Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009442

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009442
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009442
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTGTCGTTCGCAAAGAAAAAAAAAGTTTTCTACTTCATCGCTTCCGTT CTCTCGCGACGTCCGTCCCTACCCCCTCGCCCCGTTCGCCTCGCAAAACC CTAGCCCACAGTCTACTCTCATGGCTACGCCGGCGGTGGCCGCCTCCGAT GCGGCCAGCCCGCAGCCCGAAGAACCTCCTAGGGCCGAAGCATCTGCCCC AGTGGCAGAACCAGAGGAAGCATCCGGCCCTGGCGCCGTCTCGGCGGCAG CAGCGGTGGAAGATGCGGCAGGTGGGGATGCCCCGTCCGCTCCCGCTCCT ACCTCTACCTCGAGTCCTGCGTTGCCACAGCCGCCGGCTTCCCCTTCCTC GGCTGCCGCTCCAGGGCCTCCACGGCCGCAGTTCGCTGCCTCGCCGGCGT ACATGACGCCCCCGGTGTCGTCTCCATCGCCGGCCTTCTCTTACAACGTT CTGCCCAGGGCGCCGCCCCCGCGCCTAGTGGGAAGCGGTGCGGCCCACCA GCAGCTACCTTCCGCTCCGGTAGAGTAACAGCATCCTGTCCCGAGCTTTA GCTTACATGCTTCACCTAGCTATTATATGCACTCATATAAGGGAGTTGTT TTTCTTTTGCTTTTTGGTGTATGATCCACATAGGTAATGTTGTAGTTTTT GTGGAGGGATATCTGGTTATATCACACTATATTTTTGTTAGCTGTGTTGA ACGGCTGACATTGGTTTGCGTTAATTGATGATCCAATTTTAACTGCATAA GCCAGTCTCTTGTGCCATCCTATAGACACTCTGAAATTAGGGAATTTCAA TTGCATAACCCTACTTGCCATCATATATTACCCCGGTTAAAAAGGGATAG TATGTTTCAAGTTCCACGTGATATGGTGCAGAAGCTTACAGTAGTCTAGG TTGTGGATTTCGTTAGCTTTTGTTAGCTTCAACACAAATGCCTAGTTCAT GCTTTTGTCAAAGAAATTGCTCTTTTAGGTGTATGTTGCATAATCCTGTT GTAACTTTGCTGTTTTATGCCTTCTGCACTGTTTTCATCTTGGCTTGGTG AAACATTCTCTGGTTCGATTTTTTATCAGATGCAAAATATATAAATAGGT TACCTTTTCATTGTATCACGGTTCATGGATATTTGATATCAACTTAATTA GCTTGAGGAGCTCTTGCATAAAGTATCCTGAAATAATCTGAATGCTAGAA GCTTACTCAAATCAGGATAATTCCACGGCTATTTTGGTTTCTATAGCCTA TAGCTTCTTCATAATCTTCATAATTAGTGAACTGAAAAATTGTTAGTGGA TCTGAATGTACACGGCTTTGACATCTTTACTTTTGAACAGTTCTCGTATA AAAGAGTGAGAGAAATATGAGTATTGACACCCAAACTTATGATCACTGCA AACAATTCAACAGTGCGCAAGTTAGATTATCATAAAACTAGTAGTCTTAT CATTTTTTCCTTTCCAGGCTCCGATGGTTCCTCCAATGCCTCCAGCAGCT CTTCAGCCACCAGCCCCACAGCCATATTTTGGGAACAGGCCGTCTTTCTC ATATAATGTAGTATCACATGCCAATTCTAGCTTGCCTACTGGTCAGCAGT