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GrainGenes Sequence Report: AA004247

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Sequence
AA004247
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004247
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCATCTCCCCCGAGCGACGTGTACCCCTCCTCTCCTCCTCTTCCTTGC
CGCTCGGTACAGGCTAGAGTTCAACGTGAATCCCTAGCAGGCTCGCACCA
CGTAGCTGGTCTGTCCGGTTCTCCCTCGCCTGATCTCCCTGCCACGGCGT
CGCCGCCATTCCCTCTCCTTGCCAATGCGGCTAACTCCCGCTTCCCCTCC
GCATGATGGGCTTGTTCGACACCTCCTCTTCGTATGGCGGGGTCGCTGGC
CTCTTCCCCTCAACCGCGCGTAACAAACGAGGAAGGCGTCTTCACCTTCA
ATTGCTGGAGCCAGCTCGGTATGATTTCCGCTCTCTCTTCCAACATGATT
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CGATCAAAGTCATTGAGTTTATATTGCTATAACAACTTACGAAGTGATCC
TAATCCTTAGACCATAAGATCATGTAAATCACTAGAACCGGAAGAGTTTA
TTGATAACATCAAACGTCACACCGTAACAAGGTGATTATAAAGATGGGTT
CAGAACTAATAAAGTGTTATGTTGAGGCCCATGGATCGAGGGAATTTGTT
CATCCCGATGACGGATAGATATACTCTAGGCCCTCTCGGTGATATCATAT
TGGTTAGCTTGCAAGCAAGTGATTTGATCACTAGAATGTTATATCACGGG
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AGATACTAGCGTAAAAGGTTCCGACGATGACAAGAAAGTCATCGTTGAAT
GTGTGGGAGTCAGTATGGGTCTCCAGACCCCGCTTCTGATTATTGATCCG
AGAGGGGTCTCGATCATGTCCGCATTATCCGCGAACCGTAGGGTGACACA
CTTAAGAGACACCGGCATACATTTGGATCAAAAGTTTCATGCCGGAAAGA
ATAACAAGCGCAGGAATTTATTTTACTAGATACAGAAACAGGTTTTCGGG
TGAAATTGCAGAAAGGTTTTTGCATGTGAAATATAATTCTAGCAAGGGGT
TACATGTGAATGTTTGTCATTAAAGTAATTGACAAAATTCTGAATAAATA
ATTTTTTTTATTTAATGAGAGTTTGAATTAAATTTGGTGAAAATTTAATA
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TCCTCACTTCTCACTCACACCTCCTCGTGAAGGATCTCTCTCCCCCTCTA
GAATTTATCCCCCATGGTCTCAGACTAGCGAGATACATGTTCCCGGTGGC
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GATTTGCGGCGCTAGGACTTCCTCTCAATCTTGAGATCGGCAAGAGATCG
TCTACATAAACCACGAGTTTAACTCGTTAAGCTTTGTCGGTCTTCAAGGG
TATGTTCTCTACGGATATACATCCACCCGTTGTTTGTATCTAGTAGATAG
ATCTTGGTACATAGTTGTTTCCATCGTAGGAATTTTTTGTTTTCTATGGT
GCGAACCCTATAGTGGTATCAGAGCCAGGTTTATGCGTAGATGCTTTACA
CGGGTAGTACACATATGAGTATGTGGGCGATGATGATCATGTTGTTGCTC
ATATTGGTGGCATAGTGGGATGAAGCGGCCCGGAAAAACTTTACATGTCC
TCGCACATGAGACCTGTTCCACGCTTGACATGCAACTAGTTTGCATAAGT
GGCTAGCGGGTGTCTGTCTCTCCTACTATAGTCAATATCTATTTTGCAAC
GAGTTGTCAAAAATTTGGTTATCCTCGTTGTGGTTCATGTTCGTAGGTAT
GAACGGTTCTATCTTCGAAAGCCCTAAGCCACATAAAACTTGCAATGGAT
AAATTAGAGGCGTCTAGTTTAGATTGTTGCTGGGCTAGTGTTATGATATG
