Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026039

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026039
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026039
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGTCAAACATACCCGGCCACCACCCACCGGAGCCATCCTCGCCGTCCGT TCCCCTCTCAAACCTTCTCCCCGCCGTCCGTTTCCCCTCCCGCTATATAA ACCCTCCATCCCCACCGCGCTCTCCCCCCTGTCTCCACCTCTGTCGCCGC CATTCTCCTCCTCCTCTCCTCCTCGCGCTTTCTTCTCCGGCCCGGCGAGG AACAGAGAAGCGAGGGGAGGAGAGATCCGGAACAGATGGCCGCGCTGCGC TTCGCGGCGGTCGCGCGGGAGGCCCCCACCGCTCTCTCCGCCGCCTCCAG GCCCGGGAGGGAGAGGGACTCGTGTCCCCTGCGCGGGTCTGCCACCAGCG CAAGGCTGGGAGGGCAATGCTGGGCGCGGAGGGGGCTGGTGCTCCGGTGC CAGAGCGGGGCGGGCGCCACGACTACCCTGAAGAAGGGCGAGGCCTCCTC CCCCGTCACGCCGGAGACGGCGCCTGCGGCTGGGTTCACCGTTGTCATGA AATTCGGCGGGTCCTCGGTGGCGTCGGCGGAGCGGATGAAGGAGGTGGCC GACCTCATCCTCAGCTTCCCCGAGGAGACGCCCGTCGTCGTCCTGTCCGC GATGGGGAAGACCACCAACAACCTCCTCCTGGTACATACTACCGTTTTCA GCTCTGAGTGGAAAATTTGGGGTTTCTGGAAGCTCCATTCCGTGCTGAAT GTAGTTGGCTGCTGGACTATGTGTAGGCCGGAGAGAAGGCCGTGAGCTGT GGCGCCCCGAATGCGGCCGAGATCGACGAGCTCAAGGCCATCAAGGAGCT TCATTTTAGGTGCGTCTCAGTTCTGGTAAATTTTGCGGTCTCCTGACGCT TAAGAAGGTCTGCTCTGTAGCTTGCAATCCTCAATACTTGTTTGTTTGTG CTCTGCTCAGGACGATCGACGAGCTTGGATTAGATAGCTCTATTGTTTCA GGTATGTTACTGTGGTTTTTCAGTTGCTAGCTCCAAATCAATACGTGTTA CTAGTATAAAATTTTCCAAGGCTTCTCCCAACCTAAAAATGGATCGACCC ACTGACGAATTAGGCTCGCATTTCGCCAGTTGCAGTTCATCAGCCATCCC ATTAGCTGAAATCTTTTTGGCTCTGGCTTTAACTTTACCTACCAGACCAA TATTTTCAGAGACTTTATTTATTTGGCTTGCGACGGATTTCCTCTATCCG TGTTCCTTTTCTGTTTCTATCCCTTGGTCATTGCCACCATCCCTGTGCAC ATCTACTAACCTCTGGCCAATATCCTTGCTACTGCGGGAGACCGGGACCA CGATCGGGACCATGATCATTGATGGACAACAGGGTTTTGGCTCATAGCGT TGCCCAACTTACTCATTTTCATGGTACAAATTAATGCTCAAAATTCAAGT TCAGCAGAATGGTGCCCATTTTGTAGGCCCCGGATACCAAATATAGATAG GTCCTTCCTTGCCTTATTATTTTAAATGGCAATAGAAGGACCTGTTAACA CCACAGGTGCATCCACATCCTTAGCTCGTTACATGAAAATCTATCGATGT TGGGTTGTAAATGAACATAAATGCACCAATTTTTCCTTTCGATTTTCATG GTACAAGTTAATGCTCAAAATTCAAGTTCAGCAGAATGGTGCCCATTTTG TTGGTCCCAGATGCCAAATATAGATAGGTCCTTGCCTTATTATTTTAAAT GGCAATAGAAGGACATGTTAACACCACAGGTGCAACCATATCCTCAGCTT ATTACCTGAAAATCTCAAAATCTATCGATGGTGTGTACCATATCCTCAGC