Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA046648

[Submit comment/correction]

Sequence	AA046648
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA046648
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAATCCTCCTACATGTGGGTTGCGTGTTAATATAGTCAAAAAAAAGT TGGGCCGTATACATACACAACTTGTACGTACCCACTTACATATGAAATAC ACATGATTTCATATAGCGTCTTATTACATTGTCTAACACCTCCAACCAGT CTTGCGTTCCTCTCGCCGCCGGCTGCCGTCGCCATGGACGGCCATCGGTA CCGTGAATGCCGTCGCCAGAGCGCTGCCGCACGCCGCGCCAGGGATGTCG TCTGTAGCCTTGATCAAGCCCATGACCCCGTCAACGAGGGGGAAGTGGTG TACGCCGCCGCCGAAGCTCCCCGCCGCGTCAGGGATGTCGTCCGTAGCCT TGATCTAGCCCATGACCCCGTCAACGAGGGGGAAGTGGTGTACGGCGCCG CCGCCGAAGCTCCCCGCCCTGTCGGGGATGTCGTCCGTAGCCTCGATCTA GCCCATGACCCCGTCAACGAGGGGGAAGTGGTGTACGGCGAGCACGGCGA GCTAGTCCGCGGGCGCAGACGGGGTCGGCGCATGCGACGCAATCCCAACT CCGAATCGTCTTCTTCCACTGTAACCGGGTGAGCTAAAAAAAATCTCTTC CCATCTGTACATCCGCTAAAAAATCTCTTTAGCCCCCCACCCCCCAAATG AAACTTTGATGGAAACTGCGAGTAGAACCACAGATTAAACATCTCGTTAG GCCCTAAAGAATGAAATTTTGATGGAAATTGCGAGTATAGAAGCATAGAT TGCAGGCGTTTTTGTACTGACGGAACTAGTTCAAACAATAGGGATGTAGT TCAAGCTTCCTTCTGATAATTGCTAGCACTATGAATTAATTAATGTCCAA TCTGTCGTATTAGGGATCCTATTACTGAATTTACTCTACTTGTCAAATCT CTTTGTGACCCAAACCAAATTTTCTTTCACCACCTAAACTAGGTTAGCTC CTTCAAAATTGTCATGTGTACGTTTTGATATAATGGCCACTCATGTCATG AGCAACCACTTGTTTATATTAGGGATAGCACCTAAACCATTGTACCGTGT AAAAAGTTATCGATTCCATTTGAGACCATTGGCATTCCAAAAAAAAGAGG GAGCTCGCAACTTTGCACTTTCTGTATCTGAACAAGCCATCAATGGCGTC AAGGAATACATACATAAAAAAAATGCTATAATCAACTCAAAGGATGAATG TGCAGTCAATTATTACATGGTAACTGTACCATACTTAGTATCCCTAGGTT TATAGATCAAAATGTTTTAATTGTAGCAGATAATTAACATTTTACCTCTA ACCTTGAGATATCATATTTAGGTTCCTTAAGATACGAGTTGACTTCTGAT CATAAACAAGCATGCACGAATGCGTATTACTATACTGATTATTCTGTATA CTTGAGTAGAACAGCTCAAAGTTAATTTCCCTTCTTCCTAGCCAAACAAG TATGTGCGCATATGCCATAACGTTGAAACTCAGACATCAACTGAAAATGA TACGAATCATAAAAAAAACGATCCAGCTAATTTTTAAATTGAATTAAGGA ATGCACTTGTTAGTTACTTGGTGGAGGAAGGAAATTTGAAAATTATTGTT TAGTGGAAATTTGACCGTCTTTTTAAGTCATGGTTCTTTATACCTACTTG AATTGCTGCAAGTTACAACCTCTGAGTTCAACCAGCACTGCATCATCTAA TAGCAGTGTGTTCACCAATTCAAGCATAAGGCTTAAAGAGTGTTGCATGT ACGGAGTAGTATATAATTGTGTTAACTGCATTCTGATGGGTACAAGTTTG CCAATTCCAGCCATCGTGGGGGATATTTTCACTTCTATCAATTATATATG CTAGCTCTGCTGCAAAACAATTAAAGATAATAGGGTCTGTTGTCACTGGT