Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008197

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008197
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008197
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGTACAAAATACTCCTACATAGACGGGATACGCCTTGAGTATCAGATAC
AGTAGCAGCACCCAGCGTTCCGGTCGATCCTACTCAGTTCCCACTTCCGC
GGTTCCTTCCACCCTCCCCGCCCATGGCCGCCGTCGCCTCCGACCTCATC
GACTTCCTCAACGCCTCGCCCACCGCTTTCCACGCCGTCGGTACGCGCCC
CCGCCCCAGCCCCCTTTCCTTCCGTTAACTTAACTTAACTGAATCGGTCT
CCTGCTGTTGCTTCCGGTGGGAGAAGATGAGGCGAAACGGCAGCTGAAGG
CGGCGGGGTTCGCGCAGCTGTCGGAGCGGGAGGAGTGGACGGGGCTCGAG
CCCGGCCGGAAGTACTTCTTCACACGCAACCACTCCGCCCTCGTCGCGTT
CGCCATCGGCGCCAAGTGAGCACACCTAGATCCGCTTGCCTCCCGGGTTG
CCTCTCTGGGCGACTCCGGAGGCCTCCCGCCGATCCCCCGATCACCCTGC
CGCCGCCGGAGGAGGTCTCCGGCGGATGGCGGCGGTGTGGTGCCCCTTTT
TCTAGCCTTTTTTTTTTCCCGTCCTTGTGTTCTTAGCCAACGCCGTGATC
TGGTTTCCATAGTGTTCCTGAATTGCTTGTGGTTGACAGATGCGTTGTTT
GTCTCGCAGGTATGTTGCTGGCAATGGATTCCACATCATTGGTGCACATA
CGGACAGTCCATGCCTGAAACTCAAGCCTGTCACCAAGGTTTCAGTTTGA
ACCCTTAGCTACTGATGATTTCAGAGTAAAATGTGTCCTGCAACTTCGGT
GTGATACTACTCCATCATGTCCAAAATCCCAAACAGACCTTTTATCCGGT
TTTTTTCCGCTTTAATGCAAACCGTTGCTATTTGGCCTTTCAGTTATGAT
ATGTGTCTGGTGAATATGGTAGTTAGCTGTTTCCTGTTAGGTGCTACATC
TTGATGAAGTACCTACTATAAAGTCTTGCATTTTGTTTGTCAGCTAACTA
AGGGAGGCTATCTTGAGGTTGGAGTCCAAACTTATGGAGGTGGATTGTGG
TACACATGGTTTGACCGTGATCTTACTATTGCCGGTAGGGTGCTCGTACG
AGAAAAGAAGGGAGGCACCATCTCTTATGCACATAAGCTTATAAGAGTGC
AAGAGCCTATCATGAGAATCCCCAGTTTGGCTATTCACCTCAACAGGTTG
GTGTTAAAACTCCTTTTTTATAGCCTATTGAAGTTATTTCTACATTCAAT
CATGAGTGGTGATGTTACATTTGGGTGCTATTTATCGTGTAATGAATAAT
CTTAATAGTGGTAGATTCCAACTGTTTATAAAACAAGAAAGATACCCTGC
ACGTTGGAAGGGAATATCCTTTTGAACTCTATTATGTAAATGAAATGGTA
TGAACATGATTTTGTTAGCACTAAGAGTATAGTGCACCTGGAACGGACAA
CATGGCAACGTACACAAAATGAACAGTAACTATTGATGATCTAGACGGAG
GAGCAAAACCAAAAAAAGAGGGGGTGGGGGTGGGGGGCAAAGATCCGACG
AAGCATGGGGCAGGGGGACTTCAGGAAACCATATTGGGTTAAGGAATTTG
TTAAATATGAAATGCACCATCTATAACCTTTTATGTACATCAAGCATTAT
AAAAAAGTCGCCGGTTGTTGTGAGGACCCATGTCTCCAATTTATGAGTTG
GTACATTGTTCCTAGAAGCTAATGGAAATCTACATGTACTTGCAGCTATT
TGATGTGCGTTGGATGGAACTTAATGAAAATAGCTAAAAGCCTAAAACAG
