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GrainGenes Sequence Report: AA005963

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Sequence
AA005963
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005963
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGATTTTCTAATTTTACATGCTATAATACGATATCTATCTATGATATTCT
AACCATCTCTTTCTTCGTTGTGCCAGGACAGCAAGAATGGTGCCGGTGTT
CGTAATCGTCGCTAGGTGGTTCAACGAATTATTTGTAATCTCTTTTAGTC
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GTCTGCTAACTGTAGACTTATCTTACAACAATTTTCAAGATAACATAGGG
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AATCCATTGTTTGCCCAATTTGCAGTATCTGCACCTAAGTGAAAATAGAT
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CAAGGCCTTTCCACAGCTAAAAGTACTGTTGTTGGAACGGAATTTGTTTG
AAGGAATGATCCCAAATGATATATGTCATTTGAAGCATTTGCGTCTACTA
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CAAAAATCTATACTGAACCAACTAGGTCTGATGAACTCAAAGATCGTTTA
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GAAGAGCAGGCAAGAGTATTACAAGGGAGACATTCTCAACTACATGTCTG
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GGTGATATGCAGTGGTTACGGGCACTGAATTTCTCTAACAATCACTTGGA
TGGATCAATACCAAATTCCTTATCAAATTTAAGTGACCTCGAGAGCTTGG
ATCTATCGTACAACAAATTGACAGGCCAAATACCACCAGAGCTAGTAGCA
TTGCAGTCACTTGAGGTTTTCTCAGTGGCATACAACAACCTCTCCGGTCC
TACACTGGGAACGACAAGGCAGTTCATCACATTTGATCAGAACAGCTACG
AAGGCAATGCATTTCTCTGTGGCCCCCCATTGCTGAAGAGTTGCTCCACG
CCGCCGTCAACTCCTCCGTCTGATGAACATGGAGAAGAAGATGATGATCA
AGCCGGTGATATCATACTATTTGGATGTTCGGCGATGTTCTACCTGGTTG
GTTTCTGGACGTCCTTGGGTTTGCTTTACTTCAAGAAAAGCTGGCGATGG
TCATGGTTTTCTGGCGTGGACAGGTTTGGTGATTTTGTAATGTTCAAGTT
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TTAGCTGGTCTTATCTGTTAATGCTGTGTAGTTTTCCGGCACTGGTTAGT
GTGATGGCACTCTGATTGGAACTAGGGCAATGCATTTTTAAATATTGTAC
TGAGCAATGTTAAGTCACCTTGTTAATTACTGTTATCTGCAATGCTGCAG
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CGCAGCTTGTCATGGAAACCGCAATGGCTCAAAGCAGTTTTCTGCTGACA
TTACAGTCTGAGGCGATGGACAAACAACATTACAGTCAGAGGGATTTGAT
CTAGCGAAGTCATTGTAGCTAGCTAAGCAACTCATGGACATGCTGCTCTT
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GTGGACACTTGATTCTACCACTATCATATTTGTCAGGTACGCTTCCATTA
CCATCTCACTCAACATAAAGCTATGACACTTGAGTCTCCCACTATCATCT
TTGTCAGGTACGCGTCCATTATCATCACACTTTCCAAACGGGCTACTCCC
