Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA031525

[Submit comment/correction]

Sequence
AA031525
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031525
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGCGACCATTTTTGGTCGAAAACCGATAACGAACAGTTTATTTACGGG
TCGCGCGGCTAGGCTTACAACGTGCGTACGTTGTACAGCCCAAATTGGTG
TCGTCACCTCTGAACTTCCTCCCTTGGTCTGTTTCTCTCCTACGTGCCCC
GCTGCCACCCCAATCACTAGCGGCCCCATTCCCTCCACTCTCTCTCGCAT
GCTGGCTTCTTTTCTTCAGCTTCTATATTACTCCGTTTCACCCCAACCAC
ACGCGGGTGAGTCCCACTTCCACCTCCCGCCATGTCCATTCCCGCCCTCC
GCTCCTTCCCCGCCGTCTACGGCGCTAAGCCGAGCATCACCCGCCCGATC
CGACGCCATTCCCGGCTCGGCGGCGGCCTCCGGGCCAGCTCTGTCGCCGT
GAACGGGGAGCTGGGGCTGAGCACCGGCAGTGCCGAGAAGAAGGACGACG
CGGTAAAGGAGGTCGCCGACGACGAGAAGCACAGGCGACTGGAGCCTCTG
TACGACGACGGGTTCGGGGCCGTGACCGTGAAGGACTACTTCGCGGCAGC
CAAGGCCCTGTCCAAGGACGACGGAGGGCCGCCCCGATGGTTCTGCCCCG
TGGAATCGGGCCAGCCGGCCGTGGAGGACGCGCCCCTGCTGCTCTTCTTG
CCAGGTTTTGGGTCCTCGATCGAATCTCTGGAGACTAATAGCTTGGCCTT
GTTTTTGTTCCCTTCCTATTCTCTCATGATCACTTCCATGTTTGTGGTTA
CCTAAATATGGCCAAATGGAGAACTCGTTCTAGACTTCGCTTCTGTTCTA
AGATTACCTCAAATCGACTTGCACCGCAGGAACCGACGGCGTTGGGACGG
GACTCATCCTGCACCACAAGTCTTTGGGAAAGTGAGTATATCTTGTTTTC
CTGTCCGTGCACAAAAATATATACTAGTATAACGATTTCACTTTATGGTA
CCACGTCTTGTCAAATTCAGCGAAATATTAGCATGCAAAGCAGTTGTAGG
CAATGCGTCGCTATAGAGAAGATTCCAATGCTAGTACTTTCCCTGTTTTA
AAATATAAACTTTATAAAACAAATGTATTTAGACTTCTTTTAGTATGTAG
GTTTATTCAAATTTAAATTAAATCTACACTATAAAAAAAAGTCTAGATAT
ATTTTATTTATATAAATCTAAAACATCTTATATTTTAGAACAGAGGAAGT
ACATCACTAATCTAAAATAGCTTGTTAAACCACGCTATTTTTATCCCTCG
GTTCCAGGCTATAGGAAAGCCCGCTTTCAGTGTTGGCTTTTAGCCGATTG
CTACTTGGCTCCATGTTCTGTTCAAAAAAAACTTGGCTCCATGCAGTCAT
GATCTACCAAGTTAATTATGGATAAAAAAGGACTACTGGCCTGAGATGAC
GTAGTAGCCGTTGAAGTTCTTGTTTTTTTCTTCTAAAACTCGACTGCCCC
ATGTGACATGAAGTATACTCCCTCTGTTTTTTATTACTTCGCGTTCTAGC
AATTTTCAAAATCAAATTTTGTCAACTTTGACCAAAAATGTAGGCAAATA
TATAAACATTTATTATTCCAAATACATATATTATGAAAATATAATACGAA
GATTCCAATACTATAAGTTTTATATTGTAGATACTTCTATTTTTTACTAA
ATGTTTGGTCAAACTTTAATTTTTTTGACTTTGACTAAACCCAGAATACG
