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GrainGenes Sequence Report: AA044260

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Sequence
AA044260
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044260
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAACGGCCAGAAAATTCCCCACACGGCTCCGCTCCGACCACCCGCACAC
GGCGATGGAGGCCGCCGCCGATGACCTCCTCGCCGCCCTCTCCTCCCCAT
CCTCTCGCGCCGGCCTCCACTCCCGCTTCGCCGCCTACCTCCAGCCGTTC
TCCCCCCACCTGCCCGCCGCGAACCCTAACCCCACAAAGCCACCGCCGAA
GAGGACGACGAAGCAGCCCAAGCAGCAGCCGCCGCCGCCCCCCGACGCGG
CCGCCGTGCGCCCTCTCGCGAAGCGGTTCCTCCCGTTCCTCTGCCGCGCG
CTCCAGCTCCTCCCGCCGCTCCTCCGCCCGAACCCTAGCTCGGTCGACGC
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CGCTTCGTCGTTTGCCTCGAGTCGAGCGGTCACTACGCGCGCGCCGAGGC
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TGCAACTTCGGAAGTTTGTGCTGCTGATTTTTCAACACCGTGTCGATAGA
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GGTGTCCCAGTTGTTCCTTTCAAACATACATAGTAGGCCTGGAAGCTGGG
CGGCGACCGGCCAAGCTTCAGGCAGCGAGCGAGCAGGGCCACGGCGAACA
GCATGCAGGAGGCGCGGCTGGAAGCTGGGCAGCATCGCGTCGAGTCAGCA
GTACTGCGGCGGCGGCTGTGTAACAGGAAGTTGGCATGGTGGCCGGCTGA
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GGTTTGACATCTCATGGGAGTGCTATTTTGGCTATAAAATCCAAGATTGT
AATGGCATTTTGGCAACATGGGCTTTTTGAGTGGTATCTTGGAACTCTAG
GTTTTAACTAGTGGTATATTGGCTATTCTCTCATGAGATTTTTTCCGTTT
GCAGGATTCTGACTGAGGATTCCAGCAGGAAGTATCTTACCCTGCTCGTG
AATGCACTGAGCCGCTGTGCCATTTTCCTTGCCGCTGAGTCTGAATGTTT
CAACGCTAACCTTGTGCGTGATTTCTGTGTTGCAACCTTAGGGGAGTGCG
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AATGCTTTTACTACTTATTCTGGTTGAAGGTTGCACGCAAGATCTGTTCT
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GCCGTGCTGTGTTTATTCAATAATATGCTGTGGGAAATCTGACACACAAG
TTGGCAAAAGCAGGTCAAACAAATACTAAAATGAACAAAAGCAGTTTGCA
AACAGTATTATGATAATCCACCGCAGTACCAAACACAACTTAAGTTTAGT
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GGAGATGCTTGGGTTTGATTCAAAGTGAATAATGCTTGTAAATAGCTCAA
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TACATTTCTCTGTTGACAGAAAGAGTGCCAAAAATACTACAGTACAATGT
TTTTTTTTTACCAAAAATACTTCCTTAACTGTTGCAATATCATGTAAATT
TTTTCAGGCTGACTTACCTAAATCTGTAAACGAGTTCATGGAATTTCTAG
CATGTTTTTCCCGGAGCTTTCTTTCTTCAAATAGGAATGTACATGCTGGT
GTCTCAGAACTACTTTATGGACAAGGTGGTTACTTTTCTGAGGTACATTC
TGCACTGTTTTTCTTAGCATTGCTTGATGTTATAATGCATACCATACGGT
GCATTATTATTTTTGATTATTTTTTCTTGAAAATTATAGATTTCCCCACC
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GTTACTGTCAGTCACATGAGCATATTTATTTTGTGGCATATTTTGATTCT
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TAAGGTCCATAAAATCATAAGTACTATCGCTGCAATAAGTTTGTGATTTC
