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GrainGenes Sequence Report: AA023045

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Sequence
AA023045
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023045
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGGGGTCACACTTGACCAGTCTGTTCTGAGACAGAGAGGCATGGAGGCG
AGCAGCAGCCGGAGCCGCAGCGAAGGCTACCCCTCGAAGCGGCGCAGTAG
CGGCGGCGGCGGAAGCGGAAGCAGGTACGGGCCATCGGTGCAATCGCTTA
ACGACGACACCCTCCGCTCCATCTTCTCCCGCGTGGACGACCATTTTGAC
CTCGCCCACTGCTCCGCCGTCTGTAAGTCATGGTAAGACCCGCTGCGCGA
ACTTCCCTTCCCGTCCCTTTTCCTTGTCTCCTCCAGTTCATTTCCGGTTG
CTCGGAGTAAGCAGTCGGTTCATTTTGTTCCGTGCTATGTTCTCTTGCTG
TGTAGCTGAGCTTAGTTCTCAATTTGCTAGGGTTCACTATCGCACTCGTT
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ACCTCAATACCTCAGTCCATGAGATCGAAAAGATCTGAGAACAACCTAAA
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TTATGTGGTGTGTAAGTGGTCTTACAGTTGATCAGTGGTATAATGATTCA
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TGTAGATAATTGAGCATGAGAGTTAATGGCTTTGTAGTTTAATGAAGTAT
TTAACTCTGTCACCGATCTAATTACTATCATCTCGAGCACCTCATCATTG
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TGATTTTGATGAAAATAAGGTAATCACTGTTAGTACACTTGCAGTTCTGC
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GTACTTGCATACTGATAGCAGTCTGCAGCATTGAGAGAATACTTCACCTA
TCTACTTGTCAAAACATAGTTACAAGACTCACAGTTCGCTCAGTTCACTA
TTGAGAGAATACTTCACCTATCTACTTGTCAAAATATAGCAATTGATTCA
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TGTTTGTTTCCGTAATTATTATTTGTTCAGAAGGTGAATAGTTGAAAACA
TAAATGCAGATCATAAAAAACCGATAGATGTGGACTCATTGTGCATATAG
AAGCTCTTAATGATCACATGTCTCCGTTAGACATTAAGTAGCTGGAGTTA
TAGGCAAGGTTCAAAAAAGCGCTAAGCGCTAGGCGAGCGGTGAGGCACCA
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AGCGCTTAAGCGCGTTTAAGCGAACGCTTAGTTTCACTTTTTTGAACCAT
GGTTATAGGTCACAAATTCCAAAATTTAATTAGACTACTCATAGTGGGAA
GTAACATAAAGTAGTGTCAAGCTGAGTGTTGCTCAAGCTTGACCTTGCCC
GAGCTTTCGACTCCGTCTCATGGCCGTTCTTTTTGAGGTGCTGCGACGGT
TTGGCTTTGAGGACAAATTCCTGGACCTGCTCGCGATCCTGCTCCCCTCA
GCAAGCACGCGAGTCATGGTTAATGGTGATCCGAGCCCGCCCATATGGCA
TCGCCGTGGCCTACGGCAGGGAGATCCATTGTCTCCGCAGCTGTTCGTGT
TGACGGTTGACGCTCTGGGCAGACTGATCAGTTACGCGGCCGAGATGGGC
ATCCTGCAAGCACTCCACCCCCGACGTGCCATCCCGGTGGTCTCCTTATA
CGCTAATGATGTGGTCCTGTTCTGCCACCCCACGCCGTCTGACACCACTG
CAATCAAGTCCATTCTGGACCTATTCGGCAAGTCATCTGGACTGCAGGTC
AACTACTCTAAGAGTTCCGCTACCCTACTCAATGGCGAACCTGATGACGC
GGAAATAATCAGGGACACGCTGGGCTGCCAGATTGCTGAATTACCACTTA
CCTACCTGGGGATCCCCCTAACTCTCAGGAGGCCGACCAGCGCGCAGCTA
CAGCCATTAGTCAACAAAATGGCAGGGAAGCTCCCCACTTGGAAGTCCCG
GCTCATGAACAAAGCTGGCAGACTTGCCATGGTCAAATCTGTGCTCTCGG
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AAGATGTTTGACAAGGTGGAGCACGGCTTCCTTTGGGAGGGGCGTGCACA
GACCAATGGTGGCAGTTGCCATGTCAATTGGCGCACCGTCTGTCGTCCGC
TCTCTCTTGGTGGGCTTGGCGTTCAAGACATGGATCGTGCTGGCCTAGCG
CTGAGGACGCGATGGCTATGGTACAGCAAAACTGACGAGAGCCGTGCCTG
GAGTGGGCTGGACATGCAGTTCGGCACTCGTGAGCAGAGCCTATTCTTCG
