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GrainGenes Sequence Report: AA041870

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Sequence
AA041870
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041870
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGACTCATTTTGTATACCTTGCGGCTTGCGTCGTCCTCTCTGACCTAC
CCAAGCCCCATCCAATCCGGCTGAAATTTTTTCTTCGCTATGCCCTAGAG
CCGCCGCCGCCGCCGCAGTTGAGCCTCGCAGCCGTCGCCTCACCCCCTAA
ACCCTTCCGTGCCTCCCCGCCACCATCGCCCCTCCCGTTCTACCTCGCCG
CGTCCTGCTATCTTCAACTCCCCCCTCCGAATTCCTCGACATTGATTTCT
CAAGGTACGAGCTTTTGGGTCCTCCGGCGATTACTTAAACCCGCCTCCAA
CAAATTTCCATCTAGATCCGCACCTGGTTTGGTGGTAGAGGTTGATTTAC
ATAGCTCGATGTTGTTTTGTTGTTATGCTGCGTTCAGGCCACAAGCATCA
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GGCTATGTTGACGCCCGTGTGGTTGAGGATCGTAGGGGTCACCATCCCGG
TATCCGTGTGGTCGATGATCGCAGAGGCTATCCTGCAGTCCGCGTGCTCG
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GCTCATGGCTGACCGTCACGCTCTAGCCGAGGAGCGGATGGAGTTACAGA
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AATGGCACAGGAAATTCAGCAAATGCGGTCTGAGTTGGCTAATCTTGATG
TGAGACCATGGGGCACAGGTATGTAATTTGGATCGACTACATCATATGGA
AATTTCACTTATAGTTTCTACATGTTTTTTATTCTATTTGACTGTAATTA
CTTTTTTGGTTTGGAACTGTATATGTGCAATATGGTAGGGTTGTGTGCAA
TCCTGTTCCAGGAATTCGGTGAACTCACATGTATTACTGCATTTCTTTTG
GGAATCTGCAATCTGCCAGCAGTTTGCATGGGTTTATAAGAAACAGGACA
TCAGTCAAGTACTGCTTTTGTTTGTTACCATTTGGCAGATATTCTTTATA
AATTGTATTATCAGATATGTTAAAGATCAAGTGAGCAGTGAACACCAGGC
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TTTTTGGCTAGTCCACTTGCTTTGGCTCATCTTTCCTCAAAAGGCAATTA
AGTTATGTGGAGAGCTGATTTAGCTTTGATAGTTCCTCTCTATATGCTCA
TTTCTACAATGGTGCCCTGTTAGGAGTTAGGACATGCAAAATTTGGCTTT
GTGCTACATGGCATTCTGACAGCATTGATCATTTAACATACATATCTATT
TGACTACAACTATTGCCGAAGTAGTAAGTTGCTAGACTTACTATTTATTC
CATGTATGGAATCTTAAACACATTTTATAGGACACCTATTCGCAAAACCA
TTCGAAGCATGGAAGTTAGAAAAACCTCGTTGTTTTACGAACTAGACTAA
ACATGCTTAGGGGCCATGTGTTTTCATTTATGGCATAATGAGATTTACGT
GCAATTTTGGAAGATGACATCACTATGTGCACCACAATCATAAATTTATG
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TTATAAAAAGACCCATGTATATTTTTGTTTGCCACTTGTGACCTCGGCTA
TGCCTTACATGTGGGTCCAACCAGCAAGCGGACCACCAAACAGCTAATTA
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CTCACTAGCCCTTGCCATTACAGTAAGTTACAATTTATTTATTTTTCTAA
TCTAAATGCTTAATAAATACTTTATGTTAATTATAGATCCAAACTCTTAT
TCTCTTTGTCTCAAAATAGATATCGCAAATTTTTCTAAATTTGGATGTAA
