Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042881

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042881
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042881
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGGATCGACCGCCAGACACGATTGCGTGAAGCCGTGAAGTCCATCAC CAAGACGACGATCGACCACCTCGGCCTGCCTGCTGGTGCTGGTCCGCTCT CTGCGGGTTACACTTATCCTATTTTTTAGTTTTTAATTCTTATTAGTACC TGATTGTTGTTCTTATTTGTAGCGGGCAAGGTTAACTGATTATGGTGCCC GAATTATAACTGAACGAGATTGATATTTGATTCTATTGTCACGGACTTTG TTTTTAGGAATTTAAAATTTTAAGATATCATGTAAATATTGTTATTTTTG TATAAATATTATAGTTGAGAGTATACTTGAAATATTTATTTTTCGTCATC TCATATATACATAAAAAAATTATAATAAAAGATCCAAAATTTTAGTTTCG CTCCGGGCCCTCGAAATATCAGGACCGGCCCTGTTTGTTTTTCTACTCTA GGCGTGTAGATTGCCTGATTGCATTTCTTTCTTTTTTGACCAACTTATTT TCTATAAATGGTTGCATACAGCCTCTCCTTGTCATCCGTACCTGTAGCGT TACAATCTTCTGATTCCACGGGCAACTTGTTTGTTTATGAGATGATTCTT CATTTCATTCCAGAAGTTGTTCTAGCTGGGTGCTACAATTTTTTCAACTT TCGACTAAAATCATGTGCAAGATCTCATGTAACCATGCCCCATGCATGAA TCTGATCAACTTTTGAATAAAGTGAATCTTATGTATTCGCAATGACCAAA TTATTTTCTTATTTTTTTTCGAAATGGAGACTTAGCCCCGGTCTCTGCAT CGGTAGATGCATACGACCTTTTTATTAAATTTATTATAGTTAAAGTATTA CAAAGGATTATATCATGAATCACTTATATCATGAATCACACAGGGTTGAT ACATGTATCAACCATCTAAATAGAAAGGAGGACATAAAGTGGCTCTGCAT CAATATGATTACCTATAATCAAAACGTCAGTTGCACCGGTTGTATAAATC TCGTGCCACCGACTCTAGTTGACTGCATCCAGCATCCGTAGTCTCGCGCT GCTCCATAGATTGCAGGAAAGACCATAAACGGATCCAATAAGTAGCCTGT GGGATAACCTGCATGAAAGAAGTATTTTTTTGCTTTGTTAAAGATATAAT CATTTCATATGTTCCATATGGCCCAAAGAAGAGCACATACTCCAACTCGA ATTTGTACTTTATCTTTCTCAGGCACCCCCTTTAACCAATTACCAAACAA ATTATTAATACTAGTGGAAGGGGCTAAATTAAAAGCCATATATACAATAC GCCATACTACTTTTGCAAGGGGACAAGATAAAAACAAGTGTTGTATTGAT TCATCCTGAGAACAAAAACAACATTTCTTATATCCTTACCAATTTCTTTT TATCAAGTTGTCTTTCGTGAGAATTACTTTTCGTTGTAAGAACCACATAA AAATTCTTATTTTAAGTGGTACTTTTATTTTCCATATGTATTTTCGCAAG TATCTAGTATGATCATTCATGTGGTCAAGGTATAGCGATTTTACTGTGAA AGAACCAGAGATTGTTAGCTTCCAAACAAATAATTATTTTCTTATTATCC AGCGTGAGTTTACTTTTTATTGAAAATTAATATATCTTGTCAACTTAAAC GTTTGTTTAGTGTGCTAATGATTTTTATGTTAGTAAAATTACTTCTAATA GTTGGGATTTCAAAAAATCTAGTCGCCCGGAGAGTGGGCATACCCCATAT CACTAATCACAAGGGTCAAATGAATTATATGAACATGGTAGTAATAGTAT TGTAGTTGTTTGGAGTGAATTCTTTTGTTGACATAATAAAGTAAGATCTT GCGTCCAAGTCTTTGTCAAGACAAAGTCAACAATAAAGATGGGCAGCTAA TTGCGATAATAATGTTTTAGAAACAAGTTATTTCAAAGTTTTAGATCTAC