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GrainGenes Sequence Report: AA018352

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Sequence
AA018352
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA018352
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAAATAACCAGATAGAGGCCAAGAAGAGGGAAAGGAAAATATTTCAGC
ACGGCGAGCGAAAGAGACCCTGAAAAAAGCCAACGCGACGCCAAATCCAT
TCCTCTTCCCTCTCCACAGGCTGAGGCGAAGCCAGCCGAAGCGAACACGA
ACACCCTAGGCCAGGCGCGCGCGCGCAGTGCCGTGGCGGAGTCGTCGGCC
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GGCGGCCGCGGGGTCGGCGGCCGAGGCGCCGATGCTGATATTCCTCTACT
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TTCTTGTTGACCCTTTGCGTCCTGACAATCTATCTTTGTAATGCTTTCTT
GTTATGTAACAATTACGCAAATTAGTTTCGAGTTCTTCGTCCTCTAGTTT
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AGAGCATAAAGGGGAACATGACCTCTTTTCCCAGCTGCTTGCTTTACTAC
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TATTTAACATATTTTCATCCATATTACCCTATTTAGCTAAAGTTTTGCCA
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GTAAGTGGCGCTGATGAATTACGAGCCTGTGGCCAATCAATTTCGGTCAT
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ATGGGGTAATATGAATGCAAAATTGTTAAATGGGGTAATTAGTGTCAAAA
TAGCTAAACAACAGGGTAAAAAATGGAATTCACTCTATTCATTTCATACC
TGACTAGATATGGAAAACAGTAAGCTGCCCAGTCTCATATGTTTGAACTA
ATTTTAATTTCTAAAACAAGTGGATTTTGATGACAATATCACCATTGAGA
AGTTTTATTAAGGTAGGCTCTTGTTGTAGTTGTATTGATGAATCCTTAGC
AAAAGCATTTTACTACTAGGTTGTCCAACTCTCTTGCCCTTGTTACAGCA
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CAAACCAAGCTGTCAAACATTTACTTCAAATATTTTGAGAGATTTTATGA
TATACTTTCCCATTAAAGCAATGGTAGTGAGACAGCTGTGGTCTTTTAGT
TGCTACTGTATTGTCATCATGGTTTTAAAGGCGTCGCCTAAGCGACACTT
CAGCGTCCGAGCTCTCCGAGAGTGCAAGGCGTCGTCGTCGCCTTTGGCTG
CTGAGGAAGGTGTCTATAGGCGTCGCAGAGGCGTCCCAAGTCGTCGCCTC
GGCATCCCAAGTCGTCGCCTAGGCGGGAAAATCGCCGCCTTCCTCGCTTC
TGGACGCCTCTGTCAAGTCGCGCGTGAAATGAGCGTTGGCGGGAGGGGAA
AACAGAAATTGGCGGGCTGGGAGAGAAATTGGGGGCCAGGGATAGGGAAA
AGAGAGGGAAGAGAGAGAGGGGAACAGACCAGGCCAGGGGAATCGATTGG
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GATTTGCTCCTGCTCCGCCATCTACCAGCCTCCCCAACTCTGGCCAAGCT
TGTGGCCAAGCTTCCGGCGACTCCTCCCCCTGGTGCAGCCCTCTCCCAGA
GGGGAAACAAGATACGGCTTCTCCTCCCCCCTGGCGCAGCCTCCCTTTCC
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CTGCTTGCCTCCCTCAAAGGCGTCGCCTTGCAACGTGCCTTGAGCGCCTA
GGCGTTGAGGCGCCCCCCATCGCCTTGGGACGCCTGGACGCCTTTAAAAC