AAAACCTCAGTGCAGCTCGAAAGGATTGTAGTTGTTCTTTTTGAAAAAGG AAAAAGAGGACCGAATATTTTAGTGTAAAGTGTAAACAGTTCAATTTTAG GATGGAATCAGCCATTACTTCTCAAGCCAATAGAGCTAGTGGAAGACAAG AAGTACTCATGCAATGCAGTGGAAAACGGAAGGTTCAGAGAATTGGATCT AAATTAGAATGGTGTGACCAAAACCATGAACTATACCTCTTAAATAGCAC CAGTGGGCTCACCTGCTGCACCCTTTCTTAATTTCCATGAGATTAGCTAG GATTAAGGTCAAACAGACTTGCATTTGATTAGTGTATTGATCTCCTACAA TACCATGCAAGTAGTCCAGTAATAAGGGGAGATTTTGGATCTATGATATA CATAGCCCACTTCTAAATGATAGATCTATCTAGAAATTCTCTGTTTCTTG AACAAGGACATGCTTTTGCTAGATGTATCTCTTAGACTCTCACTGCTATG TGGAGCAGAATGTTGGCCCACTAAAAGATAACACATCCAACAAATGAGTG TTACAGAGATATAGGCATGCTACAGTGGATATGTGGCCATACAAAAAAGG ACTAATTATTATTTTTTGAACATAGAAGGGTCCCGAAGGACCCGACCCTG CATTAATATGGAAATAGTAGTACACAGAGGATTAAATTGGGATCCATAAC ATAAAAGAAAATACAAACAGGTCCCTGAACATTTGCAAGAAGGACCTCAA ACACACTATGAAACGTGATCAGGTCCCTAGAAACACGGGGGGTCCACCTT GCCGTCGCCAGGGGCGAGGCCACTTGGGGTGACGAGGCTGTCATGGGGCG CGACCTCTGCTTCCAAGCAGAGTGGCCTCCACAACGGCAAAGTGCCAGGA TGTTGAAGATGGTGGTCAGTCCAAACCGGCCACCTTCGGCCAGAAGAGTC ACCAAAGTGGCAGAGACCACCCTTCCATCGCTGCGAAGAAGATCTCCTGG CGAGAGGCGTCGCTCTGCATCCAACTCTAGTGAGGATGAGCTTGATGAAG ACAGCCCTTTGGCCAGCAGATTGAGTGTTCTCTTGGAGAACACCGGCCAG CAACCGACGTGGGTGGCCAGCACTCCCCGAAAGGACCCGAAACTGAAGCA CCAAATCGATCTGGAGTAGAAGAAATCTCCAGAGAAATCTTCCAGATCGG GGACTAGACCGAGCTTATCCGAGGAGATCCGACGGCTTGCCGCTGCTGTG GACATGGCACGCCAGCCACAGCAAGAACAATGCCGCGAACGCCGTTGCCC GCTACTTGATTTCGGTGACGACACACTCCATACCAGCACAAGGCCGAACA CCAGAAAACCTAAACCTAATCTAGCAACACTGACGGAGAAGTTTTGGACT TTGGGCCGGAGAGGAGAAAGCTCTCACGATTCTCAAGGCTCTCGAAGGGG AAAAAAGGACTGAATTAGAATGAGGTAAACGTGATAGGGTAGGGGTGGCA CTGATTGAAGAGAAGCTTGTCCAACACCGACTAAGGTGGTTTTGGCATAT CTAGCGGAGGCCTCCAGAAGCACAAGTTAATAGTGGAATTATGAAGGGTA GGGAAAATACTAGGAAGGGCATGGGGAAACCAAAGTTGACATGGGAGGAG GCGGTAAAAATGGAATTGAAGCATTGAATGTACTTGGCTCTTGATAGTAA TGCATAGAAATCAGCAATCGATGTGCCAGAATCTTAATTTACTCTCTTGT ACTTTGTTTACTTCTTTTCTCTCCCTTTCACTTTTGTTTATGTTGTGTTG TTGGCTCTTAGACACTGTACATTTTGATAATTTATACATCCATTTTTGAT GATTCTGAGTAATCCTTTTTGTCTTGTGGAGTATGAAATCCAGTTTGAGA ATGAGAACTATATGGTGGATTGTTCTTAATTTGGTTCAAGCTGGTCTGCA GTAGCTACATCTACTTTCTTCCAGAGTTGTGCATAATACACAATGAATAA CACCAGTGGTGGAGCCAGCTCCCGACGACCCTGGGCAGCTGCCCGGGCTC ATCTGCTGAGCGCCCACTGAGAAACACTAGGTATTTAGAGATCGAAGCTA