Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046110

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046110
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046110
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTTTCCTTTTCTGCGGTGATCGCCGCCGGATTTACGGTCGGGGTCAC
GTGAAGATCACCTTCCAGTCCGCCACCATTACCTTCCAAAAACGGCGCGG
CGCAGGCAGGGAGGGAGGGGTGTAACTGCAAAGCCCCCGTCGTCTCCGTC
ACGTTGTTAATTCGAATAAACTACACGGGGTTTTAGTTCCGTTCCTTCCA
GTGACATACTAATAATAATCGTTTTTGTTGCAATAAACTCCCTCTTGTCC
CTTTCCAACGCCCCCTCTCCCCCCTCCTTTCTCCCCTACTCCGTTTCGCT
TTCCCGGAGGGAGGAGGCTCCCATCGCTGTCGCAGCTGCTGCCGCTCCTC
GGAACTGTTTCTCTTCGAAGAACGATTTCAAACCGAACCCCGGCCGCTGC
GCTCGCGTGGCCGCCCAGCGCCGCCCGATTTTCGGCTCCGGAGTAAGTAG
GCAGTTTTCTACCCCCGCCGGTTCGGCTCCCGAATTCCAAATCCCCGTGC
TCGCATCTGCATTTTTTCGAGGAATTTTTTCTGCCCGGATTTTCGGGCCT
GCTGCATTTGGTGTGGCAGACTCTAATCGGTTGGTTTTGCGCCGGATTCG
CGCGTTGCAGAGCTGGGATTTGCATGCCATCCATGATGTTCACCGAGGGC
CTGGATCGAGACGCGCTCAAGTGGGTGCGGGAGGTGAGTGAACCCCTCGC
CGCCGCCGCGCTTCTTAACTGAACTCAACCCTAGCTGCTGGGATGCGGTG
TTCCCCCGTCCGCCTCTGACTGACGCGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTG
GTTTGCGCGAATGTGGCAGGGACACGGCGCGGGCGCGCTGCACAGCCACG
ACCGGATGGACGCGCTCCGGGCCGTGCGCGGCGCGGGCGCGGGCGGCCTC
GGCATGCCGCCGCCGGAGAAGTTCAGGAGCGGGCACCTGCCCCGCGCGTC
CGTGCCCGCCAGCGCGCTGCGCACCAGCGCCTCGTCGGCGTCGGACATGG
ACGAGTCCTCGGACGCCGACGAGGAGGAGGTCGAGGTCTGCAGCGGCAGG
TACTCCGTCGACTCCTCGCCCCGCCTCCGCGACGAACTCCCCCGCCGCAC
CGCCGTGCCCCTCTACCGCTACGCCAACGTGCCGGGCCACCAGAGCTACT
ACTCCAGCGACGGGTACTCGGATCTGAGCTCCTCCAGGGACACGGCGCTG
CCAAGGGCCAAGCCGCGCCCACAGCAGCCGCAGCTGCAGCCGCGCGCTGC
TGCGTACGTGGAGGAGGAGGAGTACTCCGACTCTGCAGGCAGCTCCGAGT
TCTCGAGCCAGCCTGTGGGGCGGAGCAATGGCGTGGCCTCTAAGGGTGGC
TATGCGTCCGAGTACTCCCATACTGGCCCAGCAAGAAGAGAAGTGAGCAA
TGCGGTTCCTAAGGCTCGCGTGGCAGCTAATAAGCCTTCGAACTCGAGGA
ATTACCAGCAGGAGCACTACTCTGCCCATGTCCCTGCTCGAGACAATGTC
AAATCTTCTCCTAAAAGGGTACGTTTTTCTGTGCTTACCGTTCTCATTTT
GTTTAGCCCCTGCTTCATTCTCTGCAATATCAAATTTGATAGGACCGTGT
TCCAGTCCTTCGTTGCATATGAAACATTTTGTTTAGCCCCTGCTTCATTC
TCTGCCATATCAAATTTGATAGGACCTTTTTCCAGTCCTTCGTTGCATAT
GAAAGCTCTAACATTTTCTCTGAGATAAGCGAGCAATCAAGTTTGCGTGT
ACCATGAAGATCAGTTTGTCCGTGATAAATAGTATTCACATGTGTACTAG
GCATTAAATTTGTTCAACATAGAGATATATGATGCCACAACACTGTTCTG
