Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA014149

[Submit comment/correction]

Sequence
AA014149
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA014149
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCAAATCAGTAATTATTAGAACAGGTTCCTCCCCGGTGAATACCCGTCC
CCACCGGCCCACCCTGCTCGACCGACTATCCGCCGTCTCTTCTCCGCCGC
CACATCCCACCCGACGGCGACACGTTCCGCCTCCACAAAGGGGCACGGGA
AGCTCTTCCCCGCCGGGTCGATTTGGCAGAGGTACTCTTCCTTCGCAGCT
AGGGTTTCCCGCCGTATCCTTGGATCGATGACGTCTTCTCTTATCTACGG
ACGATTGCAGTGCGCATTACCTTCCCAGATCCCCTAAATCAGACTCACTA
GCCAATTGTTGGTGCAAATTGTTTTGGTTAGTGTATATTGCCTAAATTCA
GCCGACAGCAAAATTCAGGTTGTGTGCCCATGGTGTGCTACGCTTCTAGT
TCAGATTGATTACACCTGGAGTATTTTTTTTTTAGTCGTGCATCGTGGTA
TTCTTTTGTTTAGGTCGCTCAGCACATATGCCATGTGGGTTTTTAGTCCT
GTGTCAGAATCAGTAGCTATTGTTCAATGCAAGATTGCAAATAGTTGATT
ATTGAGGTACTACTTACTGTTAGCTGTGTCTCCTGGGGTTTCTTTGTTTT
GAGGTCGATGGTAGATTCTTTTTGTGCTTGGTCGTAGAGGTAAAATATGG
GTGACTGGTTCCTTTGGGATTGGCTGGTGGTGATGCCAGTCTGTTCGAGG
CCTGGGGACAGAACTGCTTGTATTGTGTTTACCATTTTTCATCTAATGAA
GAATGGGGGCTGAGAGCTCCTTTAATGAAAAATGTTGATTTGATTCGCTA
GCATGGAGTAAATTCACTAGCCATTGTTTAATACAAATTGTTTTTATTAA
ATTTTACCCCTATATTTAGTTGGCAGCACTTATCCCCTGTTTGACACTGT
CCTCCAGACCCACAAGGACATCGACTCAGCATGGAAAGTGAGAGGCAGCC
ACCTGCTGCAGCGTCCGCCGCAATATCAAAGGTGCTCAACAACGATGACC
TTCTCATCGAGATCCTCCTCCGCGTCGGTTTCCCCACCAACCTTGTCCGT
GTTGCTCTTGTCTGCAAATACTGGCTACGGCACGTCTCCGACCCCAAGTT
CCTCCATCGTTTCCACAAGCTCCACCCGTCTACCCTCCTTGGCTTCTATA
TTGCCACTGGGCCGACGCTGCATGCTCCGCACTTCGTGCCGATGCAGCCT
CAGCCCCCAGAGCTTGCTGCCGTCATTGGTCGCACAGGCTTCAGCCTGGA
CTGTGACCAGAAAGTACTGACCTACATAAGGGATTGTCGGGATGGCAGGG
TCTTCACCACACGATGCAAAGGAAGTGAATCGATACATAGAGTGTACAAC
CCGTTGTTCCCTGAGAAAGGTATGCTCATCATCCCACCAATCCCAAGCTA
CCAACGTCAGGACGACTATTACTGCTGTTTGAGTCAAATCCTCTCTGTAA
AAGAAGGCGATGACTTGTCCTACTTGTTTGTGTGGGTAGCGTCTAAAAAG
GTAAGAACAAAATCTATGGTTCATGTATATATCTTGCGACCTGGTGATGA
TGTCTGGCGCACACATCTTACCTTGGCCACAGACCCGCTCTCTAATAACC
GGGTTACAAAATTTGTGCTCAGTGACAATAAAATCTATATGCGGGGCGTA
AGGAGCGACATTGTCGTCTTGGATTTGGTAGCCTCGAGATCCTCTATAAT
