Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000988

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000988
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000988
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCTTTCGGGCTCATACCTGCACAAGGCGGCGGCGGGGCGAGCTCCTCCG CCTTTTCCCTTGTGCGGCGGCGTCCTCCCCGCCGTGCTCCTCCGTATACC AATACCACCGAGAGCACGTTTTTTTTAATCCCCACCCCCTCCCGTCTCAT TCCTCTCACACACCGGGCAGAGGAAGTATTACCCGTCGAGCAGCGGCACG GCGGCGGCGGCGGCCGCGGCGGCCGGGCAAGCAACCATATTGCCCGATAC CAAGGACGCCACCGACTTTTACCTCCCACCTCTCTCCAGGACTGGTCAAC CGAGCGCCCACGCGCACGCCCACGGCTATGATGTTGCGCGCCGCCGCCAT ACGCCGTGCCGCGGTGGCTGCGTACTCCACGGCGGCGGCCAGGCCGGAGA CGGGCCTCTACGGCTTCGATGTGCTGCGCACGGCCAAGGGCTTCCGCCGC TTCGTCGACGAGGCCATCCAGCGGTAGGGGGAAAAACCCTGAACCCCTCC AAATCTCCGATACTCTTGACACCCAAAACCAGCTATCGTCTGCTAATTTT TTTTACTGAACATTTGCTCGAACCTGCAGGTCAGACGAGCTCGTTGCCCA CATCGCTCAGCTGCCGCCTTCGGCGGAGATTGTCAATGCCATGGATGAGA TCTCCAACACCGTAACTTGCTCTGCTTACGCTACTTTTGAGTTAGCTCAC TTGTTTCTATGTGGGTTTGGCTGATGTGCTTATGTAATGCTTTGGTTAGG TTTGCTCGGTCATTGATTCGGCGGAGCTGTGCAGGAACACACACCCGGAT AGGTGAATGTTGTTTCTCGTGTAATTTGGATGGTTTGGACTTTGGAGCAA TGTGCTGTCAGGTTTTACTAAGCAGATATGTATGTGAACTAGGGAGTTTG TGGAGGAAGGAGATAAGGCGTCGATGAGGATTTACGAGCATCTTCAGGTA AGCTCGATAGCTTGAAAATGCAAGGGAGAGAACTGAGTGAAACGACCATA CAGAAATATAACATTCCATTATCTGTAATCCTTTGCAGTACCTGAATACA AATACTGCTTTGTACAACGCGATACTAAAAGCTGAGAGTGAAGGTGTCCT GCTCACAGAAGAAGCTCGAAAGGCTGCAAATCACTTGCGCGTGGACTTTG AAAAAGGGGGGATTCACCTTCCTAAAGGTTGCCATACTCAAGTGTATCTA AAGTCGCTTCTTTCCAATTTTCATCACTTTTACTTAGAAACACAATGTTC TTCCACTGCAGATAAACTTGAGCGTGTTAATCAGCTGAACCTTGCAATTG CCCAGCTGGGTAGAAAGTAGGTACATGAATCGGACACTGGCTATTGATAG TCTCTGTACCATTTTATTGTTTAACTTCCCATCTTAGTTTTTCATTTCAT GTTCCAGTTGATTTGATTGTTTAGTGGAATTGTTTGTTGTTAAGCGTCAT GCTGATTTAACACTAACCACTGTCATCCTTCTGTTTTGGAATTATATTTC TCTTAACTTTGCCAAGTTCATGGATGGCTCAAAGCCTTGCTAGTTTAATC TTCTAATTATCCTCTTAAATGCTTGAAATAGTGGCATCAGAATTTCCCCT CTAAATGCTTACTAATCTGGATGTTGCTAATACCGGTGCTTCAGTGGCAT GTAGACCATCGAGTAAGTGTTAAGGTGTACAATTTTTTTTTTTGTAATTC ATGGGTTTAGTCGACTAAGTCTATGTTTATTACCTACTACCTCCGTTCCA