CTAAATAGTGTCTAGATCTTCTAAAATAATTAGAGTCTAGATATATCACA
ATTTAGCCAAATTTCCGATATCTATTTTAAGACGGAGGGAATACTAAATA
AAGTCAAACGTGCACATGTACGCGATGAGTCGGGGCATCCTCGCGTCGGC
ATGCACCTCATCGATAACTTAGGGACGACAACCACACCATATGCTCCACT
GCCGCGAGGTTCAAGAGAGCCCCTCTGCAAGCTGTCCGTTGACATCGTCG
GTGTGCACACGGTGGACGTGCTTTGACAACACAAAGCGTGTGCATGGACT
TGCCCCTCGCATTTCCGGTGCATCATGTGTCAATCCCAGCAGCAGAACGC
GACATTGGTGCGGTGGCAAAGGCTGGCCCATACATGGATGCGGCGTGGAT
CTGCTTGTCGTGGTGCGACGTTATGGAGTCTGCTCTCCCTAGGGACATGA
GAATCAACGGCGGCATGACACCGCCGTGGTGTTCGCCTCACGCTCTGCCG
ACACCGATGCCGAGGTAGCTGTCGAGTTTCTCACCCTCAAACTCGCGGAA
GCAATGTATGTAGACGCTGTGGAGATCCACGTAGACGTCTAAACTCAAAC
GGCTCATGCCCAAGAGCACGTCTCGTCGGTTATGGTCGCTCTCTGGGCTT
TATATTGATATATTATGTGGGTCCTAATTAAAACAACATAGGTACCCTGA
TGGCAATGTATTTTGTGCGGTAGGCGTTGAGCCTGTGCTCGAGTCCCTCT
AGGCTAATTAAGTTTTGTTAATTCGTTTAGCCACTAACAGGGTGGGTCTG
GCACCACGTAAGGCAGCACCCCTGGGTCACAACCTTTGAACTAAAATATA
CAGGGTTCTTTTCACAAAAAATCATAACGACACGTGTTATCTATAGATTG
TGTTTGGACCTGTCTGTACCCTCTATGCAAGTTGTGGTACCACGGGTTCA
CGTTTTGCAAGTTGTGGGACTAATTTGCACGTAGCGAGCAAGTTGTGGTA
CCATTAGTGTATATAGCTCTAAATTTATACTAAAGCTAAGCTGACAGCTT
CCCTTTCCGTGCTCTGCAATAGCCATTGTTATCTGCTTGTGTGTGGCGTG
ATAAATGATATGATGAAGCTGGGATGACAAGGGCGATGCTTGAATACCAT
TGTTGCACATGGCTACATGAGAGGGAGGGAGGGCAAAACTCTGTTCTATT
TTCTTCCTTCTCCTTTGTTGAAAGGCTGCTTACAACCAGAGATAGATTGT
AATAAGAGAGATAATATATCTTGTTAATCCTTTCCTGATTCGCACCTTTA
CTTATCCTAATTTAGACTCACACTCATATGTAAATCTAAAGACCTAACAC
GATGGGAAGGTTAGGAAAGTTCTAGCCATCCCGATCATGACATGCCTCCC
AATTTATAGTGAATTTTGAGTTTGGAAGTCTTCTAATATGAGAAGAATCC
TCCTAATTTTTTTTTGTAATTTTTAGTTTGAGCCTGCATACACACTTTTA
AATAGACATTTTGTTTCTGCTATATCTGACAAAATGGCACTTACGTTATA
AGTACATGGGAAAATTATATATTTTAAATCGTATAGTGGAGGGGCTTCAG
TTCCATATGCGACCCTTCTTGAGGTCCAGTCTTTCTGGGTATGCAAATTC
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AATGCATATTTATGGTTTCTCTTTGCTGCAGGTATGAATAGAAATCATTT
TTTTCCTGTTAGTAGGAAATTATCAGTTAATCCTGCATTTCATTTATTAC
ATGCTTTAAAAAGATGAGACCCAAGGGACTAGCACCCTCAACACATTATT
AAGAAGACAACGGTATACACTGGTTTATTAGCCCCAGGGAATAAAACAGC
AAGAATTAATCTGACCCGTAGCCCAATCTTTTTCGCAGTTGACCTTCTAC
TTGCCTCAGCAGTACCTTTGTTTAACAGGCCAATAAAAATCATAAAACGT
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GAGAGCATAAATCATCATAACAGACTTATCCTAGATGAGGATTTTCTCCA
AGCTAGACTACCTGAATATTATCTGTTTATCAGCATCACTGTATGAGTTG
CTCTTAGCAACTGACAATTTATGGAAAAAATAGTCACTCTCATGGTACTA