GCTTGTGTTGGGCAAAAGTTCAGGCCTGTGGACGTAAGCAAGTCTCGCCC GGTCTCTGATGAGCGGCTGGCTCCGCCACTGAATTACACCTTACCAGCTT CTAATAGATAGATCCTCTGCCAATTGAGTTTGATCTGGCTTTGCAACCAG ATGCAGTGCTAAGTTTCGAAGGAATTCTGAACTTCCAGTCATCCTGCATT CCTGCATCGATCACCGCACCAGAAATTAATATCCGACAAAGTTTCTTGTG AAATAACTTTCTTCTTCTGCAATTCCTACTTCACCGCATCACTACTGTCG TTCAACTCTACTTGTGTATAATTCAGAAGCTCTCTATTCATCTCTGCTTC TAATTTTTTTCTCAAAATGTCAGAAAGCTGATCCTCTGTCCAGACATGCT GCACTAAGACATCCTGAGTAAAACATGGAGTTAACTTCCCTAGTTCTCTT CCTGGATTATAGTACTGGCTTCCAATACTTACGCCACAACATCAAGGGAC AATCATTTACTCAGGATGCCTCTACTTGTGTATAATTCAGAAGCTTTGTA TTCACCTCTTCAGTATCATTGGTTTTTGGAATTACTGTGACCACAACGTA GTTCATCTTATCCAAGTACAACTCTTCTTTGTGGAGTGGGTCTGGCATCT CTTCGCTAATAGCTTGAGCGGATATGTGGCATATTCATAGAAACATTAGG ACGGCCCGAACGACATGTTAGCATGATTTTTCTGTTTGTTAACCCCCTGT TGCATGTCGTTTCTAATTTGCAAGCCTTTAATGCATTAATATAGGAAGAA GCCTCAAGCACTGAAATTTTACATGTAATTAACTACATATGGATCAAATA ATCAGAAATGGAAACAGACCCACACCACAAAATGCATACGTTGTGGAATA AACTGTTGTAATTTGATCAACTTTTATTCCAATGTATTTAATTAAATACA AACCCATGAAAGCACAGAATAATGCTCTAGGTTGTAATTTGTGATACTGC CAACACATAAGTGGCCCAACAGCTGGCCTTTCATTTCCAGCAACCACGGT TTGTTTTGTTAAACAGATATATCTTCACTTGCTCAATACACGTAACAAAG ATTCATCATGCATAGCATAACCTGGGTGTATTGTTATCTTTGCTACTGAA AAATGATTTATTTCGAAATGCACTTGATGCCTTGAGAAGGAGGAAAGTCT TTGTCTTGTTTCTGTTAGTAAGTTGTAACTTCAAATCTTCCAACCTCAGG AGGTCAGCTGGAAATCCAGGAGCTGGAACCGCAATTCATGTTCGACAGAG TGTTCTGTATTCAAATCGACCAAGGGTATCTGGAAGCAGAGGAGGACGAG AACTATCACCAAACAAGCTACTGTAAGTGTATTTAGTTATTTCAGGTGTT GTATGTTTGCCTATTCCATCTGAAGTTCAAGTTAGATGTTTTTGCTTGTT ATTTAGACGACCTAAATTCTGGTACTTGCAGAAAAAATAGTATGGTCCTA AATTTCTGATACTTGCATTTGCACTGACTAACAGCATGTTCTGATCAGGG CTGAGGCTAGGGATGTTAGCAGCAGCGAGGGCCCTATAATTACAGATCTG TCAGAATTCAATGCGCTATCACTGAATGACATGCCTCCTAAACTTCGGTC ACCCTATTGGTATGACCATAACTACTTCTGTATTAACACGGATATTATTA TGACCCATAGTACTCTTTGATATGTTTCGCGCATCATTGGGTTTGTTTAA TTCATCAACTTATAAAAGTAGTTGAAGATTATTTATGTCAAATTGAATGC TAGCTAGCTAAGCATGCATTAGAATAACCACTTGTGTGGATATTTGTTGC TGTAGGTCCAATTTGCCTTATGATACTGACAGCAGCGACCCTGGGTCTGA AATTGTGGAGGACAACCCCAGTGAAGAGTCAGATTTTGATTTGTACGTAT GATTTTTCTGCTTGTTATTATTGAGCTGTATTTTGTTCTGTTAAGTCTCA GATGCATTAGTATCACAAGAAATCTAAAAGCACTAAACTTAACTACCTGT TTATACATGAATCAAATGGCAAAAAAAAGTAGCAGAATGAAAACTGCATG CCATTAACCATTTGGATTTATGGGTTAGTGCTATCATTATGTAGCTAGTG