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GrainGenes Sequence Report: AA041601

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Sequence
AA041601
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041601
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCCATCCCCGCCTCCATGGACCAGCTCCACAGCAAACCAAGGCAGATC
CCACGACGCGAGACCCACAGGCAGTCTCTCAAACTGCAAGCACCAACCCC
ACTGAGAAATCAGCGCTCCTAGAAGTTCCCGCCAGTCCTCCACCCAACCA
GCGGCGAGCTCTTAAACCCACGCCTCCCGTGTGAAACCCCCATTCCGCAA
CAACATATTCCCCACCTCGCTCGCGCCTCGCGGGCTTCGTTTCGAAGTAG
GAAAAACCCTAGCCCACCCACGCGCGCGGCCGCGAATCTCGACCGATCAT
CGATGCCGCGGAGAGGCGGGGGCCGGGGGAAGGGGAGAGGGCGACGAGGA
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TGTTGTCAGCTGGAAAGTATGGTGCATACATTTTTGTTTGTGAACGAGTT
ACATTTGTTATGCAACTGCACAATTGTTATCTATATTTGATTAATGACTA
ATCTGCTGTTCTGTGTCATTATTATTCGTACACATCGACATCCGAGTCTA
GATCGGTTGCCACGATTTGTATGGAAACTTTCTAGCCTGTATGCTTGTTC
TCTCTAAACCTGTCTAATAACATAAGAGATGTACTAGAGTATGACTTGTT
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ACTGGAAAGCAAGATTTGATTTGTAGTGAAATCGAGGATGATGTATTTGT
GAACAGCGAGGATGGTAAGAGTTATCCGCTTACAGTCTTGAAACTTAAGA
TGTATGGATTGATGAATTTGTTGTGTATGGCTTGTTTTGTTGACTCTGGA
CGCTTTTCTTCGCATAGATTTAGCATAGCCACACAAAGTTATGGTTTCTA
TTTGAATTTTGACTCACAATATTAGTTTGAACTTATTCACACAGCAGGTG
GGCAAATGTTGCCTCCTGGTAGGAAGTCCAAACGCCTACTGCGAGAATCA
ATCAGAAAGCAGAATTTGGTTGATGTTTTTGCAAATAGTGAGGATGGCAA
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TCTTTCCTAATAAATAAAATCCTGATATAACTTTTACCAGCATGATTGCA
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GATGACGTTTCTGATAGTGACACTAATGAGAGTAAGTGGGCAACCTTTGA
AGTAATTTTTTTATCTACATGATTATATCATGATTCTCTTCTTTTGCGCA
CCATGTGTTTTGCTTAGTAAACTTGTCATATGCATTTTCTGAGGTGAATT
GAGCAGCCTTTGGGAATCCTTTTTTTATTTTCTTGAAAATGACTAGATTT
AATAACTAAAGATGTGGTTCAGATAATATTTACAATGGCACTAAGCTTTC
TGTTTCATTGCACAGTATATTTCATGGTTTGTTTTTGTACTGGGTCAAAC
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AGAAACAAGCATATTCAATAAGCAAAAGGAGAGATTAAGCAGTACACCTA
TTAAGCACCCTAGCTTCTATTTATATTGTGCTAATTGGGCGATGGTGTGC
CATTCAATGAGTTGACATAATTGGACTGCTCTGAAATCATAACAGATCAT
AGGAAGGCAATTCCATGCAGAAGAATGTCGAAGTGTTTACAAGAGAAACG
GAAGGCTGACCATATTTCAGATGTAAAATTCTCAAAAAGAAATGGTTTCA
TTAACTCATGCTTTTCATGAAGTGATAAATGTTTCATGTTTATTTTTAGG
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GGATCAGGTAATAAGCAATCTACTTGTCGAGAAGTTTCAGTTTAATAATC
ACCCACGTTGTCGATGCTTTACTCTGCGCAGAAAATTCTAGAACTCCTGT
AGAGCTATGATGTATGTATCATGCATGTGTGTATGATGCATGCAATAATG
TTCTCGAGTGACATCTTATCAGTGGATGTTACAGCTATACGTCCTTCGTT
ATACTTGTTGCGGTAGTCTGCAGATTCAGTCATACATTTTTCTGCCTTTT
GTTGACCTATTGGATACTTGGGTCCTTGTTTTGAGGTTTATCTAACATGA
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ATACTGTAAAACCTTGCCATAGCACTTCTGTTGGACCCATGTGCTCAATA