CATGATTGTCATTGTTTGTCATTGCCATGGGTTGGCATGGTACCTTGTTT
TCGTATTCTGGTTAAACAGTCACACAGTTCTGACTGTCATGCATGCATTG
TAGACTGTGTACTTGTCTTCTGCATTTTTTAAACTCTGCAATGCATGTTC
GTGTTCGAAGTATTTACCTCATATATGAATCTTACTTTAAATAAACTAGT
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TGCCATTCCTCTGTTTAGATTTTTGCTTCATTCTTTGATTTGCACTAGAA
AGTACAAATATGCATCTATTTATCAATCTCCCTCTTCTCTGTATTTTTTA
GGTGGACATACGTCTTAACTTTTCCTTTCGTGTTGCTTTCTAGATGTACT
TCCTCCGTGTCAAAACATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGTAAATGTATC
TAGATTTGTTTTAGTACGTGGTTCACTCCGGTTTAGAGTGAATCTAGATA
CTAAAAGAAGTCTAGATACATTTTCTTTACAAATCTAAAACATCTTATAT
TTTGAAACGGAGGGAGTATATACCAACGCCTAAAAAAAGGCTGTATACAG
TAACATACATTTGGCATACAGAGTTCAATGTTCATGTAATTTGTGTAATA
CCTCTATGCTTGTTTGTATTGAACTCAAACTATTAGAATAGGTGGTCTCT
GAAACTCTAATTGCAAAGGAGGTATAAACATGTACAAATATTTAGAAGAT
TCACATTATGTATGCGCCGTTCTCTTTTTCCAACTGTTTGAGCATCCAGC
TCGCTAATCTCCATGACATATATGCTTGTTTATTCTTCTTCTCTCGCTGA
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GTTGAGTTGGAGTTGGACATGCTGATACCAGTGGGACCCAAGATCTTTTA
GTTTTATTCAATCATCTACATGATTTTGAGAGTAAACTGCACTCTGCACC
ATGTAAATTGCAACTTGTGTCACTTTGCAATTGTTTTCGTAGAAAATAGG
TTTGCAAAAGTCTGGAAATGAATTAATACATGTGTATTCTGAGACGAAAT
GTATACGAATAAATTTTGTTTAAAAACTCATACAATGCCTGGAAAGCACA
CTAAATCTTTTTTTGGCACAGGTGGCAAATAGTCATATGCCAAAATCTAT
CCCCTAAAACACATGTACGAATTTTTACAGATTTTTCCGAACACGTCTTT
GTACGATACCTGGTGCAATGCGATATTATTGTGCCAGACCTGGTGCAAAG
TGACTAAAGTGTCATCTACCAGGTGTAAGGTGCAACTTACTCTAATTTGA
TGATATCATGCAATGTTGTAGCCTCCAATTATTAAACAGAAAATTGGGTA
TCATTTCTTGTATCCCTTGCTGCTGTACTCTAAAGAGGCCTCTCATTATC
GATGAGAAGCTTTGACTTTAGTTTGGTGACTAACCCAGACAGAGAAGTGG
GTTGCAATATGAACTTGCATGAACCAGAACCTATCTTTGGGTGTTTAGAA
AGCGTGTTAGATTTTTAGTTGCATTATGTGCTTCACATGATCATGTATCT
GCTGTGGTGTCTGTATTCTAAGATCATATCAGATGTATTTACTCAAAATA
GATAGAAATAGTGTCTGATCATATTTCATACCTATTAGTGTCTGATCATC
TGAATTTTGTAGGTCTTCCCGTTGCTTACCAAGAAATTTTCATATGAAGA
GCAGTCTGATTTAGTGTGGCAGTTCTTATGCAGCATTCCTGTAAACATGC
TGGCGGAGTTCCTTCCATGGCTTTCAGCTTCTGTTTCATCCGATGAACAT
GAAGATATTCGTAACTGCTTATGTAAAATAGTACCTGAAGAGAAACTTCT
TCAGCAGGTCTTCACATTTGCGACTCTTTACAATTTCAGGCAATAACTTG
CTTGGTGTCCTGTTAAATTTGAGTTTAAAATTTGTGAAGGTTGTATTTAC
TTGGATCGAGGGGAAAGCAACAAGAGAAGTGGTGCAGAGTATCGTCAGTG
ATAATTTGGAAATAAGTCATAGCTTCAAGGATGCCTCCGTTGTTGATCAA
GCTGATGGTCAGGCTGACAGGTTTCCCATCGATGAGATCTTATATTGGCA
