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GrainGenes Sequence Report: AA040894

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Sequence
AA040894
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040894
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AACATTTACCCCTGACCATGACTGGAGCGACGAAGGGCGGGGGTTGGCGG
GACTGAGCCGGCGGATGTACCCAGGGCCCCAGGGGGGTCGCGGCGGCCGC
CGTGCCGGACCTATGGGCTGGGGCTCGTCATTCAGCGGCGCGCGGGTCGA
GCGCGCCGGAGTGGCCTGGGGCATGCGGTGCCGGAGCAGAGGGCGAGGAG
GCGGTGAATGTGAAGCTACGGCGCCGGCCGCCGGCCGCCGCACGCCGCCT
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GGCATCGTTCAGTAGGCAATAGAAAGGAAGACTTTGGCCGGGTATAGAAT
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ACAACGAAACAAGACGTAGAAAGATAAGATAACAAAACATGTTCCTTCAT
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ACAAACACAACAATACACTTGCAAGAGAGAGCAAGAGCTTACTGTGAAGC
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GTCCATAGATCGATTTCAGACATCACAAATCCCATGGTCGGAGCCCCACC
GCCTCCCTTCTATTCTATTCTCTTATCTTCTCTTTTATGTAGTCTCCCAT
ATGTGTCTAAGTATTCTTGTAGTTATTTGTTTCCATACAAGTCCTAATAT
GTGTCCCCGCAAAAAATATAATGTCCTAATATGTGAGCGTGATACTTGAC
CTGAAAAAAAATTGTGCCTTAGATAAAAGTATGAAAATCGATTTACAAGA
ATATGTGACTTAACAAAAAAAAATTCTGCAGCTCAAGATATTCTTTTCCC
GCAACAATCAGGCTTACCAGTGGATAACCAGACCCCACAATTTGGAGGAC
GTGGGGAAGAGAATAGAAGAACTGAAAAATGAGGGAAAGGCGTTCAATCT
GGATCCCGAAGCACAGGTAGAACAAAGCAAAAAAAATGATACTTTTGCAG
CCATCAGCGACGGAGGCACGAAAACTGGAATGCAAGGGAGGAGTGCCGAA
AAGGACAAGTTAATCAGATTGCTATTGAGAACTGAAGCTAATGAGCGTAT
TTCCATCATTCCAATTGTTGGGCTTGGTGGTATAGGGAAGACAACATTGG
CTCAGTCAGTTTATGCAGACAAGAGGGTCAATGTCTTCGACATCCAAGCC
TGGGTTCATGTGTCTGACAAGTTTGATTTGCGAAAAATTGTGAGAACCAT
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GTAAACAAAGCGTAGTGGAAACAATGAGCACTGGTGATCTTGCACATCAG
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TGTGGGGGTATACCACTCGTGGCAAATGCTTTGGGGAAAGTAATGTCAGG
AAATAAGTCTGTGGGGGCATGGCAAGATATAAAATTAAGGATGGTTGATT
TGGGTTTGAGAGGGGAACATCAAAAAGACACATTAGAATCCCTCAAATTG
AGCTACTACTACATGAAGCTTGAGTTCAAAATTTGTTTTGCGTATTTTGT
GGCATTTCCAAAGGGCTTCATTATAGACACCAACCGTCTGATCCAGCAAT
GGAACGCTCTTGGATACATTTATTCCGAACATGATGGCAGAAGCTGCATC
GACTACCTTCTTGGGATGTCCTTTCTCCAGATTTCAGGACCTCCTTCGGT
TAGTTTCTTCAATCAATTCTATTGTTTATGTTCGGTCATTGATACCTTAT
CTATTAGCTGGTTATGATTTTTTTTAATGGATATGAAATTGAATCATATA
