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GrainGenes Sequence Report: AA019259

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Sequence
AA019259
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019259
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATGGGCGCGATTGCATCTCAACGGCGAGCAGCCCATTGACCCTCTCCTC
TCTGGGCAGCCGCGGGCTCACGCACGGCAACGGGTCGCCCGGCCCAATTC
TGCAGCGGTGCTGTCCCCAATCTCAGTGCTTTGCCTTTGTGCAGCTCGGG
TTTCCAAGCGGAGGCGGAAGAGGCGCTGCAGCGCGCGGCCGAGTCGACGA
ACTGCCGGCGGGCGGCTGGAGATCAGGGTTAGGTATGTCCTGTCTCCTGT
GGTCGCATTTCCGCCTTTACATGGCATCAGATTCATCCTTGCTTAGGTGC
CAACTTGCATAGTGGCTCCATCTAGTATGATCTTCTGATAGTGGAAGAAC
TCCGGTAGTGATTTGATCTGGTAAAACACATGTTTGAATCTAATCCCGTA
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ACTTGTTTTAGGATTTGCTTAGTACAGAACTTAATGTACGACCAATGTAT
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GGGGATAATCCCCACCAAACCCCAGATCCCCACTTACTGCTAAAAGCATG
TTTGATTCTAGAGTATTAGGCTAGTTTAATCCCCACTTTTCCCCAAATTA
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AAGAGATGCAAGATAAAATAAACAGCAAAGTAAGGGTACCATGGTACACA
AGCCAGATTACAATTTGAAAATGATTAGGTTTCAGTTTATTGACAATCAA
CAACGACGCAGTTAAGAAAATTATCAATCGTGTACAAGCAGATGCAACAA
CAACTCTAGTGAGCGTTTTCCTTTCACCGTCCCGAAAACTTGCTTATTTC
TGTCAGCCCACCAGCATAACCAGACTGGAAGGAGCTCCCCTCATTGCTTA
CATCAGATGCCATCATCCGGAGCTGCTTTGGAATTTTTGTATCCATGGAG
TTCTTAAACCGAGGAGTCCCAGAAACAGACTGCTTTTCGCTTGAAACTGC
GGGCAACAACACTCTGAGCCTTGAAACAACCTCAGTCATGGTCGGCCTGT
CGATGGATGCACTTTCGACGCAGTTCATTGCAAGGTCTACCACACTCTCC
AGGGAACTGACATCGTACTGATCCAGCAGCCTCTTGTCAACAACATCGTG
AATGCTGCCCTTAGCTATCTTTTGGCGCACCCAATTTGGCAGGTGGACGG
TTTGAGGGTCCAGAAATACCGGGGCCTGGCCAGTGATGATCTCCAAGAGT
ACGATGCCAAAGCTGTAAACATCTGTCTTGACAGTGAGTTGGAATGTTGC
ATGATACTCAGGGTCAAGGTAGCCAAGAGTGCCAGCAGCAGCTGTAGATA
TGTGTGTGTGAGCATCGTTAAAAGCCCGTGAAAGCCCAAAATCAGATATT
ATCCCCACCAGATTCTTGTCCAGAAGGATGTTGGGGGTCTTTACATCTCT
GTGCACTATTGACGGGGTGCATAACTCATGCAGATACTCCAGTCCTGTAG
TTTATTCAAACTTTCACTTTGTCAATAGACACATACATACATATGGACTA
AAGGCTAATACACAACTGAAATGCGGACCTTGTGCAGCATCAAGTGCAAT
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TGACGATCTAGGTATACGCGCGCGACTTGTAAACCGAAACGGAGGGAGTA
ACAAATTATGGTTACACACACAATCATTAACCAAAGCAACATTCGGTATA