CTTTCTGATTTAATCTAACCGAACGAAAGAAAGATGGTCGTTGCTAAAGA
CGGGCACTCCCCGGTTATGAATTTGATATACACTAGCTACTGTCAAATAA
TCTACAAGTGGTTCTTAAAAAAACTAGTAAATAAATCTAGAAGCGGGGTA
AAGAGTAGGAGAAAAATCCTATGCGACCTGGTCTTACCGTCCCGAGCGGT
GGACCAAGTTGTGTGTTTGCCACGTATCAAAACAAATCTCAAAGCTTCTG
GCCACTTATTCCTCAATTTCTGCTTAACAAATCACTAATCCCACTAGGAC
CAGCTCCTTCCCGTCGGCGTAGCTCGTTGACGACGCCGAAGCAGCACTCC
AGCTAGCCACGGACGACCTCCATCGCGCCTGGTGGCGCAGCTCCTTAACG
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ATGAGACAGAATGCACAAGATTTGACAAATAACACCAAATAGCAATATTT
TGCTGACATGCCCAGCTAACTAGCATTAAGGCACCAACATGACACACCAA
TATTCAGACGGCCTCTGATCCAGTACAACCCCCTCCCCCTAAACTCGTAT
CAAACTCGTATAATCTCAAACACAATGACGACCCAGATCGCTCGATACCA
CTTCGTTATTAGTATAAACAGGTATATACATAGCTTTGTACAAAACCCGT
ATATCTCAACCTAATTATACGTCTTTCTAGCAACGTATATGTACTAATAC
GGCTGCACGCCGGATCATCGCTGGCGACGGCTATGGCCGGCAAGCTGGTA
GTGGTGGCGGTTGGGTCTGCCGAGCTGGTGGCGGTGACTCGGCCTGGCCT
TGTGGAGGCGACGCGGTGGCACGGCTGGCGTTGCGGCGGTGTGCAGACTT
GGCAGCTGCGCGGAGGCGGCGTGCAAGCATGGTGGCGGCGCGTGACCGGC
CGGACGGTCCAGCGACATGTCCGGCGTCACGAGGGACTGTTTGGTGTATT
TTCCGGCGAGTAGTTCCGAACGATAAAATTTTAACATGAGCAACTAGGTG
TCGCCGGACATGTTGCCTGGACATGTTGCAGATTGTGCAAAACTGTCTGG
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CGATTGCGATGATGGCTGGGGCGACGGTGATTGGCACGGGGGTGTAGGCG
GGTTGGGGTCCTGTGCGGCAGTGGTGCGCAGGCCAGATGCCTATACGTCG
CCATCCATATGCGTATACATGGGTATACTCCTTTTAGATATGGGTTTGAA
TATGTATGTAGACAGCCTTCTACGAGTTTAAGAGGGAGGGGGTTGTACTG
GAGCAACCCAACCTTCCGAAATCCAATTGACTAGCGGCTGGTGTTGTGCC
ATCTCCATTAACCTCAAACAGCAGTCTTGTAAATTCTCCATGGATAGGTG
GGACAAAAGCTGCCTGGTACTCTCCTATTATCAACACAATCAACTTGTAA
AGCTTCAGCTGTGGGTGGAACAAAGTACTGATTCGGCCTTCATTTGATGG
ATGGCTTGAGACTTTTCCTGCACATTGTTTGATACAGGGAATTAGGAAAT
TGAAACCTTGCCACTTATTCGCACTACATAACAGTGAACATACCTTTTTC
CTTTCCTTTCTTTGCTCCCTCTAGAACTTCTTTTGATCTTTTTTGCATCG
GACCTTTTACTCGCCCAGGAGCTTAAAATGGTACGGCTATTTTGGCCATA
TCTTCATTACTTTCGGCGGAACTCTCCATGTCGTCAACTTTCCGGATCGA
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TCGCATAGGATTTTTCTCCGGGTAAAGACTAATACAACAGAACAAAGACC
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ACATTGCTGCACCTGACTGGTAGTACTATAACTCTATAAGCTCTGAGTAT
AAGCGCTCAAGATAGCAGCAGAAGCGCGCTCGCGGTGCGGGGATAGCGTG
ACCATGTCGCGCTCCTGCATCCCATGGCCGGCACTGGCCGTGCTCTGCTT
