Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039141

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039141
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039141
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTGAACGTCCTCATGAGTGGTACTAGTTCTGATCCATGCCTGGGGTA
GAATATATATAGAACAGAGTTGTGTAGATCCTCACGTTCTTATGGTTCTA
GGCGCTATAGGCACTCATTTGTGTTTCCTCATGCAAGTTTTGATTTTCTG
CATAAGCCGTGAAATTAGGTTTTAATATGGACTAGGGAAACACTTTTGGT
TGATTATACCACGTTCAAATAACCAAGTTGTTTTTGGTACAAGTTTGTCT
GATCATAGATCCATATCCATGTCACCAAATTCCCAGAATTAGTTGGAAGT
TAGTATCAAGTTATGAGCACCTAGCCTTCACTCCTCGTGATGAGCTTCAC
GAATGAGTGGCATTCACTTTATTCCTAAGTTGCTTATCATCTTTTCATTA
AGTTGATTATTCACTCTAACTTAAGTTTAAGTTTGTTTCCCTAAACTATT
TAGGTTGCAACTTCCAGTCTACCAAGTTGTAGATAGTTGTCCACAAAGTT
GCTTCACTAGGAAACTTGGTTTATCAACTTACTCAAACAAATTAATTTGT
TTATATCATTCCCTTAAGTTGTTTATCATTTATTAAGTTGTTTTTTGCAT
ATCCATAGAATAGGGTTATTCCTTTCCATTCACCACTCAAATAATTGCGG
AGAGTTGTACTTGTGGCGGGGGCTGCCAAGAAGACATCAAATTGTTTCTT
CACACATGTGACTAGTTGTATTTTTGTCTGTGGTATTATTAGTTCCACAT
ACGAGCTAAGTTGTATTTTTAATAATGCTAAGATGTATTTCAACTAATGC
TAAGTTGGATACCCAATATTGCTAAGTTGTATAGTGACTAGGGTTAAGTT
GCACCATTATCCAACATAGTTGTATAAAGAAAAAGCATTGTTGCATACCC
ACTAGGATTAAGTAAATTGTTTCTTCGGCCCTCCTCCATCTTAGCATCAC
CGGTCTTAAAGAGACATCTTCTTCGGCTTCTTGCATCTCGCGTTGCGCCT
CGTGCTCGTGGCACCGGCAACATCCGTGTTGATCGCAATGGAGTTGTACT
TGTGGCAGCGGCTACCAAGAAGACATTAAATTATTTCTTCACACATGTGA
AAAGTTGTATTTTTCTCGGTATTGTTGGTTCCACATACGAGCTAAGTTGT
ATTTTCAATAATACTAAGATGTATTTTGACTAGTGCTAAGTTGGATACCC
ACTATTGCTAAGTTGTATGCTGATTAGGGTTAAGTTGCACCATTATCCAA
CATAGTTATATATAGAACAAACACCGTTGCATATCCACTTGGGTTAAGTA
AATTATTTCTTCGGCCCTCCTCCATCTTAGCATCGCCGGTCTTAAAGCAA
CATCTTCTTCGACTTCTTGCATCTTGTGTTGCGCCTCGTGTTATGCTGGT
GGCACCGGCAACATACGTGCTGATCACAATGGAGTTGTACTTGTGGCGGC
GGCTGTCAAGAAGACATCAAATTATTTCTTCACACATGTGACAAGTTGTA
TTTTTGTAGGTGGTATTGTTGATTCCATGTACGAGCTAAGTTGTATTTTT
AATAATTTTTTATCTCACACATTCGCTAAGTATTGTAGACAGTACATTGT
AGCTTCACATATGTGCTAAGTTGCATACCCATTACTGCTAAGTTATATAC
CCCTACGGTTAAGTTGCATACTTTATCACATCTGTGAAGTTAGATATATC
TACACTAGAGTAGCAATAACTTATTTCAAGAAGTTGCAGTAACTTGCACA
