Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA013812

[Submit comment/correction]

Sequence
AA013812
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013812
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCGAACGGATGGAGGTGGTGGGCGCTTTCAGTCGAACAGGGTAGGGGGA
CAGCGCGGCTGTCGTCGACCGGCGCCGCCCCAGCGTGCTTCCTCGACCGG
CCGTGGCCGCGACGCTGGCAACTGCGACCGGCATTGGGGAGCATTACCGG
AGGTTGCCGATCCTGGAGGAGTGCGGCAAAACACCCACGGCTGCGGGTAG
TTCTGCTAGTAAGCCATCTGCACTTCACCCTCAGCCGCCGTCGTCTTCCC
ATGGAAGCATCAAGGATCCAAGCCGCGCTGCTGCGCCGCCGGCAGGGTAT
TTTTGCTAATTCTCTTCTGAATTTCTATGTGCTGGATCATGACCTGAAGC
GTATGCCTAATTCAGTCCGAGTGTGGTTTTGCCTTTATCCCCCTATCCGG
TTTACCGGCTGTTAATTAAATCTGGGAGTGTCTTGACTTGGTGCTTGTAT
CCTTAGTTCTTCCAAATTCACTGTCAGTAGAATGCAACACCAAGTCCCCT
GAATTAGTTAACCAACAACAACCATTAGGTCCAGTTCCACCGTCACTACT
ATTTAATAGGAATAAAAGCATAGGAAACCACGGTCACCCAGAACTCACTC
TGATTACCTGTCATCACCTTGCCTAATGAATGACCTTTACAGTAATGGAC
TCAGAGATGTTCAATCTCGAATTTCTAGTCCTGATACTAGTGCCTCATGT
ACTACAGTTTACATCAGGTACAAGTAGTACATCGCAGATGGCAGGATTTG
TAGCTTTGAACCAAGGTTACTTATGCCGATGGTGAAGCAGTTTCGACAGC
GGTCAATCAAGGCATTCCACGAAGTCCCAGGGGACTGCCAGGACTCAAAA
TATCAAAATCTCAGGCAAGTTTGCTCTACTAGATGAGACTGGCATGTATA
CAGCAGGATGTTTTCCTCAATTGACAGGTTGCATTTTCGTCCATGTTCAC
CAGCTTTGTCTCTTACTAAAGGCATCATCGCCACAAAATAGCATGATCAC
TGCTCTCTAGCTAATATCCTGTTTCAGTGGGCATTTCTCTAGCAGCCTTT
GCTTTTTCATTGAATAAAATAATCTTTTGTGCAATATATATACTGCGATT
CTGTTTGATTGATTGATACTAGCGAACTATTCAGAAACTAAACTTGCTGC
ACAATAGCTTACTGGGCCTTCCCCATGGGTACCGGGCACTAAAGGAACAG
AGAAAACAAAGGCCCTCCCAGAACCTAGATAACCCCTAGATTTTGAGATG
ATAGCCTACATATATATAGCCTTGGATGTATTGCTATAAACCTTAGTTAA
GTAACACTATTTCAAACTGACCATTTGAAAGTAAACTACACTAGTGGCAC
CCCTTTTTCTTTCTTTCTATGATTAAATTGCGTGTACTTTTCTATTTCTG
CAAGTTTTTCATATATATATTTGAACAAGTTGATAAGGTTCATATTTTAA
GAAAGAACCAAAAAAAGTACAATACCTATGAGTAGACAGACACCAGGAAC
AAATATAGTAAATGCATACTCTAATGAAGCGCACTTTGCATTTGCGTCAA
TCTTCTAATTATAGTAAACTTACTGTAGTAAATTAATATCTATACGAATT
TCAACAAATTCTTGAGCTCTCAAGCGTCGACTACTCTCATATCTGGAAAA
TGAAAATACGAAATTTCAAGAAGACGTTAAACTATGAACCTTTTGATTGC
CGATGGGACGGGTGGCTCATACAAAAAAGCCATTGAAGTCTAAACTTGTC
