Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA037965

[Submit comment/correction]

Sequence	AA037965
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA037965
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAAATCAAGAGCCTAGACAAGAGAGCGATTATATATTTTTAGTGTGG AAAAGGAAAGAAAGCGCCTTGCACTCCGTCGCGTGTTTCGTCTTGGCTGA AGAACCATGGTACTCTCTCTCCCCAACCCGATCAAAAAAATTCGTGCTTC TCGATTCCATTCGCCCAGGCGACGCCAGATTTGACACCGGGCGGAGCCGG CGGCCTGACCGGTCGTCGCGGCGTTCGATTCGGTGCGGATTTCGCCGAGA TAACCCCGTCCCTGATTTCGACTTTGTTTTTTTTCCCTGGGGATTTCAGG ATAGGAGGGCGACCTCGCAGGGGGATTACGATGAGCAAGGTGAGGCTATT TAGTGTATTTTGTGTAGTTCGTTTCAGACTCAAGAGAAGCGGGGCGAATT ATGTCTGGGATTTCTGGGATCTGATCCTGGGTGGGTGTGGCTGTGCATTG AACGCCGTGCTCGTATGCGTGCAGATCACCGGGTGAAAGGCACCGAGGTG TTCGTTGGTGGGTTGCCGCGGTCCGCGACAGAGGGGACACTCCGAGAGGT TGGTTTGTCATACGGTCATGAAACACCCACTTGCGTGTGAAGTGTTGCTT CTCAGTATTTCTGAAATTAACGAGTGGTGTGCTGCATAAGGACAGAGTAA TGCCTGAATTGCCTACAGCCCCGATGATTTGTATAAGCCATGGTTCCGAG CAGCAAATGTTTTAGCTGAATAACTGTCTGGGCAGCATTGTAAATTCCTC CACTTCATGTTGTTTTCTCCACTTGTTAGTTCTCTGCAATGCAAAAGACT GTGGCCATGGTTAATCTGAAAATCTGCAAATGCCACCTTTTACTCACCCA TTGTAACCGTTAATGTTGTGTAAGGCATGCCTACCAAATCAAATGTTGCC GCACACCTAAACCATGTTTGGTATCTACCAAAAGCTTAACTGGTACGTAC TTCTGTAATTTTTGGACGTGGCTTGGTAATTGGTAATCTGCCACGCAGGC AATTTTGTCGTGCTCTAGCTAGTGATAACAGAAATATGTGATACTACAGG CGCTAGAATATTTTCCTTAATTATGTGATATTTGACTGTTGAGCTTAAAG TATATGTTTATCCATTGTAGATTAGTAATAGCCACTTGTCACTGTCCAAC TTCTCTTGGCTCTTGTCTCTAGGAGAACAATAGCTCATTTGTTAATCTTC ACCTGTTCATGTTAAAAAGTTAGTGTTCTTTCACATACTCCTTGGACTGA CCCATCTCATCAGCAGATATTTTCTCCTTGTGGTGAGATTGTTGACTTGC GCATAATGAAGGATCAGAATGGCGTTTCCAAGGTCTGGTTCTATCGCAAC ACTTAGATCGTTGCAATATATGTTTAAATCCTTCAGACATGTGATATACT ATCGAGTAACTTTATCATGAAATTGTATCAACATTAGTTTTCCTGAACTT CCTCAGGGATTTGGGTTTGTGCGATTTGCTGAAAGGGAATGTGCTCATAT TGCTAAAAGGCAAAAGAATGGCATTGAGGTAACGACGCAATCTTCTTTCT CAATGTTGCCCAAATTTCCATATAAGACATCATATATGTACACATGTTTC AAAACTTTCTAATCCCGTATTTCATTAGATCTCAAGTAGGACCTGGGAAG TAATCAACCCTTGTCTTCACTGTAGAGTACATTTTCAATGATATGTACTA TAAAAATACAAACTGGACATGATTGTTAATAAATTGGTGACATGCATCAA CCTGCTTCTTACTGTGGATTAAATTGCAAGGTCTAGAGGTTAATCAAGAT AAATTTCTTCAATTACATGACTAAGGAAAATTAAAGCCAGTTATATCCAC TTCTGCCTATCAGTTTTATAGTTTTTCATGCATTACTAGTTCTTAACATC TCTTTTGGTCATTATTTGTGTTATAATAAGCTGCGTATATACCTATCTGC