AAATGCAAGTTAGCATCATTATCGTGAACTTGTTTATCGTTGTGCCTAAG
TTGTCTACCAATAGTCCTAAGTCGTCTAGCATCACTATTGTGAAGTTGTG
TAATATTGCTATGAAGCTTCCTAACACTGCTACAAGGTTTACTGTTTTGT
ATGAAGTTGTATTTTTCATTGCTATTAAGTTGTCTACCATCAAAAAATTA
CCAACGATATTACCCAATTGCTAAAAGTGATTAGATGCTGGTTTGCTCAA
TGCAGACTCCGTTTTATGGCCGTTAGATCCACTGGATCAAGTATCACATC
CGTTGCTGACTATTCATTGTTAAGTGAGTATTTAAAAAATTAAATTAGCT
CCAAAATACGAAAAAGCAGTGTAAGAAAGTTCCCAAAAATAGTTTGACAC
TCTACTTCGGCAGTTAGCTAGGTTATCCTACAGGCTGGACTTGTGGGGTA
TCGCAACTGCTGAGCTCTGATACCACTCTGTAACACCCTCAGAATCGAAC
CTATGCAAGTTTTAGCGAAACCCGTCAAACCCGCATAGAAACGATTCAAA
GGTGCCCACCAGGCACTTCCGTGCGGGTGGAAAACGAAGTAATAACATTA
CACAACAGTCCTCGATGGGACCCAGAGAACAGATATATATATAACAGCGA
CTCAAAGAGTCAAGAATACAGATATAATATACAAAGATCCAAATCACCTT
GAAAATGATAGAGCGTCCGACTACGGACAAGATGCAAATGGGGCTAAGAG
CCCTGAAGAATAACCAATGGCGTCCATAACCCTGCCCAGGCCAAGCCGGA
AGGGTAACCCTGCTAACGACGTCGATCTCAAAACCTGCTTAAACAAAAGG
GGTGCCGACAAAGGGCAAAGGAAAAAGAAGGAGCGTCAGTACTGAGGCCA
GTACACGGCGAGGCTAGAATTCGGCGGTCCTCGCCTACATAGGTATGGTG
GACTGAAGCGGCAGCGGCAGCATGCACTAAACAACCTATAGAGACTCGAT
ACAACTGGCGGATATCAGAGAGGGATAAGAATGACCTAACCGGATCCAAC
CTGAAGCTATCACCAACCAAACCCATCCTGGTGTTTCCCCCTCGAGACCC
AACGAGGAAGTCAACCGAGGAACTCACACAGTTGGCAGATTTACTTATTC
AGTTATAGTTGCGGCACTTTACTAGTCAGGTTTAGATAATCATCCTGATA
AAGTAAGCAGTGGGCACTTTTAGTTATTCATTCCGTTGTAGTTGCAGCAA
TTACTAATCAGATACAGATAGCATGATGTAAACCCAAAAACCCAGCAGTT
GTTGGTACTTTTAATCAGCCAATTCCGTTGTAGTTGCCATACTTACTAGT
CAGGTACAATGGTCGCAAGCGACAATCCAAACAAGCAATTGTGGGCAGTA
TTATTAGCCATTCCATTATAGTGAAGCTGATTACTAGTCATTATAAAGTC
AAATTTATAGCAATAAACTTTAGTTATGCTTGTCTATGATCGAGATACTG
TGCTCCAAGTCGTCCATATCCGCGGACACGGCTTTCAGAAAGTTTTAACC
CGGCCGGGGTGCACAAATAGCAACACACACACGATCAACCTCGGAAAAAC
CAAATCAAAACCCAACGAGGTCTTCACGACAGAGCAATCACAAGATTCAG
AAATATTTCAGGGGGCCACCCCATTGAGTAGACCCGCAACGAAGTAAGCA
AGCTTCGAGACGGACTCAAGGTTAGCGCCAATGGCTGTAAGCGACTGGGA
ACCCGAAAGTGTGGCTGGGCTTGTCGATGCCGCGTAATCACTCCGCTTAC
CTAAACAGTACAGTGTGCTCCTCGCACAATCGTAAATAAAGCAGTAAAGC
ATGGCATAGGTACAGGATAGTAAATAAAACCTCAAACTAGTTGTGGCCCC
AAGAAATAAGACGGAATCAAGCTCTGGCTAAGGGGGGCCCATACTCCCCA
TATGTGGATAGCGCGATAAATCAAGGAACAGGTATCAAGTACTCGGGGTC
