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GrainGenes Sequence Report: AA001458

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Sequence
AA001458
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001458
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCAGCGCCTCTCGTAGCCGCGAAAGCCGCCGTGCCGGCCCCCAACTCTT
CTTCGATAGGCATAGGCCCCAGCCTATTTTACCTTCACAAATAAAATAAA
TATATACCCAGAAAAAAAAACTAGTAATAGAGAGCAGCGTTCTCTCGCTC
TCCTATCCTCCTCCCCCTCCGGGCCATCCCCACCATGGCCTCCTTCCCCT
CCCCCTCCGTCGCGGCCGCGGCCCCGCGCCTCGCCCCGGGCCTATCCCTA
TCCGCCGCCGCCGTCCACCACTCCTCCCACGCCTTCCGCCCACGCGCCAT
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CGGCCAGCCCCCTCCGCTGCTCCCACCGCCGCGCCGTCTCGCCCAGGTGA
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GCTAATTCGCGTCGGTTTATGCAGGTTGAGGAAGCGGACGCAAGGGCTCG
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GCAGGCCTAAGGTTCGTCTCATCTCAACTGATAAAAATCATTAGGGAGCT
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CATATTGCGTGCTGCTGGACCTGACGAACCACATGTTGCAAGCCCAACAT
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AATCCGGGGTCAATTGAAGAATGGCCTCAGATATCTTATTCTACCAAACA
AAGTTCCAGCAGATAGGTGAGGAAGCCTCATTTCATTTCCATCTATTACA
CTACTGGCAAAAGTAGTTCCATAATTTTCTTCTGATGAAACAAAATCCCT
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TGTTTGTGTATAGATACATGTGAATCTAGATAAATTTGCGACATCTAATT
CGGGACAGAGGGAGTACATGATTTGCTGCTACTAGCTGTATTTCCCAGCA
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CATTTTCTCGCAACTGATATTTTGTTGAACTCTTCTACAACATCTACAAT
TTCCTAGTGATCTATCAGTTAATGTGGCCTTTTTTTGTTTCATTTTAATG
CTCAAAGATGTGTGGCAGAATTATTGGTCAAATCCTTGAATAGTTGAATT
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TGTATATGGATACATTTGTAAACATTGTGGCTTTCCTTTCTCTCTCTTGT
TTCTAAAATTTGTATTCAACTTCGGAGGTGTTTGAAAATATTATAGGTGA
ATCCTTTGAACAATTAAACTGAGATGGCATGTTGATTTGAGTTCTTGAAC
ATGAAAATTGTAACCCGATTCATGGACCCACAGTAAATATGCTTAATTCA
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GTGGATTTGAATTTTTACTTGTTGGCTGCCATAGATTTCACATTTTCTAA
ATAAACTAATGGATCAAGTTAGATGTCTTCTTTTGTTTATCTAGGATCTG
ACATTAGTTTGCCTTTCGTGTGGTAGGAATATGGCGAAGCCTTACTCCCT
TCTGTGCTGGATGCTTTGAATGAGGTAAGGTGTTGTTACTCATTTGCATT
CCTATATGTAGGAATTATAGGATGTAAGGATGTTTGCTGACTGTAGGCTA
