Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008367

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008367
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008367
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAAAGGATGACTTGGCGGGCCCGATAAGGTACCAGCGAAAACCCTCGCGA GCTCCTCCCTTGCACGCGGCGTGGGAGCGTATTTATTCTCGAACGATGCG GGCATTCACGGCAGCAGCAACAGCAGTGGCGGCGCCTTACCCCGCGCGAC TTCTCCTCGTCTCCGCCCGCCCACGATTCGGTGGGTCCTCGACTCTTCCT TCCCCAATCCCGTCCGGTAAAGTTCCGCCTCTGCTCCGGTCGCTCGTACC GCTGCGCCGTCGCCTTGTCGCCCGGAGTCGCGAGGTTCGATTTGGCCGCA GGATTTCCGGGGGTTTAGAGTTTGTGCCTACGTGCTCTGGAGATTTAGAG GGAATGGCGGACTATCTAGTGGACCTGTTGCGGGATTCAGAGTTTAGGAG TCTATATATGCTTGAATATAGTTTCCCCTGGTTTGGCTTTACCCCCTCTA AACCAAATTTGTTCTGCTCGAATCTCATCTGTCAGCGGTAATCCTTTCGC GGCAGGTTGATTTGAGCGTTAGGAGCCTGCAAGTACACAACTTTTGGAAT GAGGGAGATGTGAAATAAGCTGCTGTTTATTCTCTACTGTGCTCAATTTG ACTTAGGTTTAGGTTGTAGCTAAAGGATTCATAGAACCTTTTGGTTGCTG AGTATAGTCCTGTTTGCTAATTTTTGTGCTGCCTATCTAGCTAGGTCACT GTAGAGCATCTTCCCTCGCAAGGCTGCTGAGGAGCTCCTGCTACGCTTCC ACCACCATGGGAGACGAGACCTCCACTTCCGCCTCTGCCCAGGCGCAGGA GCCAGCACCACTGGTGAGTATTGAATTGCTGGTTCTGGACATGATAGTGT TGATTGTGTTTTGCCTGTACCCACTCGATTGAGATTGTGACGAGTCAAAA CATATTGCTAGGCCGTGCAGGGAGCTGGGAGTGTCAAGCAACAGATCGCC AACTTAGCGGCTCTGTCACTCCGTGCGACGGTGCCTGAAGTGGATGTAGA ACCAGTGGTTGAAGTTTGCACAACAAAGTTCGGTGACTATCAGTGGTATG TTGTTGGCTCCTTGCCTTGCCTGCTGTGTCTCTTCGATGTGCTCATCAAA TGACTATATGTCAACCATATGCAGCAATAACGCAATGGGCTTGTGGTCAA AAGTTAAAGGATCCGGGACAAGTTTCAAAAATCCCAATGCAATTGGACAG GTTAGAACGATTCTATCTTTTTGAGTGCTGATGGTTTACTTCCAAGATCT CATGGAGTGGGAGAATTCTTTCATAGGGGAGCTGCTACCTTTATTTCCTT GTTTGTTCATTTTTCTTTCTCATACATGCTGAATTTTTTCACAGGCCATT GCCAAGAATCTGCCTACCTGTGATGTTATTGAATCAACCTCTGTTGCTGG TCCTGGTTTTGTGAATATTTCATTATCCAACAGCTGGGTTGCAAAGGTCT GGTTTAGATGTTTTACCTGCAAGTTTTGCATACATTGGTACTACAGTTCT TTCACCCTAAGCGCCAATGAACTACAATCTTGCAGAGAATACAAGATATG CTTGTAAATGGTATCAAAACTTGGGCACCAGTTCTTCCGGTTAAGAGGCT AGTGCTTGATTTTTCATCCCCTAATATTGCAAAGGAAATGCATGTTGGGC ATCTGAGGTCAACAATAATTGGGGATACCCTAGCACGCATGTTTGAGTTC TCAAATGTCGACGTTCTCCGACGCAATCATGTTGGAGACTGGGGTACACA