Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012264

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012264
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012264
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCATCCAGGTCCAGAATACATCCAGATCGATGATGATGCAAAATCTCA
TGAACGAACCCGGCTAGACGGCCGCCAGGGCAAGAAGAACGTCGACCCAG
CACGGGTGCGCGCCAGCGCTTCGCTCGGCTCTTCATCATCTTGTTTTTAG
AGAAGAAAGAAGCTCTTCATGGTGTTCCTAATTCCTCTTTCAACTCCTGC
AGATCGATCTCTCTCCGTCCGGACCATGGACGCAGCAATTACTCGAGGAC
CATGAACCATATATGTCCATCAAGGTTTGTTCTTCCCTCCGCAGTTTATA
CGAATTCTCTTTCTTGTATTGCGTCCTCTCTGTTTCTTCATGAACAAGCT
AGTAGTCCCCATATTTCTTAGCCAAGCATGATAAACTCAATTTGTTACGA
ATCCTCGACCGATTTCATGTTCGGCTATACATCGGACCCAATTGCTCCTT
GGTCCCCGCAAGATTTTAATCTAATTGGATGGCTTATATAGATTATATCA
ACATGCTTGTTTGCATCAATAAAAGAGAACATATCACCAAGGGATCTAAC
TCTATCACGAATGTTTTCTAAGAAACCCCGAGAAAATTTAACAAAAAAAA
ATTATAATTCAATTCCCTATCGCAAGAGATATGAACGACATGATTTTTGA
TAACTTGGGTTACTAATTCGCCTAATTATCACTGTTAGGGGTAACATTTT
TTCCTATTTCTTCCTAGATATGTAAGTTGAAATCAGGTGCAAACTTGGTG
CAAATGTACAATACCGTATGACCTGTTGCAGGTTTTTGGAAACATTCTTT
TTAGTCAAATCCAGGTTGTTCTAAATACATACTGTATCACCGGAGCCTGC
GGGTTGCGGTGTTGTCGCCGCTATGCGGGAGTCAGTCCGAGTCGACCAGG
ATGACCTCCCGTTCCATGTCCTGTAGTGCCGCCACCGCTTGGATGGCCGC
GCGCTGCTCTGCCTCGCGCCTCCGTGTGCAGCTCCGAGCAGCGGAGCATG
ATGTCGATGCCGGCTTCCTCCGCGTCATCGTCACCGATGAAGTCGATTGG
AACCACCACGTGCCCGTTGTGATCCTCTCTCCCTCCTCCTCAATTAGCGG
TGGAAGGAGGTGCCCATCGCGCTCCCCTCTGTGAGCTCCCTCCCATTGTT
GCGGGTTAAGTTCCACCGACGCAGGGAAGCCGGTGGCATCTCGCCATGCT
TGGTGTACCGGTGTGCTGCTCGCTTCCTTGCCCCAATGACGCCAGGCGGC
GCTTCCGCTTCACCTCCTCGGAGGTTAGGGTGCACCCGACAGGGGTGTCG
TGGCCGCGAGTGAGTGCTGATTGACCCACTTGGCTGCCCCAACTTTGATA
GACAACGTCCTCGCATGTACGTGTAGGGCCAATTTGCGAACAGTGGCAGC
TTTAGGTCATCAGAGAGCGATCAATTTGGCGCCGATGAGGAAGGGGAGAG
GGCCAGGGTTCTGACCAGTTTTTGGCATGTATCCACTCCCCCGTGCGGTA
CATATAGCGTGTGTGTGGGCCGATTTTTGGTACAACAAACTTCTTTACGG