TAATGCTATCCGTAAAGAAATGAATGATATAGCAGAGGAGACAAGAAGGA
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CAGTTTATTGCAGATGTGTGCATCTTTCACAGGTATGCATCATTGAAACT
TCACTCATTCACATATTTTTGTAAGATCCTGTTTTGCAACTGTGGTAAAT
TCGGTGCTGTTTTTATGCAAGTTGACATTTAGCATGTCATTCACTCATTT
GTTTGTCAATGTTTAACCTATCTGTACTTACATTCATTGTGTACCTGCAT
ATCCTGCTTGTTGCATGGACAGTTTGGTGGCTTATGCACAGTTTGAGACT
GTAATAGACTGGTGGCATCTAGGTTGCAAGTTTATATTAACTATCTGTTA
GCTTCTTTTAAGGACTTAGATAATTTACTATAAATTTGGTAGTAATTATG
AATTATCTTAAATAACCAGATCCCAGTGTTTTGCAGAACAGTACAGCAAT
GGCAAACTGATTCATAGTCACCATAGCTAGCATATGACCGCACACTTCAA
GATTACTAAAGAACACCTGAATATGATGTTTATCATTGCATGATTTGGTA
CAAACTTATGCCTTGAGTTTGTCATTATCAAATCAATTCGCTCGTCCTAC
TCCCTTGATTTTTTTTCCATCCTAAGTAACGCAAGATGACAAACACTTGG
GCAACTAGTATCGCCAAATTTGCTAATTCCTCTCAGATTAGGAACACTTA
AACTGAGAAGAGTTATGTACATATGTATTATGGTTTTATTGTACATATAG
GAACTTCTTGTGTGCATGTACTGCTGTCATGCTAGCCATACCTTGCATAT
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GAATTGTCCTTCGTGCTGGAGCATGCTGAAGAAGAACGGCGATTTAACAA
TTTTAGACGCTTAATTCAGCAAATCCAAATGGCAGGAGCAAAATCAACTG
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GCAATTGAGAAACACTTCTATAATGAAGAAACCAAGGTGAGTACTTAGTA
GTGATGTTGCTTGATCGATGGAACTATCGTTTTGCCGGTCGAAGTTTCAT
ATTTGATTTAATTACCTAGGTGCTTCCCCAAGCTAGGGTTCTTTTCTCTC
CTGAGAAGCAAAGGGAACTTCTATACAGAAGTCTGTGTGTCATGCCATTG
AAGCTATTGGAACGTGTTTTACCATGGTTGGTGTCAAAACTGAGCGATGA
GGAGGCATCTTCTTTTCTTCAGAATATGCGCTTGGCAGGTCATCTATTTA
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TTTTGGGAATTTGCTAAAAGATTCTCATGAAACAGCACCATCATCTGAAA
CCGCGCTGGTCACTCTTTTCTCTGGTTGGGCATGCAAAGCTCGCTCAGAG
GACAAATCCAATTCTGGAGAATATATATGCTTAACAACAGGGGCAGCAAG
ATGCCTGTTGGACGATGTGGATGAGCTGAAAAAATGTCAATCATTTTGTC
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AATGGCTCTAGACCAGGCAAGCGAGGAAAAGATGCAGAATCTGTCCTTGG
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GTAGCAAAAAAGCTTGTTGCATTCCTGGGTTGAGAGTAGAAACCAGTAAC
CTTGGTATTGGTTCACTGGCTTCTGCAAAGTCCTATCTCTCTCTATCATA
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GAAGATTTCGTTTATTATGGGGTCTTTACAGGGCACACAGCAATGCTGAG
GATGAGATTGTGTTTCCTGCTTTAGAATCAAGAGAGCCACTGCACAATGT
GAGCCATTCATACACTCTTGACCACAAGCAGGAAGAGCAATTATTTGAAG
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ATGCTGGACACATGGAAGCAAGCAACCAAGAATACGATGTTTGGCGAGTG
GCTAAATGAGTGGTGGAAGGGAGTTCCATCTGATTCTTCGGCAGAGATAT