CTCATTGAACAAACCTTCTCTAAGAAGATACACAAGCAGGTTCTTGGTAT
CTGCTCAACATGCTTCTGCTTTTAGTTCACTTGGATAGTGATCTGGCCAA
TCATTTTTTTCTTCCCAACTATTAGGAGAAACTCGATTTCGTTTACCGTT
ATAATCTGGAGATTCAACCTTCTCTGAAAAAGCAAGAAAATTCAGTTCTG
CAACTGCATCATAATCGTGTTGTTACTGGTTCTAATCGATGAAGTGACTT
AGGAACCAAAGGTCCTGGCCATATCAAATTAGACAGCACCATTTCTGCTC
TGTTTCACTCCTTGGTTGCATATGAAAGCATTAACATTTTCTCTGAGATA
AGCAAGCAATCATGTTTGCGGGTAACACGAGGATCAATATTTTCGTGGTA
AATAGTCTTTGCATGCGCACTAGGTATTAAAATGTTCAACATGATATTGC
AACAAATTTTCTGCTCGTTGAACAAACCTTCTCCAGATACACAAGCAGGT
TCTTGGTATCTGCTTAACATGCTTCTGCTTTTAGTTCACTGGGATAGTGA
TCTGGCCAATCATTTTGTTCTTCCCAATTATATTAGGAGAAAATCGATTC
CGTTTACCATTATAATCCGGATATTCACTTTTCTCTGAAAATTGCAAGAA
GAAATCAGTTCCTCAACTGCATCATGGTCGTATTGTTACTGGTTCTAATA
GATGATGTAACCTAGGACCCATAGTTGCTTTTTTTAAAGGGTTAGGACCC
ATAGTTGCTGTCCAAATTTGTTTTGTTTGTGAGTCATTTGGCCCAACAAG
TTGCAAGGGTCGTCTATTTCCCTGCTTTCTCAAATAGATGTGAAGTTATG
GTACCGTTATTTTATTGATGCAGAATCGGATGGGTCATGTGCAGGATGGT
TTGTCTGATGTCCCCAGTGCACCACCAATACATGATTGTAGTCAGGAAGC
TTCACCAGCTCCTCACTCTCATACCAGAACTTGTGCAAATGCAAGTGCAT
CGGATGGTTCAACTGTCAAAAAAGAGGAACACAGTGATGGTATCCTGGGA
GCTAACTTGCCCGAAAAGACTACTAGGTAGCTTTTATAATACTTGATGCT
CGATCAAACCATCATTCAGAAATTAATTGTATTTCTTCTGTTAGCATGCC
ATTCTGACTAATTGTTGTACCGTGTAGGAGCACTTTGAATGGAAGGCACA
TCAGCAGGCCATCTAGTTCAATTCCTCTTAGGGTCCCAACGTTTCATGCC
AGGTATGTAGAGTACACATTAAATACTATTTTGTTAACTATTAAATATAT
TTTTACTAATGTGTTCAATAAAAAAAGTTTGCAAGGGCCATGGTATTCTG
TGCTTGCATATGATGCTTGTGTTCGCCTATGTCTTCATGCATGGGCAAGA
GGCTGTATGGAAGCTCCAGTTTTTCTGGAAAATGAATGCACTCTGTTGAG
AGATACATTTAGGTGAGTTATGGACTTGTGGTTGAATTATTTATGCTTCA
AAAACCAAGTAACTAAAGATGTCATGAATTATTCTAGCTGCACCTTTCTT
AGTACTTTTGTTACCATCAGCAATGGTGGAAATGTTTAGTTTGAGTCCAA
CCTGTTCCGCAATTTAGCCTAACCCATCTGGGCTCTGGCCTCCATTAGGA
CACCATCTTTTGGCTAGTGTGCCTGTGGGGATCTTCACCCGTTCTTCTGG
TGGCAATAGATTCAGACATTCAGTCTGTCCTGGAAGCAAAAGCATGCTCG
AAATTATGTCAATTTGTTCCATTGAAAGCTCAGTGTCCTGGAGATGCAAA
TTGTAAAGATTAAAATACATAGAATCAGCCAAAATAGCTTCTTTCCTTGT
GAACTCCAATCATTCAACCTTTAATACATGTTCTAAACTAGGATACTGTC
ATTTTTCCAAGAATCATAGATCTCATGGGTGTCTTATTGTGGCAAATATT
ATCACACACACAAAAAAGGCCGCAAACTCACAATGCCTTCAGTTAACACA
CACTGATAATCTGGTATCTCCTACTTCAATGCTTCAAAACTTGTCAAGCT
