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GrainGenes Sequence Report: AA019193

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Sequence
AA019193
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019193
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAGTAGCTACAACAGCAACAAAACAGCTGTCCGGCAATTCCAATCATCA
CTACTTAGCTCCACCAGTCCTAGTGAGTTGTGTCATACCACACACAGTTA
ATAACACACCAACAAGCATCCGCTGAGTGCTCGAGAGACCATGGCGGAGT
TCGCGCTTGGGTTGACCAAGACGGCGGTGGAGGGGACGCTGATCAGGGTG
AAGTCGGCTATCGAGGAGGAGGCGAAGCTCAAGGTGCGGGTGCAGAATGA
CCTGCTGTTCATCTCCGGTGAGTTCCAGATGATGCAATCGTTCCTAAAGC
TCGCCAACAAGGAACGCGCCAAAAATGAAGTGGTGCTGACATGGGTGAGG
CAGATCCGCGATCTCGCCTTCGATGTCGAAGACTGCGTCGAGTTTGTTGT
CCACTTGGACAAGCCGTCGCGCTGGGACTGGGTGCGCCGGCTGGCCTCCT
CCTTCTTGGTGTGCATGTCACCGCTGCTGCTCGACATGGCGGTCGCCGAG
ATAAAGCAGCTCAGGACAAGGGTGGAAGACATAAGCCAGAGGAACACCCG
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CAGCAGCAGCAGTTATTTATGTCTCCTCTCCGCCGGTGCCGGAGCTTATG
CTGCCGGCCACCGCCGGCAATACATCATCAACAACATTCCGCGTCCTGAG
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GGAAGTACGTCAGCTGCTCATCTCTGGGTGACTCACGCCTTCAGGGAGGC
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AGCTGGTGCATCCTTTCAACCCTGACGACTTCCTGAGGAGCCTGCTGACT
CAGCTGTATGCCACCTCTTCTCACCACCAAGCAGACTTGGAGCCCTTCTT
CCGGACAACAGAAGAGTACCATCTCATCAAGGCCGAGCTCATGCAGCAGG
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AGCCATACCAAGTATCGGACCTTAGACAATTCTCCGACGGTCAATCTCTG
TGTGCCTTCTTCAGCAGGGTACGTACGTAAGCATGCTCAACTAGCCACTT
TCTTAATTATATAGGCATGTTATATAATGGTTTATATGTTAATCAACAGT
ACTATACTATCAATTTTTTTAAAGCTTGAGTTTATCAAAGGTTGAGTGAA
AAACTAGATACTACGACTTTGTTCATTGTGAAATACGTGTGCATGTGTAG
TACTCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTAAATGTGTCTAGATTTGAATAA
ATTTAGACACTATATAGTATATAGATTCATTCAAATTTTAACAAATCCAA
ATTAAGTAATATGAGTCTGAGGAAGTAGTTAATGAATTAGGCTGAATCTT
AGCTAGCAATTCAGGTCTACACAAAAGCGTATTATCAAAGAAATTAGGGA
AACGATACGTATCATCCGGGGGATGAAACGTTTTCATCCGCCGGGTCCTA
TCGTGTCGCTCGTTGTTAGGTTCCTCTTGAAGACAGCGCTCTTGTGTGGC
CCCATCATGCCAATCCTCCCAAAATATCTTTACCTTATCTTCTCCACCGA
AATTATTCCCCAACTCACTGCCCGTCTTCTCCTACCTTGCGCCGGCCGCC
GCTCTTCTCCTGCTGTTCTTCTTCCACAACACGACCACGCGTCATGGCTT
ACCTCCGCCACAGCAAGGCGCGCTGTTGTTAGTTCTCGGCCATGTCGTTG
