC
GATCACATCGCACACCATGCCCAGTTTCTCAAGAGCGCTTGACTTTCCAG
TCGCCTGTAATTATGCAGTGAAGGGGAGATGCGGAGTTGGGCTGTGTCGC
TTTTGATGTGTCGGCTCACAATCTGTACCGTGGTCTTTCTGTCTGTGTAA
ACGTGCTCTCTGCTAGCTTTGCGTTGAACATTGTGTCCAGCTGGGAATAA
TATGGTAGACCCGTTCTGCTATCACGGCCTGATGCAAGCTGGAGGTCAAG
ACGTTTTTTACAAACACACGCGAAGCTCAGGTATGCTCACGAGTGCTCAT
CCCCATTCTCCTCCTACTGGCTGCGACGTGTGATCGTGTCTCGTCGACCC
CATTCCTGTGAATCCATCTCGTCTCGTCCCGTCTTTGACTGGGAGTAGAT
TAGCCCAACCAACGTTTCAGTACTGCACGACTCGGTCCAAAATTTGTGGG
ACGATGCTCCCGTAAATTACTCCTGCGCCGCTCCAGGGGCAGATTGCGAG
CAGAGACCCACCGCTCGTCCCGGCGTGGTAGGCATTAATTTACCCTCTGG
CGCGGCAGGCCAGGCGGCATCCGAGGTCATTTCTCACCCTTTCCCAGATC
GCATCTAAGCCTTGCCATACCACCTCTAATGTAGCCAGCTTACATGTGGG
ACCCCTCCATGGAGAGGGCCACGGGGCAGCCGCTGTGCGCGAGCACGTGA
TCGGTCGCGTCCGTTAGCTAGCCCCCCGCTCCCCGGGGTTATTTCTACCC
GCGTCTGCAGACGGGGCGATAGTCAGTCAGGGGAGAGTGGAGTGGATCTA
GCGGCGGGGGCTCCGGCCCTCCCGGGTCGCGGCCTCATCCGAGGAGGAGG
CCAGAGCCCAGGGCTCGGCCTAGGCCGGCCGACCGCCGGCGTCCTGCTCG
TCGGTGTGTATGTGCGGCGGCTTAAAGAGGGGCGCTCGGGGGAGATGCGC
CGGATCTCGCGTGGCATAGATCTGAACGACGGGAGGTATAAATCTTTTCT
CCTCAACTAGATCTAGTTTCTGCAAGTAAACCCCGCGTCCAGCCACTATT
TTGCCGGTGGGTGGATCCGAATCCGAAGTTAAAATTGTTGGTCATCCACC
GTACATCTGCAGTGTCAGTGTGGTACTAAGATTCCTGGGCTACCTTTTCG
TCCGTTCTAGATCGTCTAATAAGTTATTAGTTCTCCTCAAGTAAACCATG
AGCGCCACTGTTTCCGTGGGGCAAATTTGCTGGCCATCCACGGTAGATCT
ACACTGTTAACCTGCTACTATAAGCCAGATAACCTGGTGTTTCTTTTCTA
CGGTTCTACTCCCTCCGTTTAGAAATATAAGATGATTTAGGTTTGTGAAT
GAGATGTATCTAGACATCTTTTAGTGTATAGGTTCAAATGAATCTAGACA
CCTTTTAGTGTCTAGATACATCTCATTCACAAACCTAAAACATCTTATTT
TCCAAACGGAGGGAGTAGATCTCTTAGTTTCCTCAAGTGAACCATGAGCA
CCACTATTTTTCCTGGCTTGCGTCTCTACTGCAAATCGTTGGTCAGCCGC
CGTAGATCTACAGTATTTGGTATAAGCTAGGTTTTTCTCTAGTCCGTTTA
TTGCATGATTTCAGTATTTGCCTCGTTATGAAGATACATAATGCTTGATG
CATGTTGATGGGTTTCAGAACTAACACTTCACATCTGTATAGGTACCAGC
ATGGGATGAGAGTCACGGCTTTCTGTGGCCTGCAAAGATGAATCGAAGAT
GATGTTATTTAGCTGCCACCATCCATCTTCTTTTGTGTCTGAACATTGTC
AGATCTAGACTGGGCTCCTACAACACGTCCTGCCGACCTGCCTGCTCGTT
GGTGTTTATGCACAAGCAGCCTGCGCAGGGGAGATGCCCTGTATCAGGAG