GGTGATGATGATATGCGTTGCGCCATTCCTGCCGCGGTGCGAGGCGTGTA
TCCACCAAGAGTGGACTGCGCTTATGAACCTCCGCAGTGAAATCTTTCAC
GAACCGCTGTACTGGAGTGGGAGAAATTGCTGCGAGTGGCAGGGGGTGGC
CTGCAACTCCCGCACAGGCCGTGTCACAGGCCTGGAGGTGACTGGATTTG
AAGATGATTCCACGTACATAGGGCTACTCAACAGTTCAATGTTCCTCCCA
TTACAAGAGCTACGGAGTCTGTCCCTCACTGGCCTCAACATTACAGGATG
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AGGGCAGGCCATGACACCCAACGGCACCCCCTAGTTTGTCCACCCCTAGG
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TTCATACAAACACTAAAATTGATATAAAGGTTGAGTAATCATACATACCG
ATCATGGATCATCTTTCTCTTCTTCTCAGAACCATGCCCGTTGGATTGGG
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GGAAGGCTCCACTTCCTTTTGCTTGAGATCTGTTTCTTTGGCTCTTGAGT
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ATTTTTCGCCTCCACATACATGGAGCTGGGAGATGCTCTATTGGCGCGCT
TCTGGGAGGACAGATGGATCCAGGGCAGATCCATTTGCGAGTTCACGCCC
CAGCTACGACTGCGTCCCTAAACGGCGGCGCAAGATACGGACAGTGGCTG
ACGGCCTTGCAAACAACAGCTGGGCACAAGATATACAAGGCGTACTCGGA
GTCCAGGAGGTGGGCAATTATCTACACATCTGGCAGCTCCTTGCGCCCAC
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GTGAATACACTGCTAAATCAGCGTATCTTGCCTCCTTCCATGGGTCAACC
AGCTCCAAGTCTTGGAAGCTCATCTGGAAGTCCTAGTTGCCCAATCGCGT
CAAATTCTTCCACTGGATCGTAGACATGGACCAGTGCTGGACTGCGGAAA
GGCTGGAGCGGCGGCACCTCCAACACCATCCTAGGTGCCTTCTCTGCGAC
CAAGCCCAGGAGACCATGCTCCACCTGACCATCACATGTCCATCCTCTCG
ACAAGTCTGGCATGAGACCCTTGCGTGGCTGCGCATGACCTGCCACCCGC
TAGCTCAGGAGGCATCGCTTTTCGACTGGTGGACCCAAGCTAAGCAAGAC
ACACCGAAGGCCATGCACCAGGGGTTAGCTTCCGCGACACTGCCTGTCCC
ATGGATGATATGGAAACATCGAAATGACTGCGTCTTTGAGAGGGTTCGGC
CTTCCATCGTGGGCCTGTTTGCGAGAATCAAAGATGAGGCAGCTGCATAG
GTCATGGCAGGAGCAAAAGGGCTTAGAGATGTAGTACCCATGACGTGGGA
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TGTAACAACAACTCTATCTATGCAATGAAATGAGACACAAAGAGATTTTT
GCGTTTTCGCGAAAAAAATCATAAAGCGTCAGATCATGGGCGCACTGATT
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TGATGTGCGGCTCGCCCCTCGAACGCGGGAGCTGATTGGCGCCAAACATA
GTGCATTCGTCCGTGGGCGCTGCATCCACGACAACTTCGTCCTGGTGCAG
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GCGGAGGCGCATGGACTGCTTTCTGATCCCCAGAGGTTTGGCATCAGGCA
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TGCCTCCGGGCTCTGAATCAATTTCACCAACAGTGTTGCGATCCCAATTC
GCTGTCCCGATCAGCTACTCGCGCAGATCACCCCGTTCCTGGACTGTCCA
