Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA018386

[Submit comment/correction]

Sequence
AA018386
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018386
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCAAGGAATAGTTTAATACTTTTTTGTTTAACTATCAACACTAAAGT
GCATGTACATGCATTAGAAGAGGAAAGAGAACACATATTCTTTATGTGAT
TTTATTCGGTTGTAGGACATGTTATACAAATATTTGGAACTAGCTACGTT
GTAAATCTGTTGCCAAATTTCATACCAATACCAAATAGTACTTTATCAGA
AATATGGCTATAACAACACTCTGGGTACCCTTAGTCAACAGACTCGTACT
CCCTCCGTTTCAAAATATAAGACGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGAATC
TAGACTTGTTTTAGTATGTAGGTTCATTCAACTTTAGGATGAATCTACGC
ACTAAAGAAGTTTAGATTCATTTTTTTCACAAACCTAAAACATCTATTTT
GAAACGGAGAAAGTACAAACAAATAAGTTAGGAAGTCGGGATGGACTCTC
TAATTGCACCCATCCCTAGCAAGGTGTGGAGATTCTACTTCGAAGCTAGC
TGCTTCGATTTTCGAGGGTGCCTATTTTAAAAAACCCTTTATTAGTAAGG
AAAGTAATAAAATGTAGGAGAATTTATTTCAAACAAATACTCGAAAGAAA
TAATTCGATTACTATGGTGCCCGCTGCTATTTCCGCGCGATTTTTTTTAA
ATAATACACTTTTTTTAATATTTTTTAGATCTATTACACGTTTTTTGGAT
TTTACAAAAGTAGTACTTTGTCGGTCTGGAGGAGGCCGATTGGGTCAATC
AGACTGGAGCAAGCCGACTGGGCGTCGGCGCGTGGGCCCGCTGGGCTGCG
TCGGCCAATCGGCCTGGGGCAGGCCGACTGCCCAATTGGCCTAGGGCAAG
CCGACTGGCTCAAGTATGCATGGCCACATGCATGGAGGATTTTTGCATTT
TGGCATGAAACATGGGTGCATGCATGCAGAGTAGGGGCAGTCTGCTTGGC
CCAGGCCGACTGGACAGTCGGCCTGCTCCAGGCCGATTGGCCAACGCGGG
CCCCAGCTGCCTCACGCGCCGACGCTCAGTCGGTTTGCTCCAGGCCGCAA
TCGGCCTTCTCCAGACCTACAAAGTAATATTTTTGTAAAATGTTAAAAAT
GTGTAATAGATCTAGAAAATATGAAAAAAAATGTATTATTTAAAAAAAAT
CGCGCTATTTCCGCCCCTAGTCTCCTACCCCAAATATTCGTCATACTCCA
TGGAGCTTTTTGTTCGGGTATTCAAGTCACCTCTCTTTTCCACGTACATG
ACTATTTAATTAGGGGTTAGTGCACTACTACCAACAATTCATTCAACTAT
TTCTATTGTAAGATCCTTAAACATTACTGTAAATCATTGTTTGTTCTGTG
TACAGTGCTTGTGGAGAAGATACTGAGGGTTCAGCCTGGTGTCAAGAAGC
TCTTCCTCTTGGTTCGAGCCACCGATGACGGATCTGCAAAGCGTCGGATC
CAGACTGAGGTAAAGTATTTTTCTTCGTCAAACGTTTTTCTTTCTTCCAC
AACAGTTTATATAACACTCCCGGACAGATCCTGAGGTGCATCCGATGTTT
TTGACAAGTCAAACTCAAAAAAAAAAAAAATTAACTGCAAATAGCCCTGT
TGCAAACTCTGCAAATTTCTTTTTCCGAGAAACTGCTAATCTTCTCCTCA
GCATTTATTCTGGGAAATAGCTCACATGTGGAAGTAATTTACAAACATGT
CTGACAGCTCAAAAAATTATGACTAAAAGGAATAGTGAATTACAAACATC
TATCTATTATATACTAAAAGCAATATAAGGAGGTGTTTCGAGGTATCAGG
TTGATCCACATCATCTGAATTATGTTGATCGTTAGATTTAAAATTTACGG
TTAACATATAGCAGAAGATTATTAGTTACGTAGCCTATTTGACACGATAT
ATGTGTTGAAGATAACGTGTGGAATATAATTAGGTGTGCCACTGAAGAAA
AACGTCCACAAATAAGAGCCGTGTACGCGCACCCTTGGCCTTACATGTGG