GGTAACAAACTACTTGATGCTTCTTGCTGCTGAAATTTCTGGTACAAACG TATGATCCTTTAATCTGCCTACCCATTTTGGCTCATAGACAATGTGGTTA GGCACACCAACTCATCCTTATTTCTCCTCGGCAGGGCCCTTTTTTTGGCC TGAATCCGTTACCTCACGTACCTTTATTTTTGGGACACATCAATGCTGTA CTATCACTATCTAGGCTTTCATGTCTACCATACAGCAAAAACTGAAAGTT TCACTTGTGCTGTGCTGGAGAAAGTGGTGCCTTGAATATTGCATTAGCAG AAATATCTTCTGCTTGTTCTGTAGGCACTAGTAACTGCTAAACTGTTTGG TGATGTGGAGGCCTTATAAGTTAAACGGAATTTTCGCTTTGCGAACTAAA CCATGTTTGTCTTTGTCCATGCAGTTTGGAATGCTCATTGAATTTCTGTT TGAAAAGTTCCCGGAATGGGAGGAACTTGGCAGCCAGGCCATTGGTGATC TCCAGGTAAGGTTTTGTTCTATGCATTGATGGTACTATTGTAGTATAATA ATGTGGCATAAAAAGCTTATAAACACATGCCTATAGGTATTGTTGACATA TTCAATTAGGCATATAAGCATGCATGGACTTTTGTACTACATATCCATGT AAATAGCTACATGGTTGAAAGAAAACTGAATTATGAGTTTAGAGTTACAG GGTAATTTGTTGCGGTAAAATAAATCATACAACCTCTGTTCAAAATTATA AGATGTTTTAGGTATTTCAATGTGGACTATATACATACCAAAATAAGTGC ACCTACACACTGCATGTCTAGATACACGCGTTTCAGAAAAAAAAAGCTAA AACATCTTATAATTGTGAACGGAGGGATTAATTGTTTGTGTTATTCTTGG TAACATTCATATTTACTTTTATGCTCAAATAGTCATTTATGTGGTATCCG TAATTTCAGTATTATCACCGTAGTGGTTTATGACTTAACCAATTCCAGTA AAATACAGATGATTTTAGCCAGGCATGTAATGCTATTGTTTTGGATGCCA TGTTTAACTGGATTGCTTTTTTTATCGCCTAACTTGAGCAGTAAGGGCCA TGATGTTGGATTTCCCTCTTGGTTGCTTGTTCTCAACTACCCACTTACCT GCTAACCAAGTCCTTCAAAATACATTTCTGAAATTTAAATAATTGGAGCC CATGAAGCTGTGCACAGCAGCAAATCTGAGTTAGTTTTCATTAGCATACA GTCAGGATGAAATGACTGTAAATTATCTGAATAGCATATTATCTAGATAT GGGTTTCCTCTAGGTGTATGTGCATGCATGCTCCCGATTGATCTATATCT TGCGAATATTGAAAGAAGTGCTTATTTTGCTTCATGTTAGAATTTCTGAT TCGGTAAACAAACGATCATGTTTCATTTTGGTTATTTGCTGCAGCTTTTC TATAAAGCATCCAAAGAAAAATTCGATAATGATGCGGAATTTAAAGATAG GGCTCAACAAGCTGTCGTTCGCTTACAGGTAAGTTGACCATTCATATATG TGGATTCTGGGAAGATTGCAGTCTTCTCTCATTCTCTTCTAACTTCTAAG CAATACATACTATGTAGGGAGGGGATGAGAAATATCGTTCTGCTTGGAAA AAGATATGTGAAATCAGCAGGAACGAATTTGATCAGGTTTACAAGCTCTT AGATGTACAACTTGAAGAAAAGGTAGTATCACTTTCTACTGATATTTGAC TTATTATTCTAAGTTACCTAGCAAAATTATCAACAAAATATATCTGCTAT CTGAAAAGAATTATGTTAATTGGACTTTAGATGAACGTGGAAATGTCTTT TTGTAGAATGTTTGCCCTTTTGCCCTAAAGCAAAATGAACTATTGTACTT TGTGAAACTGAAATCTGTGCAATGTTTGTTGACTAGCGATTTTTGCTCAA