Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012972

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012972
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012972
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATTCGCCAGTTTCTTCCTCGAACGCCCATTCATGTCCATGGCGTCCTCGC GAATCCTTCCCCTCGCGCTGCTCCTCTCCGTGCTGTCCGTGGCGCAAGCT CGGCTCCCGTTGCAGACCATTATCCGGCTCCCGTCGCAGCAGCACGAGGC GGCAGGTCAGGCGCCGGAGAATGAAGTCCCCGTCGTCGGCGCAAGGTGGG CCGTCCTCGTCGCCGGCTCCAAAGAATACTACAACTACCGTCACCAGGTG CGCACCGCACGCCTACTGTTTTTCCACCAGCTGCTGCTCCGTCTAATCTC GGGAGGATGGATTTCCTGGGTAGCTTGCTTGCTTAGTTGGCAATATATAC ACAGGAAAAACTTCCAATTGGTATTGCTGCTGCTACATACTGTCTGGCTC TATGAACTTGATTTCAGCTTTCTATTCTTGCTATTACTACACAGTTAGTA GAGATCAGTGGCTGCGTGTCTAAATTAACTGGGAATGGAAACTCGATCGC AGGCCGATATCTGCCACGCCTACTAGATCTTGAGCAAGGGCGGTCTCAAG GACGAGAACATCGTCGTGTTCATGTATGACGACATTGCGAACCACCCCGA GAATCCAAGGCCAGGCGTCATCATCAACCACCCCCAAGGTGGAGATGTCT ACAATGGGGTCCCAAAGGTACGTACGTAGTTGATCATGTGAATTATTATC CGGCTTACAGTTTTTACAGTTTATTGATCCAGTAAATAAAATAAAATAAA ATAAAATGGAAGAGATTAGCTTACTGCTATTGGTACTATTTGCTTGACGG ATCCATAAAAATATGAACATGATTACAAAGAAATTCCAGTTAAGCATTTG TCCCTGAAATTTGTCAGTCCTTACGCCGTGTTCTCATATATATATATATA TATTGTTCTGACTCGTGAATAGAAAAATTACGCGTGGTCCACGTGCACAG GTGGTTAGATGTCAACATTATATTGGATAATGTCAACATCTCCATCGTCT AAAATCCTAATGTTGTGTCCCTTTCCATATACAATGTCAACATCATGCAT GATTCCTGCCCTCTCATCTCAACATCATGATTCCTACCGAGTAGTTGTCA TGCCGCTCTCCCGTTCTATTTTTATTTCGGATTTGTTTCCGCCCCTAACA AAAAAAAATACTATTGCCCTGGCTGGCTCTATCGCTTGTACACCTACCTA TTCTTCTATGAATATAATGAGCAGCTTGCTTGCCCGCGCCGATTCGTCAA AAAACAATGTACAGTTTTACATAATTTGTCTATTTTGGGCCAATGTAGGA CTACACGGGTGAAGAGGTCAATGTCAACAACTTTCTCTCTGTCCTGCTCG GTAACAAAACAGCTCTCAGTGGTGGGAGCGGCAAGGTCGTGGACAGTGGG CCTAACGATCACATCTTCGTTTTTTACAGTGACCATGGAGGTCCCGGGGT CATTGGTCGGTATTCTTGCACTCCCTATCTTTAATTTGTTGTTTCTTGCT CAGACATTATTTGGGAATATATGAAAAACCAATAAGAAAATACATTTTAT AGAGAAATTAAAATCTATATGTTATGCATACATATATATTCCCTCCATCC TCAAATAACTGACTTCTAGGTTTTGACATATGTCGAACATTTGTAAATTT GACCAACTTTTCAGAAAATAGTGGCAGCATATATAAAAAAATCAAATTTA