Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002836

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002836
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002836
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCACCACACCATCCCAGTTTCTGTCCTCTTCCCCTGGATCAAGAAGTG
AAGAGAAGAGAGGAGAACCTCTCCCCTGAGTCTACCTCTCCCCTCACCTT
TTGTAAAGCATCAAGCCCCTCATGTGCTTCAACCCTTCCCTGATCAGATC
CCTCTCCTCTCCACCTCCAGCCCATCCAGGCGCCAGAGCAGACCTGGAGG
AGAGCCAGGTACCTCCCTGTCCTCTTCCCCTTCTTTCCCATGGTTTCTTG
TAGATAAGACCCTAGTCGACCCCCTGTTGATATCTCTGTGGTGTCCCTTC
TCGAGTTTTGCCAGGGAGTACCAGGCCACCGTTCTGCTTCGCCCGTCGTC
CAACACCAAACCCCGCAGCTGTAGCTTGCCGGAGGGACCTCGCCGCCGAC
GGGAACCGCAGCACCAGGAGTTTGGGGAGCACGAGCCACGTCGACGATCT
GGTCCACCTCGAGCACTCTAGTCTGCACCCGTCGGTCGCTGGTGAGTCCC
TCTCCACCCCAGACATGGTACCCATCTCCCTCATGTCCTGTTGTGCCGCC
CTGCCGCAGCCCCTTGCCGTCGCTCGCTGCACTGCGTGCCCGCGCTCGCC
AGACCAACACCGCGCGCAGCCGGTCGAGCAGCCGTACACCCGCCTTCCTC
TGTTCCCGACAACATACCAGCATCCTCGGTCCACCCCCGGCGAAGAACTT
CACATCACTGCGAAGAGGGTACTCCCCTCTTTCCATATCACCAGACCGTG
ATTCAAACCATTGGTCGTAGCTCCTGGAATCATCCTCTGTAGGTCGTAGT
TTTTCTCTCGGCGAAACTGTCTTTTTCCGTCAGTTGTTGCAACATCTTTT
CCCCTATGTTCATCGCGAGATCCCAGCATACACGGTAGTTATTCGGTGAT
AGTTCCTTAACAAAAGTTATAGAACTAGCCTCCCTCTTTCTAAAAAACCA
AACCATGCCCTAAGCGGAGTTCTACAGAGACAGCAATCATCTGACGAAGT
CAACACGAAATCGTGGTAACTTCTGAAATTTTTCGTTCGAGATCTGAATA
TGCACTGTTCTTAGACTTTTACCGGCGCGTACAAGCTTCCTATTAAGAAA
CTTACTTATTCTAAGTTGTGTATAATCGCTCGATCTAAAACTTCAGTTTT
TACGTAATCTTCAACTTATGCACCGTTTAGTCGCCATCTTCGTTCTAAAT
CAGACCGATTTTATTCAAACTCTAGATCTGAATTCAGATTCGTGAGAGAA
CCTGCCAGAACATTTTCTATGTAGGCCCCTGTATTTTCCTGGAAATAACC
CTGCGTCCCGCGCCTGTAGCAGATCTCACACGTGTCATCCGCCCGCTGGC
GTGCGCACGCGCTTGGGTCGTGGTGCATGGGCCAGCGTGTCGGTCTCCGT
GGGTAGAAGAGCTGTGAGTGAGAAAAACCAGTCCCTGTTAGATAATTCAA
AAACTCAAAATGTTTATATTCTGTTTCAAATCTAAGCTGTTAATAACTTT
TGTATAACTATGAATGAATTTGGCCAAACCCTTAATATGAAAACTCTTCA
