Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA006063

[Submit comment/correction]

Sequence	AA006063
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA006063
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGAAGAGGAGGCAAACCGCGCCGGGGCCGCCCTCTCGCGCGCCCCCATTC CATTCCTTCCCGCCCCGTCGCGCGCCGCCTCGCTCCTCGCTCCCGCCCTC TCGCCTTTCCCGTCCCAGCCGCCGGTGGGGACTATGCTGAGGGGACGGGA GAGCCTGGTCCGCCTCATCGGCCGGCGCCGCCGCTCCCCTCTCCCGGAAT CCCTCGCCGCCGCCCTCCTCTCCCCCTCACACACCACCTCCCACAAGGTC AAAACCCTGAACCCCAAACTGCTCGCCGGTTCTATTCTACCCGTCTCATC TGCGCTGTCCGACGCTTAGCGTTTCTCCGTTTTCTCCAGGCCGACGACGC GGGCGCGGGCGCAAGCGCGAGCGCTAGCGAGGCGGCTGCTGCTGCTGGCC CGTCGTCGGGCGGGAACCCCGGCGCCGGCGAGGAGTTGGTGGCGTGCCCC GTCTGCGGCGAGTCAATCCGCGGCTCCGACTACAGCGTCAACACCCACCT CGGTCCGTACGCGCATTCTCGAATCTCCACACTCCTCCCGAACCAGGGGA ATGTTCATTCAGTTAACTACTGATTGCCGCTAGGCTTGCTAGTCCGTGTT GTTGTCGCGGAATGCTGATTGCATTTGAGTTTGGCTAAATCGTTGCTAGC CAAATCAGAAATACGGTTAGCTACTTCCTGATTGGAACTTCAGGTTGATG TGGTTGCCTGGGCAGTGTCACTTTTATCACTCTCACGTGCTGCATTGTCA ATTAAAGCAAGTCATTGACTCAACACCGTGTCTGTTGTCTCTTTTGATTT AGGATAGTACGTTCGCGTGGAATCTTACTCCCCATATAGTGGGATGCATA AGAAGCATCACATGCTTAACAATACTATAATAATGTTCTGAAGATTTCTG TTTCGACATGAACGGTGCAGATCTATGCCTCACCAGAGGAGCGAAACGGA AGTTAACACAGAGCAGCCTTCTTGATTTCAGATTCAGTAAAAAAGCAACA GTTGAGCCTACTCTAGACAGCTTGAACAAGGATGATGAGGCAGAAAATAA GGGACTGGCAGATGAGGACGTATCTAGTGACGGAGACAGGAATTCTGACC CCGGAAGTCCCGAGGATAGCACTGCCCCTTTATTACCTGCCTGCCTGCAT GGTTCACCTGGCATTTCCAAGATGCATAATACCAGTATACCTTCAAATAT TGTCTTGCCAAATGCTGAATATGACGAGGTGGAAAATGGCTCTTCCTGTG TGCTTTCAGCAGGAACAACTCCTGGCAGTATTGATGCATGTCCAGACATG GATTCTAGCACCACGGTAGCTGTCGACACTGTCATAGTGGGCCGGAGGTT CCGTGAAAACATTGAACTGCAAGAAGGTGTGGGCATAACTGTTATGAGAG ATCCTCAGAACGCTAAGGACCCTGATGCTATCAAGGTTTCCACCCTCTGT GAACAAATTATATTTCTGTTGATATCTCTTTCATGTAGAACTTTGTTCTT TATACCATCGATAGGTGCTTTATGCAGGGTCTGAATGCGGGCAGATGCTT GGGTACTTGCCTCGAGAGTTGGCTAAAGTCTTGGCTCCTCTACTGGACAC ACATTTTGTTGAATGCGAGGTGATCACTTATTTATTTGCACAATAAGTGT AATGTAGCCTGCAGTGGCTAGGTCCTCCAGAGCTCTATACCCTGCCTGCT TGTTGAATAAATATATTGCAGTCAATTTTACGCAGAACGCACTACAGTGG