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GrainGenes Sequence Report: AA004851

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Sequence
AA004851
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004851
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGGATGATGTGAATGTCAAGCACTTCATTGACATTTGCAAGGAAGAGAT
TGATGCTGAGAACAGGCCACTAGGTTGTTTTACTCGCCCTGGTTGGAAGA
ACATGGTAGCTAAGTTTGAAGAAAGATCTGAAAAGAAGCTAACCAAGACA
CAACCGAAGAACAAATGGGATAATATGAAAAAAAACATGGAGTTGAAAAT
TGCTACGACCGGAATGGGTTGGGATGATGCAAAACAAACTGTTGATTGTT
CTGCCACATGGTGGGATGAGCATCTTGAGGTAAGATTACTATAATTTTCT
ATATGATTATTTTATATTTACACTAGCTAACGTGTAAATTTATGAACTAC
AGAGATGCAACAATTCTGAAAGAGGTATCAAGTGAAATCGTGTGAAGTTT
AGAAAACGTGGTCCCAAGCACATTGATGATCTACATGTTGGAGATATGCC
CTAGAGGCAATAATAAATGTAGTTATTATTATATCTTTGTGTTTATGATA
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GTGTGATTTGTAAACTTAATTTGAAGTCCCTAGTATAGCCTCTATACTTC
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GTTATCAACAACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGATATGGTGGACATAC
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AAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCATA
TGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAACTCGATCATGT
CCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGACGTTGT
TTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCT
CGGATGGGATCCGGGATATCACGAGGTGATCCGGAATGGTCCGGAGAATA
AGATTCATATAAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTGCGGAATGATTCCGGTG
TTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAATGTCTGGCACTCCGGGG
GGGAGGGTACATGAATGTGTTATATCAAAGTTGGTATGATTGCATCATGT
ACTAAGTGTCATCGCTGTCCGAAATAAAGGGTTAATTCAAATCCTAGTTT
GAAAAGTCAAACGGCTAGTTTGAAAAGTCAAACTGCCAGTTTTCGGAAAG
AGGAGAAGGAGGATTGGTGGAGGCCGAATTGGGGGAGGGTTCCTCCCTTG
GCCGGCGCACCACCAAGCCTACTTGGGGAGGGACTCCCCTCCCCTGGCCG
CCGGCCCCTCCCATCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCCTCCTAGCACA
CACAAGTTCCTATCTTCTACCTCCGGTTTAGAGCCGTTTGGGTTTAGAGC
TTCTAATTGCTTTAGACTTCGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTTTAGAGCC
TTCTAATTGGTGTGTCTAATTACTAGACCACTAATAGCCTCTCTCATACT
CCACCATACTCGCACCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATTTCCCCTCT
ACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAATCGCGAGGAGAGTGCTAC
AACCTCCGCTGCATGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTAC
CGAACGTGTGACCGACTACGGAAGCGCTGCCGGAACGCAGCGCCGGAAGG
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ATCGACTCGTTGCTATAATCTAGTAGATATATCTTGGCTTGTTTGTTTGT
ATGCGATAGAAATTTTTTGTTTTCCATGCTACGAATCCCTACAGTGGTAT
CAAAGCCGTGTCTGTATGTAGATCTGTTGCACGAGTAGAACACAATGGTC
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TCTTGCGGTATGTTGGGATGAAGCGGCCCGGGCTAACCTTACATGACATC
