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GrainGenes Sequence Report: AA002500

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Sequence
AA002500
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002500
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAACCAAAACACAAACACCCCTGAGTCAGACCGGGAGGAAGAGACCAT
CCGGATCCGTCCCGTTCCTTCCTTCCGGCCCACGGCGACCGAGGAGACCC
ATCACGCCGGCTCACTGCCGTTCCACCGCCCCCTCCTTCCTCCTCCTCCT
CGCCTCCCCTTGCCGGCGGTCCCAAATTCTAAGCGGCGCGCATGGCGGAC
CCCGACGCGAGCCGGGCGCGGGAAACCTCCCCGGGGGACGACGCGTCCAC
GAGCCACGCGGCGCCGGACTCGCTGCAGAACACGCCGTCCAACATCGCCA
GGCTCGAGGACGCGATCGAGAACTGCGCCGCCCGACGCAAGTACCTCGCC
CGCACCAAGAGCCCATCCGACGGCGAGGACGTCCGATGGTACTTCTGCAA
GGTCCCCCTCGCTGACAGAGGTGTGCCTGTCCTTCTCCCCTCCTCTCGTG
CAGACGCTCGAGTTTCATCATCATGTACTGATAGTGCTAATTTCTTTGTG
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TCTACTATATAATATTAGGGGAATATTTTATATATCATTACTGTGTTACT
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ATACCTGTATGCTACCAGGCTTCCTTATTTGTTCGCAAAACCAGTTATGG
ATCTATTCTTCCATATTTACATTCTACTCATAACTATTGACTGAGTAGGG
GTAGGAAGTAAGATCAGTAAGACACTAAGACTGAACAATAGAATGTTGCT
TATGTGGTTTTAATATGGCGTTGTTTTTCACTTTCAGCTATGTTAGCTAG
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GACGCCATTGCTTCCCTGTATACTGGAATGGTGAGAATAGACGTGTTTTG
AGAGGCCACTGGTTTGCTCGAAAAGGAGGTCTTGATTGGATTCCCTTGCG
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CACTGCTATGAATAATATTCTTGTAACTTGGAATGCTCTAGAAAAAATAA
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TTGATTCTGAACACTGAACAATGGATGTCATGGTAATGATGGCAAGGAAT
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TGTCATGTTCCGGTGTCTGTTTCTCCATTTCCCCATAGGCATACTCCCTT
CTATAATAATTCCATTGGTTCTGAAAACAGTTGAACACCCTATTGTTGTC
ATACTAGGTCTGGCATCGTCGCAAATTTCAACCTTCAGGCTTGTTTGCTG
CACGGGTTGATCTCCAAGGAAGTACACCGGTATGTAATATACTGATATAA
TGTTCCCAGAAAAGAGAAAGAGAAGTTGGATGAAGGCTGAAGTATATCTT
TTGCAGGGCTTGCATGCTTTTTTTACTGGAGAGGATGATACTTGGGAAGC
TTGGCTTGTCTTTGATACAGGTCCTAAGCTAGGTAGCAACACAATCAAAA
TAAGGCGTGGTTTCTCTTCTTCTGGAGCTGCAAATCCCACCCAGGTGAAC
AACCATGTCAAGTGTTTTAATGCTATCTATGTCTATCCTAAGCTTGGCTC
TCAATCTCACATTTTTCAATAGCTTAGAGAAGTCAAAGTTGTTTATGGAC
CGAAATGATGAGATACCTGAACTGTTTAAATTCTGGCTTGTTAAATGTTA
ATGCCCATTGCCCATTTGGTTTGTGAGCAAAAAATGTTGGCTTCTGGGTG
GTTTATGTTAGCAATAATCTGGATGCTTAGTAGTAAGTAGCCTAATCATA
CTTGCATGTCAGCACAAGAGACTACTAGTATGACGGTAGTAGCAAGTCAA