CCTCGACATACCTGATCGTCGGCAATGGGCTCACAGGGAAATTTTGAGAA
GACCGGTGGCTCAATGGCCGCTCTGTGCGCGAGTTCACTCCGCAGCTATA
TGCTTGCGTTCCCAAGCGCAGAAGGAAATGACGGACCATAGCTGATGGCC
TGAACGCGAATAACTGGGCACGCGATATTCAGGGCACCATAGGCATCGAC
GAGCTGGGACAGTACCTCAACCTTTGGCGTCTTGTTGCAGCCACGGTGCT
CTCAGACCATCCAGACCAACTAATCTGGAAGGAGACGGCAAGCGGCAGCT
ACACTTCAAAATCCTGCTACCTTGCAACGTTCCACAGGATGCACAGCATG
GAAGCTAATCTGGAAGAACTGGGCGCCACCTCGTGTTAAATTTTTCCACT
GGTTAGCCAACAAAGATCGCTGCTGGACTGCAGAGAGATTACGGCGACAC
GGCCTGCAACATCACCCACGCTGTTTACTTTGCGACCAAGAGCCAGAATC
GATGCAACATCTGCTCATGGCATGCCCCTTCTTGAGGCAGGTCTGGCATG
AGACGCTCGCCTGGCTACGCATACCCTGCAGGCCACCGCAGGACGAACCA
TCGCTCTACGACTGGTGGATCACAGCGAGAAGCACCACTCCCAAGCCCAT
GCACAAGGGACTCGGATCTGCCATACTGCTGGTCGGATGGATGATTTGGA
AGCACCGAAACTCTTGTGCTTTCGACAGAGAGCACCCTTCAGTCCCGCGT
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TGCTGGTCTGAGAGTTGTCATTCCTACAGTTTGGGATGTTCACTGATTAG
TTTTTTTTGGCCATCTCTTGTAAATCCACCTGCTGGGTGGCTTATGTACT
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CCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAACATAAAGTAGTGTCATGCATGTGAT
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TCTTAGAAATAGATGGAGGGAATTTCCAGCTTAAAAATCCACTCGGTGGC
CCACATGCCAGGACAGCATTTAATCTACACACCGTCTTCTCTAGAAAGCC
CAAAAGTGCACCGTCTCCACCAAAATCCAAATCACCAAGGGCCAGCATGA
CTGAATCTGCTCCCTACGTGCGCCCATGCTGCACTAGCCAGTAGCCACCA
TATCTTTGCCATGGTTCCTTTCTCTTCCACACCACACGGCTGGTGCGGCT
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TGACGCTGACGAAGAAAATGTGCAGAGGTGGAGTTGCTGCATCTTGGAGG
TGACTTGACGGACACCACATCTTTGTTGTGGTCGCACCTGACATCATGTC
TTCGCACCAACGAGTCTGTTTTTCTCGTCTCTTTAGCGATTGATGACTCA
GGTGGTTAATTCTGCTTGATCTGTAGCGATCTTGAACCTGGATCGCGAAG
CTTTTCCAGTTCCACCGAATCTGGTAGGCTGTAACTATGGGTCAAGACAT
CATTTGTACATTTTAAACATCTTATTCATGTTCATATGAGCATCTAGTTA
CCATGATCTTAGCAACATGCTTTGGTGTACTTAAGTGTGAAGGAAAGTTG
CAAAATAGATAATCAAGTGTCAAGGAAAACTGCAAAGTAGTCCATACTCC
ATACTATAATCCACACGGACCATGTCCAGCACTTGAAGCCGTTATATTAT
GTATATTTGAATATGGACCAAAAGTTATGGGATAGCTTTTCTAATTGCTG
AGTACGTAGTTGTATGAACATTTTGTTTTTATTTGCACAATAGTAGGCTA
TGCAGTCAGACCAATCTACAATAAAATGGTGATATTGGCTAAATATAGAG
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GCCTGGTTTAACCGTATCGACAGGACTTGCTTTTTTCCATTAATGACAAG
ATTGATGTTACCTGGTACAAAGTAGAATTCATGTTTGAAGGCAATATATC
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TGAGACACCAAACAAGCATAATAATCTTTGCCATCATTTAGTTTCTGGTT
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ATGCATGCTGAAAATCATGTAAATATAGTGGAAGAGGAGCTTTCTATAAA
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TCGTTCTCTTATTTTAATTAGGATTATTTTTTATTTATTCTTCTGCAGTT
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GGAGTCCAGTAGCATATCATGTGAATGAAGTGTTTCTGCAATTATTTATG
TTAGAATGGGTGCACAAGCTTCATGTTCAGAACAATTCTGTGACATTATA
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TTAGAATTTTTATTGGAGATAACATGCTGCAGTTAATGTATAGTCTTGCA
TTATAGTGATGCCTGTTTAACAATGGTTTTCAGGCTTCACCCTTCCCCTG
TGACATGCTTGGCAGTAACAGATGATCAGCTGATCATTGGTGGTTCTACA
