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GrainGenes Sequence Report: AA041669

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Sequence
AA041669
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041669
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCTGCGGCAGGCAAGCCCCTGGACAACTTGGATGTGGTCTCATATAT
CCTTGCAGGTCTTGATGATGAGTATGATGGATTTGTTGCTGCAATCACAG
CCTTGATCAAGGCGGAAACCAATGTGAGTTTGAGTGTTGTCTACTCACAG
TTTATGTCGTATGAGGCTTGGTTGGAGTCTAGAAAATCTGGTGATGGAAC
GTCAGTTAACACGGTGACTCGTGGCAGCCGTGGAGGTGGTCGTGGACGTG
GAAGCTATCAAGACCAGTATCGTGATCATAGAGCTGAGTATGACCAGCGT
GGTGGCTATGATCGTGGTGGCTATGAGCGTGGTGGATATGAACAATGCAA
TAATTATCATGGTGGAGGCCGCGGCAATGGTGGCCGCAATTCTGAGCGCA
ATGGTGGCCGAAGCAACGTGTCAAGTGTGTGGCAAGGTGAGCCATATAGC
ATTAAACTGCTGGAAGCGTTTTCAGAAAAGTTACCATGGTCCAGAAAAGT
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GTGTGATCGCTACAATGCAAATGAACAAATTCACACAACCAGCGGTTCAG
GTATGAATATATGTCATATTGGTAATTCCGTAATTCATACCCCTCATCAT
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CACATCAACAAAACGGCCCGGCTGAACGTACATATTGTTGAAGTTGGATT
GTCTCTTCTTGCCTATGCATCTATGCCTCTTAAGTATTGGGATGAAGCGT
TTCTCACTACTGTCTATTTAATTAATCGCCTTCCTAGTCGGGTCATTGAT
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GTCGCAAGCTAAAGTTTGAATTTAAACAGTCTTGGATATATTAGCCTTCA
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GTGACATCGTCTTTGACGAGTCCGTTTTTCCTTTTTCCGAGCTTCGCTCT
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ATCTGCTGCTAATACTCCTGAGTTTGCTACAGGATCTACGGGATCTTCTA
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GATTCGATATGACCATATTCGTTTTGCCAATCTTTGCAGTACTGGTGAAT
CAACAGATACGCGAGAGGCTCTTGCCGATCCTAAGTGGAAGGCTGCTATG
GATGAGGAGTACTCGACGCTGCTCAAAAATAATACTTGGCATCTTGTTCC
GCCAATGTTGCTAAAAATATGGTTGATTGCAAATGGATTTATAAAATCAA
GAAGCGAGCCGATGGATCCGTGGAGCGTTTTAAGGCTCGTTTGGTTGCTA
AGGGATTTAAGCAACGATATGGTATTGACTACGAAGATACCTTTAGTCCG
GTGGTCAAGGCAGCTACTATTCGACTAGTTTTGTCTCGTATCGTGGATGG
CACCTTCGCCAGCTAGATGTGAAGAACGTGTTTTTACATGGTGTTCTATA
AGAAGAGGTCTACATGGAGCAATCTCCTAGATATGAGGAGAGTGCTCATC
TGGGATATGTGTGTAAACTGGATAAAGCCTTGTATGGGTTAAAGCAAGCG
CCTCGGGCTTGGTATTCCCGTCTCAGTTCTAAACTTCAATCTCTTGGTTT
TTCTACATCCAAGGCTGATACTTCTCTGTTTTTATACAACAAAGGGGGGG
TGTCTACATTTATGCTCATCTATGTTGATGATATTGTTGTTGCTAGCTCC
TTAGAGAAGGTTGTCGATGCTCTCCTTCATGATCTTGGCATGGATTTTGC
TTTCAAGGATTTGGGTGATCTACATTATTTTCTTGGCATTGAAGTGAAGA
AGGTGCATGACGGTATTATTCTTACACAAGAGCAATATGCCAATGAATTG
CTTGAACGGGTAAATATGACAAAATGCAAAGCGGTTGATACTCCTCTTTC
AGTGTCTGAAAAATTGTCTCTAGTTGATGGTGATATTCTGAGTAGTGAAG
ATTCGACTCGATACAGGAGCATTGTTGGAGCTTTGCAATATATTACGTTG
ACTCGGCCTGATATAGTGTTTTCCGTAAACAAAGTACGTCAGATTTTGCA
TGCATCTACTACAGTTCATTGGACGGCTGTGAAGCGGATTTTACGGTATC