TTATTACATGAACATAAATGCACCCATTTTTTTCCTTTCGATTTTGTAGG GTGGTAACAGGCCTACAGGTCATTATCATCCATTCACATCCTTTTCAGCA GAGTACCTTTCTGTTGTATGTACAACATTGACAGATTTTGTATTCTATAG GCTAGTGGCTCCACCCTAGTTGGTTTAACTATTTTTTCCTCAATGGGATG GCATTATTTCATATAGTGCACTGACCTCACTGGACTGTTGAACACATTAG TGGTTTACTAGTGACGTTCAGTCAGTCCTGTAGTACATTGACAGATTTTG TATTCTATAGGCTAGTGGCTCCACCCTAGTTGGTTTAACTATTTTTCCTC AATGGGATGACATTATTTGATGTAGTACACTGACCTCACTGTACTCTTGG ACACATCAGTGGTTTACTGGTGACATTCAATCAGTCCTGCAGTACATGAA AGGTTTGACCATATGGAACAAACATGTTCTTTTATTAACAGAAACTCATC TTCTAAATAAAAGTATAAAATTAATGCGAGTGCAGCTCGTATGGCATGCA CATTTCAATTCACACACATGTACCTCAACTACTAATGTGAAAAGGTAGAA CATGTGACATGTTCAGTACTTTAAACCTGAAAGTCCCATATTAGTTGTGT CCCCCAACATGTTAAAAATTAAAAATTCGGATATCTGAAATGTGGTATGC TGGATCCTTAAAAGTTATACATCTGAAATGTGTTCCCCATAACACTATCA GAAGCTGTGTCTTTGACTCTTAGCATTTTGTTGTTGTTTTGTATTTAATT TGTTGGGCTAACTCAGCACATAACATTCTTTGTCTTCAATGAATGAGCCT TCTGTAGTACTATACAGACAACACATTTTCACTGTTTCATCAAACAGGTT TTTTGGACGAATTGGAACAACTTCTTAAGGGTGTTGCTATGATGAAAGAG TTGACTCCTAGGACACGAGATTACCTTGTTTCCTTTGGCGAATGTATGTC TACAAGAATATTTGCTGCGTATTTGAATAAACTTGGGAAAAAGGCACGAC AGGTACATACTTCTATCAATGCAATAATTTTAGTAGTTTGGTAAGCTTTG TTTGAGCAGGGATATGATCTAATGATCGATAGTTAAATCTATTCCTTCTA TATATCTACATTGTTGACGAATTTTTCGTTAGCTCAAGCACAGAAAGCAC ATGACGATGTGACCTTGCTTCGAAATATCTACTCCCTCTGATTCAAATTA ATGGCCTCAGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGTCATGTGTTAGTGC TAGATACATTCAAATCTAGACAAATCTGAGGCCATTAATTTGGATCGGAG GGAGTAATAAGTTTCACCACTACATGTTATAGTAGACATGTAAAATATGG TCAACAAATAACACTGATATTTCAGTCCAGCAATGTCTTAACTATTTTTT GCTTGTTTGCAGTATGATGCGTTTGAACTCGGCTTTATAACCACTGATGA TTTTACCAATGCGGATATTCTTGAAGCAACTTATCCTGCTGTTGCAAAGA GGCTACATGGGGATTGGATTGATGAGCCTGCTATTCCTATAGTGACTGGT TTCCTAGGGAAGGTCTGTAATGTTACATAATTCATTTGCAAGAGCATCAA ATATGTTCTGTTTGTATTTATGACGAGGCAGATACAAATTTTCAGGGATG GAAATCATGTGCGGTCACTACTTTAGGAAGAGGTGGAAGTGACTTGACTG CTACAACCATTGGCAAAGCCTTGGGTTTAAGAGAAATCCAGGTTTGTTTT CTATTTTAGTGAGTTGTTTTAATTACCTGTTGGAAATCTGTTGGCCCCTT TTGAAAAATCCTTCAGGTTCTAAGCTGCTAGAACCTGCTATGTATAAAGA TGCCGCAGTTTCTTATATTAATTCATTCAAAAGCTTTGTAATTGGATTTT TTATTAATTTTCCGCAACAAAATGTTGTCCAAATGTTTAACCAAATAAAC TTAAACCTACGAATAATGTGTGGTGTACTTGTGATGCCTCTATGCTATTT