TGTAAGGTATTATTTTTGCGAGAAATTTGCAAGGTTTGCTCACACATATT
GTTTTGCATTTCCTTTTAGCCATATGCGCAATCTTATTTGGTATATCTGT
GTGTAGAGTGGAACTGGCAGCTGTCTTCTAATCCAATGTCAGAATGCTAG
TTGTTCTCGTAGCTTCCATAGTTTCTGTCTTGATCCTCCTATGCAAAACA
GTGGAGGCAGCTTGGAATGTCCTCTGTGCAAAATCAATCAAGCTTCCTTG
GCTAAGGGGACAGAAGTGAATCCCTCAAAAAAGATCCAAAGGTTTGTTGG
CTGCAGACGGGTTATTCTTCAGGAGTCAGATTTTCAGTATCAGTTCCTCG
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CCTTGCCACTCTTGTTTAATGTAGCTACCTTGGAAATGCAGTTTTGCTCT
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GACAGCACCCTGAACTAGTTTGTATTGGTATGGCTAAAAGTGGAGCTTGC
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GTTTGTTAAATGACGCTCTGCTGCATTTTGAAAAAGATTTCATATGTGGT
CACTATTATCAATGTAAGATTTTAATTGTTTTAATGAGAAATTGAATTTT
ACATGCCCTAGGTTCCCCTTGATTGGCTTCTTGTTTTCGATCGTCTACGG
GCACAAACCTACATCAGGAACAATACGTAAGCACTCTTTTTTTATTCATT
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TGTAGTCTGAACAGTCTAATAGATCCTTATCAATAGTGACATGATCAGCC
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TTGCTCCTTCTCAGTAATAAATAACACTCCTATGATATTTGCACGCACCA
ATAAGAACAATGAACAATACTGAATTTATAACTGCCATTTCCTTTTTTAA
TTTATTATGTGCTGTGTTCTTAATTGGAATGACTCCTTTCGTTTACTGTT
TCTAATGATCTTGCAAACTTATGCAACAGCTTGCCTAAGGAGGTCCACAC
GGATGATGAGAGGAAACCAGAATGGTTTGAAGTAGATCGTGCCATTGCAA
TTCGTCGGAAGTCTGACCCTCATGGTTTATGTGACATCTTGGCTAATTTT
CAAGATAATGTAGACTTTGAGGGCTTTGAGTTCCTTGTGAAATGGAAAGG
TCTTGATTACTGTGATGCTACATGGGAACCATATTCGACTGAAGGCGTGC
AATCAGCTGTCTCTATGCTTGTCGAAAGGCATCAAAATACTTTAAAAAGA
GCTGATTATGTCAGCCAAATGAACACTGATGAAATGATACCAGAAAATGT
ACACAGTGGTGCTTTATATGATTATCAGCTTCAAGGATTACGATGGATAT
TTGACAATTTCAAAGCTAGGAGGAGTGTTATTCTTGCTGGTATGTCCATG
AACTCTAAAAACTTAATTCATGCACTTATACTTTTTTTTCTGTTATTTCA
GTACATTACCTCAGAATTATTTAGGTATTGTGGGTATCATTACAATTTTA
TTTTTGAGAAAATGAAAAGCATTATCTCGATTCATTGATAGATAGGATTT
TTTTGGTACACTAACTACAATTTTAGTGATCAAAATGATTATTTTTGTTC
CTTCTGAAATATATGTTTTTAAAAGATGCTTTTAACAGTACTCCTCACTG
ATGTATTTTTTTTAAATCATCGCATGCATTTCTTGGTAATCTATACAAGC
TGGTAGCAGCCTTTTGGCATATGCAATATGCTTGACTGCTCTTTTCTTAT
TGATATTGTGTGAAGACAATAATTATAACTCTTGTATTTTCTTTTCCATT
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CCCAAGAGCATCCTACTCCAATGGAAAAAGGTATGTATAACTTTCCATGA
TCTTCTGCCATATTACTCTAAATGCTATAGTAAGGGAACTTAAAAACATT
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GTGATAAGGACTCCAGGAAGTGTATTCAAGATCATGAAATGTACTCTTCT
GAAAGAAAAACTTTATTTGACGCTCTTGTGACAAGTTACGAATTTGTCCA
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TGTCTAAAACGATATAGCTCAGAGTTCCGGCTGCTACTTACAGTAAGTCT
TGCTCTTGCCTATAGATTGTTTTTTATGTTGCATCCTTTACAATTTAATG
CTGTTAGTAATCCGAAGACTAGGCTGCCTACTTGTGAATGATCTGTCCAC
ACTGATAAATGGTTCTGAACTGGAGGTAGATTTGGATGGAACTACGAGCA