TCGAGTGAGGACTGCGTCCTAGCAGTACTGAGTCCTAACGTACATATCTA
GGTACAACTAATTAAGAGGAGTAATAAACTTTACATTGTTTTCTGGTGAA
ACCTTCAACATAATTCCCTAGATCCAGTAGGACGAAAATATGCTTTTATC
ATGCATATGCTGATATGCATATACTAACAGGCTGGTGACTGCCAGCTCTT
AATATTAAACGCGGCATCTTTGCATTGTACCTATCACCAGCTAACTAGCT
TTCAGCAAACAGATCAAACTGATGAATAAACCATGCCTGCAGGCCCTGGC
GCTTTATACTTAATTATGAGCATTCTGTTGCCATGGCGCTATCGATCACA
TCCGAACAAGACTCAACACTACTACCTGGGGAAATACGAATGCATCTGGA
TGGATCGTTGATCACAATGCAGGAGTTTGTGTAATTGTAGAGACTGAGAC
AGCAATGCCAACATATAATCACATACAGTAGACTGTTCGGCTTATAAATA
AAGTACCTGACATTTTTGAGCCTTCCACCAGTATGGTTGCACCAGAGAAG
AGCAGGATCCAGCATTTATCTATCCATCTTGAAGGTAAATCTAGATCACT
CAGTTAGCTACCTTTGCTTGTACTATATGCTTATAAATTGTAACTTGTTC
CTCATGTAATCATCTTAGCATTTCAATGCTACCTTTTCAATATTTTTTGC
TGGAATTCTTTAGCTACAGTTACTGGTGGGAATGATATGTTAGTTTATCT
TTGTTATAGAAAAACACGGTGAAAATGGCGATGGTCCTGGATGCTTTTGC
ATCATATGTGCAAAACATGCTGATGAATATGGCAAACGAAGAGGTGCAAA
TGCTTCTTGGAGTTAGAAAGGAGATTGGCAAGATGGACGTCAAGCTTAAG
GACCTCAAGAACTTCCTTGCCGATGCTGATAGGAGAAACATCACCGACAA
GAGCGTGCAAGAGTGGGTGGGGCAGCTTAAGCGTGCCTTGTACGAAGTTG
CCGACATTCTCGACCTCTGCCAGTTAAAGGCCATGGAACAGGGTTCATCC
ACTGTGGATGTGGGGTGCTTCAACCCTTTGCTCTTTTGCATGCGGAATCC
CCTTCATGCCCATGTAATCGGTAGCCGCATCAAGGCACTCAACAAGAGGC
TTGACATCATCAAGGAGCGCAGCGCTCAGTTTAGCTTTATCAATCTTGGC
TCCTACCATAGCAGCACAATGCATACGTCTCGTTCATGTAATCCCAGTCG
TGAGACGACAGGGGCGTTCGATCGGTCAGGTGTAGTCGGGGAGAAGATCA
AAGAAGACACAAGAGCGCTGGTTGAGATCATGCTGACTGAAAAAGAGGGC
AACACCAACATCATGGTGGTTGCCGTTGTTGGCGTTGGTGGGATTGGTAA
GACCACTCTTGCCCAGAAGGTCTTCAATGAAGAAACATTGAATGCCAAGT
TTGACAAGATGATATGGTTAAGCATCAACAAGGACTTCGACATGGTTGAG
TTGCTCAGGACAACCATCACGCTCGCCGGGGGAGAACATGGTGGTGAAAA
GGTGTTGGCTGTGCTTCAACCAATCCTTACTAATGTCTTGATAGGGAAGA
AGCTATTGCTAGTGATGGATGATGTGTGGAGCCACGGAGCATGGGGCGAT
GTGCTTGAAAGGTCCTTGGGTAACGTGGTGGCACAAGGAAGTAGAGTCCT
AGTCACTACTAGAGATGAGAGAGTTGCCCGAGGGATGAAAGCTGTGCTTC
CCTACCACCACATCGACAAATTAAACGAAGAGGATGCCTGGTCATTGCTC
AAGAAGCAGGTACGTAGCTGCTAGCTCTTAGCTTAATTTGGAGTAAATAT
ATAATCATAGGCACTGTTTTTTTCTTTGAGATTACAATATGGATCCATAC
AACACATGGACACTACACTTATGCCATAACACCTGCAGACACCCATATGT
AATCTTACAGTCCCTTATTTGATTACATGCGGTAATAGCTAGCAGGGAAC