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TTTACCTTTGAATTCGCTCTCGAGCGCCGCTCCCCTCCTTGGAGGCGTCA
GCATGAGTCTTGCGCTCTCTGCCTTGTAGCTCTGGGTGAAAACCTTGGTC
TGATCTTCTGGACCTAGCGACGGAGGCGCATTCGTGTTGTTCCCTCCTTG
GAGGCTTTGTTCGGGAGCTTTGATCCCTTTTAGCTGGTCGTCGTGGGTGT
GCTTCATGGACATTGGTGGTGTTGCTCTCGGCGTGAAGTGTCTTGTGGTG
GTGGCTGAGCTCAAAGTCTCTTCATTCTGGGTGGTCCTGTTTCGAGCTGT
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CGATCCAGGGTAAGAGGGGCAGGGGTCCCCGTTCGGCGAAGGATGGATGG
CAGCGTGACGATGTTCGTTCTTCCTTGAACCAGACAAAGACTTCTTCATT
GGTCAATTTAAGCACTCTGGTAGCGAAGACCTTGACGTTTCAAGTTGCGT
GTCTCATCTTTTTCTTTTGTTTGCTTGTTGTGTTTAGTCTCTGTAAGTTG
TTCCCTTTAGCACTTTATATCCGATAGGCTGTGGGGCTTTATTACTTTAA
AGCCAAGCGTAATGCCTTCATGTAAAAAAATCTCTACATGTTAAATCTCG
TGAAGATCGGGATCCTATCATATGGCGTCCTCCTCCCATATAAAGCAAAG
TTCACCATATCCCACTCCTAGATCATCCACTTTACCTCGTTGTTTCCGCT
GTTGTTGCAATCTTAAAGAATATACATGTATTTTACTAAATCACCATACA
ATATATATATGTATATATATATATAGATTACCATGGAAATTAAATTGTTA
TATGTCGTGAAATCTATAATCTATAATTGTAATTATGTGAGGCAACATGT
TTGCATAGAAAAAAAAATGGTCAAAGCACTATCTCTAAGACCGTGGACAT
GTCCAAAACAGCTTACGTTTTGAATGGTAGGTACTATATTCTTTGAACAT
ATGATTACATATTAAAATCAAACTAATTATTGCATAATGACTAATCACTT
GGCAACTATACATGCTAAATAACTATTATATATATTCAAATGGTATAGGA
GGTCCCTTCCTACTGTATTTTTCTAAAAAAAAAAATCTGTTCAGCAAGTT
TTCTTTCGTTCTATGACACGGTTTGACAGTAGTTACTTATGCAGGCTAGT
CAACGTCCAATGCGTTCCAGTGCTTCTCGGAAGCTTTCCATGCATGATCT
GGTACATGATCTTGCGTCAATAATTACTGGTGATGAATTTGTTGTTTTGG
ATGCTGATTCTACTAAACTAAGGACCTGGAAAAAAGCTATTCATTGTCGA
CATGCAGAGTTGATACAATATAAGAATCAATCCAATGTTTTCGAGCATCT
GCCAAAAAAGCTTAGATCCCTTCATATAAGAGATTCGCAGAGATGGCAAC
TCCCTCCAAAGGCATTTTCTCAATCCAAGTACATGCGTGTCTTGGACCTA
TCATGTTCAGTTGGGCAACTCTCGGAAGGGCAATCCACGTCAAGCAACAT
CAGGCTGCCTTGTTCCATAAAAAAAATGAAGCTACTTAGGTACCTTGATG
CCACGGGCTTGCCAGTTCCTTCACTTTCAAAGTCTGTGTGCACACTTCAA
AATATGGAGACTCTGATAATGTCCAATTGCTTACTTGATATCTTGCCTGA
TGATATTTGTAACCTCCACAACTTTGCTATCTAGACCTATCCGGTAATAG
AAGCCTTATTAAGTTACCTGCGTCATTGGGTAAGCTCTCTAAGCTCTCTT
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TGCCAGCTGACATGTTTACAACACATAGACATGTCAGAGTGTCGTGCCAT
TCACAATCTCCCTGATAAGTTTGGTAGCCTCCCAAATATCCTATTCCTAA
ATTTGTCAGGCTGTTCAAAGTTAACCAAACTACCGGACAGTGTTAACCTT
GAGTACTTGGAGCATCTGGACCTATCAAGTTGCCACGAGCTAGAAAAACT
ACCACAAGATTTTGGGAATCTTCGAAGTCTTGTGTTCTTAAATCTATCTG