ATCTAATTGTGAACGGAGGGAGTACTGCCCATGGGAGGCATCTGCCCAGT
GGCGGATCGCAGGAGAATCCGATGGGGTGCCTAGCTCAATATTTATAGTT
TAAATATCATGTCACTACGTGAGAAGACTGACGTGCCGACGGTCGGGCCT
CGTCGGCATACCCAGAATTCCGTCGGCGTAGGCCGATGATTGCCGTCCGC
ATATAGTCGTTGATGTACTAGTCCGTAGGCGTAGTCTCTCTACCCGTCGG
TGTATATAGCTACGCCGACAACAAAACCGTCGGCCTAGACCATATGGGTC
CCATCTAGATAACTAATGGCCTTGGCTACGCCGACTGCCGTCGGCCTAGA
TTATTTTAATTGTTTTAAAAAAAATTAATTTTTTTTAACTTTTTGAATTG
TTTATCTCGTTAATCTCATAGGAACATTTTAAATTCTAAGTCATTTAATC
TCAAATCAAATTATACTCGTAGTCAAACTTCCCGATCGGTAACCTATCTA
ACACTACTCCAGCCCCAACACACTTAACTTTTTCATTCCTTCTGCACGAG
CTTCCGACAAAAATTAAAACTTATTGTCAATACTATGATATCAATCCTAT
TAACCATTGGACTATAATGTTAGACGTCTTTATTTTTTATATTTCATACA
ATTATTTAAGTAAACAATAATGAATAAGTATTAATAATCTTGAATTCAAA
TAATTTTTTTATTTAATTTGCCTTTTTTCCATTTAATATTGAATAATTCA
TATCTACAAATCCGTAAATCATAATTCGATAAATAATATATCCAAATCGA
TCAGAAAAATGAGAGGAATCCAAATATGACATCCCTATCATCTAATTAAT
TATATATCGTATCTTTTTAACACTACATCAACCAAAACTATGTCAGAATT
CATGAAACACCTCGTTTTTTGCACTCAGAAAATAGAAAATAGCTTTTTGT
GCGACGAAAAGGAAATATTGCATTGGATCTCTGATAAAATAGCATATTAT
GAATCTAAAAATGATTTTTCCAAAATATCATGAGCATCAGATTATGTACC
TGTAGTTCAAATCTGACTCATTTCCTTTCGATTCAGCAGGAATTTGTCTT
TTTCACGAGGGGTGTACAGAAAGGTTTGAGATATCCCCGTTAGGACATTG
TCCATGCAAGATGGTCTAGTATTTTTGAAAAATAGGGTGATACCATTTTG
AAACTTTCATTTGGTGTGGTTGCTTCACAAAACACCCCGTTTTTTGTACT
CAGAAAATAAAAAATAGCCTTTTGGTGCTACGAAAAGAAAAAACTTCCTC
CTATAACATTGTTCACCATCTCATGATGCACATGCACGCATAATATGGGC
ATATTATCGTAAACTATGTCGCGATTCTGGCTAACATTGGTTATTTGACC
CAGGAAACCTCGATTGAGATAGGTCATTTTGTGAAGGTTTTTTTTAGACA
CAATCAATATACCAAGTTTGGTATTTTTCCTTACAACTATGTCACAAAAT
ATGACACCACGCGAAGGTTTTGCATTGTTTCGATCGTTTTTGAATTTTTA
TGCCTGTTTTAAACTATTGTCAAAGTTTCTAAATCGTCGGGCACGAAGAT
TCTTAGCTTGGGATCAAGTCTCGCTAAACTTGCATTGGATCTCTGATGAA
ATAGCATATTGTGAATCTAAAAATATTTTTTTCAAAAAACCATGAGCATC
AGATCATATAACTGTAGTTCAAATTTGACTCACTTCGTCCTGATTCGGCA
GGAATTTGTCTTTTTCACGAGGGGTATACAAAAAGGTTTGAGATACCCTG
GTTGGAACATTGTCCATGCAAGGTGGTCTAATATTTGTGAAAAATAGAGT