TTCAACTTGACACTGTAATTTCTCATGGCTTTATTATTACCAGAGTTACT ATTCTTCCTTTGATTAGTCCTTCCTAATGATCTGTTCCTTTTCTGTGATG CGCTAATGCTTAATGCCACCTTTTCTTCCAGGGCATGAACCATGCTGTCC AAGTTCCTATGTTTGCTCGGCCAGCATCCTTGCAGCCTCCAGCTCCTGCA CAATTACCTCACCCAAGTGGACCATTCCCAGGAGCTATGGCGCCAAATCC TCCGGGATCTATTCGGTTGCCATTTCCAGTGCCACCCAGGACTTCCAATA TTCTTTATGGCACCAACCCACAACAGGCACGGTCCTAAGCCTCCCAGCTT CCTTTCAACACTGCATACTTCGATCCGCTTGCTTCCATATGATCGAATCT TATGAATTGGGTACGAATAACTTCTTGAATCATTACAGGGTAACCCAGAT GGTAGTGCTTTGAAGTCGGATGTCCGAAGTGTCCCGGAGGCAAGTCCCCA TACCATGCAGCTACTGCCACCTCGCCCTGAGGTTTTTGGGGCTGTTGAGG GTTCTGCACCTGGACAAAGTTCTTCAAACTTGTCAGCTCCACCAAGCCTT CTTGGGAGGCCTACAACCCCATCTGCTCCTTTGCCTCAAACATCACCATC AGGTGCTGCTCCACGGACTGCCCAGCAACAGTTTTATCCATCCTATCCTT CAGTACCTGGTATTGTTCCGCCTCAACCTTTATGGGGATATCCTCCACAA CCTACTAGTTTTCAGCAGGCTCCTTTCCACTCATATCCACCGGGCCCTCT TGGTAGACCAATGGTTGGAACTTCTGCTGTGACTACATCGTTGCCCAACA TCCAACCACCTGGCATTACAACTGGTGGAGATCCCAAGGAATCACTATCA ACAAATCCAGGGTCTGTGCAGCCCATTCATAGTTCAGTTGAACGACATCC AACAGGTATTCATTTTACTGGAGTTGATGATCACTTGATTAGTCTTAGTA TTCCTATTGATTCTTCAGTTCTCATGATTTCTGTGCAATGCTGAAGGGCT GGAGCTCAAAAGTACCACTGGAATTCAGGATTCAGATGCATGGTCTGCCC ACAAAACAGAAGCAGGTGTTTTATATTATTACAATGCATCGACAGGAGAA TCAACTTATCAAAGACCACCTGGTTATAAGGGGGAGGTAGTTGCACAGAA GAATAACTTTATCAAGTAATATAACTTCATTCCAGTCTGTGACATGGCAA TTTAGCATCACAATTTAACTAACTCAATATTTCCCTTTTTTCTGTAGCTC GAGAAGGTTGCAGCTCAACCAGTTCCAGCTTCTTGGTATGTCTGCAACAT TTACCCTGTGTTACTTTTGACTAATTTTATGTTGGTATGTGAGGGTTGTA AGAAATCCCTCCCACCTTTATTTATACTCTTAAGAGTATTACAAAACCAT TTGCACAAACAACTTATTGTTGAATGATAGTGTCACATGGAACTCAAATA TTTCACTTTGCCAGGGACAAAATTTCTGGCACAGACTGGAGCATAGTAAC TACAAGTGATGGAAAGAAATACTACTATGACAATAAACAAAAGGTATGTT CTTGATAATGTCTTTGAAGGTCAACACATCTACTACATTGATTAATGTTG TGGTCTTCCAGTATTGCATGAGTTTATTATGTATAGCTTATCTCTCAATG CTGAACAGATTAGCAGCTGGCAACTTCCACCAGAGGTGGCTGAGCTCAGC AAGAATGCTGATTCTGGTAGCTTGAAAGGAAGTTTGACTTCACTGCCGGA TGCTGGCACAGTAGGAAATAAGGGAGAAACGAGTGTTGAAATAAGTATTC