TCGTTGATATTTTGAGAAGATTACAATACGTGTGGAATGTGGACTTCCAA
GAGCTGTGTGGGCTGGAACGTGGATCGTTGTTAAAATCGTCTAAGTCGAA
AAAAAAGCTAGAACGTTGTAGCTGTGAACCCTTTGTTCTCGAATGTGGAG
TTGTTGAAAAAACGTGTAACCTTTTTTTAGATGAAAAAACAAAAAGAAGT
GTAACCAGGTTGGTATACTACGTTACATGTATGAGTACACATAAAATAAT
ATTGCATCCGTCCAAAATTAATTGACCCCACTTTGTCAAAGATTTGTGTG
TATCATGCATTATGCTTATGTAGAAAAACTTAAGTTAATTAAGTTGGCAC
CGAGAAAATCAGTTTATTTGACTACAATTAGGTCCATGTCCCATAACTAG
ATCCAAGCAAAACTAAAAGAAGTCTCACAGTCATTGTTAAAAAGATCTTG
GGACTTATAAACAAAAACAGAGGGAGTACTAAGGTCTATGCTTTGATTAA
TAGAATTTTTTTTTGGAAAATGTCATCTTGCATAGGAGAAAGGTGCTTTG
ATCAAATTTGTGGAACCATCTAGGCCTCCCATATAGTCGTAAGTATAGCT
GCTCCTTGTATATGTAAGACATTTTTATTTTTTAATTAATAGAAAACATG
CAAAAAAGGTTGATATGCAATACCAAAAGTAGTTAAACCACACACGTTTC
ATGAAATTTCACATCGGCAATAATAAAATCAATTTAGTGAGTTCATGTAA
AATCATCAAATAGAAGGCGTTTGATTAAGGCATGAGTTTATAGGTATGGA
CCGTTATTTTGCTTCCTACTGTGTGCACACTTGAAGTGTTGGCTGCCAGC
ATCCTAAAAAGATCACTGTCTAACTTATGATACTAACTTATGATAACACC
CGCTATATGCAGCACAAGTGCCTCGCTGGGTTTGAGACGAAACCTCTAGA
AGGTATCATTTACATCAAAAGAAAATAGTTTGAGTGATTCGTGGTTTATC
AAATCGATGCCATTTCAATTCAATGGCTCAATGATAGCTCTGTTACTTCT
AATCAATTGTTCAATGATACTTTAGTGAGCTACTTCATGGAGTTGTATTA
TCCTGAAGTTACCATCGTTTTGACTCTACTATTAACATGTCAGTTTGTTG
AAGCCTTAGACATATGTGCCACCTATGTTAATTAGCGCTTTGGCTAGAAG
AAAAGGTACGTGCACACTCAAGGTCAAAATTTGAAGAATGTAGGAATGCA
ACAATTAATATATCGAGTAATGAACTCATGACCAATGGTATGATTTTATA
GATGATTAATTTCACACATTCAATATTTTCTTGATATAGTGTTTTTGCAT
AGGCCGGTATAATTTACCCATATATCGTGATCAAAGGCGGCCATAATCTT
TGAGCAAAGCTAATAGCTATAAAGGGTGGGTATTTTATACAATGGCGCAA
GAATTTGATGTAGAAGAATATGATTGTGGACTTATTTATGGAGATACTTG
AGAATAGAGTAAACATTGATAAGCATGACCAGGGAATGTCGATTGTCACT
TTGGATTTATAACATATGTTTTGTGTACATGACATTGGCACCATGTCGCA
CTTTCGCTAGCATAGGAAACTATATACATGTCATTCCTAAGAGTCACACA
AAGGGATTTGGACTGTGTATAATTATCTACCATGAAGATAGCGTTGTGGT
TCATATGGTGAATAGCATAGTGCACGAATTTTTACTAAAGGTACAAAAAA
TTCCACCTTTCCTATAATGGTTCTTTCATTTGATGTTACTGGTCTTTGAA
ATAATTATAAATACATAGAGAACATTATTTTTGGTTCAGTGCAAATAGTC
TTCCAACTAGAATTAGCTTACATCGCTTTTGTGCACTACATTGATGAAAA
AAGTTAATCAAAATCATTAAAAGTTTTAGACAATTATGATATAATGTGAT
CACCAAGATTATGTTTACTTATGGTATATATACCAGAAGATAGTTTTAGA
TCTCTTATTACTATGATACTAGAAGACAGAGATACTCTATATTGAATTTT
TTGTGATAGACCAAGATAAACCATCTAATGCTTTTAATATTACAAGTTTT
TGTAATTTTCATGTATTTTTAGAACATCGATGCTATATGTGTCTACTGCA
AAATATTCAAAAGTATTAATAACATGTATGTATATCTATGAATATGATAT
CCTTTACTACAATGGACAACGTTTAAAAGATCTTAATAATTTCCCCAATA
CATATTATCTTACCATTTCTATTGTAGAATTGAATTATTATTTGGATAAC