CTTTTCAAAGATGAACCCAATGGTTTATTCAAATCTGTTCAAATCTAATT
CAAACTAGTCCAACCTTCGACATTCACCCCTTTTAATAATTTTGATCTTA
ATATTAATTTAAATTCACAATTCTAAATAATATAAAAAACATATGCTTTT
GGATCAGTAAAATGTGAGGAATATGAATATGCTAATCATAATCTCATTTT
AGCAAATTAAAAATTTCGAACTATTAAATTATTAAATGCTAATAAATGCT
TTTTCTTAAATATTGTATAACTTTAAAACCGTAACTCCGAATTCGACAAA
TGATATGTCTAAATCGATTAGCTCGACGAGACCGTTCGAACTATGCATTC
CATGATATAAATTGAAGCATGCATCATATAAATATTGAATAATCAGAACT
GTTTATGGGAGTAAAACATGCCTAAATAAATTAACAAAGTGCTTTATTAT
TGTTTTCTCACCTCACCCATGTCATGCTATGTTATACCATGTAAATTGTG
CATTATATCACCATGGCATACCTTGTTTTGCTTGTACATATGATTTATAT
GATTGCGTGGTGTATTTATTTTGGCCCTTGTGTGTTTGGTTTTTATCCGA
ATAGACGCCGAGCAAGGATCTTACCAGGAGACTCAGGAGTTTTACCCGGA
GCCATCTTATTCTCCAACTAAACTGCCAGTTAAGCATTTCCCCATGCTTT
CACTACATATAGTACCTATTGCATCTATCTTATTCTTGCATCATGTGTCG
CGATCCGAATAAAATTGAATCGCAAGTATTGCATAGCCTTTTACTTTTAA
ACCCCACCAAAGCTTGTTCCCTCCATCCTATGAGCCATTACTATAGGAGT
TGTTTGAGTCATGCGGGTCGTAGAATTGCATGTGTAGGGTTTGTGAGTGT
CTTTGAAGAATGAGGTATCCAAACAACTGAATTGAGTAGTAATGGGATAA
CTAAAGAAAGAGGCACCGATGGGCAATAGCTGAGATTTGGTTTTTATCCG
CCCACTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTACTTGATTCTTGTTCCTTGATT
ATCGTGCTATCCACATATGGGACCATGAATCCCCTTAACCCTAGCTTGAG
TCATATTTAATTTCTAGGGGCCACAAAGTAGTTTGGGGCTTTATTACTAT
CATATACTTATGCCATGCTTTACTGCTTTAATTACTATTGCGCGTGGAAT
GCCTGTACTGTTTAGGTAAGTGGAACGTTTTCGCGGTATCGACAAGCCTA
GTCATACTTTCGGGTTCCCAGTCGTTTACAGCCATTGACACAAACCTCTA
GGTCCGTCTCGGAGCCGGCCAACTTCGTCACGGGTTGCTTAGTGGGGTGG
CTCCCTGAAATCAAATATGAATCTTGTAAATGTTCTGTCGTGATGCCTCG
TTGGGTTTTCATTTGGTTTTTTGAGGTTGATCGTGCGTGTGTTGCTATTT
GTGCACCTCTGCAGGGTAAAACTTTCTGAAAGCCATGTCCGCGGTAATGG
ACGACTTGGAGCATAGTTTCTCGATCATAGACAAGCATAACTAAAGTACC
GTTTCTAAATTGACTAAGACTTGACTAGTAATAGCGCAACCCTCATGGAA
TGAATAATAAAATTTCCAACGGATGGGATGTTCTTCCGCCTTCTCGTTTG
GGAACGGGGAGATGGGTGAGCGAGTTTTATTAATATCGATATATATCTGA
TGGGAAATTAATGTTGTTTACTTAACGAGCGTCCGTCTATCATTGGTTAG