TCGTCTCCCACAAGGGGTGGAGTATGGAGATAGGGACACTATGTTGTCAC
GGGCAGATGATGCACCTGGTGTATATCTCATCCAAGTGAAGGAGCTTCAG
CTTCGCATCTGGCTCCACAAAGGGGACAATTGGTTGATGGTGGACACCAT
CAGTTTGGTTGAGATGTGTGGTAATTTGAGCATATCAGATTGCATGGGTG
AGGAAGAGCAAACTGCAGTTCTTTGGATAAAGCAGGTGGGAGACAACGTT
GAGTTTGTTTTCTTGCAGATGGGTCGATACATACTCTATTTGGATATCAA
GTGCAGGACATTGCGTAAAGTGCATGAGATGGCAGGCAAGGATCAATGTT
ACTATGTTCATATCTATCCTTTTAAGATGATCTGGCCTCCCACTTTCCCT
CCGCTGAAGGATGATCCTTCAAGGTATGCCTTTTGCGCTCTAAATGATTT
GTATAGTTCTGTTGTTGAGGTTACCAATATTTGCAACCTGCATAGTGTTA
TTCTCTTTCCTGTTTTGCTACTTTGTTATTGGCTTATTGCCACATGCTTT
AAATTTCATATTTGTAGCTTTCATCAATACACCATCATAAACGACTACTT
GTGGAAAGAATTGGCATTGCTGCATTTGTGATGCTCTGACACTCTTGTTA
GTTGTTCATCAACCATCAATATTTGATTTAACTGTAGAATACTGTATGTT
TGATTCCTTAGGTGATTTTAAGAATACTAGCTAACCATCATTTCAGGTGA
AAGATGCCTAGCCCTGTATTCGGATATATCACTGTTTTCTGAACTACAAA
TGAACTTACATAAGTACAAAACATCATGTATAAGAGCTGAAAGGTGCCTA
GACTTGTTATCCCATTGACCACTGTATTTTCCTGTCCTGAAATATTATCA
CAAACCCATCAATCCTGAAACTCTAGCTTCCTATTTCTCAAAATTAATTA
TGGTATAACTTTTGGGTGTGGTCTATGTCACCTCCGTACCGTTCAACCTT
GAACCTCAAACTATCATGTCTGAGATCGTTAATACTTTGGATTTTTCCAA
ATATTGCAGTTATGTTGAAGCAGTCTATCGCTTATTTCATTTTTGGTGGA
TTTTTTATTTTACATGGTACGCATAAGCTTGTTCAAAATTTCTGATTCAC
ATATCACAATGAAAACTTTCCTGTTGTATGATACACAGTGATCAGTCCAA
GCTAACAGTGGCAGTGGTAGTTTGTGCTTGTGTGGCATTTATCAATCTCG
ATCAGATATTTTGCAATGAATTCCTGGAGCTTCTGCAATGAAAAAATAAA
CTGTATTGCAAGAAGAAATGCATTATTTTGACTTTTGAGTGCACATAATA
CTCGACTATCATTGTACTAGCCACTTATCTTTATGTCCATTTGATATCCC
CATGCTGATCCTTCCCTGGTTTGCTTGAAACAGAAATGCCATGTGAAGAA
CAGGGAATCATGGAATCAAGGAAGATTAGTAGTGAGCTGCATTTCCTCGA
GTAGCTGTAGGCATGTAGCAGTTCTAACTTCCCTTATGATACTTCTTAGT
GGGTTCCTATGTAACTGGAGCAAGTACTTATTTGGTACTAGTTCGGGTCC
GAAACTTTTGTTACGTGAAGAAGACTCACTCTTTGTTGACGAGGTATCTT
GTCAGATTCTCGTGTGTTGCAGTCCTATGGTTCCAATGCGTGCCTGCTTG
TTTGCTCGTGGCATTCAGTGAAGTGTATTTTTCTTCACTGTTGCAAGATT
GGTTTCTGTTGGTTAGCGATGTGCAAGGAAATATGCCGCATTTAACCTGG
ACCATTGAACTTCTAGGGAAGGAAAGAAACTATTGATGGAAAAACTGATT
TTCAACTTTTGAGAGCACATATTAGTTGATTATCGTTGTGATAGCCACTT
