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GrainGenes Sequence Report: AA039781

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Sequence
AA039781
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039781
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCGCCGCCGCTCCCCGTCGTTATCCTGCCGCCGCCGCTTGTCGACAT
GGCTGTCCAGTATCTGCTACCACGGTAAATCGAGCTATTTGTTGTATTGT
TGATGAATTATTTGTTGTATTGATGATGAACTATTTGTTTGTGTTACAAC
ATTAATTAAACTATTTAATATTGATTTATTTTATATGTGTTTGATCTTTG
TTGTTCTATATTTGTGTCTGTTTGATGTTTATGTTGCCGCACTACCATAT
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TATCGCCGTATTAGACTAGTCATAGTAGGAGTAACTTGAGTGATAACATA
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CGTGGGTTCCCACACCTCACCTCGCCGCCGCCGCGCCTTCCTCCCCCGAT
TTAGGGACACCTGGTCTCAGGCAGCAGGATACCATCGCGTCGGCGTCGCT
GCCGTGGAGGCGCGGTTCCGCGAGCTCTGTTCTCGCCGCGTGAGGAGGAC
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TCAAGCGCGGGTGCAAGGAGAGCTGGACGAAGCCCAGAGCGAGGCAGCGG
CGCTCCGGGAGGAGGGTAACGGAGCTCGAAGACAACGGCGAGGAGAGAGG
GGGAAGGCGCTGACGGTAGAGGCGGCGATTGCCGGGCTGGAGGAGGAGAA
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AACCTCGGCACTCTACTGATTAAGCAACATCAGTACGAAGTACCTCCCGG
ATGCAATCCGGGATTACAGACAGAAATATTACAAGAAAAAGGCTCACTGC
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AAAAGAGTAAGTTGAAAATCCTTCTGCACGCTCCTTGATATTGCTCACCA
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ATGGAGAGACAATCAGAAGCCAAGATAATATGCATGAAATCATTGTCCCT
TGAGATCGTCAGCGCTTGTCTGATAGCGACTTCTTGCCAATTTTCATTGG
AACATTTTCCCTGACTGAACTCCAAACAGCTGTTGCAAAAGGGCAGGTCA
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GTGGACCATATACCATAACGCGATTTTCATCTTATTCGGGCAGTTAATCG
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ATGCAGACCTGATTGTATAGACGCCGAACTTGGCATACGGCCATGACGAA
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CCTTCCTGATTAAGGAGAATCCGCACCGTGGCCTCAGCTGTGATTGGCCC
CAATGTGGTGAAAGTTTCTGGTTGATAGCCAAGTACCCAGTTGTCATGCA
TGATCTTAATTTTTGTGCTGTCACCGACACCCCACTTAAGGCCTTTCATC
AATTGATCCCGACCGAAAAGAATAGATCTCTAGGTAAAGGAAGAGGCCCT
CGGCTTGCCTTCCGACAGAAAAGCTGTATCTGGAAAATAAGGGCCGGTCA