TTTATTCATTAAGGATATTTGAGATAGTAAGCATATTCAATTGGTTAGAG
CAATTATGGTGTGTCTGTCAACTATCTGCTATCATCTTTTGTTATTGTTA
TTGATGCGACGACACAATCAAACTGGTAGCTGAAATATAGATGCATGCTA
CAATGGGATGCTGTTAGTCTGTTTGACAGATCTCTTGACATTATGACTTA
GATGTATAAACAAGTTCTTCAATTTTGTTCCCTTCAGATAGCTTTTCATC
CTAAGTTTTCTTCATCTCGTGTCGAGAAAGAGAGAAGAGCAATTCTTTCA
GAGCTCCAGATGATGAACACAATCGAGTACCGTGTTGATTGCCAGGTAAG
TCTTTTTTGGGCCAGTGTTTACCACTTGAGGAAACTTCTGAAAAGGAATT
TCACTTTAATATTCCTGGAACAATGCTGAATCATTTACTATAGGGCACTA
TCTTTCTGTACTAATTGCAGCTCCTTTTGTGCAGTTGTTGCAACATTTAC
ACTCGGAAAACAAATTGAGCAACAGATTTCCTATTGGACTTGAGGAGCAA
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TTACCCTGCTAATGCCACTTTATACCTGGTAGGAGAAATTGATGATATTC
CCAGAGCAGTAAGGGAGATAGAGGTAATCACAAATTACATCCTACTACTA
AGTATTATTATTGATAGTTTAGCTGATTCCAATAGGATTAAGTTGCAGGC
TGGTTAGCTGACCCATTGCAATGCAGGCTGTGTTTGAACATACACTTCCG
GAAAATGGAGCAGCCCCTATGTCGACTGCAAGTCCATTTGGTGCCATGGC
AAGCCTTTTTGCGCCAAAACTGCCAGGCGGCTTGGCTGCAAGCCTAACTG
GTGAAAAATCACCTGCCACAGATAAACTAAAACCTATAAAAAGGGAAAGA
CAGGCAGTTAGACCCCCCGTAGAGCATAAATGGTCTCTTCCTGATGTTCA
TCAGGATGCCAAGCCTCCAGTGATTTTTCAACATGAGTTGATACAGAGTT
TCTCTATCAACATGTTCTGTAAGGTATGCTTGCCTGCTAGCCTTAACACT
TTAGTTATGTTTTGCAGTTTGCACCTATGTGGCTAGTTTACCACCAAATC
TTTCATTCCATTAGTAGTTCATGTTATAATACTTAGTACATAAACAAGCC
ATATCAGCATAGCTGCACTGCATGCGCGGCACTTGGTTTGATAGCCCATC
TGTTTTTTGGATAAAAAGTCTCATGTTAACAATGGTGCCCTTAATATGGT
CTTCTTTAAAGATATTTGAATATAATGATTTCGACAACTAGTTTACTGGT
TCTCTCTGTGAAGTTCCTTAACCATGCTGCATATGGCTAACTGTTCCTTT
ACATTGCTTGACAGATACCTGTCAACCGAGTTCAGACATACAAAGACCTG
CGCAGTGTACTGATGAAACGGATATTTTTATCTGCTCTGCATTTTAGAAT
CAATACAAGATACAAGGTTTGTGGTTTTTAGAAACATTCATGATCCGATG
GCCTATGGACACTATTTTTAGATCTTATTTCTTTCAGAAACTTTGTTATA
TCAGAGCTTAACATTTTCTTTGGTTTATAACTTTATATCCTTGCATGATT
AAGCGCTTCATACTTTCATATGTATGCACAATTGTACATGTTATTTTCTC
ATTATTAGGAGCTTTGTGCCTAGCAGTCTACTACAGTCCACATAAAATGA
CATTCGATGCGCAAAAGATTTCATATTTTTTTATCTTCAGCTCAACTACT
AGTTACTCAGGATTCATTTCACTTGACATTGGACTTGAAATTTGAGTTGA
ATAGCTAGGTTCTTCCACTAAGGAATTTGCACATGTTAGCACACTTACGT
ATTTTACAAGGAAACAAGTACTCCCCCCGTCCTGAAATAACTGACTTGAG
TTTGTCTATATATAAATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATACATT
CGAATTTAGACAAACCTAAGTCAGTAATTTCTGGACGGAGGGAGTAGTTG