GTTCATGAGACTTGCTCCACGCTTGACATGCAACTTGTATTGCATAAGTG
GCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCTAGCATAGTTAAGATCCAATTTACAAC
GGGTGATTAACAATACTAGTATCAATGTTGTGGTTCTTGTTCGTAAGTTA
GAACGACACTTATTGAAAGCCCCAAACCACGTAAAATATGCAAAGAAAGT
AGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGGGGTGTGCAGTGATGTGATATGGCC
ATCATTGTGATTATATTTGATGTATGCAATGTTCCTTATTGTAAGTCGGC
AACCGGCAGGAGCCATATGGTTGTCTTTAATTTATGTTAAGACCCGCGTG
TCTATTCAAAGTAGTTGTAATAGTTGAAGCCGGTGGACGACAACCATGGA
GTAGTGTCATTGACCTTGATGCAATGCCGGTGATGATGGAGATCATGTTC
GTGCTTGAAGATGGAGATCGGAAGCACAAAGAAGAAAGGCCATATCATAT
CACATATATATTGAATTGCATGTGATGTTAATCCTTTATGCATCTTGTAT
TGCTTAGTAGACGATGGTAGCATTATAAGATGATCCCTCATGCACATGAA
TTTCAAGTCATAAAGTGTTCACCCTTAGTCAGCACCATTGCTAAAGCTTG
TTGTTTCGAAGCACCACGTGATGATCGGGTGTGTTAGATTCTGCAAGTGT
ATACAACGTGAGCAAGCCAGATTTGCTCATGCGGAAACTAAGGTTTGATC
TTGACGAGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCGGAACACAGATCACCGAA
AGGTAAAGCATGAATCATATAGTAGATATGATGAACATGACGATTGTTCG
CCATTGAAACTATATCAACTCTCGTGATGATCGGTGTTGATGTAGTGGAT
TTGGTTCGTGTGATCACTAAAACAATGTGAGGGATATTGTTTTGAGTGGG
AGTTCACCTGGTTTAATTACATTAATTAATTTGAACTCAATTTGTCATAA
ACTTAGTCTAAACTATTGCAAATATGTTGTAGATCAATGGCAACCCCTAC
CATCAATTTTAATGTGTTCCTAGAGAAAGAAAAGTTGAAAAACAATGGAA
GCAACTTCGCGGATTGGTTCCGCAATTTGAGGATTGTCCTCACAGCTGGT
AATTTGACCTATGTGCTGGATACACCGCTGGGTGACCCACCTGCAGCTGA
TGCTCCCGATGAAGTAAAGAATGTTTACCTCGCTCGGAAGAATCAGTACT
CCATAGTTCAGTGTGCTATCTTGTAAGGTTTGGAATCGGAGCTTCAGAAA
AGGTTTGAGGATTCAGACCCATATGATATTGTCGAGGATCTCAAATTGAT
TTTTGAGACTCATGCGGCAATTGAAAGCTATGAGGCTTCTGAAAAGTTCT
TTAACTGCAAGATGGAAGAGGGCAGCTCCGTCAGTGAGCATGTGCTTAAG
ATGTCTGGGCACGCAAACAAACTTCAAAGCTTGGGTATAGTGATTCCTAA
TGCTTTGGGGATTTACCGTGTCCTCCAATCACTACCACCAAGTTACAAGA
ACTTTGTGATGAACTACAACATGCAGAACATGAACAAGACGTTGCCAGAA
CTCTTTGCCATGTTGAAATCTGCAGAAGTGGAGATCAAGAAAGAGCACCA
AGTGTTGTTGGTCAATAAGACCACCAAATTCAAGAAAGGCAAGTCTAAGC
AAAAGGGACACTTCAAGAAGGGTGGTAAGAAAGTTACCACGCCGGCGAAG
AAGACCAAGGCTGGACCCAAGTCTGATACTGAGTGCTTTTACTGCAAGGG
AGAAGGTCACTGGAAGCGGAATTGCCCAAAGTACTTGGCGGATTTGAAGA
ACGGCAACATCAAGAAGAAAGGTATATCTGATATACATGTTATTGATGTG
TATCTCACTAGTACTCGTAGTAGTGCCTGGGTATTTGATACTGGTTCGGT
TGCTCATATTTGTAACTCGAAACAGGTGCTGCAGAATAAACGGAAGCTAG
CGAAGAACGAGGTGACGATACGCGTGGGAAACGGATTAAAGGTTGATGTG
ATCGCGGTCGGCACGCTACCCCTTCATCTACCATCGGGATTAGTTTTATA
CTTAAATAATTGTTATTTGGTGCCTGCGTTAAGCATGGACATTATATCGG
GATCTTGTTTATTGCGAGACGGTTACTTGTTTAAATCCGAGAATAATGGT
TGTTCGATTTATATGAGTAATATGTTTTATGCACATGCACCTTTGATAGA
TGGTCTATTCTTATTGAATCTCGATAGTGGAAATACACATATCAACAACA
TTGAGGCTAAATGTTTGAAATCAAGCGATAATTCGACCTATATGTGGCAC
TGTCATCTTGGTCACATTGGAGTGAAACGTATGAAGAAACTCCATTCCGA
TGGACTTCTTGAATCACTTGATTTTGAATCACTTGAAAGATGCGAAGCAT
GTCTGATGGGAAAAATGACTAAGACTCTATTTTCTGGTATGATGGAGCGA
GCTACGGACTTATTGGAAATCATACATACCGATGTGTGTGGGCCAATGAG