GGTACCATTTTGAAACTTTCATTTGGTGGTTGCTTCACAAAACACCCCAT
TTTTGCACTTAGAAAATAAAAATGGCTTTTTGGTGCGACGAAAAGAAAAA
CTTCCTTCTACAACATTGTTCACCATCCGATGATGCACATGCGTGCACAA
TATGAACACATTATCACAAACTATGCAGCGATTCTAACCATAACATTGGT
CATTTGACCTAAAAGCCAGGAAACCTCGATTGAGATAGGTCAGATTATGA
AGGTTTTTTGAGACACAATCAATATACCAAGTTGATATTTTTACTTGCAA
CTGTGTCACATAATATGACACCACACAAGGTTTTGGATTGTTTCAATCAT
TTTTTATTTTTTTATGCACGTTTTAAACTATCGTTAAACTTTTTAAATCG
GCGGGCATAAAGATTCTTAGCTCGGGGTTGAGTCTCGCTAAACTTGCATT
GGATATCCGATGAAATAGATATTGTGAACATAAAAATAATTTTTCCAAAA
AATCATGAGCATCAGATCATATACATGTAGTTCAAATCTAACTCACTTTC
TACTAGTTCGATAGGAATTTGTCTTTTTTCACGAGGGATGGATAGAAAAT
ACCCCAGTTAGGACATTATCCATACAAGGTGGTCTAGTATTTTTGAAAAA
TAGGGTGGTACCATTTTGAAACTTTCATTTGGTGGTTGCTTCACTAGTTG
CTTCACAAAACAACCTGTTTTGGGCACTCGAAAAATAGAAATATGTTATA
CAAAAGTATTTATACTTTATATATATATTTTTGAACAAAAATATGTAATA
TTTGAGTTTATATAGATAGATATTATTTTTCTGCAAATTTTAATATATTA
TATGTATTTTTCTAAATTGAAATGGTTTAGTTATGATTTTTTTAAAATTA
ATGTGGCAAAAAGGAAAAATAGCTACACAGTCGGCGTAGACTTGACGCTG
TCACTTTTCCGTTAGCCTAATACCCTACGCCGATGGTCTTGTCTACGCCG
ATGGCTGCCGTCGGCCTATCCATACTACGCCGATGACAAAACTAGGCCAA
CGGCCGCATGGGCCGACTGACGAGTCTAGGCAACTGCGCCGACGAACCCG
ACCTTTTGCCGTCGGCATATAAAAAAGCCGTAGGCGTATCAAGTTATTCA
TGTAGTGTGTATAAGTACTTTTTCCGTTCAGAAATAACTGGCTTGAGTTT
ATCTAGATTCAAATGTATCTAGAAGCATTTTAATATATAGATACATTCGA
ATCTAGACAAACTTAAATCAATTATTTCTGAACAGAGAGAGTATTTTTAA
CACATACAATACACATAAGATTAGACGAATTGCTACAAGATGAAAAAAAT
CTACAATTCCATGGCACCCCATTGGATACGCCCCTGCATCTGCCCCTTGT
TTTCTCTTGCACTAGTCAGGCTACCTGCTGAATCTCACCGGATCTGCAGT
TTAAGTTTAATTCCTCGTGTTTCTCACTTGCAGGGCCTTTGAGGTTCGTT
GCTTGCATATACCAGTGAATGATCGTACGCCATTTGAAGGTACGACTTGC
ACTTACTCCTTAGCTTCATCATTTTTCAAGAACTATTAAGATAGAGAGAA
TGTTTGTTACAAGAAAACCAGGCCTTAAGTCTGTACTAAGATCACAGTAG
TATCATCCAAATCTAATTCCAGGTGTTCACAGAACAATGACTAAACGTAT
TTAGTTATGAAAGAAAATCGGAAACAAGTGAACTGAAAGCTTCTGTTAGT
CTAACACGAAAGGATATAAATGCTTACAGGTCTATTACAAATTGTTGAAC
AATCTATCAAATATGAGCATGGTTTGTCACCAAACAGACCGATATATCTT
GTTGGAGATTCGTTTGGTGGATGTCTGGCGCTTGCGGTGGCAGCTTGTAA
