Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA013811

[Submit comment/correction]

Sequence	AA013811
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA013811
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGTTGTGGCACTATCCCGCACGGGCCCGTATGTAGGAGCTCCAGCGGTGG GCCTGGTTGGGCTATGCTCGCCCAGCCTGAAGCGGCCGGGGCTTGCCCCG ACGACGCCGTCAGGTCGCCGCCGGCGCGCCCTGGTAGCGAGGCAGCCGAA CGGATGGAGGTGGTGGGCGCTTTCAGTCGAACAGGGTAGGGGGACATCGC GGCTGTCGTCGACCGGCGCCGCCCCCGCGTGCTTCCTGGACCGGCCGTGG CCGTGACGCTGGCGACTGCGACCGGCATTGGGGAGCATTACTGGAGGGTG CCGATCCTCGGGGACGACAAAACCCCACGGCAGATGGTAGTTCTGCTAGT AAGCCATCTGCACTTCACCCTCAGCCGCCGTCGTCTTCCCATGGAAGCAT CAAGGATCCAAGCCGCGCTGCTGCGCCGCCGGCCGGGTATTTTTGCTAAT TCTCTTCTGAATTTCTATGTGCTGGATCATGACCGGAAGCGTATGCCTAA TTCAGTTCGTGTGTGGTTTTGCAATTATCTGTTACCTTTATCTCCCCTGT CCACCGGCTGTTAAATAAATCTGGGAGTGTCTTGGGATGGTGTTTGTATC CTTAGGTTTTTCAAATTCACTGTCCCTAGAATGCAACACCTCGAAATAGG CTTGCGCCCCGCTATATTCATAGAGCAAACCACCGATACAAGGACACCAC TGCTAGGGCAAAACAGCACAATCTGAGCCCAAGAGAAACAAAAAAGTCCC CTTGAATTGGTGTTTGTTTGTATCCTTAGTGCTTCCAAATTCACTGTCAG TAGAATGCAACACAAGTCCCCTGAATTAGTTAACCAACAATAACCATTAG GTCCAGTTCCACCGCCACTACTATTTAATAGGAATAAAAACATAGTGATC ACATTGCCTAATGACCTTACAGAAATGGACTATGAGATGTTCAATCTCGA ATTTCTAGTCCTGATACCAGTGCCTCATGAACTGCAGTTTGCATCAGGTA CAAGTAGCACATCGCAGATGGCGGGGTTTGTAGCTTTGAACCTAGGTTGC TTATGCCGACGGTGAAGCAGTTTCGACAGCGGTCAATCAAGGCATTCCAC AATAGCCGATTACCTTGTAAGAAGTCCCAGGGGACTGCCAGGACTCAAAA TATCAAAATCTCAGGCAAGTTTGCTCTACTAGATGAGACTGGCATGTATA CAGCAGGATTTGTGTTTCAATTTACAGGTTGCATTTTCGTCCATATTCGC CAGCTTATTTCTCTCTTATTACAAGGCATCATTGCCACAAGTAGCATGAT CACTGCTCTCTAGGTCGTATCTTTCAGTGGCCATTTCTCTCTAGCAGCCT TTGCTTTTTCAATGAATAAAATAATATTTTGTGCAATGTATATACTGCGA TTCTGTTTGATTGATTGCTACTAGCCAACTATTCAGAAGCTAACTTGCTG CACAATAGCTTACTGGGCCTTCCCCATGGGTACCGGGCACGAAAGGAATA GAGAAAACAAAGGCCCTCCCAGAACCTAGATAACCCCTACATTTTGAGAT GATAGCCTACATATATATATATAGCCTTGGATGTATTGCTATAAACCTTA GTTAACTAGCACTATTTCAAACTGACCGTTTAAAAGTAAACTACACTAGT AGCACCCCTTTTTTTTTCTTTCTATGATTAAGTTACGTGTACTTTGCTAT