CTACGGGACACAAGTGGGCGTTCGGAAACCAAATGTTATCTATCACCCAC
CGATGCCTCTGCTTACTTCAATTTTAGTTGTTAAACAGGAATTAAAGTGA
ACAATAAGTAAAACTATGATCATCTCCAACATCAACATGCGGCAATACAT
CAACAACTGTGGCACTTGACGACACGCAACAGCACTTGAGCAAGCGACTA
CGACGCGCAAGTCCAACTATCTACCAAACAATAGGTAATAGGATGTGTCC
GAGGCAATATAGGGCTGCAAGGGATATCACGGGTACGGAAAACTAGAGCA
TCGCAACACAGATAGCAATAGATCAACAGGAGGGAAGTAAATACTATAAA
AGTAAGATAGGTAGAAAGAGGGGGATGCTCGCCTGAAAACATTGCCGAAG
GTTCAACCGAAGATCGGGGCGAAGCTCACATAAACTCAACGGCCTTATCC
GCGAAGAACCAAAGCACTAGAATAAACACCGGATGCAATATTTTAATACT
ACGGCAAAAGATCGGCATGATGCATGTATGATGTATGACATGGCAAAGAT
GCGATGCAATTAGGTCATATTAAGCGGAACCGGGGTCCCGATATTTAATT
AGATGGTTCGAGTTATTTAGAACCCCCGCAATTTAAATGTTGTTTAACAA
GGCAAGATATGAAAACGGTTCGATGCACAGATTTAAATGAGGCCAATATG
AGACTAGATTTGCCCGCATATGGGCCCCATATTTAATTATATGATGGATC
GGCATAAGGCCCCCAAACCACAGACAGGTATGCATGCATGACCAATTAAT
ATGCGACAAGTTGTATTATATTATAAAATAGGGTTTCGGCAAGGGGTTCA
CACATTAGGGTTCGGCAGTTATTGGTCCAGGGGTTCGGGGTCCGGTCTCA
GGGTTCAGGGTCTCGACGGAATCGGTCTCGGATAACTGAGGTGGATCTTG
GCGTTCCGGGAAGAAGGGCTTGGTTCGGTGTCGAGGGCGCATCGGATCCT
CCCTGGTCGGTGCCGATCTTGTCGTCGATGGCGAACTTGAGTGGGTCGGG
TACCGGTGTCTTCAGATCCGTGAAGTAGATCTTGTCGCACGGTGTCCGGG
GTAGACGAACTTGGCGTATTCGCATCGGCGATCTTGGCGTCCTTCCGAAT
CGGGTCCTGGCGCTTCGGATCGGTCTTCAGGGGTTCGGGGAGTAGATCTT
GGCGCTCGGGTTCTCGACGAACTTGGCGTCCGAGATGAAGGGCTCGTCGT
CCGGGACTCCTCCGAGTCCGTGTTGACGACCTTGGGGTTCCGACTTTGGT
TGTTGGCCGTGAACTCGTTCCGCGAAGGTACGGTCTTCGGGTCCGGGAGG
AAGTACTTGTTGTTCCGGGAAGGAGAGCTTGGGGTTTCGAGACTTCAATT
GCCGATGGCGAACGTGGACTTAGCACCGAATGCTCGGGCGGCTTATCGGG
GTACTAGTCCGGCTTGCAGCTATCGTTCACCGGACGGAGTATATGCAGAG
TCACCAACTTGCAGTACCAACAACACCACCGCAGGACCCCTGTCTACATC
ACCAGGAGGGCGCCCGCGTGGCTTGCTGTGGCACACGCACGGCAGCAGGG
CGGCCAGGGGAAGGCCAAGATCGACCGACGCGGCCAGGGACGCGCAGGAA
CACGGGGCAGCGGGGCCGAGGCGTCTGCGCAGGCGCTCGGGAACGCGGGA
CGGTTGGAGGCGCTGGAGGCCGAGGCGAGCTCCTGGCGGCGAGGTCGGGT
CGGGGAGCTCCCGTCGGCGGCAGCGCTGGGCCCGGAGGAGGGGCGCCAGG
GAGAACGGCGGCGGTTGGGCGCCGTCAGGCGGAAGGCAGCGCCGGCGAGG
AAGAGCGGCGGGCGGCCGGTGGCGGCTTGGCGCACGGACGGCGCAGGGCG
CGGAGGAGGCGATGGCGAGACGGGAGGACGAGGGAGCGGACGCGGGCGGG
CGCGGCCGCGCGTCGGTGTGGCGGGCTCGCGGGGGACGCAGCGGTTGCGG