GTGATGTTGTAAGTAGAAGTATGAGATGATACTCTTACAACACACATAAC
GTGTAAGTTCCATAGACCTTGGCCTTACACATAAAGGTATGATAGTGATC
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GTTCTTCCTTTAGTATGCACCGATTATGTTTTCGTCGCTCCAAGACATCA
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AGTTACACATGCGAATACTAAGGTTCTTACTTGGCGAGCCTAGCATGTAG
AGACATGGCCTCGGAACACAGACCGAAAGGTTAAGCATGAGTCATATAGT
AGATATGATGCCCATTTGATGCTCGCCTTTGAAGCTACACCGACTCACGT
GATGATCAGACTTGGTGTAGTAAATTTGGTTCATGTAATCACCAAAAAGA
CACGAGGGATGTTGTTTTTGAGTGGGAGTTCATTCGTAATGTGGATTAGT
TGAACTCAATCTATCATAAGCTTAGTCTAAATTTTACAAATTCTATTATA
GATGGCACCACCTGCTTTTAATTTCAACGAGTTCATGGAGAAAGAGAAAC
TTGCAACGAACGGTAGCAACTTTACCGAATGGGCCATGAATTTGAGGATT
CTCCTCTCTGCTGCACAAAAGCAATATGTGCTAGAAGAGCCGCTAGGCCC
CCCACCTTTTGAGGATGCCCCTGACGAGGAGAAGAATGTCTACCAGACTC
GTCAGGAGGACCACAACTTAGTTCATTGTGGAATATTGTATGGGCTAGAG
CCAGAACTTCGAAAGCGTTTCGAAAACGGCAATGCATTTGATACAATGGG
GAAGTTGAAAATGATTTTCGACACACATGATGCTGTAGAGAGCTACAATG
CTTTAGAAAAGTTCTTTAGCTGCATGATGGAAGAGCACAGCTCCGTAAGT
GAGCATGTACTCAAGATGTCAGGTTACGCCGATAAGCTTGTGTCCTTGGT
AATATCGATTCCCATTGACTTAGGCATCCATCGTGTTCTGCAGTCTCTGC
CACCTAGCTATAAGAGCTTTGTGATGAATTATAATATGCAAGGCATGAAG
AAGTCTCTCCCCGAGCTTCTGTCAATGCTTAAAACTGCAGAAGTGAAGAT
CAAGAAGGAACATCAAGTGTTGATGATCAATAAGAACACTGGTTTCAAGA
AAGACAAGAAAGGGAAATGGAAGGGAAGTAAGGGCGGCAAGCCGGTTGCC
GTGCCTGAAAAGAAACCCCGAGTTGGCCCTAAGTCTGATACCGAGTTCTA
CTATTGTAAGGGGACTGACCACTGGAAGCGCAACTGCCCAAGTATTTGGC
AGACAAGAAGGCCGGCAAGGCAAACAAAGGTATATATGATATACATGTTA
TTGATGTGTACTTGACTAGTGCTCGCAGTAGCACCTGGGTATTTGATACC
GGTTCAGTTGCTAATATTTGTAACTGGAATCAGGGGCTGCGGAACAAGCG
ACCGCTAGCAAGGGGTGAGGTCAAGATGCGTGTCAGCAATGGAGCAAGCA
TTGATGTGATCGCCGTCGGAACGCTGCCTCTCCACTTGCCATCGGGATTA
GTAATAAACTTAAATAATTGTTATCTGGTGCCTGCACTGAGCATGAATAT
TATATCTAGATCATGTTTGATGCGAAGTGGTTATTCATTTAAATCCGAGA
ACAATGGTTGTTCTATTTATATGAATGAAATCTTTTATGGTCATGCATCG
ATGATGAATGATTTATTTCTATTGGATCTCGATAATGATGTTACACATAT
TCATAATGTTGATGCTAAAGGATTAAACTTAATGATGATATATCCGCATA
TATGTGGCACTGCCGTCTAGGTCATATTGGCATTAAACGCATGAAGAAGC
TCCATTCGGATGGACTTTTGGAATCACTTGATTTTGAATCATTTTATACA
TGTGAGCCATGCCTTGTGGGCAAGATGACTAGAACGTCATTTTCCGGTCC
AATGGAACGGGCGATAGATTTATTGGAAATCATACATTCTGATGTATGTG
GTCCAATGAGTGTGTCGGCGCGAGGTGGATATCGTTATTTTGTTACTTTC
ACGGATGATTTGAGTAGATACGGTTATATCTACTTGATGAAACACAAGTC
TGAAACCTTTGAAAAGATCAAGGAATTTCAGAATGAAGCGGAAAATCATC