CATGGTTTCTCTGACTGAGAAAGTCTTATTTTTGTTCTTTTATACAGAGC
TCAAATCCTCCCTTTACATCAGTTGAGCTGGATCACAGTGACTCTGGAAG
GGAAGGGTGCACGGTCACTACTCTAACAGTAACAGCTGAACCCCAAAATT
GGAGGAGTGCCATCAAAGTTGCTGTTCATGAGGTTTGTGCCTTCACGGCT
CAGTTATCCTGTTTTACAAATGTCGTTTAGCAGAATGTTTTGTGTCACTC
GAAATATGGACCAATTACCTAGATAAAATAAGCTTCGAATCAGTTCAGTA
CTAATATTTAATTATCTGTGCAAAAGTGTCGATTTAGTACGTACGTGAAG
AACTATTGACCTTTTAGCTACAATGAATGATTTAGGAAGAACAATTGCTG
AAGACAACGGAAGATATTACAGCAAGATTATCCTAGCATGAGCCCTTCTC
AAGTCAAGCCTAGCCTGGTCTATAAACTGTCTAGCCTACTAGCCGTAGTC
TAATATGGCATGATCTGAGCTTAATCTTTGCCTAATCCAGCCTAAATGTG
AGCTGGAACTAACCCTAGCCAATTGAGTTTTGAGTTTGACATTAAGCCAG
TCCAGGCCAAGCTTGAACTCTAGCCAACTAGCCGGTTTATTGTAAGTGTT
ACGTTTAAAACGTCTCCAGCTTTATTAAAAAAATGCTGGACAGGCCCAAT
CAGGAATTCAGGGATTAGTTCAGAAGAAGCTACATCCGAGACTAACCACA
AATGTGTGCCAAACATTCATTTGGTACTGAACTAGTCCCTGAATTCCGGA
TTGGGCCTGTCCAATCACATGTGTGCTGCCTTATTAGCCTCTATACGAAC
AAACCCAAATTTAAATCCTGGAAGATTTGAGATGATTTGTTCCATCTCTG
TAAACACTTGGTCTCACGCCAACCTCCTCCCTTGACCTAAATGCCATTGC
TTGACTATGGATTGACAGTCCGTCTCCAGAATCAATCTTTTGACCCCTCT
CTCTTCTGCAAGCAGTAAGCCATCTCTGCATGCAAGAACCTCTGCAGTAG
TTGGATCCTCCATTTCTTCATACTTCCGACAGTGCGCTGCGATAAACTGA
CCTCCTCACCTCTTGCTACTGTTCCTGATCCAAAATACAAGTGTTCCATT
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CGGTGTCACAATGGGAGAAATGACCCGTTATATGGACGCACTAATAAAAG
ATAGTGAGCAGCTGGCTATGATGATTGATAGTGTTCCCTCGGTTGACAAC
TTGGACTTCATTATGGAGAGTGATGCACTTGGCCATACTGTCATGGATCA
GCTGCAGGGACATGACAGTTTGCTTGCGGTTGCCGAAACTGTCACGCTTG
AAGAGGTACTACATTATCATTTTTCTTATAAAAGTCATAGTGGAAATAAA
TGGCATCATTGCATTTTACTCTCTGCTAGTTTTTAAATGACATTTTAATA
AAATGCATTTTACCATATGTAGGTTAACACCGTTGGTGCAGAAGTACTTG
AATTTATTTCGGACTTTGGAAAACCCAATGCACCACTTCCTGCTGCTATT
GTGGCCTGTGTACCAAAAAAGGTCCATATTGATGGAGTAGGCGAAAGTGA
ATTTGAGATACATCCAGAAGAAATAATTGAGTCCATGAAGGCAGGTCTTG
AAGAACCCATTTACCCGGAGCCTGAGGTATGTTGGTTATTTATGATATCT
TTTGCTTGTTATGAAACTATACTAACATGGCTTAGCAAAGTTCATGCTTG
AATGTATTTTTTGTACCACTGTGCATACCATAAAGCAGCATCCTATTTAT
TGTTTTTCTCCTGGTTGCAGCTTGAGGTGCCAAAGGAATTGATTACTCAA
TCAGAACTTGAGGACTTGAAGTTGCAACACCAACCATCATTTGTTCCTTT
TGGTAAAGAGCAGGATGTGGTAAAAGTATTTGACAGTGAGACTGGTATAA
CACAACGCCGCTTATCTAATGGAATTTCCGTCAACTACAAGGTATTATAG