GTACCCTTGTGCACAATGATGCTGGCTCAGTAAGTAGACGCCAACATTGC
TTCCAAGCATTGCTTGATTAAAAAGGACAAAGTCCCTAAAGCCCATACCA
CTGAGAGATTTTGGTACTCCCTCCAATCCAAATTAATGGACTCAGATTTG
TCTAGATTCAGATGTTTCTAGCACTAAAACATGGCAAGATACATCCGAAT
CTAGACACATCTAAGTCCATTAATTTGGATCGGAGGGAGTATTGAACATC
CATGCATGTTTTTCTTACCATCCTCCCATGAACGCCAATGCATCTTTTAT
TTGTGTCGTGTGTACATGAGAAAGGTGTCGCTTGCGTTTTCTTATGTCAT
GGAACTGACCTCTCTCAATGCATATACCATTGCTTATTGTAGTACAATTC
CAAATTACTTCTTTTTAAGCCATAGGGACATGTCAACTATTGTTATATAT
CTCCGCCAATATATGTATTTATCTATTATTTGTGAACGTCATGCATATCC
ATACACTCACTATTTGTTTTTAGTATTAGGAGATGGAGAATAAAACACTG
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CTTAAAACAGATTACTAATAATTTTTCCAAGGACCGTATAATTGGTTCTG
GTGCGTATGGTGTGGTTTACAAGGTATCATTGTTATTTGCATCCTTTACT
TGGGCTTTTACTTTCCAAACAAGACAATATGACCGCTAATAACAAGAGCC
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GGAGGAGATTGCTGTCAAGAAGCTTATATACAGGCCTTTAGACCATGACA
ACGAGAAACAATTTCACAATGAGTGTATCAACCTTATGAGGGTCCAACAT
CAAAATATTGTGCGGTTAGTTGGCTACTGTGATGAAACACATCGTCGATG
TGTTGAATACGATGGAGGATATGTTTTTGCTGATGAGAATGAAAGAGCTC
TCTGCTTTGAATACTTGTCGGGGGGAAGCCTTGACAAACACGTCTCTAGT
AAGATCATGCAGTGCATAGAAAATAATATCATGCTTGAAGAAAAATTTAT
CCCTAAACTTCAGATCTATTTTAATCAATCTCTCAATTTTTCTATTTGTA
ATACATGTTGTGTTAACTTCTGCAGACGAACCATGCAGACTTGAATGGGA
CACATGTTACAAAATAATTAGGGGAGTCTGTGAGGGCTTAAATTATCTCC
ACAATGGATACAAAGATTCTATTTTCCATTTGGACTTAAAGCCTGCAAAT
ATATTGTTGGACAACAAGATGATTCCAAAAATTGGAGATTTTGGTTTATC
CAGACTCTTTCCTACAACCGAAACATGTACCACAACAACACCTTTGGGAA
CAATGTGAGTTCATACCTGACGAAGTAATCAACTTCTAATATAATTCCGT
TACAAAGTATTAATATTTGATACAATGCAGGGGATACACACCACCAGAAT
ACGTCGACAAACAAGAAATCTCACCTAAATATGATGTATTCAGTTTGGGT
GTTGTAATAATACATATAATGGCAGGAAGGAAACACTACTATGACCATGT
GGGTACTCCATCCAAAATCATTGAGCTTGTAAGTAATAAATTTCTGAATC
ATGAACTTGTCTTTCATAGAGTTATGTGGTGTCCACCCATGCTCTGTACG
TATGCAACATGTCAACATTTTGCTTCCATTTTGTAGGTATGTGAAAACTG
GGGTAAAAGGCTGCATGCAAGGACACAAGAAGTTAAGACATGCATCAAAA
TAGCGTTAAGATGTGTGAAGTCTGACCGACAGGAAAGGCCTACTATAAGC
AAGATTGTCGATGATCTTAACAGGATTGATATTGCAAAATTGCCACTTAC
ATACGAGGTATTGAAAGACTAGTGATATTTTTCACTCTATCTATGGTAAA