GTGTTTGTGTTTGTGTTTGCATTTCTTGGTGGTCATATTCTCCAGAAGGA
AAAGGGCATTTGCAATATACATGCAGTATACCTATGGTTGTAGTTAAAAC
AATTCCCAAGCTTCGTTGATCACCGTAGTTCTTTTGTTTGGTTCTACTTC
TAGATTACCTATGATACAATAATACTCACCTAATCATGTAAACAAACATC
ATTTGATACATTTTCTTTCATATCAGAAAAAAATGCATTGTACTTCCAAT
GGATGCATCCGTTTTTGCTATACATGGTTTTTGTATTGAGGGGTTTGTCC
TTCTTTCCGGTGATCCTTTTGCATTCATAAATTGATACACAACATGCACA
AATCAACACTAAATATAGTAGTAACGTTTGGCCTAATTTAGGAAATTCAC
AATGTACATGTTAATGTTTTATGTATGGTTACAACTTGGTCACTGAATTT
TGGAATAAGAGGTTTCACCTAAGAGATTCGGATCAAACTTAAACACCAAT
TGGATGTCTAAGTTGTGTCGGTACTCGGTAGCACAGGTTCATTATCTATT
GTATGTCAGGAGCGCGACCAAGCGTGCCTACCCTCCTAGTTAGTATTGTT
TGCCACCGACACCTTTGTTTTATGTTCGAGGAGACATAGTGTGCAACCAA
CACCTTTGTTTCATGGTCGAGAAGGAGGCTTATTGTTTGCAACCAACATC
TTTGTTTCGTGGTCGAGAAGGGCTTGTATATATTTTTTTTACCAAAGCTT
GTATTTTTTTGATGTGCTTGTTTTGTATTTTCTTTGGAAAAGGAAGTGGG
AGATTTTCTCTCTGTAATTAATAAGGAACGATTGCAAAAAACATTGTGGA
TAGAAAATGGAGAAAAAACACTAGAGTTGGTTGTGTTTGAAGGATCATAA
ACTTTGGTTCCAAGCTATGGAGATTCAACCACTATTTTTTTCACGGTCTT
AAGGCTAAAGTGCACCAACTCTATGCGGACAACTATTCCAATTTCGAATC
GGTTGCTCAAACTCCTACATCTCATTGTCCCATCCATATTTTTCATGCAC
GGCATTGGCCCGACACTGTCTTTCACAGGCCTGACATGGCCCGGCACGCT
AGAGCCTGTTACCAGCGAGCTGTGTCGGGCCGGCATGTCGACCCGTTTGG
CACGTGGGACACGCCGTCCCATCTTTTTCCATGCAGGCCTTCAAGAAAAC
CCTTAAGTTTGCCGAGCTGCTACTATAACACAAAAGATTTAGTAGTCTGG
TGGTTGAGGAGAGGGCGTAGTAGGTGTAGGCCATCCTATTTTTGCAAACT
ATTATTCTGCTAATCATGTGCTCGCGCGGGCTAAGGACGTGTTTGATAGG
TCGTATGCGATTTTCGGCTCAGTTGGACACTGCTAGAATGGGTAGTGCCG
CGCTGACTTATACATGTGAAAGCCACCTTTACAGTTTGTTTGGTAAGCTG
CAGGGAGATCTTTTGCACGAGGACAATAACAAATACATGTTGTTTGGTTG
CCTGCATTGATTTGGATGTCACACTAACAGATATACCTAAACAGTCATCA
ACACAAATCTTGTTGTGTTCGCAACATAGAAAACAAAAAAAAATCCTATG
ATGGAAACTATATACGCCACGATCCATCTATCTAGATACAATCAACGGGT
GGATATACATCCGTAGAATATATACCCTTGAAAACCGACATAGCTTTACG
AATATAGACTCGTTGGTGATGTAGTCGATCTCTTGCTGATCTCAAGATCG
TGTAGAAGTCCGGTAGCACCGCAACTCAGCGAAGCATCCGTGATCGCACA
AACGTCCGGAAATCCGACCACCTCCGCGACCTCGCTCCAGCAATGCAGCA
GAAGTAGCAAATCCTTGCTCTAGAAAAACCCACCGAAAACATGTATCTCG
CTAAGTCAAGACCATGGGGAAATAGTAGAGGGGAAGAGAGATCCTTCACG