TGCAGTATTGTGGGCTATTACTCATTTTTCTAAATTTGCAACAGGTTTGG AAGGATGTAGATGGTGTGTTGACGTGTGATCCAAATATTTATGCAAATGC GGTACCAGTACCGTACTTGACTTTTGATGAGGCTGCTGAACTTGCATACT TTGGTGGACAGGTATTCCTTGTTTATTTAACTGTGTTAGAATAGTAGACA TTTGCCAGTTGCACCTTAGGCCGGAAGATGTTCATATATATTTTTCTCAC ATCCCCAACTTCTCAAAATTAGCTTGTTTTGTGGTTCAGGGACCGTTACC GCATTGAAGCTTGTTTTTTTTATATTTTTACTGAAGTTACTTGTGATACT TCCCTGGTGCTTTATCAAGTATTATTCTACTATTTTTTTTACTGAAGTTA CTTGTGTTAGGTTTTGCATCCGCAATCAATGAGACCAGCTAGGGAAGGTG GTATACCAGTTCGAGTGAAGAACTCGTATAACCGTCATGCACCTGGGACT GTGATCACTAAATCAAGAGATATGCGCAAGGTTTTGTTCTGTGACTATCG ATATATTGTGATTCTTCCATGTGTAATTACTACTACTGCCTTCTGATTGT ACATTATTTTCAGAGTATATTAACCAGCATTGTGCTGAAATCAAATATCA CCATGCTCGATATAGTGAGCACAAGGATGCTCGGCCAGTATGGCTTTCTA GCAAAGGTACATAGCAACGGACTTCTGGCTCTTTCTTTCTATACAGCTAT ACATATTTTTTTATTGCATTATTGGTGTGCAGGTCTTCTCAATATTTGAA GATTTGGGCATCTCCGTTGATTCTGTGGCTACTAGTGAAGTCAGCATATC ATTGACACTAGATCCATCAAAATTGTGGAGTCGTGAATTGATCCAGCAGG TAAATAGTCCATTTTCATGTTCAGTTCTCTGCCAACAATACTAGTACTTG GGACTGTCCTACTGTTGTTGACCTTTCCTTATTCCATTTTTTTTTGTTTT GATGATGTGGCAGGAGCTTGATAATGTAGTTGAAGAGCTTGAGAAGATTG CAGTTGTTCATCTACTACAGCACAGATCAATCATCTCCCTGATAGGGAAC GTAGAGAGATCGTCTCTGATTCTTGAGAAGGTATGGTCTACCCATGATAC TCTTAGCAGCTGAAACTTTGGCCTGACATAGCATTGAGTAATGCCAATCA TAGCACAACCAGAATTTACAGTTGGTTTGTACATTGTTTTTTCTGGCTAT ATCAGTTGATCATTTTGCATCTTACCATTTGCATTCACTGCTGCATGCCA GGCATTCAACGTTCTACGCAGAAATGGTGTCAACGTCCAGATGATCTCGC AAGGGGCGTCCAAGGTACTCCCCATTTGCCAGAAATAGATATAAACTTAG TTTTCTGCACACGACCAAACGAGAAATGTTTTTTCCTTATTTTTCCAAAC GGGGTGACGATTGCTAACTATTCTTACATAAGCAGGTGAACATCTCCTTG GTGGTCCATGACAGCGAGGCGAAGCAGTGCGTACAAGCCCTCCATTCGGC ATTCTTCGAGAATGGCTTCTTGGCAGAAGTCGAGGAAGTGGATCGTGCGC AGAAGAACGGTTCCCTGGCCCCAGTTAACTCCAACGGTGTCATGCATGGA AACTAGTCGACATTGCTTTTAGTATCCTGATTAGAGGTGATTGGTACCTG ATTGGTTAGGCCACCCTGTTGAGCGAATTTATGTGTTGTAAGAGCCTATA TAACGTACCTGGAAGGCGTACGGCTCTGTGTTATACTATTAGTTAGCAAC ATGACCTACCATTCTTCCATGGGCAACGGGAGGTAGCAGATGGCGGCCCA GTGTGTGAGGCCCGCATGCTACTTGCTGGACTAATGAATTATTATTGGAA GTTTGTAGTGCACTCTTTAGGTAAGTATAAGTGTGTTGTATCCATCTATT TATTACCAGCCAATAAATTGAGCATTACGTGCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.