TTCTGCAAGTTTTTCATATATATATATATTTGAACAAGTTGATAAGGTTC ATATTTTAAGAAAGAAACAAAAAAAGTACAATACCTACGAGTAAAAATGC ATACTCTAATGAAGCACGCCTTGCATTTGCATCAATCTTCTAATTATAGT AAACTCATACTGTAGTAAATTAATATCTATACGTATTTCAACAAATTTTG TAGCTCTCAAGCGTCGACAACTCTCATATCTGGAAAATGAAAATACGAAA TTTCAAGAGGATGTTAAAGTATGAACATTTCGATTGCCGATGGGCTGGTG GCTCATACAAAAAAAAGCCACTGAAGTCAAAACTTGACTCGAGTGAGTAC TGCGTCCTAACAGTGCTGAGTCCTAAGTCCTAACGGACTTATCTAGGTAC AGCTAATTAAGAGGAGTAATAAACTTCACATTGTTTTCTGGTGAGACCTG GAACTTAATTCCCTAGATCTAGTAGGACAAAATATGCTTTTATCATGCAT ATGCTGATATGCATATACTAACAGGCTGGTGACTGCTAGCTCTTAATATT AAAGGCGGCATCTACTGCATTGTACCTATCACCAGCTAGCTAGCTTTCAG CAAACAGATCAAACTGATGAATAAGCCATGCCTGCAGGCCCTGGCGTTCT ATACTTAATTATGAGCATTCTGTTGTCATGGCACTGTCAATCACATCTGA ACAAGACTCAACACTACCATCTGGGGAAATACGAATGCATCTGGATGGAT CGTTGATCACAATGCAGGAGTTTGTGTAATTGTAGAGATTGAGACAGCAA AGCCAACATATAATCACATACAGTACACCGTTCGGCTTATAAATAAAGTA CTTGTCATTTTTTAGCCTTTCACCAGTAGGGTAGCTCCAGAGAAGAGCAG GATCCAGCATCCATCTATCCATCTTGAAGGTAAATCTAGATCACCCAGTT AGCTACCTTTGCTTGTACTATATGCTTATAAATTGTAACCTGTTCCTCGT GTAATCATCTTAGCATTTCAATGCTACCTTTTCAATATTTTTTGCTTGTT TTCTTTAGCTACAGTTACTGGTGGGAATGATATGTTAGTTTATCTTTATT ATAGCAAAACGCAGTGAAAATGGCTATGGTCCTGGATGCTTTTGCATCAT ATGTGCAAAACATGCTGGTGAATATGGCGAACGAAGAGGTGCAAATGCTT CTTGGAGTTAGAAAGGAGATTGACAAGATGGGCGTCAAGCTTAAGGACCT CAAGGACTTCCTTGCCGATGCTGATAGGAGAAACATCACCGACAAGAGCG TGCAAGAGTGGGTGGGACAGCTTAAGCGTGCCTTGTACGAAGTTGCCGAC ATTCTCGACCTCTGCCAGTTAAAGGCCATGGAACAGGGTTCATCCACTAT GGATGTGGGGTGCTTCAACCCTTTGCTCTTTTGCATGCGGAATCCCCTTC ATGCCCATGCAATCGGTAGCCGCATCAAGGCACTCAACAAGAGGCTTGAC ATCATCAAGGAGCGCAGCGCTCAGTTTAGCTTTATCAATCTAGGCTCCTA CCATAGCAGAACAATGCACACCTCTTGTTCATGTAATCCTAGTCGTGAGA CGACAGGGATGTTCGATCGGTCAGGTGTAGTCGGGGAGAAGATCAAAGAA GACACAAGAGCGCTGGTTGAGATCATGCTGACTGAAAAAGAGGGCAACAC CAACATCATGGTGGTTGCCATTGTTGGCGTTGGCGGGATCGGTAAGACCA CTCTTGCCCAGAAGGTCTTCAATGACGAAACATTGAATGCCAAGTTTGAC AAGATGATATGGTTAAGCATCAACAAGGACTTCGACATGGTTGAGTTGCT CAGGACAACCATCACGCTCGCCGGGGGAGAACATGGTGGTGAAAAGGTGT