GTTCTAAGCTGGACTGCTGGAGCAAGTATCTTTCTGTATCGTGTAAGCAT
AGCATTCATTGGTTTGAATTAGTGTAGAGTGCAAGTTACTTGTTCAGGCA
TGTCATTATACTACTTTTTTACATGTTGCAGTACAAACATAATTATACAC
CTAAGTAAGTTCATCTTGCATGTTGTCATTTAGCTTGCAAGATGTGCTGC
TGCGATCTGAAGAGGAGCTCATGACAAAACGGGCATCAGAACTAGTTACT
GAAGGCGCTGCATCAAAACCCAAGAAAACAATCGGCAAAATGAAAGTACA
AGGTACATTTCCCAAATGCATGCCAAATCTTTTGACTTTTCTACTGCTCT
CTGTGAGGACTTCTAATAGCGCGACAGATCATCTAGCTCTTCGGAGTTTC
TCTTTACATGCTCTGTAAACTACTCTGAAATTCCATGATGTTAAATGATA
ACATAATGTAATTTATTGCAGTTCGCAAAGTTCGTATGTCTGTAGACATG
CCTTCTGGTTGCAGTTTTTCATCATTACCAGTGGTGAAATTCGATTCAGT
TAGGCACCGTCTGTCCAACGTACAATCATCAATCACATCTGGGTGGGAGT
CAGTTAGGAGAGTTCAAGTATCACCGCATCTACCTCCTAATAGTTCGTTC
TCGAAGCATAGCTTAGCATACATGCAAGCAAGTGCTCAATATATAAAGCA
GGTATCTGGTCTGCTAAAAGTTGGTGTGACTACCCTGCGCAGCAGTTCAG
CAGATGAAATACAACAAGGTAAACATGCTTTATTTCTTTCCTTAACGTGC
AGCCTCTTGACCTGACCTCATCATGTTCTGTCCTCAGAGACGTATTCGTG
CAAACTGAGGCTTAAAAGTTCACCTGAAGATGACGTGATACCAATGCAGC
CAGGATCTGGAGAAACACATGTTTTGTACGTACAAGATACTTTCTATAAT
AGCAATGTTCTTTGATTATGTATATGCCACTCTTAATTCTTGGTATCTGG
TGAAGTACCCTACCAATTAGCGTGTCGTATATTTATTGAGAAATATTCTG
CGAGAACAACTTATGAATATTATGAAATTAGTGTCAAGCTGAATATCTTT
CTGTGAACATTTCAGCTTTCCAGATAGCCTGGGAGATGATTTGATCATTG
ATGTATCCGATTCCAAAGGAAAACCCTGTGGCCGTGTAGTTGCTCAAGTT
GCTACAATGGCAGAGGAACCTGTAAGATTATCCTTGCTATTTTGTTGCTT
TCTTGAAAGTTTGTTAAAGAAAAAGATTCTTGTAGATTTCATAGTTTGGT
GGCTCATGACATACTACTTACCAGTTATGCCTCTTGTTCGATTGATGTTC
CCCAGAAAACTTAAATTTTCTTCTGTAGGCTGACAAACTTCGCTGGTGGT
CTATATACCGGGAGCCAGAGCATGAACTTGTGGGCCGTATACATCTTTAT
GTCCAATATACAACCGCTGCGGATGAAAACAACACAAAGGTACTGATTCA
TGGCTATACCAACTTATCATATATTTTAAAGATGTAATTGTAGCTATATT
GTATTGTTAGTTACAGATTAGTTTCGGGTTTAGTGCATTAAGGTTACCTG
TGTCAGCTAAGTAAAAGGTTCTCCAGAATATCCTCGTACCGAGGAATATT
ATCAATTTCAATATAGGTGACCAGGAAAGCATATTTATCATGGTATCAAT
CATTAAAGAACTGATTGAACATGTCCAATTTCTTAACTTCATACTCATGC
CTTTCTTTGTTCTTGTAGTATGGCTCTGTTGCAGAGACAGTGGCATATGA
TATTGCTTTGGAAGTTGCAATGAAAGCGCAACACATTCAGCAAAGAAATC
TAGTCTTGCAAGGTTCTTGGAAATGGTTGCTGACAGAATTTGCATCATAC
TATGGGGTTTCAGATGCCTACACTAAGTTGAGGTACTTGGTTACAGTAGT
CCCAAATCTTTCTAGCTTCTTTTTGACTGTTCATTATTGCTTGTGTTCGT
TGTTTCAGTCCTTTTGCATGATTTTTGTGTTCTATGCCTACATTAAGTTG
AGGTACTTGGTTACAGTAGTCCCAACTCTTTCTAGCTTCTTTTGCCTGTT