AGTGAACTTGAGTTAGCCTGACATGAGCTGTAGCTTAGCTGTTAAAGTAG
TAGAGTCCAAAACAGCATCAGCTGGATGGTAGCTAGTAGATGCTAGCAGT
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TCATATGTGTGCGTATACCTCTGTTTTATCCTCTGTTTTACCTGTGTGTG
TGAGCTACTAAGAACTAGCTAACAGCAAGCACATATACTTCAGTTTACAC
TTAAGCTGTAGAGGCTGTATGATCCTTATTCCTTGACAACATCAAGAAGG
ATTGAAAAACTAGTTATGTATCGTATTGACCACCAAATACGTAATTTGAT
TTAGGCATTTAGTGCCTCTCGTGATGAACTGTGGTCTGACTGACTATAGA
CTGGATAGCTGAAGATTGTGATCTCGTCAATTGTTAGTCATATTACTGCT
TAAGGTTATGCAGCAAAAAGGAGCCTATTCTATCTGTGCTCATTTCTTTC
TTAGTTTGGATTTAAAAAAGCACCTGCCGGTATAACTCTAGAATGAGAAC
CTGCCACCTCTTTGTGGGGTTTTCTTTGTAAGCATGGAGCTATCTTCTTA
TTTTTGAGAGCATTCGATGTCTTCCTGGTGTATAATTGTTATTTGATTAT
CTGCCAGGATGAGTTGCGTCAGCAGAAAGAAGAGGAAACAGATGATTACT
GCTCTCAGGTATTTCTTTCGGCAGGCTTCTTTTCTCTTTATACATTAGTT
CCCATAATATTTATTCTACCATCTCCCAAGCAAAGTATTCATATATACAT
ACTTATATCGCTGAAAAGTAATTTAAATTATTACTATATTCCACTGGAAT
ATCTAGTTTATCTGATTCTATTCTGCATTTATTGGTGCCTTTCATGTCAT
CAAAGCGTTTCATATATTTTATAAATAAACAAATGACTGGCATCCAAGGA
GCAATGATTGGGTGTTTGTTTTGAGGAATGCTCGTTCGGTCATATCATGT
TCTTGTTGGTTCGAGGAATGGAATGTGTTCGTCCATCACCACATCATCCT
CACAAGCACTTAGTGTTAGAAAACAACAAATGGGGTAAAATCACAAAAGT
TATGGGTTGATCATTATGATACAGTCCATCTGAATATGAGACGGTTCCTC
AAAACCAAACGTACCATAAAAGGAGCATCACATGCTATGTGACACCCATA
ATGCATACATTATTGTGATATCATGTAGTAATTTCTTCCATGTCTGAATT
TCTTAGCCATCCACCTTACACCTATGATTGCCACACTAATGGAATATTTA
CACTGTGGCCTCCGCTTTCCCCCTTAAATGCATGTGAAGGAAGTTACAGT
AAATTTCACAAGGTTTATTGCTTAAGGAAATTTGCTGATGCTGATGTACT
TCCTGATTACGTCTTAATAGGTTCCAGTTGGTCATGTGGTATTCATGGTT
CATGGGATCGGGCAGAGATTGGAGAAAGCTAATCTTGTTGATGATGTTGT
CGATTTCCGCCGTGTCACTGCTAACCTGGCTGATAGATACTTAACTCCGT
ATCAAAGAAGTACACAAAGGGTTCTATTCATTCCATGTCAGGTAACATTA
ATAGATTATTATAACTAAGTTACTTGTTCTGATACCACATATGGAAATCT
CTATTATCATTACATTAGTTGATCCCTTTGTTGCAAAGGACAAAACAGTT
GACTTGTCTACAACATGATAAAGAAAGCACTAATCTGGGTTTATGCCTTC
TGAGTTAACACAGTCTCATTTTAAACAACTTTATCATCTAGTGAAACTTT
AACACGTGTATCACCTTACACAGTGTTACTTTAGAATTGTGACCATTGGG
CTTCATTAATTTTATCAGAAAAGGGATGGCACATATGGCAGGTTGGTATT
GATCACCTATGAGCACTGGAAGCTTTTTATATACTTGTCATATCTGTCAT
CTGTTGCTTTTAGGCAAACTCACTTATCTAGTTATTAATCAACAATGGCT
GTAGCATATGCGTGTAGCTAAGTATATTGCACTTACACAGTAGCATGCTG
CCTTTTTGTTCTGTCATTATATGAAATTCGGTTTCATCCATGTTTTCACT
GGTGGCTTTTATGTTTAATAGTGATGATTATTATTGCAGTGGAGGAAGAG
CTTGAAGCTCGGTGGTGAACGCACAGTTGAGAAGATCACCTTGGATGGAG
TTAAAGGTCTCCGCGTAGCGTTAGGCGCCACAGTTCATGATGTTTTGTAT