TTCCAGAATACTATGGTTGTGAAAAAACAACTCCCAAATCGGAGCCGAAA
TCTCTCATGTTCGTGTAGCAGTTCCTTCCACCGCTGCCGACGATCTGATG
TACTCCAATTATGGTCTAAAGTACTCGTAGCACTAGTAGAAAAAGAGGCT
TCGGTTCGATTTAGAGTCTGACACTAGTCCCGATTTATTACCGGTACTAG
TATGAGCACTAGTCCCGGTTCGTACCGTTTTTCGTGGCCAGGAGACCGAG
AAAACTCTAGTCCCGGATCATTTCGGACCTTTAGTCCCGGGTCGTGATAC
GGTCCGGGACTAAAGGTGTGCAGGCGTGGGCAACACCCTTTAGTCCCGGG
CCCCTGGACTAAAGGGGTATGACGCAGACAACTTAAAATTGCTATAACTT
TTGCGTAGGATATCGAAAAAAAATGTACAACCTATCAAAATGTGTGGAAA
AAATTTTGAGTTCGATTTTAACAGCCTTATTTGGATTCCTCACATTTTTA
GATTTTTAAAATTATAAATAATGGATTCCTCACATTTTTCTGATTCTTTT
ACATTTTTAAAATTTGAAAAGGAAAAAAAGTTATTTTTTATTTAGCAAGT
TTTTATTCCATATTTTGATTTCTCACATTTTTTTGATAATAATGAATATA
TTATTTGTCGAATTTCGATTTACAGATTCAAAGATATTATTTATATCATA
TTAAATGAATCATGGCAAAAAATGAATAAAATATTATTTTATTTAGTTTT
TTTACTCTCATTATATTAAAATATTATTATTACTTATTTATTGTTGTTTA
CTAAAATAATTGTTTGTAGTTTCAATAAATAAAGATATATGACATATTGA
TATGGGCTAATAGGATTGATATGATAGTGTTGACAACAAGTTACAAAAGG
GCTTCGCGCAAGGACATCCGGATGGAACAGAGAAGTTAAGTGTGCTAAGG
GTGGAGTAGTGCTAGGATGGGTGACCGAATGGGAAGTTTGACCACAAGTG
TAATTTGACTTACGATTAAATATAATTAGTGCTAAAAATGTTCCAAGTGA
GATGATTATGAGTCAAACAATTCAAAAGTTTAAGAAAAAATTCGAAAAAA
AATTCAAAAAAAAAATAAAAAAATTCGAAAAAAAATTAAAAACAAATCTT
TAGTCCAGGGCCGTATTACGACCCGGGACTAAAGGTCCTTCATCCCCCTG
TAGCAAAAAACGCCCATGCGGTGGCCCCTAGTCTCGGGTTGTAACAAATC
AGACTAGAAATATGGGCCTTTAGTCCCGATTTCACAGTCCCGGGGTGCAA
AACCGAAACTAAAGGCCCTTGCAAACCGAAACTAGAAGCCTTTTTCCAGT
AGCGTAGGGTTGCGTCAGGCTAGCGTTTCTACTTTCCGTTCCGGTAAATA
ATGGGTCAGATCTCAGATCGGAACGAGTTCTGACTTCTGACTTGTGAGGC
GAACCAACGTGCGATACTACTGTTCTCTGATCGCTGACCGCATGGGCCCA
CGAGAGAGCCGGGCCCTTGTGCAGCCGGTGCTAGCCGCTGGGGCCACGTC
ACGCTTATGCAAGGGGGTAGTTATTTATGGCTTGCATATCTATCTTTTAT
CCCGTCTCCTCCTCAGTTCATCCAGATTCCAGAATTCCAGATCGATGTGC
TTTGCACGGCTTTTCATGGTGTTTCCTACTAATTCCTCTTTCAACTTCTG
CAGATTTCTCACCGTCCAGCCGGCAAAGGGCAGCAACTACTCGAGGCGAC
