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GrainGenes Sequence Report: AA028867

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Sequence
AA028867
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028867
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTTCCCACCGCCTGCAAAAGAAAAAGATTAATTACAGGCAAGCCCCTCGC
TCCTTCTCTGTCTCTCTTCTGCCCCTCGTCGCCTTCTTCCTCCTCCAGCT
CCTGACTCAAATTCCCTTCCCACCCCAAACCCTAAAAACCCGAATGCCCC
TCGCCGTCAGCTCCCGGGAGGCGCTGTGTCGTCCCCAGTGACCGCTGATC
CGCCCGCCCCCGCCCCCCGCCGGCTCCGGCCGGGCCGAGCCGCAGAGGAC
CGAATCTCGGAGGAGGGGACGAGATGGCGTCGCGGCCGCATAACCAGAAA
TCCAAGACGCTCGACAACAAATACGTGAGCGTCCCCCCGCCACCCCGCCC
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GCGCGTTGTGTCTTTGGTCGAGTGCCGTCATATGGAGCACGTGGGCATCG
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GCTAGACATAGTATTAGTAACATTCCATTAAATGTTTCACAGGGATTTGA
TTGTTTCCTCATCTGTTACAGAATACCCGTGCTTGCACAAAGCCTTGTAA
CTTGTAAGCACCATGAGCTCTTGAACCTTCACGTTCTTCCTGTAGCATCT
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TGATAAAAATTAGTACAAATTATAAAGTATTAGTAGTTTGTATAAGTTAT
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TTTCAACATTGTAATATGTGTATCAACTTTTTGGATCTGCATATCCTTTC
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TGTGTATGTTCTGTTAACTGTTCTCCATGGTTTGCTGGTGTGGCCGATTC
AGCAAGAAATTGATCTACTGAAAGTAAGTGTTTCAACAGTACTACGTTTG
GATTCAATAAGACAATTAGCCCCATATTTTCCTTCATTGTTAACTCATCC
CATATCCCTCCCTACTACTCTGTGTTACATTTTCCCCCATCTCATGTTTA
CTTAATTTTTGCTGTTACCATTTTCTACCATAGTCAAAGTTCTGTGTGCC
AAATTTATGCTTAAGAACAATGAGAGGCACCCTTCCCTCAGTTGACATCT
TAAATTATGTGAACTTATTTTTGAATGATCGGCTAGCTATGTAAACACGT
GATACTCTCTCTGTCCCAATGCATGTGGCGCCATAGATGTGCGTGTTTTT
TCTTTGACCACTAATTTGACCAATAATACGTGTCATTTGTTATAAAATTA
TACCATTTAAAACTTTATTTGAGTATGTATTCAATGGTATAATTTTTGTG
ACAGATGATTCATGTTTTGTTGGTCAAACTTTGACCTCGAAAAGTGCGTA
TGCCACCTAAATTGGGACTGAGGGAGTAGAAATTAACTTGGATGATCAGA
AGTGTATGAAAGGGTCTTGATTTTTAATATAGATATTATGTCCTTGTTTC
TTTATCCCTCATATCATACCTATTGTTATAAAAGGCCCTTGATTTTTGAA
CATCTATTTCACTCCTTTAGTTGATGCAAATGTTTTCGAGAATTTTGTTG
CTTTGAGCTGAAGGTTTTGATACTTTATACAGAATCTTAATCACAAAAAT
ATTGTGAAGTATCTGGGATCGTTGAAGACAAAGAGCCATCTCCACATAAT
TCTAGAGTAAGAAATCCTGAATATTCGCCGACAATGTTTTGATAAGAAGT