AAGCTTAAGGCTTATATTTTTTTTTTAAAGTCAAGCTACGAAAAGTTTGA CCAAACTTTTAGAAAAAAATATAAAGAACTATGATATTATATAGATACCA TGTGAAACTATGTTTCATGATATATCAAACGGTATGAATTTCATGTTGTA AATATTAATATATTCTAAAAACGTGGTCAAACTTTACATAGTTTGACTTT TGAAAAAAAAAAGCCTTAAGCTTTGGAACGGAGGGAGTATTTACCTTTCT TTTTCCCTAAGATCGTGGAAATGATATATGCAATGTTGCTTTCAAGTATA TTTGCTTTAGTGTACACAAAATGTGATTTCCTATTCATAACTAATCTTTT CAGAAATAGTATTTTAAATTGCCACAGGACCTAGTATTAATTTAACTAGT TTATTATGGAGTTGATTCTTTGCACTGTAGTTTAGCCTGATTTGACACAG ATTTAGAAAATTAACTGTAACTGCTGTGCACTTTCTTGTTGTGCCAGATT CAATGAAAATATTATGATCAAACCAGGTTTTGTGGATATATATCCAGCTT CACGTATTCCACGGAATATCCAACATAGTTTCAAGTCCATTAGCCGTTCT AGGCAGAGCAGTGTTGCAGAACAAAGCAATCCAGTGAATACTACAAGGCA AAAGGGTCTAAGGATATTGACAGACTCAGGAACTCTATCATCAGCACTAA GATGGGTTGCGGATGAGGAAGTATGTTCCTTCTGTTCCACTCATCAGCAT CTGAATTTTTCTTGCATCCAATATCTGCATGACATGAACTTACATATCCA TGTTATTACAGGAATGCTTGAATTTTCCGTGCTCATTTAATTTTCATCAT GAAAATATCATAGTAATATCTTTGTTTTAACTGTTTATATCTTTCTCTAT TTTTGCATAACCTTTAGAGCTATTAATGTATGTCATCACATTAATGGCAG CAATTTAACAGTTCCAATTTTTCTGAAGGTCAGGAGACAGGTATTCATTG CAGGAAACTCTGAACCTCGTGAAAACATTGGTGTTCTTGACGAACTTATT GATTCTCGTGATGAGTTTGCAAAGGTAAGTGCACTTTTCCGGATCCTAGA GCATATATTTATAGGGAACGTGCAGCCTGATGGCCAATGTTTTTACATCT TTTGTGCTAAACTTCACTTGATGCTGCGAGCATTCAACTTACAAATTTGT GATATGGAGAAGATGGCAGTCAATGATGCTGCAGGTAGAGATGATAGTGG TTCACCATTAGGGTACCCTCTACCCTCTTTAGTTCAAAAAAAATGAACTA AAATTTTCAAAACGATGATATTTATTAAATAATTTAGCACAGTTGTTTAT TTGGAGCAATTGAACCCCCAAAATTATCTTGTGCTACTTGTGCTTTGGAT ACCAAGTATGTTTCTTTAGCTGGTCTATTTTGGATCACATGTGGTATGCA GATAAAAAGTTGACCCAGTATTTGATGCCTATGTTGTGTAGTTCTCTGGT TCATTTAACATGTGAAGAATGAGAATAAGATTTCACCTAATATACTTTCC TAAGTGAGTTCATCAAATACCATGACGTCAATTACATTACTTAGTCTGAA TATTTCTCAGATCTTTCTATTATTCCGGGATAAACAGTTTCTTTTTTCCA TTTGGCAGACTATGGGTTGCAAATCATATGCTGAATTTGCTATCCGTCCT AACATGGCTGCATCTGCAGATGTGGTTATGGCATTTCTCAATGAGATGAG CCACATTGTTAGGCATAAAGCTGATGAGGTATTCAAGGGATTGAACTTAG TCTTGGCATGAATAAGACAATCATTATATACTTATATCCAACCAGCAGTC TCTGTATTCATAGCATGCTCTTATGCAGGAATTTAACACTATACGAGATT TCAAGAGAAGAATATGTAATCAAAAGAGTGCTGATCTGGAATCATGGGAC GAGGATTACTTCATTGGAATGATGAAATCATCTGCGCATAGTGTGGATCC