CTATTAAACCGATGGTGTGTGTGCATGAGTTGAGAAAATATTCTCCGCAA TCCCCACCGTTTTTGTAGGAATGGACGCACTAGATGGGGTGTCGATTCAG AGCACTTTCGTGGACACTCGAATTTCCATATGCGTTCATTTCCCTTTTGT GGACAAAATACCATGACAACAGGTGGAGTGTGGGTTGTGCCACGAGTTGC ACGTATACAATTTCCCTTTTCTTTTCAACCACAGGCTGGCAAACACTGTA ATTGATCATACAATCTTGAGTGTTCTAATTCTTTTCCCGTGCCTTTATTT AGATCCTAATTCTTTAAAAGTTTTCCGTGCCTTCGCTTAGGTCCTAATTC TTTGAAATAGGAATTCTAGATCCCAAATCTTTCAGCATTCGCAGTCGGGA TCCCCTCGCCGGCATCCCCATCGTGGCACACTCCAGCAGCCATGATCCCT CCGCATAGCACCATGGTCCTCACCATCCCCTCCGCAATGCATCCCCGCCG CAGCGCACACCCCACAACCGGGATTCCCTTTGCAAAACACCCATGTCGTC GGTATCCCCTCCATAGTGTGTGCCCTTCGCCGAGCTTCCTTCTGCAGCGT TCCCACGTACAATGCACTACTGTCGTCGTCGCCATGGCACGTGCACCGGG AGTCCACCCGCGCTGCCACGGAGTCCAATCCACCACACCATAACTCTCTC CTGCTCGTGCCGACGAGGTCCCTAGAGCGTTGGACCGTTGGTTCTACCTC ACCACGCGGGGTTGAGGACGGGATGGTGCCACACATAGGAGTCAGGAAAG ACAAGGATGAGTGAGGTGCTAGGTGGGGCTGGATGGGCCAAATCCAACTC CACGGGGACGGAGTTTTGGAAGAAATATAATTTTGAAGGGCTATTTGCAA ATATGCTGGGTGGCCGGTATGCCTCATGGTCCTTGTTGTCGACGTGGCAT TGGTTAACGTGTGTAAAACCGGTTTAGGACCTCGCATGGCTCGGTTGTAA AAGATTTAGGACCTAGCTGATGTGCAATTTTGAGTTGGCGTGGTGTCGGT TAACATGAGTCAAACCAGTTTAAAACCTAACATGAATTAATTCTAAAAAA ATAGGATGTGCAAGTTTAAAGAATTAAGGGCTTGTTTGATTCATAGGAAT TGCATAGGAATTGTGTAGGATTTGAATCCTATGGGAATTTTTCCTATGTC ATTGTTTGATTCATAGGAACACATCTTATAGGAATTAATCCTATAGGAAT CTTGTAGTGCAATTCCTATAGGAAAGAAACATTAGATCATACCTCATGAA AAAATTCCTTTGCTATATCAAACAAAATTCCTATTCCCATAGGATTCAAG TTGGCATGACATCTCAATCCTATGTTTTTTCTATTCCTATGCTTTTTCTT TCCTATGAAATCAAACAAGCCCTAAGACATAAAAATAAGTAAAGACACGT AAAAAAATTAGGACCATCTTTATAATTTAATGTTCGAGATGAGAATGAGA TAAGTACAAAGATGAGACGACAAACGTGCAATGATCAGATGCACATGTGC CTTGGCGCCATTTCTTAATAGAGTACACATATACCCACAAGAAAAGGTAA AGGTGTACTATATTAATTCCTACCGCTTTCACGTTTGACACGGGCCCAGC TGCCAGCGACCCGCCGCGCGCCTTATTTATACGACACGGTCACGAGCACG CGGCGACATCGCCGGCCAGACTGCCCAACCCGACCGACCCAGCACAGCCC ACACGGCTCCTCCTCCTCCTACTCCCACAGACAGACATCCACCCGCGCAT CATCTCGTCGCTCGCTCGCTCGCTCGGGCGCTCCGCCGATCCGCTCCTCG TCGCCATGGACGAAGCCAAGGGTACGCCGCTCTCAACGCTTGGCCTCCTG GCGCGTTAGCTCCGCCATCGTGTTGCGGAGTTCTGTGATCCGCGATTCTC TGTCGATCCTGCTCCGGATTCGCGTCTGTCGATCTCGTTTTCCTTTCCAA GGAAGCCAGGCGGCTCGAGATCCGACGAGTGTGGGTACCGTACCTTTGCG GGTTCCGAGTGGGGGAATACATCTGTGTTGTTCCCCCAGAAATGGGTGGA GCTTTAGGATCAACCAATCGCTGCACCGAAGATGCGCTTCCCAGCCTATG CTTGGGTTCAGTTAGAGGAGGGGTGGATGTGGATGGGATTTAATTTCTTC