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GrainGenes Sequence Report: AA002197

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Sequence
AA002197
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002197
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGGTAGGAGACGTGGTAGAGGAGATGAAGAGGCAGCTGAAGCTGGG
GCTGCCCATCTCCTTCACCAACACGCTCAACTCCAGCCTCCTCTTCGTGT
CTCTCATGTTCGTGGGCCACCTGAGAGACAGCGAACACGTCTTCGCCGGC
ACGGCGCTGGCCACCAGCTTTGCTTTTGTAACTGGATTCAGCTTGATGGT
ACGTACGTAATACGTGTGCATGCACCTCATATCTCTCTCCCCAATTCTTC
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CTACTATAAAAATTAATCTATTGGAAAAACGAAAACTTACATCTTAATGG
TCCGAGTCAATCCGGCCTATTTAGAGAATCCTACATGTGATCGGAGCATT
TCACGTCGCTACAGCGATGTATATAAGGCTGGTCTTAGTGGGAGCATCAT
AATACTAGTATCATGCATATAATACTAGTATATGATACTATGTCTCTAGT
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TCTCTTTATTAATTATGACGCCACGTTAGATTTTTGCCAAGTTGGCATGC
ATGATACACCTTATGATACTAGCACTAGGATCAGCCTAAAGACAAATGCT
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ATACTAGTTGATTTTTCGTGGCTTAAATTAAAATTTATAGAATTATATTT
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TTAATATAAACCGGAGGGAATAAATTACTATCTCTAGAAAAAATATCCAT
GCACAGCAAAGGTGAAGTTGAAATGAAGGACGTGACAGTGGCAATAACTT
AATTCACTCGCACTTTGGCACTCGAACTGATCAGTCTCGGCTTCCTTTTT
AATCCGTCTTAGGAAAGCAACTTCACTACTTGAGCTAGCTAGCTTGGAGA
AAACAATGGGTGCTCCTTTCACTTGTTTAATTCTCCGTGTTATCGTCGCA
AATTTTAAGTGATTGCCTACATTTTTCGTTACTTTTTTTCTTAAATCACA
GTCGCGATAGTGTAGACTGTTTAGGTGGTTGTCCAATGCCTATCACCTTT
TTCGTCCTGAGTCAGCTTCTTTCTCTCCATCTAGCCTTGCCTCCCCCGGT
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TATTTAGTACTACTATAAAAAAATCAATCTATAGGAAAAAGGAAAACTTA
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ATCTGAGCATTTCACGTCACGACAGGCGATGTGGACAAATGCTATATGCT
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CATGCTTGTCGATGTGTATGTTTCTCAGGCATGCCAAGACTTCTTTTTCT
CTTTTTTCTATTCTTTTTTTCATTTTAAATAGGGTGCAGATTTTTAAAAA
TTATTTACAATTTTCAAAATGTTCAAGGTTTAAAAAATGTTCATGATTTT
AAAATTTTGTTCACAATTTTTTGAAAACTCTTTATGATTTTTTGAAAAAA
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AAAATTCATTATTTAAATAATATTTTAGTTTTATAAAATACTAAAAATAA
AAAAAATAATGTTTAGGCAGGAAATATTTTCGTGTAAACATATTTACGAT
TTCTTTAATGTCTCATGGTTGGCTTACTGCTTCCAAGGATTATGCCATTT
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AATGCATGTGTTAACCTTCCTCAAACTAGATTTAGCAGGATGTGTTTGCC
CAATATCCTCATAGGCTATACCAGTTGATTTTTTCATGGATTAAATTAAA
ATTTATTGAATTATATTTGTGTGTCAGTCTTCTTCAACAGTATTTATTCA
CATAATACTACTAACTAATATACTTGGTTTTTAAAAGCATATTGACACAT
ATTTGATGATGTGTGATCACCAATTCCTAGAATGGTGTACTCAAGAGTCA
ATACAATATTTAGTTCCGCCATATATAAGTTCCATATATGCACCCCGAAG