CAAGTTGGCGGCCGCCGTAATGCGAGGACGGGCGCATCGAGCAGCTGGAG
GCGTACGAGGACTGCGTGTTGGTGCGACCACGATGGCTACTGCGAATCTT
AGCTAGCAATTCAGGTCTACACAAAAGCATATTACCAAAGAAATTAGTGG
TCAAAGTAGAACCGGAATGTGACACTTAATTTGTGGTGTTTCTTTTAGGG
AACTCCATAAGAATTTAAAATGTTAATGCAACAATCCCTAAAGCACGGTC
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GTCGTCATTTTAAACTAGAGCTGGTTCAAAACTGTGACACTTATTTAGAA
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GGTCACACATTATAATTCATGAGGTTAGCTCAAACTTTATTAGATACAGT
TGGCGTTAGAGTTGTCCGAATAATAAATTACAAGTTCGTAATAAGATTAT
ATATGTATAAAATAGTTGGAGAATATCCGTCGGTGAGCTGAATGCATTTG
GGAGAATATAGTATAGTGAAAAAAATAGACATGAATATGGGGAGACAGGC
TCGCAAATCATGGGCCAGACTAGGCCTAATCATGTTTTCCGTCCGGACTC
GAGCCTGGAACCGATGAGCCCGAATATCAAAACGGCCAGGTGCATGCCTC
AAAAACAGATGATTTTAGTTCAGGTCGGGCCGGGCTCCCCAGGCCAAGTC
AGCCTTTTTGGTCTTCGAACCAGGTTTGGGCCTTATTTTAGACAAGACAA
TTGGTTTGGCTTGGGCCTCAGATTTTAGTGTCGCGCTTTTTAAAGCATCT
CTCGAAGCCCGGCACGCCCCGAGAAATGCCCAGGTGTTGTGATAACCATT
ACATATTTTTATGTGAAAAGGAGCATATATTAATATCACAAGACACCAAC
TATATCCAATCTCTGTAACAATGTATTGCCCTAGCGGCTTTACAAATGCA
CACAGCCAACAAAAAAATATAAAAAAAAAGTCCTGCTACAATGATCCATT
TCTTGAACCAACGATAAAACCACCATCAAGACAACACCAGAAGTCCATAT
TATCTAAAAGCGACGCCTCTAGGAAGGAAACATTGCACAAACACCATCAT
CGTCCGATCATAGATCTTAGGTTTTTACCCTAAAAAAGTCCACGCTCTCA
AATAATACCTTTAACAAAGCCATTGTCAGGCACAACTAGTTAAGACCAGA
CCCTGAGTTTTCACCCTAAAAGATAGGACTATGAACTTCTCCTATGCAGT
CGCCCCTATTTGCATGCTACTGCTCCAATTCATGAGTCGTCAAGCCCTTA
TCATCACCCAGACTTAAACCACCATTGTCAGTCCTTAGGTCTCGCTCCCC
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AAAACATGGTCCGCACGACCGAATCCCACCCGATCCGGCAATGTCACGGC
ATGAACGCACTTGTGGAGTTCGCTGGCGGAGCCGTCCGGAACACGACATA
GAAACCAGATCAATGGAGCAAACATCAAGCGAATCTTCGTCTTGGCTTAA
GAACCCTAGGATCACCTCCTTTATTCAAACCATTACATATATGGATGCAT
ATTAGTTGTCAATGTCTGAAAGATTGACCTCATGCATCTCTAGGAGTACG
TGAAAAAAAAAATGGAGGGACGGTATGAGTGAAAGACTAGTAAGCTTGGT
ACAGAATTTACAAGATTCTGTGGGGATACTAAACACATACTTTATCCTCG
TAATTTGCATTTCTAATATAATTACAACCATATTTTGTTTCAAAACACAG
ACTTCACATGCACTTTTATAACCAGATATAAAAATATTGGAGAGAAGGGT
ATCCGATTAGGTATTCTTCATGTGTATGAGAATATGATGCTCACAAATTG
CTGTAGACAATGGGTTTGGTAAACTATAAATGCATATGTTGTTCTCATGA
TAACTCAGCCATCGTACTTCAGTCTTATATACTTTGTTTTCTTAAAGAAT
GTCAAGTGTTCCTTCTGGTTTCTTCAAAAGAGATAAGAATAAAACCTTAA
AAGTGTTAGCATTAATGGGGATTTTAAGTTTTTATTGCAGTTGACCATCC