TTAAATGACAATAATCAGAAGTACATAGTATAATCAAAAGCAGATGTTGG
CAGTCTGCACCAAGTACAGCTTGCATCTCTCAGTAACCATGTATTTTGTG
GGAGTCCAGCACACACCCCAGCAAGAAGTCTGTTTGAATGTAAAAAAAAG
TATATTCAGTTCGGACCCCTCCATCCGCTGCATCATCCGATCATACTGAT
ATATCAATATACGGTTGTCTTGGTGGTGGCAAATATTCTACAGTTCAGCA
AAAGTGATATCCTATCATACTTACTATTATGCAGCCCATGTTTGGACACA
ACCCTGTTTTGTTTTGAACGCTTGGCCCAATACTATTTTATAGTTATATG
AAGCATTCTCATATTTGTCTTGTTCACATCTTGCATAGGACTATCTCCTC
GGAAGGTTTCAAGATTAACAATCAGGATCATCTTGTCCCTATTCTGGGCA
CGCTGATTAAGGTGAGTTGACTACATGATCAGAATCTACTTCTTGTTATT
GATTAGTTTGTCACCTTAGTTAATCCAGAATGTTGAATATTTGGAATTAA
TATATTCACACTGAATTTCATTATTGTCCAATATTTGGTTGGAAGTAATC
TATTATGATAAAATGACTATGGAAAAAGTATGCACTTCTGTTGATTGAAC
CATTTATTTTTTGCAGAATGAAATGCAGACATTAGTAAAAGAAAATGCTT
CACAGGAGTCAACTGGGACCAAAGACGCTAAGCACCATCCACTATTATTG
CAGGTAATGTCTTACTGAAAATATTTGATGAAACCGTTCTTATGAGTTCT
GACTTATTAAAATATCAAGAGTCATTGGGTTAAAAGTATGTTTCAGTTTT
CCCCTAATGTATGTTTCTTTCATTTTGTTGCAGTTGATTGCTAGAGAGGC
TAACTGTGAAGCTGATGAGATATGTGACTTCGAGCTGCAGCTGTGTGATA
CTCAACCAAGCATTATAGCTGGTGCCATGAAAGAATTCATATTTTCAGGA
AGGCTTGACAACCTATGCATGTCATTTTGTTCACTGAAGGTTTGTCTCGT
TGTTTCAGTTTACTTATAGGTTATAGAGACCACATGTACGAGTTCACATA
TTTTGAAACTATTAAAGTCATTTGATGTCACTTTATTTTAAATATTTTTG
CATGCAAGTCTCCATCGGATAATATTTTAAGTATTTTTTCTGCATGTGTC
ATATAGTATTGGTATTCTTACTCGATTCAGGATAATATATTTCTGATTTT
ACACAGCAGAAAATATGTGCGTTCTCTAGTTTAGGGAAAAAGATAATACA
CCACAAAGGCAGAAAGAACAGTTTATGAAGAGAGGCTCTTTGAATCTGGA
TACTTATAATCCCTACATTATTCTTCTATACTCACAGTTGATTGTACTCC
ATGCTTCTACATTACTAATATGCTCACCTTTGATTTGTTCTCGATTTGAC
CATACAAATCCTGTATCCTATGGAAATAATTTCAACCATACTGCAATAGA
ATTGATTTCTATTAAGTGATGTCCTCGTTTTGTATATGTGCGGATGAGCA
TCTACCCAGTGGTAAGAGCACAGTGGTGCTTTCTTGCTGGCGCTAGTTCG
ATCCCCGTGGGCAAGATTTAACTTCTTTGTTAAATTTCCCGGGTTGAGCC
TCATGCCTCACAGCTTCTTCTTAATACAAAGCAGCAGGGGTTCCTCCCCC
TGCTGGTTTTTTTTTTTTTTATATGTGCTGTTTTATGAGATTATGATTGA
TCCACAACATGTGTATGTTCCTATTATTCTAATATGAAGTGTAGTAGAAG
TCATAGAGCTAACAACATTCATTTTCGAGTAAATACTAATTTCTGTCCTT
ATTTTGCAATAAAATCGCCATATAACTAGTTCTCCAATACTGTTTCAGGC
CCTAGTAGACTCAACCTCTGCTGACCACTCCCTTGATGATGAATCTGGTG
TTCGAATGGTGGCTCTTTTTGATCATGAGGAGGTTGGTTCGGATTCAGCT