GTCATTTTTTTTCCTTCAACAACTAGTTTCTCCATATCTCTATGTTGACA CAAGTTTGCCCTTTTTATTGCATCCTTTGTAGATTTAGTGTTGATAGCGA TGCTAGCTTTATTACATCTCATATATTTATCTTGACATGCATAATACATC TGCTGTTTGTTCTCGACCAGCTTCAAGGAAAGAGACTCGCTGTTGATCTT TCCTTGGATCAAGATACTCTCTTCTTTGGAAATCTTTGCAAAGGTAAACT TCACCCATGATGAACCTTGATAATCGGAATGCAGAAACTGTGTACGTAAG CAAAAATCAAGAAAAAATCACATGCCATCACAGTTGATGAAATTGAATTT TCAATATCAATTACCATGGACTTTCACGTTGATACCTCTTTAAGCGTAGT GTATGACCTATGTGACTTCTGTATTGGCTGTTTTCGTCATAATTTTTCTC GTTCACATTTTGTTTCCTTGGTTTGTCATATAACTATTTGTTGAAGCAAA ACTGGTAGGAGACATGTTTTTTTTAAGGAGGAAAAATGTTGTTTTTATCC TCAACATTACATGAATGTATCTTGAGCTTCATCCCTGCACTCCTAAACCA CCCAAAGCTGGTCACTACTATCAGTACCATGCAATTTTCATCCCTCAACC GTTTCAGAAAAAAATCCCACGGAGAAGTTGCCCATTCGTAAGCGGTTTTG AATAATGTGGCGCCGGCGTGTAAATCACATCAACACATGTCTACCATGTC ACAAGTTTTCTTTGTGATACATTGATATAATCCACCAATTTATTAGATAA TCTGATCACTGAAATAACTAAAAATGTGGAAAATCAGAAACTTCTGAAGA TCACAGATTCAACTTAAATAAAAATCAAATTTCCTATTTCCAGTGACTTT TTGTATCATTTTTGAATTGTTTTGTTTATGGAAGTTTTTACTAAAATATA ATTCATGCAAATTCCCTAGAAAATTCATTGTTTATTTTTTCTAAACTTCC TAAATTTGTCTAGTAAATTTGTTGTTGCTTTTATGAGAATTGTTGATGTG GCGGATACATGATGGTATTGTGGCTGACACATGTACTCGATACGTCATTC AGAACGGCTTTGGAATGGACAAAACCGCTTTGAGAGATGAAAATGGTATT GATACTTGTGAAACCAACTTTGAGTGGTTGTAGAGTATACGGATGAAAGC TATACTCAGACAATAGCCGAGGGAGGAAACACACATTCTCCAAAGGAAAA TAGTATGGTGTACATATATATGATTTATGTACAAAGGATTTGAGGCGTCA AAACCTACTCTCCTGAGGTCATAGACTCAAGGTGCCAGTCACCTGCTGAG GTCCATGCTTGCACCTTGTCCTTTATTTTGTGGAAGAGCTGGGTTATATG GGAAATAACCAACACAGGCAGGCCCATTCGCGCAAGCTATATAAGATCCT AAAAGTACCAATATCTCTTGGATCAGAGAGAATTAGTACCAAGTCTTGAT TCTTAGTCGATTGGTAGTTATTTTTACTAGGATTCGAACTAGTAAACTCT CTACAGTCAGACTCTACTTATGATTATGAAGCGAGGCAAACTAGGAGACC AAGCTATCAATAAGTAATTCTTAGCAGTAATCCCTTCTCTCTATCCTAAC CCCATTACCTACCTCTGCACAAAAGCCAATAAAACAGCACCAACCGGCAG ATGGTTCCATGGCTGGAGAGCAGCTCCTGGCATGGATCAACGTTAGATCC TTTGTATCTAATAAGCTGGGAGTCTGGGACAGCATTGTAAAGTAACTTAA GATTATCATGATGGTGTATTGGTATCTGTTACCACTTAGCAGACACATGG TTTCACATGCACATCATCATATGGTTTCTGTTTTCATCTATATGCTGTAG TTCAATCTATACTAGTTTTGGTTTGATCAAATGGAGGCAGGAAATACTTA CAGAAAAAATAGATCAACAAACTGCAGGAGAGTTGTTGCCACGTTGAATT GAGAATCATTGCCAAGTCGCATCGACATTAATACTGGTATTAATTATCAG CAACTGTGTTGTTGAGGGCACTAAGTAGACAATATTATATCGTTTCAGCT TATTTTATCCCTCTTGTTTTAATTTCAACGTCAATGAGCCTGAACACTGA