CATGGTGAAGAAATAATAGAGCTACAAACCAGTGAAAAATCGTTATCATT
GCCATAAAATGTGCCAACTAGTAAACCCTACTATATAACAACTAAATATT
TTGTAATTTGTGCTAGAAATTGTTTCGTGTGTTGAATATAAATATACTGC
CTAGCCCCTTTCCATCAGATCGGTCTTTTGGGATAATTGGCTAGTGCATA
AATCCTTCATGGTATCAGAGCCAAGAGGTCTTGAGTTCAAGACCCTGCTC
ACGCAATATTAAAAAAAAGAAAAAAAGATTCTGCGGCTTACTCCTATCCC
ATGCTAAGGACTAAAATAGCCTAGATGTGAGGGGGAGTGTTGAATATAAA
TATACTGCCTAGCCCCTTTCCATCAGATCGGTCTTTTAGGATAATTAGCT
AGTGCATAAATCCTTCATGGTAGAGATGGGAGGTAACCGCCGCCGCCGCA
CAAAAAACCGCCGCCGCCGCAGATTCCTGCCGCTCCGCCGCCGCACAAAA
AACCGCCGCCGCCGCAGATTCCTGCCGCTTCCGCACTATGACCAAGAAAC
CCGCCGCCGCCGCAGATCCCTGCCGCCGCCGCACAAAAAACCTAAAACCC
TACGACACAAACCGCGCAATTTTTTGCGCCTCCGGCGCGGCTAAAATAAC
CGCGACAACCTCGATCACGGCTACGTCACGACCGGCTACCTCGACATCGA
CATGAAGAACAACGTCTACAACAACTCAAGAACTCCAGTCAACAGCGTCC
GCGTCGTCACTTGCGTCCACGCCACTCCCGCTGTGACTGTGGGAGAGAAG
AGAGGCACTAGAAGGGGACGCAATCACCACCCCTAGGTGCCAGCCATGAT
CATGTCCACGGAGGTGATGATGACAAGGAGGTGAAGACGACGGAAGCGCA
AGACTTCAAATCCAGTCGCAAGTATCCGCTTCACTCCCGCTCCGACTGAG
GGGGGATGTTAGAGTACGTATACGTGTATAGGCTAGAGATAGACTAGGAC
TCTACATCTTGTACTCCAAGTCTCCACCTACCTCATGTAACTCTATATAA
ACCCCCACAAGGATCATTGCAATACAACACAATATTCTAGGGATTCAATA
TTTTCCACATCGTGCACTAACTCCCGATTAATAACTGATTAATGGGATCA
GGTTTATGTATCTTTTCAAACATCGTTGTGGTGCAAGAATGCAATTTTTT
TCAAATACTAAAACGGGGAAGCCTCTACATTCTACAAACATGGACTAAGC
CTCTACAATTCGTTATTTATAGGCCAGCAGCTTACAGAGCAGGAATGCCT
TGGACTACAACCAATACACAACATCAGGTAAGCATCTCACTTAAAATAGT
AAGATTTATGCGTTTCAAATGTTTGCAAATTTCAATATGGATTTGATGGT
CTTAATAGGATTGATATTGCAAAACTGCCGCTTACATATGAGGTATTGAA
AGATCAGTGATATTACTTTCACTCTATCTATGGCAAACACGGTGAGGATA
TGAAATAGTCTCAAACTCTCATCAGTTATGAAGAATGTTTGTCTCATAAG
GATGCCTTCTCTTGAATATGTGGCAACCAAATATGAATGGGGATCAACCT
GCTAGAAGAAGGGAATATTTTCTGTGCAGATAAAATTAAATCCATATATG
CGTACATTCTAAGAAAGGAGTGAAGAGTGTTGTTGTACATAATTCAGTGT
GCCTTCTGAAGCGTGGGTATAGGTGTTACAACATTAAAAATTAACCATAA
GTTCGCATCTGAATGTTACAATTACATTTTCGCCAAATTCAATCCATATA
TGTGTACATTCTAAGCATGGTATAAAATAAAAATAATAATCAGTTGTGTT
ACAACATTAAAAATTAACCATAAGTTGCATTCTGAATGTTACAATTGCAT
TTCCGCTAATATAATCCTAAATGAAAATCCTAAAGTGTGAATAACTACAT
TTTCAGGTTGTGTTTTTGAAATGCCTTGAAAGCCAAGCATTTTGTAATAA