TCAACTGGAAACCTCGGGCTATTTTTCTAGAGACAGAAGAATCATCTTCT
TCAGTAGCCAATTCTGTGTAGTTTAGCTTTTGTTTCTTCATACTAAAAGA
TTAATGATGATTGATGACAGATCACTCAAAATGAGGCAAGGGTTGGTGTC
ATGCGGCTGATAGTAGGTGGTGGGAGAGCCACTGAAGATTCTGAGTCGAA
GGGGTCTGTTATTGTTGGTGTCCGTACTTTGAGTGAAGGCGGCTGTGTTG
GTAACTTCTCTAGGGAACAGGTATCTTCTACAAACTATTCAGTTTATATG
CCAGCCAAGCTTTCCCAAACTTTGAACTTACTACTTATGTCTGTATAAAC
ATTTAAACTAGTCTCGTCACAAGATTACCACATCTATTCTTGTAATGTAG
TTCTAGCCCCAAATTCCTGTTTATAGTTCTCTTTTTTTTACTATTATTCC
AACATTACCATTGTTTTTATGTAGCGATACACTGTTTTAATTTTACTAGC
CTCAGTGTTCACAGACTGTGTTTCTATCTTACTAATGCTGATAATTATTT
ACATTTTCTTACAATCTGCATATGACATATTTCAGGTTGAACTCTTCTGT
GTGAACAATCTCATAAACTGCTCTCTGGAATCCAATGAGGAGTTTATCTT
TATGGAATTTAGGTTTGCTTTAAGAGATAATGGCATGCGTGCTGCTTTCC
AGCTCCTACATATGGTCCTTGAGGTGTGGATTTTCAACTTACGGCATAAC
ATACTCACCTGCCTCGCTATTAGAAAACTAAGTTATCTTTGAAACATGAC
CTTATTGAACTTACACAATTCACTTCTTTGTGTTACAGCATAACGTGTGG
CTAGAAGATGCATTCGATAGAGCAGCTCAGTTATATTTGTCTTACTACCG
TTCTATCCCCAAAAGTTTGGAGCGTGCCACGGCTCACAAGCTTATGGTAG
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CAGAAGTTGACTCTTCAATCAGTTAAGGAAGCCGTCATGAACCAGTTCGT
GGGTAGCAACATGGAGGTTTGTTGTCATTTCTGACTTTTCATTCTCTTCT
CCCTGTTCCAAACTCCCAACATTTCTTCTTAACCAGCTCTAAGTTTAATG
TTGAAATATTTTTTACAGGTCAGCGTAGTTGGTGATTTCACAGAAGAAGA
GGTAGAATCTTGTGTTCTCGATTATCTTGGGACTGTAAGGGCTTCAAATT
CTTCTAACACAGCTGAGCATATTGAGAAGATTTCCTTCCTGCCATTTCCT
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ATATATATATTCATGCCTTGTGCTGTAAAGCAAAGAAACAAAGAGATAGT
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TTCTTTGCCAGGTATACATAAAGGACACAGATGAGAGAGCTTGTGCATAT
ATTGCTGGCCCGGCACCTAATCGATGGGGGTTTGCTACTGAAGGGAAGGA
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TACTCTGTGAGGTGCTCTCCTTGAGTAGTAGTGTATAAACATGTGGACTG
ATATTTGTCATACTTCCGCATCAGAAATCTCTGAACCAGCAAGCTCGGAT
ATAGTGGGAAAGACACATATTAATGTCCACAACCATTCTCTTTTCTTTGG
CATCACTTTAAGTTTGCTGGCTGAAATTATCAATTCCAGGTAAAGAATTT
CTGTGCATTTTTTATTATATTATTATTGTAAAGCTATCTCATGCATGATA
CAGTGTGTTCACTGTGCTGTGCCACCTTTGAATGACTAGGTTAGGAGTGG
TTTGCTTCTGCAAAAATCTTGATGATGCCCTATTTATTCACTTTACATTT
ACACTACTCCCTCCGACCCATATTAATTGACTTGGATTTGTCAAATTTTG
GATGAACCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATCCAAATCTAGACAAA
