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GrainGenes Sequence Report: AA009475

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Sequence
AA009475
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009475
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTGGAAGACGTGATAACTTCAACACCAATGGTCGTGGCTGTGAAAAA
TAGTTTTGGAAAAACGGCGGTAATCAAGGAGGCGGTCGTGGTGTCTGGAA
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TGGAATGGTGTAACACACCATGCATAGGAAATTATAGTGGACTCTTTGGA
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AAGTGGAGGCTAGCAAAATACTAGGAGCGACCAACTAAGAGAGCAATAAT
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GTATCACAAGTCAAAAACTAAATGATCATAGAGGCTAAGGTGACTAGTTC
ATAGTCATAACATGGTGTGAGCATGTGCCAAGTCAACCCAAAGAAAGCAT
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ATTCTTTCAAGGCACATTAAGAAATCTCAATTGTTTGGAAAAAAGTCATG
CTACAACAATAATCACTAAGCATAATGTCAAAACAACATCTAGCATGACA
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CCTCCTCCGCCCCTGCCTCGCCTCGTCACGATGCGCGCGCACCGTGGGTT
GCGGGAATCTCGCCGAGCCGAGTTCTTTTTTGTCACGCATGACTGGTATA
TGAATGGGTGTGGAGAATTTGAATAGTATACGCCAATGGGTTTTAAATAC
GACCTTAGTGGAGGTTTAATTCGAACTTAGTGGAGGATATTTGGCTTCGG
TCGCTGCATGTTCGTTTCCTCTTCCGACGTTGCCTGTTCGCTTGTCTACA
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GTCTTGCGGCGTGCACCAAGAGCCGGGACAGTAGGCCTCCGAAACCCCGC
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ATCGGTGCGACTACTGGCTTCATCATGGACTCCTTCACCGATGCTGATGA
CATCTTCCCCAACAATGACTTCTTCCCCGCCATCGAAAACCTCTTCCTCG
ACGACATGGGTGACAACTCCAATGCCAACACCGGCGCACTGCTATATGGT
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TGTTTTTCCTGTTGTTTATTTCCCATAAATCACTTGATAAATTTCTCATA
TTTCCAACAATCCAAAAACCTTATTATAGGAAATTTACTCCAAGTGGTTT
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ACTCTTGGCAAGCCTGAGGGAGAGCTTACTCCTTCCCAGGAGCAAGTTTT
CCAAAAATCTGACAAGCTCTTCAGGGCTGCTCGGTTGTCTGTGCTTGGGG
AGAACATTGTTGAACCCTATATGTCATTTGATATTGGCAAGGACATGTGG
GCTGCTCTCGAGGCCAAGTTTGGGGTCTCTGACACTGGCATTGAACTGTA
TATCATGGAGCAATTCTATGACTTCAAGATGTCTGATGACCGCTCTATCA
TTGAGCAGGCTCATGAGATACATGCACTGGCCAAGGAGCTTGAGTACTTC
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GTGACCCTGATCATTGGGCTCCTAGATGCCCCAACCGCTATGATAGGCGC
CTGATACGTCGTAAACGTATCTATAATTTTTGATGTTCCATGCTTGTTTA
GTATCAACTTTGCTTTGCTTTGACTATACTTTGAGGTATTTTTATATGTT
TTCTGGAACTAACCTATTAACAAGATGCCACGGTGCCAGTTGCCTGTTTT
CTGTTCTTTTTGGGTCCAAAAAAGCCAGAAAATAAATATTCTCGGAATTG
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AAGACGAGACAGAGAAGGGACACGAGGGGGACACACCCCCTGGCCATGTG
