Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006803

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006803
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006803
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGGGCTCCCTCCGTCTTCTTCATCTCCTTCTTCCTCCTCCGATCTCTC
CAAACCCTAGCCAAGCAAATCCAGCACAACCCCACCCACGATTGCCTCCC
GATTTCCATGACCGCCTCCTCTGGCGGTGGTGGAGGAAGCGGAGGCGGCG
TCTCATCTCCGGCGCCGCGGGCCATGAAGCGTGAGCTCGCCTTCGCGCTC
CAGTCGCTCTCCGAGATCACCGCCTCGCCGGGCCGCACCCGCTCTGGCCG
CTCCCTCTCCTCCCCGGCCCCCTCTGCCCCGGCCATCGGCACCGCGTCCA
AGAGGCGGAAGACTAGATCGGACCCTCCCGTCAAGGATGAGGAGGCGCCC
GCGGATCTGGTCTCCCCGCCCACGCCGCCCTTGGATTCCGAGGCGCCCAA
GGCTGCCACCCACGACGCCACCGAGCCGCCGCCATTGGGCACTGCCGAGC
AGCCGCCCTCGGCTGCCGAGGCGCCGCTCGAGGCCAGCCCCCACGACGCC
GAGCCGCAGCCCAAGGCCAACCACCACGACGACCCCGTCGTGATGGATGT
CGAGGCCCCCCATGACGCCGACCTCATGGACGCCTGCGCCTTCGCGCCGC
CAGCAGGGGAGAAGAAAAAGGAAGAGGTGGATGGATCCATTTCTGCAATC
ACCCCTCAGCACCTGAAGGATGGATTGGATGCTCCTGTAGAAGATGCCGA
TCCCACAATTCAACTGCCCGGCGAGCATGCAAAACAGGACGTAGGAGCTG
ATGAGCCCAATGCTGCTGCCGCAGTGCCGCTTGCAATGCCAGATGTGGAA
GAGCGTGCCAGCCTGGAATTGGATGCACGGCCAGCTTTGCAAGAATCCGC
TGCTTCGACTGAAGAAAACCACAGGGACAAGCTCATGGATGCATGCCATG
GATCAGATGGACCGAGCATACCGGACAATGTCCTGGCTGATCCTCCTTTG
GCCGCTGAGGAAGCCACCACACCCGCTTCCACTGCCGGCCTCAAGCCTGC
AAGACGCTTCACACGGTCGCTGCTCGGTAACAAGACGGACAAAGAGGCCG
CAGCTAGTGAAAGTCAAGGCGTTGAGGACAAGAAAGAACCCTCCACTGAT
TTGACTCCAACACCAGGGAGGAGGTTCACAAGGTCACTGCTCAAGCCAAA
GGTCGAGGAGCACCATACCAGCAGTCTGGTTGTATCTGAAGAGCCAGCTG
ACAGCACATCACACACCCCTCCATCCGTGAAGAAGATGGAGATGAAGATG
TCTAAGAAGGTTGACTGCCTCACTAAGCACCCAACCAATGTCAGAGACTT
GCTGAGCACAGGCCTACTCGAGGGAATGCCGGTTATGTACATCATCCCTC
ATAGCAAGGTACGAGAGAATCTATTCGTAAGTTCTGTCAACAGTGTTTTA
TTATGCTTCATGATTTAGCTTAGGCAAGTAACCATCAATATTTGTTGTGG
CCTTTTATCGTTTACTCCACATTGGGATTCACGGAGTTCTTCCGTTGGGA
CATTACATGTATTTGCTTCCACTTTGTTAAGTCATTTGCTAGACTTTGCT
TATGAATCTGTGACGGAACGAAAGTAGCTTTGATGACACTTCCTATTATT
TGAGACCTTTCAGGGACACTCGCAATCATTTGTGTGATAACTTCTTGGTA
AAAATTGTGAGACAAACAGTCAGGTCCTTTTTGCCTCTGTCTGTGATGCC
ACACTTCTTGTAGCCATGGCATGTTATATTGTGAATGTCAATGAACCAAT
TAGTCCCATGAAATTTTGCTACTCTTTAAATAAGCTGCTGCATGCTGAGA
TATGTGGCTATATTAAAAATGTATTCTGTTATTTATAATGGCAGCCATTC
GTAGCGTACTGTGGATCATGTTATAACATGTAGAGCAGAAAATCGTAACT
CAGTGCAATTAATATGAGTTTTGTTTGCAAGTTGCAGAAGACTGTGCTGA
ATGGAGTGATTACAGGTTACAATATACGCTGCTTTTGTGTTAAGTGTAAT
GGCTCCAAGGTTAGTACTCCTTCCCTTCAAAAGGAAACAATAGGTTAGTG