TGGCTGTGCTTCAACCAATCCTTACTAATGTCTTGACAGGGAAGAAGCTA TTGCTAGTGATGGATGATGTGTGGAGCCACAGAGCATGGGGCGATGTGCT TGAAAGGTCCTTGGGTAACGTGGTGGCTCAAGGAAGCAGAGTCCTAGTCA CTACTAGAGATGAGAGAGTTGCCCGAGGGATGAAAGCTGTGCTTCCCTAC CACCACATCGACAAATTAAAGGAAGAGGATGCCTGGTCATTACTCAAGAA GCAGGTATGTAACTAAATGTGAATTGACACTAGGCGTTATCATACCACTA TTCTCTTGGGGCATACTACTTACTGACTCTTATTTGATCTAAATTGCTTG CAGATAGTCTCTAGTGAAACATATGGACATCAGATCGATACACTAAAGGA TATTGGGTTACAAATTGTAGCAAAATGTGATGGCTTGCCTCTCGCTGTCA AAGTAATGGGAGGACTCTTGTGTCAGAAAGAGAAGAAACATCGTGACTGG GAGATGGTTCTGGATGATTCTATATGGTCGGTATCTGAAATGCCCGAAGA GTTGAACCATGCAGTATATTTGAGCTATGAAGATTTGCCTGCTTGCCTCA AACAATGCTTCTTATACTACTCCCTTCTCCCTAAAACTGTTTTGTTTTAT ACAAATGAGATTGTCGGCATGTGGATTAGTGAAGGATTTCTTCATGGGAT ATCAGACGATTTAGAAGAGTTGGGAAGCAAGTACTATAAGGAGTTGATAT TGAGGAACCTTATAGAGCCAAATCCAAAATACATTGATCAATGTATTTCC AACATGCATGATGTTGTACGATCATTTGCTCAATTTGTTGCTAGAGATGA GGCACTAGCAGCTCACAGTGGTGAAACTAATATTGTTAGTAAACTTGGTT CACAGGAGTTTCTTCGGTTATCATTGGAAAATGAATCATCTGAACAAGAT GGATTAGACTGGAGTTGTTTGCAAGCACAAAAGACATTGAGAACACTGAT ATCAGTTGGCCATATAATTATGAAGCCTCGTGATTCATTGGTTCATTTTT CATGTCTACGAACTCTACATACAGATTATTCACATGCTGATGCCTTGGTT GAATCTTTGCATGAACTCAAGCACCTGAGGTACTTGTCCTTAGAAAACTC TGATATATCTAGTCTTCCAGAGAGCATTGGAAAGATGAAATTCTTGCAAT ACATTAATCTCAGAGGATGCCAAAAATTTCTGAAACTTCCACATAGCATT GTAAAGTTACGGCAGCTAAGGTATCTTAACTTCAATGAAACTAGTATAAT TGGCATACCTAGGGGGTTCTGTGGTCTGACAAATTTGAGGATACTACGTG GATTTCCAGCACAGGTTGATGGTGATTGGTGCAGTCTGGAAGAGTTGGGC TCTCTTTTTCGGCTAAAGCATCTTGGGATATATGGATTGGAAAATGTAAC TTCTTCCGTGTCGGCAGCGAAGGCAAAGCTTGGTCAGAAGATGCATCTTA CCAACCTAGACTTAGTCTGCGGTAGTAGTTTGGGGGATGATGGGTTCATT AAAGAGCTAGATATCATCTCCAGGGAACAACAAGAGCAAATCAAGAAAGT GTTTGATGAGCTCCACCCTCCGCCTAGGTTAGAATACCTTTCAATAGAAG GCTATTTTGGCCGGCGGTTCCCAAGGTGGATGATGCCATCATCAGTTGTA CCTCTCAAGGGCTTGCGGATTCTGATGGCTGATGACCTGGCTTGCTGCAC ACGACTTCCCGATGGCTTGTGTCAGCTCCCCTGTCTGGAGTTCGTTCAGA TCAACCGTGCTCCAGCCATCAAGCGTATTGGACCTGAATTCCTCCAGTCC TACCATCACCATTCTCATCCTTCCCAGGCGGTGGCTGCGTTTCCAAGTTT