TATATGAGTCCTATCTACTGCCAGCATATAATTGACTCGGTATTTTGCTT
TCTAGGCACACTTTTTCCAGTCATTTCCACTAATTCCTTGATTTCCATTT
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TATATTTCCTTTCTTATATTCCACCTCAAAAGTTTCTGTATCGGAGCATG
GAACCCAAACAAAGTTCGCATGCTGAGATGGAACAAAAGTGTCAGCAAGT
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AGGATCTCATATCTGTTTTTTTTGTTACAAGTTAGTTGGTGTGTCATGGT
TGTTTGAGTGTGTCATGATGTGTTTTTTTGTTGCATATTTTTGAGGTGGA
AAGGGACGAACACCATCGCCTCATTCACCAAGTCTTTCAATTACTGAGGA
TGATGATTTAATAATTCAAATTTATAACAGGTCTCGAGTCAGTTGAACCA
GTTGTATATGAAGTTTTTGAAGAGAAATCCTGGTTACAATGGAAAGGTTT
GCTGTTCATAGCTCATTTCATAATATATTTTGTAACATTATACTTTTTTC
TGTCGGTTAAACAAGAAGCTGCTTGCCTTCTTTTTTGGCAGGTTTCGTTG
TACGGCCACTCGTTGGGAAGTGTTCTAACATATGATATACTTTGCCATCA
AGAAACCCTTTCCGCCCCATTTCCAACGGATTATTTTAGTATGGAAGTTC
CATCTGATGAAGGCCAAGTAGGAAAAGCACCCGACACGACTGCTGTTCAT
GACTCTGGCATAAAAGAGCATGATACTTCTTCCAGCTTGGGACATTCTCC
TGCTCATAATGTAAATGATGTAGATGAAGTCAGCACCAGAATTGACGGTT
CACTTACAGACAAGATCGGCCCGCCACGTGTGTTCGAGAATGTGCCAAAT
CATGATGACACACTCGCATCGCCTATTGCAGTTGATGGGGTACAAAATGA
AGTTGTAAATCAGGATGTGACATGTACTGAAGAAGGGGATACTTCAGCTG
TAAGTGCAAAAGATGCTGAGTCTGTTTCAAGATCTTCTGTAGAACTACAT
GAAGAGATCTTTGACAAAGACAAATCAATCTCGTCACTGGAAGAAGAGGT
GTGATTTTATTGAATTTGGCTAAATTTTATGTGGTTATTAGGATTTTTTT
AATCAAGCAAGAAGGCTCACAGTGCTGTTGCCTTGAGATCAACTCATCAT
TTGTAGTAAGGATTGATAACTTGTTTCAGACCACAAAATTTAGAGTAGCC
ACGCTGTCTGGCTATCTTCTGCACGGTAGTTACCCCGTTGTGGATCCAAG
TCCATAAAAGTTATCTTGGAGCTTAGCAACTATCCAACTTGCATATTGTG
TTCATGCCTAGATTTGTATCTTCACTTCAGGTGAGACGTCTTAAAGCTAA
ACTAGCAGAACTGGAGCGACATAATGATTTCACTGAAAGCATCAGTAAGG
TCGAGTCTCATCAAGGTAATTGTTGCTTTTGTTCACTGTTGTTTTCTCGA
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AAGCAGCACAAGTCAGTCCTACAGACCACGCATTAGATACACTAAGCTAA
ATTTTAAGGTAACATGTCCTTGTTGTTGGTCAATGATGTTTTTACTTTTG
GTAGTGTTTATACCATCATCACATCATTTTTTGATACTCAGGTCGACACA
TTCTTTGCTGTTGGATCCCCTGTGGGAGTCTTTCTGTCCTTGCGGAATGT
TCGTATTGGTGTTGGTATGTAACTTTTGGCTAATAATATGCTTTCTTATA
CCAGTATTGAAACTTTTACCCCCTTTTTGGTTTAGATACTTTCCATAGCA
CTCTTCTTATGTTCAGAACTAGATATATTTACTCCCTCCATCCAGAAAAG
GATGTCAAAATTTTGTCTAAATTCGCACACATCTAGACGTGTTTTAGTGT
ATAGATACATGCGAATCTAGACAAATCTTCGACATCCTTTCCCGTACGGA
GGGAGTAGTATTTTTGGTCATTTTAATAACCAATTATTTAACAACAGGCA
TATATTTTATGCATAAAAATTTCAGCATTTGGATACTGATATGTTTTTTG
AACAGCTAGAAGAATTATCTTTGTGGTGTTCAGGATAGCATAAAACAATG
GTCAGTAAAACTACATGCAGAGCTTAACAAGACTTCTTGTCTCGGAATGT