GAGGATGTTGTAGCGTGTCTCTATAGGACTGCTAGACTTTATTTTTTTTG
CCGCAATTGCATCACCCTCAGGTTGTTCCCTTTAGATGCATAAAGACTTG
CTGAGCCCCTTAGGGTCTCACACGATAAATATTTGGTTCAGATGGATAGG
TTTACCCACAGGAAGGCTACTGGGTTGAAGAGACCGATGATGGAGGCAAC
AACCATCTGGCGTAGAGTTTCCGGGGTTTGGAGATCTTGAGATCATGTGG
GTGGGATGTGCTTATTTTTAGGGCGTCTTACGCCAATTTGCTTCTTATCC
GTACTCAGATCTGTCTTCCGCTTCCGCTTGATACTCTGATGTGTGATGTT
TGAGGATGTATCCTAACCATTAGAACTATCTAGTAATTTGAATCTTGTCG
TATAGCGTTGCATATTTCTATTTTTTTTAGATGGTCTGGCTCTGATGTAC
TCTTGTATGTCGCTATGTTTTCGCATGCCTATCGACTACGCCGCTCGTAC
TTGTCCCGATATTCTTGCAAAGTGGATGGGGTGTTGACCGGTATCGTGTC
CTGTTCCGCTCAGACGGGACCTACCCGTGGGTGGCCCCGGCCTCCTCGGT
AGGACACCTCAAGCACTTTGGGTTCATTCCAGGCTTGTTACTTAGAGCGT
AGTGTCTGAGGTATTACATCTGGTATCAGAGTCATTCCGCCCTTCAGGGT
CTCAGCCAAGATGGTCGTTGTCAGTCTAGAAAATATTTTTGGTAGTTATG
TATATTAGGGAAAAATAAAACGTGAGAATAGGACTGCTTCAATTTTTCTT
CTTACCCACCCTTTTTCTGGTAAGGAAGTGTAACGTTTATCAATCCTCTT
CTAAAAATTCAACTTAGGATTCTCGTGTTCTGGGTTTCCGTAGTACCATA
GGATGTGTGTTGTTAAATCCCTTGTTTATCTGTTGCATCCAATTTGTTAT
CGTAATCTACCTCTGGTTATCAACTGCCGGTATATTCCATACCGACAGAC
TTTTATGAACCGACGCAATCTATCATACTCTTTGTAAACCGATGCGATTT
GTCTTACTCCTTGTTACCGACGTGATCTAGTTAGGGGTGTTCGATATCTA
AGTATATTTTCACGTGATGTGGAATTGCTAACTTTCATCTGTTAAGTGAT
TTTGCGCATTTAAGTGATACTATTGTCGGAGTTGGGCCGCACGAGTTTTC
CTATTCATGTATGGGGTAATGCTTCGAGTGCGGGATGGAGTCATGACCAT
ACCACTACTCTTAGCATTCGCTCTCTTTCATTCAATTGGTGGATTAATGT
GATTTTACTATGCTCAATGGAAGATTACAATGCTGAAAATTGTGGAATTT
TTTTCTTTGGTTGATTCGTGTTTCACACTCCTTTCAGTCGTGTGCGATAT
GTTAACAATCTCTTAGGTGCTATAAACTTTGTTTGATATTTTAATATCAT
CTTAGTAAATTGTATCCTTTAATCATGGTTAATTCCATTTTTAGTATTGT
TCTGGGTTACTAAACAGTTTCCATTATGGTACTAATGTAAGCTCTTGCAT
CTGTAACAGGATGGCGCCTCCGTCGCGTAAAAATGTGGAAGAAGAAGCTC
CGGGATTACCAGAGTTGGGTGCTGCTCTTGTCAGCATTGCTACTACACTG
GGGGCAATGCAGCAGAACCAGCTGAGGTTCAAAGAAAGCGTCAGGAGGAA
CGAATTTTCTCCACCTCCTCCACCTCCACAGCGTGGCACCTTAAAGGATT
TCCTGAAGTTTAACCCTCGGCAGTTTGAGATGACAGTCGAGCCACTCGAT