GGGACTTTTAGCATGTTTTGTTGTTGTTGCAATTTTAATGTCTTTGATCC CATATGCAACACTAAGGTTTTGTTTGTTTGTGCGTGCTTGTGTGGGTGCA CGTGCCTCTTCGTACGCTCTTACCGTACTGTGTGGTCCAACATAACACAA GTTCCATTATTAAATCTGAAATGCAACCTCTTATTAGACATTTCCATGGC GAGAACTGAGAAGCAGTGCCAAAAAGAAAGGAAAACAGTCGTGGTTGCCT CTACAAATTTAGCCTGTTCTTAATATACGAACTTGCATGAACTGATACCC TTTGTCTCTTCGGCATTTTACCTTTATCCGTTTGACTTTTCCAGTAATAT GCACAATGCACATTATGTATTTGAAAGGCCTCAATAACTTCTTTAATTGT GGATAACATAATATTCTGGTTGTGGGTTTCCTAACAATTTTAGATGTCTC TGACAAAATTTTAATTTGTACCGCGAATTTTTGTTCTTAACATAGTATCA TGTTATAAATATTAGTTTTGAGAACCTATGAAAAAAGCACATGTATATTA TCATCCAAATTCTTATCACTGTGCTATCTTATTATTGTTCAGAATGGAGT GTCGAAGAATTTGAAGAATTGATTTATAAGGTAGGACCTTGACCGTTTAT AGGCTATCAAACATATTTTTTTTCCATTTTCCATAAAACAGTGTCCATTT TTTATCTACAGACATTCAAAGATGTCATATCGGTTGACCTTGCAACAGCT TCAAATCTTGATTCTTCAACAAGCAAAAGGCGTCTAAATCGAGGCTTTGC GTTTGTGCGATTTTCTTCTCATGGAGTAAGTCTTTATTCTCTATGCTGTG CTAGGAAATTCGTTTCCTGTTAACAGCATCATGTAATGCATTCTATTACG AAAGTCATGACCTGATAATTTTGTTTTATCATACATGGCCTATCTTAAAA TTGCTAGAGTTTTCCTTAGCTTTGAGCGCTGCTGCTGTTTAGTATCAATT ATAATCATAACTATTTAAAGGTGCATATAAACGAGCTAGTTGTCATACCT TATTGCCTTGAGAATATCTGTAATTGTTATATCTTTCTGAGTTCCTAGTT CACCTATAGTTGACCATAGCCTTGTCGCATGATTTATCTTGCAGGTCTTG ACCAACATTATTGCCTCTTATTTTAAAACAATCTTATTGGATCAAACCAT CATATGTATATATCTGTATATGTATCTAGCTTCTATGAATCTCCTGTTTA TCTGTTGCTGCTCTCGGATGAATGATTCTGCACTTTATTGGTTGCCATAA ATCGATCTAATAGCAAAAGTTCATCTGGTATTCCATCCTTACATGCTTAA GTAATGGCACATCCTTAGGGCTGCTGTCTCAAGTCAGGAAGCTAGACTAT GAATTGACAGTTTGACACCAAGTAACCAACATACCTTGTGTTATGTTGAC AAGCAGCCCAGCTCTTGGACTCATATACTCGTTTTGGTTATGAACTTTTA TAGTAACAAATTTTATCATCCTTTTCTCTTATATGACTGATTTATTGCAA AGGAAAATCTTCAGCGATCACCTATTTTCTTATGAAAATGTCCCCATTGC ATTGCGGATCTGCAGAAGATATCAAAACCAACACAAATGATTTTATACTT CTGAGGGAGTTGCCCATATTTACTGTCTCCTACAAACCCTTATTGATCTT GTAAAGAAATAGCAGAACTGGTGGTATATCGTTTGCCATGATTTCTGCTG TAGTATATGTGGATTGACCAATCTTCTCCACCACTTTGGACTTCTGGTTC TACTGGTTGGTGCATGAAACTTAATATGGTACAAGAGCAGAGGTCTTGGG TTCAAATCTCGGCTTTCACAGCTTAGAAAGAAAAGTTGCTTGCCCACTTT CTGTCCATGCTTAGGCCTTATCGAGCCACCCCTGAGAGGATGTGGATTGC CCAACCTTCTTCATCGGTTCGGATTTTTGGTTCTACTGTTTGGTGCATGA AACTTAACAGTTTTGACTTCATATGTACCTTAAATCTTCAATTACACTTC CAATCTTCACAAGAACTTCCGTCCATCGCACAAGTTCATTTGCAGAGTGC AGGATAAAGATATAGCAAACATGTGGTTTATGTTAATCCCTAATCCTCTC TGATTAAATAGATGAACTACTGCGTCGATTGCAATGTCTGACGAAACATT