ATATGTTGTCCTTTGTTCTTATAGGAGAACTAACATCATTTCTTTAATTC
ACAAAAAGTAGGGAAACTTTTTTGTGTGGAATTTATTATTGCTCTATAAT
GTTTCATTCTTGTTGTGCTAGGTGGGACTGAGCGCTGCACTAGACACATT
CTGCGGTCAAGCCTTCGGTGCAAAAGAAGAAGCTTCTGTAGGTGTACACA
CGCAGAGAGCTATGCTAGTGTTATTGACCATTTGCATTCCAGTGTCAGCA
GTGTGGAACTGCACAGAGCCTGTACTAATCTTCATCCGACAAAATCGAGA
AGTTTCCACGGTGGCTGGTTCCTACATGCGATGGATGATCCCAGCATTAT
TTGGCTACGCGCTCGTTCAATGCCAGACTAGGTTCCTGAACAACCAAGGG
GTCGTGATTCCCTTGATGCTTAGCTCATTGCTATGTTCTGCCCTCAATAT
ACCTCTGTGCTGGCTTCTCGTTCTCAAGTCTCCTCTTGCCAACAAGGGGG
CTGCCGTGGCTCTCTCTGCCTCATATTGGTTCAATGCCATCTTGCTTGCA
TTTTATATCAAATTTTCACCCACTTGCAAAGCAACATGGACAGGGTTTTC
GAGGGACGCCTTCCACCATGTGCCTCAATTCCTCAAGCTTGCGGTGTCGT
CGGCATTGATGATATGGTGAGTGAACTCTAACAAGCACACTCATTAGTAC
TAGTCAGTTGTTGTTTTTAGCTCTTGTCTCACGGGTAATTTTTGTTAATC
AAGTTTAAGATTCTGGGCGTTGGAGCTCCTAGTGCTTCTTTCTGGTATTC
TGCCAGACCCAAAACTCGAAACTTCAGCATTCTCGATCACGTAGGTTTTT
TTTATCCCTTTTTGCATGGAAAGTACACAAATTTATCTAGATTTTACTGA
TACTGGGCATGAATTGATCTCATAGGCGCAATACTTCATCAATTGTTACC
ATGATCTCCGTTGGTTTGAGCACTTCTGCTAGGTATGCTACATTGCAACT
CTGTATCTGTTAACCTACCGTTTTTTTTTGCGCAATAACTTGGTCATAAC
CTTCATTTTTTTTCTTCAGCATACGTGTATCAAATGAGCTGGGTGCTGGT
CGTCCAAAAGAAGCGCGAAAAGTTACATTAATTGCTTTATTTATAGCTAC
TTCTGAAGGCTTGAGCATATCATTACTTCTAGTCTTGCTGAGAAATGTAT
GGGGAGAGGTTTATAGCAATGAAACTGAAGTTGTGAAGTATGTTGCCAAT
ATGTTACCCTTGGTCGCCATTAGCCATCTTTTCGATTCAATACAATGCTT
GTTTGCAGGTATGTAAGTATTTTATTTTATTTCTATCTACAGGTGCTCCT
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ACTATCACACCATGCATATCATATGATTTAAATCAAGATTGAAGTACACT
AATTCAACATAAAAATTGACTAAGGCGTGAAAAGATTTTGTTTAGCATTT
GTCACTATTAATTAAAGCATATGGGCTAATTTTTTAATTGCACAAGTACT
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GTTGCCTAATTTTGTGTTGAGAATGACATTTCAAGGAAAATTTGTCTACA
TGTCAAATGCCGGTTAAGTTTCAAACTATATAACTATGGATTACCAGGAT
ATGGTTTTGTTTCGGAGCAGAAGGGTGCACATTGGTCACTTGTCCATGCA
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TTTTGGATTCCTAGGTATATTGAGGGGATGTGGATTGCAAAGGACAGGTG
CAATAATAATTATAGGAGCATTGTACTTTATTGGTATTCCTCTCTCGGTT
GTTTTGGGCTTTGTTGTTCACTTGAGATCAAAGGTACTACACAGTATTCT
TCTGTTAGATTCTATAATGCCGAAGCTCATGTGCTATTAATCTAAGTGAT
ATTGGCTACAATGAAAGTAGTTCCCTATTTGTGTTGTGGTAAAAGTAATT
TTGCCAATTCTTTGTCACTATTGGATCAGGGCTTTTGGATTGGGTTCATC
GTCGCACTCTTCGTTCAAGACTTGATACTTGGAATGCTATTTTCAACCAT
TAGTTGGGAGAACCTAGTAAGTTATATGCATCACAATAGACTAGCATTTA
GAATGTTTTCAACAGGGGGAGAAATTCCATCTACAGTCTTGAAATAATAT
CACACCAATTACACGACTAATCCATTGCAGTTTATATTAAGAGAAGTGAC
CTTAATAAAAGCCTTCCTTTATAGGGAATGCCAGGCTTAACCTTCGATCA
GTCAGTTGAATGTGGATTCATATTTATGATATTTCTTTGTTTTTATTTAT
AGGCTGCCAAAGCTAAAGAGAGGGTATATGTTTCCATCTCACAAAAAGAT