ATGTAGTCCATCAAGGTTTGTCTTTGCCTCCGCATTTTTTATACGTATGA
ATTTCTTTTCTGGTTTCCGTATGGTGATGCCTATGAATTTCGGCCTCTCT
GATTCTTCGTGGACAGTCTATTTCATAGCCGGGCATAATCTTGATCTGTC
ATGAATCCTTGACTGATTTCTTCTTCGGCTATACTTAGATCCGACCTGCT
CTCGGCAATATGTCGCTCGATTTTAATCTCGTGGGATGGCTTCGATTAGT
TATATTTATTTGCACCAATCGCAATAAGGTGCACCGAGGCTTGTGGTGTG
CACCTGGTGCATCCAACTTTTGGCTGCTCCTTCATGAAAGTTTGAAGAAA
AAATTGATGACTTGGATATAACATGAATCTGTTATTTTGTAATAATTATT
TTCTAGTTTTAACCGACGTAAATTTTGATAGCTTGGGGTTATAGATTTAT
CACTGTCAAGGATTATAGTTGCTCTCTTTCTTCCTAGATATGTACGTAAG
TTGAAAATCAGGTCAAGACTTTGGTGCACCTGGTAAATACGTATTGTACG
AGCTGTTTTAGGTTTTTGGAAACACATTTTGTAATCAAATCGGGGTTGTA
AGGTAAATACGTGCTGTATCTATTAGTCCAACCAGGTTTTGCACCATATA
CGTTCCTGGGAAATAGAGCCTCGTTTCGTAAATTTATGCCCTGGCTCTCG
TGGCGTCCACACAGGCGTACACAAAATAATACAACATGGTATACTGTAGT
TTGAGACAAAAGCATCGTGAATTTTTTTTATGTAAAGAAATTAGTGATAT
GATACTCCATACAATCCGTTAATAAGTGTTGCTGATTTAATACTTTCTCC
GTCCTAAAATAGATGTCTTAGATTTATCAAAATTTCTATATACTAAATAG
TGTCTAGATTTATCTAAATTTTAATAAATCCAAGACATTTATTTTAGGAT
GAAGGGAGTACAACTTAATACGTACTAAACCAACGACGATTATTATGGAT
CTGAGGGAGTATTAAATTTGCTAAGAGAAAGAATGGACATAGTATTCCGG
TGAGACTCGTTGGTATATTGCGCTAATCTTTCACTCAACATCTAAAAACC
GATGCCAAAACTGACCGGAAGTCATGAAACCTTCATTTACCCTGAACCAC
ATCCGGATGGAAATCTACGAAAGCAGGCAAAATTATTTCTCTTTTCAGAA
ATTTTGTTTTTTCTGGCCTAAATTCAGTCAGTTAGAACCAAAAAAACTTT
AGAAGGATAATTTTTCTCAAACTGTTGCTCATTCAAGTGGTCTGGAATTC
TCCTGCATAATTTTGTCCAACCATAATAGCGAAAACAAACAGTTTCAAAA
CAGAATAGCAGATCTAAGAGAAATGCTTCCCCTGAAAAACAAATCAATAT
TACTTAAATCATCATATAATCTAGATGCCGGGGTTTCACTCCCTTATTTT
TTGGCAAAAAGACTTAAATAATATCCTCATATCAAGTCAAATCTGGACAA
AAATACTTAAAATTCCTCAGATCAAGTCAACCTAGCGCCGCGGCACACAT
GGAACTCACAATTACTCAAATCAAATTAGAAAAATTGTCCAAACCATTGG
ACACGCCCAAAGATTTCAACACTACTAAGTAACACAACCTTTTGTTTGAG
AGTTTTGGTGTCTAATATTTTTGTAGGAGGAAGAATTCCAAGTACAAGAC
AATTACAACTGCGAAAACGACTGTAGAACGAACTCCCCACCCTAGGTTAG
TCCCAAGTTAGCCACAAACGAGAAAACAACTACAAAGAAAAAGAGCTTGT