GCCAGACCTGGCCCACGCCTGGGGGTGAAACTGCCTCGGGCACCCCCTCG
GCCTCCCTCTTTGCCTATAAGAAGCCCCCGATACCTAAACCCTAAGTACT
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GATCGGCTGGGATCTAAAGCTCTTCCCGGCACTCTGCCGGAGGGGAGAGA
TCATCCCGAAGGCCTTCTTCATCACCATGCCAGCCTCTGGTATGATGCGT
GCGTAGTTCCACCTTGGACTATGGGTCCATACAATAGCTAGATGGTTATT
TCTCCTCCTTTGTGTTACCATGTTTAGACCTTGTGAGCTCCGTTCATGAT
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GATATTGAGATTACTATGTCAGATTGATTAATGGTTTTGTCTTATTGATT
CTATCATGTGTTTGTTGTTTGAGATCTTGCATGCTCTCCGTTTCTAGTAG
TTATCTTGGCCAAGTAGATGCTAGTGACTCCAAGAGGGAGTATTTATGTT
CGATAGTTGGTTCATGCCTCTATTGAATCTGGGGAAATGACAGAAATCTC
TAAGGTTGTAGATGTGCGGTTGCTACTAGGGACAAAACAACGATCTTTTA
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ATCCGTTGCTTGCAACTTAATACTAGAGGGGGTTCGGTTGATAACCTGAA
GGTGGATTACTAGTCATAGATGCAGTTGGATGGCGGTCTATGTATATTGT
TATAATTCCCAATCGGATCTCATAGGATCATGAATTTCTAGTATTTCATT
GTTATGCCTTGCTTTGTCCTATCAATTGCCCCGCTGTAATTTGTTCACCC
AGCATGCCATGTTGTTAATCTTAAGGAGAACAACTATAGTGAACTATGGA
CCCCGGTCCAATCTTTACCATTTGTACTTCTTCCATTGTTACTGTTTACT
TTCTGCAAGCCACCATTACCTTCCACACCATATGGTTAATCCTTTGTTTT
TAGCAAACCGGTGAGATTGACAACCTCACTGTTCGTTGGGGCAAAGTGTT
GAGTTTGTGTTGTGCAGTTTTCCAAGTTGCTAGCAACACCTTTGAGTCGT
TTCCTTCCTCCTACCGGTTCGATAACCTTGGTTTCTTACTGAGGGAAAAT
TTGTTGATGTGCTCATCATACCTTCCTCTTGGGTTTTCCCAACGAAGCTC
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GGCTAAGGACAGCTTCACAAGGGGATTCCTTCACAATGTTTCTCTTTACT
TTGTTTTTGTTTTGCTTAGTTTCTTTTTCTTTCTTCTTTTTATAAAAAAT
TACAAAACAATTAGTTCCCTTTGTTTTGCTTTTCTTTATCAAAAACACAC
AAAAATTAGTCCTAATCTAGTTGCTGCTGCTGTTGGTTTGCTCCACTTTT
CCAAAAATGAACTCTGCTGAGAACACCAAGTTGTGTGACTTCACTAGCAC
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CTACGTTTTATGAAATTAATCCTACTTTGTTGAATCTAGTGATGAAAGAG
CAATTTTCTGGTGCTAGTTCTTATGATGCTGCTGCCCACCTCAATAACTT
TGTTGAACTTTGTGAGATGCAAAAATATAAGGATGTAGATGGAGATATTA
TTAAGCTCAAATTTTTTCCTTTCTCCTTGAGGGAAAAAGCTAAAGAATGG
TTGCTATCCTTGCCTAGAAATAGTATTGATTCTTGGATTAAGTGCAAAGA
TGCTTTTATTGGAAATACTATCCTCCTGCTAAGATTATATCTATGAGAAG
TGAAATAATGAAATTTAAACAACTTGATAATGAACATGTTGCTCAAGCTT
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GTGCTACAACAAAGCTCCTTGATAATATGATGGTTAACTATTCTGAATGG
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AAAAGCTCATATAGATCCAAACAATGTTCCTTTAGCCTCTTTGGTTGCTC
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ATTCCTAAACCCAATAAGTCTAATACCTGTGATGCTAAGTTTGATTTTGA
TCTTGATGGCTGCAATATCTCTGAAGTGATTATGTTCCTACAAAAGCTAG