ACGAGGCGTGAGTGATAGAGAGGGATAGGGAGTCTTTTATAGGAGGAGGG
GGAACCCCAAGGGCCATGGCCGGCGGCCAAGGTGCTTGCCCCCACCCCTT
CTCCATTCATGTGAGTGGAGCTCCCACTCACAAAATGACTCTCCATTTCC
TCCACTCAAAATTTCACTCACATGCATTAAATTTTCACCAAATTTAATGC
AAGCTCTCATTTAATAAAACTCTTTTATTAATTTTATTTAGAATTTTGTT
AATTACATTAAATTAACAAATATTCACATAAAACCCCTTGCAATATTTCA
ATTTTATATGCAGAACCAGTTTCAGCAATTTCACCCCAAACAATTCTGGT
TTCTATTAAAATAATTCCAGCATTTTCTTTTTCTTTCTATGGAATCTTAT
TTGCTCCAAATGGTATAGGTATCCCATAAGTGTGTCACCCTTCGGTTCGC
GAACAATGCAGACATGATCGAGACTCCTCTCCGATCAATAATCAGCACCG
GGACCTGGAGATCCGTACTGACTCCCACACATTCAACAATGATTTCTTGT
GATCGTGTGAACCTTTTTACACTTGTGACTAAATCTTTTTGTCTCGCGAT
ATTTTACATTTCCGAGATTCGATCATCGGTATCCCCATACCTAGTTTGAT
CTCGTTACCGACATGTACTCTTTTCTTGTTCCCGTGATATAACATTCTAG
TGATCCCCATCACTTGTTTGCAAACTATATCAATATGATATCACCGAGAG
GGCCCAAAGTATATTTCTCCGTCATTTGTATGGACAAATCCCACTCTTAA
TCCATGAGCCTCAACATAACATTATCGGAGTATTCAAACCCACCTTTATA
GTCGCCCTGTTATGGTATGACGTTTGATGTTATCAAGACACTCTTTATAT
GTTAGTGATTGACACGATCTTATAGTCTAAAGACTAAAGTTACTTGTAAT
GATGTTATAGTAATTTAAACATAATAACTTTGATCGTATTATTATACTTT
GGATAAATGTTCATCACATCATTCCACCAATACTGTGACCTTTAACAGCA
TCCAATGTCCATGATCAGGAAACCTTGATCATTATATTAATCAACGAGCT
AATTTATATGAGAGGCATAACTAGAAGCACTTTATTTATTTATTAAACAC
ACATGTATTAATGTTTCCAATTAATACAATTATATCATGAGAAATAAACA
TTTATCATAAACAAGAAATAAGATAATAACCACCTTATTATTGCCTCTCG
GGCATATTCCCTTCATATATGTTCTTCGTTGTCTATTGTTGCAGTTGTTG
GCACAAGACCTATTGCGTCTGCGTTGACGACGGAGGGCGGCGGGGAACCT
TCTTGCAGCTGCGCCGGTGATGGAGGGCGACATGACACGTACTACGGCTA
TATCAGTGATGGAGGGCGGTGGGCTACCTGCTGCGGTTGCACCAGTGTGC
GAAATGACACCTTATGTGGCTGCGCCGATGGTAGAATGCAATAACGACAA
ACCACAGTACCATCGATGAGGAACCGCTCGATCTTGCTCGCCGTATCGGG
ATACTTCCCCATGGCGCGTCTAGGAACTCGAGATGGAACACGACATAATG
GAACACCTGGAATAGGTTCGTGAAGGGGAGCTCCGCGCGATCATAGCCGC
GGTCGACGATGACGACCTTGGCGGTCCTCTATATGCACGACCCGCGCGTC
GAGTAGGCCTTCTTTATCAACCTCATTTTTAACCTCACGTACAAGTTGAG
AAGCTACATATTGATTTCTCTACATCCACCAAAACGAAAAACTTCCAACA
CAAGAGTTGTGGGGAACAGCAAGATCAAGCTATCCCCCAAAATAAATTTC
GAACGGTTGAACGTGTGCAGTTGAATGTGTGCGACAAAACTGACGAAATT