TTTTGGGCACAGTTTTGTTCTTTCTCGTCAGTACCACTGTTGGCACTTGC CCAAAACAGGGGAGCAATGGTGCCGATAAAAGCAGAGGTGAGACCTGCAT TTGGCAGAACGGGGAATCCTGCTAGTCTTTGTGGACGATGCAGACTATAC CGATCCTAGAGTAGGCCATACGTGTGGCAACGGCCCATGGGAGTGAAACA CTGTCTGGATAGTAGGTGCTTCTATTGTAGATTGCCGTTCTATTTAACCT GTGACTAAAATCATGTGCGACATCTCATGGAACCGTGCCTCATGAATCAT CTTCTCCGTTCTTTTCTAGTTATGGAGGCCATGGGTGGGGGAATACAGCT GTTCTGTTCCAAAAATGAGTGAGGCTGGGAGTGGGTTAGGATCAAGCACT GCACTGAAGATGCGCTTACCAGCCTATATATAGGTTCAGTTAGAGGCTGG GTGTGATTTAGTTCAGTTAGGTGCTCGGTGTAGTTTGATTGTGTCGAGTG TTCTTCCATCTGGGCACATTTATGATCTTTCTGATCACTACAAAAACTGT TCTGGCCCGATTGTCAGTGCGAATCCTTTGTTTAGCACTTGCCCAAAACA GGGCAAATGGTAATAACAAATAAAAGCAGAGCACAAACAGGGTTCTGCAC TCGTGAAAACTGGGAATTCTTGGAATTTCTATGAACGGTGCAGGCTATAC ACGATCATTATAGAGTAGGTACACGAGTCAATGGCCCATGGGAGTGAAAC AATGTCACGATATGTGAAGTTTGTTGTGCTTCTGTTGTAGGTGTGTAGAC TGCCTGATTCTGTTCCTCTTTTTCTTTCACTAATGTAACTTCCTGAACTG GTTTCATACAGCCTTCACTTGTCCTCCATGGCAGTGTCGTTTACAATCTT CTGAGTCCATGGGCATCTTGTTTGTTTACGAGATGATTTTTCATTACATT TCATTAGTTGTTCTAGCTGGGTGCTACACTTTTTAACTTTTGGCTAAAAT CATGTGCAAGGTCTCATGTAACTGTGCCTCATGAATTATCTTCCTTCATT CTTGTGTAGTTGTGGAGACCAAGGATGGAACCATCGCAGTTGCTTCTGCA TTTCCTGGTCATCAGGAAGGTACCAGTGATTAGCTTCCGTTTGCTCTCTC TACTTCTTACTGCACTACATGACAGGGATTTGCTATTTTCTGACTGTTCA AGAAAGACTAACTTGCTGTATTAAACAGCTGTCCAAGACAGGGATCACAA GTTTTTATCAAAAGCTGTGGAAGAAGCTTACCGAGGAGTCGACTGTGGCC ATGGAGGCCCATTTGGTGCAGTAGTTGTCCGCAATGACGAAGTGATAGTT AGTTGCCATAACATGGTTCTGAATTACACTGATCCAACTGCACATGCTGA AGTAACTGCAATAAGAGAGGTAGGTTGCCATTGCATAGAGGCTATTCTCC GCAACTACTTGGTGCTTAATATTTTCCTGTAGTAGCCTCACCTCCCTATA GGTTGTACCCAATTTATGTTTCATGCTTTTCGAACCAGTACCATTTTCTT CTTGCAAAACATATTACATGTTGTGTTCACCTGTCTACACACATAACTAA TATGGCATATTCTAGTACATTCTTCATCTTCAGATGTTCCTGACTCTTGT ATTGGTACCGATATCATCTCATACTACTAATTCAAACATGTCCACACACA CAACTGAGAATCAGGAGTATTACACTATCATCTCGTACTACTAATTCAAA CATGTCTACATACTTGGTGCTTGCTGTTCACATTTTGATACTTCATATTT CTTGTAGTAGCATCATCTGTTGATATAGGTTGTACCTGATTTGCACTTCA TGCTTTTCGAACTAAGTGTCACTGCCTTCTTGCAAAGCTTTTGGAACCAG TACCACTTTCTTCTTGCAAAGGGTATTATCCGTTTTGTTCACCTGTCTAC ATAGATGAGATGGCATATATGTTCCAATCTCTTTGCTTATTCTTGTACAT GCTTATGTTGTAGGTTATTCCTGATTTTTGTATTAGTACTGATATTATGT TGTACAGTATCACATTATCAAATTAAGCAACTTTAGTGTCTAAAAAAATT AAGCTACTTCAGGGTAACTAGATAAGGTTGATTATTCCAATACGGAGGTA AGAGATGCAGATAAACTTTACTAGTATAAAGTATATTAGTTCAGTACACT