TGTTTACCTGCTCTTGAAGGTGGAGCATATGGGATGAAGCTGGGCAGTCC
TGAAGCGACCTTCCCTACTCAATATGGAGATAAATACAATATCCATTCGG
TACGATCTTTTGAAAGATGACATCTTCAAAGAATCTCATTCTTTCCTTAT
CATCGTATGATGATTTTTTCATCTAATTCCGAAATGTACTATTTTGTTAC
CAGGGAGTTTCTGACAAAGGTCCATTGCATCCTCCTGAGTCTTCGTGGGG
CACATATGACAAGAATCGTTTCCAGTACCGCTAAGATCCCAGTTGCTACA
TTCCTGGGAGAAAGAATCACCTTCTAGGTGTTAATGATCATATCACATGG
TTTAGAGTATCTACCTACTTGTTTGTGTTAAACTCCAGACTTCTTTAAAT
GCTTCTTATAATTTTGCTTTCTGTGTTAGTTGATAAAATTTGTCACAGCA
GTATCCTGTTACTATTTACATTTTGGCTCCAGATCTATGCATGTTACTAG
GATATCAAGGTATCCTGGTTATATGGATCTATGATTGGCAGATATTTTTA
CATGGCTTGGACTTTGGACATATATGATAATACATTAGTCGGAGTGACTT
AGTAGTGCCACATATAGAGCATATATTCTAAATTTAATATGAAGCCATGG
AGGTCATAACTGAAGAACTTTTAATGTAAGTATTTACAATAGCTTCCACC
ATGCTACACAAGGAATTAATGAACTTGAGATGATACGGGTAGTGCATAAA
GTTTACTCCTGGTGATAACCAAGTGTATGGTTTCTCTCATGTTACTTAAG
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AAGAGTTATTATTCCAACTTGTGAAGCACATTTTCTGTAAAAACTGAAGT
CCTCTGGTTATGTGACACCGTCTCCTCACTGACCATATTCTCTACATCTA
GGTTTATGTAGGCCGAAGTTGTCCCATGTAGCGATCATATGTTCTCTAGA
TTTATGTCAACTGCTGCATATTTGAATGTGTAGTGGATCCAAGACTGGTA
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CCTCCTTCAATCTATAAGACAATAACAGTGTGGACAAGTCTACGTTATGT
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TGCTAAACTCGATGGCAGTTTTAGCACACAAGTTGTTTCAACTGAATTGG
TTTGCATCTGATACTTGCATCATCAGTTTTCTCAGTTTGTAGTTGTCTTG
TGCTTGATGAATTTTAACTTCCACACCTTGTGTGAGCATGATTATAAATT
CTTGCTCTGGCACTTTGTGTAGATTTATCTTTTACGGTATTAGTCTGACT
ACTTCTAGCATATTTTGGATTTGGAGTCTGGTCTCTGGTGTCTGAAGCCT
TAGGGGGCTCCTATTGCTGCATGTTAGAGAAGAGCGAGGCTATTCAGAGA
CTTGTCGCTTGTTAGATACTAGATGTTCAGCATCAGTTCTTACGCATGCA
AAGATTGATCGAAGAGCTCTTTTAAGGAAGTTGCAGCTACCATTAGTCAT
AGGACTACTGTTGGACTTCCATTGTTGGACCTCCACCATTGCACACTGGT
GGCCTCTCTTGCTCCCTGAATTTGTTAGAGTGTGCATCTACATGCCACTT
TTCTCATTCTTTTCCTGGCTTGATGCTGTATGCATAAGGCTGCGGCATGA
TAACTATTTCTTTTTTTGCCTATTACCCACTTGGCTAGCCTATACCTATG
TAGCTGATGTAGTACCTGTGGAGTTAGTCATGTTCTATATTGGACTTTTA
CTGGTAGCTCCAGTATCCAAATTTCAGTCAGCAGTTCAGCTTAGTATATT
GGACACGATGCTGACAACTCGCGATTTAGCAACATCTGCTGGATCATAGA
TGTTATTTAGAGACTGTGCTTCAACTTTCTTAGCTTTGGAAGATTTTGCT
CACGTCGAGAACATGAAACCATAGTCTTTGTCGTGGAAGACAGAGAGCAA
CTTACAATACCAACCAGAAGCAATTGTAAATGCATCAGCCTTGCAACCTC
CTGGAAGCTTATGCCGCATCATGATCTGAGCCATATTTGACGAAGGCCAT
GACCCTCGGATCTCCCTGGACAGATTTTAATGGTCTCCACAACTCCAAGA
