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GrainGenes Sequence Report: AA008333

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Sequence
AA008333
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008333
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTGGACAAATTCAACAAGTATTGGGAAGAACCCAATAATGTCATGGT
GATTGCTAGTATTCTTGACCCAAGGTACAAGATGAAATACATTAAGTGGG
GTTTTAGAGAGATCTATTCAGAAGAGAAAGCTACTACTGAATATAATTTG
ATTGAAACCGAGTTGGCAAAGCTGTATGACACTTATGATATACATCATCT
GAAGGGAATATGCCCTGAGAGGCAATAATAAAGTGTTTATTATGTGTATT
CCAAGTATATGATAGATGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACG
GAAACGTTAATACATGTGTGTTTAATAAACAAACAGAAAGTTCCTAGTTA
TGCCTCTCTCATAAACTAGCTCGTTGATTAACAAGATGATCAAGGTTTCC
TGATCATGGACATTGGATGTTGTTAATAACGGGATCACAACATTAGTGTA
ATGGTGTGATGAACATTCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATT
GAGTTTATATTGCCATAACAACTTACAAAGTGATCCTAATCCTTAGACCA
TGAGATCATGGCAATCACTAACACCGGAAGAGTTTCTTGATAACATCAAA
CGTCACACCGTAACAGGGTGATTATAAAGATGGATTCAGAACTAATAAAG
TGTTATGTTGAGGCTCATGGATCGAGAGTGGAATTTGTTCATCCCGATGA
CGGATAGATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGATATCACATTGATTAGCTTG
CAAGCAAGTGATTTGATCACTAGAATGTTATATCACAGGAACGAGAAAAG
AGTGCATGTCGGTAACGAGATCAAACTAGGTATGGAGATACCGATGATCG
AATCTCGGACATGTAATATATCGTGAAACAAAGGGATTAAGATACTAGCG
TAAAAGGTTCCGACGATTACAAGAAAGTCATCATTGAATGTGTGGGAGTT
AGTATGGGTCTCCAGATCCCGCTTCTGATTATTGATCTGAGAGGGGTCTC
GATCATGTCCGCATTATTCACGAACCGTAGGGTGACACACTTAAGAGACA
CCGACATCCAATTGGAGCAAATGTTTCATGCCGAAAGAATGAACAAGCGC
AGGAATTTATTTCACTAGATACCGAAACAGGTTTTCGGGTGAAATTGCAT
AAAATGGTTATGCATGTGAAATAGAATTCTAGCAAGGGGTTATCTGTGAA
TGTTTGTCATTAAAGTAATTGATATTTAATGAGAGTTTGCATTAAATTTG
GTGGAAATTTAATGGGAATTTGAGTGGACTTTTGAGTGGAGGGAATTTAA
AGGAGATTTGTGAGTGGAGTGTCCACCCACATGAAGAGGGGAGGGCAAGG
GGGCAGCCCCCATGCGCCGGCCACCCCCTTGGGTGCCCCCCCTCTCCCCT
ATAAAAGGCCCCCCTCTCCTCCTCTCACATCACACCTCCTCGTGAAGGAT
CTCTCTCCCCCTCTAGAATTTATCCCCCATGGTCTCGGACTAGCGAGATA
CATGTTCCCGGTGGCTTTCGGCAAGAAAGAGTTGTGCTTCCGCTGCATCG
CTGGAGCGAGGAGGCGGAGGTTGCTCGGTGCCTCGAACGTGTGTGCGAGC
ACGGATGCGCTGCTGTTTTGCGGCGCTAGGACTTCCTCTCGATCTTGAGA
TCGGCAAGAGATCGTCTACATCAACCACGAGTTGAACTCGTTAAGCTTTG
TCGGTCTTCAAGGGTATGTTCTCTACGGATATACATCCGCCCGTTGTTTG
TATCTAGTATAAATAGATCTTGGTATATAGTTCACATCGTAGGAAAATTT
TTGTTTTCTATGCTGCGAACCCTTCAGTGGTATCAGAGCCGGATCTATGC
GTAGATACTTTACACGGGTAGTACACATATGAGTATGTGGGCGATGATGA
TCATGTTGTTGCTGCTTTGTTGTGATTTTGGATATTGGTGGCATAGTGGG
ATGAAGCCGCCCGGACAAACTTTACATGTCCTCGCACATGAGACCTGTTC