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ACGGTTAGTGCATTTTCTGATACTGACTGGGCTGGTTGTCCTAATGACAG
GAGGTCCACAAGTGGCTTTGCAGTATTTTTGGGATCCAACTTGATTTTAT
GGAGTGCACGCAAGCAGCCTACCGTTTCTCGGTCCAGTACAGAGGCAAAG
TATAAGGCTCTTGCTAATGCTACAGCAGAAATTATATGGGTGCAATGTTT
ACTCACTGAATTGGGCGTGTCACGGCCAGAAAGGGCATGTTTGTGGTGTG
ATAATATTGGAGCTACATATCTTTCTGCTAATCCAGTGTTTTATGCTCGA
ACCAAACACATTGAAGTGGATTGTTCGAGAGAGAGTGGCTCAGAAGCTGT
TAGACATACGGTTTGTTCCTTCCGGAGATCAGGTGGCTGATAGATTTACA
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AGATAAGTTATGATTGAGAAGGAGTGTTAGGACTCCTTGAGTCGGTTACA
TGTGTGAAACATATTGTAACTTGTATGTCTTGGCTTAATATAAATACCCG
TGCGTCCCTGGTTTTGGGGTACATCACAACCCATACGATTGATATCTTCT
TCCATTTCCTACTTTTAGCCTAGAGGGTAGTCCAGGAAGCCAAACAATCA
TCGCGATGGGTGGCTCGGACAGTCTAGCACTCTAGCTACTGACACCTTCC
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CGCGCCGACCCAAACGGCTGACCGAAATGCGTACAGCGGTGCGACTCATC
TGTCTACGATTGGCGAATAGGCCATCACCAACGTCGACATACTTCCAGTG
TGTTTCCGCCGGCATCCCGCCTTTTTTTTACGCCGCTTACTGTACCGCCG
GTTCTGAGCGTTTTCCGCCGCATTCAGACGTAACCATAAAAAGGGAGCCT
AGACAAGATAGCCACAACCAGATCCCCCAACCACCGCCACCACAAATCAC
CATGTATGGCCATCCGCGTCGCCGCACGGACCTCCGTGGCAATGATATCT
GCACAGAAGAGCCCGGGCGCCCGCTGCCCTCGTGGTGGCCAAACCCGCCG
AAGTTACCGAACGTGCTGCCACCTCTGATTCTGAGGCGCCCGTGGATTTA
TAGGATGTGTCCCAGGCCGTTGCGCCCTTTATACAACCGCCATAGGACCA
CCGGCGAGCCTTTCACGTTGGAGGTGGCGGAACACGTCTTTCTGCTGGAG
CACCGGCGATGGGACGCGCTCGCATTGGTGCGTGGTGACCTCCAGGAAGC
GGTGCAGACCAATCTCGACGACGCTTCCCTGCGTGCCTACCTCGCTCGAG
CTGAAGAGAGACGCAGACGCATGATGCGATTATCTGGTCTCTCAATGACG
AATGGTGTTTATAAAACCCGTCGCTACCGCCGCCCCCAACGCCGTAGGAG
GCGCATAGTTATAGGGGTGGTTTGCTTGTAAAAAAGTTTCTTGGCTTCAA
TAAAGATTTTCATTTCCAATGGTTGTTGCCCACATTGTTACATCATACAT
GGCGAGTGCACAACCTAGCCTACTCGTCGAAGTCGGAGTCGGAGTCGGAG
TCGGAGTCGGAGTCGGATATGGAGTGGTAGCAGCGATGGCACATGGTGTT
GTCGAATACGCTGACGCCAAGCATCCCTTCATCATCGTACTTGAAGACGA
CGATGTTGCCCACTTTGATCTGGTGCGCTCAGGCGAACTCCTCCCAGCCA
TTGGTGAGGTACATCTGGCCGAGGTGGTCGAACAGCACCTCCACTGGTAC
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CAGGCGATGACGGTGTTGAGGGAGAGCGTGGTGGCGCGCTGCTTTGGCCG
CATCCTCGGCGCCTCCCTTGGCATCCACAGCCGGGACCTGATGGTCGTCC
TAGACGCCCTCCCCTCGATCCAATGCCGTCGACCATGGCTACCTACCGAT
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TAGTCGTTGACCTAACACCAATAAAACACCGTTCACTAGTATTACATCCC
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TTGACTTTATTGAAGAGCTTTAGCTTTTGATGATGATTCCTAGAGCAGGG
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GTTTGATGCACTATATCTACAGCCACAGACCTTAGGTCGTAGGCAATGCA
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TCCGTCAGCCTTCACGGGTTTACCAAAACCTTCATGGGGTTCCTTTCCCG
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GCACAACCGGGCGATCTTTACCGTCCACACTTCCTATGGTGTGGGGGCCA