CCTCTGTTCCAGAAGGTTTGTGCAGTTGGTTTCTATGGGCTTTTGCCCTC
TACCACTAGCAATGGTTTCAACTTGCATTGTTCCCCACTTGTTAATACCG
TGTCTGTCAGAATAATCATAAATGTTACACATTGTGGTGCATATGGCTTA
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GTGGTCCAGGGAATTGTAGGTCCAGTGTTGGGCTATTTTTCGGTAAATAA
ACAAGAAGACCTATCAATTGTTTATAATACTTTGGAATGTGCAAGCTATG
AAGATTTATCAAAGAGCATATCTTGGGTGTTTCATAGGGAACAAACATGC
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AGAATGAATTCATAAACATTGATTAATTTAGTTCTCTTTGCTTGGTTTGT
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TTTTGCATCTAACGCTTGTTTAATCTGGAAGTAGTTCTACGACTGGTTCC
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ATTCATTCACAAGACAAGCTTGACCAGAATGACCCGATGTTCAAGCCTGG
CTGGAAGGATATCTTTCGAATGAACCAGAGTGAACTTGAGGCAGAGGTGC
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GCAGCGGAGGTGCTGGTATACCTGGATGTGTTTCTTCGTACCGTGACCAG
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TGCCGCTTGCTGTAACAAGCTGTTCACGTGCAGATTCTGTCATGATAAAG
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AACTTGCAGTTGCTTTCTTCATGAAAAATATAAACTTTGCACATTTCCTG
ACAAGTTTTTCCATTTATATTTCTGAATCGATATCTTATTTATCCCTTTC
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ATTGTTCACAGGAACAAATAAGTATAAATTCGATCTGAGCTGAATAGGGT
GTCAAGTGGGATTCCACCTAAATCCCACTTCTAGTTCATTTGCCAAATTT
TAGTGTAAATTTTGAGCAAAAACTCAAAATTTACACTAGATTTTGAGAAA
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AAATGTTTCTGTTCCTTGACCTAGCAATAATATTAATCTCTATTACTGTT
CAGTGTGCTCCTGTGGTGCTTCACCTAGCAATAATATATAGAATGTAAAC
TAAAAGAGTATAATTTCTGGTGTTCTCAGGAAGAAAAAAATAACTTTGCT
AGTGTACGTTCTTTTCTCTAGACCATTTCAATCATATCAAAACATAAATA
TACCAACGTTACTTGCTACCTGTAGGAAAGCAACACAGGAGATGATGTGC
ATGGTATGTTTGAAGGTTCAACCTGTCGGTCCAAATTGCCAAACTCCATC
TTGCAATGAGCTATCCATGGCAAAGTATTACTGTAATATCTGCAAATTTT
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GGCATGTGTTTTTGCTATTGTTTATAGACCAATGTATTGTTCTGGTGTTA
GTTTCTATGTATTTTCGTGACATGTAGCACCTCCACATCCAAATTCGAAC
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TGGTAACAATCTAATCAACATGCAAAAATCAGAGGAATTTTAATCTAATA
GAGCATGCATAACCAGTATTGATGCAATCAGTTTCTTAAGATATTTACGC
CAGGGAATATATAGTGAAGCCTGCTCTGTTCACCTATGAAATTATCAGAG
AAGAACAAAACTGAAAAATCTTTGGTAAACAAAATGTCTGTTGAATGTAC
TACCTCTCAGGTTCAAGCTGAAACTTCATATTGGAAGGAGAAACGAGTGT
GAGGAATTTTGATGTCCATAATTACTTTTATCTTCCACATCTCTCTTAAG
TTCTCCAGAGAACGAGATTTTTTCTCTCTTAGAATCTACCTTCACCATGT