TATTCTTTTTGATTGAAATAAAAATTTAGATAAATTGTGGTGTTGGCTCC
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ATCTCCTGTCTGTAGCTATTGTTCCTGTCTAGTCACCAGTGTCTTGATGA
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TTTTTCATTGCCCCTGGCAATTGACAATCGATAATCTGTTGTTTTATTTC
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AAGAACATAGTTGAAGAGATGCCATGCTGCCGTCAGATGTTCAATGTTTT
TCATCCTTTTGATCCTGTAGCATACAGGTTTGCAGCTTCCTTGCATATAA
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TGAAAGTAGGTAGTAGTAAACTGGTACGAATTAACATGTTACATAAGCGT
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CTTGTATGTGAAGATTATGTGAACAAGCGCCCCGTCGTTATTCCCTACCA
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TCATTCGTCGTCTGAAAATTTTCCATCTGCCCATTGCTTGGACGATTTTA
CCCCTGTAAGTTTGGCAATATTACATGGACTAACCACCGCTAAGTCAAAC
CGAACGGGAAAAAAATCCCCAAAGCCATCCCAGGCTCTCCGCCGCCCCCG
CCGGTCGGAGACATTTCCCCCCATACTCTACAGCGCCGCCGTCCTCTCCC
CTTCCCCTATTCCTTTCCATCTCGCCTGAATGGCAGTTGGAGACGGGCGG
AGTCACGGAGCAGAGACACGGCGATGGCGGCAAGCCGAAACCAGCGAGGG
GAGGTCGACAGGGTGGGGCGTCGGGTACTCGTGGCCTGACAGGACCACGG
GGAGGCGGAGTACAGCGGGCGGCGGCGCTCGGATTTGCTCTACGGGAGGA
CGGGAGTAAGCGCCGCACTAGGGAAGAGGAGGGAAGGGTCCGGCTTGTCG
CTCCTAGGAGATATTGGAGGGGTGGCCATCGCTGTAGTGAAGAGGAGCGG
CGGTGCGTCGATCTGAGGGTGGGGTGCAGCGGCGAGCGGTGGCTGCGGCA
CGGTGGCGCGTTGATCTGAGGGAGTGGGAAACGGCAGGGGTGGGTGTGGC
CGAGCGGCACTTCGATATGATGGAGGGGCGTTGTAGCCGGTGCAAGCGTT
GATGGCTCTGCTGCTTCCGTCACGGGCGCTGCACATGTTGGGAAAGTCCA
CTGTCCACCTCGCGCATCCCCTAGCTGTCCGCAACACTCCACCAGGGAAT
CGACTGCTAGGACCATCGACAATTCAAGCAGCGGTACCACGAATTTCTTG
ATCATTCTCGAGAAGAATTTCTTGATAACCATCGACCCTTCAGATGGGCC
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GGGTTGTCCTTCTCCGAGTTAATCTTTCTTTTGTACGAAGTAAACATTAA
ATGCAAGTAAAATATAATCGGATGATGAGAAGACAATTCTTGGTTCGTAT
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ATTACTAACTTCAGCAAACATGATAGTACAGCTGCAGATCCTGGTTCATG
ATTTTGTAGTTCCAATAAAATAGGAGAATGGATAGAAGGGGCAATATTAG
AGGTTACTATAGCGTTGGAAGAAATTTACAATAGGAATCTTATCAGGAAG
GCCAATTGTGAGGATACTGGGAAGATATTTTTAGGATCACCTTTAGACAC
TCTAAGATGTGTATCTTATCAGAGTAAGAACTACTCATGACATCCACATG
GACAACGTGGACAGATAATAGTGAAATTCAACTATAATGGTTTCGCATTG
TTGTCCTACTAATCAAACGACATTAATAAGGTCATAATTTTGTTAGTGAA
ATCAGAGCTACAAGGCCATTAATATCCACAATGGTTGACCGGAACGACAT
AGTGATGTTCAAAGTTGTTCGTGACCATGTGGTATACGTTCACAAGCATT
GTTCCGGTGATGCAGATTAAGGAGTCTTCGGAAAGTAGAGTCACTAAATA
TAATAGCGATAGAGTAAGCGACAAAGCTCACGATTAACATGTCTTTTAAC