CTAGAAGTCCTAATGCTAGTGATATGAATGTGGCTTTCACCAAACACATT
AAAAATGCTCTCATTAAAAGTAAGGAAGAAAAATTGAAACACCAAGCATC
TATTCCTAGGAAAGTAGAAGATAGTTGGGAACCCATCATTAATATGCAAG
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ATTATGCCTATAAAGATTTATGAAATGCTTGATTTTGCCACCTTTGGAAG
ATTGTTATTTGGATTTCCCAGTTGATGATAATGCTAAAAAGAAACTGACA
GGGAGTGTTAATGATGTTCTTATTATGGTTAACAATGCCTATGTCCCAGT
TGATTTCTATGTTTTGGATTTTGAATACAATGCTTCGTGTCCTATTAATT
TGGGAAGACCTTTTCTTAGAATTGTTGGTGCCATCATTGATATGAAAGAA
GGCACCATTAAACATCAATTTCTATTCAAGAAAGGTATTGAACACTTCCC
TATGAGGAGATATAACTTGCTTTTTGCTCCTCCTTTGAAAGCAAAGGTTT
GATGTTAATGCTTCTTCATTTGAAAATACTTGATTCTTGCTTCTTGTGCC
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ATTTGGGGAGTTGCTGTCCCGAAACAGATTTTTATGCTCCACCGTAAAAA
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TCCCCTAGGTTGTTAGCTAACTTTCGTTAGTTCAACACTTTTTCATTTGA
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GTTTTTAATGAAAGTTTCGCTGTTTTAAAGCTAAACCCAAACGTATATTA
TCTTTTGAATGCTCTAATGTTGCTAATGAAGATTGTGTGAAGTTTTGTAT
GAAGGAAAATTTTTAGGTGTAAGGAAAGAATGATGTAATGAGATGAAGAA
TGGACAAAAGCTCAAGCTTGGGGATGCCACCAAGTGTCACCCCAAGAAAT
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CTTCATCAATAAAAATCTCAGGTCTTTCTAGACACTTCATTTTTATTGTT
TCATGCACTGTTGTGATGTTCTTGGAGAGTCTTTCTAAAAATCCCGTTCT
TCATCAATAAAAATCCTCATGCATATGGACCTTGCCATACTACGAACCCG
GGAGAAGAGTCTACAAGCCACCAACGCTCTCCTGGAAAGAAGAGTGACTA
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TTCTATGAGTACCAACCTATCTTCCCACTGCCCCAAGATGTACCAGGACC
CTCCACTCGCCTTCCCAAAGCTGAAGAAGAAGCCAAGGAGAAGTCTCCTG
AAGTCCCCGCTGCCGGCAACTAGACTAACATAGTACCGATGTGTTGTAGT
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GAATGGTTTGAACATTGCTAAATGTATGGATGTTGTGCAAGCATGATATC
CTTCTTTGCATGCTTTACCCACGATGTTGCATCAGACTCAAACCCCCGTA
GTTCTGCTCTGAGGGGGAAATTCTGCGTCTTTCCTGTTCAAAACTCGATA
GACCCAAGGAGTCGACCCCTAGTTATCACCAAGTGATAAACACCCCTCCA
AGGTCTGGATCGTCGACCCTGCAAGAAGGACAACAATCGGCACCTCTCCA
AAATCAGAATATTCTTCGGGAAATTCCTCCACTCCCAGGGTCAACCGCCC
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AGCAAGGAAATGAAGAAGACTCAACTCGTCGTCCCGCTTCAAGAAGGAAG
TTCCCCGTCGACGAAAAACCTGCGTAGACTTGTACTAAGGGGAAAAGACT
ACGTCTTTTCCATTGGTTAAAAGCTAAACCGCCTGACCCAAAGCCACTCA
GCTCCGATCTGTAACCAACCACGTCCGGTATTTACAGGACTAATCTCGGG
ACGAGAAATTACTAAGCGGATGTTATTACCCCAACCCTACTCCTCCCTAA
TCTCGGGACGAGATTATTTTAAGGGGGGAAAGGTTTGTAACATCCCAATT
TCAGCAACCCTGATTTAATGTCCAAAAAAGGAAAAAACCAGGGGGAACAA
AAACTTTTTATTGTATTATGTGCATACTTGTTTGCTTGTGCTCAAGCAAC
TGTATGTGTAATAGTTATGTGCTCCTCACCTCAACACTAGTTTACAAAAA