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AAGAATCACTGGCGACATTGGTTGTTAAGTCCTAGGTAATATGTTCCTTT
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TGAGCAAGTGTGAACTTGCCTTTTGTTATTGCAAGATTATGCACTCATGG
TCTTCGAGACGATATAAGATCCAATATCTGAAATCTGCATCATTGGTCCG
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GTGAATTCAAGTGATTCTTTCAGATTTGGTTTATCTTCAAATTTTACTTT
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TAAGTATAGTATAAGATGATGTGATTATGGTGAATTTTCATGTGGTGATT
ATGATATAAGTCCTTGGGATTGAGTTGTTAAGAGTTGAAGAACTTATTAT
GAGATTATTGTTTAAAGTGGCAAAAAGAATAACATTTGAAGAAAATATTT
CCTTCCTAAGGTTTAAACAACCCCGATAGGTTATAGAATATGATTGATAG
AATGTGATTGATGTTGTTTATGCTTGCTTGAATAGTTTGGACTTGAGATG
CATTATGTCTTAATTGAAATGGACCAAAGTTAACTATAAAAACATAAGTA
GTTCTTAGACATAATGTTTATAAGCTTTTGAGACTAAAGTTAACTTTAAA
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ATTTATGATAGGTATAACTAAGGTGTGGAATTATTCACTTTCTATTTAAG
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GTTATGTTAATAGTGGTTAAGGTATAATGATCATTCACCATATTATATAA
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AAGAATATTTTAAAGTTAAAAGTTATACTTAAGTTTGATGATGAATTCAA
GTTATGGGTTTGGAATTGGTACTAAGTCACTAATTGCTCAAGGTTTTCTA
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ATAGGTATTAGGTAAGGATTTATTATTTAAAATATTAAAGACTTTCCTAA
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AATGAATTTTTATTTATTTTTAAGTATTATCTTTATTTTTATAAAATTCC
TCAAAAAATTAAGTGTTTTTAAATATTTGCTTTATGTTTTATTTGTAAAA
TTTTGAGTTAGTATTTCTATTAGATAAGAGATTTATTTGTATGCATGAAA
GTGATTTTTATTTATTTTTAGGAATTTTTTCTAAATTTATTAAATTTCAT
TTATTCATTTAAGGTTGTTAATGTTTATCTACATTTTATTAACCTTAAAT
AAATATGATTATATTTTTCTTAGGTGGAGATTATTCTTATAAGCATTTAG
ATGTACTCAATATATTTTTAGGTTTTTTCCTACATTTTCTAGATATAAAA
TAGTGTTCAGGGGTGTTTTGGTCATTACTTTATTTTAGCTTTATCTTATG
CCCCTTTTTTTATTTTTGTCTGTTTGGTTGGTAACAAGAACGGCCCGGCC
CGGCCCAGTCCTGGCTCGGGGTCAACACGACCCCGGCCCCTTCACCCTCC
TCGCTCACATCTTGCTCCTAGGACAAACCCGAGCCTCCCCTCTGCGGCGC
CCACTGCCGACGCTCGCCAAATCCCGGCACACATCGGTTGCTGCGGCCAC
CGCCGCCAGCCACCCTAGCTCCGCCCATATCAGACCTACTCATCCCTCCA
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GTTCTAGGGTTCTTACTGCCCAAGGCTCTAAAGGTTGATGTTACCTTCAT
TGGTTTGTGGTGGTGCCCTAGTGATGCGGAGAGGGCCTGGTGGTGGTGTG
TTCGTGGTCGTTGGCCATAGCCGCTTGCGGTGATGAGCAGGTGTTTTGTC
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TGCTACATAGCTTTCTCACTGAATTTGGCTTGTAAATTTATCTATTTGTA
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TAGGAATAGTAGTGATATTGCTCCTATCCACCCTGTTAATGATATGATCC
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TAGAATGATGGGTGTAACTTTGATACTGATTTGGAGCCTCGGAAAAGGAT
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GATTTTTCTACTAGGAAAATGATATGTGTTGATTGGATTGCCATTGTTGC