AAAATTAACATCCTAAAATATCAACCTAAGAACTTTACTAATGATCTAAC
ATCACATAATCGCCAAGCTAAAGAGTTCAATAAAATCCAAATTAATGTCT
AATCAAACATAAAAAAAATATAAATATGGTCATTCGTGTGAAATTTTAGG
ATGGCATAATCACATGTTTTCCACAAAAATAAAACATGAAGAATTTTTTC
AAAAATTTAATTTTATATTTAGGTTAAATTTGTGGTACCTACATAACCAT
ATTATTTACTATCATATAAAAGGTATAAAATAATAACTTTCTTTCTCAAA
CATACAATATGCACTAAGCATAATTCCCTCGCATTTGCGAGGGCCACTGT
GCTAGTTTATAATAACAATAACATGTCTTAAAAGTGTCAATAAGTAAGCC
AAAACATGGAAAACTTTATATAACTCAAATTAAATTCATCTTGTGGTAAT
CCTCACCTGAAAGTGCAAACGCTATTTTGGTAACTTCAGGTGATAGGGAA
GGAGATCTTTAAGGTTCTGAAAGAAAAGCACGGCAATAATTTTGAACACT
TCATCGAAGAAAAGTTATGCCCTTTGGCAGGAGACATAATTCATGAGAAT
TTTGGGCTACACAACGCCAAGCTGAAAGAGCTGTCGAACGATGTAGACAT
CATCGTCAATGGATCTGCTACTACGAATTTCTACGAAAGGTTCAGGACTG
CTTCAGTGATAAATTGCTCCCTTACATTTATGCTGTCAAAAAATAATTGG
TCAAAATTCGATGGGCTTGCAGATATGATGTTGCTTTCGACACGAATGTC
TTGGGAGCAAAGCATATATGTGCATTTGCAAAAAACTGCTCCAAACTGAA
GATGTTGCTACATGTTTCAACTGGTGCGTAGTAATAGGATCATATATGAT
TATATATGTTCTGTGCAGTATTATTCCAATTATGTTTATTAAGCAATTCT
TATTCTGAATTCTGAGAAGTTAATGACTTGAACAGCTTATGTAGCTGGTG
AACAAGAGGGATTAATACCAGAGAAACCTTTCCTGATGGGTGAGACACTA
AGAGAAGGCACACACTCAGACATCGAATCCGAGCTAAATCTGATCAAAGG
TACCCTGATACAACTGAACAATAATTTTTCTTCAGAAAAGACCGAGAGGA
GAATCATGAAGGAACTTGGTCTCAAGAGGTCAGATAAAAAGAAGAATAGA
AGAGCAATGCATATATACTACTTATGTACTACATTTCAAAACCTTTTCTG
CAACTAACACTACGAACCTGACACGTTTGTGATATACATGATTCTAGGGC
TAGGCAGTTTGGGTGGCCAAATACCTACGTTTTCACCAAGGCAATGGGCG
AGATGGTGCTGGGGCACCTGGGATGCGACCTTCCGGTTGTCATCGTCCGG
CCGAGCATCATAACCAGCCTCCTGAAGGAGCCATTGCCTGGATGGATGGA
AGGAATCAGGTGATGAGTAAACTCAAAATTCCATTTCATGTTCTCTCCAA
GCAATCACTGAATTTTTCTTCTTCTTCAGAACAATTGACTCAGTGATCTT
GGGCTACGCTAGGCAGGCCTTGAAATTCTTTTTAGTAGACCCGGATACCA
TAATGGACGTGGTGAGTTTCACATCCCAAACTTGAAAAAAAAATACAACT
TCATCAGATTTTACATACTCACAACAAGGGTTCGAAGTTCGGACAGATTC
CCGGGGACATGGTGGTGAACGCTATGATGGTGGCCATGGCGGCGCACTCC
AAGAAACAAAAGCAGACCATCTACCACGTGACATCGTCGCTGCGCAACCC
AGCGTCCTACACGATTCTCCAGGAGACGGCCCATCGATACTTCGTCGACA
ACCCGCCGGCAGGGAAGAACGGCGAGCCGATCCGGCTACACAAGATGCGC
TTCTTCAGCACGGTAGCCCGGCTCCGCGTGTTCATGGTTATCAAGTACAA
GCTCCCTATCGAGGTTCGACTGTGATCTGTGTTCTCGCTCGCCATTTCAA
GTTGCAAAAATCATTGTTTTCAAAGACGAGAATGAGCTCAAGTTTCTGTT
ATGGACTTATGGTTGGACTTCGACAGATCCTTCACCTGCTTAACATTGTG
CTCTGTGGTGTTTTCTCGCGGCGCTGCAACGAACTCAGCGGAAAATACAG
ATTGGCCATGAAACTGATCGAGCTCTACGCGCCATACACCTTATTCAAAG
GATGGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.