TCCACAAATTGATTTGGTCCTCCTACTGGTAAACCCAGGCAAGTGAAAAC
GTTGTAGTTTGGAATTTACTGAGAAAGTATTGTTTTCATAAGGCATATTG
TAAAATAACATACTTTTTCTGTAGCAACGTCATTTGCAAAGACTCCATTA
CAGCCAATATTGCCTCTTTTGGAAGCAATGCCAAGCGACCTTCATGTTAC
GGTTCCATATCTTCTCAGTTTTGTTATGGGTATACTTTCTTAGCTTGTTT
AATTATATGATCTGTACTTTTTACTAGTTGTTGTGTGCATTTTTTCTGTC
TGATTTGACATGCCTGTCAAAAATTTATCTGGTTGATTTCATGATCTTCC
AATAGTACAAAAAAATAAATGCATGTTCATACTATGGGAAATGACGTTCA
AAAACAGTGGGATAAAAGAAAAAAATCATAGCAAGTCAGACATTTGAAAA
AACATTTCCTATAGTATGATCTAAAAAACTTGGAAGACATGAGCTTGTTG
ATTTTTGAGTTATTTTTTTTCCAGAATGGATTTTTGAGTTATTGTTTCAT
AATAAATCATATTCTACCTCACTGTATGTAGATTTAAAATTTAATGCTTA
GTCCACTTCTTTTTGACGAGCTAAGGATGTTTATGAGCAGCTGACCCTCT
GAAGATGGCTATGGTTAGCATTGAGAACAACCTTACTCCTGCAGAAACTC
TTCAAAAGCTGTCAGAGAGTCTCACTTCTTTGCTGCCTTTGCTTTCAGTA
TGTTATCAGCTTTTCTATCTATTAGTGCCGCACATTTACTTCTAAGTGAC
CTCCTACTCAAACATAAGGAAAATGGAATAAAGAAACATATGGTTATCAA
TTTCCTCAAAGTTACTTGATCAGCCCTAAGTGACCTCCTATTCAAACATA
TTCAACAGTACTTGTTTCGTAGATCTTATTTCGAGGATGCTCAGGAGCTA
CGGGAAATGTTTATTAATTTATTTTTACGCTTCTAGAAAAGGCTATTGAT
TACAGTCGCATTGTTATAAAAGGGAGAAGTATCTCAGTATTTTCAGAAGT
CCACTTTGTGCTCTTTGTCCTCGGAAGAATCAGTTAAAACCTATTATGGT
GCTAATTAATCACTTAAAAATACTTCGGTATTATTATATTATTACATTTC
AATCCTTTCATATATCAGGAATTGGCAGATATCATACCAAGGGATGCACT
TTTGTGGAAGCTCAAGCTTCTTAAGTCAGGAGCAGCGTATGCTAACTCTC
GCCTTCATGCTGTACAAGCTGAAGTTCTACTTCTTGCCAGGTACTTGCTA
TAACAATGCAGCCTAAATTCTGCCATTTTTAAACCTTGATGGAATCATTT
ATCTCCAATTGTTTGATCTGATACTCTAAATATTAATATATTTAGTGGCA
AAGATAATCTTCTGCCTAGTGGAGAAGAGGCGAATCGACTCTTCAAGACA
CTGAAAAACTGCCGAGTTCGATACTTCAAGGACAATGGCCATACACTACT
CTTGGTACACTCGCAATTCATCGAAATGTTTCTGAGCTAGTCTAGTGTTT
TCATACCATTAATATACTCCCTCAGTCCAAAAATAGATGTCTTAGATTTT
TTAAATTTTAAATGAATCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCTAAA
TTTTAATAAATTTGAGACATCTATTTTAGGACGGAGGGAGTATAATTTAT
GCCAAGCATTATAATTTTAGGAGTAATGCTGAAACTCATATTGTTCGTGC
ACAGGAGGATGGTATCAACCTATTATCTGTCATAAAAGGTGCAAACATGT
ACCGCCGTGGCAGACAACGGGACTTTGTGACTGACTACCTCCCCCCTACA
CTAAATGAGTTCAAGAAAACATTTGATGAAGACCACAAGTATATATTTAG