TGATTATGCAAACTGTTCTTTTTTGTGCTGTAACAGCTGTACCAAAAGGT
CTGAAGAAGAGAAGGAGCAATTGCATGAACAACGTGGAACCTTAATGAGA
TCCCTCGTTTCAGCAATCAAAATTTCCTTTGTGACCAACGAGGCTATCGA
GGTAATTAAGTCGCTTGTCCTATACTTGTATTGAGTTTGAACAGAGACCA
TTTAGTCATTTATAGCTGGTAATCTGGTATTATGACATGCATTACAGAAC
CTCTGGATTCAGCCTGTTATTGTAGAGTGTCATCATTTTGTTGCATGTAT
AAATTATTAAATTATCATGAATAAACATATTTGTGTATTCTCCTATACCA
GTGCCATTTGTGAAGAATTGCTGTTAGATTACTGATTATTAATGCATTTT
GCTTTCATAGTCCAGAAGAGCTTGTTTTCTATCTGCCATTTCAAGTACAT
GGATAAAGCTTGATGAGCTCAATTTTTTGATGTCTTCTATCGGTAACATT
GGTGTAACACTTTATAATGTTGGACATCTTGAAAAGGTACCCTTCTGAGG
TGTTGGTTTATTACTTAAATTTGCTTTTAACTATTGACGTATACGATTGA
CCATTGTAACTGCTTCAGGCACCGAAGGCATTAGAACTATGCTGTCAAGC
AACGTGGGCACACACCACACTTTCTTACTGTAGACTATCAGGAAGAATGG
AAGGTCACATCATTACTGAGGATCTTCCAAAGGATACACTGAAGAATATC
ATTACGGATGCTTTTGCAAGGATAGCAAAGATGGTTGACATTCTCCATAG
ATGTGGCTCAAAAGTGATTCGCGATGTTGTTGTGAAGAGCCTGTCTGAAT
TGTTGGCTTATGGTGACACATCTGATTATCACAAGAGCTATTTGGTTCTG
ATCAAGTTATGGGTGAAGGTATTGACATAAAAAACTATAGAAACAATCGC
GCTTAAAACACTTTGTTGATATGGTTTCATTTATTTTCTTATGCAAACTT
TAGATAACAGTTAAAGATTTTGAGAAAGAACAACATGTGGATAGTGCTCC
ACTTCTTTATCAATCTCTTGTGGGCTACCCGTCTCCCTTGCCAAAGAAGT
CAATTGGCTTAATCTTAGAGCAGGTATAGGATTATATTTTGTTAAGATCA
ATAACAATGGTGTATCTGTATTTTGATCTCATTCTGATGCAAAGTGCTTT
GGACGTGCACCGTTTTTTGCAGGAATTATTAGCATATGGAGCAATGGAGT
CTCGTGCCGCCATGCTCTGTGCAAATATGCAAAATAGGATTATAGATATC
CTCTTGAATGAAATATATTGTTCAAAAGAATATTATCTGGACAGATCAAA
GATGTTAGTTAGGAAGGCACGTGCACTCCGTGCATCTGGGGTGCAAAACA
TAAGCAGCTGTCTCAAGTCCTTGTCTGAAGCCATATCTTTACTGGTGAGC
CCCCCACTCCCCTTCCTGTCATGTTTTCTTATGTATAACAGAAGGGAGAT
CTAAGATCCATTTCATCCCTCGAACTAGCGAGACATCTTATTGGATTCAT
CTCAAGGCAATGCGATTGTGATCCATGAATTGACTATTGCGTACTGCTTG
CATGCACAATGTGCCCAAGAAGCCAATCATGACGACAAGGTAATTGCTTC
ATATGAATTGCTTGTGTAGTCACTTGTGTATTAGCTATAGCATGCCTCTT
GATTTCTCATGGTTATTTGTTTCTTCAAACAGGTAATCTTTGAGAATAGG
AGTGCTGAACAGGTAATTTTTGAGAATGCTAGGAGTGCTGTTGGCTTGTG
GTCAAAGATGGGTACTTTGCATCATTGTTCTCCTGGTGTTATCTTTCAGA
AGCCATCAGAAACTCTTGTACCACTTCTTTGTTCTCTGGTTGATTTGTTG
GCGATGAAGGTAAGGCCATGCGAAAACTTATTAGGTCCGATAAGATGCAG
CTGCTGGCCTTTAGCAAGATAATCATGTGTTTTTTACTTTATACCAGGGC
TGCTTTGAGCTTCAGTTTGAGCTATGCAAGCTTATGATAATGATATGGAA
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GGCGCCTTAATCATGCATGCTGTCATCTCCCAATGGACCAGAAACTTGTT
TCTTATGTGGCACAGCATCTTGGTGTCGATTGCCACAATAGGATATTTTG
GAGAAACTGTTTCAAAGGAGATTATCCTTCCCTTATTATCTTTCTTCAGC
GCTTGTGGCCTGTTGATTTCTTTTCTCAATCATGCGAACACTCCATTGGA
AATGAGTTTGGTTTTAGTGCTAGTGTTGATGAGATTGATAAAGTTGCATC
ATCTCTGGCTTCTGAAGTAAGCTCTTTTACTTGCATGGTGGTAACACAGT