TGTAAGTCAATTAATATGGGTCGGAGGGAGTATCATAAAGCGACATACTT
GGTTATACATCTTATTAATGTCCCTGTGCCATTATTCTTGACTAAAAAAC
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GGCTATTTACAACAGTTCGAGATTCCATGGGATTAACCTATGATGTTTCT
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GGTAACTTCAACTCCGAGCAAGGTATTTAAGTTGCGATATTAAGCTTCTT
GTTCTCTGCTCTTCTGCTGCTTATACTAACATTTTGCGATCTTTGATGCC
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AGTAGTGCTACTATTCTTTCTAATCATGGCTATGTTGCTTAACAGGTAGA
TTAGTTCAAGAAAACTGCACATTTTTAAGTACTGCACATCTTGTTTGATT
TTCATGCACTTAAGGCGAATATGCATATTGGGAATGTTGTTAATCGCATA
CCAAGCTCATAGCTTTAAACATAACTTTACTGTTCTAGTGTGTACCTGAC
TACTGAACATTATGTAACAAGCACCATCATTTTCTACCTGTTAATTTGAT
TAGCACTTCCCTTGTCTTTCAGGCAAAGAGGACACTGCTAATGAAACACG
AGGCTGAGACAAAGACAAATGCCTATTGGCTTGGTCTGCTAGCCCACCTG
CAGTCTTCGTCCGTGCCTAGAAAGGTAATTTCTACATGAGGGTTATTAGT
GCAAATTCTTTAGAAAATTGGAAAAAGAAATAGACCTCCATTCTAGCCCC
TGGTTGCAAAGGTTAGTTCGGTTGCCTTGTTCTTGTCCCACTTTACTGGG
AAATGCTGTTCTATTCTGGTCCCTGCCTGTTGCCAACATCTGGGCCGTTT
ATTGTTTGGAGATTCCAACTTCCCACTTGCATGTGGGTCCCATGATTAGG
GAGAGATAGAATCCTAAATTACAGAGCAAGTTTTGTATACAGCTCAGTTT
CCAGCAGGAAAATCGAAGGAATTAATAAGAAAACTACTGGATTGGATCAA
AATGTGTTGGACAAAACACGAGATATAGGAAAAACACAACGGGGGCAAAA
GCTTGGCCCCAATCTATTAATTAAGAAGAGAATTGCCCAGTTAGTTGATG
GAAAACTGGGCAAAAACCGTTACAACAAAACCACAAGATATAACAACACC
TAAATCATACAACCTCCAAACCAACAAGCACCACAACCTACTATGACCGC
GAACCGACGACACCGCAAAGAAGAACCACAGAACGGACAACCCAAAAAGG
GTCCATCAATCAAGCAACATCCGAAGCTTTCCTTGCTACGCCTCTTTTCC
TTCTTTTGCCCCTCAGAGATACCTTTCTGAGAGACTTCTCCACCTTCTTG
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ATATCCAGGACTTGCCGCTTCTAAACTGGCGAGCAGCCCATAAAGCTCTT
TAGCAAAAAGAGCCTCAGAGTTGCGCGCCAACACTCCTCCACTGTCCACA
AAGGCGGGAGACTGTGGTGACAACGGCGTCTTGGCCACCGCCAAGTCCCC
ACATGAGCTCGGCTCCAACAGAAGCACCACAGAAGATTCCCCACACAACT
CATGAAGCTCGGGTGTGATCTGCAGCACCGGAGCAATGATCCCATCCATG
CCCTTACTCTCAGAGGCAGCCAGCACAACAGGCTGTGGCGATGGGCAGGG
ACTGCCCCGAGGAGAGAAACACCCGTAGAGATGTTTTTCCTCAACCACAG
ACGACTTCTGCTCAGAGGAGTCAAGCGGAAACGAATCCTGCTCGTGGGTG
AGCCCCAAGCCACCACCAACGCGCGCCAACAGCAGCTTGAGAGTTGCCAC
CTCTTCACGAAGGGGGTGAGACACCTCCTCGATGCGGACTTCGATCAGCT
GAAGGAGCTTCATGCGCAACAAGGCAACCTGAGACTGAAAGAGAGAGTCC