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TATTAGCATAATAGATTTCCATTTCCTGATGAGTGATGGGGATGGTGTTG
GTTCCGAGTCATGAATAGGATTTTGTACACTTAAAAAGCCTATCATTTAT
AGAGGTGAACCAAGATTTCATGGTGTTTCTTCTAGGGATGCTATTAGGGA
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GACTTACAGGGCGGAAACATCGATTTGTGTGCTTGTGGAGGTGGAGCTGC
AGTTAGCTTGATAAAGCAGCATGATTTATGGCGGCGGTGTCTTGCGCCAC
ATATTAGATAGGTAGGTGTGCCTGCGTTCTGGAGAAGGGCAGCATAGTCT
TTGTTCACTGTTCACCATGGCAGAGCAGAGGGTGCTGCGTGGCAAAAGCT
GCCATGGTGAGCAGGCGTGGCACCATCAAAATCTTGGGTAAGAAGATAAA
ATAGATGAGGCCAGCTCCCGTGTGTAGGTGAAGTAAATAAGATATGAAAG
AGGAAGACTGGTTTGGGTGTGTGAAAAAGAGAGTAGGTGAAGTAAATAAT
TTGGAATAGGTATGACAAACCAACGGATGTTAGCATATTATATCTTCCTG
TTCCCAGTTGTTTGCGGGCATTATATTTTCCCCGTACCCTATCTAAAGTA
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GGAAGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCCAAATTTAGACAA
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AGTGCAAGTTATTCTTGGAAGTATCTAATATGCTTCAGTCTGTTTGAGCT
ACTTCTGCTCCTCTTTCAGTGATGTCTAGATTGTAGTTGAACTCTTCGGA
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ATGTTACTATGTGTAACTTTATGACTAGATATTAAGTTCTGGAGTTGAAA
GCTCAAACATCATATGTATTTTGCTCTGACTTCTATACAAAGTTGTTAGT
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ACAATGTATTGCTAAATTTTTCTTTCATTTAGATTGCATAAAAAAAATGG
ATTATTAGAATCTCAGCTCAATAATCAAACTGTATTTCAATTTTTACCGT
CAGTTCTAGTACTTGTTTGATCTTTTCAGAAAAAAAAATCAACCAAAATC
CATGCCATTCTATTAGTGTTGTGAATTTTATCATCATCGAACTGACTTGT
TTCATTTTTACTATCATTTCAGTTATAAGATGCTTGTCTTTCAGCGCAAA
CTCGCACTTGATATTCGCGGGTTCATCTTCTGGTTATGCACATTGCTGGG
ACTTGAGGTTCGTATCAGCAGTAGTTGTTCTAATTTAGTACTGTATGAAT
ATCTAGTTTGTGTAATAATTGGGGCTGCTGGCTGTAGCGACGAAAAATAT
ACCATGGACAGTAAGTAAGTCTGCCCTTGAAGTATTGTTCCATTGCGATG
CCTCAAGAAAGGAATAACTTGTATGCTCTTCTGATCAACTATCTTGATTT
TTCTCACAGTTTGAAGTTTGCGTAGAGTAAATATGAAGTATAAACAGTTG
CATGGCCTCGACTAAATCAGGAGTCTAATGGAAATGGTTCATTTGCTCGG
CCTGTAGTTAATAATGTTTTATTACATATTGACTCATTAGCTTACAGTTT
ATGCTATTATACGTTTTGCTTAGAGATCTGTATGTTATATCTCATAATCT
GGTAGTTTAGAAGTCAAATTATTTTAACATGGAAGATTACTTCCCTGCAG
AGAAAAAAAGAAATTTTTAAGTTTGAGAAGATTAGTTATAAGATTATCAC
GCTGACTACCGGTTGTTTAAGCGCAGCAAATTATCATTTTGGCACAATAG
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CTTCATTGTGGATGCAGGCCAACCAGCGCAATCCAGCCCCAGGCTGCAAG
ATGAAAAGAAGCATGGCCGCCCGGCAGGATCCGGCTCCAGGCAGCAAGTC
GAGAAGAAGAACATCCGTGAGATCCCTCCGGATGCCCGGCTGGACAACAT
CCCTACGAACCTGCGCCCGCCGATCACTGGCCTGTCTGTTGGCATGAGGA
AGATCGTGACCACACATGGGGAGAACTACATCCGTGTCTGGAAATTTCGC
TAGTGGAGTTGTTAGAGTGGTTACCAGGAGTTCAGAAGCAAGCGAGGCTT
AACTCAGCTGTTTGTTAGTACTCCCTCCGTTTATAAATATAAGATGTTTT
AGATTTATGAAGAAGATGTATCTAGACATGTTTTAGTGTATAGGTTCAAT
GAATTCTAGACTGAAAGATGTCTAGATACATCTCATTCATAAACTTAAAA
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CCAAGATATATTGTTGTATTGACATGGAAATAAGTTGTGCAGGGAGTTAA
TACTGTGTTTTCTGCAAATAAAAGATAACTTTGTTGAGTTTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.