GCGTAAGATGATTTTAATAGAAATGGTGGAATGGGAGGAGTGGGAATGGG AGGAGCAAGTGCAGGCCTTTCCTGTCTTGCAGTACCTTACATTAGAACAC TGCAAATTGACACGTCTTCCTCCTGGCCTTGCCTCCCAGGCAAGGGCTTT GAATAAATTAATTATACAAAATGTCCAGGGTCTCATCATCCTAGAGAACC TTGTTTCTCTGGTTGAGCTGGAGCTGATTAAGAATCTTGATCTGCAGAGG ATCACTAATCTCCCTAGACTACAGAAGCTTGCCATCACCAACTGCCCAAA GGTGAAGGTGTTGGAGGGTGTCCCTGCACTCCTGAGGCTGATGCTTGAGA ATAACATGGAGAAACTTCCAAAATACATGGGAAGTATAAAGCCAATGCGT TTGGAGCTAGAATGTAGCCTAGCACTGCTTGCTTCAATAGCCACGGGGCA ATCTGGCCCTGAGTGGGACAAGTTTAGCCATGTTGAGCATCTCCAGGCAT ATGCACCTGAAGGGGATAATATAAAGAAATGGTATGTCTTGTGCACATCT AGCCCCTACAACTTGGAGACAAATGTCAGCTGCTCTTTCATGTCCAAAGG TAAATTAGCTTTACTCATTCATCTTAATTTATTAATTTTGTTCTACTTGT CATCCATATGTTTGATTTTGAATATATTTCCTAGTACATTCTTATTTACC CTTAATGATATGCAAGTCCTATGCAAATGTTCATTTTACATGGTGTTATA GAAGATGGACTATTTGCATTGAGTTAGTTTTTCTTGTAAGGTCTGACCAG ACCTTGAGACACATTTGCTAGGGTCTGGGCACATAGCCGCCCGCGCTCGC CCTTGCCTTCTTGGTACTTTCACCTCTGACCACACACTCGTTGTTTCTTG TAGTCCTCACTTGCATGTTCATGACTCTGCTTCTGGGATTAACTGATGCC ATTTTCAGACTCTTTGCATATGATAGCACTGAAACAATGGCATGCATGCA CGTGTGCACATATCTGTATGTGTGTAGTAAGAAATCAGTTGTTCGATTTT GACTTTCCAGCCTCTGTCATTAGATTGTTATAAGATAAAAAAATCGTGTC ATAACTAAACAAATTGATACCATGTAATGCTGATTTGTGGGATTTGTTGC CAACGTCTCCACATTTTGCCTCTAAAATGCATTTACTCACGTTTTGCCAC ATGCTACAAAAGTGATACAGTAGTATAGTTTAACCTCCCGAAAAGAAGAA CAAATGACTAGATTTTGTCCTACAAGCTTCTTATCATTATGTAATGGTGT CTGATTCCCCCACAAAGAAATGACTAATTGTTGACTGATGCTACTTCCTG ATGTGGCTGGAGTCGCTCATGTTGCTAAACATATGTTATTCTCACTGGTC CACTAAGCTACCTCGAGATTAAAAATGAAATGTTGTATCTCAAAGCTTAT ATGTGATTTCTAGGTCTGACTGTTTTAACATTGTCAGAGTTGAGCTCTTG CCTTGCTAGTTATGGATTGTGTAACCACTTTTACATTTCTACTCATTCAG GAACCTTGTCTTCCTTTGAGGACGCACAAAGATTTGAGTCTGTCTTTAAA ATGACAAGAAAAACCTTTAACTACATCTGCAGCTTGGTGTTTGGGCCATC AATGGAAGATATGAACAGCTACAAATTTATTGATGGGAGGGTGCTGTGTT TAGAAGATCGAGTAGCCGTTGCTCTGACAAGGTTGTACTCCAGTGAGCCA TCGGAGACCTTAGGATCCTCTGTTGGTGTGGACGAGTCAACTATCTTGTT GGTAACTGAGAGGTTTGTTGACGTTGTGTTCAAGCGAGCATCACACCACT GGCGCTGGCCTGACTCTAGTAAAGTGGATAAAATTAAATCCACATTTGAG