GCAGATGATTAGCTCCGTGAGACCACAAATCTGCTGGATACTGCTGATGT
GACTGAGCAGGACAGGGTCAAGTGTGCTACTCACTTGCTGCGTGGAGAGG
CCGCACTTTGGCGAGAGAACTACCTGAGGTCAAGCCCGCCTAGTTTTCAG
CCATCTTGGGGGCAGCTCTCTGATGCCTTCAAGGAACAGTACCTACCTGA
GATTGTGATGGAAAGTATGAAGGAGGTGTTTCTCAATCTAAAGCAGGGCA
ACGACAACATCAACACCTATATTAGGAACTTCACTAAGCTCTCTCGCTAT
GGAGGCGATGAAGTGTTTGATGACAAAAAGAGGTAGAAGAGGTTCCGTCA
AGGTCTCAAGCCTGCGATCAAGTATGCTTTGACTCATGCAAACACCAGTT
CTCTGCTCAAGCTTCAACAAGCGGATCTCCAAGAGGAGTCGAGCAAACAG
GCTTATGAAGAATCCAAAAAGCATAGCCGTGATGTTGGGTATTCCTCTGG
GGCCGCTCCTTCCAAGCACCGCGTGTGGGTTCCTGCTACCACATCGTCGC
TCCCCGCTCCTCCAAGACCGGCAAGTTTCGCTCCAAGGCCACCACACTCT
TACAAATACGCATCTGGGGGCTACAACAGCAACTACCCTAGGGCGCCGTA
TGGTGGTTACTCGGCTCCACGCCCAAGTGGCGCTTGCTTCACCTGTGGTA
ACTTTGGGCATCAATAGTGGAATTGCCCAATGAACAACAACAAGTCTCTT
CCTCCACCCCCGCTAAGACCCGCTTCGACTACTTCTTTGGTTCGGCCACC
TACTCTACGAGCTATCAACATCAACACTAAGCCCGGGGAAGCTGTCACCC
GAGTCAATAACGCCAACCTCGTTCAAGATGAACATGCTCCTAGAGCCGTA
TTGGGTACGATTCCCGTCAACTCAGTCTCTGCACGAGTATTATTTGATAC
TAGGGCATCGCATTCATTTGTGTCTCACAAGTTTGCAAATGAGAATGAAT
TGTCCATCGATCCTCTAGCCAAGAGTTTAATGGTTGTTTCTCCTGGAGCC
CGGATGATATCTTCCAAAATAAGAAATGGTAACCACATTTAGATTGGTGG
CTCGTCTTTCATGGCCTCTCTGATTGTTCTAGGCAACTCGGACATCGATA
TAATTTTGGGCATGGATTGGTTAAATGCTAATGGAGCTGTGATCGATTGT
GCTGATTACTCGGTTTCCTTGAAAATTCCTGAAGGCCACATTGTCTATTC
TCCAAGGCAAAATCCATCAATACAGCTCTACTCTATGGGTGTTCAGAACG
TGGATGTTTTGGCTGCTCTCCAAAGTGTACTAGTGGTCTATGAATTCTCG
GATGTTTTCCTAAAGAGTTACCAGGTATGCCTCCTGATCGTGAGGTTGAA
TTTGTGATTGAACTAGAGCCTGGAACCGCTCCTATTTCCAAGAGGCCTTA
TAAAATGGGACCTAATGAGCTAGTTGAACTCAAGCGACAACTCAATGAGC
AAGAAAAGTTGGGGTTTATCCAACACAGCACTTCCTCCTGGGGTAGCCCA
ACAATCTTTGTCAAGAAGCGAGACTTGACTGATTGACTTTGCATTGTCTA
CCGAGCTCTCAATGCAAAAACAATCAAGAACAAGTACCCTCTGCCTCGAA
TCAACGATCTCTTTGATCAGCTAGCTGGAGCTGTGGTGTTCTCTAAGCTT
AATTTGAGAAGTGGATACCATTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCACTAG
CCCTTTCCATCAGTTCGGACTGTTGGTTGCGTTGGCTAGTGCATGAAGCT
TATCATGATATCAGAGCCTAAGGTCTCGAGTTCGAGTTCGAGTCCTGGCT
TTCGCAATTTATTCTAAAATTGTTGTTGACCCCTCTGTGTCCACGTATAG
GCCTCTTGAGTCATACGTGAGTTTCGCGCGCCGTCGCTCTCTTCCGGTTG
CACGTGCTGACTTCTCCCCGTCACACGTGAGAGGGGGTGTTGAAGTGTAT
AAGTGGATTGCACTAGCCCTTTTCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGTTG
GCTAGTGCATGAAGCTTGACAACCATCAGATCAAGATTCGCAAAGAAGAT
TCCTAAAACGGCGTTCACTACTCGCTATGGCATGTATGAGTACATGGTCA
TGTCCTTTGGTCTCACCAATGCACCTCCTACATTCTCTAGGCTCATGAAC
TCGGTCTTCATGGAGTACCTCGACAAGTTCATGGTGGTTTATCTTGATGA
TATTCTTGTCTATTCCAAGTCTCAAGAGGAACATGCTGAACACCTCCGTT
GCGTCCTTACCAAGCTTAGCGAGAAACGTCTCTATGAAAAGTTCTCCAAG
TGTGAATTTTAGCTGCCAAAAGTCACCTACCTGGGGCATGTCATCTCTGC
AGAAGGCATTTCTGTCAACCCGGAAACTATTCGGACAATAGTGGAGTGGC
TTCCTCCGAAAAATGTGAAAGAAGTCTGCAGCTTCCTCGGATTGGCGAGT
TATTGTCGTCGATTCGTCCAAAACTTCTCCAAGATTGTCAAGCCTCTTAC
CGATCTCCTCAATAAAGGCAAGAAATACCTTTGGACACCGGCGTGCCAAA
CAAGCTTTGAAACTCTCAAGGAAAAAAACTCACCTCCACTCCTGTCTTGA
TTCCTCCAGATACATCGAAGCCCTTTCAGATCTTCTGTGATGCTTCACTC
CAAGGGCTTGGTGCCGTTCTCATGCAAGATAAGCAAGTCATTGCATATGG
TTCTTGTCAATTGAAAACTCATGAAGTCAACTATCCTACTCATGATCTGG
AACTTGCAGTTGTTGTCTTTGCTTTGAAGTTATGGAGACATTACCTTCTT
GGCAACAAATGTGAGATTTTCTCGGATCACAAAAGCCTCAAATATATATT
CACTCAGCCGGATCTTAACCTTCGGCAAAGGAGATGGATCTCACAATCAA
CTATACTCCAGGCAAAGCAAATGTCATGGCTGATGCCTTGAGCCGTAAAG
CTTATGTGAACAATCTCAAGGTGAAGAAGTATGAGCCTCAACTGTGTGAG
GAATTCAACCAGCTCAACCTCAGCCTTGTTCCTAGAGGCTACCTTGCAAC
CTTGGTAGCTACTCCTTCCTTGCAAGAAAAAATCTGTTTTGCTCAACTGG
AAGATCTCTTTTGTAAAGAGTATGCAATAAAATCCCAGAATCCAAAATAT
GAAGCATACCACCTCGATGGTCAAGGCACCTTGTTATATGATCACAGAAT
GGTTGTTCCTGAACTTCCAGGCTTGAGGTAAGAGGTTCTGAAAGAAGCTC
ATGATTCTGTTCTTTCCATCCACCCCGACAGCACAAAGATGTACATGGAC
TTGAAAACACAGTACTGGTGGCCAGGAATGAAAAATGACTGCGCCAAGTA
TGTCTCTGAGTGCGATGTCTGCCGCGGAGTGAAAGTTGTCCATCAAAAAC
CATACGGCCTTCTCTAGCCTTTGAAGCCTCCAGAATCAAATTCTGGAAGA