ACATGCATAACAGTAAATTTTAGCACTGATACTGTGTGATGATGGCAGGT
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GTGATTAGTGTGACTTACATTTTTTGTTGGCTATGTCCGCTTCTAACTTG
TCCATTACTTACCAGGTGTTGGAAGGCCTTGTTTATCTGCATGAGCAAGG
TGTCATACATAGAGATATCAAGGGTGCAAATATATTGACCACGAAAGAGG
TAAATGGCTCCATCACTTGCATATTTGACCATGGTTTTTATTTGGTTTTA
CTTCTGATGAGTGATGCTGAAGTCAGGCGACAGTATCAGCTTATAAGGAA
AAATTACAGAAGGGATATGACATCTTTCTACAGTTCTGCGAATATTATGT
TTCAAATCAATATTTTGAATGAATTTTCTGTTAGTAAGAAAATAAAAAGA
TGCATGGAATGGGCACCCTGGGGTGAACTCTTGGACATACCGTAGCCTAG
CATTTCTTGTTGGAATAGATAACTGCAAATGTACTATGACATTAGCTGGT
TTTACTGTCTGCTCTTGATGCTTTGGGTAGTACTCCCTCCGTCCAGAAAT
AACTGACTTGGGTTTGAATAGATTCGAATGTATATAGACGCGTTTTAGTG
TATAGATATGATGATTCTCAAACTACATGTTAATATGTTGGAACCTATGG
CATTTTTTGTTGCTGTAGAGTGAATATTATGCGCATAACCAGTAAGCACA
CAACTTGAGTAATATTTGCTATAATCTGGTTGTACTTCTTTCACTTGGTA
CAGTACTAGTATGTGTAATAGCCGCAAGCATGATCCCTCAGTTGTAGTCA
CATGGAGGAAGTAGCTACGTAGCCAGTAATATGTTGCATGGGAATATTTA
ATATGATTGATGAGGCACACAACCAGACTTGAAATCTACACTTACCATGG
TGCACGACCAAGGGCATAAGAAGTCATATTTTATCGGGATATGTTACTAT
TTTCCCCTGAAGCTCTCATCTATCTACATTTTGTTGTTTAGGGCCTAGTT
AAACTTGCTGATTTCGGAGTTGCTACTAAGTTAACTGAAGCTGATGTGAA
CACACATTCAGTGGTTGGAACCCCATACTGGATGGCCCCTGAGGTATGCT
AATTTCCTGTAACTTCTATGCCTGCTGAATTATTTGTTAGGTCCACTGGC
ACGCCGGACTAGTTTCTTAACTTGTTTCTTGTACTCCCTGCATCCAGAAA
AGGATGTCTCAACTTTGTCTAGATTCACATGTATGTACACACTGAAATGC
GTCTAGATACATGCGAATCTAGAAAAAGCATCCCTTTCTGGACAAAGGGA
GTAGTTTTTTTTATTGTTAGTTGTCTCAAAGGTGTTGTCCTGTTCCATTG
TATTTTGTAATCGAATTTGAAGCATTACTTAGAAATAATACAAGTATCAG
TTTAGTGTCAATTTGTCAAGCGTATTATCACTTCAGGAAAAAAAAACCAT
TTACCTGGATGAGCATTAATTAAATTTGATATTCCTCCTTTTTGTTGCTG
ATAGAGTTTGTTGAAACTGTGAGTATGTGTTCAAGGAACTTATTGTGCCA
GTGTGGCAGATGACTTGAGTGATTAAATTACCCCTCTGTTTCATATTATA
AGACGTTTTGGCAAACTGCCCTTTTTCTTATAATATGGAACAGAGGTGAT
ATTTTCTTTTCCATGGCGATAATTTTGACACAAAGAACCAGCAAATGTAT
GGTGCGAAAGTAAGACTCCATCCACTGGATCTGCTCCAGGAGATCAGGAT
AAGAAAAAACTTAGTAAATTTCCTAAATTGCACGAAGTGCTATTAGCATC
TGGAATACTAGTATAACATAGTCAAACCAATACTGCTGATATGATAGCAT
CACAGCAGGCGTTAGCAGCCAAAATCGATCAAATCTTAACTTTTGGCTAT
AGTTACTATTGCAAGGTGCTAATATGTGGCAGTTATAATTGTCGACTGAG
GTTCCATTTGACTTAAAATCCTTGCTATTATGTCATATTATCATGATATT