GTTTCTGAATTGCAGGTTTGTGGACATAACAGTTATATGGCTGAATTTAT
ATGGCAATTAAGACGTTCTGGTGTTATGTCTGTGTTCAGGGGGGGTAAAG
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TGATTTTGAACGGCATGTCTGGTTAGATGTAACCCATGAGTTACGTTTGG
AAGATTTCTCTAGGAGGTTACTTTCGAGTTTCCAATCAGATGATATCCGA
ACCAGTGAAACTGCGGCGGTTGGTGAGGTTGATCCCATGCGTGTCATTGA
GAAGTGTCATGAGTTTTTACGTGGATACAACTGTCTCGTTGTTATTAATG
GTTTGGACTCGATAGATCACTGGAACATGATAAAAGAAAACTTCTTATCC
GAACCTATTAAAAGTTGTATTCTCATCATTACTGCTGAAGAGAAGGTGGC
AAGACATTCTGTAGATGCGGAAGATCGAGTGTTCAATAACAAAGATTTAG
AAGACTTGAGAATGGTATGCATTTTTTATTTTGTGTACTAATCCCAAAAC
TAATATTTATTTTTATTCTAACAAATAAGCTTGAATATTTTACCCTCAAA
CAAGTACTCGACCTTAATTAATTTTGCTAAAAGCTAATTAATATTTTGCT
CTCATCTCCCATGTTTTACTTTCATGCTTACATATGTTAAGTTTAACTCG
ACGGGAGTGGAGTTGTCTTAACAGACAACTTCCACTTGTTACTTAACAAG
ATAAATTGAAATTAATAAGTGACTCACTGGTTAGTAATTATATTTGTTAG
ATTACTCTGGTTTGGACCTCACCTTACTAATTACGGGTCTGGTCCAGATG
GCGATTTTCAAAGTTCAAGAACCATTGTGAGGCCTTGCAAGTGCATTGAG
AAACTATAATGCACTTCAGTACTATTGAAAATGTCTTATTTAGTTTAGAA
AAAAGGTAGCACTGCAAGCCTTCACATCGATCGGTTGATTTACACGTCTC
GAATTTTTTTAAGTTTTATAATGATGATTGCAAGAGTTTTATCTTACTAC
TTGCAGATGGAGTTATTAATGGAAAGATACTTCCGGAAGGAGTGCCACTT
GCACATTGGGGTTCACCGCGTGACTCGTTTTTTCTCTGGTAGACAACTGG
AGGCATTTGAGTGGAGGGAGAAATATGGACTTGTTGGTCATCAGAGTGAA
TGGAGTGGCCTTTGCGATCAGTTAGAGGGCGATCCTGGGGTGATCTCAGT
GTGGGGGGTTGCTGGTGTTGGCAAAACAACTCTTGTCAAACACATTTACT
ACACCAATATAATTGGTTTAAGCCAATATAATCTAGGCACCGGTGTCACA
AAGTATAGCTGGGTTGATGTGACATATCCGTTCAATTTGACAGACTTGTC
CAGAAGCTTACTTCTGGATTTTCATTCTGATAATCTTGAAGCTAAGGAAA
CCGCCGCTATTGGTATGATGGAAGGGCAGGACCCAGCTCAAGAGTGCCGT
AACTTTATGTGCCGAGTCAAATGTTTCGTTGTTATTTGTGGCCTGCGATC
CATTCAGGACTGGGATTTGATAAAAGAGGCATTCTTATCTGAGCCTATTG
AAGGATGCATACTTGTCATTACAAATGAAGCAAGTGTTGCCAGACATTGT
GCAGATGACGGAGATAGAGTGATCAACGTCAAAGGTCTAGAAGCCGACGC
AGCCTTTGCTCTTTTCACAAAGGTGTGTTGGCTCAAGCTTTTTATTATTG
AAATTCTTTTATAGTTCAAGAAATACAGCAACATACGTATTATTTTGTGC
ATATTAACATATATCCCACTAGAGTAAAGGATGAAAGCTAGATATACTGA
TGTTTCGCTATAATAAATAAATATCAAAATATAGATAAGAAGAATGTCCC
AACACAACTACCTTAGCACGAAATTATAGGTAAAATATGACATGCCTCCT
CGCACCCTTCCCGCCGTGTCCACATCTTCCGGCCATCCCGACGCTTGTTT
GTTAGTTGCATCCAGTGTGTCCTACTCGTTCATCTCCACGACGTCTAGCC
ACACGTGGCGCTTGCTTGTTATCCATTCTTTTTTTTTGTTGCCAAATCTA