TGTAGCATCGCGCGGTGGTTATCATTATGTTCTTACCTTCACAGATGACT
TGAGTAGGTATGGGTATATCTATTTCATGAAACATAAGTCCGAAACTTTC
GAGAAGTTTAAGGAGTTTCAAAGTGAGGTAGAGAATCAACGTAACAAGAA
GATTAAATTTCTACGTTCTGATCGTGGAGGTGAATATCTAAGTACGAGTT
TGGCGAGCATTTGAAGAAATGCGGAATACTTTCACAATTGACACCGCCGG
GAACACCACAGCGTAATGGTGTGTCCGAACGTCGTAATCGAACTCTCTTA
GATATGGTTCGTTCTATGATGTCACTTACAGATTTACCGCTATCATTTTG
GGGTTATGCATTAGAAACAGCCGCATTCACTTTAAATAGGGCACCATCTA
AATCCATTGAAACGACACCGTATGAATTATGGTTTGGGAAGAAACCCAAA
TTGTCGTTCCTTAAAGTTTGGGGATGCGAAGCCTATGTAAAGAAGTTACA
ATCGGACAAGCTTGAACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGATACC
CGAAGGAAACTATTGGGTATACCTTCTATCATAGATCCGAAGGCAAAATC
TTCGTTGCCAAGAATGGATCCTTTCTAGAGAAGGAATTTCTCTCGAAAGA
AGTGACTGGAAGGAAAGTAGAACTCGACGAGGTTGTCGAACCTTCTCTCG
AAATTGCGAGTAGCGCAGCACCGGAAGAAGTTCCTGTGGTGCCTGCACCA
ATAAGAGAGGAAGATAATGATGGTGATCATGAAACTTCGGTTGAAGTTGC
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TATGAGGAAGCGATGATGAGCCCAGATTCCAATAAATGGCAAGAAGCCAT
GAAATCCGAGATTGGATCCATGTACGAAAACCAAGTATGGACTTTGGTGG
ACTTACCGGATGGCCGGAAGGCTGTCGAGAACAAATGGATTTTCAAGAAG
AAAACAGATGCTAATGGTAATGTTACTGTCTATAAAGCTCGACTTGTCGC
AAAAGGGTTTCGACAAATTCAAGGAGTTGACTACGATGAGACTTTCTCAC
CGGTAGCGAAGCTAAAGTCTGTGAGGATTATGTTAGCAATCGCTGCATAT
TATGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACAGCATTCCTCAATGG
AGACATTGATGAAGAGTTGTATATGATGCAACCCAAAGGTTTTGTCGATC
CTAAAGATGCTAACAAGGTATGCAAACTTCAACGGTCCATCTATGGATTG
AAGCAAGCATCCCGAAGTTGGAATCAACGTTTTGATAAGGTAATCAAAAG
TTTTGGTTTTATACAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGA
GTGGGAGCTCTGTAGCATTCTTAATACTATATGTGGATGACATATTGTTG
ATTGGGAATGATGTAGACCTTCTTAATAGTGTCAAGGAATATTTGAATAA
TAGTTTTTCAATGAAGGATCTTGGCGAAGCAGCTTACATATTAGGCATAA
AGATTTATAGAGATAGATCGAAACGCCAAATATCATTGTCACAGAGTACA
TATTTGGACAAAGTTCTAAAGAGGTTTGGAATGGAAGAAAGCAAGAAAGG
GTTCTTGCCCATGTTGCCCAATACGACCTTAAGTAAAACTCAAAGTCCGA
CATCGGCAGAAGATAGAGAAAGGATGAGTAAGACTCCCTATGCCTCAGCC
ATAGGATCTCTAATGTATGCCATGCTATGTACTAGACCCGACATTGCATA
TGCTGTTAGTTTAACTAGCAGATATCAAAGTGATCCAGGAGTGGATCATT
GGACAGCGGTCAAAAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATATG
GTTCTTTCTTATGGAGGTGATGAAGAACTCGTTGTTAATGGTTACACCGA
TGCTAGTTGGAACACCGATCCGGATGATTCTAAATCGCAATCCGGATACG
TATTTATTTTGAATGGTGCAGCAGTTAGCTGGAGGAGTGCAAAGCAAAGC
GTTGTGGCGAGATCTTCAACTGAATCGGAATACATGGCTGCTTCGGAGGC
TTCACAAGAAGCGATATGGATGAAAGAGTTCATTACAGAGCTGGGTGTGG
TTCCTAGTGCGCTGGACCCAATGTCTATCTACTGTGATAACATGGGCGCC
ATAGCCAATGCGCAAGAACCAAGGTCACACAAGAAGCTGAAGCATATCAA
GCTACGTTTTCACGCTATTCGAGAACATATCCAGGATGGGGATATAAAGA
TTTGCAAAGTACACACAGATCTGAATGTGGCGGATCCGTTGACTAAACCT
CTCCCGAGGGCAAAACATGACCAACACCAAACTGCCATGGGTGTTCGGTA
TATTACCATGTAATCTAGATTAGATGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGT
TGGAGATATGCCCTAGAGGCAATAATAAATGTAGTTATTATTATATCTTT