AAACTGGCGTTGACATTGAACTCCTAGCAACAGCTAGGAGAGGGTTTTGG
CGGCACCGCTGCACGCAACGATGAGTGGCACACGGCCTCAGCCCAACTCC
GGGGTGATGATGGCCGACGAGGCTGAGCGGACGGAGATCGACTGTCATGT
CATCTCCTGTAGGAATGAAAACTACTGGATTGAATCAAAATGTGTTTGAC
ACCACAGGGAAAACAAAACTAGTAAGAGGTTCGGGTGGATGGGATCTTTC
CTCCAAAATAGAGTACAAAGGAATCTTTAGGAAAAATTCCCAGTGGTTTG
ATTTTGTATTATATGTATACTTCACCTGACTGCAATTATAATTATATGAT
TTGGTTGACACTTAACCAGGTACTGTCGGTACTTGGTACCATCTGTCAGC
TTCTCATGCTGTAGCATGCAGTTCGCTAATCAAGCAGTTTAACTGAATTA
AGTAAAACCAAACCTTGTGCTGTTCTGAATTTCTACCCACACTTCTGGAT
GACTTTGAATGAATGGAAACTATAGATACATACTCCGTCCGTTTCAAAAT
ATAAGATGTTTTAGATTTGTAAAGAAAATGTATCAAGACTTGTTTTAGTG
TGTAGATTCACTCCAAACCTGAATGAACCTACATACTGAAAGTAGACTAG
ATAGCTTCACAAATCTAAAACATCTTATATTTTGAAACAGAGGGAGTATA
TGAAAAAAAATATCAAGATGGCTAAGACTCTGTCTATTTCGGGTTCTAGT
GCTTTTCTTGACCATACTGTATACAGAAAAGTTGAAAAGTGGTCAGGGTA
TTGTGTATCTGCTAATGTATAAGTTCTTTTTTTTCTTTTATATACTCCCT
CCGACCAATATTAGTTGACTTAGATTTGTCTAGATTCGAATGTACCTAGG
CAAGTTTTAGTGCTAGATACATCTGTATATAGACAATTTTGAGTCAACTA
ATATGGGTCGGATGGAGTATTATTATTACCACTTGGTGGAACTCTGCCCA
TGTCTTATCCTTCATTATTTTTATAGTATTATTTTGGGTACTTCTTTTCT
TTTCTTCTCTTTTCTGGTGTTGTCACTCTCTTAATGTATTTCATTTGTTC
CAATAAAATGCAGGATATATCTTGTATTAAGGAATTGACGACACTGTATG
AAAGTGCCACAATTGAGGACTTGTATCTTGCATATGAGCACTTGAAAGTT
GACGATTCATCTTTATTTGCATGCATCGGTATTGCTGGTGCCGAGTCTGG
TGAAGACATGAATGGTACGTAACAAGAACATTAAGTGTTCCCGATGATAT
GGATTCCGAGTTATCTGAATCTTTTTCAATTTTGAGCAAAATTATTGCCA
GTATATGTTAATTTGGAAGTAAATATGTGTGCTGACCAGCACCCATCAAT
ATGGTCTAGATGTATTTCTTAAATCAAATTCTGTAAATTAATCCTTTTTT
ATTTGTTATGTTAGCAGATGATGAGCCTGATATGGGGCTTCCTGGTATGG
TTCCCATGGGAGGCCGGGGTCTATCAACTATGACCAGACCGACCACATGA
GTTGTACACTTTTCACGACCCAACTTTCTCAAGGTGTGTTGCAACTTTTT
GAAGAAAAGTCTGGTGCCAGTGCTCTACATTACAATACCTTTGCCAATCG
TTCTGTTCTAATTTCAGTTGGCCCACAGGTATGTGATGCCGTGGAGACTA
CATATCAACCTAGCTCCTGAAGAGAGGATCCCTATGTGACCCTGTGGAGA
CTACATATGATGACTGTATACTAGCAAGTACTCTAGACCCCATTGATGCA
TTTGATCAGGCCAATTCTTATTCCGTGGGCATTGCAACAGCTTGGTCATT
GCATTTTCCCAGAAAATAGAGTTGATTGTTGCCAAGGTCTTGAAAGCCTT
CCAAGGAAGGCCATGTTCAGAATGTATAGTAAAGATCGATTCGATTCTTG
CACATTCCTGAGTTGTTGTAACTAGTATTCTTCAGGTCATCACAGAAGAT
AGAATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.