CACGCTTGACATGCAACTAGTTTGCATAAGTGGCTAGCGGGTGTCTGTCT
CTCCTACTATAGTCAATATCTATTTTGCAAGCGAGTTGTCAACAATTTGA
TTATCCTCGTTGTGGTTGATGTTCGTAGGTAAGAACGGTTCTATCTCGAA
AGCCCTAAGCCACGTAAAACTTGCAATGGATAAATTAGAGGCGTCTAGTT
TAGATTGTTGCTGGGCTAGTGTTATTATATGGTAGTGTTGTAAGTAGAAG
TATGAGATGATACTCTTACAACACACATAGCGTGTAAAATCCATAGACCT
TGGATTTACACATATAGGTATGATAGTGATCATACCACGATGCACATGAT
AGAGATCATCTGCGGGAACCATATAATTTCACTAATAAACATATGATGTT
TGGTTGCATCTTATATTGCTTATTTAGCGCTTTGTTAAGCATAATAAGAT
GATCCCTCATTTAAATATCAAGATAAAAATGTGTTCTTCCTTTAGTATGC
ACCGATTATGTTTTCGTCGCTCCAAGACATCACGTGATGATCGGGTGTTC
TTGGATCCTCGACCATATTTCGGGTGTAAAACAGTTACACACGCAGAATA
CTAAGGTTCTAACTTGGCGAGCCTAGCATGTACAGACATGGCCTCGGAAC
ACAGACCGAAAGGTTAAGCATGAGTCATATAGTTGATATGATGTCCATTT
GATGCTCGCCTTTGAAGCTATACCGACTCACGTGATGATCGGACTTGGTG
TAGTGGATTTGGTTCATGTAATCACCAAAAGGACACGAGGGATGTCACTT
TTGAGTGGGAGTTCATTCGTAATACAGATTAGTTGAACTCAATCTATCAT
ACACTTAGTCTAAACTTTACAAATTCTGTTGTAGATGGCACCACCTGCTT
TTAATTTCAATGCGTTCATGGAGAAAGAGAAACTAGCAACGAACGGTAGC
AACTTTACTGAATGGGCCATGAATTTGAGGATTCTCCTCTCTGCTGCACA
AAAGCAATATGTGCTAGAAGCGCCGTTAGGCCCCCCACCTTTTGATGATG
CCCCTGACGAGGAGAAGAATGTCTATCAGACTCGTCAGGAGGACCACAAC
TTAGTTCATTGCGGCATATTGTATGGGCTAGAGCCGGAACTTCGAAAACG
TTTCGAAAACGGCAATGCTTTTGATACAATGGGTGAGTTGAAAATGATTT
TCGACACACATGCTGCTGTAGAGAGCTACAATGCTTCAGAAAAGTTCTTT
AGCTGCATGATGGAAGAGCACAGCTCCGTTAGTGAGCATGTACTCAAGAT
GTCGGGTTACGCCGATAAGCTTGTGTCCTTGGGAATAACGATTCCCATTG
ACTTAGGCATCCATCGTGTTCTGCAGTCTCTGCCACCTAGCTATAAGAGC
TTCGTGATGAATTATAATATGCAAGGCATGAAGAAGTCTCTCCCCGAGCT
TCTGTCAATGCTTAAAACTGCAGAAGTGGAGATCAAAAAGGAACATCAAG
TGTTGATGATCAATAGGAATACTGGTTTCAAGAAAGACAAGAAGGGAAAA
CGGAAGGGAAGTAAGGGCGGCAAGCCTGTTGCCGCACCTGAAAAGAAACC
CCGAGTTGGACCTAAGTCTGATTCCGAGTGCTACTATTGTAAGGGGACTG
GCCACTGGAAGCGCAACTGCCCCAAGTATTTGGCAGACAAGAAGGCCGGC
AAGGCAAACAAAGGTATATATGATATACATGTTATTGATGTGTACTTGAC
TAGTGCTCGCAGTAGCACCTGGGTATTTGATACCGGTTCAGTTGCTAATA
TTTGTAACTCGAATCAGGGGCTGCGGAACCAGCGACCGCTAGCAAGGGGT
GAGGTCAAGATGCGTGTCGGCAATGGATCAAACGTTGATGTAATCGCCGT
CGGAACGCTGCCTCTCCACTTACCGTCGGGATTAGTTATAAACTTAAATA
AATGTTATCTGGTGCCTGCACTGAGCATGAACATTGTATCGGGATCATGT
TTGATGCAAAGTGGTTATTCATTTAAATCTGAGAACAATGGTTGTTCCAT
TTATATGAATGAAATCTTTTATGGTCATGCACCGATGATGAATGGTTTAT
TTCTGTTAGATCTCGATGATAATGTTACACATATTCATAATGTTGATGCT
AAAAGGATTAAACTTAATGATGATATATCCGCATATATGTGGCACTGCCG
TCTAGGTCATATTGGCGTTAAACGCATGAAGAAGCTCCATTCGGATGGAC
TTTTGGAATCACTTGATTATGAATCATTTGATACATGTGAGCCATGCCTT
ATGGGCAAGATGACTAGAACGCCGTTTTCCGGTTCAATGGAACGGGCGAC