AAACTGCAGATACACCATGTTCTGTTTGGTGTCCTTGATTAGCGATGAAT AAACTAGCATTGACTTCCGTGGTAGATTCTATTAGAAATCTCGCTACATG CCATCTTAGTGAATGCTCGCTGATTATTATGGATACAATTAATTTCTTTG CATAATAAGGTCACAATTTGTCAACTGGATGCTGCACTTAGTCAGAACAA CTGTAAAATCATATACGCTCTTACATTTAGCTATAAAACTTACTTCTCTT CATACCCAATAGTTGTAAGAAGAGGAGTTCTAGGACATCTCGGGTCTGTC TCTGTAAATTAAGTTTTTTTTTCAGCATCCGGTCTCAGTGAGTTTCCTTT TTCACTAATTCTTGTTTGACTTGCACTTTTCACGGCTTTCCGCTTGACTT GCACTTTTCTCTAGTTTCCGTTTGGGTTTCATATCTAGCCTACCCCACTT GATTGGGACTAAAGGCTTGGTTGTTGTTGTTGTGGTCTCAGTGATTTTCA TATGGCCTGTTTAGGGTGTTTCTCTCAAACCAGGGGGACATCGCTGCTGA TTTAATCAGTTTTCCAATGAAGATCATATGTTCATATACAAGCTCCCAGC TAACATTAACCCAACTATATCTGTAAACAAAGGTGCAGTTAGGATAAAGG TTTGTAGGATTGGGAGGTACATTGCTCATCTAAACACCTGGAACGGACCA ACACCACTTCATATCCATTTATACTCATTACTCTGGGCAAGCAGCACTTC CAGTCACTGGAAGGCTGGAAGCCCACTCTACCTGTGAAAGTAGTTAGTAG AATAACGATGTATACCCTGGTGCAAAGTGCAAACAGATCTTTAGTAAAAA CTAGCACTCTCTTTGAGTTTTAACATTTGCTTTGATGGTTTTTATTGTGA TTAATTCCCTAGCAATGCTAGAAAAAATATCAGATGGTCACTTGCGTGTC ATATTTTCTGATGACATTAATCTTGGTGGTAGTAAATTTTTTACCCTGTT TGCTATAGGAACACCACAAGGTTTGTACTCTCGAGTATCTTTTTTGGTTG ATAATTTTGTTTACCCAAGTTGATAGCTCCAACTTCTGATGCTCAGTTTC CTATTTTATTAGGGATTTGTGGTTGGTTTGCCTGAACAACAGCTTGACAA CGTGCCCATCCATCTAACTTGTCAAAAATGTAAAGATGACAATCAGAGAT ACGAAGATCTGAGATACCGACAATCCTTATGGGAAATTTTTCTTGGTGCT GTTAGAAATGGAAATTTTCTACGACCTAACAGTGCAAGATACCAGGCAAA TTTTAATACAATGATAACCGATGTTATGACCAACCATACACACCTTTTCA ATGATAAGGAAGCATCATTTCTAGGTTTATTTCCTTCCCGCAACATTTAA TATTTCTTGATCAAGAAGTCTTAATGACTAGTTTATGTTTTGACATTCAA TAGGTTCTTTTAGATCGTTATCGAATGATAGCCAACGGCTTTTTGTGAGG ATTTACACTCGAAAAGGTTAGCTCCTGATGTCCATTGATAGTTAAAATGT TGATTTGGCTTCATTCATGTTCCATATGTATGTTTCAGAATTATAATGCT AGCCGCTTAAGTTTAGTGCATGTTTTACTTTGATAGGTTGAACAAAATGT AGTCCCTTATTGCGCAAAGAAAATTCACACTTGATTGACTTAATTTTTTG CAGGGCCATGGTTTCGAGTGAGCAGTCTCTCGTACCGTGAGATATCAGAT GTGGAGCATGCTGCCATGGAGTTAAAGTGTAATAACCTTGGCCTACTCAT TTTTTGTAACTGGCATGTTAGCATGCTTTAGCTGTTTTAATTGGAAGCTG CTTCTTTTACAGTGGCAGGTTATATAGAGATGCTTTCTTGCACCGATGTT CCATCTGAATATGATATTAAAGAGATTCTCGATGTGCTAAGTGTTCCTGA