CTGCCATACAGACAGGTGGCCGTGATTCGTTGCCACTTCGGCAAACAATT GTCCCTGCATCGCCTTCTGCTTTGGATTTGATAAAGAAGAAATTGCAGGA CGCTGGTGCTTTCAGTGTGTCCTCTCCTCTTGCTGCTCCTTCATCTACTG CATCCGAGTTGAATGGATCTAAACCAGCTGATGGTACACCTAAGGGACAA CAAGGCTCAAATAACGGTGAGAAATCAAAGGATAGCAATGCCAACGAAAA TATGTCAGATTCCTCTTCAGATTCAGATGACGAGGAACATGGACCAAGTA AAGATGATTGTATTCGTGAGTTTAAGGTGATTCTTGTGACATTATTTCAG ATTTCGGAATAGATGTTAAAAGAGCGTCTTGCTTCTCCAGGAGATATGCT TTTCCTTGAGATGCTAGTTAAAGATTATGAATTTTGGTACTTGTTCAATT CTGTTTTTACTTTGTAGCCATGTGCTATTTCATGTTTTATTGGCAAGGCA GCATTCTTTATACTTTCTGTAGTTGGGAATTAAAATAACATAATACAAGT TTCTTATTAATGAAACTAGATGATGTTTTCAGGAATAAACTAGATGATTT TTTGTTGGTGCTGTGCAGTAATAGCATGTAATCGGTGCATTTGTTGATTT TCGCAGGAGATGCTAAAGGAACGAGGGGTAGCACCATTTTCAAAGTGGGA GAAGGAACTACCAAAACTAGTGTTTGATGCACGCTTTAAGGTTTGTGAAG TTCGCCATCGTTGTCTTTCATGGGGTCTCTTAAGGTCTGCCATATTTGTC ACCGTACTCCTGCTTCCAAACTATCATTTGTGGCGAACAGAGACTTCTTC AGTGTAGTGCGTAACGTCATGTAGGGTTTTGTAGTTGATTTCCACCTGTA TGGAATGCATTATCTTTTGCTTGAATAGTTTTGTGCACAGTGGTGACTTC TGAGTTCTGTAGCTGTATTATAAATAGGATACCTCTTGCATAGCACACAA AGAGAAATTTTTATTTAGATGGTTTTTTTTCTGGAGAACATATAGTTAGA AACTTCTAAATTGATTATTGAATTTTCCTAATGACCAAATATCAAGGATA GCTTTGCACCTAACCGGTGGTCTGCTTTTCTGTTTATTCCTGGCAGAGGG CCAGAAACATCTTGACTTATCAGTTGTGATAGCTCACAAGGATAACAAAG TAACTACTGACTGATGATCTCGATTTTTTTTCATGTTTTTTTTGTTCCTT TCTACCAGGTGTTTGTGGTGTAGCAGTTGTGGTTTTATTTTCAAGGCAGT GATATAAATTCCTTGACAAAATACATAACCGTAGCTACCAACTTAGTTCA TTCAAGTTTTAATGGGGCAAAGCCAATTTGCCTACTTTCTGTAATTGATG TCATAATTTGTTATGCGTGTAGATTTATTATGGTTGCAGTTAAAGGAGAA ATCTGAAGTCTCCTTAATAGACACAAGGTGCTGTTAGAGTTAGGCCTGTT AAAAAGCAGTTTAGATCGAAACTGTGGAAACGGGTGGTTAAGTTTTTTAT ACTAGCTTGGACGGATAGTTTGTAGTTACTAATCCACCATCAGCAGGGGA TACAAACCTGTTTTGAACAGCCTTGGTTAGAGGTTAGTTCGAAACTGGGA AAAACTGACAAACCTAGTTCATCTTGATCTGCCTTAAAACTTAAAATATA CAGTGATTACGCATTTGGAAAACTGAATTATGGGTGTGCTTGTGTTTTTA AAAAAGCTTCTATTTTACTAATTTAGTTATAGCAACATCTTCTTTAATGC CATAACATCAATAGTTAACATGCATTGGGAGATATTTTGCACACTAGACT