AGGCTTTGGACTTTCTTCCTCTCATTTGAACCATAATGAAAAAGGTTCTG TCAAACATCTGAGTTGATTCACCTTGGTGTATTTTCTCATTGTCATATGA AGTCTCAAAGATTGGAACTTTTACGACTGCTACCAAATTTTACAATTAGG TTCACTTATTAATTGGTGCGCGTCAGTTTCCCAGAGAAATGTATTGAACT CCTGATTTATTGAGCTTTTCGTATTACCAGCTAATATTTCTGGAGATACT CACAAGACTTCAGAAATATCTTTTTCTTAATGGAAGTTATTTTTGTACCT TTTTTGCTTTCTTGTAGTTCATCTGAAATCATTCTGATCAAGCATCCGTA ACTTGCTATTGAATGCTTATATACATGTTATCTGTCTCTTCCCCGGAAGC AACCCAAGAAGGTTATTGGTTTATGTTTACGGTGAGAAGCAAAGCTAATT CTTTCCTAATTACTTACCTTTCAGGGGGAGAGCTTTTATAATCCTTATAT TCCACAAGTTTTGGAGGGATTGAGTAACCAAGGTTTCATTAAGGAAAGTG AGGGTGCCCGGGTAATTTTCATTGAAGGTCACAAAATCCCTTTGATTGTG GTTAAAAGAGATGGTGGCTTCAACTATGCCTCAACAGACTTAGCTGCTCT TTGGTTAGTTACTGAATAATAATTGACTTGTTGTTTCTCCTCATCTTTCT GGGTTCTTATTTAGCTGTTGTCTGTAATCTAAGACTTTCATATTTGATGT AGTCTGGTTTCTTGAGGTGATAGAGTTTGTGAAATTCGACCTTTCTTTTT GTCTTTGCCTTTATGAAGGTACCGGCTAAATGTTGAGAAAGCTGAATGGA TAATATATGTAACAGATGTCGGTCAGCAGCAGCACTTTGATATGTTTTTC AAGGCAAGTGCAAAGTATCATTTATCTTTACAAGAAATATATTATTGTGA TATTTGATAATAGTTCATTCTTAATATCAAGAGAACCGTTTTAGATCTTT ATTGCTTATCCTAAAAAAATAATCTGTACTTGCATTGATGGGATTTCATT TTGTCTTGTGATGCAGGCTGCCAGGATGGCTGGTTGGCTCCCAGATCCGA AGGAGAAGAAGTTCCCCAAAACAAGTCATGTTGGGTTTGGCCTTGTTCTT GGAGCAGATGGCAAGCGCTTCAGAACTCGTAGTACTGAAGTTGTTCGGTT GGGAGACCTACTTGATGAGGCCAAATCACGAAGTAAATCAGAACTTGTCC AGCGTCTCAAGGACAATGGTAAGCGATATAATTATGGAATTTCATTTGCT TCTTTTAATAACCTTTCAGGTTAAATATGATATTGTTTGTTTCAGGTAAA ATTGTTGACTGGACTGAAGAGGAATTAGAGAAAACTTCAAAGGCAGTAGG ATATGGTGCTGTCAAGTATGTAATTTTTCTTTGAAGACAAATTTATTGGA CTGAAATTAAATAAATAAGCCTTTTAAATCTTAATCTGATAAGTATTCTA CCTTCAATATAGGTATGCAGATCTGAAGAACAATAGACTGACTAATTACA CATTTAGCTTTGATCAGATGCTAAGTGATAAGGTACTTCCAAACTACAGT ATTTATTTACTCAATTATTTGGCAATCTTGGCATTCTTCACCGTTTCTGT TCTCAATTGTTCAAATACCATATCTGTATATACTATATGCTCTGTCTTCA ATCTTGTACTGATTTGTTTTGTGTTTCCTTTTACTGGCATACCTTTATGA TCATCCTTTTGCATGAATGTAAATTTATTTTCTGAGCCATTCATCTTTTT GCCTACTCTCGTTAATTGTTATTTCCATCCTAATTTTCTTTTGAACAGGG AAATACTGCTGTCTATCTTCAGTATGCTCATGCTCGTATTTGCTCCATTA TACGAAAATCTAACATGGATGTAGAAGAGCTAAAGATGGTAATACTTCTT