TGATTTCTGGTTCAGTGTACCTTGTGGTGCTGGGCAGCCAGAATGATTAT
TTAAAAGCAATTCTCCAGCATGTTGCAATAACATAGATCAATGTCATTTT
GGTTTATCTAAAAAAGTTCTTTTATCTTGTCAGTTTTGATGGAGGTGCAT
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TGCAGTGCCGGAGGAGGTAGGATACAATGATAGTTCAATGCATGACCCCA
TGGATTATGCACACGAGCATATTATGAGGTTAACATATTATATTTGCCAT
TTTTTTCTTTCCAAGAAGATGTACATATTATGTGCTTTTTACGCACTCCA
GAATTCTCATTTGAATGTTTTAGGGACCTGGCGTCCTATGCTATTGGAGG
AAATGCTTCTAGAGCTATTTCGCAGCCTCGAGATGTGACCCAGACAATTG
AGGTCGACACATTTGACGATGACCATCGTAGGAGTAACCCACATCTAAGG
TTTATTCTTCTTTAAACAAATACATCGTATTTTTGCAACAATTAGACCAT
TCTCATTTTTCCATTTTTGCTCGGGTGCTCTGCATTGCTGGTGCCAAATA
TGTGTGTATTTGCAGCGGTATAAGGTTATATTTTAGAACCTTATCCTGTT
TTTGCGATAATCTGTGCATTTTTTCACACTTACAAGTGTTACTCCATCAA
TTTTGAAATAGGTGACGCTTAAAAAAGCATGTAGAACTATAGAGGTTCGT
TACTAAATACTACTACTCCCTCCGATCCAAATTAATGGACTCAGATTTGT
CTAGATTCGGATGTATCTAGCACTAAAACATGACTAGATACATATGAATC
TAGACAAATCTGAGTCCATTAATGTGGATCGAAGTGAGTATCATTTTTTG
CTGAAAATAAGTTCCACAGCGACTGAGCAGCTCATAGACATCGTCTGCCT
GGGGGCACGTGTGCATCAAGCACTGCTAGAATTCACTAATAGTCAAACGT
AGACATTATTTGAAGTTCTACTCAGTACTCAGTTCACACAGTGGTGCAGT
GGCGCCCATCTAGTTTCATCTGTTTTGGTATTGGTAGTGCACAATAAGTT
CACATGTATCTTCTCTTGTTTGTTTTGGTACCAACAAGTAAAAACTGTAC
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ATCTAACTTCTAGAGATTTTATAATTAATATTATAATAGGCATGTTCAAA
TTATCCTAAACTAGCATTGCACTATTAGTTTGATGACCTAAAATACAATA
TAACCTCCTTTTAAAACATACATTTTGAGGGTAACTAAAGTAGAATGACA
CAATATTAACTTAGAATGCTATCTATTTTAATTTAAATATATATTGTCTT
TCCAAATTTGGAAAACACATGTTTGAGTCTTAAGAATTGGTAACATTAAA
CAGCTATAAGAAAAGAATAATTTAGTGGGTGGAATGTTTGCATAATTCTG
TTTTTTGCATTATTATTATTTTGAACAAGTTTACATTACTACTCCCTCCG
TTTCAAAATATAATATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGTATTTCACTAG
ATACATTTGAAATACATTTGCTTCACAAAGCTAAACATATTATATTTTGA
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ATACATGTTGATTATTAAGGACTTATATAAAAACACACTTTGAAATTTCG
TTACTCTTTTCGAACTTGGCAATAAATTATACTCCCTCATTTCCAAATTA
ATTGAGCAGCTTTGTCTAGATACGCATGTACCTAGACGCGTTTTAGGTGT
AGATACATGCATATCTAGACAAAGCTGCATCAATTAATTTGGAATGGAGG
GAGTACATGGAAACTGGTTCAAAGGGTAATTACAAGACTATCCTTTTTTA