CCGGAACCGGGAGGGGCGAGCTCCTGGCGAGCCCTGCAACGGCGAGGCGG
GGATGGTTGCAGGGAAGGCAAGGCGGGCGGAGGGAGATGCAGCGGCGAGG
CGGCTGCTCGTGGGCCGGGGCGGCAGGGAGATCGAGCGCTGGCCGGAGAC
GAGGTCATGGAGGCGGGGGTACTCGGGCGGCGCGGCCGGTCGCTGAGGAG
GACGGGCGAGCGGTGGGAGGTCAAAGGAGGGGAGACGCGGGGCCTGGCGG
GAGGGTGAGGACGCGGCTCGCCGGAGGGCGGACGCGCCGGCGGTGGAGAG
GATGGTGGCGGGGCGGCGCGCGCGTCGGGGCCGGCCAGGGGAAGGAGAGA
CAAAGAGGAGGGAGGTGGGGGAGAGGAAAGCGTGTGGGGGACGCGGGGCT
GGTGGGGGAGGCGGGTCCCGCGGGTGGGGTCGGCCAGGGGACGGGGCCCG
CGGGTGGGGTCGGGGGGTAAGTGGGAGGTGGTCAGGTGGGGGAGGAGAGA
GAGATTAGTGGCCAGGGGTGAGATGGCAGATTTTGATAGGCTAGGGGGGG
GGGGGAGAGGGTGAGGTGGCACAAGGGGGTTGGTTGGGGTGATGTGGAGG
GGAGGGCTGGGTAGGAAGATTGGTAGATGTAGGATTAGAGATGGACCGAT
TTAGTTTCTGGGGTGGTCGTTCGGGTCATTCGGCCCGTTCGACTGCCCCA
CTAAAATAATAAATATTTTTATTTGTTTTACAAACACCGTTTGCAAACCG
ATATCAGACACACAAAAATATTCCGGGGACCCGGGGTTTGCATTTTGAAA
ACAAGTCGGGCGTTTTAGAAAACAAAACAAGTTTATCTGCAAATAGTTTT
ATGCAAACAATGCATGATGATGACGATGCAATGCACAAATTCAACGCGAT
TTTCTAGTAGTGGTTTTGCGGGATGCCACAAAAAATCAAAAAATTCTGAA
TCAATTACTCTGGATGATCGATTGAAATCACCTACTATCTCAACATCATC
TCTGGTTTATGAATCTTCTGATGAGCCATTGCCTCCATCACCAACCAAGT
TGATGTTATCTCCGGTTTCTGAATTGATGAATCAAGAAACAGTTCTGGCA
GATGATGATAAGAAACTGGATGAACCTAAACATATAACAATAACAAATAA
TGTAATATATGATTATCTCCCACAAGGTAAAACATTTTCTTTATTATTTT
TTCCTTTGTACCTATACTTTAAATGAATAAAACAAAAGTTATTAGATGCA
TTATTTGTGTATGTGTATTTATTCAGCATATACTTGCTTTTTTCTTTTGC
AGATTATACATTGACCGAACTGGATGAAATTGCTCATGATATTATTCTAG
AATCTAAGGAAAGGGATATATTAATGAAGATAGATGACATATCTATCGAA
CAACGTTATTTGTTATGCCTGCTAGATAAAAGCAAATGGCTCGATGATGA
AGTAAGTACCTTACTAACAATGAAATATTTTATGATTATTAACCAATCGT
TAATATAATGTTTTAAATTTTTTTTTAGATAATCAGCGCATATATATGTT
GTTTAAAGGAGCAAGCTCTTGTGCAAAATCATAATGATGCTAAAATATAT
TTTGAGAATCCCTTTGTCACAAGGCTGTTAAAACAAGATGGTCAAAGTGG
AAGAAGTGAACCTACCTGTATGACAAAGGTTGTCAAAAACTATCTGAACT
ATGACATGGTAACATCGATATCCTTAATTAGTTTTAGTATTAGTAGATTT
TTAATTACTAATTTTACATGTCTATATAGAAGTAACTCGTTCTCTTATTG
TAGATACATCTTCCCATAAATATCAAAGACTCACATTGGTATTTAGCTTG
CATCAATGTTGAGAAGTGCGAAATACAAGTACTTGACTCATTGTGTTGGA
AGTTCAACCGAGCTGACCTCATAAATACGGTTAGTTACTATAGTATTTAT