ACTATCTCTCATCCTCTGGCCATGTGGCCACTTTGGCGATTAGGAAACAA
CCACGTCTTTGAGCATGCCTCGTCCGACGTATTCGTGTTGGTTGATGAGA
TAATTGTCGAAGGTCGCAGCAAAGTTGTGGATGCTCATAGGCGCAAGGGC
ACATCATGTTCTACTGCTGCACATTCGACACTTTGACGCCATTCTTACCT
AGCATCATGTAGCGTAGCTGGACAATTCTATTGGCTTCCTCTCCTTTTAG
CCTTTTTTTATTTTGGTTGTTGTTTGTGTTTCAGTTTGTACTTCTTGTCC
CATCTCGGTGTCTTCTTCCAACACAAGACATGCATTTTCTGCGTGTTTTA
GGAAATAAATTAAGTAACTTGCTTAGCCACTGTAGATGGTAAAGATAGTA
ATAAACTTAGCATCTTACTAGGGTTAGCATGTTATGATGTCTCACATGCT
AGGTATCCCAGTTGATAGCAACGTCCCTAGTACCAATTCATTCAATTTAC
AATTCCGTTTAGAAAAAAATGAAACAGTGCTATATTGGCTTCCTCTCCTT
TTAGCCTTTTTTTTTATTTTGGTTGTTGTTTGTGTTTCAGTTTGTACTTC
TTGTCCCATCACGGTGTCTTCTTCCAACACAAAAGACTTGCATTTTCTGC
GTGTTTTAGGGGAAAAAAGTAACTTGCTTAGCCACTGTAGATGGTAAAGA
TAGTACTAAACTTAGCATCTTACTAGGGCTAGCATGTTATGATGTCTCAC
ATGCCAGGTATCCCAGTTGATAGCAATGTCCCTGGTACCAATTCATTCAT
TTTACAATTCTGTTTAGAAAAAAAAATGAAACAGTGCTAGGAGAAACTAG
ACACTTTTTTTATATAGAAGAAGCGGGTTGGCGTGAGAATTCCAGAAATT
CGTCCCTGACAGGGATCAAACTCCGGTCGCTGGGATGTGCTAACTGCGAC
CCAACCACTAGGCCATTGCCCCATTCTCTACAATTCCGTTTAGGTAGTGT
GTAACTGGTATGTCTCTAGTTTTCTTTTCCATAGTAGCTTATTATAATTA
AATGTGAATTGACACTAGGCATTATCATACCACTATTCTCTTGGGGCATA
CTACTCCTTGCTGACTCCTATTTGGTCTGAACTGCTTGCAGATAGTCTCT
GGTGTAACAGATGGACATGAGATCGATACACTAAAGGATATTGGGTTGCA
AATTGTAGCAAAATGTGATGGCTTGCCTCTCGCTGTCAAAGTAATGGGAG
GACTCTTGTGTCAGAAAGAGAAGAAACGCCGTGACTGGGAGATGGTTCTG
GATGATTCTATATGGTCGGTATCTGAAATGCCCGAAGAGTTGAACCATGC
AGTATATTTAAGCTATGAAGATTTGCCTGCTTGCCTCAAACAATGCTTCC
TATACTACTCCCTTCTCCCTAAAACTGTTTTGTTTAATACATATGAGATT
GTTGGCATGTGGATTAGTGAAGGATTTCTTTATGGGATATCAGACGACTT
AGAAGAGTTAGGAAGAGAGTACTATAAGGAGTTGATATTGAGGAACCTTA
TAGAGCCAAATCCAAAATACATTGAACAAAGGGTTTCCAACATGCATGAT
GTTGTACGCACATTTGCTCAATTTATCGCTAGAGATGAGGCACTAGCAGC
TCACAGTGGTGAAACTAATATTGTTAGTAAACTTGGTTCACAGGAGTTTC
TTCGGTTATCATTGGAAAGTGAATCTTCTGAACAAGATGGATTAGACTGG
AGTTCTTTGCAAGCACAAAAGACATTGAGAACACTAATATCAGTTGGCCA
TATAATTATGAAGCCTTGTGATTCATTGGTTCATTTTTCATGTTTACGAA
CTCTACATACAGATTATTCACATGCTGATGCCTTGGTTGAATCTTTGCAT
GAACTCAAGCACCTGAGGTACTTGTCCTTACAAAACTCTGATATATCTAG