AGATATAGACCCATAAAGCACAAAGTAATGATCTAGTAGGTCGTAACACC ACCAGCAAACAAGCAGCCAAACAAGTGCTTCTGTTCATCTACAGTAATTT TGCTCTATTTTGCTCTAGAGGGGTAAATTCAGTAGCTTAGTACCAGGTCG ACCTCTGATTTATTGCTTATTTTTATCTTGTTGGCCTCTTTTTGTTCTTT AGGGAGAAGGAGCTGCAAGAATGGAGGGAGTACTGTAAAGAGAATACGAG CGATACTATAAGCGAAGGGATGGACAAGATTTTAGCTGTTGAGCGTGCAA CTCTTGCTGCTGAGTTTGATAAGATGTCGGCTGCTGAGCATGCTGACATG ACTGCTCGATCTTCCTACTTTAGTCCAGCTGCTTCAGATGCCCAGTCACT TGAGGCAACAGAACAGACTTCAAGTGCTGAACCATCGTGGCAGCGTCTGC CACGTCGACAACCACGGTAAACCATCCTTTGTCTTGCTAATATTCCTCGT CGGTTTAGTTTTTCTCCAAGCATTATCATTTTGTACCATTGAAAATTTAT GAATATGGTATAGTATATATTTTCTTTGTACATCATGAGAAATTTAGCTT GTATGGTCATACACATACACAAGATGGAAAAGCAAGGTTTCCTTTCAGTG ATTTAATGTTCAGGTTTACATAGAATAAAAGTCTAAAGCTCCTAAACCCT GGAGCTGCAGATTCATAGCACTAAACTTGTATAAGTGGGTTATTGGAAAC TCACCACATGATGCTTGGTCTGATTGTCAACTGGCTGACTGCTGAGATTG CCCATTGACCACTGCCAGCAATTACCTCCTCGTACAATAAATTGTCATGT ATGCTGCACATTATATTATAATATCTTACCTTTGCATTTTCAGAAAAAAG TATTTACCATCTATATTTCGTAAGTATCGATAACATTCACGCATGCATGT TGATTCATTTACATATATACATCACACTGTCTTCCCCAATATTTATTTTC ATAGATGACAAGAGGGATGACAGGCCATGTTGATTGGAAAATGTAATTTT GAATTTGCTGTTCAATACAGGCGTGAAGTTTCTGAGGAAGAGATCATTCA AAATGGGAAAAACTGGATGAATAAGGAGGTGATGCTGGCATTTGATAATT ACAATAAAAGAACTGCTAATCTCAAGGTCTGTATGTACAGCATGCTTTGA ATATTTTGATTGTTAAAACTGCAAGAAAGTGACCAAGGAAATCGTACTAA CAAGGGTGTTTATCTCATTTTAGGGACTTGACTGCCAGTTGGAGGAACTA TGCCACCAATGCTTTAATGTGGAAAATTATAACAAAAATTTCCACCACTA CAACTTCTCCGTGAAGATTACGGACCTTAGTTCAAGTGATTCGAGAGTAG CATTGTTCTTCGCCGAAGTAAAAGAGATATTCGGAAAAGCAAACTACTTT TGCTGTCCTCTGGAAAGACATGAAAATGGTACTAATCCTCATCTTTCATG ATGGAATAGGGAATTAGTTATGCCAATACTGTTGTTTTCTGATAACAGCT GGCTGTGTTGATTTATTTCAGGTCAGTGTCATGCTTGCCATAACCAAGGA ATGGATGATCTGCAGCATCCAGCTACAGGTGGATATGACCGGGGTTCGAC GGATACTGTATTCCCTTTCATGTATATGGACGAGTGTGAAAGTTGTTGAA CCAGATGGATTCAGACTTATGCTTGATTGTTCTGAACGTAAGCGTCTGAG ACACCTGATACCGTAATCACTAATTCAGCTGTTGAATAGTGATCTTCTGT TAGGGGCCTGTGATACTGAGATTCTGTGTGCTCGTATTGTTTCTGCACTG AAGCCACATCTGTTGTCTGCAAATTTGCGTGCAAAAAATGGTGCTGGCGG CAGACAGCTATGCAATGATTCGGCAAGTTCAATCCTAAGATTTTCAGGCG AGCTGTTCAGCAGCTATGTGCATCGGGGTTAACGCAAAATGGAGTTGTGC CTTTTTGTTCTTTTGTGGAAAAGGCAAAAATGTGGTTGTCATCATGCTGA TA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.