TATAGAGAATTGATCCATCGCTTACGTGTATCATTCTTACAGCTGCAAGG
ACTACAATATCATTTGGATATTCTTATTAATAGCCAAGAAAATTTGGGCA
ATCATAAATGGAAAAACCTTGATGTTACCAAATGGACGATTATAGAACAA
CAACAAAAGCCAATCCAGAAAGACAGGTATATAAAATATATATATTCACA
ATAATAACCATATAATAAGTATTGTGACTCATGTGGAGTACTAATATTTA
TATTTTATTATGTAGTTCATCTTGTGGTCTATTTTTTCTTAAATTCATGG
AATATTGGACTGGACATACACTATCCAATCCAATTACACAGGTAAATAAC
TCTTTTTTCTGTTAATAACACATATAGTTAGTGCCACTATAATTGTTGTT
ATCAATAATAGTATTTTTTGATGATGTGCAGGAAATTATTACTTCTTTTA
GATCTAAGTTAGCTGCAATACTATTATGCTGGAAAAACAACACAGCGCAA
TCGACCGCAAAGTTTGAAGAAATTGATTATATCGAGGGAGATCCAAATGA
TCTTATAATGTCGGACACTCCTTTTGATCAAAAGCAATCAAAAGATTTGA
ACTCCTCATCTATAGAGAACAAATACCAATCACTGATGTCTGTTCTTTCT
AACTTGAGCATAGATGAGTTAGTGGGTGGACTCTGTAACTACATCAAAGC
AATCAATTCTATGGAAACTTTAGAGTAAGCCATCGATTGCATATAATTTT
ATATTTGTATTGAGTACAATTGATAACATTATTATTTCTTTGTGGTAATA
TTTTACAGGAAAGTTTGGATTCAGAGCTCCGATCCATATCCTATTAGCTT
AACTCTCAAACAACTACAAGAAATGTTAAATGTTGAGTTGCACATGGACC
GGGATTGTTTTAATTTGGTTGTGCGGAAGATGATGTTTGACAACATCGAA
ACGGAGAAAAAAAGAAGAGGGTTCGTATCAAAGCACTATCTTGACATGCA
ATTTTGGGTATGTTATTACATTCACTATATATATTTATTGTGTCTACATA
TATACACTAATCATTTTTAACAACTTTCTTAATACTTACATATTTTATTA
TATATCCTAGATGACTACTGATTTTGGACGACATCCAGACTATCGAAAGA
AGTTAGATGTGGAAAAACTAGCAAATTCCGTCCGTAGCTGGCCCGGTATC
AAATATAGTGTTTCATCATGCAGAATGGTAAGAAAACCTCCCTACACGTT
TCCTCCCTTTTTTTAAATACAACTAATACAAAACTTATTTCAGATTCATA
TTCCAATACAATCCGGCCGTGAATTTATTCTAATCATACTTGACCAACAA
ACCAAAACTGTCTATATTTTGGATCCTATTCCTCTTGAAGACATGTACCA
GCGCAACCCAATTGCAAAATATATCTACAGACTTACATGGATTTCTGAAC
ACTTACCGAAAGCAATGTCAAAGGCATGTCCTGGATTTACATGGAACAAT
AATATTTTCCTATGGCAACAAAAGATAGTACATGACATTTCGTGTCAGAA
AAGGTAACAATTTATTCTAAGTATTTTATATTCTGAATATGTACAATATG
CATTATTGGCAATGATTATTAATTATGTATCTTATGTAGGGAAATGTCTG
GTTATCTTGTTACCTACTTCATGTCCACATGGGAAAATGAAAAAGTTCAT
TTGCCATTTTTGAAGGTAAATATCATAATTATTTGAATAATTATTATCTT
TTTTGCACATGAGATGCCGATCTTATTTGTTTATATTAAATACAATGTGT
AGGATGGGTACGAACTCAGGAAGCAAAATTTGGTACACCTATTAACATTC
AAGCAGAATGAATGTGAAGACAACATGACTTCTGGTGTCCTTGATTTCAT
CAATTGTATCAGGAAGACAGTAAACAATATGAAAGTGAAGGAATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.