GTGTTTATGATAAATGTTTACATTCATGCTATAATAGTATTAACAAGGAA
ACATTGATACTTGTGTGATTTGTAAACTTAATTTGAAGTCCCTAGTATAG
CCTCTATACTTCACTAGCTTGTTGATTAATGATTGTGGTTTCCCTATCAT
GAACATTGAGATGTTATCAACAACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGATA
TGGTGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTC
AATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTC
GACCATGAGATCATGCATATCACCTTTATCGGATGGATGCTTTGATGACA
TCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGTTATAAAGGTGGCATTGAGTGTTC
GGAAAGTATTGGTTGAGACACATGGATCAAGAATGGGATTTGTCCATCCA
TATGACGGATAGATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGGAATGTCATCCAATT
AGCTTGCAAGCATGTGACTGGCTCACAAGGGATCACATATCACGGGAACG
AGAAAAGAGTACTTATCAGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGCAGAGATAC
CGACGATCATAACCTCGGATAAGTAACATATCGTGAGACAAAGGGAAATT
GGTATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAAATAT
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AGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTT
AAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACCGA
ATGTTGTTCGCAGTCTCGGATGGGATCCGGGATATCACGAGGTGATCCGG
AATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTG
CGGAATGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCTGGAAT
GTCCGGCACTCCGGGGGGGGGGGGGGGAGGGTACATGAATGTGTTATATA
AAAGTTGGTATGATTGCATCATGTACTAAGTGTCATCGCTGTCCGAAATA
AAGGGTTAATTCAAATCCTAGTTTGAAAAGTCAAACGGCTAGTTTTCGGA
AAGAGGAGAAGGAGGATTGGTGGAGGCCGAATTGGGGGAGGGTTCCTCCC
TTGGCCGGCGCACCACCAAGCCGACTTGGGGAGGGACTCCCCTCCCCTGG
ACGCCGGCCCCTCCCATCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCCTCCTAGC
ACACACAAGTTCCTATCTTCTACCTCCGGTTTAGAGCCGTTTGGGTTTAG
AGCTTCTAATTGCTTTAGCCTTCGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTTTAGA
GCCTTCTAATTGGTGTGTCTAATTACTAGACCACTAATAGCCTCTCTCAT
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TCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCAAAATCGCGAGGAGAGTGC
TACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAG
TACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGGAACGCAGCGCCGGA
AGGATCGTCTGCACGATCTTGAGATCGGAAAGAGTACGACTACATCACCC
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ATGCACTCTTTGATAAGGCACATGTCAACGGGGCTACTGCGGCATATTTC
AGAGATGTATCCTCTGATGAGTCCAGCGACGAGGATGTGGTTGAAGTGGA
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GCAAGGAACACGTATCGAAGAAAATAAAGATGAGAAGAGTCCCTTCTTTC
GAAGGTAAAATAAAACATGACAGAAGATAGAAACTGGAGTGGACAAGATA
ACCTCATTTGTTGAAGCGTCATCGGTTCCTATTCCAACCAACCATGTCCC
TACCATTGCACATGTCCTGAAGTTGGTGAAAGAGTACGGTGTTGAAGAAA
AAACTGCTCTCTTCCACACAGCCACGTTGTTGATTGTGAAGCCTGAATTT
AGGGAGATTTTTAGCTTGCTCGAAACAAATGAAGGCAGGAAAGATTTGCT
TGAGAGAGAGCATGAAAAGGAGATCACAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.