TCTTCCAGAGAGCATTGGAAAGATGAAATTCTTGCAATACATTAATCTCA
GAGGATGCCAAAAATTTATGAACCTTCCACATAGCATTGTAAAGTTACGG
CAACTAAGATATCTTAACTTCGGTGAAACTAGTATAAATGGCATACCTAG
GGGGTTCTGTGGTCTGACAAATTTGAGGATAGTACTTGGATTTCCAGCAC
GGGTTGATGGTGATTGGTGCAGTCTAGAAGAGTTGGGCTCTCTTTTTCGG
CTAAAGTATCTTGGGATATATGGATTGGAAAATGTAACTGCTTCCATGTC
TGCAGCAAAGGCAAAGCTTGGTCAGAAGATGCATCTTACCAACCTAGACT
TAATCTGCGGTAGTAGATTGGGGGATGATGGGTTGATTAAAGAGCTAGAC
ATCATCTCCAGGGAACAACAAGAACAAATCGAGAAAGTTTTTGATGAACT
CCAGCCTCCGCCCAGGTTAGAATACCTTGCAATAGAAGGCTATTTTGGCC
GGCGGCTCCCAAGGTGGATGATGCCATCATCAGTTGTACCTCTCAAGAGC
TTGCGGATTCTGATGGCTGAAGACCTGGCTTGCTGCACACGACTTCCCGA
TGGCTTGTGTCAGCTCCCATATCTGGAGTTCGTTCAGATCAACCGTGCTC
CAGCCATCAAGCGTGTTGGACCTGAATTCCTCCAGCCCTACCATCATCAT
AGATCTCATCCTTCCCAGGCGGTGGCTGCATTTCCGAGGTTGAGCAAGAT
GATTTTAGTAGGAATGGTGGAATGGGAGGAGTGGGACTGGGAGGAGCAAG
TGCAGGCCTTTCCTGTCTTGCAGGACCTTACATTAGAACACTGCAAATTG
ACACGTCTTCCTCCTGGCCTTGCCTCCCAGGCAAGGGCTTTGAATAAATT
ATATATACACAATGTCCATGGTCTCATCTACCTAGAGAACTTTGCTTATC
TGGTCGAGCTGGAGCTGATTAAGAACCTTGATCTGGAGAGCATCACTAAT
CTCCCTAGACTGCAGAAGCTTGCCATCACTAACTGCCCAAAGCTGAAGGT
GTTGGAGGGTGTACCTGCACTCCTGAGGCTGATGCTTGAGAATAAGGACA
TGGAGAACCTCCCAAAATACATGGGAAGTATAAAGCCAATGCATTTGGAG
CTAGAATGCAGCCTAGCACTGATCGCTTCAATAGCCACGGGACAATCTGG
CCCTGAGTGGGACAAGTTTAGCCATGTTAAGCATCTCCAGGCATATGCAC
CTGAAGGGAATAATATAAAGAAATGGTATGTCTTGTGCACAACTAGCCCC
TACAACTTGGAGACAAATGTCAGCTGCTCTTTCATGTCCAAAGGTAAATT
AGCTTTACTCATTCATCTTAATTTATTAATTTTGTTCCTTTTTGTTCTAC
GTGTCATCAATATATTTGATTTTGAATATATTTCCTAGTACATTCTTATT
CTTATTTACCTTGAATGAGCTGCAAGTCCTATGCAAATGTTAATTTTACA
TGGTGTTATAGAAGATGGACTATTTGCATTGAGTTAGTTTTTCTCGTAAG
GTCTGGCCAGTCCTTGAGGCACATTTGCTAGGGTCTGGGCATAGAGCCGC
CGCGCTCGCCCTTGCCTTCTTGCTCCTTCCACCTCTGAGTGCACACTCGT
CATTTCTTGTAGCCCTCACTTGCATGTTCATGACTCTGCTTCTGGGATTA
AGTGATGCCATTTTCAGACTCTTTGTATATGATGACTGATGCCTGACCAG
AGAACACTGGCATGCATGCACGTGCACATATCCGTATGTGTGTAGTAAGA
AATCAGTTTTTCGATTTTGACTTTCCAACCTTTGTCATTAGATTGTTAAG
ATAAAAAAAATCGTGCCGTAACTAAACAAATTGATACCATGTAATGCTGA
TTTGTGGGATTTGTTGCCAACGTCTCCACATTTTGCCTCTGAAACGCATT