AATTTTGGCAGCACAATACCACACAGCAGATCAATGTCAAACTGTCCATT TGTGCTATGTTTTTCTACTCCCAGTTATGCTGTATCCAAGACCTCATGTT GTAATGCATTGATTGTGATTGCTATACTGTATGTTCGTAAGTATCAATCT AAATCTGTCCTGTCCATAGTTCACCCTAAATTGTACTTCTCAGTTCTCAC TTAAGTAGAAGTAGTGATTGCTATATGCTCATACAAGAAACTTACTTGAT AGTGCTTGCTGCTGAGCAAGGCACAATATATTTTCTCTTTGTTGGCCTTG CTCCTACTGGTAACTTTACAGTGTAATTCTGTAATTGAATAATTCTAATG ATAGAGTGCCCACTACAGGCTATTCCTAGTCACTCAACAAGGCGGGCTAT ATTTGACCACTTTGTTCGGACACGTGCTGACGAGGAACGGAAAGAGAAGA GAGCTGCTCAGAAGGCTGCTGTGGATGCATATAAACAGCTACTGGAAGAA GCATCTGAGGTTCACTAGTTGCTATCGATTTTACAAGTTATTTTAGGCTT TTCTTTGAATTAGAGCATGCAATGATAGCCAAATGGCTCCAGCTGTTGCA TATCATTGGAACTACCACTATCTTGAATGTCATGCCTTCGTGATGCATAA ATTGCAGGATATTGATCACAAAACGGGCTACCAGGAATTCAAAAGAAAAA GGGGTACTGACCCAAGATTTGAAGCCTTGGATCGAAAAGAAAGGGAGGCT CTTTTCAAAGAGAAGTAAGGCTACCGCCTTCTATACTATTGTTGAATTAA GGATTTTCAGTTTCATCTTTCAAATCAAATTAATGGGCTATGTACATTTA GATGATGCATTTCCAAATGTTTGAGCAGGGTGAAGGCTATTGAAGGGAAA TTTCAATCAGCACGGAATGCTGTCATAACTGACTTCAAATCAATGCTTCG AGAATGTAAAGATATTATCTCAACTAGCCGTTGGACCAAAGTAAGTTCCT TGTACTCATTTCGCTACACATCTTGCATTGAGATCAGATGACAAAGGAAG CAGAATTTATTTATGCAAAGATAATGTAATAATCCACCTCGTGATGATAT TTCGTTATCTCCACTTGCAGATTAGGACAGACATTTTGATACATATTATC TCCTTCTGTTATCTTCTACTCCCTCCTTTCCAAACTATAAGACGTTTTGT AGGCTATTTTAGCCTACCAAAACATCTTATAATTTGGAACAAAGGAAGTA CTAGTATTGATGACAGGAATGGGTTCAATCTCCTATTGTGAAATTTGAAA TGTTGTCTAAACATGTAAATTTCATTTACTTGGATTCGTTTCTCTGGTCT AACCACCTTAATTTATTTAAGTAACCAGTGAAATATGAATCCTTGCTTTG TAAGCAATATCTCTGGGTTGGTCAAAACTAGTAAAGACTAAAGAGATATT TCATAATGCGATTTTGTGTAACTTGCCCATTAGCCCATTTCTTCTGGAAA GTTGAAACTGACTAAGAGACCAAGTCAAGCAGCTGCCCGAGGCTCTGACA TAGGGACATTTGTTTTCTTGTGACAAAGTATCGTAATTTGTGACTTATAG TTGCTGTTTTGATTCCTGTTTTCAAGTCATCAGTATCATCTGGATGGGCT TCATTGAAGTATGATTTTTTGTTTTCATATGATAGTTGACCATCTAGCTT ACATGGTCAGGTTTCATCTTCCTTGTGTTTACATTGACGTGGCATGTGCT TTGTATCACCATGTTCAACTGTTGTGGACCAATTGTGGCCCTGCAACAGC TCCTGCCCATTCGGAACTAAATATGAAATTGATTAGTTCGCTGCTTACTT