GAACTGAAGACTGGAAGAAGCACACTCTCCGTGATAGGCTAGAGTACCTA
CCAGATTTTAACACGGAGGATTCTTCTTGGTTGAAAGCCATTGTGATTGG
CTCTGACACAAGATGTTGTGCATAAACAGTGTTCTTGCGAATGGAAGCTT
GATGCATCCTTCACTTTAATGCTCAAAAGAAGTGAAGATTCTGAATAGAA
GTTGGCTTAAGAGTGCAGTGTCTGAGCCCCTTGTACAGGAGAACTGGGCT
CAATTTGTGAGGAGGGGAAAGCATTCCAAAAAAATTGTGTGAAAGCAGCA
GATGAAAGGTTGATGCGTTCTTTCATGGGATGCTTAAAGCATAGTGCAGA
TTGAATAGAAGTTTGTTGAAGAGTTAAGCTGATGATCTGACTATGGATAA
TCTTTACCTCTATTAGGTGTTCCAACAGGCTGGACTTAGTTATCCCTTTG
TTGAGTTCGGATTTTGGGTGCTCTATGGGATTCAATTGCTTTTATAGCGT
GTCAGGTTATGGAGAATCTTTGGCAGAGCTTATTGGCTGAAGTTGGCCAG
AGAGTATGGTGCCTGAATTGCATGAGCTCTTAATGCTGGAAACCCTTGCT
CAGGTTGCGCGAAGGGCAAAGAATTCTTGTGCTTTTTCACGACAGCTGAC
AGATGGAAGTTTGCTCTTTGATGCCATTGAATGCTTAAGCTGACAGGCAG
ACTACTCTTGAGCAGAAGTGAGCTGGAAAGATAGTTGATCTTTGGACTAT
GTGGATTTTTAAGGATTTAACCTTGTCTGTTATAAGTCCATCTGTGCATA
TTGAGTCCGAATGGGCTTGAGCTTACTTAGTCCATGTACAGAGCATGTAG
ATAGTTATGCTGCTGTTCTATTTTGTGTATCACTCTGTGAAGGGTCAAAG
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TACCAACCATGAGGCAAGTAATTTCTTCATTGACGCCACAAGTTATGCTG
GGTCTCTTTTTATTATTTTAAACGATCATACTTGATAGTGCGCATTCATT
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ATCCGGTGGAACCCTATTAGTTTTACTGTAGGATAGACCTGAAAATTCGT
TGTCAGTATGCCATGTGTTGGAGAAGCCTGGCTAGTAGGCCGGTGTTCTA
AAAGTCAGCCAAGTTCAATTTGAGCTCGGCACAGCCATGTCTGAACGTGT
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AGTGAGAATGGTTCAAGGGTCAGCCTTGTTGTCATTGTTGAGTTTGCTGT
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GTCTCCTCATCCTCCTCCTTTGCAGACAGTCAGCATATGTTGCATAGGGC
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AACTGAAGCTAGAAGCGAAAGCCTATTCTAATGTACAATAAGGAGAGGGA
AAAGACATGACCTCTCTCTCATGCCCCCACCCCCACATCAGGAGACCTAG
TAAAAAGCCGGAGCCTGCGTTCGCCTTTGCACTCCCATCTTCCACAGCTC
AACCTTGGCCAAAATTGCCTTGACCAATGACCACTGCCTGACAGTCCAGC
CCTGCATCTGGCGCCTAGCAATTTAGTGAGCACTGGCTGTGTTCATTTTC
TGGTGAAGAGCCTGGATCTGGTGATTAATTGCCACACATAAGCTTATCGG
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TGGGTACTTGGAGCGACAATCTGATCTGAATTGTATTCAAGATGACTTCT
GCCATTCTACAGTTCAGCAAGGATCTGATGAGACCATGTATGATCTCTTC
TCTATAGGTGCAAATTGATGAACTTGGGGGTTAATTGAGTAATTGAGGCC
TATGAGGTTTCTAGACCCCCTCCTGGACTCTGCACACAAACATTTGATTT
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TGCTTCAGGAGTGTAGTAGGAAACAGTTCAAACTTCATAGTTGATTGCTT
CATGTCATCCCGTTAGTTTTGGAGAAACATTGTGATATTGGCTGTTTCGA