CTCGGTGTGTGCTATTTTTCTCAGAATGTTCTGTTAATTAAATCAATGTT AAAATATACTATTCTGACCGTATTCTAGTTATTTCCTGTTAAATAGTTTA TGTAAAGACATACTTTGCATATATAGGTTGATAGAAGCCAAATGAGACCT ATGTTTGGTACTTGTAAGCTAACATGAAGAAAATGAAGTACAGAATCACT AAGTAGTTTCATAGATTTCGTTTGTGAACCTTAATCTTCTGTAATTCCTT CAGGATTGGAGCTTTTTTTTTCTGTTTTGTTGTTTCCTGCTGACCATCTT TACTTATTTTAAAAATCCTATTTTGACGCTAGCTCTTGTGCCTAGCAGGT TGTTGCATCATATTTTCCGTTGTCCCAGTGCATAAAGGGTTTAAATGTGC TGGTGGAATCATTATTTGGTGCCACATTTAATCAAATTCCTATGGCGGAT GGAGAGTCATGGCATCCAGATGTGATAAAGCTGTCTCTTCATCACCCTGA TCAGGTAATGCTACTGCTATAAGCATCTGTTTAGAAGAAAGTTAACATTA AGTGTTGCAAATTTCTGCATCTTATCCGTTTCAAATTTGCAATATGCGTC CCTATATGCTTGAAGTTTTGTAGTAACTGTACTAAAAATGAACATGTCAG AAATAACTTGCATTTCTGGAATTATGGCAATGTCTCAGCTAGGTGACCAT CAATAGTCTGCCTATAATTATCAGATCCATAGTTAGCGATGAAATTATAT CAAAGGGATGGGTCATGTCCTGTTGTGAGTAGTACTGATCTAGGAGGTGC ATATAATCCCCACAAAAAAAGGAGAGGTATCCGAAATTTCTTGTACTGTT ATTTTTCTCACCTATGCCATAAATTGGATAAGAGAGCATAAAATTCTATG CTGATCTGAACAGAAATGGTTTGTAAGCTATTAGGCGCTGAAGTATTGTG TTCCTTAATGGAAAATGTATTAATTTGGAAACTATCATTACCTTTTTTTT TCTGTAATGCTTACATTTTACTCTTCTTATCTTGCGCCGTAGTATCTAAT AACATGCAGGTGAATTTATTAATTAGTTTAGAGTACATGTATATCCTTGT TTTAATGTTTTCCTCATTTATCGTATCTTCTCTCACCTGCACTTGTAAGC AATACCCTCACTAGCGATTCTTCGCTAATTCCCTGGTGTATATATATAGC AATGACAGCATGGTTAATTTTTCTTGTCCTTCTCTTGGATTAGTGACCTT CATTGTTATTGTTTTTATTTTCTCTTAGTTTTGTAGTGTGAATCCTTGTT CTGAGCCCACTCAAAATATACCTTCTAAATCAAGGTTGTTGGTTACAAGT CCTGTCGTGCATTGCACCCCATTGCTTGATTGCATCCTTCTAATTTTTGG TATATTTGCTGGCCCAAATTAACTAAAGCCAAACTTTTCTAATCAACAGG GTGATTTAGGATTTATGTATCTCGATCTTTACTCCAGAAAGGGTAAATAT CCAGGGTGTGCTCATTTTGCAATCAGAGGGGGGCGACGATTATCTGACTT GGAGTACCAACTTCCGGTATATCCTCTTAATCTCTTGTTGATTATCATTT AATTTTGCAGTAAAATATGCAGGCTTCTAGTGTGGGCATGAATGTTTTCC CATAATGGAGTAGCATCTCCAAGCATTATGGGACTCTCCTTGTTAGCTAT CATCTTATGCATTTAGATCAAACATTTTGAAAATCAACTAGGTCCATGGC TGATGCATGCCTGGTGTAGCCTTGTGGCATATTCTCATTTCCTCATGAAA ACTGGAGCACCAACTTACTCCACATCATTTGATGCAACTAGCTTAATAGA TCTGCATATTGGAAAATTAGCATAGTTCAAATTTGTCGAGCTTCATGCAC TAATCAACTATTCCAAAACACCGATCTTATGGAAAGTAGTTGGCAATTCA CTTATACACTTCAACACCCCTCCTCACGTGTGACAGGAAGACAAGTCAAC