AAAGATAGGTCTAAGTTCCTTAATGATGCAATAAACTCTACCAGCATAAT AATGTTTTATTTTCCATCAGATGAGTAAATGATGAATAACGTATCATTGA TAGTTTTGCATTTTATATTAGATCCTTTTCACTTTTTGGTTGTCTGTCCC ACTAACCAATGTCTCGCTTTTACTCTACTAGGCTTGCAAAAAGCTTGGGA AAATTGAGCTGTCGGATTGCGAAATGTATGCATCATGTGAACCTTGCCCA ATGTGCTTTGGTGCTGTCCATCTCTCTCGGATCAAGGTTCACTCCTTAGC CCTTACCTTACCATTCTTCATCTGGTAGAATATAATATTGCTGAAAAACT TTGGAGGTTTCAGGATACCGAAAGAACTGTCATGCGCAAAGTTCATTTCA GTATTATATTGCATCAATTTGGAATCTAAAACCAGGTGAAGATAGGAAAC AAAATGATACCATCGCAATCAGTAGATATTTTAAGGCAGCCACTCAATAT ACACAACAACTTTTTATAATTTAATAAACACAAAGAATTAGAGAAGGCAA ACCACGATGACAGACCTCTTCACCAGAAATGGGATCAGTAACAGGTTCCC CTGCAGGTGCTTGATTGAAAAGCATATTTCCCTGTGTAGATCGGAAAAGC ATCCTCTCAAAAGCCAATTCCTTGGACTTCAGTATTATCCCACTAACAAA CCTAACACCAGATTCCAATGCCCCTTGATGTATACCCTTAAAATATTTGT GTTACAATTCAATGGAAGAACACAACAATATTAACTTTAAGGATAAGAAC TAAGATAATACCTGTTCAAGCAAATAGCCATTTCCCCCATACACTTCCTT GTCATATATGTGTTCATCTAACTCCTGGTCAACTGGAGCTGCATGATTTT GAGAAGCAGGGAGGATGCCACCTGCCTACAAGAAGTAATTTGAGGAAGCA TGGAAAAGCAACAGATATTATTTAAAGCATAGTGAATATTCAACTGACAT ATCATAATACATATGGTAGGAATTCATAATCGCCAACCAGTTACACTTTA TAATTTAAACCACATAGTCTCCAGTCGTCAGCTGCAGACAGCAAATATTC TTTGTGAATTACAACACTTTCCAGAAAACAGTACCCAAGGGCTATCACTA GAAGGTGTTGCAAATACACTAGTGTAAATCATTATCTTCCACCTTAACAG TCACAAGAAAATGCATGGAACAATTAATTCCATGTTTCAGAAGAATTGAG AACAACCTTTGACATGACCAGCTTGAATTCGAAAAGTTCGTTGTACGTCT GTTGTAATGTCCCACTATTACTATTCATCTCAAGCAGCTCATGCTCATTC TCACCCAATTTTGCCTTGAGAAACAATAAAAGCAGAAACTCATTTTCCTT AAAAACAAACTAAATATTTCCCCTCAAAATTATTACTTGTTGCATAAATA ACAGAATCCAGAAGGAATACTACCTCCGTTCCAATGAATAAGGCGCCCTC GTTTTGCATGATTTTTTTTGACCAAGATTTACTCTAAATATACAAAGAAT GTTGGTACAAAATTAGCATCATTGGAAAGTGTGTTTCAATACGAATCCAA CGATACTAATTTTACATAATATAATCAAATTTTAGTTGTTCTATTTACTC GGTCAAACTTTGCATTGGAATCCGTGTACGCCTTATTCTTTAAAACGGAG GGAGTACTTCTAGTTTTGTTATAAAATGGAAAGGCTAATGTACCTCTAGC TCCTCCAAATCAATCTCAGGTTGTTCTGCAGGCCGGCAGAAGATTTAACA CATGCCTGATTTGATCACTAAAAAACTTTAGCTTCCGTGACATTTCTGCA CACCGCTTTACCTAGCGGGGGGCGGGGGTCATCCTTAATTAATAAATCTT GTTGAATGCTGCCATGCAGAGGCTGGTGTATGGAGCCAAGGCAGAAGCTG CTATCGCCATTGGATTTGATGATTTCATCGCTGATGCTCTGAGAGGAACT GGATTCTACCAGAAAGCCAACATGGAGATAAAGCGTGCAGATGGCAACGG AGCCCTGCTTGCTGAGCAAGTATTTGAGAACACTAAGGAGAAATTTCGAA TGTACTAATGTGTCAGTTTAGACATGGTGGGATTTGAAATCGCATGAGCC CC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.