ATTGCTACAAGGTCTCAGTGCTCCCAGAATCATTTTGTCAGCTTATTCAC
CTGAAAGACCTAGATCTTTCAGATTGCCACAACCTTAGTGAACTCCCTGA
CTGTTTTGGTAACCTCTCTGAGCTTGACTCTTTGAACCTAACAAGTTGTT
CCAAGTTGCAATTATTGCCCGAGTCATTCTGCAAGTTGTTTAAGCTGAGG
CATCTCAATTTGTCATATTGTATGAGGCTTGAAAAGCTCCCACCCTCGTT
AGATGGCCTTAAACTTCAATTACTGGACCTCTCTTCTGTAACTTTTCATG
ATTTACCAGATAGCCTCCATGGCATAACTACACTCACTCAACTTGTGGTC
ACGTCAGCGCGCAAAAAGGTGTATGACCAGGCTCGTGACATAAGGAAGCG
TCTAAATTTGGCAGGGATGATAGTACATACTGTACATCAGATTGAAAACA
AAGGATGTAGCAGTATTGTGGAGCTAGCGGAATTGGCCTGTGAAGAGCTG
CAAGTCTTACGGCTCTATAATGTGAGGTATCCAGAAGATGCAGAGAGAGC
CAAGCTTCGTGATAAAACAGATCTTCGGCTACTAAATCTTCGCTGGGGAC
TTCAAGGAGAGGAGGACAAATCTGTGCTGGAGAGGCTCATACCTCCTCGC
ACTCTTGAACATTTTTTTCTATCTGGGTATATGAACAAGGATTTCCCTAA
CTGGATGTCTCACATCTCCACCTACCTCCCTTCTCTTACTTACCTCAGGC
TTTCTGATTTAGGAACATGTGATATGCTTCCTCCAGTAGGGGGACTGCCA
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CACGGAGTTCTATGGAGTGGGGGGTGAAACTTGTACAAAATTAAGAACTA
TACAGTTGGAGTCAATGGAGAATTTGGTGGAATGGTGGACAACACTGTCA
GGTGAAGAAAATGAAGAGTTCTTAATCCCTAATTTGCATAGTTTGGAAAT
AAAGGACTGCCCCGAGTTGAAGTTCCTACCATATCCTCCGAGGAGTATGT
TTTGGCGCTTGAATGACAGTAACATGGTTTTGCCTAAAGAAGGATTTGGG
AAGCTTTCTTCTTCTGCTCTTCCATTTGAAATGGTAGTAAAAAACTGCAA
TTTTGCTCCACACAAGTGGGATAGGCTTCAACACCTCCCCACCCTGGAGA
TATTTCATGTTGATTCCTGCAACGGTTTGAGGGCGTTGCCAGAGGTCTTT
CGATGCTTAACCTCTCTCACAAAACTATATCTGTGGGCGATGAAGGACCT
AGATACACTGCCGGAATGTTTGGGGAACCTCACTTCTCTAGAGCACATTT
CCATGGAAGATTGTCCCTTGGTGACATCTTTGCCCGAAAGCATGAAGAAG
CTCACTGCTCTCAGAGTGCTTTGGCTGAAAGAGTGCATAGGCCTAGAAGT
ATTGCCAGAATGGCTGGGAGAACTGATCTCCCTTGAAGAATTTAGCATCG
TTTGTTGTCCAAACCTGACATATTTGCCTGAAACAGTGCGGAACCTTACG
GCCTTGAAAGAACTCTACATCTGGGGCTGTCCAAGTCTGGTTGAGAGGTG
CCAAGGGGAGGATGCCACCATGATTTCTCACATCCCAGAAGTCACATTAT
ACGGATCTAGAAGAAGTAGAGATACGAGACTCCCAAAAGCCCAGTAAAAT
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CTCGATGGATGTGTTTACAGCCAGTTATTTTCATTTTGTTCTGTTTCCTG
CACATGGGCTTCTGAAGACACGAGAGAGGAAGAAGAGCTGAGGTCCACTT
CTGAAGAAGCACCAGAGAGGAAGGGTGGAACTGATGAAAGGGAAACTGTG
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CGAAAAGGGGAACAAAGCCTGACGGTGGTGTAGTGTATTGCAGGTGATCC
CCGGAACTGTGTAGTATTAAGCTGGTGCTCTACTAATGTGGGACACCTTC
TGCATGGAGTGGCAGGCCCCTGAGCCTGGACCTGCGCGGGATGGCAGTAT
GCAGCTGCAGCTGCAGCCTGGACCTGCACGGGACGGCAATATGCTGCCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.