CTTACTCCTGTATCTGTAAGCTGTTGCATAGCACAAAATGTGTATGTAAT
TTTGTTCTCCTTTTCAATCTTTACAGGCTATTTCTACTTATTTGTTCGAA
CAACATGCTGGAAGCAGCAAAAAACACCCTGCAGATCACATATACTTGGC
GAATGGTAATAGTTTGCGGGATGTGATACGTGCCTCTGGAAGTTCTCCTT
TGGAATCTCTAGATAAAACAATCCGGTCTTCCATTGATCCCATGGGTATA
AGGTGCCGCATGAACTGTCTGAATTGCAATGGTGAGACCTTCATGCTTAG
GTAACTCTTGGAGTTGTAATTTTCTCTTGTGCCTTACTGTCTTTGCTTAC
GTCTCCTAATGCTGCAGGGCATCTTCCTTCCTCACAAAGTGAACACTTTC
TGTGTGACTGTTGCCTAGAGTCAAAACAAGATCCTACTTCCCCATATGTA
AGCAAGAGCAATTCCAGGTAAACAATTTAAGAATCATAATGTGCTCCTAT
GACTAATTAACTATGAAACCTCACCGTTGGTTGCATAATTTGTTTAAGTG
ATAAGAAGTTTCTGCTATCTAGCATATTTTAATCTTATAAGCAACTTTCA
CAATTCTGATTGTTTTATATGAGTATATAATCTTTTACTTGTTTACTTCT
AGCTTGCAACTTATGTTAATTATATTTATAAATGATTCATCTCCACGTTT
TGTTTTGGGGTGCTATAGTATGACTCCAAGTTCCAAGGATTCTTTATTGA
AGAGGATGTCGTCAAGCAAAGGTGGGAGTACTGGAAAAGTAACAACAAAG
TCGGTACTTCTAGTTCTATTATGTTGTCCTTTTTTCCCCTTACTATTAAG
CACATAATTCATTGGTAATTGGTTGATACTTATTTCAGGGATACTGGGCT
ACACAAATTGGTCTTTAAGGTTTTGCTTGATGGCACCGAAGTAGCCTACT
ATGTTGATGGGCAGGTTGGTAGACCAAGAGCCATATCCCCTTTTTCTTGA
AGCACACCCTGTATTATTTGGTTGATAATTTGCATTTGCATTGTGCAGAG
AAAGGTTGATGGGTACATCAAGGATCAAAGAATCTACTGTAACCACTGCA
ATAGAGTGGTGCGTCTCCTTTCCTGTCGTAGCTACTTTTTAATATGCATC
CATCATTTCCTGTGAATTGACCTTTTATGAGGATTATCCAGGTTAGCCCC
TCAGCATTTGAAGCTCATGCGGGTGAGGGATCAAGACGCAAACCGTAAGT
TTGGTATCCTGTTTTAGCTTATACCAACCTGCCTTGTCCGCATTCTCTTA
TTTATTACATTGCTATCAGGTATGACAACATCTTCACATCGAATGGGGTA
TCCTTGCATGAGCTGTCAATGAAAATATCAAAGGATATGGAATTGTCGGA
ACGTGAAACTGATGATCTGTGCAGAGAATGTGGTCTAGGGGGTGATATTT
TTGCTTGCAAAATGTGTCCAAGGTCATTTCACCTAGGTAGGGGCTTCTAT
CTTCGTGAAATTAATCATCAATATGCTTTAAGACTGGTATTTGTTAGTTA
TTTAACTGGTATTTGTTAGTTATTTTGTTGTAAAGGATCATCTCTTAAAC
AATCAATCTAATATGGATCTCTTGTTTTAAATTTGTAGCTTGCGTTGGGC
TGTCTGAGGTTCCCTCAGAGTGGTTTTGTGATAACTGTAGCATCCTTGTT
CAAAAAGAAAAGGCTTTAGCAGCAAATAAAAATGCTAAGGCTGCTGGAAG
ACAAGCTGGAGTTGATTCCATTGAACAGATAATGAAGAGAGCTATAAGAA
TTGTCCCAATCTCGGATGACCTTGGAGGATGTGCCCTATGCAAGTGAGTA
CCACTTGTCTTAGGTTTTCCCTTTTTAATATATTCGCTCTATTACCTTAA
TAATTTATATTTGAATTAGATCCGGTAATTGCAGCTAAGAAATGTTTTGG
TGCATGCTCAATTTACAGCCTTCAGGTGTAGGGTTACTAGGGTAGATTAA
TATGATTGTATGAACTATGGTGGTGTCCAGAAGTATTGGATTTGGGACCC
GTCGTGGCAAGTAATGTTTATCAAATACTCGTATTATATTCTATGTACTG
TGAGGCATGGTGACAACAGCTTGGGAACGAACTAGTGTTCTGAAAAATTC
CAATATTTCCTGTAGTGACATAGGCATAAGTAGTACAATAGCTGGTAGAC
CCGTAATAGAAAGAACACAAGAGCAGCAACTAGCCTTCCAGTAAATATAA