AACGTCTCCGGTAGAGAGGGTCAAAAAGATATAGTACACCCTAAAGGTTC
AAGGGGCACGGTACTAGAAGAAGGTCACGTCTGTATACAACAAATGTCTT
GATCATAATTCTAAGGGTTGTGGACAAAACCCACTTTCTCCTTGGGAAGG
TCCCAGAAGTAAAAAAGATGTACTGCCTTTACCTTGTGCACATCACTGTA
ATTGTATTTGTTGTATTACCTTGATTTGATTTTTTAGTTAATAAAGCTCC
CTTTAAATCTTAGTCTCTTGAATGCATGCAGTAGACCCATTTGTTGTGCT
GACAAGACACCAAACACCCATGCGGTGGGCCTTATCATTTAGCCACACCG
ATATCCTAAGGTCAATCGGCGGGAGGAAGATTTTTACACCCGAGGGAAGA
CCTAGGATGTTAGTCCTCAATGGGGCTACCTTTCACTGGTTCTAGTATCG
GCCCACGACCCATTGGTCGATGTTCAAGCCCATTGTTTCCTGGCCAAGCG
ATGGCTTTGGTGGGGTTCATCTCGACCAATCAGTTGCAGATGGGCGTCAA
GTGGATCATATGGCCGTCATATCCTTGGTGGCTTGAAGAAACTCGCCAAG
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CCTCACACCCTGATAGACGGCGGAACTGAACCCGGGGTTGTCGCGAACCT
AGAAGAAGGTGTTGTACATGTACCCACGTTCACCAGTGCGCCGACCATGT
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TCACGCTAAAAAACTAAATTCTAAGAACACCCGTGAAAAAGGAAGTTTGC
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ATCATCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATATTTGTGAATGGAGG
TAGGAGATGTCCTAGACGAGATGAAGAGGCAGCTGAAGCTCGGGCTGCCG
ATTGCCTTCACGAATACACTCAACTCGAGCATCCTGTTCGTGTCTCTCAT
GTTCGTCGGTCACCTGAGCGACAGCGAACACATCTTCGCCGGCACAGCGT
TGGCCACCAGCTTTGCAAATGTCACTGGATTCAGCATGATGGTACGTCTA
TATGCACCTCTCTCCCAAGCATGATTTCGATCTTGCTTCATTTCTACTCC
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CCCTCTAGTCTATATTAATGACCTTAACTTTATCTAGATACGAATGCATC
TAGTCCAAAATGCTTAACTAGATTCATATGAATCTAGATAAAATTAAGAC
CATTAATATAAACCGGAGGAAGTAACATATCTATTAGGGCCAAAAGCACT
CGCACTTGGCTCAGCTTTCCTTCCTATTTGTCCTCGGAAAGCAGCTTTAG
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AAGCGTTTGTAGAGCCAGGGGTTTAAAAACGACAAAAGATCACCATATTT
TTTTTATTACAAACAGCACCCGATTGGGCTGCCGAAAAGCATGACTAAAA
GCTCTTCCACCATCAACAATTCAACATCATCAGCTAAGCTCTTGCACTCT
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TTCTTGCGGTTCATCGATACTTGAGAGATTGTGGTAAGACTATATATACC
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ATATATGCAAAAAACATAATTAACGTCTTCAATTCCAGAATTTAGGGGCT
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GTGCTTACCAGTCAGCACTATCTTTTATTATCACCATATATATATAAGTT
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AACAGCCGTTTATTTAATCTGCAAAATATAGGGAAACACATATTTACAGA
CTTCGTTATTGAGTTATAATGTTTCACTCCTTGTGTATTGTAGATTGGAC
TGAGCAGCGCACTAGACACATTCTGCGGTCAAGCTTTCGGTGCAAAAGAA
GAAGCTTCCGTCGGTGTACACATGCAGAGAGCTATGCTAGTATTAATAAC
CATTTGCGTTCCAGTGTCAGTGGTGTGGAATTTTACAGAGCCTATACTAA
TCCTCATTCGACAAAATCGCGATGTTTCCGCCGTGGCTGGATCTTACATC
CGATGGATGATCCCAGCATTATTTGGTTGTGCGCTCGTTCAATGCCAGAC
TAGATTCCTGAACAATCAACGAGTCGTGATTCCCTTGATACTTAGCTCAC
TGATGTGTTCTGTGCTCAATGTACCGTTGTGCTGGCTTCTCGTTTTCAAG