CGCTAAAAGAACTCTAACTTTGGCCATAAATCTGAAAAGATATAGCTCAC
CAAATTAATGATGATAGTCAGAATAAAATCCCCTCGTCGACCTGCATCTT
TTTCATATAGAGATTGATTTGATTCGAAGTCTATACGTGCTAATCACAAG
TGTCTATAGTAAACCTGCTTAGAGAGGAGAGAGAAAAGTGGACTCGTATT
ACAGATCCAACAGATCCAAGTGAGATTCCACTAAATTCTACTTGAAGCAC
ATTTTGTCATTTCTAGTGTAAAATTTGGACAAAAATTGTGTACTAGAAAT
AACAAAATAAATAGAAGTGGGATATAGATAAGATCCCACACCATAACTCA
TATGGAAGCGTGCAAGGATGAATTCATGAGGGTGCTTTGACGTGCGCTCA
GGCTAGCTCCACCCAAACGCTGCTCAATTCAAACGTTATATATGGGCCTA
GCTCTGGGCTGTTTTACGACTCACACAAGACAGACCCTAAAGGTAACACA
GGTAACCAATAGCCCATTTTCTTTCCATCTGGCCTGCCTAGAGTGGTGCA
ACCTATCAAATGCATCTTAAATTCTAAACGAGTCGTGTCAGGCTAGCCCG
TGTCCTTGAGGCTGTGCTTTTTCTACGTGCCTCGGGCCGGCCCGTTGGCC
AGGTTTGGGTGGGCCTAACCGTCCACGGCACAAAATTAACTTTTTTTTAC
CATGACTTCATCGCCGCCCGTGGATTCCGTACGAGCGCACCCAGTCGCCC
CTCCGCCGCCCTAACCCGCCCCACGGCGGCGCCTTTCGGCGGCACGCACG
CCGAAGCAGTATACTCCCGCTGGCAAGGGATTCCCCGCCGGATCCATCTG
GAAACAGGTACTCATCATCTGGCCCATGTATGGATCAATGACGTCTTCTT
GTATATGCTGGGCCTGGATTCCCAAATCAGTTTCAGTTGCCATGGAGTGA
TTTAGTTCCGAATCAGATTCACTAGCCAATGTTTTATGCAAAATTGTTGT
CTGCTCCATGCCTAAATTCAGTTGATAGCACTGATCAGATTGGCTAGCCA
TGGAGTATCAGATTCACTAGCTATTGTTTAACACAATTTATTACTAATTT
GTAAGATTCGCTAGCATGGAGTATTTCTGTCCCAACCCAGATTACCTAGC
CATTGTTTAATTAATACATTGCCTAAATTCAGTCAGCAGCACTAATCCCC
TGTTCTACACTGTCCACGGACATCAGCTCAGCATGGAAGTCAAGAGCCAG
TCGCCGCTGGCAGCGTCTGCTGCTGTATCGAAGGTGCTTGACGACGACGA
CCTGCTTCTCGAGATCATCGTCCGCGTCGCCTTCCCTACCAGCCTCGTCC
GTGCTGCCCTTGTCTGCAAGCGCTGGTTATGGCACATCTCTGACCCCAAG
TTCCTCAGCCGTTTCTGCAAGCTCCACCCGCCCCGCCTTCTCGGCTTCTA
CGTTAACAATGCGGCGTTGCCGCGGTACCCTCTGTGCTTCATCCCGATGC
AGCCTCAGACCCCAGAACTCACTGCCGTCATGCGCCATGCAAGCTTCAGC
CTGGATAGTGGCCAGAAGGCAGTGGCCTACATAAGGGACTGTCGGAATGG
CAGGATCTGCATCATGTTCTGCGAAGGAACTGAAGTGAAACATGGAGTTT
ACAACCCGTTGTTCCCTGAGAGAGGCATGTCCATCATCCCACCATTCCCA
TGCTACCAACGAAAGGACGACTATTATTCGTGGAGTCATCTCTTCTCTAT
AAACGAAGGTGACGATTTGTACTTCTTGTATGTATTGGTGGAGTCTAACA
AGGAGACAGGCAAATCTGTTGTTCATGTATATACGTTGCGACCTGGTGAT
GGTGTATGGCACATACATCTTACCTTGGCCACAGACCCGCTCTCTGATCA