TTGACTTCTCTTCAATCTTCATCATCTCTTTTCTGCATATATTATCATGA
TATTTTGACTTCTCTTCAATCTTCATCATCCCTTTTCTGCATTAGGTCAT
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CTGTTATTGAGCTACTGACATGTGCCCCACCATATTACGAACTACAGCCC
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TCTCTTCCCTTCAAATACACTGTTCATTCAGCTACAAGTGCAGATTACCT
ATAAAATCTTCTACTCATGTAATACAGGATGTGCATCCACCAATACCAGA
AGGATTCTCTCCTGAGAGCACTGATTTTCTGCGTCAATGTTTTAAAAAGG
TTCTTTATTGTATCTCGCTACTATTTTTTAGAAGGCTCATTTATTTTTTC
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CGACCTGATGCAAAGACATTGTTGATGCACCCATGGCTGCAGAACTCGAG
ACGACAGCCTGTTCGAGAACCGAGGTAACTCAAAATTGATAAGATGATTC
ATTCTGATGTTATGGGTGACAGTGAAAAATTAGACGAATGGAAAAATAAA
AACATCATGAAACCACCTGATATCCCCAGAATTTGACCTTTTTTAGTCAC
TTAACTAGTCAAAATTTCTTCAAGTATTGCTGAAATCATGGTAGTTATAT
TATTCGTGTAGTGATTGGGTGTGTACAATATGTAGAGGTTAGGTTGCAGG
ACTAGTGGATTTGATTTAGTTTTGAATGCAGCTTTCCTGCCAGAGATGTT
CTGGATTATTTTGTAGTGCTTTAACTGATATATTTCGAACTTTTGCCTGC
TCTTGAAATTTCTCATAGTTAAATTCTCCTTCTTAAAACAATGCCCGTGC
ATTGCACCGGGAGAGAAAAAAACTAAGCTTACAAAGTTCTCCTTGGTTCA
ATAATTCTATTCCAACTTGTGTCCATAGACAACAAACTTGAATAATACAA
TTTTCAACACTAATTTAAAAAAAGATTACCAACAGAGAAATTTAGAATCT
GGTTTGAGTTTACCTTTCTCTCAAGCATACAAAGATGATCTAAAGCCTGA
CTATTTACATCTGAGAGTAGCTTTTTATACTGTAACATTATTTCTATAAA
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CTCTCGATCCCCTTTTTCTCACTTGACGACTGATGACGTCCATGCCACCG
CCTGCCGCTCTGGCCGCCGCCGGCCGTTTCCATCACCGCCGCACACCGGC
GAGGCTCGGCCCCGGTCTCCTCCACCAATTCCCGCCACATCTGCCTGCAC
CTGTGCCTGTACGCACATGAACTGCCAACCCTAGCTTGGTCTTTTGCAGT
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GCCACTGCTGGTCTACATGGCTCCGCCATGGTTTCCTCTCCTCGACCGGT
TCTGAAGAAAAAGAAGCTGCGTGTCGTTTGGTCAGGGAGAGAAGAAAAAA
AGAAGGAACGGGTATCATGGCAATAGTGTGTTAAATGTAGTTTGGTGTGA
GGATAAAATCGTCCAAAAAAGTGTAGGAAGGAGGAGAATACTCCGTCCTT
TATTATTAGGTATTAGGTATAGATGAATCATATGCCACTTGCACCTTTCA
ATTGTTCTTTTCTTACCAACAAGCGTATCGCGCTCTTGTTACGAATTGAA
TATGTCTGTTCCATGTTCATTCCTATTGTTCTATCCCATGGCATTTCTCA
CCATTTGTAAATATTGGATACTAACAACTACAGCAATGTGACAATCAAAT
CTACAAATGTATAATTTGTAAATCTCAACCAGATTAATTGTCCACATAAC
TGCTACCAGCATTGCTTCTATTGTCTTTTGAAAGTAACCTTGATTGATAG
ACTACTAAACATAAAAAGTTCATGATTTTTTCGTACAATAAGGCATGTTG
ACGAGGATGATCCAGTCCCAAGTGGTGATAATCATGCTGATACACAATCG