TACTCACGTTTTGCCACATATGCTACTAAAGTGATACAGTAGTATAGTTT
AACCTCCCAAAAAGAAGAACAAATGACTAGGTTTTGTCCTACAAGCTTCC
TATCATTATGTAATGGCTGTCTGTTTCCCCCACAAAGAAATGGCTAATTG
TTGGCTGATGCTACTTCCTGATGCGGCTGGAGTCGCTCATGTTGCTAAAC
ATATGTTATTCTCACTGGTTCACTAAGCTACCTCGAGATTAAAAATGAAA
TGTTGTATCTTAAAGCTGATATGTGATTTCTAGGTCTGACTGTTTTAACA
TTGTCAGAGTTGAGCTCTTGCCTTGCTAGTTATGGATCGTGTAACCACTT
TTACATTTTCTACTCATACAGGAACCTTGTCTTCTTTTGAGGACGCACAA
AGATTTGAGTCTATCTTTAAAATGACAAGAAAAATCTTTAACTACATCTG
CAGCTTGGTGTTGGGGCCGTCAATGGAAGATATGAACAGCTACAAATTTA
TTGATGGGAGGGTGCTGTGTTTAGAAGATCGAGTAGCCGTTGCTCTGAGA
AGGTTGTACTCCAGTGAGACATCAGAGACCTTAGGATCCTCTGTTGGTGT
GGACGAGTCAACTATTTTGTTGGTAACTGAGAGGTTTGTTGACGTATTGT
TCAAGCGAGCATCAAACCACTGGCGCTGGCCTGGCTCTAGTAAAGTGGAT
AAAATTAAATCCACATTTAAGAAGATCCACAATATGCTTAACTGCTGTGG
TGTTATGTGTACAACTCCCATCCCATTTGGTCCAAACTACGATCATGCCA
AGAATGAGACCTTGCTAATGCAAGGCACCATTGATGCAGAGATGAGGTTC
ATGGACATTTGGCTAGGATCGGCAGGTAGCATGAACCAGTCAAGTCTTTT
GCAAGACTCTCAAATATTCGAGATGTGTGGGAAGGGTGCTTGGCTGAATG
GCAGTAAGCTGAAGGTAGCAATAGATGGATCGAAAGTCGGAGAATACCTA
ATCGGTGATGTAGGTTATCCTCTTCTCCCATGGCTACTCACACCATACCA
GGAAAAATACCTCTCAGACTCAAAGGCGGAGTTCAACAGGAGACACGCCG
CAGCGACAAGTTGCGCGATGAAAGCAGTGGCAAGGTTCAAAGACACATGG
AAATACCTTAACGGACAGATGTCCTGTTCAGGCAACATAAAAACTCTAGC
TGACATTATCTATGGTTGCTGTGTGGTGCATAACATAGTGATAGATATGG
AGGATGATGCAGACATGCCAAGCTCTGACCCTAATGATTGGAATTACAGT
CAGGAAGTACGCCAATTAGCAAATGAGGATGTTGTCAGGGCAAGGGATAT
GCTGTCGCACAACTTCTTGACGACCAGCCAAATCAGGAGGTGAATTAACA
CAACTTTTCCTACATCTTATTCTGTTCGACTTGGTTGCTCTGTGCACTAA
TTTTTTTATCCTTCACATGTTTTGTCAGCCTAGGGGATGCAGTGGAGGAC
TATGAAGTAGCAGCATCAGGCTCAGGGGATGAAGAAAATCCCACCAGAGT
CCCCAACTCCGCCCCATGGTTCTCAGGTTGCTTCTCCTTTCAAAAAAATA
AAAAAAATCAACAGGGGCTAGTCCATGTTGGTCTCATTTTTTTTAATTGA
TGCTTCATTTAATAGCATGCATGATATGTCAAACCCTGGTACTGCGGTAC
ATGGTTGTTATCTGACATAACTAAAATCTTGTTTTATCAGGTGAAAGGGA
ACCCTGCATTATGCTGATTGCAGCTTTTGGATGCATGAATCCAGAGCGCC
CATGCAATGGAGCCGGAGACTAATTTGAGCTCCAAATTCAAGTTCAGTAA
TTTCTACTACCTCTGATCCATAATACACTTGAATGGAGTATTAGATTTGG
TCATATATTTGACAAAGACAAGTGTTACGCGAAATGCACTTCAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.