GCATGGGAGGATGGTATTAATGAGATATACACCAAAAGAATAATTGTATA CCTTTGGTTAAGGTTGCCGAGTGCAGCACTCTTGTATTGGGTCTCACTAG TAATTAGCAACATGGGATCATCAATCCATGGAGTTTCAATCACCTTGATA ACTGGAATGACAAAAGGTCCATCAGTTCGTCTTCCCCTTGTACCCATCAA TGACTGAACTGAATCATCTACCTATTCTTAGCTATATTCTGTCCCTACTT CTGTCACATACTACTCCTATTCTTGTCTTACCGTTCAGATTTGTCATGTG TACTTCACTTGGTTTCACCACAAACATTAAAGCCAGTAAGCCACTCAACT CCATTTTCGTATTTTGGTTCTTCATTTTCTTCAGAGATCAAGGTTGTCTT TTTGATAGCATACGCAGTTCATGGCACTTTTCCAGTACCCGCTAAATGTT GTACTCTGCCCTTGTTGCTATTTATTTTTTCTCACCCTTTCTCTAGAAAC TGTGAGGACATGTGCAAAAACACAAAGTGACTGATAGGTAGTACATCTCT AATGTAACCCGAGTTTTAGCATCAGAACAACGAGAGTAAGTGTGTAGGAA TAAGGAATTGGAATATGGGAATCATCATTTTATCTCATCTGTGCAAGTGA CGTTGAATCGTGCACACTCCTTGTATTCCAGAAACTGCTGTCTCCTCTCC TTCAATCTCTCTCATAAATTAGACAAACAGATACTTGTGAATGCCAGCGC CTTATGTTTGGGGAAGGCTGTGACAAGCTGATCCATGATTAACTTTTCCT TAGCTTCATTTCTGCATAACTATTGTGCTCAAATCTTAAGCTGCCATTGT ACGACATCTTCTGGAATCTCACTTCTGACATTGATCATAGCTTCCAATTA TGAAGGACACATGTTTATCAACATAGTATGCTGGTTCGTCACTGAATACT GATCTGAGGTTATGCTACTGATTCGTGTGCAAAAAGGAAATATCTATATC ATCATGGAGATGCTCTTTAGTCCATGATATCTGATCAGATCATCTCCCTT TGATTCTTTTCATCCTAAAACTATCAATCACAGGCTGCCGCACGTGTACT CCGCATTGGTTCCAGAACAGATTTTCTGCTTGGTGGTATTTTGCATCCTG CAATAAATTGGGCTGAGAGAGAATCTAATGTGGATGCTGATGAAATGGCC AAGGTTATTTCAGTGCCAAACATTTCTTCTTTATTTAAGTATAGCTATAT TCTGTTTTGATTGTGTTCTCTATGCTTCTTATACCCAGATTAAGACTGCT TTTGTTGGTAATCTGCCAGCAAATGTTAATGAGGACTATCTGAAAAAGCT TTTTGGGCGTTTTGGAGAGGTCTGTCAACTAACATGGCTACACTTGTTTG TATTTACCAATTTATTTGTGTGCGATGTTAAGCCTAAAGTGATGTGTAAT GGCTAATCAGGTAATGCGAGTTGCGGTCTCAAGAAAAGGACAATACCCAG TTGGATTCATTCACTTCGGCAGTCGTTCAGTAAGTAATTTTGTCAATTCT GATATCTTTTTAAGTTGTATACCTCAAGTTCTATCCAAGTAATTCACACT AATTCTTAATCTACCGCAGGAGCTTGACAATGCAATAAAAGAAATGGATG GTAAAACAGTAATCGGACCTGACCGAGGACCATCTTTCAAGATCCAGGCA TGAATAAGAATATAGCTTCTTTGGGGCTAATCCTAGCTTCTTGCTTCTTA ATTTGATTAGCCTAATTTGGCTTTTGGTGCTGCTTATCGCAATAGGTTAC AGTTGCTCGACCTGTAGTGGAGAACGATAAGAAGAGAGGTCGCGAAGAGG TGAAAACTAGAAGGTCAAATGTATCAAGAGACAAGTCAGATTATTCTCAG GGAAGATATGGACATGATTCACTTGATCGTCAAACGAGAGCTCCAAGGCT ATCGAACGTGGTATGAGTGATAAACACCGAACATATGATCAGTTTGTTCT TTCCATTTCATATGCATTAAAGCCAAAAACTTGGGTTTCAAGGAAATATA TAATCTCATTAAACTTTGAACTACTTCTTTAATAATTTGTGGTTTTGCAC AACTGAGCTAGGCATTCACTTGCTAAAGTTTCAGCTCACTGCTATATCTG