AAGATCCACAATATGCTTAACTGCTGTGGTGTTATGTGTACAACTCCCAT CCCATTTGGGACAAACTACGACCATGAGAAGAATGAGACTGTACTAATGC AAGGCATCATTGATACAGAGATGAGGTTCATGAACATTTGGCTAGGACCG GCAGGTAGCATGAACCAGTCAAGTCTTTTGCAAGACTCTCAAATCTTCGA GATGTGTGGGAAGGGTGCTTGGATGCATGGTAGTAAGCTGAAGATAGCAA TAGATGGACCGAAAGTCGGAGAATACCTAATCGGTGATGTAGGTTATCCT CTTCTCCCATGGCTACTCACACCATACCAGGAAAAATACCTCTCAGACTC AAAAGCTGAGTTCAACAGGAGACACACCGCAGCGACAACATGCGCGATGA AGGCACTGGCAAGGTTCAAAGACACATGGAAATACCTTAATGGACAGATG TCGTGTTCAGACAATATAAATACTCTAGCTAACATTATCTTTGGCTGCTG CGTGTTGCATAACATAGTGATAGATATGGAGGATGATGCAGACATGCCAA GCTCTGACACTGATGATTGGAATTACAGTCTGGAAGTGCGCCAATTAGAA AATGAGGATGCTGTCAGGGCGAGGGATATGCTGTCGCAACACTTCTTGAC GACCAGCCAAATCAGGAGGTGCATTAAGCCATTAACACAATTTTTCCTAG AAGTACATCTTATTCTGTTCGGCTTGGTTGCTGTGTGCACTAATTTTTTA TCCTTCATCTGTTTAGTCAGCCTAGGGGATGCACTGGAGGACTATGAAGT AGAAGCATCAGGCTCAGGGGATGAAGAAAATCCCACCAGGATTCGAGTGC CCAGAGTCCCCAACTCCCCATGGTTCTTAGGTTGCTTCTCCTTTCAAAAA AAAAAAAAATCAACAGGGACTAGTCCATGTTGGTGTCATTTTTTTAATGG ATGCTTCATTTAATTTTTCGAAATGGATGCTTCATTTAATAGCATGCATG ATATGTCAAACCCTGGTACTGCGGTAAATGGTTGCTATCTGACATAACTA AAATCTTGTTTGATCAGGTGAAAGGGAAGCCTGCATTATGCTGATTGGAG ATTTTGGATGCATGAATCCAGAGCACCCACGCAATGGAGCCAGAGACTAA TTTGAGCTCAAAATTCAAGATCAGTAATTTCTACTACCTCCGATCCATAA TACACTTGAAGGAGAGTATTAAATTTGGTCATATATTTGATAAAGACAAG TGTTACGCGAAATGCACTTCAGTTAGGGGTGATAAGATTTTGTTTGTTGA ATAAGAAGGCAGTGTAGCTTTATGGAAACTATCTGTGATTTCCATCTATC AGTTGGTACTCTGTTAGCTTCAAGTGCATTCCAGATAAGTCAGTCGTTAT AAAGAGAAGAACAGAGATGACCGTCTAATTTGATACCTGTGAATTCAGAA AATGTTGCCGAAAAGGGCTGGCGAGGATGTTGCCGTGGGTGAGGCCGGCG AGGATGTTGATTTTGAGTGGAGCAAATTTAGCTCCTGCATCGTTCGCAGC GCCCAGCTCGTTGCCGGCCAGGGCAAAGGAAATATTTCCTTGGTCTTTAC TTGTATACGTACAATTGTTCAGATACCGACTTACTATAAGCAGATCGTGG AAGGACTTGGGCTGTCTGCTTTAAGCACCCATTTAGATCATTTTATGGCT TATAAGCCAAAATCCAAAAACAAGATTTAGGTGTTTGGTTTCCAGCCACA ATTTGACAAGCCAAAGTTTGGCGATTTGGTATGTGTTTGGTTTTTGTGAC ACTTTGGCTTCTCATACTTTATTAACCACATGGCTCATCTGTCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.