CTATTTTTACAAAAGAGATGTCTTGGCTCATTTTTCATATTCTCAAATGT
TCTGGCATTTCAAAAACCTGAGCCAAGATGACTTGGACATAACCAAATAT
CTTACTAGCTTCTATTGCCAAAACTATGGAGACATATATATATATATATA
CTCTCCTTATGTTTTCAAGACAGAACCTTCACCTACTCTTATCCCTAGGT
TTTCCAAAACCTTATTAAAACCTTTTCATCTCAATCTTGGTAGAGATACC
AAGATGGTACTTATCTTGTTTCAAAACTAAAACCCTTCTCAACATACCCA
TACTTACCTCAATATAGGCTTGATGGTAACCCTAGTAGTATATAGATAAG
TTAAGATGAATTGTCGTGATCTGCTGTCCGATGAATTGCCTTGATCTGCT
GTCTGATGAATTGCCTTGATCTGCTGATTGTCTTGTTTGCTTAGGATCTA
GAAAGAGCTAATCTAGTAAGATCATTCCTTAGGACCCAATCCTTTCTTGT
GATCATCAATCTCAAAGCAAGCATCCAAGTCTGGATCTACCCTAATCCAC
TCAAGCGATCATCTCATCTCCTGCTTATCTCACATCCAAGGACAATCCCT
CTGTATGGTTTCCAACTCAGTGGAGACCCCATCTAAGCTTGAATTACATC
TACTTAGTTAATAAATAAACATCATCTCCTTGATCTAGATTTTTGAACCC
AGCATCCTCTCAAAATCCTCTACACTTTCACTCTAGTCAGAATCACCAGA
TCTGCCAAAATGGCTAAGTCTGGATTTATTATCTAGATACCATTTCTGGA
GATCCCCCTCTTCCAACCTATGTGCACTTTTGGAAATGCACTTGAACCAT
CTTGTAGTACATCTTTAGTACTACCAAAGACCACTCTTGCCCTTGGCTAA
GCCATTTTAACTCCCACCCATCCATGATGGTTTTGTAGTCAAGATAATAA
TCTTTTCTGCCAATCTTATCATCTTGCCTACTTTGGCAGAAGCCCACATC
CATATGCCACATCCCCTTGACCAAATCTTGGCATTGTTGTGATCTACTAA
TCATGGACTATCAACTCCCACTCCACTTGTTTCCATTGGAGACTTGTGAT
TCTTAAACCCCCATGGTGTAGGAAGCTAACTGATGTGTCTGTTATGGCAG
CCTTATTTCCAACAAAGTTTGCCAGCTCTCCAAAACCATCACTTCCGCCC
GTCGTTGGGATGCCCTCCGACCATCGCGTCTCCCTGCGCCATCGCCTACC
TCTCCCCGCTCCCTGGGTAAGCTCCCCCACCGCCGCCTGCATCCAGTTAG
GGTTTCCCGCTGGCGTGGCCTTCGCGAGGTTGAATAAGGCATCTCGGCCG
TCGATCTCTATTAGATCCGACGGCCAGCATCTCCCAATACCCCTTCATCG
CCCAGTGTGACTGACGAGCAGGCCCCACCTGGAAGGCTCGAATGGCTCCC
TCGTGCGTGTCGCCCTCCCCCGTGGGCCGAAACTCCCCTACACGGCCCAT
TTCCCTCTCAGAGCCGGCCCTTGACCGAATGCTCCCTTTTTATTATTTTG
TCTAGATCCAGAAACTTGTCTAGTTACTTTTAAATGCAAAAAAAATGGAA
ACTGCCTAAACAAATTTGGCTAGTATTTTTCACCAGTACCTATTTCCACC
CTCTAGCATGCAGACCAAGTTTTGCCCTAAATAGATGAATAAAATAAATA
TGACAAATAATCTCCCCAAATCTGTCCAGAACACTAATTAAACCTTCCAG
AGAGTTTGGCATCTCCACAAGGAGTAATTCCAATTGATAAAGAAAGGTAC
TACCAATACCCTTCCATTCCCACAGGTCCCATAGTCACTTGCTTCCTATA
TTACCCCTAGCAAAAATAACAAAAGTAGATACTTTCTGACTTTAGGATTT
TCTCTAGGTCAAACAAAATGAGGTTTGAACCTATTTCCAACTCTAAGTAG
ACTCACATAACTATATCATCCTAAATCCAGGAGCTCATATTTTTATGAGC
CTCTGTTGATTTTTAGTGAATTAAATCCTTCTGCGCATGGTTTATTCACT
AACAAATTCACCACAGTAACTTTGTAACTCCAAATTGTTTGATTCCAATT
TACACAGAAAGGTATTTTCATCACCTAACCTTTTTCCTTGTAATCAACTA
AAAAGCTTCTATAAAATAAATCTGATGAAAAAGACAAATCTTGTCCAGTA
CTACCTTTGGTGATTTCTCAAGGGCAATCTGGTAATTGTTCTAAGGTGAA
TCTAGCTCCTATGGATTCAGTCCCTCAAATACTACTATTCCACCCAAGGA
AATAATTTTTGGAACTCTAGAGAAGATCTGGTGAATTATCTCCTAAAACA