GCTTATGTATGATGACTAATTAATATTTGGTGCATCATGCATGATAACGT
AGCCGCAAAACATAATAGTAAAGGGGATCCGCGGCAAGATGGAGAGCTTG
ATTGACCGTAGCAACGCACGGACATTCAGCTAGTATTTCTAACTTGAGGC
TGTTTTGCCTCATATACCTAATTTGGTTTGATATGTTACAGGAGTTCACA
GAAGATATTGCTGCACGTTCTCAAGCTATAGCCCGTCAATTCAAGTCATT
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GTACATGTGAATGATAAAGAACTGCTAGCACGGCTCTTGCCTAAAGAGTT
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ATGGAAAGGTTGACAGGTTCACCAGATGGTCGGGTTGATCATGTGCTTCA
GGTAATTATGCTCTAGTTAAATCAACGTAATTTCTACTGTTTATATTGTG
CATTGTTGCTTAGTATAGGCATTAAAATGCGTGCTCCACTCTGCATTGGG
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CACACACCCATGTGTTCTTAATTCTCAGCTCCTTCCCAAACGGCAGCTCA
GGACTTCCAGTAGTGGATATGAGGTCCCCACTGGCAAGTTTCGAACTGTC
TGATTCCCCGTCCCCACCAGTTTGGCGGTACAACCAGGATTGCTAACACC
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ACAGTTCCAATAATGTAATTGCAGGAGAAAACATTTCAACATCCGTATTT
ATCCGCCCTGGGATCTCATACGTGAGCTCACTCATCATTCTTGTTGGTTT
GCTAATTTTTCCTGTGTCTGCTTCATCACATATTAACAAGCCTGTGGGTT
GATTCCTGTAGCAACTACTGGCGAGATCATGATACTGCTCTCTTCATTAT
CAAACATTTGTACCGTGATATACCTGAAGAACCTCCAACTGATGTAACTG
GAAGGGTACCCGTTAGACTGTTCTATGTGAGGGATCCAATTGCTGAAGAC
ACTCCCTTGACATTCTCTGATAACTCCTCAGTTAAGGAGTTCTCAAGAAA
AGTGAAAACTTATTCGATGAAAGCAGAGGATGACGCGAACTGCGAAGCCT
CTTGATGGTATGTTGACATGTTAGTGCACCCTTCTCGTTTCTTTTCGAGC
ATGTTTTGTTGCTTACTTTGAACGAAGACTAGTTAATGCAGATTGCTCTG
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CAAGCAGAAGCATGATGTACATAAACATGGAAAAGCACAAAGCACAAAGG
GGATGCATAGTTGGAACATCCTCGTCACTTGGCACCAGGCACCGGAGCAA
AGAGTATACACTTTGGGTGAACGAGCGTTGCACATGGAATCATTGGCCAG
CAGTTGCCGTGTATAACTTGTTCATCAGTGTATCTAGTGTTGATGTTGTA
CATACACAGGTAAAGAGGACAGAATAAAACAGATTGATTAGTTTCAAAGC
AGTCCAACACCAGATGGAAGACAGAGGTCAAGGCTCGTTCATCTTGCAGT
GCATTACGAGCTGGATGGCAGATCTGTATTCTCATGCCATGTCCAGAGAG
TACAGCCTTGCCAATGTTGATCTGTATTCTCATGCCATGTACAAGAGCAA
GATGAGTCACGCTTCGATCTGCCAAATGATGGGTCTTGTGGTACCAACTG
AGATTTCTTCATCTCGCGTGTTTTGGAAAACTTGGTCAGAGTATAGCCAA
ACCTTGATGATACGTACATAAAAGGAAAATGCAGAGAATTCTGGACAGTC
GCCTGTAATCTCTTCTGTAACATTGACTGTTCTGTTCCGTCCTTGTCAGT
CTTACATTTTTGGTCAGTGGCTTGACTTGACTGTGCTTTGGCTGGGTTGG
TTTGACCGTTTGCCATAGCCGTCCCCCTCCCATCCTGCAACCCACCTGTA
CTAAATTACAAGATGCACGTACGCGTGCATGTGCTGTGAGCCTTTGACTG
ACTTGCTCCAACTGATCACTACTTACTTGGAAGCATGCTTTGCTCGCCTA
CTTATGTACGAGATCATTGATTGTACGTTCTTTTAAAACAAGGCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.