TGATTTATTGGAAATCATACATTCTGATGTATGTGGTCCAATGAGTGTGT
CGGCGCGAGGTGGATATCGTTATTTTGTTACTTTCACGGATGATTTAAGT
AGATACGGTTATATCTACTTGATGAAACACAAGTCTGAAACCTTTGAAAA
GTTCAAGGAATTTCAGAATGAAGTGGAAAATCATCGTAATAGAAAGATCA
AATTTCTACGGTCCGACCGTGGAGGTGAGTATCTAAGTTACGAGTTTAGC
ACTCACATGAAAGAGTGTGGAATTGTTTCACAGCTCACACCTGCCGGAAC
ACCACAGCGAAATGGTGTGTCGGAACGTCGTAATCGTACTTTATTAGATA
TGGTTCGATCTATGATGTCTCTGACGGACTTGCCGTTGTCATTTTGGGGT
TATGCACTAGAAACTGCTGCATTCACTTTAAATCGGGCACCATCTAAATC
CGTTGAAAAGACACCGTATGAATTATGGTTTGGAAACAAACCTAAGCTGT
CATTTCTTAAAGTTTGGGGTTGCGATGTTTATGTGAAGAAACTTCAACCG
GATAAACTCGAACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACCCTAA
AGAAACTATTGGGTATTCCTTCTATCACAGATCCGAGGGCAAGGTTTTTG
TTGCCAAGAATGGATCCTTTCTAGAGAAAGAGTTTCTCGCGAAAGGTGTG
AGTAGTCGGAAGGTAGAACTCGAAGAGGTTGTGGAACCTTCTCTTCAAAG
TATGGCGAGTAGCGCAGCGCCGGAAGTTGTTCCGGAGTTGGCTCCACCTG
TTGAAGAGGGAACTAATGATAATGATCATGAAACTCCGAAAGAGAGTACT
ACCGAACCTCGCAGGTCAAACAGGACGCGTGCAGCTCCCGAGCTGTACGG
AAATCCTGTCATGAATTTCATGGTTGATGAAAATGATGACCCTGCGACGT
ATGAAGAAGCGATGATGAGCCCGGATTCCAACAAATGGTTAGAAGCCATG
AAATCCGAGATGGAATCCATGTATGAAAATCAAGTTTGGAACTTGGTGGA
ATTACCTCACGACCGAAAGGCCGTGGAGAACAAATGGATTTTCAAAAGGA
AAACTGATGCTGATGGTAATGTGACCGTCTATAAAGCTCGACTTGTCGCA
AAGGGGTTTCGACAAATTCAAGGAGTTGACTACGATGAGACTTTCTCTCC
CGTAGCGATGCTAAAGTCAGTTAGGATTATGTTAGCAATTGCTACATATT
TGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACCGCGTTTCTCAATGGTA
ATATTGAAAAAGAGTTGTATATGATACAACCAAAGGGTTTTGTCGATCCT
AAGGATGCTAACAAGGTGTGCAAGCTTCATCGATCCATCTATGGATTGAA
GCAAGCATCACGAAGTTGGAATCTCCGCTTTGATGAGGTGATCAAAGAGT
TTGGATTTGTCCAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAGT
GGGAGCAATGTGGCATTTCTGATATTATATGTGGATGACATATTATTGAT
CGGAAATGATATAGATCTTTTAAACAGTGTTAAAAGTTATCTAAACAGCA
AATTTTCAATGAAGGACCTAGGTGAAGCGTCATACATATTAGGCATAAAG
ATCTATAGAGATAGATCTAGGCGACTAATAGGGCTATCACAAAGTACATA
CCTTGATAAGATTTTAAAGAAGTTTAAAATGGACGGAAGTAAGAAGGGGT
TCTTACCTATGTTGCAAGGCAAGACATTGAGTAAGACTCAAAGTCCGGCT
TCGGCGGAAGAAAGAGAGATAATGGACAAAGTCCCCTATGCTTCAGCCAT
AGGCTCTATAATGTACGCCATGCTATGTACAAGACCGGATGTGGCACATG
CTATTAGTTTGACTAGTAGGTACCAATCGGATCCAGGTTTGGAACACTGG
ATAGCGGTCAAGAATATCCTTAAGTACTTACGAAGAACTAAGGATATGTT
TCTTGTATACGGAGGTGAAGAAGAGCTCGTCGCTAAGTGTTATGTCGACG
CTAGCTTTGACACCGATCCGGATGACTCTAAGTCTCAATCCGGATACGTA
TTTCTCATGAATGGCGGAGCGGTTAGTTGGAGGAGCTCCAAACAATCTGT
GGTAGCAGGATCAACAACGGAGGCCGAATATGTTGATGCTTCAGAAGCGG
CTCAGGAAGCAGTTTGGATGAAGGAGTTCATATCCGAACTAGGAGTAGTG
GCAAATGCGTTGGACCCAATGGTGATCTATTGTGACAACAATGGTGCCAT