TATGTTATGATACTCCATGTGAAATGGATCCAGTGATAATACATGGTGTC ATAAATGTGTCGCAACATGTGGACAAAGGTTAGAAGTATGCTTATTTGCG GATGGAGAGAGTACATATATACATAAAAATCTAGGTGTGTACTCCCTCCG CTCTTTTATACAGAAGTCCACAACACACTTTTAAGGTAATAAGAAACGCA ACCAACTGGAAATGCTTTTGTACACGGGGCTGATTAAGAATGTTGCATAT TGTGGTTCTTTCCCTACAAATGCATGCAATGTTTGAATTAATAAGTAGCA TCCTATAGGAGTAAGAAATCTAATCAGTTTTTCTCGGTAAGTGTTTATAG ATGCATAATATATCTTTGAGTGTCCTTGTATTGAAAACATAGAGTAAATT GCCTTATTAATCTAACTCCACAAGCTACTCTTGGTTTTTGTCTTTGTTAT TTTTATTTTAGTTGCAGTCCTAGACATGTTAGTTATGCAAAGACCGGCTA TAAACTTATAGACTCTGTATCTTTAGTACTCTCTCCGATCCTAAATAAGT GTCACAGTTTTGCACTAGAATTAGTTCAAAACTACGACACTTATTTAGGA TCATAGGTAGTATGATATATTTGAGTAATAACATTCTATTTTTCAATAAA AACACAGGTTTTCTTCCTTGTTTTGGATATTTTTGCAGGGATGCCTACCA AACCATATGTTTACGCCAATGATCTCGTAGACACCCTGAAGAAGAAGCAC GCCGCCGGATCTTACAAAAGCTTGGTATCCGATCGATCATTTTTTAATTT GGTTAATTTAACTCAACAAGCACGCTATGCTCCTTTAAGCATGAACATCC ATCAATGTATGGTAGTTGTCTGACACATTTTGCATGCAGGTGTTTTACCT TGAAGCATGTGACGCCGGGAGTATGTTCGAGGGTATACTGCCGGATGACA TCGGTGTATATGCGATCACGGCGTCGGGTGCAGATGAGGGAAGCTGGCCA ACTTACTGCCCCGGCGGGTACCCAAGCATTCCCCCAGAATACGACACATG TTTAGGAGACTTCTTCAGCATTGCTTGGATGGAAGATAGGTACTTCATTC TTCATCCCTCTCAGTGAGGCATTTGTTTGACGGGCAATTTTTGTTTGCCT CATGGTTATTACTACCTCCAATTATACATATAAGATGTTTTAATAGGCTA AAATAATTTATCAAAACGTCTTCAATTTATGAACAGAGGTAGTACTTATC AGCACTCTTAGTTACACACACTAATAGTTGAGAACTTTCAATGTTGATAG CGATGTCAACAACCTGCGTACTGAATCTCTCAAGGAACAGTATAATGCTG TGAGTGCTTTGTACTCTGATTTTATTTGTTCAAACTTCCATCTATCCGGC TTAACATAACTTAATGATTACGCCAGGTAAAGAACAGAGTGGCGATTGGT TCCCATGTAATGCAATATGGTTCCTTGGACCTCAATGTCGAGCCGTTGTT CACATACATGGGGTCAAATCCCGCTAACGACAATACTACATTTGTTGAAG ATAACTCGGTCTCATCGTTCTCAAGAGCTTCTAATCAGAGGGATGCTAAT CTAATTTACTTCTGGCAGAAGGTTCGTGATTCTGCCGAGAGAAATCATTG ATATATGTTTACACAACACTGGATAAGCCATGGTAAAAACGAAGGTTAAG CTAACTAGTTTACCTTTTATGTTCCATTTAGTACCGGAAATTGACCGAGG ATTCCCCTGAGAAAAATGATGCAAGGAAGCAATTGCTTGAAATAATGGAA CATAGATCTCATCTCGACAACAGTATGGAACTGATTGGTAACCTTCTGTT TGGTTCTTCAAAAGGTCCAATTATTCTAAAGGCCACCCGTGAAGCTGGTG