GCTTGTTTGTAGGTTTCGTTTTGGATGGCTAATTATAAGCATTGTGTGTA
GCAATGTGGTAGCAAGAAGCAAAATCTGAGTCTGGTCATTAGAGCATGGA
TAATGTGTTTTTTATGCAAGTGATTCTACATACATGCAGTTGTGAATGAT
ACAAGTTCGACATAGGTGTTGTAGGCTGCTAGTATTCAGGTGATGGCATC
TGAACCTTAAGTTGCATATTATTGTTGTTTAACTTATGTTTCATAAATAT
AATGCACCCATGCCTTTAGTAGTTTGTTTTAAACCGTATGAACACCATTG
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ATGCCACAAACTGGGCACAATGTTGAAATCCAAATATGATCCCTAAACTA
ATTAAATAAAACATCTCTTTGATACAAAACTTAAGAGTGTTGTTATCCAT
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GGAGCAGCCTAAGAGCATCTCTAGCCGATCTCGTATAATTTAGAGGAGTA
AATGGTAGAGTAAAGTTAGAGGAGTAAAAAATGTCTCCTCTAACAGTGGT
CGGACCTAACCGATCCCTCAAATTTAACTTCTCAAATGAAGTGACCTCAC
ATTGAAGTCTCTTTGTAGCTTATACCTCCTTGCCTTTTCCCTTTTCTTCC
CAGCCACTGCTTGGTGGTGCTCCCCGTCGGCAATCCAGCCTTGCAGCTGG
CCCCAACCTAATTCCCTCCACGCGGCCACCCAATCCCCTTAGCCACCATA
GCTACTGAACAACACGAGAGTAGTGAGTGAAAACCCCTATCAACCGCCAC
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GGCCGACCTGGGGGAAGTGGTGGTGGAGGAGAGAGGACCGAGACGCAGCA
CCCCTAGCGACAGCCATCGGTGGGTGAGTGGGCTTGCTCGTCGGTGACGG
GGATGAAGCGTGGTAGTAGGATTGGTGTGGCCTTCTTGAATGTTGCAGGC
GCGTGAGGTGTGAAGCATGGAGCACTGCTGCAGAGGAGATGGCTTGCTGT
GCAACTCGGGATCTTTAGAGGTTCTTTTACTCATAAATTGGACATTTCGG
GCGGAGGCTGAGGGTCGTGGAGTTCCTCGCCGCTGGCGAGGGTCGCTGGA
CTTGCGGAAGACCTTCTGGTTCTATTCCGGTCGGAATCAGGGGCATCATT
GCCAGTGTCGGCAAGATTGAATTGCTCTTGTGGGTGACCAAAATTTTACT
CCTCCACCATGGGGATGAGTATATTTGAGAGAGTTGGCCTCCTTTTTAGG
GGTGAATCTTATTATTTTACTCCCTTAACCATTTTGAGAAATCGTCTAGG
TGCAGTTTCTAGGAGTAATTTTTATTTTATGGCTTGAGATGTCCTAGGGT
AGTTTTTTTTTTTGCCAAATCAATGGACGGGGCGTCCAATTTTTTGAAGT
TCAAGTTAGCTTAGCTCCAATTAAGCTAATGACATGTCCTTATGGCACAT
GCTGGGGCCGATGCACTATATGCGTGTACTACTTATACAGGACATGGGTT
GATCTACACAGCTTGCATTGACTTGTACTATATGTTTAGTACGAGACGGG
CTCGTTGTTTTTTAACTGATTAAGGTAATGAACCCGCTCCCTAATATTAT
CATGCTTTACAAGTATGTTACCACAACAACATGAACTAGTAGCCAAAATT
ATATCAAAGGTTTAGGGGCCTGAAGTAACTTTATTATGTGTCAAGTTCCA
AGGATAAAAGTGATATGTGCAAAACTCAATTTGAAGTCCAGATTTGAGTG
TCTGGAAACTGTTCGCTTCTCATATTTAATAAAATATAGGCATTGTTTAA
TTTTTTGTTTCCCAATTTGATTTCAAGTCAAATGCTGGGATCTTACCTTA
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TCTTTCAAAGATGATCCTGACCAAATGTGGAGGGCATCTCAAAGTAATTG
CTACAATACGTGAATACTGCCAGAAAGAGCGTGAAACGGAAATGGCTTTG