CATTATTTCTTCTCTTCATTGTTTCAGTCCTTTTTGCATGTTTTTTGTGT
TCTATGTGATTTGACATACCTTTTGTGGCTAAACATGCCTTTTGTGGCTA
AACATGCCTTTTGATTCTTGTTGGGTTTGCATCGAATGTTGTCTCCTTCA
GTGAACTGCTATTTATCACTCTTCCTACAGGTATCTTTCTTATATTGTGG
ATATTGCAACCCCTACCGCTGATTGGCTGAATCTGGTACATGAACTCTTG
CTGCCTGTACTAATGAAGAGCCATGGTACTGCCCCATTGAGCCATCAAGA
GGTATTTGCTGCCAGTATTTGCTCCTTTTTATCAAAATGAAACAGTATTT
TTTTCTCACAAGATAGCAAATTTCTTAAATTTGGAGTATTGTATTGTTAC
TTTTGATGTATAATATAGTTAATAGTTAGCTGAAATCAATAAGATCCTTT
CCGCTCGTTGGCCTTGCAATTCTTACTTACCTAAACTTGCTCTTGACATC
TCAACATGATTATGTGACTGTAATTGCTTCATTAGAATCGAATACTTGGG
GAAGTTGAGGAACAAATCGAGCAGACTCTAGCAATGGTATTTGAAAATTA
CAAGTGCCTTGATGATTCAGTGGTGTCTGGACTAGTGGAAGATTTTAGGC
CTCCAACTGGATTGGCTGCGTCAGCTCTGGAGCCGGCTATAAAGCTGTAC
AGTCTACTACATGATGTGCTATCTCCAGAGGCCCAACTGAGACTTTGTGG
TTACTTCCAGGTCATTCTTCGACAGATTTGTCAACGCATGATATCTTTTT
TTTCGAGATGCTGTTACTTATTGAGTTTTGTATGTCCAGGCTGCAGCCAG
GAAAAGATCGAGGAGGCACATGCTTGAAACTGATGAATTTGTGGCAGGAA
ATTCTGAAGGCATAAAGATGGACTTGGTTTCCTTCACAACGGCTTACCAG
AAGATGAAATCATTGTGCCATAATTTACGCAATGAAATTTTTACAGACAT
TGAAATTCATAATCATCACATACTTCCGAGGTACTTTGCTGTTTCTGGGT
CTGATGTGCATTTTTTAGACACAGTTATATGTACGATCTATGCGAATCAT
TCACTGTAAAATGATTCTGTTACCTTTGCTTTATTTCCTCTTCAGTGAAT
TTATTCCAATCTCTGTTTATTCCTCTGTTTCCTTAGTTTTCTGGGCCTTA
TGTGTGTTTTTTAGACAGTTATCTGTACGATCTAAGTAAAATGACCCTGT
TACCTTTGCTTTATTTCCACAGTTTTGTCGACCTCCCCAATTTGACAGCC
TCCATCTATAGTGTGGAGCTCTCAAATAGATTACGCTCGTTCCTTGTTGC
CTGCCCTCCCGCTGGCCCTTCATCTCCTGTTGCAGATTTGGTAATTGCTA
CTGCAGATTTTCAGAAGGATCTAGCCAGCTGGAATATTAGGTAAGTATCC
TTGTTAACTGGGTTCTTCTTGCACACATGTCTTGTATAAGCAAAACTGAC
GTTTTAAGTTATCCCCAGCCCTATTAAAGCTGGTGTTGATGCAAAAGAGT
TATTCCACTTGTACATTGTATTATGGATTGAAGACAAACGCAGAGCACTG
CTGGAAAACTGCAGGCTGGATAAGGTAAATGCTTCTCTTTTATCTGCTTT
GGCTGATTGATATGATAAATAGTTGCACCAATTTTCTGTAGATAAATGAT
TAAAAAGTGATTAATGACCAATCTGCTGTTGTTGGTGGCCGACTTTGAGT
CCTGTATTTCTTTCTCTTTTATTTCCTTCTGTTGCATCTTGAATGGCATT
GGCCTGGTTGCTAGCGGAATCACTGATAGGTAATAACTAAAATAACTCGA
TCAATAAGTTGAAGGTTGTGGGTGTGGACACTTCCTCTGTAGGGATCTGA
TCCATTACTTAAAACAACTGATAGAGAATAACTTCGTAATATTGGAAGTT
TTTGTAGCGCGCATGCAAAAATGTGATAATATTCAGTTGAATTGTGGCCA
TGCCTGGAGATAAATGCTTACCATACAGTTAGTATCTGTGTATGTAATTC
TGATCCATTGCATTAAACAACTGAAAGACAATAACTTGTAATATTGAAAG