GGGAAACGAACTTGTTAATTGTTATACGAGTATGTAGTTTTGGTCTTCAT TTTTTTCTCATAGATCATACTACTGCATTATACAGGTGAAAGAAAATTTC CGGAGTGATCCACGGTACAAAGCCGTAAAGCATGAAGAAAGAGAGAACAC TTTTAATGAATACATAGCGGAACTTAAATTCGCTGAACGGGAAGTGGAGC AAGCTGCGAAGGCCAAAGTGGATGAACAAGTCAGTCAACTCAGCCAGTGA ACTGTAGGATGCTTTCTTTACTGATTGTGGCTTCACATATTCTGTTGTAT GCATTGTCAGGCCAAGTTAAGGGAGAGGGAACGCGAAACTCGCAAAAGGA AAGAAAGGGAAGAGCAGGAAATGGAGAGGGTAAAATTGAAGATCCGAAGA AAGGATGCTGAGTCTTCGTATCAGGCCTTACTTGTTGAAATTATAAAAGA TCCAAAGGTGATTCGGTTGACTTGTATACTTTAAATTTAACTGAACATTC TTGGTCTTTGTACTTGTCATAGCACATTTTTTTTTACATTCAGCTGATCT GTTTGTTTTGGTCTTTGACTGACTTTCTTTTTCTGTAAAATTCGCTTTTG CTATTTGGCATGTTGCAGCTTTGCAATATATAAATATTAACTTAAGTACA TTGTTTTTCTTCCATAGGCATCATGGACAGAATCCAAACCAAAACTTGAA AAGGACCCACAAGGTCGTGCTTTAAATCCCGACTTAGGCCAGGGTGAGGC CGAGAAGTTATTCCGTGACCACGTCAAGGACTTATATGAGGTAAATACCT ACAATTGTGGTCTGTCTGTAGCTACTGTAATAGAATTTTAAATTGCTATT GTATTCTGGTGGCTTGCTTATTGAGGTCTGCTTCTTGGGCTCTGAGCCTG TGGCCTGGTTCAGTCATCTTCATTCATAGAAGAAACCCAAAATATTCAGC AGATTCACATGAACTATCAGCATTGAAGTACTTATGTTGGTATTATTGCA ATGTATTTATTTGGTTGAGCTCTGATGCTTGGGTCACTGCTACTTTAATA AAACCTCTCACTTCGGCGGTTTTGGTTGTATTTTGATTGCCACATGTATC ATCTATAATGCGAGATTGAATTTTTTAGTGCTCAAGTTATTGCATGCTTT TGACTGGTCTTGATGTTCCTATATTTTACCTGCAGCGTTGTGTCCGTGAC TTCCGGGCACTCTTATCTGAGGTCATCACCCCGGAGATAGCAACCCGGAC AACAGATGAAGGAAAGACTGCAGTTAGCTCTTGGAGCGAAGCAAAAGGCC TTTTGAGATCTGATCCAAGATACAACAAAGTGGCGAGCAAAGACCGTGAG TCTATTTGGCGACGGTATGTGGACGATATGGTGAGAAAACTCAAAAAGTC AGATACAGAGAAACCAGATACCGATGCGAGACAACAACATAGGTCCTCTG ATCCGTCAAGGCGGAGGTAACTTGTAGAAATTATCCACTTGTACTCCCTA GTTTTTCTTCCTGTTGGGTCATTTCAGGGGTCGGTGCTTGCACTTCTCTA TGCAGCAACAAAAACAAAGACTTTAAGCCAGTTTTGGTACCATGAGCCTA CATGTATTACAATTTTCCTTTTAAGATTATGGGCATCAGTCCTTACTGGC GCCATTTCATGCTGCCGTGCCACATATTGTTGCGATATATATTTCTATAC AGTTAAGAAGTACCTTGAGTTGTCTTTGGAAAGGAATACTATGTTCACTT GCGTGTATACGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.