TGCCAATGCCAAAGAGCCAAGGTCTCACAAGCATTCCAAGCATATTAAGC
GCCGGTTTCACTCCATCCGCGAGCATGTCAAGGATGGAGATATAAAGATT
TGTAAAGTACATACGGATCTCAATGTAGCAGATCCGTTGACTAAAACTCT
CCCTAGAGCAAAACATGATCAACACCAGAACTCAATGGGTGTTAGATTTA
TCACTATGTAACTAGATTATTGTCTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGAAGGG
AATATGCCCTGAGAGGCAATAATAAAGTGTTTATTATGTGTATTCCAAGT
ATATGATAGATGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACGGAAACG
TTAATACATGTGTGTTTAATAAACAAACATAAAGTTCCTAGTTATGCCTC
TCTCATAAACTAGCTCGTTGATTAACAAGATGATCAAGGTTTCCTGATCA
TGGACATTGGATGTTGTTAATAACGGGATCACAACATTAGTGTAATGGTG
TGATGAACATTCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATTGAGTTT
ATATTGCTATAACAACTTACGAAGTGATCCTAATCCTTAGACCATGAGAT
CATGTCAATCACTAACACCGGAAGAGTTTCTTGATAACATCAAACGTCAC
ACCGTAACAGGGTGATTATAAAGATGGATTCAGAACTAATAAAGTGTTAT
GTTGAGGCTCATGGATCGAGAGTGGAATTTGTTCATCCCGATGACGGATA
GATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGATATCACATTGATTAGCTTGCAAGCA
AGTGATTTGATCACTAGAATGTTATATCACAGGAACGAGAAAAGAGTGCA
TGTCGGTAACGAGATCAAACTAGGTATGGAGATACCGATGATCGAATCTC
GGACATGTAATATATCGTGAAACAAAGGGATTAAGATACTAGCGTAAAAG
GTTCCGATGATCACAAGAAAGTCATCGTTGAATGTGTGGGAGTCAGTATG
GGTCTCCAGATCCCGCTTCTGATTATTGATCTGAGAGGGGTCTCGATCAT
GTCCGCATTATTCACGAACCGTAGGGTGACACACTTAAGAGACACCGACA
TCGGATTGGAGCAAATGTTTCATGCCGAAAGAATGAACAAGCGTAGGAAT
TTATTTCACTAGATACCGAAACAGGTTTTCGGGTGAAATTGCATAAAGTG
GTTATGCATGTGAAATAGAATTCTAGCAAGGGGTTATTTGTGAATGTTTG
TCATTAAAGTAATTGACAAAATTCTGAATAAAATAAAAGAGTTTTATTTA
ATGAGAGTTTGCATTAAATTTGGTGGAAATTTAATGGGAATTTGAGTGGA
CTTTTGAGTGGAGGGAATTTAAAGGAGATTTGTGAGTGGAGTGTCCACCC
ACATGAAGAGGGGAGGGCAAGGGGGCAGCCCCCATGCGCCGGCCACCCCC
TTGGGGTTCCCCCCTCCTCCTATAAAAGGAGCCCCCCTCCTCACTTGTCT
CTCACACCTCCTAGTGAAGGATCTCTCTCCCCCTCTAGAATTTATCTCCC
ATGGTCTCGGACTAGCGAGATACATGTTCCCGGTGGCTATTCGGTAAGAA
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GTGCCTCGAACGTGTGTGCGAGCACGGATGCGCTGCTGATTTGCGGCGCT
AGGACTTCCTCTCGATCTTGAGATCGGCAAGAGATCGTCTACATCAACCA
CGAGTTGAACTCGTTAAGCTTTGTCGGTCTTCAAGGGTATGTTCTCTACG
GATATACATCCGCCCGTTGTTTGTATCTAGTAGATAGATCTTGGTATATA
GTTCACATCGTAGGAAAATTTTTGTTTTCTATGCTGCGAACCCTACATCA
TCGTTATGAGAAAGCTGATTCTTATAGATCTGTTGCATCCTCATCTACAC
CTATGGATACAAGTTCATCTTTACCATCAAGTGCAAGCGAGTTTACCTCA
TACTTAAGTGAGACTTCTATGGAGACATCAAAGAATGAGATTGATAAGTA
TCTTGGTGAGGCAAATGAGAGCTTGCTAAACAAAAAATTTGATGTGCTAT
TGTGGTGGAAGTTGAATGCCCATAGATACCCCGTCGTGTCAAAGATGGCA
AAGAATTTCTTGTCTATACCGGCGACTTCTGTTAACTTCGGAGTCTACTT
TTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.