CTACTCAGCACGTTGGTGCTTGTCAAGACCATGCTTGGAGCCATTCCGAT
CTTTGCCATGATGTCATTGGACATTCCGGCGAAGTCGCTCAATGGAGTGA
GGAAGGTACTCCGAGGTTTCCTATGGTATGGTCGTAAGGATGCGAACGGT
GGATATTGCCGCATGACTTGGGATAGAATTTGCGCTTCCAAATCGTTGGG
AGGCCTGGGGGTTCCAAATCTACAGTACTTGAGCATCGCTCTAAGGACGT
GGTGGTTGTGGCTCAAGCAGACGGAGCTGGACAAGCCATGGGGAGCGTTC
AACATCCAGGTCCCCAAAGAGGCACTAGGGATCTTTGAGGTGGAAACGAG
GTCCCATGTCGGCGATGGGAAGAGCACTTTGTTCTACACTGATAGAATGT
TTGAGGAAGCTCGTTTGCGGGACAGATTCTCGAACTTAGACCTCATGGGT
TGAGAAGAAACCCCTGGGAGTTGTATGGTGGCCAAGTCCTGTCGTGGAGA
CTGGTTGACAGACGTGGGAGGCCGCGACCGGCGAGTTCTTCACCCTCTGG
GGATCATGTATGAAGTGCGGCTCACCGAGGAGAAAGACCACCTCCAGTGG
ACATGGGAGGGCGATGTCAGCTACTCAGCACGTTCAGCCTATTGTGCTTA
CTTTGCTGCCACGACGGTGGACCTGACAGGCGATCAGTTATGGAGACCGT
GAGCACTGATAAGCCTCTTTTTTGCATGGTTGTGGCCAAAAAACGGTGTT
GGCAAGCCGACAGATTGGCAAGGAGAGGGCTACCACATCCGTCGAGGTGC
CCTCTATGTGACCAGGAGCAGGAGACTTTATCACACTTGTTTAGGTGCCC
GACAGCTCGGGAGATCTGGCATGATGCACTCAGTTATTGGCAGATGCTTC
AGTGGGTGCCGACGCCGGACAAGCCACTTGAGGAATGCTGGACGTCGCAC
TCACGTGGCCGCAAGATAGGTGCTAGGTTTTTGGACGATCCCGATCTTGA
TCATGTGGTACATTTGGACATGCTGCAACGATTTCATCTTCAACGGCATT
ATGGTGTCTGACAACAAGGTGATTCATCAAGACATAAAGACAGAAGAGGC
GCAATGGAGGAGAACGCGAATCCTCAGATGTGAGCCTGCAGGAGACATGG
CCATTCGGCCAGCACGGTTGCCTCATAGAGAGTAGTTGCTTTATGTTTAG
AGGGTGGTGTGGTGTAGCGTGTGTATGTGAAAGCGCACGGCGAACACCAT
TTGAGTGGTGATAGGGTTGCATATGCCATGGGCATGTACTGGCCTGGCAT
TTTCTTTATATGAAAATGACATGCCTTTCCATGGCGTATTCTTGAAAACA
TCTGGTATACTAAGATCTAAGACCTATATAAACATGAACTTTGACCTTTG
AGAGATCATTGCTTTTCCTCCTCTTCAACAAGTTTTTACATAAAAACCCA
ATTAACAAGTGAACCAAACTACTGAAGTATTATTTGAATACGTACCTCTC
TACTTGCTTCCTTTGAAAGCTATACATGTTTAGAATTTGTGACTATCTTG
CCATGGTTATGAATGTTTGACTCTATGAATGTAACTGTGGCAGCCTCAGT
TTGTTAAAAAATATTTATGACCATGTGATGGTGAGGACATTCAAAGCATC
TCCAAGAAAAAAAATAAGGTCTAGCAACTCAACTATATTGACTAGTAGCA
ATAATAGTTTAGGTAATCAACTAAGCCTTCAACAAGGAAAAATCAGTTTA
TCATGAATCCTGATTCCAGTGCAATGTCGAATATAGAGTAGTTTGATTTT
ATAAAAACAAAATATTTAAGATGCATGTCAAATGTTATGCTGGGGAGCAC
AATATATTGATAAAAGTCTGAAAAGTAGGTGATTCCTAAGTGGTTAGTGA
AAGTTGTTGGTATCTAGGTCTCTGCGTATTGTTTGTTTTGCTTAGAACCT
TGAATTAGTCAACTTTTTTTAGATTGAACAGATTTTTGGCTTAATTGAGT
AATTCGATTTTAATGAGTCAGTAGAAATGATCTCTATAGCATCAAAATAC
AAGTTATCAAAATAACTAATTGCAACTGCAAGTTGGATTTTCTGTACCTA