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CTTAATGATCTCTGTCAGGTGTGGCTTAATAATAGACAGTGCTACATTCA
CTGTATTTTCTGAATCAAATGTCTAATATGATTCCTAGATTCCTTTAGGA
AAATGATTATCTGATTCTTAGTAGATATGGATGAACCTGTTGATATAGAG
GTTCTCCCCAGATGGGATATGCCCTGTACCAGCAATGTGGTGAGTATAGA
TCTAGTTAGAACTAGATCTATTGGTCTATGATGCTGGTCTGAGACTGTGC
TAAGTAGAAACTAATGTTTTTACTTACTGCTTTCTTTCTTAAATGATGAA
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ATTATTCTAAGAATTATGTGTATCTAGTTATAAAACTAGAGCTTTTAATC
TAAGATCTGTGATGCAAGGCTGAGATTTGATTGTGGTTTGTAAAGATTTA
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TCGGTGATGTAGCTATGATGATTGCTCTTGCTAGCTTGATCCTGAAGTGG
TGATCACTCCCTGGACCTTGTTCTCCACCTATTGGTGCTTCTCCAGCTCC
TCCTTACTCTTGCTAATAGCTGTTTGCCCTTGCTATCCTCCTGTTGTAGT
TGGTACTTGATTACTTGATATCCAATCTTGTGGATGTTGCTCCTGGTACA
GCTGACCTCCTCCTCCTTATTCCCATGTCCAGCTTCTTCTATAGCTGTGG
CCTGGATTGCTTTTCCTGGAGCTGCTATCTTGCCTTGATTTCCTCCTTAT
CCTAGCTCCTGGATGGCTCCACTGAGCAACCAAAGTTAGGGATGTGGTGG
TGATCTGGGTGAGTCTCGTGGTTTTATGAGAGCAGTTTGTTCTTGAGTGT
GATGAACAGAAAAGGGGTAAGGAGATTGTTGATGTGCTAACCGGTGGTAC
TGGTGAGTGTGCTCTCCCTTTATATGCTCCATGTGAATGCTTCTTGTGTC
GACAGCACATCACTTGCATGCTGTGACTGTGCTGTTGTCAAATGGGACCC
CTGGGTTCAAGTTTCAATAGTAGGATATTTATTGGGATGGATCAACTCAG
CTGGTTGTTATTATCTCAAGTTGGGATTTATTTTTGTGTTGCCAAGTGGA
ATGGATTCCTTTACTATTCTTTCAAGGTGAAACTTGCCCCTATTTAAATA
TGCTCAATGATGTGAATAGCAATGCATTTCATTGCCATACTGAGAGCAAA
ATTACTAACATTAACTCCTCTCTTTGTTTTTATCTTTTATTTACTTGTTT
TGCAGGTACAAAAGAAGATGAGCAGATACCAAAAGTTTAGTTTAGGAAAT
ATAGTTTAGAACTCTCCGTTTCATTATTTTTGTAATTTTCTCTTTCCTTT
GTGAAATATAGAATGTTGTAATATTGACTAATGATATTTTTATATTAAGG
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ATAAATATTGTAGAATATTCTTATGGTAATAATTATAAATAGTATTTGTT
TCTTATTCTTGTAATATTATGTATATGATAATAATAAATTAAATGTCTTC
TTTCATAATGTAACTTAGAACTCGTAAATATTTATATCCTATTTATAAAT
AAGAATTCAATTATTTCTGTATTATTGTAATTCATTTATTTTTCCTTCTA
CCTATTCTTTTATAATTCAAATATATCTTTTGAGTATTCAAATTGAATCA
CTTTCCCCTTAAACACAGAAGTACGGTAGAGGTCATGTCGAAATCCATCG
CACTTGATCTGATGTTTCTATCGGAACAAGAGAGATATCGATCCCTCCTC
TATAGTTTCTTTAGTTTTGCGCAAAAATTCTCTGGATTTTCTTATGCATG
AATGCAATGCACAAACATGTGTCCTTTATAATTCTAGGTGCTAATCATGG
GATGTTACACGATGACATTGAAGTGTCTAGCCAGGAGGGGCAGTTGTCGG
GCGGCGCCAACATCGGCGTTGAGGGAGAGCGTGGCAGACAGCCAGGGTGT
CATCCCATCTCCATTGATGGCGCAGGCTGCAGCCGGTCAGCCTTCCACCC
GGATCTCTGAATCACTGCCGCGGTTGCATGTGACTCGGTGCCGTTGCGCG
CATCTAAATCAATGCTGCGGTGGCTAACGGGTGGGACAGTGGAACAAGCA
AGCAGGACACGCCCTCGGTCCGCCCGCGTCCGGGCCGATGTAATTGATGC
CCAGATTTGGTGCAGGGATGGGTCGTTCCACTAGGGCGCCGTGCATGCCC
TCCCGTCCGCATGGACGAGTTCGGACGCGCTGGGACGGGTTGGGTCGACC
CGATGAAGATGCCCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.