AGACTTTTAATCACCATAAAACCCATTATAAATCAAGGGAAATTGATAAA
ATAGTGAAACCACTTTTGTTGGCCTCATTTCATCAATACCCATCTGATGG
TATCATTTTTACACAATGGTATCATACAGATCAAGTCCTTGAGAAAAAAC
CCTCTCCTAAGTAATTCCTAGTCTTGGAAATCCAAAGGGAGCCTTTCTCC
CTAATATCTCCAAGTCTCCTCCCAATCCAAGCAAATCCTTCTTCCAACAT
CCTCCTGATATTTATGATGTATTTATCCTTAGCTTTCTTTATGGTTTGTG
GTTTGTATGCTTGTATTGATTGTAGCTTTGTTTGCTTGCATGTATGCCCG
ATAAACGGCGATAGTTGCGATTGTGTGACGCCGAGAAGAAGGAAGGATCG
GGATTATATTGATTATTGATACTATTGGTATTCTGGTTATATATCTCGTT
TGTAAATTGCATGAAAACAGACATTGTTTATTTCAAATAAATAATGTGAG
TAACTTGTCTCCTCCAAGTTATGAATGAGTGTACATTGGACACCTATCCT
TACCCCTTAGAACGAGGCTAAGATGATTAGCATCTTCCCTCTTGGAAACC
CACGGATTTTCAATGATAAAACTATTTTGGGTTTTTGCCCTACTATAAAG
TTTTAAAAATAAAACCCTTGAAAAGAGGCATCGTTTCTGAGTGGAAGTTT
TACCAAACAAAAGATGAGGTGGATGAAGAGAAAGTCAAGCAAGAGAAAGG
AAGGGATGTTCTAAGACAATGTCCGGAACAATTTTTATCCGTGCAACCAC
ATTACCCTAGTCGATGGGTCATAGCTCGTAGTTTGTGGTCATTAGCCGGG
GCTGCTCTTACTCGCTAAAGGGGAGAATTCCCATGAAATCCAGGCTACCT
GTAGGGTAAGGCACTGGTGCAGCAATTGGGTGTCTCGCGGACGGTATGCT
TTTAGGTAGTACGGATGGAAGATTGTCACTATTGCTACCGGTCAGACTTC
GTTCTGGAGGTAGGGGTCAGTACGGAAGGAAGGACCAGGGTCAAGGTACC
CCATACTCGTACCGGAGAGATAAACCCAAAAGGAAAAGCCGCCGTTGCTA
GGGATCGGCAAATGAAAGGTTCAAGTTTGATTATCCGAACCCCTGTCTAC
CGTGTGTAGCAGGCCGTGGTTTTATCCCGGCGGATGTATTGATTCTTGTG
GGTAAAGTGCACAAACTCTGCAAAGTGTAATCTATTCGAATAGCCGTGTC
CACGGACAAGGACGATTGGAATGGCAAGAGCTAGGAGTACCCTTCAGTTA
AGTTGAAATAAGATAAAGGATGTGACTTGGTCATGAGGAAAGATAAGAAT
GAAAATGGTTTTGGCTAGATATGGTCGATAAGGTTTTAAAAAGGGTTTTA
AAACAAAACTGTTTTCAAATCTTTTTAACAATGATGTGGAGATGTCCAGA
TTTTCAAAAAGAAGTCATATTTTCCAAAAAATCTTTTTCAACAAAGATAT
AGAGATGCCATTTGTAGGTCTTTCAAAAACAACTATAGTGTAGAGCTATC
TCGCCACAGCCAGATATGCATTAGTCTTATTACCTTGTCTCGGTGGTTTG
TGAGTACATTCAAAGTACTCACTGGCATTGTCCCTGGGTATTTACTTGGC
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TGAAGACTTCCGCTACATATGTTGTAATCGCCATAAAGGCCTCCTTGTAA
GTGTTGGACTCGTTATTATATGGATTATGTCATGATACTTGTCGGTTATG
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CCCTTCTTCATCAATAAAAAGCTTAGGTCTGTCTAGGCAGTTCGCTTTTA
TTGTTTCATGCACTGTTGTGTTGTTCTTGGAGCGTCTTAGTTTTCATTTG
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GTTCTTGCTTGTAAGTGCAAGAGGAGCTTGCATTGACTATGACTTAGACT
TTAGCATGACATGCTAGGTGTTCTTTTGACCTTATGCTTAGTGATTATTG
CTGTAGCATGTCTTGTTCCAAACAATTGGGATTTCTTTGTGTGCCTTGAG
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ACCATATACAACCAGTCGTAAGCCAAATAACATGCATAACATATCACATA
GTATCATACATAAATATAGGCACAAATAGCACAGAGTAGCACGAATAGCG
AGGTCCACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.