GTATAAATTTTTTCTGCTGTTCTAGACTGTTTTATTTTGTTCCAAGCAAG
CCTTGCGTAAATATGCCACTGTTTTCTGAGATGGCTGCCTGGTGCCAAGA
ACGATCTTTGGTGCTGTTGTCTGTCTACTGTAGTGTAGATCTACAGTGTT
ATCTATAAGCTAATCTAGATTCATAGGGTTTGGTGCAGTCCATTTGTTGT
CTAGGCAACTCATTGCTCAGAATTTGTCCTCTTTATGAAGAAACATTAGA
TACATGCTGATTAGTTTCCCATCTAATAATGAATACCAGAATCGTATATA
GTTTAATTTCTGCAACTAAACCATGTGTACCAGCCACTGTTGCTTGGCTG
GTTGGTGTGTACATCAATCTGTACTGCTGCTGTTTGTTATTCAGTATAGA
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TATTTTGATTAGGTGCATGCTGATTGAGTAGTCAACTAACAGCTAATAAT
TTCATATGCGTAGGTACATGTCTTCTTTGGATCGATATTGGCACAGTTTT
TCCTCTCTTGACAAGGATATACCAGATCAAGCATCATATCATGTACACAG
TAAACTTTTACTATGCCTTCACCGTTAATGTCTACTGGTTGGATCATGCT
TCTGTTTATGAGCTCATTGAAGTAACCATCTCCTAACTCAAATGGTCCGA
TTTCTTGTTTTTATGATACACAAAACCTTCAGCTATCCACTTGCAAATCA
GTTGGTCTCTCTTAATTTTGTTATCTTCTGAAAATATGCTTAGATATAAT
AAATGATGTGAAGGTAGATCATAGAAAAAGCATCATCTTTGGTTGCAAGC
TAGCTGTGGTAGGCTAGTGGTTTGGCATAAATAAGGGTCACACTATGTAA
TTACTTTAGATCTAGTAAAGAATGCACTTGACTTTTAGGTCATGTGGGAG
ATATGATCTACAAGTCAAGCTTCTTTTACTAGTTCTTTTTCATGTTCTCA
TTTATATGATTAGTTATTATAGCTAACTATGTATTGAGAGGACACAATAT
TATGATAATGCACAATAGGGGTCTCACATACTCTATATCTTAAGTACTTT
AGTTTTAGATCTAGTAAAGGAGGTTCTTGACTTCTAGGTGAGATATGATC
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ATCAGTTATTATGGCTAACTATGTTTTGAGAAGATCACAAGATTAGGCAA
GGTCACTTGATCTATAAGTGGATAGCTGAATGTTTTGTGTATCATTAAAA
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AAACAGAAGTATGATTCAACCAATAGACATTAATGTTGATGATGAAGGCA
GGGAAAGTCTTAATTGTGTACATGATATGGTGATTGATCTATACATTTTT
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AAGCATGCCTCAAGGGTGATCTATGCAGTTTCCAGATGTCCTATTGTTGA
TCCAGTGCTGCTTATGCCAAGTGTTTGCATTTCCTCTGTTCTAACCAATC
AAGGCTGTCCAGACTCATTGCATCTTACTTGGTGTTTTGAAGCTCTCGTA
CTGATCTACCCACTTGTATTTGTGTTCTATTGTTGCTTCCATTGATCCAA
GGATCACTAGGCTCCTACATTTTCTCGCGCTGAACTTCCTTCCATCTATC
TGTTTTGTAAGCAAGAGTATGAAATCATGGTATAGAGCTGGTTGGTTTGC
AAGCTTTGATTGTTCACTGTGTCATCTTACTAGCAATCTGATAATTTTTT
CCCGTTTATACAATTATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.