ATTGGGCAGTTCCCGTGTCGCTACCTCGGGCTTCCGCTCGCTCTCCCTGA
CCAAACCTCGGAGGGCCGACATCCAGCCGCTGCTAGACAAACTCGCCGCG
ATGCTGCCAGCCTGCCACACTGGAAGGCCAGGCTTTTCACGCGTGAGGCT
CGCGTTGTCTACGTGCAGTCAGTCATGACACGATCATGATGGGATCAGTT
ATCTACCAGCTCGTCGCCATGGATGTCGAGCTGTGGGTGTTTCAACTGAT
CGATCGGCTTCGATGGGGATTCCTGTGGGCAGGCAAGGAGGATATTTGAG
GTGGGAATTGTCGATTTGTACTAGTGTATGTTACTTTTATCTATTGACGG
ATCTTTTACTCTTCTGTCCTCTAAATCTTGATACCATAGACAACCATCCT
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AATATGTTGCTTAACTCTTTTTTGTAAGTTGAAGGACGTGTTTCTCTCCC
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GTTTGATTTGTATTTTGCAGGTTTTGAAGTTTTGTCAAAGTTAAACAAAT
TAGAAATTCTTGATTTATCTATGAACGAATTGAATGACAGTGGCATCTCA
TCCTTAGTTGCAGTTTCATCAATCCGATCTCTGTTCCTCCATAATAATGC
ATTGAGTTCTGCTCAAACAATCCAACGTGAGTTTTACATCTAATCTTGGA
ATTCTTTTATTTCTTTCCTTGATTTTGATTGTGGCAACCATATCTCAATT
GTCAACAGCTCTGTTGGTTTACCGTGTTTGCTGTTTCTTGTACAGAATTG
AGCATAATGCAGCTGGAAACTCTTGATATGAGCGGTAATGCAATTAACGG
CGTCGTCTCATCAGGTTACTAATTCAACTCGATGTCATTATCTATTTCTT
TTATTTCAATAAATTAAATATCCAATTTACTTATTTGATGTTTCAGATAT
TTGCAATATGAAAAATCTTCAAGAGTTGCATCTTCGTGACAACATGTTAT
TTGGGGAGCTTCCATCGTGCATAGGAAATCTAACTTCTCTCAGGGTTCTC
GATCTTTCACATAATCTACTAATAGTAAAGTTCCCATCTTGTAGCTTTAC
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GAAATCTCTTGCTGAGTTCCTTGTCAAATCACAGCCAACTGAGATATCTC
GAATTTGCAAGCAGCGGCAACCATTTTCAGCTACAAACTGAGAATCCAGC
AACCAAATTTTCTGCACAGCTTGAGGTTCTAGTTATGCGTAATTGTAACC
TTAATGGAAATTCTGCCGTTATACTAAATTTCTTGTTGCATCAACATGCA
CTATTTGGCATTGATATGGCGAATAATAACCTGAATGGTAACTTCCCATC
ATGGTTGATAGAGAACAACACAAACTTATTTTTCTTAAGTTTTCGAGGTA
ATTCATTTAGGGGATCTCTTTCTCTTCCATCCAAAGTACACAACGATTTG
ACATACTTGGATGCTTCTCGCAATAGGCTAATAAAGTTACCAATTGACAT
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TTGAGGGTCCCTTTCCTTCGGCCCTTGGCTACATAGGTATGCTATATACT
GTAGACTTCTCTTACAACTATTTCCAAGATAATATAAGGGCCGCATTTGC
TACTGGTATTTCCAATTTGTTCCTCTCCTCAAACAGTTTCTCTGGTTCAC
TCCCCCAGGACCTATCAACAATATATTCTAATTTAGTACTAAACGACAAT
GAAGTCACTGGGGAAATTCCCGTGGCAATATGTGATAGTGATTTTCTTAC
TGTGATTGATTTTAGCAATAATGGGCTAACTGGCTCTCTCCCTGCTTGCT
TATACACACTCACGTCTCTTTCCATCTTAAACTTAAGAGGGAACTCATTT
GTTGGATCGTTTCCATCGGGAATCTGGAACTCTTCAATCCTTGAGTTTCT
CGATGTCTCAAATAACAATCTTTCAGGCCCAGTTCACTTCTTACCCCAAA