ACGTGTAAACTTAGAAGTATGACTCAAGAGGTCAATACGTGGATGGAGGG GGCACCAACAACAACAATTTTTAGGAAAAATTGCGCCACACAGGCCTCGA ACTCGAGACCTTGGCTCTGATACCATGTCAAGCTTCATGCACTAACCAAC TATTCCAAAAGACCGATCTTATGGAAAATAGTTGGCAATTCACTTATACA CTTCAACAAAGTTCATACTGTTAGTTCATTTTGGCCAATAGACTCTGCTC TTTCTTTTCAGATCATTGCATTGGTTTGCAACTTCTCGAGTTCTAGGGGA TTGACCGCAAGGCTCAACCATTGGGATGTAGAAACTCTTTTCCATGAGTT TGGCCATGCCCTACATTCTCTGCTATCAAGAACGGTATTCTGCTTGATCT TCGTAATATTTAGATAATCGGATGACTTCGTATCTTACCTGGCAGCACAT TGATATTTGCAGGAATATCAGCATTTCTCTGGTACCAGAGTTGCTCTTGA TATTGCTGAAACACCCTCAAACCTTTTTGAGTAAGTAGGACTTGTTACCA AAAATAGATAGCAGTTTGATAGTGCATCTAATTGTGGCCTATCTAGAATA AAACTCTTCTTTGTTTCGAGACTCTGGTGGTCGTTAAGTGTAATTTCCGT TGCAGGTTCTATGCCTGGGACTACCGTGTCTTGAGGACATTTGCTCTAGA TGAAACAACTGGTGACCCAATACCAGAAAAACTGGTAAAGGCACTAAATG CTTCCCGGAACATGTTTCCAGCTACTGAGCTCCAGCGGCAGGTTTGCTTA TATCTCTACGTAGTTTCTTATCATCCATATTAGGACTTGGCCTTTTTTCT TTGTTGACCTGGTCCTGTTTCTTGTCCCACTTTGTGTTCTCGTTCCTGGC CCCCAGATTTTCTATTCTATAATGGACTTAACATTGTTTGGAGAGCACAC ATCAAAACCAATGGACACAATTTCTGCTGTCGCGGATTTGAAAAGAAAGC ATACAAGTTGGAATCATGTGGAAGGCACTCACTGGCATACTCGGTTTTCT CATCTTATAAACTATGGCGCTGGTAGGCTTTCTAGCTGTCTTCTAGTTCC ATAAACTGATTTTTCCCAGGAAGTTCTTTAACCTCTCGTATCACATTGTT GCAGGGTACTACAGCTATCTCTATGCTAGATGTTTTGCCACAACTATATG GCATGAAGTATGCCAAGATGATCCATTGTCCCGCAGCACAGGTAGTGCGC TTAGGGAAAAGTTCTTGCGGTATGGTGGGGCTAAGGATCCATCTTCCTTG CTGAAGGATTTTGTAGGTGATTCTGTCATTAGAAACTCTGGTAGCGGAAT AATTCCTGACATTAGCTCCTTGCGTAAAGAAGTTGGTTTGTGAAATACCA CCGAGGGTGCAGGATGGGATCATTATTATTTTTACATTGAGGTTGACGAA TGGGCCAAGCCGAGAACTCTAAACCAAAGGCATGAAGGGCATGTTGGGGC TTCAGGAGCTTGATCTCCTGACACGGTGCGACAGGATGGCAGAAGCGTCG AAGATCAAGCTGGGATTATATGAGATTCTTGAAGAGTATAATTGATTGCG AATTTTAGAGTTATGACGCGCATACTAGATCAACTGAGTGGATCCCCTGT GATTGATGATGAAACTCTAACTCAACTACTATGAGGATGGATGCCTCGAG GATGATCTGTCAGATGCTTTCTTTGAGACGATGTTAGCTTTCACTACCAT TGTGCATATCTGTTGCTTCAACGCTGCCTTCATAATCCATGACGCTGATG CCATGTTAGTCTCAGATTTTCTTCTTTTGGTTCGAGTTTACCTCGCAGTC ACCAAGATACCAACTTGTTCGTGTATTATTATGCTCTCTTCAGGTATTCA TCAGAGTAAAATGTACTTGGGGTCCTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.