CATTGACGCCATTCCGACCGGCGCCAATCACCTCCGAAGATCAACAACTC
CCACTAAACTTCCCTTGTCGACGCACCATCGACCTTTTAAGCCTGAAAGG
AGGTGGCAAGTGGATGTCGGGACTTGATCAACCCCTAGAAAGACTTTGTA
TTGGACTCACCGGTGACGATGTGCATTGCGCCAAGATCAACTTGGACAAC
GACGATTGCCGGAGGAGTGCAACATAGGACCTCCAACATAGGGGCAACAT
CGACGTCGCTGCCATCATGGCAAATCTAGGCTTTTGCTTTGTTGTGGGGA
TAACACCCGGTAGTCCCAAGTCAACAAGTCAATAAAAGAGTCATCCGTCA
ATGGCTCGAGAAAGCTAGGGCAGGCTATATCCCGGCCGGTTAGCGCCCTA
GGCTGGCTGGCCCACCTAGCCGACCCTCCCATGCTGGTGGCCGGCTGCGT
AAAGTCAATGCCCATGTCCCATCTACTCTCCGTTTCGGTTTACAAGTCCT
GCACGTAGTTCTATGTCGCCAAATTGAGCAACTTAGTATGATGTATATAT
TACAAAAAATATATCACCTGAAACTTTAGACTTTGTATTTTGCAATGAAA
TAATTTTTATATTATATAATTCAAATTATATAGGTCAAATTGAGAACCTA
GATATACGCGTAGGACTTATAAACCGAAACGGAGGGAGTACATGGCTTGA
GGCATTATGGCTGGCCGTCTCCCACGTCGTGACGAGACCGCAAAGCAATA
AGGCTTGTCATAGTAGGGGTAACTTCACTAGTAACTAAGAGTCCAAGTCA
ACATTTTTGCTTATGTGGCAATGATTTAATGAAGAGAGAGATGGATTGAG
TAACTAACTATGTTACTGTAACATCACACATATTAAGACAAAGTGTGTCT
ACAACCTAATTAATATGGCTTTGCATGTTATCACATCTAAGTTATTTCCC
ACTATAAAGGTAGTAACTTAGACTAGTAACATGTGACCAGCCTAACTACC
GTCTCACAGATACTATGGATACATAGGGCCACCAATTCCATGATGTTAGG
TGCCTATAGCGACAAGACGGAGGAGCCACCCGTGGAGCCTACTGGAGGCA
CACAGTACACCAACAACAGGGCTTAGCCCCTTTCTCTCTCTTTCTCTTTC
ATGTACCCTAGACACCGGTGGATGTTGACCCAGGAAGCCCACTAGAGAGG
GGGCGATATGAGCATTAGCTTCTTCTAGCCCAAGCCTCTTTCTATCTTGA
GACAACACAACGTTCTAGGAGCAACTCTGTACTCTTTAGCATTAGAGATC
CTTGCAGGAGCAGGGGTGTTACCTCCACAGCCAGGACCCTGAACCTAGGT
ACATCACCATGTGCTTGTGCCCAATCCCGTATCTGGAATCCGTTGTTCGC
TCTTTTGGCTCCACGCCTCTCTCTTAACCCACCCACATGGCTACTGCCGT
CCCAACATGACGACATGCTCGAAGACAACAACCAACTCCAAGCGAGCGAG
GAAGATGCTGGCACACTCAGCGACGCCTCCAAGTAGGGGGACGACACCCA
TAGGCGCCATTGTCGCCGCTTGACCATAGTCGGGTAGGACTTTCATCTGC
AATGTCGCACATCTCGACACTCAAGGATTGGGAAAGTACCGTCCATGTAG
CATCGCATTGCCGCCACCACAGCACCTTGCTATCGTAGCCGCAAAGCCGT
GGTCCTTCAACACCAGGCATGGCTGACAGACATGGTCAATCTTCCACCTC