ATGCATTGTCTTTTTGGTTTTTATGCATCTTGTATTGTTTGATTTTGCAG
GTTCCTTCAAGTAGTCAATCAACATATCTCGCTGGCTGTATATACTATGA
TTTGTCAGAAAGACTTCTGTCAAGTGGACAAGTTCTCCAAGTAATCGGCT
TCTATCATCAGTTTACCTTGGTGGAAAATCTCCAGTTATTATGAAACTTG
TTTGACTGGAGCTGCTTTATAGTTTAGCCTCCCTGTAATTGGAACACCCT
TTGTTTTTATTTTTGCAGGCCATTTCATATGGAAGAGAAGCCCTCCAACT
GCGCAAGAAACTACTAAAAAAGAAGTTCAAATTTAATTTGGGCAAGTTTG
TAGGCCGGGAAAGCCAATGTTCTGGTGGGCAAGGCTTTGTTTCACTTGAA
GCATGGGGACCAACGATGGCTGAAATCTGGCCAGATTGTACAAGGCCAAG
CAGCATGAGAGATTCTTTCCTCACCCCATGGAATGTACTTAGATGTTATC
TTGAAAGCATATTACAGGTATGTCAATAGTGTGGCATGCGTTAATTTCAG
TACCAGCAAAATGATTGAAAGAGTTGGTGGAATATGTGTACCACCATAGC
CACCTATCACGTGGTAATATGAGTCCAACCTACCTATGAGTGAACCACCA
TAGCCACCTATTACGTGGTAATATGAGTCCAACCTACCTATGAGTGAACC
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ATGGCTTGTGTTGACACTGCTCTGTCTGTTGGCAGTATCACAATCATTTC
CATAGTGTAAACCTGGCTTCAAGTAGGCTACAGACATTCTCATATTATTC
ATGTTTTTCATTATGTAATCAGGTTTCTGTGATGCATGAATTGATTGGCG
ATGGTGCTGAAGCGGAAATTTTATTACAGACAGGAAAGGAGATATCATGT
TCCCAAGGATTACCAATTTTTGCTGTTAATTTTACATCAGTATTAGGTAT
GTACATCTATTGATGATCTATCTATTACTTGATTGTTCATTTGTTCATGT
GTCCATTTGGTCTAATGTTTTAGGTCAACTATATTGCAAGAGACAGCTAT
GGGATGCCGCAGATGGTGAACTTAAACATGCTAGGAAACTCCTTGCAGAT
AATACTGAATTCATTTCATGCAAGACATGCAAGTCAACTCTAGAGATATC
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TCTTCCATGGAGAAATTGAACAACACCGGTTTTGAATTTTCTGCTGGATC
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CAGAAACCAAGTGTGGAACTTGTAATCAAGGGAAAGAACCTTTAGTAACC
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TATTGACCAGTACGATGAACTTGTGGGATTACAATCTGAAAGGGAAAACT
TGAAGGATGCCAAAAGTGTTCCACCATTGGATAAAGTTAAGAGGACGTCA
AGAACTTCATCACGTTTAGCCAAAGAACAGAATGTGGCAGCTCATGCAAA
GACTAGAACCACCCGATCTAGTAAGCGAACTGCACATGTGAAAAGTGAAA
AAAATTTAGTTGAACTAAATAGCAAAAATGAGATATCTTGCAGTAATGAA
TTGTCCATAGAGGCTTTAGTCTATGGGAAGGTAAACTGTTCTCTTGATGG
TGTTGACCGCAGCAGAGATGACGTATGCAATATGTTTGGGTGTTGGAACT
GCCTTTTTGTTAATTCACTGAAATTTGAGTGCATTGAGAATATATTGCAA
TTAAAAAAGGACTGCATCCGTCGACGCCATCTTGTGTCGCTTCTGTTAAA
AACAGGTATCATTTTTGTTCATGATCTGTTATGTGCCAAATCAATCCATG
TTATACTGCAGTTATGAGACACACAATTGGGTGTTTTACATGGCTATTGA
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TAAGGTAGCCAAATTGTGCCTCGCCACAAAAGGTGTGGCCAACACAGTGG
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CCATGGAGTTAGAGAAGTGTGACGAGCCTCAACTGTGCCAGTGAAATAAA
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TATCCTTTAGCTTAAGTAGTTTGATCTAATTTCTTACTTCTGCGATTGGG
CTACCTGCTAATTATTACTTGGTTAGTTTCTTAATTCTTTTATATTGTTC