TCAAGTTGTCACAAGATCCACCTGTAAGAGCATCTCTAACAGATCCCTCA AAAACCGGTACTGGAAAAGTGTTTTGCAGTGCACTGGAAAACAGTATAGG GTATGAAATTTTGCCTTCCCGTAACAAAAGCCCTCAAATTCATGTGGGAC CCACAAACAACCTTTTTTTTTCCTTTTTCTTTTTTTCTCCCTTTCCCCAT TCTTCTTCATCCTCCTGTAGGTCCCGATTCCCCCATCAATACCCTGCCCC GACCTCAATCCATAGCTCCCGGCCACCGGCGCCAGCCCCCAGCCGCTCCC TCCCTTCTCCCTCTGCACCATGGCTCCTTGGTCCAAAACAGGCTATATGG CGTTTGCGGGGGTTGATATCGGGGGACCCTGAAAACTTTTCCGGTCTTTT TTCTGGGATCTGCTAGAGATGCTCCAAGACTTGATATTGTGCCAATAGGT CCAATCCTTTGGCTGATGCACACAGTGCAGTTGCTTCAAAACTGAAGTGG CCATTAACCTGCTAGCTCTGGGTGCTCTGATAGTGGGATCAGATGGTTGT TGTCTCTAAACACCTATCTTATTATCTTTCCGTACTAATAAAAAATATTA AGTGTTAATATTTGACATCAATGCTTGCAGCTCGGTTTGTAGGAATTGTG TGAGTTGAGTAAAATGCATACTCCACTAATGGAAAGTGTGGTATGTTCAA TAACATAGCAAATCTTTTTGCATTTTATCTCTTAGGTGTCTGATGTCACC GACCCCTATGAAGCAGCTGTTAATTCACTACCTTCTGCTGTCAAGGAACT CTTACTTCGTATTTTGCGTCTTGGAATTGGCACTTCATACGACGTAAGTG ATTTTTATAGAAATATTCCTGTTTATATTTGTTTTTTTTGTATCGAACAT CATGGTCCTGTCAATTTTTCTTCTCAGATTGACATCCATTGCATAAAGAG CCTCAGTGAGCTTCCTGAGTCAGGTGCTGTTGCCGTTCTTAATCAGGTGC GCAATTGTTTCACGTCGATGATCTGAGCTCTTACCTGAACTTTCTTTTTC GAAAAGCCTCTTACCTTGACCTAAAAAATGGCTTATTCTGATCAATTCTT CATGCAGTTTTTGATAACAGGTGCTGATAAACGAAATAAAGGAGAATATT TCGCTTCATTAATTGCTAAGGTTGTTACTTCTTTTATTCAATATCTTCCC TTATTCTTTTGTGCTGTATTTTTTTTTGGGAACAACGATGCCTTATAACT TCTGGATTTTTGACTTGCAGCGCAAGGTTGAGGCTTTTGGCGCAGCGCAA ATATTGCAGGATACTACTTATTTGCCCAGAAATTCTGAAATACAAACCAA GAGATACCGACATCAAGATTATGATTACCCGGAATCTGGGTAAGGCACCC TCAAGGAAAATGAACAAAATGACATTGGCATGATCCTTTTTCTTTTATCT ATATATGAGCTTTGTAGCTTTTATGATTGCATCCTTGTACTGGAATGCTA TTGTAAATCTATCATGTGAATATGTAATCACTGGGATCCATCTTATTTGC AGGAGCCGTAGATACAACACCCTAGGTGATTATTCTTCCTCGTCTTATGT TGACGATCCAATAGTGTCTCAATCAAGAAGGTATGGTGAAGAAAGACCAG CTGTTGTAAGATACCCAGAGCCTAGACTGCGGCAAGAAGAAATATCGCAT GAACCAAGACATAATACTGGAAGGCATCTAGATCGAAGATACACACAAGA ACAGAGCTACAGTGAAAGATCGGCGCATGATCCCAGGCAGGACACTGGAA GGCATCTAGATCGTAGATACATACATGAACCGAGCTATGTTGAAAGATCA GCACATGAACCGAGAAAGGACACTGGGAGGCATCTAGAGCGTAGGTACAC ACAAGATCAGGGTTACATCGAAAGACCAGCCGAAGAAGCTGTTTTCCCAA GGGAAAGAAGACTGTTATCTGCTGCAGGGTACACCACAAACACTGGCCCG GAATTCAACTCCAGGTCATCCGCTGAATATTCTGCTGAACAGCAGCAAAT GAGGTTTGATCCCTTCACAGGGGAGCCTTACAAGTTTGATCCCTTCACTG GGGAGCCTATCAGGCCAGGAGCAAGCCTGCGCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.