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TAAGAGTACTATTGCTGGAAAGGAATTATTTTGAAGGAATGATTCCAAAT
GAGATATGCCATTTGTCGTATTTGTCTCTACTTGATCTATCTCATAATAA
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AGTTATTTGATTTCCAATACAGTGATAGAAATCCTTATAAAAATTATATG
GTACTGTCGGATTCTTACGAGGATCTCTTAGCCCAATATAATAATATTAT
TTGGCAACCGGACCAAGAGGAATTCATGACCAAGAGAAGGCATGACTATT
ACAAGGGAAGTGTGCTTAATTACATGTGTGGACTTGATTTCTCTTCCAAC
CAATTGAGTGGATCTATTCCTGAAAGTATAGGCAACATGAAATGGTTGCG
GGCATTGAATTTCTCTGGCAATTACTTGGACGGATCAATACCACGGTCCT
TATCAAACTTAAGTAAGCTGGAGAGCTTGGATCTATCCTTCAACAACTTG
ACAGGCCAAATACCACCAGAGCTAATAGCATTACAGTCTCTTGAGGTGTT
CTCAGTGGCATACAACGACCTTTCTGGTCCTACACCGGGAACAACAGGGC
AGTTCATCACATTTGATCAGAGCAGCTACGAAGGCAATGCATATCTCTGT
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TTGGATGTTCGGCGATGTTCCACCTGGTTGGTTTCTGGACGTCCTTGGGT
CTGCTTTACTTCAAGAAAAGCTGGCGATGGTCATGGTTTTCTGGTGTGGA
CAGGTTTGGTGATTTTGTAATGTTCAATTTGTCTTTGTTCAGAAGAAAGA
TCCGTAGCACCAACTGGACTTTCTGGAGGGCTGAGTAAGCTAGTCATCAA
GCGGCCTTCTTTTGTATGATATACTAGAATAATAATTCAATAAGTTGTGT
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TTGCCACGTCTTGTATCTTGTTTTCTATCATCAGTCAATGAATTATGTTG
CTGTGAAGTTGTTTGGCACTGGTTAATATGATGTCACTCTGAGATTGGAA
CTAGGATAATGTTTTTCCAATCTTGGACTAGGCAATGTGAAGTCACTTTG
GTTAATTTATGTTACCTGCAATGCTGCTATGCACTGTAAAACGCTCATGC
CCGTGCCCAGGAAATTCTTTGGAAATCGATTTATGACACAGAACTCGTGA
TTGTTTGAGCTTGCATTCTGTGAGTGCACAGTTGCATTTCTGGTGGTGTG
GTATTACACCGCAGTTCCCAATGGAAAAAGGGACACAATGTCTCAAAGCA
GTTTTCTGCTGACATTACGGTCGAGTCAACTGACAAACAATATTACAGGA
GTGAATTAGTCCAGCAAAATCATTGTAGCTAGTTTTAGTTTTGGGATGGG
GTAATTTGTGGGCAGAGGAGGCTGAAGGTGGAAGATGACCACGACGGCAG
CAACTGATGGACATGCTCTTGCTTCCAATCGAGAGAGAGGTGCCGTAGGC
TACCTGGTTCTCAGTCTCAGTCCCTACTACGATTCTCCCACTATCTTCTT
GTCAGGTACGCCTCCATTACCGTCCAACTCAAACACAAAGCTTATAGGCT
GATCTAACCAAAGGAAGGAAAGCAAAGACAGTCGTCGTTATGTGCAATGT
AGTCGCCAGTACAAAGACTGCCACTCCTGACGGATATGAATTTGATAATA
CCCTAGTGTCAAGTGATTTAGACGCAGAGTACAAAGACTGCTAAAGCAGA
GTAAAAAGAGCTTCCTAGTGGCAAGTGAATTTGATTGTTACCTACCTTAA
TATATCAGCTTCATCTCTCATGCGACATTGCTGCACCTGAGTGGTAGGTA
GTACTATCAGCTCCTCTGACTCTCTGAGTAGAAACCTCGCTGAAGATAAC
GGGAAGGAGCGTGCGCTCGCGACGAGGAGGATGACCATGTCGCGCCCTTG
CACTCCATGGCCGGCACTGGCCGTGCTCTGGCTGGTGACGATGATATTCC