TTTTGGTAGTGCCCATGCATGCACATGCACAAATGTGATAATATTCAGTT
AAATTGTGGCCATGCCTGGAGATAAATGTTTTCCATACAGTTAGTATCAG
TGTTCGTAATTCCGATGGCTCTTTTAACCTGAATGACATGGTAGTTGAGG
CCACATCTGTCTTCACTCTTTATTCTGAAAACTTATTAGCTTGAGATGAG
ATGCTGTATGATATCTGTATATGGGTGCACTCAGCTTTTCATTATTTAAT
ATTTTGGATCTCATCCTGCAATAACTTTGCCTTTTTTCAGATTAAATGGT
CAGGTGTTAGGACTCAACATATGACGACACCTTTTGTCGACGAGATGTAT
GATTTGCTCAAGAATACATTGACAGAGTATGAAGTTATCATTTGTAGATG
GCCAGACTACATATTTGTTCTTGAGAATGTACGTGTGGATTCACTTGCAG
ACCCTTTAATTGATTCGGTTACATCTAATGGTATGCGACTAACATTGTGC
TATGGGGAATGTTGTAAAAAAAGGCTATTGCAGATGTTGAGAAAGCGGTA
ATCGACTCTCTCGAAAAGCAGTATGCGGATATTTTGGCTCCACTTAAGGA
TTGTATCGCCCCAAAGAAATTTGGCCTCAAATATGTACAGAAGCTAACAA
AGCGCAATTCGACGTGCCCATATATTGTACCTGAAGACGTGAGTTGTGCT
ACGTATTCACATTTGTTAGAATTTCAGTTTGTTCAATATCTGACCCATGT
CTGCTTTCAGCTTGGAATCCTCTTGAATACAATGAAAAGACTATTGGACG
TTTTGCGGCCACAGATTGAGAGCCATCTGAGGTCTTGGAGTTCCTGTATA
CCTCATGGAGGAAATACAGCTGCGATTGGTGAAAGACTCAGTGAGGTCAC
TGTAACATTGAGAGCCAAATTCCGAAACTACATGCAAGCAGTTGTTGAGA
AGCTCTCTGAAAATGTGAGTGTATTTGCTACAAACTCTCCTTCTGCATAC
ATTTTCATTCCATGCTGTTAGTTCCACAGTTGATGTGCAAAACTGAAACC
GTGCTTCCAGTATGGAATGTTTTAGTCAAACTTGATTTACATTTTGATGT
TATCATCGTATTGCAAATGTTAATTGGTATGTTATGCTGGATTGCTATAT
AGATATGGTGATTGCATTGAGGAATACTTTTGTGACTTAAGCTTGATAAT
AGAAGTCCTGGTAACACTGTTTGTAGCTGCAGCAATTTGGGAAATCTTGT
CCTGGACTTTGGTTTTATCATGGGAAATTTTTTATGGGAAATTTGTAGCT
GTTTGTAGCTGCAGCAGTTTTTTATGGGAAATTTTTTACTGTCACTTGGA
TAATGTGTGGGTCACATAGGTTACATATTTTGATATTTTTATGTGCAGAC
CCGCATGCAGAACACCACAAAGCTCAAGAAGATCATCCAGGATTCAAAAG
AATTGGTCATGGAGTCTGATATCCGCAGCAGGATGCAGGACTTGAAGGAT
CAGTTAATTGAGGCAATAAACCATGCGCACAAAGTCTCTGAAGTTCATGT
GTTTGTAGCTATATGCCGAGGCCTTTGGGACCGTATGGGGAAGGTATCTG
AAATTTCAGTAGCACCATTGTTTTTTCTTACCATACGAGTTTCTAACTAA
CCTTGGTTTAGGATGTCTTGAGTTTCCTGGAAAATCGCAAAGAAAACAAG
GCCTGGTACAAAGGCGCGAGAGTCGCAGTATCTGTGAGTTCATTTTCCTA
TTGTCCCCATTTTACTTTTCACAAGAGTATTGAGTGTCTTCCTTGTCAGT
GTTGCTTCTCTTTGCTGCTGTGGCCATATAAACACGTAATGCTGCAGGTT
CTCGATGACACATTTGCATCCCAGATGCAGCAGCTGCTTGGCAATACGCT
CCAGCAGAAGGACCTGGAGCCACCAAGGTCTATCATGGAAGTTAGGTCGA
TTCTCTGCAAGGATGCACCGAGACAGAAGAACTCCAGCTTCTACTATTGA
GCATTTTTGTGTGTACATAGGAATCATGGACATTAGAATGTGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.