TAAGAAACAATGGATGAAGAATATGATTACACCACAACCAGCTTATGGTA
TGTACACCTTTAATAATATCTGACTTAGGCAATACACTATGCTCATTCTC
TGCACCTTGTCGACAGGGCGGAAGGAAACGTTCATACTCCAGTCACCATG
GGAGTAATGAATACTCTTGGCAATCTTTTTCAGTGGGCTAGATATAATAT
TTCATTGCAATGGAGGGGCACACAGGAGAAAGTGCTCCATGATGAATTAT
TTTGCCTCGAGAGTGGCCTACAGTGCCTTAGAGAAACTCTTCCGGCCATG
TATGACCTCATTGATCGAGCAGAGTGGAGGAGCCACAAACAGCGTGTGAC
TGAGCTCCTTCCAAACCTCAAGGATGCAGTTTATGATGCTGACGACCTTC
TTGATGAGTTCAGATGGTATATGCTAAAGGTGAAAGTGGAGGGGAATGGC
AGCCTATCTCCTTTCATGGACTTCTTCAATCGTGTCATTCAAGGAAGCTT
TGTGAAAGTGAATAGTATCCAGAAAAGGCTGGATAACATTTCCACTCACC
TTCGAAATATGGGGTTATATGAAGTAACAACACGGTTTGACAAATCCATC
AGGCCAGAGACTAGCTCTTTTCCAAATGAAACAGAAATATTTGGTCGTGA
CATGGAGCGAAAGCAGATAATTGAATGGTTTTGTAAACATACAAAGGGTA
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ATAATATGGGTTTGCGTCTCAGATGACTTCGATGTGAAGAGGTTAACTAA
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ATTCTCTTCAAAAGGTTCTTTCTCATATTGTAGGAACTAAAAAGTTCTTG
ATTGTCCTTGATGATATGTGGGAAGATGTTCTGAAGGAAAATGGGGAACG
TTGGAAGAGGTTTTGTGCACCTCTAAAGAACGTGCTACTAGGAAGTGTGA
TGTTGGTCACCACTAGATGTCAGATGGTTGCTGACACAGTTGGTACGATT
GACCCCATTACTTTGGAAGGTTTAAAGGATGATGTCTTTTGGAATTTTTT
CAAACTATGTGTGTTTGAATCTGGGAGTTCCAATAATAATGACAAGTTGG
AGCCCATTGGTAAAAAGATTGCTCTTAAGTTGAAGGGTTCTCCTCTAGCC
GCCAAAACTCTTGGACGGATATTAAGAATGAACCTTAAAGAAGAACACTG
GAATGCTATACTAGAGAGTGAACTGTGGAAGTTGAGGCAGGAAGAGACTG
AAATCTTGCCAGCCCTTCGGTTGAGCTACATGTATTTACCATTCTATTTG
AAGAGGTGCTTCTCATTTTGTGCCGTGTACCCCAAAGATTACAAATTTCA
GAAGAGTTGTTTAGCTGAAATTTGGGTGGCCGAAGGTTTTGTGGAATCTC
AAGGTGACATTCCAGTTCAAGATGTTGGCTGTGAATACTTTGATGACCTT
TTAGACCGGTCCTTCTTTCAGGAAGTTCGAAGTGGATATGTAATCCATGA
CTTGCTGCATGATATGGCACAGAAAGTGTCGGAGGATGACTGCTTCATCG
TCAAAACAGGGAGTGACTTCAAAAGTGTTCCACCAAATGTTCGCCATTTG
TCAATACTCTCTAGCATAGACATTGACTATTCCAATTTGTTGGGTGTACG
CCATTTCAGAAAGCTCCGTACACTTCTTTGCAACAAGCCTTTAGCGAATG
AGAAAACTGTTGCTAGTTTAATGGCAGATTGGTGCAGTGAACTGCCGCGT
CTGCGTGTGATTGTTTTAGCCTCTATGCAGGAGTTACCAGCTAGTATTGG
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ATGCTTGCAGAGATTTGCATCACATGGATTTCGCTGTGATTCAATGTTTA