AATCAGCTATGCATTACAGAAACATTAATAAAAGTTAAAGAGGGAAACCT
CCGCTTAAAAGTTGTTGAAGATTTCCTCCGGGTAGGAAGTCATAAACGAG
TGCTAGGCACTTCTTGTTTTGGCAATATCCTTGCAAAGTCACGAGATTCT
TGTGATGAACTTTGGACAAGGTTTGCACCTGCGATAGCAATATAGTCACC
AAACATCCTAGATTTGAAGCCAGATGCATCATTTTATTGAATATGGACTG
TGGAAATGGTTATATGTCTTGCCGACTTAATGGTTGAAGAATTTAATGGT
GTGGCCTAGTTGAAATACGCAATGATGTGGCCTAGTTGGTTTCGTGTTAT
ACCTCAGGGAGGAAGTCAGTTGACTCTGCTATTGATGTCTCCATAAGCAC
TTTAACTGCTACTTCATCTCCATTTTCCAGTATGCCATGATAAACAGTAC
CGAAACCTCCTTTTCCAATGATTGATTGGAAGTTGTTCGTTATGAGCTTC
AGCTCTGCGTATGTGAACCGTCTGATGTCAATATGTAGGGGAGTTTTCTC
TTCATATGAAGCGTAGTCCTCATTGTCGCCTGACTTCCCTGCATAGTAAA
GAAGGTTTATTTTACATGGAAGTTTAGGTTTGGAATTGCTATCTTCTACC
ACCTAGAATTGATGGAAATAAATTAAAAGTTTATGGTTTTGTTTTACCTT
TCCGGTATAATTTCCTGAGTATGCACATCCCTACTATGAGGGATATCAGT
ACCGCAGGAACTATCACTGCGATAAGCAAGATAGGTGTGGTGTTCCTCTT
CTTCTTCTTATCCTCATTATTACTTTTAGTATCTGAGCAGTACGTATCTT
TGCTGTTTGCGCATACAGGATTGCCTACTAATCTAGTGACACAGTTAAAC
GACATACATAAGAAATCAGCTCAAAAGAACTCAGCTGCTCTGCAGAATTA
TGATTATAACATGCCTCTATTTTCTAACACGACTAACCTGCTAATAGTTC
TACTAAAGAACTCTAGCCTCAAATGACAAACTACATGGTTTCTAAATCAC
GTGCTGTTACAAATAGGTCCTTTCCTTCCTCCCATTTTAAAAGTCCTAGA
TGATAATCTAGTAAGGAATTGTGCGACGAAGCATGCCAAACCTTAAGTCC
AGTAGACCAGCCTGAACTCGTTGACGAATAGAATCAGGGATTGGTCCATC
TATCTTGTTATTTGACAAGTTACTGAAAAATAATAGTTAGAAGCATTCAT
GTAAAATTTATATCATCAGCCACAGATGTAATCAGAAGAGACTTACAGAA
CTTTAAGTGACTTTAGTTGATAGTCTGGAATAGCTCCCGTCAGTTTGTTG
TGTGATAAATCCCTATATACATTTTGTTCTTAGGATCATGAAAGATGTCA
ACATATTCTCGTTAGCCTATCAATATTATATGGTAGGCACCACTTACAAG
TTTTCCAGTGATGTCATGTTCATGAATGATATCGCAAATCCACCACCAAG
TCCACTGCTAGACAGATTTCTGCAAAAAATAAAAACAACTCATGTTAACT
CCAGTACTCTTAAAATTAAGTAATAGCATGGAACTAACATGTATTTTCAA
GATTATGTAAATAGGTTCAGTTTTGTACTAGGTTATATCTACTTTCAAGA
TTCCAACTGAATTACATGTATTTTCAAGATCTTAGCTAGTAAGACATGGG
GCTGAGTTTCTCCATAGTGATATATCTGTAGAAAAAACAACATATCTGGA
GCAACATGCCAACAAAAATGGAACTTCTGTGAGTGTTAAATTGCTTGGGG
TTGATGCAATGCACTTCAAAGGTTTAAAATATTGACTTGTGATGCTTAGA
TTTTAAATGTATATGATATGAGTCCTGGTTATGTTCTTACATCGTGACAA
TCCTCGGATTCTGGTTGCTCTTAGAGTAGTCACAACTCAAACCTTCCCAG
GAATACTCTCTTGGGGAGCATGGGTCTCCATTCCAGCTTGCTCGTGCCAA
ATTGTAGTGTTTCTTGACTTCTTTCATGTTCTTTACTACAAGAGAAAATT