GCAGTGGCTTCTGACATTGAACATGTACGCTCTTCAGGGTTCTTTTCCCA
CCATGTTCATTTTCATTGCATGGTACCGTTTGAAGTCTCGTCGGTCTCCC
ACGAGATTATAGTGGTCTCAGTATATTAACTTTTTATTTATTTATCTAGG
ACGATAAAACAAAAGAGCTTGTTTCTGAATCTGCTGAGCTTCATGATGGA
AAACCTGCCGAAAGCAGTAGTTCAAAAACTGTGGAAGTTATGAATGATAA
TGTGGTTCCCAATAAAGATCCTACATTAGTTTTTCATGAAAAACTAGCAG
TGGAATCTTCTTCTGGAGTTACTGATTTAAATGGTAAGGTATTACATGAA
CTATCCCCAGATGGTCTGCCAAGTAAGGTAATTAGGACCAGCCAAGAATC
AAAAAAGGGTGACAGCAATCATTTAGAGCTTGAAGGTAAAGACCCTTCAA
GTTTTGAAGATGACGATGCTTTCTCCTTCCAGGCTGCGAGACAGAATATC
AATTTCCCCAAGGTTAGAACTCTCTGTATGGTAATTTGGCTTTGCACACA
GAAAAAATCTAGTGCTTTCTTGGTCAAGAATGCAGATACTTGATTCTTTG
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GAGGATTTATTCCCAGTTGACAAGCGGGGAGATCATGGGGCTGAAGCTTC
AACATCCACTACTGCCCAAGAGCTTCAGTATAATGGTCGACAAAATGACC
TTGCCAAGGAGCTCAAGGCTAGGATGGCAGAGAAGCAGAAGGAAAATGAA
AATGAGTCCATGAATGGTGGGAAACTTCTTCATCTTTTGCGTTTTAGGGA
TGGCGATCTTGATGGAGCGGTATTGCATTCACTACTGTGTTCTACTTTCC
TTTCTTTTAGAAAAAGCAAAAGATAGATGAGATTTTGATGACTGTGCCTC
TGACATGATATTATCATCAAACCCATTGTGCAGGAATTTCACGACAACAT
TCCAGGAGAGAATCTTTTTCCTTTACAGGTGTGCCCTATGCTAGAGCTGT
GATGCATTTGGCAACAAATAACTGCATTTATTTATGAGGAGCATTTTCAT
CTGTGGCAATCATCCTTCTAAACCATTTTATTCCATAAATTTTACATATG
GTGAAGTGTCCAGCTGAGAAATGGCATTGATTTACCTTTGTTCTTGGCAG
CGGCAGCGATCCACTGCTTGGTTGCAAATTCACAGTCCACATTAAATTTC
AATTGTCTAGACCTAGATATGTTGTTCTTCAAGGTGTTTTAAGTGAAATG
CCATGTATTTACATTACTTTATATTACTTTGATTTTCATACATTTTGTAG
TTATCCTGTCTTGACCTTGAAGTGTTTTCATTGCCTGCGTTTGCAGTCTG
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CAAAGTATTTTTTTGGTGGTCTTTACGCTGAAAATTGTCTGTTTATTTCC
TGCAGATTATATGCTCTGTTTTGCAACTTATCAACTACATTGTAAAAGAT
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TTTTGCTGTGCCAGATCGTGCAAAGGAAGTCCGGATGCAAGCATCCTTTT
TTCTTCAGCAGCTTTGCCAGGCCAGGTTTATTTCCTCACATAGTGGTGTC
TAACTATATTTAAACCCCAGTCAATGGAATAGAAGGTTTGGCGCTAATTG
TCAGTTTTCCATCTCCAGCACCTTGACGTTGCAAATGTTCATTGCATGCC
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TGCATTCTTTCGTATTACTAATTTTTCATTTCTGATTAATATATTCCATA
ATATTTTAAATTAGCAGGGAAATGGTTCATCTTGCAATTGATGGCATCTG
GCAGGTCTTCAAGCTTCAGCATTCAACTCCCAGAAATGATTTTTGCCGCA
TAGCAGCAAAAAATGGAATACTTCTCAGGCTAGTCAATACTCTCCATAGC