CTGGGATAAGAAAGCCATGCTCATTGACAATAAAATCTATATGCCAGGCT
TCCCGAGCGACATTGTCGTCTTGGATTTGGTAGCCTCGAGTTCCTCTGCA
ATTCGTCTCCCACCAGGGGTGGATTATGGAGATAGAGACAACATGTTGTC
ACGGTCAGATGATGCATCTGGTGTATACCTCATTCAAACAAAGGAGCTTC
AGCTTCGCATCTGGCTCCATGAAGGGGACCATTGGTTGATGGTGGACACC
ATCTCGTTGGTTGATATGTTTGCTAATTTGAGGATATCAGATTGCATGGG
TAAGGAAGAGCAAACTGCTGTTCTTCGGATAAAGCGGGTGGGGGACAACG
TTGAGTTTGTGTTCTTGCAGATGGGTCGACACATACTCTATTTGGATATC
AAGTGCAGGACATTGCATAAAGTGTATGAGTTGACAGACAAGGGTCTAGG
TTTCTATTTTGATATCTATCCTTTTAAGATGATTTGGCCTCCCACTTTCC
CTCTGCTGAAGGATGATCCTTCAAGGTATGCCTTTTGTGCTTTAGATGAT
TTGTATAGTGATGTTGTTGAGGTTACCAATGTTTGGAGTCTGCATACTGT
TATTTTCTTTCCTGTTTTGCTGCTTTGTTATTGCCACACACTTTAAATTT
CAGACTTTTAGCTTTCATGAATACACCATCATAATTGATTACTTGTGGAA
AGAATTGGTATTGCTGCACTTGTGATGCTCCGACACTCTTGTTGTTTGTT
CATCAACCATCAATATTTGGTATAACTGTAGAATACTGTATGTTTGATTA
GGTAATTTTAGGAATACTAGCTAACCATCATTTCAGGTGAAAGATGCCTA
GCCTTGTATTCTGCCAACTAACATGGACCTTCTATTCTGATATATCACTG
TTTTCTGAACTGCAAATGAACTTACAGAAGTAGAAAAACATCATGTATAA
GAGCTGAAAGATGCCTAGACTTTTTATCCGGTTGACCACTGTATTTTCTT
GCTGGAATATTATCACAAACCCATCAAGCCTGAAACCTTAGCTTCAATTT
TCTCAGAATTTATCATAGTCTAACTTTGTCTTGTGGTCATGAGTCGGCTT
CATACCTTTGAACTCCAAGCCTCAAGCCATCAAGTATGAGATTGATAAAA
AAAATTCCAATTGTTGCTGTTATGTTGAAGTATTCTATTGCTTATTCAAA
ACTTCAGCGAATTGTATATTCACACGGGTACACTTAAGCTTGTGCATATC
ACAACGAAGTTTTTCCTTTTGCATGAAAATTGATCAGTCCAAGCTAACAG
TTGTAATTTGTGCTCGTGTGACATTTATCCTTCTTCGTCAGATCTTTTGC
AATGAACTGCGGGAGCTTTTGTAATGGAAAAAAAACTGTCGCCAGAACAA
ATGCATTATTTCATCTTTTGAGTGCACATAATACTCGACTACCGTTGTAC
TAGACACTTATCTTTGTGTCCCTTTGATATCCTGACAATTCATCATTCCC
ATGCTGATCCTTCCTCGGTTTTACTTGGAACAGAAATGCCATGTGAAGAA
CAGGGAAGCATGGAATCAAGGAAGATTAGTAGTGAGTCTCAAGTAGCTGT
AGGCATGTGGCAGTTCTATCTTCCCTTTTGATACTTCTTAGTGGGTTCCT
ATGTAACTGGAGAAAGTACCCCTTTGGTAGCTTGTGACCGAAGTCTTTGT
TTCGTGAAGAGTACTCCCTCTATGTGTTCAGTCCAATGGTTGCACTGCCT
TCCTGCTTGTTTGCTCGTGGTATTCAGTGAAGTGTCTTTTTCTTCACCGT
TGCAAACTTGTATTCGGAGAAGTGTTCTTGTTCACCATTTCAAAAAACTG
AATTTCGGTTAGCGATAATATAAGTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.