AATGAAAGAAATACTAAAGGAGCTCCCTAAGGTTTCAATCTTACCTTCAA CTCCTTTCTTATTATGCACAAGGATTCAGTTTGCCTTTATTACCCCAGCA TTTTGTATTGTCATTCAGAATCACCATTTTTTCTACTTAGGAAAGTTACA CACACTACTTTAGGATTTGTTTTAGTGCATTTAGTTATTACTAGTATGGC TACATATAACTTATCACTGCCAACTTGGTAGTGGTGCTGTTGATCCATGT GGCATCAACACATCATGATGCACTTATTTTGCATAATAACATGGCACATC CATGATAATGCATAGCCTGCAAAATGGCCAAGGAATATGAAATGGTAAGA ACTGAATATCACCCGTTTATCCATAATATTTGCCTACTAATGCTCAAGAA AATGATGTGGGCATAAAACCATATTTTCCCCCTTAGAATGCCCAACAACT TATAAGTACGATAAGTGATTGCACATAATGTACACCGATGAACGATAGAT TTTTTCTCTCGAACACAATGGTCATTTTGTATTAGAAGAAGGCGTCAAGA TGACGCGAAAGAGTATAAAGGGAAAAAACCAAGCAAAACAAGATGATAAA AAATAATAAAAAAAGAGAAAGAAAAAAAAACTATACAAGAGGTAGCACTC TCTAGCTGGCTTGGTTGGACTGTCAGCAGGCTGGGCGTGAAGCAGCAGAC GTTACAATGCTTTCGCACCAGCCAACATCCACAGCCTAGCTCCATCTAGG AAAGACTCCTCACCAGCACTCCATGATTTGGGGTAGCCTGATTGCACCAT TGATAGATTATTTAGAAATATGTAATCTTGCTCAAATTGATAGAGGAAAA ACCTGAGAATATGGATGAGCATTGGAATGTTAATTGTAATTACCACACAT ACCTTATTTCAGGTGTTCTATTTGATTATATTATATGCATCCTTCGGCAG TAGTAACAGTCAAGTCCTGTGGAATGATTAACAGAGCGTGCCTCTAATTT GCAAGAATACTAGCATCAGATCTCTATATTGAAAACAGATTGGTGGCTCA ACAATAACATAAAAACTGGACAGGCGATTGATATTTTGATCAATGGCCTG CTATCGCAAGATGTTTTTCTTTGGGCTGACTTGCAGTTGATTTCTGTACT TGTTCTGGTTTTCTTAATTAATATTGTGTTTCTTTATTTTGCTTTCTAGG ATAACACAAACTGCACTCGTCGACACGAGCTTCTTAGCACTCTTCTATCT ATATACAATAACGGAACCTGGTAACAGTCTTTCCTTGTTTCATATTTGGC CATTATGATCTCATAAGAAAATTCACTTCTGGATGCAGCACATCTCTACC AAAGCGAATTGTAAAATGGACAGGAACCTGTATAAAAACATCTAATATGG CTGATGAACTTCTATGGCGCGTTCAGGTGAATGAAAATCTTGCTTAGACT GTTTATTCTATTTACAGTATTGTTCCATCCAACTGTTGTTGTCATGTATG ATGATCGATGCAACCATGCAGAGGCTCTTCTTTCTAAATGGCGATCAAGA CCTTTCATCCTTTCTATTAGTGGATCTTGGTCTGGTGAAATTCCCAGACT ACACTTGCAGCATTTCGCACCGTATTTTTCAAGAAAGAAATGATTTACTT GAGTATGAAGAGGTGAACTTCTCATTTCCTTCTAGAACAAAACATAACCT GCCAATCTTCAGTTGTGACTAATGTCTTATGTTGCAAATAGGCTATCCGA GTGGCACAGTTCATGGATGAATCTCTTGATAATGAAAACATGGATTTGGT GTCAAGATGTGCTGATTTATCTGAGAATCGACTATGCACTATGTTAAAAG AAGATAGCAGTATAGCTGAATCTCCTCCATTTTATTCATGTTTTTCATCA ACCTGGGTCTACTCAAAAGTTCTTACATTAGGTGTCTCTGTTTATGAACG CGACCGCAGGTAAGTTATGATAAACTTATGAATAACCGAACTGGTATCTA