TTGAATGAAGCAACACGATATGCTTCTATCTCTGGGTCAGGTGTTTCAGT
CACACAGAATGGTTCCACCCCCCGACTAAAATCTGGCCAGTTAGATCTGC
CAATGCTAGAAAGTTCTAAAGCAAGGCTGGATCACTACCATTCATCTGGT
TCCCTGCAGTCTTTACAAGCAGATGGAGATAAGCATAATATTTTATTGGA
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GGAAGGTCATCAACAGACAGATCTCCGAGGCATATAGAACTAGTATCAAA
TGGGCATAGTAGTGGTCAGAACGATCAAATCCGACCCTTACTTAGTTTGT
TGGAGAAAGAACCACCCTCTCGGCATGTATCTGGACAACTTGATTATTTC
CGTCAAATGTCTGGATTAGAAAGGCATGAAAGTATTTTGCCATTATTACA
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TATGTCCGAGTTTTCTCTTTCAAACATCTCCCCTTTCTGTAGAGTTTTTC
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CCTTAGGATATATCCTTATAGTGCGGCTTGCTACTACTTTGCCTTTTGCT
CCTACCTCAGGGCTCTGCTACTTGTCTGCTTCTCCCCAGCCTCCCTTGAT
CGGTGAGGGGTTAAAGTTTGGGTTTACAGATGAGCTTTGAAAAGGGGTTG
GTGGTGGTTGCAGGGGTGCCATGGGTCTGGCAAGGTTAACCGATGGCAAG
CATGTTGCAGGTAGAGGATGGGGTGGGTGGAGGAGAAAGGGGGAGGTAGA
GAGGGAGACGTCCAGCTGGGAAAGATATGGGGAATGGAGAGTAGGAGATG
CGTAACACGTTGCAGACTATAACGTGCACGGTGCAGACTATAACGTGCAC
GGTGCAACCTGTTGAGCAGCAATAGCTGCTGCCCTTTTCTTATCAGGGAA
AACGTCCAGCTGGGGTGGGTGGAGGAGAAAGGGTCTGGGAGGTAGAGAGG
GAGACGTCCAGCTGGGAAAGATATGGGGAATGGAGAGTAGGAGATGCGTA
ACACGTTGCAGACTATAACTTGCACGGTGCAACCTGTTGAGCGGCAATAG
CTGCTGCCCTTTTCTTATCAGGGAAGAGTTCATATTAGGGATTATGACCA
TCCACACATGTTGTCATAAGGGTTTACAAACCTGGTTTCAGAAGAAGAAA
AAAATGAAGTTTGGTCAGAAGGCAGAACCTAATGTATATTTTTATCGTCC
TGTCGGATTTTTTCCTTCTCCTTTATTTTTCTTATGGTTAGCTTGTGTTA
TTGCTAAACTTGGCAGACCAGTCTGTCGAAAACACATGGAGCCTGATTCT
TGATGTTACAGCAGCTCCCTTTAACCACCAGGAAACAATTTCTGGGCAAG
CTGGTCTGCTGGACCTTGTGTACCCTGGTTTGCATTTTAATGAAACAAAA
AGGTAGAATAGAGACTTAGCAGAAGGGACAAGTCACAAGTAGCATAGCTA
AAACTCAAAAGCAACCAGATAGAGACATGGCAGGACCCTTCAGAGTTTCA
ATAATTCAAAATCATAGCAGTGCAGGGATCAGTCGTTTCTGTTCTGCTCA
CCATCTCCTCTGTCCATTGGGTACTTCGCTTCAACTATTCCCCTGCTGCT
GACTTCTACAAGTTACTGGGTGTTCCAAAAAATACACCGATTAGGTTTTT
GTAATTCTAAACTACTTAAATATAAGTTCCCAGTTACACCAACTAAAAGT
ACATCATTGTATTTTGTTGTGACTCTTTGTTGGGGGTGTGGGTGAAGCAT
GCAGTGTTGATACTATTAAATACTGTGCAAGTAATGTGAAGGGGTTTAAT
GTGATAGTACAACCTTTCTGTATGTTCTAATTGCTCTTTGTATTTTGTGC
AGAGGTTTCTAGACAGGGAAGAGAGAATGGTAACATTGATTCTAATATAA
AATCTGCCAATAGAGTTCCAAGTATGAAGTATCCAACAGCTTCCAACGAG