TATGCTTCGCGCCTGTGTCATCTCTTTCGGCATGAAGTGGGAGGAATGCC
TTCCATATGCTGAGTTTTCCTACAACAACAGCTTCCAGAAAAGTATCAAG
ATGGCACCCTTTGAGGTTCTCTATGGCCGAAAGTGCCGTACTCCTATTGG
TTGGTCAGGTGCAGGTGAAAGGAATTTCTTTGGCCCTGACATCGTCACCC
AAGCAGAAGAAAAAGTTCTTATCATTCTTGATAACTTGAAAGTTGCCTAG
AGTCGGCAGAAGAGCTACTATGACAAGAAACATGTGGCTATGGAATATGT
TCCTGGTGATTTGGTTTACCTTCGTGTCACTCCCATGAGAGGCACACACC
GGTTTGGTATCAAGGGAAAGCTCGCTCCGCGATACATCGGTCCTTTCAAA
ATTCGTGGAAGAAGAGGAGAAGTGGCTTATGCATTTGAGCTTCCTGAAAA
AATCAAGGTGCACAATGTCTTTCACGTCTCATAGCTCAAGAAGTGCTTCA
AAGACCCCGACAAGACCGTGGATCACGAACTCATCGACCTCCAAGAAGAC
CTCTCTTATAAATAACACCCCGTGAAAATTCTTGAAATCGCAGAACGAAA
GACTCGCAACAAGTCTATAAAATTCAGCAAGGTGCAATGGTCGCACCATT
CCGTTGATGAAGCAACCTGGGAGCGTGAGGATGACCTCCGTTCCGAGTAT
CCTACCTTGTTCCAGTCTTAGTCTTCCTAGAATCTCGGGGCGAGATTCTT
ATTTAGTGGGGGAGAGTTGTAGCATCCCATCTGTCTAACATCTGTAATGC
TACATGGTTCCTAATAAAATGCTACTTCCTACATATTACTCTTGCATTGC
GTCATCAATATATCATGCTCATGTCACCATGCCACATTGCATTTGAGCAT
CATATAAAACCCCTTTTGTTGATTTTTATTCCGTATGCATTCATATTGTA
TTACTTGTATTTGCCTCTTGATATATTGTAGTTGGTTCTTGATATAATGC
TTAATGCCCAAGTTGAGTTGGGGGCATATCTTTTATTGACTCCACCATCT
TTCCTTATCATCACCTTACAATTCCACCATCCTAATTATATATGAGCCAT
TGCAATTATTTTTGGTGTTTAAATCTAGCTCATATGTGTTGGGAATGGAT
CCACTCCTATTTCTACATGCTCCCATATGTGATATATGTTGTTTTCACAA
TGTTGAATATGTGGAGCCACATGGCCACCTTTGCATGCTATGTGAGTAGA
ATATCTTCTCTATCTTCTATATGGTGTGATTTGGAATATGTGAGCATATT
GAATATATAAGAGGCTAACTAATTATCTAGTGGAAACCACACACTAGCAT
TGCCCCTTTATATTCATTATGCTTATTTTTCATCCACTCCATAGGAGAAT
CAAGTTGTAGATTTTGCATTGGCCTTATTCATTTTGAATGCATGTATGTA
TATATGCCCATGTGTGCAAATAGTTGTTTTCACAACTAGTGGTAGTGGTC
ATTTATGAATCATGCATGGCCCATGCAAGCTCACCACCACCTTCTTTCTT
TTGGTTTCATTGAATTTGAAGAAAGCTTCTTTGATTTAAATCCATGCAAG
TTCATTCAATTCCAAATAAAACCAATGGTTCATCTAGTTACATCCACCTT
GGTTTCTTTTGGTTCTTAGAGATCTTGTTGACCTTTTTTTGTTTAACAAG
CTTGTTTGATTGGAGTAAAAGAAAAAAAAGACAAAAGGGAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.