AGATGTGGTCTGGATAACATATATCCACCAAATCGTCTATGAGAGGATCG
GATGTGCCTGTCAAGACGGCTTAGACTGTTTGGAAGGGATTTTAAATGAG
TTGTAGAATCTGACCTGAAGATTGAACCAACAAAACCAGCTCTATGTCCA
TATTACGATTCCCTGATAGAATCTGAGGCTAAAGTTGTTGGATAATGACA
CGGCACCTTAAAGGAGCTCTTTTAGGGAGATAGTCAATCAAAGAAAAGAT
ACTTGTTATTCGGTAGGACTGAATTATGCATAAAGGCTTACTCCCTCCGT
CATGAAATGTAAGCCTTTTTGGTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACT
TGGATTTGTCAAAATTTGTGTGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATT
CATCCAAATCTAGACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTA
GTTCAATTTAGGAACGGAGGTAGTACCTCCAAAATTGCTTTTTATTCTTT
CATTGTCTATGTTGTAATCTTCTGTCAAATCTTTTTTGTGCAGGAAAAAG
GATTTTAATAACGCAGTATTTGATGAGCGCACTGTGATACTCTGTGATCA
AGTATGCCGTCTATATTTATACTAGAATTGCCTGTTTGTTTTTTCTTAAA
TTCAACTTATAATCCTGATATATTTCTGTGTTACTATGGTAATACTTAGC
CAACTCGTTTTTTTTCTTTGCTGTTCAGTGTGAGAAAGAATACCATGTAG
GATGTCTGAGGAGTCAATTGCAGGTAGACCTGAAGGTTAGCACGTAACAC
CTTCATCTTCACATTTATGTGCACGATATGTTCACAGGAAATGAACAGTG
CTTGCATCTTTGGTGGAAGATAACACAGTTGCTTGTCTTCTTTTGCAGGA
ATTACCAGAAGGGGAGTGGTTCTGTTGCAATAGTTGCTCTGAGATACGCT
CCTCTTTGGACAAGATAATTTCTAATGGAGCTCAGCCTTTGTCGGAGTCA
GATATTGATATCATAAGAAAGAAACATGAATCCAGAGGTTTATTGATGGA
TTCCAATACAGATATCAGATGGCAATTAGTTGCTGGTAGAAGTGCCACTG
AAGATGGCAACTCATTGCTCTCTTCTGCTGTCCCAATTATTCATGTATGT
GCTGCACTTCTTAATCTTGTATGCGCCATTTTGTTTGAGGGGTTATAATA
GAACGAGTTTTCGCAACATTTTTTATTGATTGTGGCACTTAGTCGTTTTA
TCAATGTTCTATACTGATTGGTTCACTTTTCTGGTTGTTTTCTCCTTGCA
GCAATCTTTTGATCCAATTGTTGAAGCTCATACTGGTAGGGATCTAATTC
CTGAGATGGTCAACGGGTAAGAGAAGATAACTGTTCTTCCATATTTTGTT
CATTGCGTATGTCAGTGTGTGTTAATAAAGTATCTTTTTTTCCTAGGAGG
AGACCTAAGGATGGAATGCCAGGCCAAGATTACAGTGGAATGTACTGTGC
AGTGTTAACTCTAGGGTAAGAATTAGTTCAGAACCAAAACTTGGCGATTT
TTTTCACCTAGTGTGTACTAAATCAATCCTACTTTCCTATCGCAGTCCTA
CTGTTGTGTCAGCAGCACTTTTGCGTGTCATGGGAGGTGACGTTGCCGAA
TTGCCACTGGTTGCAACCAGTATGGATCTTCAAGGACTGGTGAGTCTAAT
AGTTGCTGCTTATCATTAGCTGTTCTGTCAACAAATGTGGTTCTGTCTAT
ATTGTGCCATAGGAAAGAGTTCCTGTCTATATATCATTATTGATTCCATA
TCCTTTTTTGTTTTCTTATATGATAAAAACAGGGCTACTTCCAAGTTTTA
TATTCATGCCTGGAAAGGATGCTAATTTCACTGAAGATCAAGCACTTCAT
GCTTCCAGCCGCCCATGAAGCTGAATCCATCTGGATGAATAAGTTTGGTT
TCACCAGAATTCCCCAGGAACAGGTTTGTCACAGTTTTGCTGAGTTGTTT
GTGTTTTATCGTCTGCTATTGTGTCTGGGTTCAGATGATGGTGAATCTAA
TCTATACTTGCTGGTTGCAGTTGGAAGCTTATCTTAACGGGGCACACCTC
ACCGTATTCCATGGAACAGCAAACCTGTACAAGGCTATTCCTTTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.