ACAAGGTTAACAAATATGATGGCGTAAAGTAGCTGTATAAGATTACCTTC
AGAAGCAAGTATTATCTAATCATTGAACTGATAAATCGTACTAAATCATT
TCAACCATCTTCCCATGGTACATTGGCATTAGTTGACCTTTAGAAGATGG
CTAACTCCGGAGTCTGTGTGCAACTGAATAAGTTGATTATAAACTTGATC
TTGTTACTCTAGTGTAGATCTTGACAATGTCAAATAAGTCAGGGATCTAG
AGTGAGACCTCGGTCATCAGCATGGCAACTGCATGATGATCACGTGAATC
TGCTATATACATGACAAATGTGTAATGAACTTGCAGTATATTCATGAATC
TTACCATCGTTGGAGTCAGTGGTGAGATTCTCCATTCTAACAAGCGAGTA
CACCTCGAATGCGTTGATGAGTGGCGGAAGACTCGAGCTGTCCGTCTTGT
TCAAGGAGAAGAGTGCGTAGGCGTTTTTCAGGAACTGCCCGTTCTTGTAC
ATGCTGTCCACCTGGAATCGCGACGGGGAGAAGTCTGCAAACAGCAAATC
TTCAGCGCTGTAGATGTCGAACCTCCTGTTCGGATTGCTCCTGTTGATCT
CAGCGAAGTGAAAAACCGGTAGAAGTTGTAGACTCGTGGTGTCTATATTG
GGACCCGTTGCCACGGCGACGCTCATGAAAGAGTAGTTGGTGTCTATGGT
CGAGGCCTGCTGGAGGATGGCCGACGGCACGTTGAAGGCGTCGGTGCCGG
GGAGGCTCTCCACTTTATTGGTAGTGTTCAGGCTGATCCAGGGGTAGGTG
TAGTCGATGGTCCCAGACCAGCTCTCCCAGAACCGGTCATAAGGGTCCGT
TGGGTATCTTCATGGCACACATAAGGAAAAACAGATAAATAGCTAGCACA
GTACACTAATCTTTTGGTCTTAACTTAAATGTGTCTACTATGGGATCTAG
GAATCAGCCCAAACTTCTTATCACCTTTGAGATTTAGTATCACTTTTTTG
TTAGACAGAGTTGCAGGATTCAGAAAACAAAAAAGCAGACACTTTAAAGG
CGCTAAGCTAGCAAAATGAATTTACAACCATTGACAGGCATAATTCAGAT
CTAATCCAAAACTAGTATAAACGGCAGCCTTGTCTCACCTTGTGATAAAA
TCGGTGATGTTGCCGAACCTGTACCGTGTGAAGTAGCTGACTGACACAGA
AGCATTGACAAACGGATACATCGTATCTTGCAGTGGCCTCAGCTCCAAAG
AAGATATGAAGGGAATCCCTGAACCGAAGTTTATCAGGCAGATGGACACG
GAGTTGCTGGGTGCAACGGTGAGCACCTCCTTCCATACTGCGAATGATGG
ATCCCAGTTTGACAAGTTGACCTTATCCCAGAAATTAACCCCAATATGGA
GCCCAAACAGAAACAGCGACCCATCTAGACTCTTGTTCAACCTGTCGTAG
TTTCCGTAAGTAAATGTGGCCCTCAACAGATACTTCTTACCGACGGTGGA
TGGCAGCGTATAGCAATTCCTTGAGCCGTCAGGGAAGCTCCTCAGGGTTT
TTTGCTGTTCATTGGCTGCATCCACCATGAACTCTGGTAGAATGTCGTGG
TTCTGGCCGCTCTCAACAAATTCGCCATCAAAACTGAATGGCATTACTAA
GGCCTCGTCGATGTAGCCACTGCTGTTGCTCCATCCACAGTCGATGTTTA
TGAACCCTGCACAACGGGGAGCATGTATCGGTTTCATGTGTTTCATGTTA
ATGCTCTGAATTATGCGTGCAGATGGAGCAGAGCTTAAAACGGCGCATGA
TCTAGTAGAAGGGAAAAGCTACGATGGTATGACATGTATTACCAGGAGGA
GGCTGGGCTTGGACTTGAATCGTCATGACTAGCAGGATAAGAAGCAGCGC
AGAGGTCCATGTCAGCTTCGCGCCGAAGCTGACCATCATCTGGTGTTATT
TGGTTCTTGTGATGTCTGAAGCATGAAAGAGACGACCTGTGCAGTCATAT
AGCCTTCGCGCTGGATTGGTGGTGGGTATTTTGTTAGTGTTTTGGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.