GAAGATTTCAGAAAGATTATTATGAAGTACGTGTTGATGTAGCCAATGAT
GAGCATGGATTAGGATTTAGGTTGATAAAGAATATTAACCAACTCGGCGA
ATTGGTGATACATAATATTGACAAGCCAATAAGCAAGGAGCATGCAGCAG
AAGCCCAACTACAGAACAAGAAATATCTTGAAAAGCTGAACCTGGAATGG
TCTTTCTTTAGGAATCCAGAGGAAAATGACATAGAAGTGCTTCGATTTCT
ACAACCTCCCACCTGCCTCAAGTCTCTGCTCCTCCATGGTTATTCAGGTG
TGTCACTTCCAAGCTGGGTTCCGCCACAGAATTTGTCAAGCTTAATGTCA
CCTTCCTTTGTCAGTTCTGATGGACTCGAGAACTCATCAGTACTCAGGAT
CACAGATCTGATCGTTGATGGATGCATAAATTTATCAAGCCTTGAACATG
TTATACATCCATCTTGCATACTGGCCCTCAAGAAAATGACAATTAAAAAT
TGCAAGAGTTTAGTATCAGTACCAGTTATAAGGGATCTCCGCTGCCTTGA
AGTACTGGAGGTGCAGGAATGTCCAAATATATGTTCCCAAAGTTTGGTTG
CACCCTCTCTCAAGAGGCTTGTGCTGGGTAAGGAGAATGGTTGGAGTCAC
GGTCATACCCATGGAAGTCTCGCAGACAGTGTGGAATGCTGCTCCCTGAC
CTACTTTTTTTTGTCATGCAACTACCTCACATCCATCCAACTACAGAAGT
GGAATCTTCCAGCACTACGGGAGTTGATCATATCACGATGTGAACATCTT
ACATCAGTTATTGGGCAATCTGGACAGGTCATCAGAGGCACCGGCGGCAT
TAGGGCATTCTCATCTCTTACTTCCCTAACCATTTACTGGTGTGACATGC
TGTCAACCATTGATGATCTCCTAGAAAAAGAATATCTACTTGCCATCAGG
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GACTGAGCTGGAGGAGGAGATTTGTGTTACCATGTTCCCTCCAGATTCTG
TACTTGGTTGATTGTGGGGATATCTCTGCATGGGTCCCCAGCTGCCTACA
GAACCTTGCATCCCTTGTTACATTAAAGATTGCTAAGTGCCGGCATATAA
CATCCCTTCCAGGCAACCTCTGGAGCACTAATCTCACATCACTTGAGAAT
TTAGTGATTTATGATTGTGCAGACATAGTATCAATTGGTGGAGAAAACGC
AATTTCAGAAATAAAAAATGTCTTCATTCGCGGCTGTCAAAGGTTGAAGG
AACTAGAGCAGCCCATGGAAAGAGGCACCTTAAAATGGTAGTATCATGAG
ACTGGAGACAGCAGCCTTGCCCTATGGTATGCATGTTTACACAAACTTCT
TTCCAGATTGCACTCATTTCTGCACTCATGTTATTGTTGTACGATTAAAA
ACGTGTATGAGGTGAATTTTTGCTTATAACTATATGTGTACCTGTATTTC
CAAAAATTTAACAACCCTTGACTTTGCTGATCATTAATGGTTCTTTTTTT
GTGTGTAGCTTCTTATAGAGTCGACAATCAATTTAGGAAAAAAAAACCTG
AGCTCCTGGCTGAATCACAGACCTTATATATTGCTCGAGTTTACTCTATC
CATTGCTCTATTCGCGTTCCGTATATACGCTCATAAGTCATGCTATTTGA
ATACTTGGCTGCAGCCCGCCAGTTGCAAGGTACTACAAATAACGCTGTAG
TGTCATTGAAAAAGAGTTCCCCAGATTCGTCATTGCTCCATTTTGCAATT
TCTGTACCATGTGAAATATGTGAGGACAAAACATGTTGCTGTATCTCCTG
TAAGCGTGTGTGTTCCATTGATTTGTTTTTGCTCAGCCGGGGTACTAAGT
ACAATTTTAATCAGGATATTCTCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.