TATTGGTTATCCTAGCTATTAGTTTCCAATATTTGTACTCGCGGTATGTA
TTAGTTGTCTTCATCATGAAATGGGCATTAGCAGACCCTTGAGAAGAAAG
AACACATTTTTGGTTTCTTAAATATTTGGATGTCACCTTGGGTTAATTTT
GCCAATGCTTTGCTTAGTTGTCCAAATGCAATAATGCAAATTAGAAGCGG
TTGGTTTTCCAAGTACACATGTTGTATCATAGGCAACATACTTTGGCGAT
TGAAATCTGGATAGCATATGTTTTCATGGTAAGCAATAGGTCTCTGCTAA
TGTTGGGATGTTTTACAGGACGGTGTACCATTGCCCATTTTGTAATCTTT
GTCGTCTTGGGAAAGGTCTTGGCGTTGATTTCTTTCATTGCATGAAGTGC
AATTGCTGCCTTGGAATGAAACTAACAGAACACAAATGTCGGGAGAAAGG
GCTAGAGACAAACTGTCCAATCTGCTGTGACTTCCTATTTACATCAAGTG
CAGCAGTTAGAGCTCTTCCTTGTGGCCATTTCATGCATTCAGCTTGCTTT
CAGGTACTAGCATCTAGTAACATAATCATGCAATTTTCTACATAACTTCT
GGCTGTCAAACATGCTTCTGACTATTTTCAATCCCAGGCATACACATGTA
GTCATTACACTTGTCCTATCTGCTGCAAATCCTTGGGAGATATGGCGGTA
TGTTATATCATTTTTACGGGGTTACAGATATTTTTCATTTACGTGAATGA
AGTTTATCTTCATCTTGAGTCCCATAATTTGTTTTCACATTTTTATTGAA
CCGTTCTTTCTCCTTTTTTTGCCCTTCATCTAGAGGGCATTCCACTAAGC
TGATAAGTTGTTCCATGAAAGCAAAAACTGAAACATTTTCCATTACTTTG
AAACTGGAAGCATGTACCTCCATTTGAGGGTAACACAATCAAATGTTTTT
TCTCTTCAGTTGTATTTTATGATTATTGACTACCGAAACCTCTAATCCTG
ATTCCTGATGCCTGAGGATGACTTTACATGTTGCTCTTGTAAATTAAACT
CAGTTCCCAAGATGCCAAAAAGGACTGTTTTGGTCTTTGGGAGTACACAA
TCAGATTTTTTGCTCGAGTCATGCTGAGTGATGAATGATTCCCTTCCCCA
GTTCATGAATGTTTTCTTCTACGCAGACAAGTTTCAGTGTTATCTGAATA
GGAAATAGGAAGTGTTATATTGTGTTGCCATTATGTGAGAAGCCAACAGA
AAACAACCAGCTTTTCACTTGTTTGAGATCTAAATGCTGATCAATTAGCT
TCCGTAACACTATTTGTCCAATACCTTCATGATTACCATAGTAGTCTCGG
AATAGTATAAAAATCTTAATGTTCTGCAACGGTTTTAGTCATTCCCTGAA
CTTAATATGGTGTAGACTACATGCTGTAGAGGTAAACAAACTATCGGCAT
CGCTTGCAACATCTAATGATTGTTGTTTGTGAGCTGATTGCCTAAACTTT
GGAAGCAGGTTCATGAGTCTTACTGAACTTATATCTTTCTCCATTTGTCT
ATGTACAGGTGTACTTTGGCATGCTTGATGCATTGTTGGCTGCTGAAGAG
CTTCCAGAGGAATACCGTGATAGGTGTCAGGTATTTAAATTCTTCTGTTT
TTCTTTCTCATTATTTTATCCGCTGCACAGATGCAGTATTTATATTTTGT
TGCATTGTTCATCCAGGATATTCTTTGTAATGACTGTGAAAGGAAAGGGA
GATCTCAGTTTCATTGGCTGTACCACAAATGCGGCTCCTGTGGTTCTTAC
AATACCAGAGTCATTAAGACTGATACGGCAGATTGTTCTACACCAAACTA
ATGAGGGGAATATTCTTTCTTTTGTTTAGTTTGTATCTCTGTAAATAGTC
TTACAGAAGCTTGTGTAGCATAGCTGCTATATTTTTTCATCCCATAGCCA
AGTCATTTTTGTCAAGCATAGCGTGCAATTTACTAGGTGTAGCGCTATTA
GTTGTAAAAATGGACATCCGACTGACATTCATCCTGTCAGGTACATTCTG
CCCCAAAGGCCTCAATGTCCACCTAAAAGTATACAGTATACACAAATGCC
GACACAATCACATAAATCTTTCTATTGGGTGTGTGGTTCCACTCGGTCAA
ACTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.