AAGTCCATAAATGATAACTTCATGGGCATGTTGGAGAAGGACCCGAGATT
CCATAATTTGAAGGGTCTCTTCTGTTGGATGCAAAACTATTTTGATGCTT
GCCCAGATTCACTTAAGCCATGTATCTTCTATCTATCAATATTCCCTTCT
GATCATGGTTTTAGGCAGAGGCGTTTGCTGAGGCGTTGGATTGCGGAGGG
TTACTCTAGGGACAAATCTAGCGGTAGTACCGCGGAGGAGGATGGTGAAA
TGCTCTACAGCAAGCTCGTAGATCTGAGCATAATACAAAAGAAGTCACCA
ACCAGCAGCAGTAGCAGTAGTAGCAAAAAAGTTGAGATGTATCAGGTCAA
TGGGTTCTTCCGTGAATACATCGTATCACGGCCAATGGAAGATAATCTTG
TGTTTGCACTGGAAGGTAATTGCAGGCCTAACTCAGAACACACTGGAAAG
CACCTCACCATAGGGAGAACGTGGGACAGAGACGAGATTGTGTTCAAGAG
CTTGGACTTGTCGAGGCTGCGGTCTTTGACAGTGTTTGGGAATTGGGAAC
CGTTCCTCATTTCGGACAAGATGAGGCTACTCCGGGTGCTTGATCTTGAG
AACACCTTGGGTGTAACAGATAATGACCTAAAGCAGATTGGAAAGGTAGT
GCCTCGCCTCAAGTTCCTGTCTCTACGAGGTTGCGAAAAAATAAGTCACC
TGCCTGATTCACTAGGTGACATGAAGCAGCTGCAGACTCTTGATGTGAGG
GGCACCCAGATAATTAAGTTGCCATATGTTGTAATCAAGCTCGAGAATCT
GCAGTATGTTCGTGCTGGGATGCCGTTGGGTGATGATGTCGCATCATCCT
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TTAGATGGTCATCAAGCAAGAGCAGCACCGATGATTCCTTAGGACCCAGC
AGCTGGTTGTCCAAGTTGATGCAAAGTTTCGGACTCCATTGTGGAAATAA
TTATGGTGTTGAGGTTGTGGCAGGAGTTGGGACCCTCACAGCCTTACGTA
CTATTGGTGTCGTGAATGTAAGTGCTGCAGGTAAGAATGGGAAAGCCATC
CTCAAGGATCTCAAGAAGCTGACACAACTGCGCAAACTCGGGGTGTCTGG
CATCAACCGGAAAAACTGGCAGGAGTTGTGTTGTGCCATCTCGGGTTACC
CGCATCTCGAGTCCTTGTCAGTGAGACTAGATTGTACTACTAATAAGAAA
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GACCCTCCGGAGCCTCAAGCTGTACGGTGGCAACCTACGCGTGTCTCCGG
TCTGGCTGAAGCAGCTCTGCAATCTTAGAAAGGCTCATGTTGAAGATCTT
GAGTTGATAATGTCAGAGCAAGAGGACATAGACAGCCTTATAGAGTTGCC
ACACCCGAGTGCATTTCGCCGTCTTTGTGTCAAGCCGGTGAGGGATTGTC
GGCTTACTTATGGTTGGTACAGCGAGTATGATTTGAAAGATCGGCCTGAG
GGTGCGAATGAACTCAAAGCCCCGGTCCTCAAGATCGATTGCAGAGGCTA
CAAGATTGAGATAGTGTTCGGACCTAGGATACCTGAATTCGTCAAGGTGT
TGGTGGTTCACTGCTCTGCTGCTGGGTCGTATTTGGAGCTTTCTAACCTA
GTTTATCTAGAAAGGCTCGAGGAAGTCTGGCTTACGGGTACCCACAGAGA
CATACTACTCAGGGAACACTTGCAGAAGATAGTTGCCGAGCATGAGAACA
AACCTGCCTTGCGTATGTGTGATGAACTGACCCAGCAATCTCCGGAACTT
TCCCCCTCTGCGTGCTGAAAAGCAGCACTTTCTTCAGCGAAATCCACATT
GACATTCTTCATATTGTTTTAGTGCAGTTACTGTAGCAGCACCGCATGTT
CCGGTGCATTAACTTCTCGGTTTGTGTTATTTTATTATCTGTATGTAGTT
AGCTACTTTCGCCCGCGCTACTTTTCCATAACTTCAAGTCCTAACAAAAA
GTACTCTGACGAAACTGAATGTTTTGACACCCAACT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.