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AAAGCATGGAGCTCATGAAGTTCATAGTATCTACTTGCAGTGCATATCAT
TGTTGTATTTCAGATCTCTTCCTCAAGGTTGTTTTAAAACCTATGGGTCT
AATTTAATTGGGCTAATCACGAAAGAAAGTACTGGTGATTTTCTTTCTTT
AGAGCGTGCGGAAATACTATGCAGCATGAGTTTCTTTTCGCTGAAGGGTT
TCCTTTCAGAACAGTCGAGGTTTGTCGCATCAACTCCCAATCGTGCATCA
GTCACATGGATAACATTCTGATAGCAGCATTTCACTACCCTTGCTAAACT
GTCATCATCTGATCACTATCTGCAGGGATGGTTGCTGCATCTTCTATAGT
TTACAAATGTCTGATGTTGTTTCATGGTTGCTGAAAGCTTTTGTGCTATC
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GTGTTTTTGTTATTTTAAATGCTTAGTGCGTATGTACATTCTCCCTTTTT
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GAGAAGCATGTAACAAAATTCTTCCATGAGCTTCCTGATGTACCGATTGT
GTGCATTAGTATGCTTGGAGGTGATTTTGTGAATGTTCTTGGGGAAACAC
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TGGATCTCTTGCACTTTTTATGCACATGTTTATTGTTTGACAGAAGCACA
TAATGGAGACTCTCCTATCAAAGAACTGGATAATCCAACCGGAGGATCAG
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CCAACTTTCAAAAAGTTACTTGAGGATAACTTTAGATCCCTCTCGGGTGC
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ATAGAATGAAGCTTAACGACAACCTTGATGAGATACTTGAGTAAGATTTC
TTCTGTCTATTATGCCTAAGCTGTAAATGTTTGACGACGATACTCTAGAT
ATATCTTTCTCAAATATATTATTAAAATTTTGAGTTGTCATATATAATAG
AAATCCCATTTTAATAACCATTATTCCTTTGTTCTTATATATTGTTTGCT
GTTTTGAACAGAGACATGGAAAAATTGTGGCTAGGACCCTGGAAATGCCT
TCTCCTGGGCCACCAATTAGCTGACCACCTTAGCGAGGCAGTGCTGGGAA
ATCTAATCTCTGGTCTGGAGTCAGAATTTGATCTTGAAGTAGATCCAGCG
CTTATCAAGGCCATCCTTGGTGGGGTTGCATCAGTAGATGAATTGAACGA
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TCTTTTTAACTTTGCGTTATAAGTTTTGATAGATGTGCTTTACTGATTAG
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CAATTAGCATCGTAAGGCTAGATTTTTCATGGGTAAAGTTTAGTCATATT
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ACATCATTCTCAAAAGGATAGGTTCTACTTCTAGCTTTCTAGTATTGTTT
GTCTAGCAATATTGCCAATGACAGTTTTTTTATCCCCATCATATATTTTC
TTTAAACTCTGCTTATAATGGTTGAATGCAGATGCTTCCTTGGGAAAACT
TGCCTGCGTTAAGGAATCAAGAAATATACCGCATGCCATCAATACAAAGC
ATCTTTCTAGCATTGACTAGAAGCACTAATCATCACGAAGATGCCAGTGC
CATAGCCCCTCCTTTCCCTGTTATTGACCCTTTCGATGCCTTCTATCTGT
TGAATCCTAGTGGTGATTTGGTCAGCACACAAGAAGAATTTGATCAGTTG
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TATTGAGTGCTTATTCAAACAACCTTTATCTCACTGAATATTGCAAAAGA
ATAATAATTCTAATACATGTGTTGTATAAACAAATTCCTGGTTTGGCATG
CAAAAGTGGTACCTTACTGTTTTTTACATTCTAGAAATGGTAAATAAAAA
TAGCTGGAAATCTGGTGTAGCGTCCATCTTAGTGTATTGTCAGTTTTTCA
TGGCTCAGACGTGTATTAAGTTAGCATGTTACATATACTCCCTCTGTTTG
GGATTGTTAGTCCGGAGAGCCAATTTGGCAATACCAAGACGTGGGCTTGC
AAAACCGGAGTTATCTTGGGGAAGTTGTAGATTCCTATTAATTGCACCTT