GTAATAGAAAAATCAAATTTCTACGGTCCGACCGTGGAGGTGAGTATCTA
AGTTACGAGTTTAGCACTCACATGAAAGAGTGTGGAATTGTTTCACAACT
CACGCATGCCAGAACACCATAGCGAAATGATGTGTCGGAACGTTGTAATC
GTACTTTATTGGATATGGTTCGATCTATGATGTCTCTGACGGACTTGCCA
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GCACCATCTAAATCTATTGAAAAGACACCGTATGAATTGTGGTTTGGAAA
CAAACCTAAGCTATCATTTCTTAATTTTTGGGGATGCGATGTTTATGTGA
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ATAGGATACCCTAAGGAAACTATTGGGTATTCCTTCTATCACAGATGCGA
AGGCAAGGTTTTTGTTGCCAAGAATGGATCCTTTTTAGAGAAAGAGTTTC
TCGCGAAAGGTGTGAGTAGTCGGAAGGTAGAACTCGAAGAGGTTATTGAA
CCTTCTCTTCAAAGTATGGCGAGTAGTGCAGCGCCGGAAGTCGTTCCAGA
GTTGGCTTCACCATTTGAAGAGGGAACTAATGATAATGATCATGAAACTC
CGAAAGAAAGTACTACCGAACCTCGCAGGTCTAGCAGGACGCGTGCAGCT
CCCAAGATGTATGGAAACCCTGTTTTGAATTTCATGGTTGATGAAATTGA
TGACCCTGCGACATATGAAGAAGCGATGATGAGCCCGAATTCCAACAAAT
GGTTAGAAGCCATGAAATCCGAGATGGAATCCATGTATGAAAATCAAGTT
TGGAACTTGGTGGAATTACCTCACGACCGAAAGGCTGTGGAGAACAAATG
GATTTTCAAAAGCAAAACTGATGCTGATGGTAATGTGATCGTCTATAAAG
CTCGACTTGTCACAAAGGGGTTTCGACAAATTTAAGGAGTTGACTATAAC
GAGCCATTCTCTCCTGTAGCGATGCTAAAGTCAGTTAGGATTATGTTAGC
AATTGCTGCATATTTCGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACCG
CGTTTCTCAATGGTAATATTGAAGAAGAGTTGTATATGATACAACCAAAG
GGTTTTGTCGATTCTAAGGATGCTAACAAGGTGTGCAAGCTTCAGCGATC
CATCTATGGATTGAAGCAAGCATCACGAAGTTGGAATCTCCGCTTTGATG
AGGTGATCAAAGAGTTTGGATTTGTCCAAACTTATGGATAAGATTGTATT
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ATCGCAAAGTACATACCTTGATAAGAATTTAAAGAAGTTTAAAATGGACG
GAAGTAAGAAGTGGTTCTTACCTATGTTGCAAGGCAAGACATTGAGTAAG
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GGATGTGGAACATGCTATTAATTTGACTAGTAGGTACCAATCATATCCAG
GTTCGGAACACTGGATAGCGGTCAAGAATATCCTTAAGTACTTACGAAGA
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AATCCGAATACGTATTTCTCATGAATGGCGGAACGGTTAGTTGGAGGAGT
TCCAAACAACCTGTGGTGGCGGGATCAACAATGGAGGCCGAATACGTTGC
TGCTTCGGAAGCGGCTCAGGAAGCGGTTTGGATGAAGGAGTTCATATCCG
AACTAGGTGTGGTTGCAAGCGCGTTGGACCCAATGGTGATCTATTGTGAC
AATAATGGTGCCATTTCCAATGCCAAAGAACCAAGGTCTCACAAGAATTC
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TTGACTAAAATGGGTGTTAGATTCATCACTATATAGCTAGATTATTGTCT
CTAGTGCAAGTGGGAGACTGAACGGAATATGCCCTAAGAGGCAATAATAA
AGTGTTTATTATGTCTATTCCAAGTATATGATAGATGTTTATTTTGCATG
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AACAGAAAGTTCCTAGTTATGTCTCTCTCATAAACTAGCTCGTTGATTAA