CTTCTGAGAGGACTTCCCTATTTTACGTGGCTCAAATCTAGTAAGTGAAA
TACTGAACTTTTGCAGACTGTTTCACCTTGCACTGAGCCCAGTCATGATG
TCTACTCTGACAAATGGCAAAATTGTCCGTGGCCTCGCTGGTATTCCAGA
ACAAGGTCCTGTCTTGTTTGTGGGTTATCATGCACTGATGGGGATCGAGC
TAAGCCCATTGTATGAAGAATTTTTGAGGGAGAAGAACACAGTTGTCCGT
GGCCTTGGTCATCCGGTGTTGTTTGGAGCAAATTTTGAGACCTCGCGTCA
GGAGTTGTCTCGGTTAGATACAGTTTCTATGTACGGCGGATTGCCGGTCA
CTCCAATCAATATGTACAGGCTGTTTGAGAGAAATCAATATGTTCTCCTC
TATCCTGGTGGTGTTCGGGAAGCTCTACATAGAAAGGTGTGCTAAATGAG
TTAATGTCACCACATCTCTACTAAGCCTTGAAACAAGCATTAGGGCTATT
CTTGAATAATGACATTTCTTGGTAAAGTTATTGTATTGAAGTCAAATTTG
AACCTAATTCCAAAATTTTAGCAAAGAATACTCCTCTTCCAAACAGGCTC
TTATACCATACAGAAGTATTTTCTTTGCTAACAACTAAATTAACACATCA
TTTTTTATTAATTGGAGTATCCCCACTGATAAAAAAATAGTATGATCAAG
GTCAGTACCAAACTAAGTATTCCATAATTGAAACACAAAAAAAAGAATGT
TATCCGAGTGTTGGCCTACTAGATCTTTTCTCCTCCTGTAATAATTGAGC
TGAATTGGCAGGGTGAAGAATATAAGTTGTTTTGGCCGGATCAACCAGAA
TTTGTAAGGATGGCAGCAAGGTTTGGTGTTACTGTCGTTCCATTTGGGTT
TGTCGGAGAAGATGACGTTTTAGAGGTAACTTTCCCAATCCATTTTTTGT
TCTATAGGATTAATCGACACTGCTATATCTGTATTTCATAAAATATCGTT
TCAAAGGAAATTTACATTGAGATGTCATCATTTAACATCTTGACCAGTTG
ACCTTTTAAGCATGTTTTATTCACGAAAAAAACATGAAAGCATGGCACAC
AAAATGACTCAAGATTTGTGAAAATGCACAATTACTAGCTCTCTGCAGGA
AATATGTGGTGATAACCCATATTTGTGACTAAGGTTATTGAAAACTAAAC
CAAGTGTATCTGCGCATTCTTTCCACAGTTGGTTCTGGATTACAATGATC
AAAAGAACATTCCATATCTTCGGGAGTGGATAGAGTCAATGAACAAAGAC
AGCCAAAGAGTGAGGTCAGATTATAATTTCCAAACAAATACAGGAAGTGT
TACTCAAACTCTTCTTCATTCTGCTGTGTACATTTTTTTATTTCAGAGAT
AGCGTCAAAGGAGAGGAAGGGAATCAAGATATGTACATACCAGCTATTGT
TCCCAAAGTACCTGGACGGTTCTACTACCTGTTCGGTAAACCAATAAAAA
TGAAAGGGATGAACAATGTTCTGAAAGATAGGAAGAGCGCAAACGAAGTG
TATTTACATATCAAATCAGAAGTCGAGAACGCGATGTCATACTTAAAAAG
AAAGAGGGAGGAAGATCCTTACAGGAGTATATCACAGCGTGCTCTGTACC
AGGCAACTTGGGGTGTTTCTGCTCAGGTCCCAACTTTTGAACCATGAAGA
CTAGGTGCAAATATATTCCTGTGATAGTGTAACTGCACATTGGCAGTTTG
GCATAAGCAAAGACAGAAGAATGGCTAGCACTCTCTGTGGAGGAAGTTAG
GGCCAGCTTTCTCCGAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.