AAAACTCTCCGGGTAATCAGGCAGCCGATCTCCTCTTCGTTCTTTCCTTT
TGCATCGCACGGCTGAAACAGATAGCGATCCGCGAGAACAATAACTCACC
AATCCAAGGCGAGGAAAAAGGACATGCATTGGGCCGTCCTCTGCATGCTC
CACCTACTTTGCTCGCACGAGAATTAACTCACACGGGAATTAAGGAAAAT
TAACTCTAAACAGGAATTAAGGAAAATTAACTCTAAACAGGAATTAAGGA
AAATTAATGGCCCAGCCTATAATCTCGAAATATCTGAAAACCCTCTCCGG
ACTAACAATCCCAAATCTCGAAATATCTGAAAACCCTCTCCGGACTAACA
ATCCCAAACAGAGGGAGTAGATGATACTACCTGCTAAAAAGCTTTTAGGT
TCTGTTTGGTTTTGTGCCCCAACTAGCCTTGCCAAAAGTTTATGTCTGCC
TATCATTTTTTGGTCATTGTTTGATTTGTAGCCAATATTTTGGTTGACAA
TGGATGTCCACCCCTTCCTCTCACATATTCTTGCCAAATAGTTGGCCAAA
TGAGGGTATAGGATTCCTTGGCCAAAAATTTGGCAAGCCAACCCTTGACA
AAGTAAGGGTAAGTATGGGCACCAACTAAACACACCCTTAACATCTGTCA
CGAGTAAATAGACCATGAATCCAAGAATCCATGAGTGAAGGATAATTTTG
ATTTTTCTAAAACAATCACCAGCATATAATTGTGATGCTTTGATGGTATG
CAGGGAAATGCCGGGAATGCTCCAACAGCTGAAGAGCTTGTCTTGGCCCT
GAGGAATCATGATCTTTTTCTATACTTTGGACATGGAAGTGGTAATGCAC
TATGCATATAGATACTGATTGTTTTGTCATTTCGTTGACTTTTGCATTTA
CTATGCTTGTGTCGGAGTCATTAGAACTTCCACGGCTTCAGCCTTTGAAA
CTATCTAAGTGTAGTGCACTACTACCATAATATCCACCTTACAGGATACA
AGTAATTAAGCACTTGCTAACAAACACTGTCTGATACCCCATTGTCTATT
ACAATCTGCTATCAGCATAGCTACCCGTGTGAATTTATTTTGTACGAAAT
ACTTACCCATCTTTACTGAAAGCTTCCACAGGAACATTAACTAGATGGCA
CCATAATTTTAGGCTATAAAACTTATCGCTTATAGTAGTAGTGGCATATG
TATCAGTAGAAACTACTGCTTGTGATGCTAGTGCCAACTAATGTCTCAAG
TATATGCTATTACTCTCTAGGAATATGAACTCCAACCACCAAGAAGTGTC
CAGTATCCAGATACTGCTCAGGTAGCTGTTGTACTAACACAGAGTGTTCT
AACTAGTCTTGAAAAAAATGTTGCAGGAAGTCAGTATGTATCTGGAAAGG
AAATTGAGAAGTTAGATAATTGTGCAGCTGCTCTTCTTATGGGCTGCAGC
AGTGGGACACTTCATTGCAAAGGAGGTTATGCTCCTCAAGGGGCACCTTT
GTCTTATTTATTTGCTGGTTCTCCTTCCGTCATTGCAAATCTCTGGGACG
TCTCAGATAAAGATATCGATCGATTTAGTAAAGCATTGCTCAATTCATGG
TTGCAAGAAAATTTTGCGGCCGGCAAGAATTGCTCTAAATGTTGTCCGCT
CACACAAGAATTTGAGTCCATGACCATCGCCATGAAGGATAATGGCAGGT
CAAGACGAAAAGGCACACGAGTTCAGAAGCAGCAACAGACAGTAGGGATA
GATGACAGTAGTAACTGCTGTAATTGCGGGCACAGGCGAATAGCTTCACA
TATAAGTGAAGCTAGGCGTGCTTGCAGGCTTCCGCTTATGATCGGCGCAT
CTCCTGTTTGTTATGGCGTGCCTACTGTCATCAGGAAGAAGTAAATGGTT
TTCTGAGCTTTGAACCATTGATTACAGTCGCATGTCACCGGCGGAAGTGC
CATGATAGGCATGTCATTGCACAGGCTCAAATGTGCTCATGACATGTTTA
TGCTGTTGTTTGTACTTAGCAGCAAATGCAGAACTAACAAGATGATGCTG
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TTCCGTCCATTCTTATGAGATTCAGTGCTTTGCCACACAAAGGTACATAT
GAGTAGAAGTTATTATTGTTATACATGTGCTTCAAATTGTAATTCTGAGC
ACAGATGTAATCTTATGTTCTGGGAAATCAGTAGCATGTAGAGCAAAGGA
GCCTTTCCAAAGACAATCGGTAATTGTTTGTATTGTTTTGTACACACTAC
AGTTCTGATTCTTCTTATTATATACTGGTTCATTTGTGTATCAATTCCTT
TTCTAAAACATGTTCTACATGTTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.