TGCCGCGGCGCGAGGGGTGTACGCACCAGGAATGGACGGCGCTTAGGGAG
TACCGCAGTAAGATCTCTGACGAACCGCTGTTCTGGAATGGCAGAGATTG
CTGCGAGTGGGAGGGGGTGACCTGCAACTCACGCACAGGCCGTGTCACGG
GCCTGAACCGGACTGGGTATGGAGATACTTCCAACATAGACATAGGGCTA
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CAGCGGCCTCGACATAAAAGGATGCATACCTGGCGCAGGTAAATTCTTCA
TTGCCCTCTCCTCTTGCATTAACACCATCCATTTGAATCGCTAGCAATTT
CTTGCAGCTTTTTTCTTGACGTGATTCTTGCAGTTTTGTTGAACTGACTA
AAAACTTCCTTTCTTCTCGTCACTATCCCTTCGCACGTATCAAATTTTCC
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CACCACAATTGGTGGTCAAGAATCAAAAAGCCACCCGTTTTTAAAAAATT
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CGGTTTAGCCAAACTAAGAGCACCTTTACTCGTTGGGCTTTTTTATGCCA
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TGCTGCCGGACGCCGCCTCACATGCCGAAGTTGAGATAGAAGCTTGTGTA
GCTGGGGTCCGCTTTGCCGTTGTCGTCCCTCGACGGCTGCGATAGGCGCG
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GGGGGGATCATCGTCGTCGAGGACGACAAGCGGCGCGTCCTGGTAGGCGT
GCTAGCGGCGAGCGCTTATCCTCCTCTTGCAGGTACTGAACACGCAATCG
CTCCGCCTGCTCCCAGTCGTCCCTGGACCAGGCGAGGATGTCCGGCTCCG
GCATCGGTGGCGGCGGCACCGCATCCTGGAGAGAGCACTCCATCGCCATC
TTCATGGAGAAGGCGTCCTCGTCAACGGGAACCGCCCAGTCCGCCGGCTC
CGGCTTCGGCTGGCGCAGGCGAAGCCGGCCAGTCGGCGGTGATGGCGCGC
GGGGCTAGTTGATGACGATCCCCCGCGAACTTGTCCTCGGCGGCAAGCGG
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ACGCGGTGACTATGCTAGCGTGGACCCGAACGAGCTGGAGGTCGAGGCGG
CGGAGGAGGAGCTGAGGCTAACCATCCTCCTAGGAAGCCAGTTCGCCGGA
GGATAGCGCCTCGCCCTGGCCGCGGGCGCCGGCGAGCGCGGGAAGCCCAG
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TTGTTGAGGGTGGGAGCGCTTGTCATTATATGGTCGCTATGACTTTGTAG
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TTTCGTGACTTATTTGTGGAGGGATGTACGCGATTGGAGGACACGACAAG
GGATATTTTCTCCCGACATGGATGACCGCGTGATCTGGATTGATCTACCT
TAGATTCTAGACATTTATTTCGATAGTGCCTTCTTGTAATGCTTGTCTAC
CTTTTGCCTTAGTTCTGTCGTTCGTGTGGTTGTGTGCATCTTGGTTATGC
AGAGACCGTGTGTAAACATTAAATAGTTTGGTTAATAAATGCGCCATTTT
CCAAAAAAAAGCGTAGTGGGATTTCTGGTGGTGCAAGCACTTGCCATGGA
AATCACAATGGCTCAAAGTTGTTTCCTTCTGGCAAACAACGTTATGGTCG
AGGGATTTTATCCAGTGAAGTCATTGTAACTATAGTGTTTTTTTTTTGAG
CTGGTAGCTGGTGTTAGTTTTGGGGATGAGGTAACTTGTGGGCAGCGAAG
GCTGAAGATGGAATATGACCATGACAGCAGCAAGTCAGCAGCTAATGCCG
TAGGCTACCCGGCTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.