CATGAGTTTAGATGTTTCATTCAATTTTGATTGAACTGGAACCCTTGGCT ATACTATTTCTGGATTGTGTTGACACATCTTCTGGTCTACTAGATGCATA ATGGAGGGGTTTTGGTTTACATTTACGGCTGTCAGATATTTAGTTGCATA AGCTTAGTACTAGGTAGGTTGTAAAGTTTCATCTTGTATGCGAATTGTAA ATCAATGTGAACTTTTGCAGCGAAGCTGTGTTTTTGATGAAGAATCCTAA CCAAAATAGAGATCACCAATAAAGTCCTTTTCTGCTGAAAATTGATAGAA TATATGAATGCTTCCACAGGAAGGATCATTTCCTTTCTTCGTTGAGATTT ATAATTTTATAAAACTTGCGAGTTTACATTCACTCAGTACCTTTTTTTTG GGGAGGAACTAGATATACTGACTATATTGTACAGGTATTCAGATGCAATA AGGACTCTAAAGATGCTACTTAGTAAAGTGTCTTCTGGTAGACGGCGAGG ATATTGGACACTGAGGCTATCTGTTGATTTGGAGCATATGGACCGCCCAA CTGAGAGTCTTTCAATAGCTGAAGGAGGAGTAATTGATCCATGGGTCCGT GCTGGGTCAAAGATTGCACTGCAAAGGAGAGTTCTGCGTTTAGGCAAACC TCCACGGCGCTGGAAAGTTCCTAGTTATGCTGATTCTCTGAGGAGAAATA TAAAAGAGGTATATATGTATATCACTCTGATGGTCCTCAATCAGGACAAA TTTCTTTATATCTGTCTCTGGATCGAGGTGATAACATGGAAAATGCTAAA TAATCTATACTTGGGATGCATCACACATATGCTATTATCAGGTAAACATC GAAGGAAGGCCATTGAATTGTGAAATAGGAGCAAAGAATGTTTTTTATGG CTATGATGGTGAACGCTGTGGGGTAGAGCAATTAGCTTTGCAGTATTATG CTGATGAAGGAGGTGGTTGGCAAGGTACCCATTCAGAAGGTGGCATATGG ATGACGATCTTTGGTCTTCTGATGTGGGATGTAATATTTTTAGAAGTATG CAATGTTTTCCAGTCTAAATTTCAGGTACATGACTTATGGACCATATATT TTTGTTAAGAGTTGCATAACCATGTGCATTATGTTGGTGCATCTTTCAGT GATTATGCTTTTGATAATTGTGTTGCTTGCATGTTCGATTTAACGGTTTA TTCTGTTTTTAGGTCTTATAGTTGGCTTCCTTGTGGTGGTTTTGCTTAGC TTGATTTGTGTATTTTCTTGCAGACAGCCCCTCTTGATTTTGGAACAGAC GACTTCTACAAGTCAAGAAAGGACCTTATAGAATCACAGTTGAAAAGGAT ACAAGATGGAATGGCTGAAGAGATGCTTATCAGCTCCTGGGAGCTACATC AAGGGACATCCTGCAGGGGTGTCAATTGGGACCGGCACTCGATGGCTGAC CTACGAGCTGTCGTTGCAGGTGTTGGTGGGCATCGCTTGGCATTACTTCT CCGGCATCTAGCCCTTGATTACAATAGTTGGTCTAGTGGAATGCCTGACT TGCTGCTATGGCGTTTCCTCGATGAACGGGGTGGTGCTGAAGCTAAACTT GTGGAGGTCAAAGGACCCAAGGATCAGCTCTCTGATCAGCAACGTGCTTG GATTTTTGTCCTGATGGATTTTGGATTTGATGTGGAGATTTGCAAAGTGA GCCTAGTTTCTAAGCGGAGATAGCTCCCCTTTATACCTGGTGTAACAGTT TCGTTATGCCTGGTGTAACAATTTCATTGTATTGATCTCATCTGCTAAAT GTATTCAAACACACTAAAAGCTGTAACATGTATAAGCAACATTGTTCTTG ATATTTGCATCGATGCTGTGCATAAGTAAAAAACTTTCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.