CATTCGAACGGGGATGTAGGCTCCAACCACCTTAGGCACGGACAAGGACT
GCCCGTGTCGTTCGTCACGAACTCCAGGCGACCTCCACGTGACGCAACGA
CCCTGGCCTCTAAGTCCCAAATCGAGCCCATGTGGACCCAGATTGGGCTT
GCCCTGCTCCCCTAGCTCCCACGCCGGCACGACCCAAAGGGCACGACGCT
CGCCCGTAGCTCGGAGCCGGCCGATCGTTGCTTGCCAAGATCCTTCCCGG
CCAGGCCTCCTCGGTGTCGCCCCATGATTGTGGAATCGCACCGCCGCCTC
TAGGTCACGCCGTTACCGTTGGAGCCTCGCCAGGATCCGCCGCTCCTCCA
TGCTCCCCACCACCGGCGCAAACCACCGAGGCCTCACGCCGCCACCCACT
CCACCACCCACATTGCCTCCGTAACGTCCCACCTCCCCGCAAAGGAGGGC
CTTTGGGGTGCGCCTCCCTCACTCACCACCTTTGACGACGTGGCTAGGTC
AAGCAGATCGGGGCGTCGTTTTCTTCTAGGGTTTTGGGACCTCCAGAGCC
CCTCGCGCGAGAGGCGGTCTAATTGTGCCCACTAAGTAACACCGTTATGC
ATTGATTTCACCACTTCCTTGACATTTCGGTCTTCAGTAGGAGAAATATA
ATGAAATATAAACATATTATTAAATCTACTTGCCATTAATTTTGTGATCT
TGAAGACGGGGCCTATCAACAGGGTTACACTTACATGGCTGTTAGGGGCG
TCCCAGAGAGCCTGCTCCAGCCTGCACCCTAGCCTCTCATACATTCCCCC
ATTCATTAGTTCTGCAACCATAGGGGGGAAATAAAAATAAAAATCGACCC
TATTTGACATCAGGTCTCAGTTTCATTCTTTATTTTGAGGAAAGCGTCCT
GCTGCTAGCTTTATTGCTTAATAAACAGGTTTACATCCTAATATGACATT
GTTCCTAATATTACGTAGGCTCTCACCCTTTGCCGCCATTATGTCTCCCT
CGAGGCATTCACTGCCAGCGTGGACCCGTGATTGTTTTCCAAAGGAGGAG
GCTAGTAGACATGAGATCGATCCCCAATGTGTATGCCAATCTGTATTGGG
CAGAGATCTGTGCGTGGATCCAATTGAGATCAGAGAGAAAACTTGATGGC
GCGTAAGAGACGGCATTGAGGTGAAAAACATTAGCCCTGGGGTACCCGGG
GAGTGAGGGCAGTTGCTTGCGAAATTTGAAACTTTGTACAAGGGCCGGGT
AGCAAATTCATTTTTTTACTAAAATGAACGTCCAGATCTGGATCAAGCGA
CAAACAGAAACACCAAGGCACCGTATTCATTAACATTCCAACCTCTCAAA
TACTTTCTTGAAAGGATTGAGATACACCTTGCCAATAAGTTCCAACTTAA
CTTACTTCACTTTGTCTAGATAAAAACATATCTAAGTACTACTAAAATAC
TACATGCGTATCTAGACAAGTTACAAGTTGAAATCGGTTATTTTAGGACG
GAGGAAGTAGCTTGTTTTGTAGTGAGTAGTTTCTTGTCGAATTAAAGATC
AGAGCTATGGGTAGCGTGCCCCTGGGAGCCAAAAAAAAAATCACGTATGT
GACTTTGGTGTGCATTATTGACCTTCTGCCTCTTTTCACTGTTGTGAATT
ATTAACCTATGATGATAAAATAAACTTTGCATGGTAACCACTTATTCAAA
TATCTGGCTATTTGCTATTTCTGTGCATTGGAGCACTGAAAAAGACGGGG
CAGAACAGCAAAGTTGACATACCAGTCGCTCATACTTCCTCCGTTTAGAA
ATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGGAGATATATCTAGACACCTTTTAG
TGTCTAGATTCAAATGAACATATATACTAAAAGATGTCTAGATACATCTC
CTTCACAGAGTATCAAGCAACAAACAGAAACACCAAGGCACAAGATATCA
GAGCTGATTTAGCGCATTTACATCAACTTGTCTACTGCATAAGAAAACAT
GCCAATCTCATTTAGCACATTTCATCAACTTGTCTACTGCATAACAAAAC
CTGCCAGTCCATGACAAGGCATCTGGTTTCAGGACAGACAAGTCAAACAA
GGAAGATTGGAGAGGCAAGAAAGTGTCGTCTCAGTATTATCACATCATAC
GTAAGAGACCAGTCTATGCAGAAATTACTGAACTCCTCCAAACCTGTAAG
TAAGTCTTTTGCTGTTTTTACTATCTATCTCCAGGGCGAGGTAGCCTGTC
CAGTTAAGAAGATAAAAAAAGTCTGAGCTGGCAGTTTTGGGCCTGTAATG
CAAATAAAAGCAACTATTGAAACTTAAGGCAAAAGAGACCTATGGGGGGT
TTTTATTTTTGGCATGAAGTATCAATGCAGCGGTGAAACTGAAACTAGCA
CAGCCCGTTTGGTAATGAACAGAAGTAGACAGTAGGCAGTATGGGCTATT
GTAATTGCACTCTTAACTGTGTATGAGAACAAAGTAGATGTTTTCTGCAT
ATCAAAGTCCACAGTGGCTTCTATTAAAAGAACACCAGTCCAAATCCAGA
CTAGGATCAAAAGCTACAAAAACCGGACTACTCTCGACTACTTGACCGAC
TCATAATTCAATTCTCCTGACACATGAACACTCTTAGATACACTCTTCAA
CTGAACTGGAAATTATGTATAGTATGAATGAAAAGAAATATTTGAAATAA
ACTGTTAAGCTCACATAAAGCATGTGTTGAGCTTCCGGTTCCAGATCTCC
TAGTAGTTATCTAACTGATTATTGCAATTCAAATGAAGAATATCATGTCC
TATGCTCAAGACAATACGCAGAAAATTCTGGTGCCATCCACAAATTGCAT
CTAAGACGTGTGAACAAAATCAGAAATTTACCTTGGGAGTCTTCAGCCGC
GGCCATTGTTCCTCCCGTAGCGCCTGTTGGTGCTGTCCTGTTCACCGTTG
CTCACCCAGCCTACCTTCGTCCTTCACAAACAAAGCACAAGCAATTAAGA
CTAGCAGGTAGATACCAGTACACACACGAGAAAACATGGTCTCCTAGCAA
AATCTGCATAAACAGGGCCTCTAAGCAGGTTTGATTAGCCCAAACTGGAT
TTTTTGGGAGTGGGTGTATGGCGTGAAGGATCACCGAGCAGATTGACTGC
ACGGCTGCAGGTATTGCCAGTGTGGTGCATAAAAAACAAAAATTGTTTTT
TATTTGATGGTGAGGTAATTATTTAGTCAGTGAAGAATATCAGGTGAAGA
GGTAATATTTTTTTTAGTATATTTAGGACATACCCATGGTTAGTGCGTGA
GGCTAGAAGATTGTAATAATCCAGTTTGTGGAATGAGTAAATAAACAGGG
AAAGCCGATTCAGTCAGTTTGTGGAAGGACTACTAGAGAGGAAAAGTCGA
TGAAGTGGACCCTATTTTTATAGAGTAGAATTTTAACAACAAAATCTTTG
CAATGCAGTCTACCAACAACTTAGTAAACGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.