GGACTGATTCTGGACATTCCATTTGTTTGCTGCAAAAAACTATACTACTT
CACTTTTCATATATATTGTATCATAAAGGCTCATTCATGAAATGTGTGAG
ACCACTGATTTGCAACCATACTAGCATGGTATCATTGATTTATTTGTTTT
AAAAGAGATCTCTGCAATTGTTTCATCAGAATTAGTTGTACAGACGTTTA
TGGGTATGGCATCATTTGCCCCTCTTGTTTGCAATGTGAAGAGAAAAAAA
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CAGAGGATGCCTAGTTATGGTAGCTATTTGCTATTGAAGTGACCTATGGG
CTGGTAGCACATTTCTTCCCATAATAGTGCAAATTGACCTTTATGTAATA
TCTAATCTTGTGCTTGGACCTTATTCCTTTGTTTTCTCTTCACTGTACAG
GGAACGCCGTTGCAGAATAATACCCTGGAATTGTTTTCATTGCTTCATTA
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CAATTGAATCTGGACGGGATTTGACTATCGATGAAAAAATTGCTCGCATT
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TCTTCATTTGTTGGATAACTTGGATTGGCTCTTAGTTCTTTCATGTTTGA
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GCCAACAAAGAAGTGGGTAGAAGTTCCATGTGCACTTACAGATTCTCAAA
GAGACCTTTACATTAATATTTTAGAGAAGAACTACTCGAAGCTGAACAGT
GCTATTCAGAATGGTTAGTTCAAGATTCGTTCTCTTGTTTTTATCGTTAG
CATACACTGTACCACTTCGGGTACATCCAAATCTTTTTCTCTTGATTTAG
CTAGTCTGTGCTATTTTTTCTTCTCTTGGACATGCATATGCCATTTTGTA
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AGAACGCAAAAACTAGGCTAGGCTATGCTAGGCCATTGAAATTTCTAACA
CAAAATGGCATGCACTGTACCAGATTCTCAAAGAGACCTTTACATTAAGC
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ATATACTATGTCTAAATTGGCCTTATGTACTTATACTAGCAAACTTTTAA
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CAATGGTTTGTGTGAGGTCAGCACGACATAGTTAATGCTAAAGAGAAGAC
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ATCTGGGAAACTTCAACTCTTACACAAGGTACCTTCACCTACTATTATGT
TCTATCTAGGCACTGCATGCTAATCCCAGTTCGCTGTTGGACTTAACAAT
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ACTCTGCATTTATCTTGCTTTTCTGATGCATAGATTACTCCATTTGTCTT
ATCTTACAGTGATGCTCTTACTACTTTCTTAGCTCATTCCCACTGAGTAT
TGCTCTCATTCTTTCAATTTGTTTTTCACTTCATATTTGTTTTGGCACGC
AGCATTGATGGACAGACATCACTCTCTGCAAGGCAGGAGAGTATAAAAGA
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CTGGCGGTCTAGGTATTGACCTGGTATGAATCCTAATCTTTCCATATTCG
TTTCTGTTTCACATTTATGTCACCGAACTAATATTGTTCCCTATTAATGG
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AAGCGCAGTCCAGGGCTCACCGGATTGGCCAGACCCGACCGGTGGTTGTT
TACCAACTTATCACAAAATGTTCTGTTGAAGAGAAGATACTGGAGAAGTC
TAAGCAGAAGCTGGCCATTGAAAATATGTTAATGAACTCTTCCAAAAAGC
CCAGTGCAGATGAGCTTCAGTCTATTCTACTACATGGAGCCAAGACAATT
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GCCTGCCACTCCCAAGGTGGAACTACTTGGCCGTGGGAGACGGCAAAGGA
ATGTCGTGAAATACTCTGATGAGTTTGATAATGAAGACAGTGAAGACATG
TATTCTCCGCAAGTTTCCTTGGAGTCAAGTAGCTCTTCCTCGGATGATGA
AACAGAGCTAGAAATTCCTGAAGTAACAAGCATGGAGCCTGGAGTGGCTG
TAAAGACTGAAGTGGTGAGCGTGGAAGCTGCTCCTGTACTCGACAGTCCG
TTGACTTCCTCCTCCGATGACGATGACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.