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AGATGAGTAGGTGCTGAGCAGAGGAGCTTCAGAAGGGAAATTGCCCCTTT
CCCTTGGAAAATGTTACTTTGCTTTGTGTTTTGAGATTTTCACCTTACGT
TTTACTTTCGTGAACAAAAGGAGGAATACAGAAGTTGTATCTTATTGGAT
CTGCAAGAGGAGTTACTGACAGTAGGCCATGGTCTCCAACTTTATGTGTT
ATATGAGCTGGTTTGGCATCGTAGATGATAGCCGGCGGTGATGGGAGGCT
GGCACAGTGACAGGAAGGTTAGATGGAGAGAGGTAGAGAAAGTACTTGCC
TGCCTAATTGAAACCCGTGACACCTCATATAGCCCTCCTTACATCTGATT
CTAGCTTGACCATTACGTCCATGATAGTAAAATTTCCATGGAGTGTACTA
TTTTTATATCGTACTAATATCAATGTTTGATTGTTTACAGTTTTGCATAT
TCAGTGTTATTTATTAACTGTTCTGTACAACTCTTCTGATCATATTGTAA
TTCGGATCATAATGTCTAACACAACTGTTGTTCATCTTACAGGTCCTTTT
CCTTTGGCAGAAGTATAGTTCATTCATGAGTTACTGCAAGGAAATAGTAA
ATATGGTATTGGGATAACTGTTGCCTTTCTGATGCTGAAGGTGCTCTTGC
AGTTACTGAAACTACACCAGCAGATTGTCTAGAAATTCCTGCAACAGCTC
AAGACATGGATTACCATACTGGTTAGAGATATGAGAAATAGTTTATCAAC
CAGCGGGATCATTATCATCTGCTCTAGCAACCCTCTGAGGGTCTTGAATG
TCAGGCCGTGGGTGATTGTGTTCATCTGCAGGCATTATGTTTTGTTGTGG
TTTTGATGGAAAGGCAAACGCTTTTCTGGAAGCCTCTGCTTCGTGTCAGT
GCCATAATAATTTGGAAGTTCAAAAGAGATTCTGCTGCAAATTGTATAGG
TTACGGCTTACCCAGTTTGTAGGTTGAGTTGTGCCAGTCCATGATGTTTC
CAGTTGTTCCATTTGGATGCAGTCACCAGTTTGGCCAGCAGTGGAGCTTA
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GGGCTTGTTTTATGCCGTTTTATTGAAGCTGCTGATGATCATTATGCTCA
TGGTATGGCAGTGGTGCCATCCCTCAGGACCTGCACATAGACCAAGTCAC
CAACAAGCCCATCTGAGTGTTTTGACTTGATTTTAAGGCCTACACATACT
TGCTGTCACTGCCCTGCTCATGAGTTCAACTGGAACTGAAGATCTTGCAG
GTAGAGCATTTCTTAGTTGGCCAGGAAGGTTGTTCATGCGAAGCATGCAT
GTAATTGATCTTTTTGGGAGTGATGTAGCACAGAATTGCTAGAAGTAGAT
ACGGAGTAATAAGTTTTGCTCCATCACCTCTATCTGCATGGTGAAGGAAG
AGACCTTTTGATGTCACAGCTGGATCATGGCTCAGAAGGCTGCTGTCTAT
AAGAACAGAAACCAGATATCGCTGGCCTAGGAATTCCTGCTGAACAAATG
GATTTGCCTTGTTGCTCCATGCCACGTATCCTATTGAAACACCAGCTTCT
GGCTTTGCGAGGCACGCCACCATCACTATATCAAGTGTCATGATTATTAT
TCATTATCCTGAACTGCTTGCGTCCTGAAGGCCACTGAACTTGACTTGTT
GGAAGAAGCTTTCAGTCAGATACTGCGGGCAAGGAGTGGGAAAGGGAAGT
TGTAAGTTCATTGCATCCTGCGAAATGAAAGTCAGACGTGGATCAAAGTC
CATTTGACGGGATATCAGTATCCTTTTATATATGGTTGCTCCTTATAGTC
AAGGCCATGGAGTCTCTGGTTTGCCACGTCCCTTGTCGCGGCAAAGGCAA
AGTATGAGAAAGCGAATACAGTGCTGTTTCAGTGAACAACGACCGACCGA
CCGCGCTGACAACACATTTCACATAACTACATAAGCGCTAGGTAGTTTAG
CAAATGCATAACTACATAAGCGCTAGGTAGTTTAGCAAATGCATTTTACA
TAAGGGCTAGGTAGCCTAGCGATTGATATTTAGCACAGTTGAATGGCGAA
TAGATTGTGTTGCATGATACTTTGGGAAGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.