TCTCCTTTTGCAAACAAGGGAGCTGCCATGGCTATCGCTATCTCATATTG
GTTCAACGCTATCTTTCTTGCACTCTATATCAAATTTTCACCCACTTGTA
AGGCAACATGGAAAGGGTTTTCGAGGGATGCCTTCCACCATGTGCCTCAA
TTCCTCAAGCTTGCTGCCTCGTCAGCATTGATGATATGGTGAGTGCTTTC
CATTCTCCAAGCACATTCTTAAGTTTTTTTTTAGATTCTCGTTAATCTAG
CTTTTGTCTCACCTGGAAATTTTGTCAATCAAGTTTACGATTCTGGACGT
TGGAGCTTCTAGTGCTTCTTTCTGGTATTCTGCCAAACCCAAAACTCGAA
ACTTCAGCATTCTCGATCACGTAGGGTTTTTTTGCTTTTCTTTACTCATA
AAAATAATATGCAAATTATCTTGAATTTACTGACACTAGCATGATTTGAT
TGCACAGGCGTAATACTTCAGCAATTGTTACCATGATCTCCGTTGGTTTG
AGCAGTTCTGTCAGGTAACTTGAAATATAGCGTTCACATTGTAACTCTAC
ATTTTTTTGCAGAACACCTTGGTCATACATTTTACTTGGCTTCAGCATAC
GTGTATCGAATGAGTTGGGTGCTGGTCGTCCAAAAGAAGCACGGAAAGTT
ATATCAATTGCTTTCTTTATAGCTACTTTTGAAGGCTTGAGCATATCATT
ACTTCTAGTCTTGTTAAGAAATGTATGGGGAAAGGTTTATAGCAATGAAA
CCGAAGTTGTGAAGTATGTGGCCAATATGTTACCCTTGGTCGCCATTGGC
CATCTTTTTGATTCAACACAGTGCTTGTTTTCAGGTATGTACACATTTTA
TATTTTATTTATCTACACGCGTCTCCCAATACATGCAACTCTAGATGCTA
ATAAACCTATCAGACATATTTTGCAAATCATACACATAAGTTGGACTAAG
ATTCATGCTTTTATCACATCGCAAAACTATGACACCATGTGTTTGAATGG
AAACTGAACTTAACCGATTCAAAAGGAAAATTGACTAACTCACGAATATT
TACTTTAGCATTCATTGTTAGTTAAATCATATGCACTAAATTTGTTAATA
GCACAACATTAGAATCTTACACCTAGGGTTTAGGATTTTTAGAGTTTACG
GTGATTACTACCTTTGCTCGAGTACTATGAAAATCTAAGGAATGTACCAC
TCCTTAAGGTGACAATTTTGCCCATGTGTCACTGTTAACAATATGCGGTG
AATGAAGTGCACCATTTGTGGAGCCTATGATTCCATTAAATTGAAGCTGT
ATAATTATTTTAATAATGGTATTTTAGAAGGAAAATTGTGTATTATGTCA
AATGTTGATCATTTCAGACTATGTAACCGTGAAATTCCAGGATATGGTTT
TGTTTCTGAAAAGAGGGATGTACCATTGCTTACTAGTCCATGCAAAGTCA
GCAGAAAGTTACAGTGCAATCAGTGGTACTCATATATTCTTCACTTTTCT
GGATTGCTAGGTACATTGAGGGGATGTGGTTTGCAAAAGACAGGTGCAAT
AATAATTATAGGAACAATGTACATGATTGGCGTTCCTCTTTCAGTTGTTT
TGGGCTTTATTGTTCACTTGAGAGCAAAGGTACTATGCAACATTCTTCAG
TTAAATTATTTTGACCGGTGAAGTTTCTGTGCTATTAATCTAAGTGATAT
TTACTAGCTCATGAACTATGAAGGTACTTCCATAATTGTATTGACATAAA
AGTATCCTTTTTCCAATTATTTGTACTATTGGAGCAGGGCTTTTGGATCG
GGTTCATCATTGCATTGTGCGTTCAGGATTTGATATTTGGAATGGTGTGT
TTATCTATTAATTGGGAGAGTCTGGTAAGTTTTATACTTAATAAATATAC
CTGTATTTTAACTATTTACACCAGAGCAAGAAACTCCATCTACTATCTTA
ACATAATATCACACCAATTACATGACTAAGAATGTGTTCAAGTTTGTACT
AGGAGAAATCGGTTAACCTTAGTAAAAGCCATCCTGCATTTAGGGCTTAA
ATCTCGATCAGTCATTTATTAGTGGATTCATATTTATATTATTTATTTGT
TTTATTTATAGGCTGCAAAAGCTAAAGAAAGAGTATACATTTCCATCACA
CAAAAGGAGAACATCTCTGATAGAGAGGATCAGACAGTTATAGCAGAACT
TGAAGGTGTAAGGAGCATGGTACTAGAATAAGATCATGCCTTGATTGGAA
AAAAAAGGGATGTGAACAAAGTTTCACCTACTTCCTCCTTGGGCAGGTCC
CCGAAGTAAAAAATCTACCGCCTTTACCTTGCGCCCATCACTGAAAATTG
TACTAACTTTACTGTTTGTGTCGTCTTTAGTTGATTTGTAGTTAGTACTC
C

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.