GGAACATCAACATCCGGAGGAGCATCACAGACAGCATCTGGTGTGTTATC
TGGATCAGGAGTGCTCAATGCAAGACCACCAGGAAGTACAACATCATCTG
GTCTATTAGCTCAAATGGTTTCTATGAGTGCAGATGTTGCACGAGAATAT
CTAGAGAAAGTGGCAGATCTTCTTTTGGAGTTTGCACAAGCAGACACCGT
TGTAAAATCTCAAATGTCTAGTCCAAGTCTTCTAGCACGGCTGTTTCAGA
TGTTCAACAAGATAGAATCTCCTATTCTTCTAAAGGTAAGGCTTGAAGCA
TTTACAAACTGTTTCTGCTAACTTTTCAGGTGAGGTTTGTGTTTTCCATC
TCTGATATGAAACAATGTCTTCTTTTCTGCAGATTCTTAGGTGCATTAAT
CATTTATCTGGTGATCCTAATTGTTTGGAGACACTTCAACGCACAGATGC
TATCAAGCATCTGATACCAATTCTTGAACTTCGGGATGGACCTCTAATTT
ATCAAATACATAGTGAGGTGGGTGACTTAAACATGCTTAGTTTGCCAGAA
AAAGATTCCCCTTTTATGCATTTTTAGTTTATCTTCTTGGATTAGACTGA
GAACTCATAGACTGAACCACCTTACATTTGGTAGAGATAATCAACACAAC
AGAGCAATGATGTATGCAACATCTTAATTTCTTAATTATTTTTAGAACAA
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TTTTGATGTAAGTTTCTGTGCACATCATAACAGCCTCTTCCTTTCTGGTC
TTTAGGTCCTTAATGCTCTGTTCAACCTTTGTAAGATCAATAAAAGAAGA
CAGGAACAAGCAGCTGAAAATGGGATCATCCCTCACTTGATGAATTTTGT
CATGTCAGACTCACCCCTTAGGCAGTATGCTTTGCCTCTGCTTTGTGATA
TGGCTCACGCTTCTCGCAACTCTAGAGAGCAGTTACGGGCTCATGGAGGG
TTGGATGTGTACTTGAACCTGTTGGAGGACGATGCATGGGCATGTACTGC
TTTAGATTCCATTGCTGTTTGCTTGGCTCATGACAATGATCACAGAAAAG
TAGAACAAGCCTTGTTGAAGAACGATGCCATCGAGAAATTGGTGAAGTTT
TTCCGAGACTGCCCCGAACAGTATTTTGTCCATATACTGGATGCTTTCCT
CAAGATAATCACGTAAGAACACAGAGGGTATCATTTCATGTTCGATGTTA
TCTTGTTTAAAATGACAGAGTATATTGATAGATACATATTTATGCAATGT
CACCACAGGAAATCATCTCGGTTAAATACTGCAATAGCCATGAATGGATT
GACGTCATTGCTTATTGCAAGGCTTGACCATCGAGAAGCTATTGCACGGC
TGACTCTGCTGAAACTAATAAAGGTTTGTTGTTTATTCTTAGCTTTCATG
CTCAAGCGATTCTATATAAAATGTTCCATTTAGTTACATATATGATGTGA
AACTTGTAAGTAATATGTGACTGTATGCAACCTTTTTCCAGGTTGTCTAT
GAGCACCATCCCCGACCAAAGCAGCTCATAGTAGAGAACGATCTTCCCCA
AAAGCTACAGAACCTAATTGAAGAACGCAGGGATGGGCAACGTGGCGGTC
AACAAGTGTTGGTCAAACAAATGGCCACCTCGCTGTTGAAAGCGCTGCAC
ATCAATACAGTCTTGTGATTTCGGGCCACCATGTATTTTTTCCTCTCAAA
TTGTACATGTTTGCCCTGGAGGAAAAAGTTTTCCTTTTCTTTTCCCAGCT
GTGATTTCCCTTGTCATGTGCACCGGACAGCCTGTTGCACCTGCTCCCTC
TTTTATCGGGAGAGAGGTTTGACGGTCCGGTGCAAAGATAACGGGGTTTG
TAAATCCCTGCATGGTTGTTTGTACTTAGTGTACTGTTAGTGAAGTTGCT
GTATACTACCTGCCTGAAATTTTCAATAGAACAGCTGGTGTAGTAGACTT
ATTTGTGTCTGCATCTTCTTTTAGTGAAATTTTACCTGTTGCTTGAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.