CAGGGAGCTGGTTCACCTGCCATGCTAGATGCTTTAACAAGAATCACTGG
TTCGCTTAACCATTCAAACTCTAAGGTACAAAGTAATTTCTTTCACCAGC
ACCCAATCTGCTGCTGGATTTTGTTTGTCACATACCTTATTTTATCTTAT
CAATTTGTTTCTGCTTATCTGCTAGCCATTTATGATGCCGTTAACATTAT
TCATTTTATTTTTAATAATATGACATAAGGATGGAAGGGGGTAACTTTTA
GGGTACCCTCTACCCTCTGTAGTACAAAAAAATGAACTGCATTTTCACAA
ATCATCACTTTTTGACAAAACTAGTTCATTCATTTGAACTAGACTAAAAT
AAAGGGTACCCTAAAGGTTCCAAACTGCCATATCTACTATGACAACTAGA
GAACTACAATTTATTGCAGTAAGTGGGTTTCAAATTCTTAACAATGACTG
TTTGCTTTCCAATTTTTCAGCTGCTAGAAAAGGCTGTTCAGAGGAGTTTC
CTGGTATCTGCAGATATGGCTCATGCCTTACATCCCAATTATATGGTAAT
AATATTTTTTTTTAGATTAGTGTATGAGATACACAGGTATGCAGCAATAT
TTTAATATATCTTTGAATCAAATATGATTTCCACTCCAGGACAAGCATGA
GGAGAACCACAAGCCAAAATTACATGGTGGACTTGTGATTAAGCACAATG
CTAATCAACGATATGCCACTAATGCTGTGACAGCGTTTATTTTCCGCGAA
ATAGCTGAGAGACACCAACTCCCTATCCAGGTTAGTGAATGTAAAAAAAA
AAGGACCTTTATAACATACGTGAATTAGCCACTGGTAAACAAAATCAAGC
TACCATAGTTTCCTTTTTCAACTTGATCTTTTGATTACATTTTCTTGTTA
TTCAAGTTGTAACATCCTATTTAGCTACTGCCTCCGTTCCATAATGTAAG
CCTTTCTAGCAGTTCAATTTGAATTGCTAAAAAGGCTTACATTTTGGAAC
GAAGGTAGTAGTACCTTATTCTTGTGAGCTATGATTAACCCTGTAGCTTA
TAGGGAATAAATCCTGTAGCTTACAGGACCACATTCCTTCGCTAGGTAAA
GAAAAAACAGTGCACTTGAAAATAGCTCTAGCAAGGCTAATTATTTGTTT
CTTTTTCTTGACAGATAAACCAAATGCATGCTTTCAAATAAGTACAGTAG
CGTAAAATGACAGTATTTATGTAAAAATAATTAGTGGACTACATGAAAAA
AAAGGAATAACCAAATGTTGCCTATGTAGGGAAGTAATTAGAATAAGCAA
TAGTCAAAGACATGTATTAGAGACCTCATCGATGTCCAAAACAACAATAA
AGACAACTTATTGTACAGTATAAGTTCTTGAACTGGTTGTGCAGTTCCAG
ATTATCCAGATCTTGTAACCTAAATAGATATGAGAATACGTCTGCTGTGA
AGCCTTGGAACTTTATTTCATGCACCAATACAATCTTATGATTTGATTTG
TTTGCAGGATTTTGTTGTTCGCAATGACATGGCTTGCGGTTCGACAATTG
GCCCAATACTCGCCAGCGGTGTCGGTATCCGTACTGTGGATATTGGAGCA
CCACAACTGTCAATGCATAGCATCAGGGAGATGTGCGCGGTTGATGATAT
CAAGTACTCGTATGAGCACTTCAAAGCATATTTTGAAGAATTCACTGAAT
TGGATAGCAAAGTCAAAGTGGACTGTTGAGGTGTAAGTAAGGAAAGCTTG
TTGGATCAGTAGGGCTTAAGTTGTTGATGTCAAGCTTCATGCACTAGCCA
GCGCAATTAAAAGTTCGAACTGATAGAAAGGGCTAGCGCAATCCACTTAT
ACGAATCGCTGCGCTATGATTCCTAATAATAAGTGATGTCCGATGATTTT
AGCCATGAATGAAATTATGTACGAGTACTAGAACATGATGTCCGATGATT
TTAGCCATGAATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.