TGCCTCTTGTTGATGACTGGAGTTGTCTAAAATCTACGGTATGGCTTTAT TTGACTTTGGTTGGTCATGTATCAGCATCTCTTATCAACATCTTATGTTG TTTTATTCAAGTGGTCATTAACTGGGACCGAGAAAATTCTATTGATTTGC TTCAGTGTACTATAATAATCGTTAGAATCATAAATTTATTTGATAATTAT TTCCATTGGTTGGCTGACAAATATAATGCTATTTATCACCTACTGCGTAC ATCTCTAGGAGATTGTCTATTCAAAATTGTATGCTGATACTGCAGATTGA AACTTTTGTAGTAGTGTTCTGAAATAGGTTAAGCGGACATACCATATAAT TTAGAAGCCCTATGCTTGGTCATTTCACACTGGCTTTGTTACCGATTTAG TACTATTGAAGTCTATGCACACGAGGAAAACTCTAGCGAAAATGGGATTG TTTGATTGGCATATGTAATTAGTTCAAGTATTACTCCTCGAACCAGGCTT TTGTCCCGTTTTGTAAATAATGTCACAACCGAGTACAAGGTTCATCAGTA CCACAGGCACTGTAGTGTCCAAAGAGAAAGAAAAAAGAGGAGTCCAAGAA CACTGGGGCAACAACACATCAAAGCCCAAAGGAAAAAAACAAAAATGAGG CACGAGAGAACGCCCTCTAGGGCTGCTCCTCGGGATCAGCAACCGCGAAG CGCCGCGCCACCGCTCTCAACGCCTGAAGGGATCCGTCCAGATGCACTCG ATTCCGCTGCTTAGATAGCGGGTAACACTGTTGAAGGTAATCTAGAAAAG CAAAAACAGAGTCAGATGCCCATCACGAGAAGATCTTTTCGATCACCATT TTATTACAAATATTCCAAAGAGTCCATGTAAGGGACGCAAACACTAGCCA GAAGAGATGGCACCTCCCTCCTGGATGGAGCATCCCGAGAGGGCGTTCAT AATTTATGGATTTATTTCTAAATTTATGGGATTTTATAATTTCTTTAACA AACAATTCTATTAATCAACAATATAAAGAGAGTGAATGTGAAAAAACTGT AGCATCGTGTCGTCTCTTTTTACCGGTTATTATAGTCACAAAGGGATATA TTACTTTGTACATGGTGTGATATTCTCAATACCCTGCTGCAAAACAATGC CAGTTGAACTTTTAGGATGACGTTTGGCATATTGAAAACTGTATGCCAAA ACTAGTTGCTTTGCTTCAGGACATTCACGGTTCGTAACTGCATACATATA GAGATGTTTCTTGTTGTGATGCACTTGGACGATGAAATAATTTATTTTCC CCTAAACAAGTAATTTATTTCATTCCATATTTCAGGTGTGTGCCTTTGAA TCACATTGTGGCTCATTGGCACAGTATGGAATGAAGCACATGCTGTCCTT CGCAAACATCTGCAATGCCGGCATTCATCCTAAAGAGGTGGGTAAGGTCG CTGCTCAGGCTTGCATTAGCATACCAACCAACCCCTGGAGTACAAGACAC TAGGGTTTTAGTGCTTAAACAATGTGAAGGTGAATCAGTATTTAAGATGT TGTGCTATATCCAAATTTCTTTCCTATTCACACGGGAATACCAGTTCTAT AGCGGAACCATTATTTGAGCTATTCCACCACACCAAATTACAACTCGTGT GCCCAACTTAGGGAACGTGCAATGGTTTTATCTTAACAATGCCACGTATG AGGATTGCTGAGTTGGAGGAAAGAGAACCAAAAAAAAGACCTCTGTCTTC TCTTAGCTAAGAGATCATCTCTTAGAACGATATATCTCACCACATATTTA GTAATATCTATCGCTAGATATAAGACTAAAAAACTATCCATTGTATGTCA TGTTTTATCATTATATCAAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.