CAAGATGATCAAGGTTTCCTGATCATGGACATTGGATGTTGTTAATAACG
GGATCACAACATTAGTGTAATGATGTGATGAACATTCATCCGAAGTATAA
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GATCCTAATTCTTAGACTATGAGATCATGTAATCACTAACACCGGAAGAG
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GGTTCAGAACTAATAAAGTGTTATGTTGAGGCCCATGGATCGAGAGTGGA
AATTTTTTATCCCGATGACGGATATATATATTCTGGGCTCTCTCGGTGAT
ATCACATTGGTTAGCTTGCAAGCAAGTGATTTGACCACTAGAATGTTATA
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GTTGAATGTGTGTGAGTCAGTATGGGTCTCCAGATCCCGCTTCTGATTAT
TGATCTGAGAGGGGTCTCGATCATGTCCGCATTATTCGCGAACCGTAGGG
TGACACACTTAAGAGACACCGACATCCATTTGGAGAAAAAGTTTCATGCC
GGAAATAATAACAAGCGCAGGAATTTATTTCACTAGATACCGAAACAGGT
TTTCGGGTGAAATTGCAGAAAGTGTTTTTGCATGTGAAATAGAATTCTAG
CAAGGGGTTATATGTGAATGTTTGTCATTAAAGTAATTGACAAAATTCTG
AATAAATAAAAAGAGTTTTATTTAATGAGAGTTTGCATTAAATTTGGTGG
AAATTTAATAGCAATTTTGAGTGGAGGGAATTTAAAGGAATTTTGTGAGT
GGAGTGTCCACCCACATGAATGAGGGGAGGTCAAGGGGGAAGCCCCCATG
CGCCGGCCACCCCATCGGGGTTCCCCCTCCTCTCCTATAAAAGGCACCCC
CTCGTCACTTCTCACTCACACCTCCTCGTGAAGGATCTCTCCCCCCTCTA
GAATTTATCCCCCATGGTCTCGGACTAGCGAGATACATGTTCCCGGTGGC
TATTCGGAAAGAAAGAGTTGTGCTTCCGCTGCATCGCTGGAACGAGGAGG
CGGAGGTTGCTCGGTGCCTCGGACGTGTGTGCAAGCACGGATGCGCTGCT
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TCTACATCAACCACGAGTTTAATTCGTTAAGCTTTGTCGGTCTTCAAGGG
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ATCTTGGTACATAGTTGTTCTCATTGTAAGAATTATTTTGTTTTCTATGC
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GGAACTAATTGGGTCTATAGTTCTACCATTGGAAACTTTCACTCTGGCTT
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CATCTATTGAAGAAAGCGGAAGGTGAAGCCGAGGTCAACTTCTCGCACAC
GGTGTCGGGCACCACTACGAAGAAACATGAGAAAAATGATTGTCCATGAC
CTAGCCAATGTGGAATTTAGAAAAAGCTAATGTGCTAAAGAAAAATCTCT
AATGCAGGAGAGATAAAGAAAAGACTCTGATACAGTAGAGATATCATGGT
TGCCTGGTGATCAGAGGATCAGAGGAGACAGACAGCAGGTGCCAGGACCG
GTGACGGTGCCATCACCCTCTTTTGATCCGGGGCCATCGAGACTGGATCG
AGTCGCCATGGAGTTAGATTGAAGACGGGTCATGAGTCGAAGGATGAAGC
CAGGTTATCGGCAAGCTCGAGCGTGATGGGAGAGACCTTATATATCACGC
GGGAGTTATTGTGGCATAAAGAATGCATTGATCTTTGGCAGCGTGATTTT
GACTGCGTGATCGACGTGGAAGGAGCGATGGAAGAAAAACGAGCATTAAC
TATGGGTATAATTATTATTATTGATTGATCATTAACCGAGTGTAACGCTG
CGTGCTGGGTTAGGCCCATTTGGGAGCGCAAAGAGGAGCCTGAAGGAAAG
GACGTAGTGACCCACATAGATGCGTGCAGGATGAGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.