AAATTTATGTGCTAATGCTATCCATACTATAAAGTTTCACCCTGAAATAT TTTTGCCATCAGGCACGTATTAAATTGTGAATTTTCTTTTTCTCAGAACG GGAAAATTTCTCTTGACCATCCAGATGAGCGTGTCTTGGGACTGTATCTT ATCCGTTTTGCAGAGGTATGATTGACACTGTTAACTAATTTTATATATTC GATGGACTAAGAGCATCTCTAGAAGACCCTGGAAAAACGCCAAAACTGCA AAATAACAGCTATTTTGCAGTTTTGGGCCAAAAATACGTCCATATCAGAT CCCGCAAAATCGGCAAAACTGGAAGAAAAAAAAATCCATCTCCCCTGGTT TTGAGCCCCTTGTCCCCCAGATACCTAGGTTTGGGACCAAAATTTCCAGC ACCCCCGATAGCAGAAATCGGTTGGCGGGAGGGAAGTTTCAGGCCAACTG TCACCGGACAATGGACGGACTCACCGGAATCTGATGAATTTTGCCACTGC GCTCTGATTCCGGCCAAATCTCTGCCGTATTTTACCACGGTGTCCTGATT TCGTACGATTTTGGACAAAATCGTAGCATAATAGCACCTCACAGCAGACG GCTGAGCTCATATGGGCGAGTTCGCCATGGCTGCCCCGCCAGGGCAGCAA GGAGGCGCTCCTGGAGACAAACGTGGATGACCCCACGCGCAGGAGCGGAC CGGTCGGCTTGGTCGTCACGCAGGAGGCTGCGGCGGCGAGGAGCGGCTGG GGCCGGCTGCCTTGTCTTCTCCCTGAGACGCAGCCTGGGGGAGTCAGGAC TGGGAGTGATGAGGCACGACTCTGCATGGCTGGGCGCGAGGCGTGGGCGG CGAGGTCGGGGGTTGGGGCAGGACAGCAAGCTCTCCTTGAGGAAGTCGAC GGGAAAATAATAGAAATGAGAGAAAAAAATAGATAAACAGAAAATGAGAA AAAAAACGTTTTGTGGTATCACTTTAGGATATCTGTTTGGGGAGAGCACA ATTTTATAATGCAAAACATTTTGCAGTGTGCCCGAAGACACTTCTGCAGT ACCGGGATATCTGGTATCTGCTAGAGATTCTCTAACCCAGAATCAGCTCA AAACTGTAATGTGGCCTATTGTGAGCAGTTGCATTAGTGAACATTTTGGT TGTGAGCAGTTAGGAGCACATGAAGTACTCCCTCCGATCCAAATTAGTTG ACTCAAATTTTTCAAGATACGGACGAATCTAATATTAAATTATGTCTAGA TACAATCGAATCTAGACAAATCTAAATCAACTGATTTGGGTCGGAGGGAG TATTTCTAAGGCAATTCCTGCATGGCATTGTACATGAAGAATTAATACAT CAGTGACGAGGATGGCTTATAATTGGGAGGTATCTCGTCCTCCCTTTGTA TTGATTTACGTGCTGCTATCTCTTTCAGGTTGTTGAAGACGCGTGCACCA ATCTCCTCCCCAATGTTCTGTGTGAATACCTATACAACTTATCTGAAATG TTCACCAGGTTCTACACCAATTGTCAGGTACGCCTGTCTCTGTTTCCATC TTTTAATTCATTCGGAGTTCGGGGTGAGAAGATGGCAACAACTTTCACTT GTACTAAGCGCTAAGCCTGCCACCCACCTAGCTCATGAGATTTAACCGCT GTTTTTTTTTGTTATCTCCACCAGGTGGTAGGATCACCGGAGGAGCCAAG CCGGCTGCTGCTCTGCGAAGCGACTGCGGTCGTCATGCGTCAGTGCTTCC AACTGCTCGGGATCACACCGGTTTACAAGCTGTGACGGGCCAATGTTTTG ATCTTTACATCATACATCAGTTTCATGCTTGTGACCTCTACTAAATCTGT TCCATAATGTAGAATGTTTCTAACTACATTATGGAACAGAGGTGTAGTAG TTTGCATCGCTAACAGACTGAATTGATTGCCCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.